The vitamin D receptor (VDR) is an essential protein related to bone metabolism. Some VDR alleles are differentially distributed among ethnic populations and display variable patterns of linkage disequilibrium (LD). In this study, 200 unrelated Brazilians were genotyped using 21 VDR single nucleotide polymorphisms (SNPs) and 28 ancestry informative markers. The patterns of LD and haplotype distribution were compared among Brazilian and the HapMap populations of African (YRI), European (CEU) and Asian (JPT+CHB) origins. Conditional regression and haplotype-specific analysis were performed using estimates of individual genetic ancestry in Brazilians as a quantitative trait. Similar patterns of LD were observed in the 5' and 3' gene regions. However, the frequency distribution of haplotype blocks varied among populations. Conditional regression analysis identified haplotypes associated with European and Amerindian ancestry, but not with the proportion of African ancestry. Individual ancestry estimates were associated with VDR haplotypes. These findings reinforce the need to correct for population stratification when performing genetic association studies in admixed populations.

O objetivo deste trabalho foi avaliar a existência de estruturação genética matrilinear em maçaranduba (Manilkara huberi). Foram avaliados 481 indivíduos adultos de M. huberi, distribuídos em 200 hectares de uma população natural na Floresta Nacional do Tapajós, Belterra, PA, e 88 regenerantes, com base na análise de nove microssatélites de cloroplasto e, de 96 indivíduos adultos, selecionados aleatoriamente na área de 200 ha, foi realizado o seqüenciamento de três regiões não codificadoras de cpDNA. Não foi detectado polimorfismo de seqüência. A análise da variabilidade haplotípica mostrou polimorfismo relativamente limitado, que resultou em 15 haplótipos, com diversidade genética total (hT) de 0,898. Foi detectada a existência de estruturação genética significativa em distâncias de até 250 m, o que indica dispersão de sementes restrita e confirma o padrão de organização espacial da variabilidade genética mostrado pela análise de DNA nuclear, o que evidencia isolamento por distância e a necessidade de manutenção de grandes áreas de floresta primária para garantir a sobrevivência de maior número de subpopulações.

The objective of this work was to evaluate the existence of matrilineal genetic structure in maçaranduba (Manilkara huberi). Evaluations were performed for 481 adult individuals of M. huberi, distributed in 200 hectares of a natural population in the Floresta Nacional do Tapajós, Belterra, PA, Brazil, and 88 plantules, based on nine chloroplast microsatellite loci and, of 96 individuals, selected randomly in the 200 ha area, it was carried out the sequencing of three intergenic regions from the cpDNA. No sequence polymorphism was detected. The analysis of the haplotypic variability showed a relatively low polymorphism, which resulted in 15 haplotypes, with total genetic diversity (hT) of 0.898. Significant genetic structure until 250 m was detected, which indicates that seeds are restrictedly dispersed and confirms the pattern of spatial organization of the genetic variability, showed by the nuclear DNA analysis. This indicates isolation by distance and the need of maintenance of primary forest large areas to allow the surviving of a greater number of subpopulations.

O objetivo deste trabalho foi avaliar o potencial dos marcadores microssatélites em predizer o comportamento dos híbridos entre clones-elite de eucalipto da empresa Aracruz Celulose. Foram utilizados 21 clones-elite, cruzados conforme o esquema de dialelo balanceado. Os 137 híbridos obtidos, além dos 21 pais e 11 híbridos repetidos, foram avaliados em três locais: Aracruz, São Mateus e Caravelas, em delineamento de blocos incompletos 13x13 com 40 repetições. As parcelas foram constituídas de uma planta, espaçadas 3x3 m. Os caracteres circunferência à altura do peito (CAP) e densidade básica da madeira foram avaliados aos dois anos de idade. Os dados foram submetidos à análise dialélica e, posteriormente, foi obtida a correlação entre a divergência genética dos genitores, obtida por meio dos marcadores microssatélites, e as estimativas dos parâmetros do dialelo. A divergência genética apresentou coeficientes de correlação significativos apenas com a capacidade específica de combinação para CAP e com a média dos híbridos para CAP. A predição por meio de marcadores microssatélites possui baixa precisão para poder ser utilizada em substituição aos cruzamentos dialélicos.

The objective of this work was to evaluate the potential of microsatellite markers to predict the performance of hybrids among elite clones of eucalypt from Aracruz Celulose. Twenty one elite clones were crossed in a full-diallel mating scheme. One hundred and thirty seven hybrids, 21 parents and 11 repeated hybrids were evaluated in three sites: Aracruz, São Mateus and Caravelas, in an experimental design of incomplete blocks 13x13 with 40 replicates, comprising single plant plot and spaced 3x3 m. The characters evaluated were the circumference at breast height (CBH) and the wood basic density, two years after the planting. Means were submitted to diallel analysis and, later, the correlation between the genetic divergence of parents by microsatellite markers and the estimative of diallel parameters were obtained. The genetic divergence was correlated with the specific combining ability to CBH height and with the means of hybrids to the same character. The other coefficients of correlation with the genetic divergence were not significantly different from zero. The prediction by microsatellite markers is of little accuracy to be utilized in place of diallel estimates.