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Differences in phosphatemia and frequency of consumption of dietary sources of phosphorus in hemodialysis patients in southern and northern Brazil
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Nerbass, Fabiana Baggio

; Canzi, Edcléia Regina

; Araujo, Renata dos Anjos

; Corrêa, Dyane

; Santos, Rafaela Gonzaga dos

; Vieira, Marcos Alexandre

; Morais, Jyana Gomes

Brazilian Journal of Nephrology

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Mar 2019, Volume 41 Nº 1 Páginas 83 - 88

Resumo: Pt En | Texto: Pt En | PDF: Pt | PDF: En

Resumo Introdução: A hiperfosfatemia está associada a desfechos desfavoráveis, e o percentual de pacientes que apresentam essa condição em unidades de hemodiálise (HD) de uma mesma instituição no estado de Santa Catarina (SC) é historicamente maior que o de pacientes do estado do Tocantins (TO). Objetivo: Conhecer a frequência do consumo das principais fontes dietéticas de fósforo e compará-las entre os dois estados. Metodologia: Estudo transversal do qual participaram 123 pacientes, 66 de SC e 57 do TO: 52% homens; idade=46,9±15,7 anos; tempo de HD=48 (57-71) meses. Foi aplicado um questionário de frequência alimentar (QFA) com 33 itens, fontes dietéticas de fósforo. Uma pontuação de consumo foi calculada para fontes de fósforo orgânico, inorgânico e total, e obtida a média semestral da fosfatemia. Resultados: A média da fosfatemia dos pacientes de SC foi maior (6,2±1,5 vs 4,7±1,3 mg/dl; p<0001), bem como a prevalência de hiperfosfatemia (62% vs 28%; p<0001). Na amostra total, os alimentos mais frequentemente consumidos foram leite e feijão. Comparando a frequência de consumo entre os dois estados, houve diferença significativa em 17 itens. Em TO, maior frequência de consumo de carne bovina e feijão, e em SC, de outros quatorze itens do QFA (carne suína, embutidos, laticínios, etc.). A fosfatemia se correlacionou com a pontuação de frequência de consumo de fontes de fósforo inorgânico. Conclusão: a frequência de consumo de vários itens foi diferente entre os estados, e esse achado pode ser uma das razões que explicam as disparidades na fosfatemia entre as duas regiões.

Abstract Introduction: Hyperphosphatemia is associated with unfavorable outcomes, and the percentage of patients presenting with this condition in hemodialysis (HD) in kidney foundation units in the state of Santa Catarina (SC) is historically higher than that of patients in the state of Tocantins (TO). Objective: To assess the frequency of consumption of the main dietary sources of phosphorus and to compare them between the two states. Methodology: A cross-sectional study was carried out involving 123 patients, 66 of SC and 57 of TO: 52% were men, average age was 46.9 ± 15.7 years, and mean HD time 48 (57-71) months. A food frequency questionnaire (FFQ) with 33 items that are dietary sources of phosphorus was applied. A consumption score was calculated for sources of organic, inorganic, and total phosphorus, and the six-month average of phosphatemia was obtained. Results: The mean phosphatemia of SC patients was higher (6.2 ± 1.5 vs 4.7 ± 1.3 mg/dL, p <0001) than TO patients, as well as the prevalence of hyperphosphatemia (62% vs 28%; p <10001). In the total sample, the foods most frequently consumed were milk and beans. Comparing the frequency of consumption between the two states, a significant difference was found in 17 items. In TO, beef and beans were the foods most frequently consumed, and in SC, fourteen other items of the FFQ (pork, sausages, dairy products, etc.) were the most frequently consumed. Phosphatemia correlated with the frequency of consumption of inorganic phosphorus sources. Conclusion: the frequency of consumption of several items was different between the states, and this explains the differences in phosphatemia between the two regions.

https://doi.org/10.1590/2175-8239-jbn-2018-0063 1357 downloads

Integração da atenção básica à rede assistencial: análise de componentes da avaliação externa do PMAQ-AB
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Chaves, Lenir Aparecida

; Jorge, Alzira de Oliveira

; Cherchiglia, Mariangela Leal

; Reis, Ilka Afonso

; Santos, Marcos Antônio da Cunha

; Santos, Alaneir de Fátima

; Machado, Antônio Thomaz Gonzaga da Matta

; Andrade, Eli Iola Gurgel

Cadernos de Saúde Pública

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2018, Volume 34 Nº 2 elocation e00201515

Resumo: Pt En Es | Texto: Pt En Es | PDF: Pt | PDF: En | PDF: Es

Estudo transversal que avalia a integração entre a atenção básica e a rede assistencial do Sistema Único de Saúde (SUS), por meio do Modelo de Resposta Gradual da Teoria de Resposta ao Item. Com base nos dados de 17.202 equipes que participaram do Programa Nacional de Melhoria do Acesso e da Qualidade da Atenção Básica (PMAQ-AB), 2012, foram mensurados gradientes de integração para identificar o perfil das equipes por nível de integração. Os resultados demonstram que os itens referentes às ações de apoio matricial - consultas médicas; discussão de caso; ação clínica compartilhada; construção conjunta de projetos terapêuticos; atividade de educação permanente; discussão processo trabalho; intervenções no território e realização de visita com profissionais de atenção básica - melhoram o desempenho das equipes de atenção básica. Dispositivos de comunicação entre as equipes reforçam esse entendimento. Contudo, a frequência em torno de 50% de respostas associadas ao pior cenário para alguns itens do estudo, evidenciou a necessidade de qualificação da integração entre as ações de atenção básica e especializada para a consolidação de uma atenção primária à saúde abrangente.

