ABSTRACT In March 2016, wilt and shoot blight were observed on five-year-old apple trees (Malus domestica) cultivar Maxi Gala in a commercial orchard in São Joaquim city, state of Santa Catarina, Brazil. Isolation on culture media, biolog, biochemical, LOPAT tests, and whole genome sequencing were performed. Koch’s postulates were fulfilled on apple stems, leaves and fruits. The taxonomic position of a representative strain was determined by in silicoDNA-DNA hybridization using the Genome-to-Genome Distance Calculator which showed 93.9% similarity with Pseudomonas syringae. Results of biolog and biochemical tests did not match those expected for pv. papulans, morsprunorum or syringae. To our knowledge this is the first report of P. syringae causing bacterial canker in commercial apple orchards in Brazil.

Xanthomonas oryzae pv. oryzae (Xoo) e X. oryzae pv. oryzicola (Xoc), são os agentes causais do crestamento bacteriano da folha (CBF) e da estria bacteriana da folha (EBF), respectivamente, são pragas transmitidas por sementes e sofrem restrição no comércio internacional de arroz, por estarem ausentes em muitos países e possuírem potencial de comprometer seriamente a produção de arroz. Vinte e um isolados oriundos de sementes de arroz do Uruguai e Argentina, Gram negativos, oxidase positiva, com pigmentação amarela típica do gêneroXanthomonas e positivos no ELISA para Xoo, foram caracterizados para determinar a associação destes, com X. oryzae e seus patovares. Os isolados foram caracterizados por métodos bioquímicos, biológicos e quanto à sensibilidade a antibióticos. Análises de PCR e qPCR foram realizadas para a confirmação do gênero Xanthomonas e identificação de Xoo e Xoc. A caracterização de 21 isolados de Xanthomonas sp., positivos no ELISA para Xoo, mostrou variabilidade entre os isolados e distinção de Xo.

Xanthomonas oryzae pv. oryzae (Xoo) and X. oryzae pv. oryzicola (Xoc), causal agents of bacterial leaf blight (BLB) and bacterial leaf streak (BLS), respectively, are pests transmitted by seeds and suffer restriction on international rice trade, because are absent in many countries and have potential to compromise seriously rice production. Twenty-one isolates from rice seeds from Uruguay and Argentina, Gram negative, oxidase positive, with typical yellow pigmentation of genus Xanthomonas and positive in ELISA for Xoo, were characterized to determine their association with X. oryze pathovars. Isolates were characterized by biochemical, biological and antibiogram methods. PCR and qPCR analyzes were performed to confirm genus Xanthomonas and identification of Xoo and Xoc. Characterization of 21 Xanthomonas sp. isolates positive on ELISA to Xoo, showed variability among isolates and distinction of Xo.

As flores de corte são produtos altamente perecíveis e sua vida pós-colheita deve ser prolongada ao máximo para garantir a fidelidade dos consumidores. Uma possível medida para ampliar o período pós-colheita é a adição de fontes exógenas como biocidas, açúcares e substâncias acidificantes, compostos presentes nos conservantes florais comerciais. Nesse sentido, objetivou-se avaliar a eficácia do uso de conservantes florais na longevidade pós-colheita e na redução do número de bactérias em hastes florais de gérbera de corte. Seis hastes florais por unidade experimental de gérberas 'Essandre', colhidas em produtor comercial, foram condicionadas em frascos de vidro com 1L das seguintes soluções: T1 - água destilada (tratamento testemunha); T2-1,0% (v/v) Flower(r); T3-1,5% (v/v) Flower(r); T4-1,0% (v/v) Flower Plus(r); T5-1,5% (v/v) Flower Plus(r); e T6-1 tablete de Florissant 500(c). Ao final de 7 dias, observou-se o conteúdo de carboidratos totais e, ao final do experimento: a longevidade; a massa fresca relativa; e a absorção de solução. Nas soluções de vaso, durante o período experimental, avaliou-se o pH. A contagem bacteriana, nas hastes florais, foi realizada com os tratamentos: T1 - água destilada (tratamento testemunha); T2-0,75% (v/v) Flower(r); T3-1,5% (v/v) Flower(r). Os conservantes florais testados não aumentam a longevidade pós-colheita de hastes florais de gérbera de corte. O uso de conservante floral reduz o número de bactérias em hastes florais de gérbera de corte.

