Abstract At present, studies of biological control agents of microbial origin (BCA-M) have mainly focused on their taxonomic characterization, through the use of conventional molecular markers, and the in vitro evaluation of modes of action, or under greenhouse conditions, but limitedly under field conditions. Furthermore, recent bioprospecting studies of BCA of microbial origin mainly focus on Trichoderma, Paecilomyces, Beauveria, Pseudomonas, and Bacillus. Even when the research developed in Mexico on this topic has been active during the last years, the development and innovation of greater variety of registered and currently commercialized biopesticides need to be improved. In this context, the use of cut-edge techniques in the era of omics sciences (genomics, transcriptomics, and metabolomics) focused on the correct taxonomic affiliation of BCA-M, as well as their modes of action and ecology in agro-ecosystems, will expand the bioprospecting and extensive use of these BCA in a more efficient, biosafety, and cost-effective manner. In the framework of the international celebration of plant health, this review critically analyzes the knowledge status of the aspects that limit the bioprospecting and extensive use of BCA-M, mainly in Mexico, from the application of omics sciences for the identification, selection, and study of action mechanisms of those agents until the dissemination and socialization of the generated scientific knowledge. The foregoing is intended to promote reflection on this field of knowledge and encourage the new generation BCA-M with a holistic and systemic vision for the benefit of sustainable and resilient agriculture.
Resumen Actualmente, los estudios sobre agentes de control biológico de origen microbiano (ACB-M) generalmente están enfocados en la caracterización taxonómica mediante el uso de marcadores moleculares convencionales y en evaluar la capacidad antagónica/mecanismos de acción in vitro, en invernadero y eventualmente bajo condiciones de campo. Los ACB-M se centran principalmente en cepas de Trichoderma, Paecilomyces, Beauveria, Pseudomonas y Bacillus. Aunque la investigación en México en este campo ha sido muy activa en los últimos años, el desarrollo e innovación de una mayor diversidad de bioplaguicidas registrados y comercializados puede ser potenciada. En este contexto, el uso de técnicas vanguardistas en la era de las ciencias ómicas (genómica, transcriptómica, y metabolómica) enfocadas a la correcta afiliación taxonómica de los ACB-M y en el estudio de mecanismos de acción y comportamiento agroecológico es determinante para la bioprospección y uso extensivo de estos ACB-M de manera eficaz, biosegura y costo-efectiva. En el marco de la celebración internacional de la sanidad vegetal, la presente revisión analiza críticamente el estado del conocimiento y de aquellos aspectos que limitan la bioprospección y el uso extensivo de ACB-M con énfasis en México, desde la aplicación de las ciencias ómicas para la identificación, selección y estudio de los mecanismos de acción de dichos agentes hasta la difusión y socialización del conocimiento científico generado. Se pretende promover la reflexión sobre este campo del conocimiento e incentivar la nueva generación ACB-M con una visión holística y sistémica en beneficio de una agricultura sustentable y resiliente.