Cut flowers are highly perishable products and its shelf-life should be prolonged to the maximum to ensure the fidelity of consumers. A measure to assist vase life lengthening might most likely derives from the addition of exogenous sources of biocides, carbohydrates and acidifying substances compounds present in commercial floral preservatives. The objective of this study was to evaluate the efficacy of floral preservatives on postharvest longevity, and reducing the number of bacteria in gerbera cut flowers. Six cv. 'Essandre' gerbera flower stalks as experimental unit were harvested at a commercial cut flower producer and placed in glass jars with 1L of these solutions: T1 - distilled water (control treatment); T2-1,0% (v/v) Flower(r) ; T3-1,5% (v/v) Flower(r); T4-1,0% (v/v) Flower Plus(r); T5-1,5 % (v/v) Flower Plus(r) and T6 - one tablet Florissant 500(c). The following variables were evaluated at the end of shelf life of the flower stalks: contents of storage substances, longevity, relative fresh weight and solution uptake. The pH of vase solutions was determined along the evaluation period. Bacterial counts were performed from solutions of the following treatments: T1 - distilled water (control treatment); T2-0,75% (v/v) Flower(r); and T3-1,5% (v/v) Flower(r). The floral preservatives tested did not increase the postharvest longevity of gerbera cut flowers. The use of floral preservative reduces the number of bacteria in gerbera cut flowers.

Ralstonia solanacearum, agente causal da murcha bacteriana em diversas famílias de plantas, entre elas as solanáceas, causa grandes prejuízos na cultura do tabaco, se não manejada. Por se tratar de espécie complexa, esta bactéria é classificada de diversas formas. A mais recente divide a espécie em três níveis taxonômicos: filotipo, sequevar e clone. Devido à ausência de estudos sobre as populações de R. solanacearum na cultura do tabaco, este trabalho teve como objetivo caracterizar 120 isolados oriundos de solos e plantas de tabaco com murcha bacteriana, coletados em 13 municípios do Paraná, 24 de Santa Catarina, 13 do Rio Grande do Sul, um da Paraíba e dois de Pernambuco, em biovar, filotipo e por diversidade genética através das sequências repetitivas BOX, ERIC e REP (rep-PCR). Os resultados indicaram que todos os isolados estudados pertencem à biovar 1 e filotipo II. Embora tenha sido constatada homogeneidade quanto à biovar e ao filotipo, os resultados da rep-PCR permitiram a divisão dos isolados em seis grupos (A, B, C, D, E e F), a partir de 61% de similaridade, independente da origem geográfica, tipo de amostra, época de coleta e cultivar. Os grupos A e B foram os que tiveram maior número de representantes, 47 e 20 linhagens clonais, respectivamente. O conhecimento da variabilidade populacional de R. solanacearum, assim como da virulência dos diferentes isolados, pode auxiliar no sucesso de programas de melhoramento genético e de manejo integrado da doença.

Ralstonia solanacearum, causal agent of bacterial wilt on different hosts, including members of Solanaceae, causes severe losses in tobacco crop, if not managed. It is a complex species and classified in several ways. Lately, the species was divided into three taxonomic levels: phylotype, sequevar and clone. Due to the lack of studies on populations of R. solanacearum in tobacco, this research aimed to characterize 120 isolates from soil and wilted tobacco plants, from 13 counties from Paraná, 24 from Santa Catarina, 13 from Rio Grande do Sul, one from Paraíba and two from Pernambuco, by biovar, phylotype, and by using repetitive polymerase chain reaction (rep-PCR) element (BOX, ERIC and REP) primers. The results indicated that all isolates belong to the biovar 1 and phylotype II. Although there was homogeneity regarding biovar and phylotype, the results of rep-PCR allowed the formation of six groups (A, B, C, D, E and F) from 61% of similarity, regardless of sample type, geographical origin, collecting date or cultivar. Groups A and B were those that had the greatest number of isolates, 47 and 20 clonal lines, respectively. Knowledge regarding R. solanacearum population variability as well as the virulence of different isolates may help in the success of breeding programs and integrated disease management.

O objetivo deste estudo foi descrever a frequência de parasitos em amostras fecais coletadas no ambiente da Ilha da Marambaia, Rio de Janeiro, Brasil. Cento e cinco amostras foram coletadas e processadas pelas técnicas coproparasitológicas de sedimentação em acetato de etila e centrifugo-flutuação em solução saturada de sacarose. Foi observada positividade em 81.9% das amostras, sendo ancilostomídeo o parasito mais frequente, seguido de Trichuris vulpis. Ovos de Ascaris sp. também foram detectados. Observou-se elevada frequência de parasitos com importância em saúde pública nas fezes recolhidas no ambiente. Programas de educação em saúde, aliados a atenção dos serviços das saúdes humana e animal, devem ser empregados para redução dos níveis de contaminação ambiental.

This research aimed to describe the frequency of parasites in stool samples in the environment of Ilha da Marambaia, Rio de Janeiro, Brazil. One hundred and five stool samples were collected and processed by the coproparasitological techniques ethyl acetate sedimentation and centrifuge-flotation using saturated sugar solution. Parasites were detected in 81.9% of the samples, hookworm being the most prevalent, followed by Trichuris vulpis. Ascaris sp. eggs were also found. A high level of evolutive forms of parasites with public health risk was found in stool samples of the environment studied. We propose that health education programs, allied to an improvement of human and animal health care, must be employed to reduce the environmental contamination.

A morte de flores em pomares de pereiras europeias (Pyrus communis L.) foi observada em Vacaria, RS. Dois isolados bacterianos, oriundos de flores sintomáticas, reproduziram tais sintomas em flores de ramos destacados e foram identificados como Pseudomonas sp. Devido à ausência de registro da etiologia dessa doença no Brasil, ao registro de P. syringae pv. syrigae e Erwinia amylovora associadas a sintomas similares em outros países e à possível presença deste tipo de bactérias em gemas, um método para detecção dessas três bactérias foi desenvolvido. O método envolveu maceração das gemas com nitrogênio líquido, adição de PBS e PVP 2%, transferência do suco para cartão FTA (Whatman); tratamento de círculos do cartão, com etanol 70%, reagente FTA e tampão TE, eluição do DNA seguida de PCR com oligonucleotídeos iniciadores específicos para cada uma das bactérias. O método foi, então, utilizado para monitorar tais bactérias em gemas colhidas bimensalmente durante 2008. E. amylovora não foi detectada. A frequência média de P. syringae pv. syringae e Pseudomonas sp. foi de 0,7 e 16,3%, respectivamente; a última atingindo pico de 30% em outubro. A espécie do agente causal não foi elucidada, mas foi demonstrada a associação com o gênero Pseudomonas, o que já fornece subsídios para o desenvolvimento de métodos de controle da doença.

The death of flowers in European pear (Pyrus communis L.) orchards was observed in Vacaria, State of Rio Grande do Sul, Brazil. Two bacterial isolates, obtained from symptomatic flowers, reproduced these symptoms on flowers of detached branches and were identified as Pseudomonas sp. Considering the lack of reports of this disease in Brazil, the record of P. syringae pv. syrigae and Erwinia amylovora associated with similar symptoms in other countries and the possible presence of these bacteria in buds, a method to detect the three bacteria was developed. The method comprised: bud maceration with liquid nitrogen, addition of PBS and 2% PVP, transfer of juice to FTA cards (Whatman), treatment of card circles with 70% ethanol, TE buffer and FTA reagent, elution of DNA followed by PCR with specific primers for each bacterium. The method was further used to monitor these bacteria in buds collected bimonthly during 2008. E. amylovora was not detected. The average frequency of P. syringae pv. syringae and Pseudomonas sp. was 0.7 and 16.3%, respectively, the latter showing a frequency peak of 30% in October. The species of the causal agent was not made clear, but the association with the genus Pseudomonas was demonstrated, which already provides a basis for the development of methods for disease control.

Objetivou-se avaliar a degradação in situ da matéria seca, proteína bruta e fibra em detergente neutro de silagens de capim-elefante contendo cinco níveis (0; 4; 8; 12 e 16%, com base na matéria natural da massa ensilada) de inclusão do subproduto do grão do urucum (SGU). O delineamento utilizado foi inteiramente casualizado em parcelas subdivididas, sendo os níveis de adição às parcelas e os tempos de incubação as subparcelas, com quatro repetições. Para a confecção da silagem, foi utilizado capim-elefante cortado aos 70 dias de crescimento e misturado ao subproduto, armazenado em 20 tambores. As amostras foram pré-secas, moídas em moinho, com peneira de 5 mm, colocado 3 g de amostra em sacos de náilon, para incubação no rúmen por 0; 6; 48 e 96 horas em 2 ovinos sem padrão racial definido, machos e castrados. Observou-se um aumento no desaparecimento da MS até o nível 13,37% de adição de SGU à ensilagem de capim-elefante para 48 horas de incubação. Para a FDN o desaparecimento com 96 horas de incubação aumentou até 16% de adição. Para o conjunto de parâmetros de degradação estudado, observou-se que o nível de inclusão de 16% do SGU apresentou maiores valores para a degradabilidade potencial e efetiva das variáveis em questão. A inclusão do subproduto do grão do urucum à ensilagem de capim-elefante resulta em silagens com maior degradabilidade potencial e efetiva.

To evaluate the dry matter, neutral detergent fiber and crude protein in situ degradation of elephant grass silages with five levels (0; 4; 8; 12 and 16%, on a fresh matter basis) of annatto grain by-product (AGBP), this work was carried out. A split-plot design, consisting on the addition levels the plots and the incubation times the sub-plots, with four replicates, was adopted. For the silages making, the elephant grass was cut 70 days-old and mixed to the by-product, in 20 plastic drums. The samples were dried, grid in a bolter of 5 mm mesh, being used 3 g of samples in each nylon bag, for incubation in the rumem for 0; 6; 48 e 96 hours; 2 ram without defined breed were used. Was observed increased the disappearance of the DM until the level 13.37% of addition of (AGBP) the elephant grass silages for the incubation time 48 hours, this level was that presented the most disappearance DM. For the NDF the disappearance increased until 16% of addition. For the whole of parameters of degradation, was observed that the level of addition of 16% of (AGBP) presented the most values for the potential and effective degradability of variables in question. The inclusion of the annatto grain by-product for elephant grass silage results in greater potential and effective degradability.

A eficácia de três estirpes de Clonostachys rosea no controle do mofo cinzento (MC) em fúcsia (Fuchsia speciosa) foi comparada. Em experimento em estufa em Porto Alegre, RS, a incidência do MC foi reduzida em 40, 73 e 80% com a aplicação das estirpes GSAL, GFO4 e G8 de C. rosea, em 2004, e em 83, 89 e 94%, respectivamente, em 2005. Em experimentos em estufa comercial de mudas em Vacaria, RS, nos dois anos, as plantas foram aspergidas semanalmente com: (1) com água + espalhante adesivo (0,01%); (2) aplicação sequencial com clorotalonil, folpet, oxicloreto de cobre, mancozeb, iprodione e thiram, a partir de 26 dias do plantio; (3) suspensão de conídios da estirpe GFO4, 39 vezes a partir dos 26 dias do transplantio; e (4) suspensão de GFO4, 29 vezes a partir dos 61 dias do transplantio. A redução da incidência e da severidade do MC nos tratamentos com C. rosea se equivaleu ao com fungicidas, sem efeito na fotossíntese ou condutância estomática. O número de mudas obtidas de plantas tratadas com C. rosea e fungicidas foi superior à testemunha em 2005.

The efficacy of three strains of C. rosea in the control of Gray Mold (GM) in fuchsia was compared. In a greenhouse experiment conducted in Porto Alegre, RS, the incidence of GM was reduced by 40, 73, and 80% with application of strains GSAL, GFO4, and G8 in 2004, and by 83, 89 and 94%, respectively, in 2005. Other experiments were conducted in the same years in a commercial crop of fuchsia grown from cuttings in a greenhouse in Vacaria, RS. The plants were sprayed weekly, as follows, with: (1) water plus a wetting agent, 0.01% (control); (2) chlorothalonil, folpet, copper, mancozeb, iprodione, and thiram beginning at 26 days after transplanting; (3) a conidial suspension of strain GFO4 of C. rosea applied 39 times beginning at 26 days after transplanting, and (4) GF04 conidial suspensions applied 29 times beginning at 61 days after transplanting. C. rosea reduced the incidence and severity of GM to levels similar to those in the fungicide-treated plants, and did not affect photosynthesis or stomatic conductance. The number of cuttings obtained from plants treated with C. roseum and fungicides was higher than the control in 2005.

Objetivou-se avaliar a composição químico-bromatológica, a digestibilidade e a degradação in situ da matéria seca da dieta consumida por ovinos em pastagem de Panicum maximum cv. tanzânia sob três frequências de desfolhação, determinadas pela interceptação da radiação fotossinteticamente ativa (IRFA) de 85, 95 e 97% no 1º e 4º dias de pastejo. O delineamento experimental foi inteiramente casualizado com arranjo fatorial 3 × 2 (três frequências de desfolhação e dois dias de pastejo), com quatro repetições (piquetes) por tratamento. Para determinação da composição químico-bromatológica e da digestibilidade e ensaio de cinética de degradação da matéria seca da dieta, foi realizada uma simulação de pastejo no 1º e 4º dias de ocupação. A diminuição da frequência de desfolhação piorou a composição químico-bromatológica, a digestibilidade e a degradação do capim-tanzânia. Recomenda-se frequência de desfolhação no capim-tanzânia menor ou igual a 95% de interceptação da radiação fotossinteticamente ativa visando à manutenção da qualidade do pasto.

The objective of this study was to evaluate the chemical composition, digestibility and in situ degradation of dry matter of the diet consumed by sheep grazing on Panicum maximum cv. Tanzania under three defoliation frequencies, determined by the interception of the photosynthetically active radiation in the canopy (PAR) of 85, 95 and 97% on the first and fourth days of the grazing period. A randomized complete design in a 3 × 2 factorial arrangement (three defoliation frequencies and two days grazing), with four replications (poles). To determine the chemical composition, digestibility and an in situ dry matter degradation trial, a grazing simulation was carried out on the 1st and 4th days. Reduced defoliation frequency decreased the chemical composition, digestibility and in situ degradation of the diet. Thus defoliation frequency of tanzania grass is recommended of less or equal to 95% photosynthetically active radiation to maintain pasture quality.

O objetivo deste trabalho foi identificar as raças de Venturia inaequalis existentes no Sul do Brasil. Plantas e folhas destacadas de macieiras foram inoculadas por aspersão e as últimas também pela deposição de quatro gotas de suspensão conidial (2,5 x 10(5) conídios.mL-1). Quatro isolados coletados no Estado do Rio Grande do Sul e cinco em Santa Catarina, durante 2005, foram avaliados. Após a inoculação, as plantas foram incubadas por 48 h, no escuro, 90-100% de umidade e 16-20ºC, e, após, mantidas em casa de vegetação. As folhas destacadas, mantidas em ágar-água, foram inoculadas por aspersão e incubadas a 17ºC, no escuro, por 48 h. Após este período, foram secadas no ambiente e incubadas juntamente com as folhas destacadas inoculadas por gotas, a 19ºC, com 18 h de fotoperíodo. As avaliações foram feitas após 20 dias da inoculação. O padrão de sintomas permitiu concluir que os nove isolados são da raça 1. Estes resultados foram semelhantes aos obtidos com folhas destacadas inoculadas por aspersão, o que não ocorreu com as inoculadas por gotas. Este é o primeiro relato de identificação de raças de V. inaequalis presentes no Brasil e na América do Sul.

This study aims to identify races of V. inaequalis present in the apple-growing regions of Southern Brazil. Apple plants and detached leaves were inoculated by spraying and also by using four drops of inoculum (2.5 x 10(5) conidia.mL-1) on the surface of each leaf. Four fungal isolates from Rio Grande do Sul and five from Santa Catarina State, 2005 season, were used. Following inoculation, the plants were incubated in a controlled environment (RH 90-100%, 16-20 ºC, darkness) for 48 h and then moved to the greenhouse. Sprayed leaves were maintained in agarized water medium and incubated for 48 h in the dark at 17ºC. Afterwards, leaves were dried off and incubated together with the single-drop-inoculated detached leaves, under conditions of 19ºC and 18 h of light. Evaluations were made 20 days after inoculation. The pattern of symptoms led to a conclusion that the nine isolates were of race 1. The same was observed on the spray-inoculated detached leaves but not with the single-drop inoculation method. This is the first report of the presence of race 1 of V. inaequalis in South America.

Os objetivos deste estudo foram avaliar o progresso da murcha bacteriana, a resistência do clone MB 03, selecionado para a raça 1 em Brasília, e detectar a presença do patógeno em tubérculos colhidos de plantas assintomáticas. Durante a primavera (setembro a final de novembro no hemisfério sul) de 1999 e 2000, 14 cultivares ou clones foram cultivados num campo naturalmente infestado com R. solanacearum biovar 2, em Caxias do Sul, RS. O número de plantas com sintomas de murcha foi registrado semanalmente para a obtenção da curva de progresso da doença. Para comparar a resistência dos genótipos de batata à murcha bacteriana foi calculada a área sob a curva de progresso da doença. Dentre os modelos avaliados para ajuste das curvas, o modelo logístico foi o que melhor se ajustou. Ao final das avaliações, em cada período de cultivo, os tubérculos produzidos por plantas assintomáticas foram coletados e armazenados até o início da brotação, quando foram submetidos a testes para detectar a presença de R. solanacearum. A cultivar Cruza 148 e o clone MB 03 foram os genótipos mais resistentes, mas ambos apresentaram tubérculos com infecções latentes. As implicações epidemiológicas da incidência de R. solanacearum raça 3 em lavouras de batata, bem como da resistência de determinados genótipos que podem propiciar tubérculos com infecções latentes, são aspectos de importância para o manejo integrado da murcha bacteriana no RS.

The objectives of this study were to evaluate the progress of Ralstonia solanacearum bacterial potato wilt biovar 2 (race 3) in 14 potato (Solanum tuberosum L.) cultivars or clones, the resistance of potato clone MB 03 (selected in Brasília, Brazil) to race 1 of R. solanacearum, and the occurrence of the pathogen in tubers harvested from asymptomatic potato plants. During the spring (September to the end of November in the southern hemisphere) of 1999 and 2000, 14 cultivars or clones were grown in a field naturally infested with R. solanacearum biovar 2, in Caxias do Sul, RS. The number of wilted potato plants was recorded each week and a disease progress curve plotted, the resistance of the potato genotypes to bacterial wilt being evaluated by determining the area under the curve. Various models were evaluated to fit the curves, with the logistic model being the best fit. At the end of each growing season tubers produced by asymptomatic plants were harvested and stored until budding and then tested for the presence of R. solanacearum. Cultivar Cruza 148 and clone MB 03 were the most resistant but both showed tubers with latent infections. The epidemiological implications of the incidence of R. solanacearum biovar 2 (race 3) in potato crops, as well as the resistance of certain genotypes that may harbor latent infections, are important aspects to be considered in the integrated management of bacterial wilt.

Objetivou-se neste trabalho avaliar o efeito dos fitorreguladores CPPU (N-2-cloro-4-piridil -N-feniluréia), Promalina (GA4+7 + BA), Benziladenina (BA) e Thidiazuron, aplicados no período entre a plena floração e a queda a de pétalas em macieiras cv. Fuji, sobre a incidência de podridão carpelar, na safra de 2001-2002 e 2002-2003. A área experimental constituiu-se de macieiras da cv Fuji/EM-9, plantio 1994 em Vacaria-RS. Foram avaliadas características de formato dos frutos e a incidência de sinais e sintomas da podridão carpelar. O Thidiazuron e a Promalina aumentaram a presença de sinais de fungos nas sementes no ciclo de 2001-2002. Houve influência de tratamentos com fitorreguladores sobre a expressão dos sintomas da podridão carpelar tanto nas maçãs caídas das plantas como naquelas avaliadas após três meses de frigoconservação nos dois ciclos vegetativos avaliados.

The objective of the present study was to evaluate the effects of CPPU (N-2-cloro-4-piridil)-N-phenylurea), Promalin (GA4+7 + BA), Benzyladenine (BA) and Thidiazuron, sprayed on "Fuji" apple trees at full bloom stage, on the incidence of moldy core, in the 2001/2002 and 2002/2003 seasons. The experimental area was a Fuji/EM-9 apple orchard, established in 1994 in Vacaria / RS. The apples were evaluated for fruit shape and moldy core incidence. During 2001, the seeds of carpel of apples treated with Thidiazuron and Promalin showed more fungi colonization than the control fruit. There were significant differences between treatments on moldy core rot incidence as well as in preharvest dropped apples and in apples evaluated after three months of cold storage, during the two evaluation seasons.

O objetivo deste trabalho foi identificar as bactérias pectolíticas envolvidas na podridão-mole de raízes de mandioquinha-salsa no Brasil. De 1998 a 2001, 227 isolados de Erwinia spp. foram obtidos de raízes de mandioquinha-salsa e identificados por testes bioquímicos e fisiológicos (atividade pectolítica, lecitinase, a-methyl glucosídeo, fosfatase, sensibilidade à eritromicina, crescimento a 37ºC). Destes isolados, 89,9% foram identificados como E. chrysanthemi (Ech), 9,7% como E. carotovora subsp. carotovora (Ecc) e somente 0,5% como E. carotovora subsp. atroseptica. A identidade de 20 isolados representativos de Ech e Ecc foi confirmada por PCR (primers '149f', 'L1r', 'ADE1', 'ADE2'), com exceção de dois isolados de Ech e um de Ecc.

The objetive of this work was to identify the pectolytic bacteria associated with soft rot of arracacha roots in Brazil. From 1998 to 2001, 227 isolates of Erwinia spp. were obtained from arracacha roots and identified by biochemical and physiological tests (pectolytic activity, lecithinase, a-methyl glucoside, phosphatase, erythromycin sensivity, growth at 37ºC). Of these isolates, 89.9% were identified as E. chrysanthemi (Ech), 9.7% as E. carotovora subsp. carotovora (Ecc) and 0.5% as E. carotovora subsp. atroseptica. The identity of seventeen out of twenty representative isolates of Ech and Ecc was confirmed by PCR (primers '149f', 'L1r', 'ADE1', 'ADE2').

Pectobacterium carotovorum subsp. brasiliensis foi proposta como o principal agente causal da canela preta da batata (Solanum tuberosum) no Brasil. Com o objetivo de identificar essa subespécie, oligonucleotídeos iniciadores foram selecionados a partir de regiões heterólogas do gene recA existentes entre P. carotovorum subsp. brasiliensis ATCC BAA-41 e outras pectobactérias disponíveis no GenBank e P. carotovorum subsp. carotovorum BAB1. No entanto, os oligonucleotídeos iniciadores apresentaram baixa especificidade. O produto da PCR do gene recA, um fragmento de ± 730 pb, de 38 estirpes de P. chrysanthemi e das diferentes subespécies de P. carotovorum, foi digerido com as endonucleases de restrição TasI e HhaI. Estas enzimas foram selecionadas com base na seqüência do gene recA das estirpes P. carotovorum subsp. brasiliensis ATCC BAA-416 (581 pb) e P. carotovorum subsp. carotovorum BAB1 (626 pb). A análise do PCR-RFLP com as enzimas TasI e HhaI gerou sete e 12 padrões, respectivamente. A combinação dos resultados permitiu a separação em 13 grupos distintos e a discriminação de P. carotovorum subsp. brasiliensis.

Pectobacterium carotovorum subsp. brasiliensis has been proposed to be the major causal agent of blackleg of potato (Solanum tuberosum) in Brazil. In order to identify this subspecies, primers were selected from heterologous regions of recA genes present in P. carotovorum subsp. brasiliensis ATCC BAA-41, P. carotovorum subsp. carotovorum BAB1, and other DNA sequences of pectobacteria available in the GenBank. These primers, however, showed low specificity. The recA gene PCR product, a DNA fragment of ± 730 bp, from 38 strains of P. chrysanthemi, subspecies of P. carotovorum, was digested with TasI and HhaI restriction enzymes. These enzymes were selected based on the sequences of recA gene from strains of P. carotovorum subsp. brasiliensis ATCC BAA-416 (581 pb) and P. carotovorum subsp. carotovorum BAB1 (626 pb). The restriction fragment length polymorphism (PCR-RFLP) analysis with TasI and HhaI enzymes generated seven and 12 patterns, respectively. Analysis of the combined results allowed for the separation of 13 distinct groups and differentiation of P. carotovorum subsp.brasiliensis.

Considerado como um dos mais sérios patógenos da batata (Solanum tuberosum), em regiões de clima tropical, subtropical, assim como em zonas mais quentes de clima temperado, Ralstonia solanacearum é uma espécie com significativa diversidade genética. Ela é caracterizada em um sistema binário de raças e biovares, com base nas espécies hospedeiras e na capacidade de utilizar diferentes fontes de carbono. A tentativa de utilizar a resistência genética como forma de controle de R. solanacearum não tem demonstrado estabilidade, devido a alterações climáticas nas diferentes regiões e a variabilidade das estirpes do patógeno. Devido às características epidemiológicas diferentes para essas biovares, estirpes da biovar 2 são mais factíveis de serem erradicadas em um sistema de controle integrado. Em um levantamento realizado em quatro regiões produtoras de batata do Rio Grande do Sul, foram obtidos isolados de R. solanacearum de 25 lavouras de dez municípios. Após a análise bioquímica dos isolados verificou-se a presença das biovares 1 e 2, com predominância da última. Os isolados obtidos foram submetidos à avaliação da variabilidade genética por PCR, utilizando seqüências repetitivas ERIC e BOX e oligonucleotídeos aleatórios (RAPD). A PCR-ERIC e BOX puderam diferenciar claramente as biovares 1 e 2. Porém, ambas não detectaram variabilidade entre isolados da biovar 2 e apenas PCR-BOX detectou variabilidade entre isolados da biovar 1. Já através de RAPD demonstrou-se claramente a separação das biovares verificando-se que os mesmos apresentam um perfil característico dependente da região da qual os isolados foram obtidos.

Considered one of the most important potato (Solanum tuberosum) pathogens in tropical and subtropical regions, as well as in temperate regions with warmer climate, Ralstonia solanacearum is a species with significant genetic diversity. It has been characterized in a binary system of races and biovars based on the range of host species and on the ability to use carbon sources. The attempts to use genetic resistance as a strategy to control R. solanacearum were shown to be unstable due to climatic changes in different regions and due to the variability of the pathogenic strains. Due to different epidemiological characteristics of the biovars, strains of biovar 2 are more likely to be eradicated in an integrated control system. In a survey performed in four regions where potato is produced in Rio Grande do Sul, isolates of R. solanacearum were obtained from 25 crop fields in ten municipalities. The biochemical analyses of the isolates revealed the occurrence of biovars 1 and 2, the latter being predominant. The isolates obtained were evaluated for their genetic variability by PCR, using repetitive sequences ERIC and BOX and random primers (RAPD). The PCR-ERIC and BOX were able to clearly differentiate the biovars 1 and 2. However, neither analysis was able to demonstrate variability among isolates of biovar 2 and only PCR-BOX showed some degree of variability among isolates of biovar 1. The amplification by RAPD demonstrates the distinction between the biovars and revealed that they show characteristic profiles that are closely related to the region where they were obtained.