This cross-sectional study examined the integration of primary care in the healthcare network of the Brazilian Unified National Health System (SUS), using the Gradual Response Model of Item Response Theory. Based on data from 17,202 teams that participated in the National Program for Access and Quality Improvement in Primary Care (PMAQ-AB, 2012), we measured gradients of integration to identify the teams’ profile by level of integration. The results show that the items pertaining to matrix support measures (medical consultations, case discussions, shared clinical action, joint elaboration of therapeutic projects, permanent educational activities, work process discussions, interventions in the territory, and visits with primary care professionals) improved the performance of primary care teams. Communications devices between teams reinforced this understanding. Still, the approximately 50% of answers associated with the worst scenario for some study items evidenced the need to upgrade the integration between primary care activities and specialized care for the consolidation of comprehensive primary healthcare.

Estudio transversal que evalúa la integración entre la atención básica y la red asistencial del Sistema Único de Salud brasileño, mediante el Modelo de Respuesta Gradual de la Teoría de Respuesta al Ítem. En base a los datos de 17.202 equipos que participaron en el Programa Nacional de Mejora del Acceso y Calidad de la Atención Básica (PMAQ-AB), 2012, se midieron gradientes de integración para identificar el perfil de los equipos por nivel de integración. Los resultados demuestran que los ítems referentes a las acciones de apoyo matricial - consultas médicas; discusión de caso; acción clínica compartida; construcción conjunta de proyectos terapéuticos; actividad de educación permanente; discusión del proceso de trabajo; intervenciones en el territorio y realización de visita con profesionales de atención básica - mejoran el desempeño de los equipos de atención básica. Los dispositivos de comunicación entre los equipos refuerzan este entendimiento. No obstante, la frecuencia en torno a un 50% de respuestas asociadas al peor escenario para algunos ítems del estudio, evidenció la necesidad de cualificación de la integración entre las acciones de atención básica y especializada para la consolidación de una atención primaria a la salud lo más extensa posible.

https://doi.org/10.1590/0102-311x00201515 140 downloads

Integração da atenção básica à rede assistencial: análise de componentes da avaliação externa do PMAQ-AB
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; Jorge, Alzira de Oliveira

; Cherchiglia, Mariangela Leal

; Reis, Ilka Afonso

; Santos, Marcos Antônio da Cunha

; Santos, Alaneir de Fátima

; Machado, Antônio Thomaz Gonzaga da Matta

; Andrade, Eli Iola Gurgel

Cadernos de Saúde Pública

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2018, Volume 34 Nº 2 elocation e00201515

Resumo: Pt En Es | Texto: Pt En Es | PDF: Pt | PDF: En | PDF: Es

https://doi.org/10.1590/0102-311x00201515 4515 downloads

Care coordination in PMAQ-AB: an Item Response Theory-based analysis
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Souza, Miriam Francisco de

; Santos, Alaneir de Fatima dos

; Reis, Ilka Afonso

; Santos, Marcos Antônio da Cunha

; Jorge, Alzira de Oliveira

; Machado, Antônio Tomaz Gonzaga da Matta

; Andrade, Eli Iola Gurgel

; Cherchiglia, Mariangela Leal

Revista de Saúde Pública

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2017, Volume 51 elocation 87

Resumo: Pt En | Texto: Pt En | PDF: Pt | PDF: En

RESUMO OBJETIVO Analisar a qualidade das variáveis do Programa de Melhoria do Acesso e da Qualidade da Atenção Básica para avaliar a coordenação na atenção básica do cuidado. MÉTODOS Estudo transversal baseado em dados de 17.202 equipes de atenção básica que participaram do Programa de Melhoria do Acesso e da Qualidade da Atenção Básica em 2012. Baseado na Teoria de Resposta ao Item, o Modelo de Resposta Gradual de Samejima foi utilizado para estimação do escore relacionado ao nível de coordenação. Os coeficientes alfa de Cronbach, Spearman e ponto bisserial foram utilizados para análise da consistência interna e da correlação entre os itens e de itens com o escore total. Foram avaliadas as suposições de unidimensionalidade e de independência local dos itens. Gráficos do tipo nuvem de palavras auxiliaram na interpretação dos níveis de coordenação. RESULTADOS Os itens do Programa com maior discriminação do nível de coordenação foram: existência de telefone/internet, fluxos institucionais de comunicação e ações de apoio matricial. A frequência de contato de especialistas com a atenção básica e prontuário eletrônico integrado exigiram maior nível de coordenação das equipes. O coeficiente alfa de Cronbach total 0,8018. Os itens fluxos institucional de comunicação e telefone/internet tiveram maior correlação com o escore total. Os escores de coordenação variaram entre -2,67 (mínimo) e 2,83 (máximo). Maior grau de comunicação, troca de informações, apoio matricial, cuidado no território e domicílio tiveram peso relevante nos níveis de coordenação. CONCLUSÕES A capacidade de disponibilizar a informação e a frequência de contato entre os profissionais são elementos importantes para o cuidado abrangente, contínuo e de qualidade.

ABSTRACT OBJECTIVE Analyze the quality of the National Program for Primary Care Access and Quality Improvement variables to evaluate the coordination of primary care. METHODS A cross-sectional study based on data from 17,202 primary care teams that participated in the National Program for Primary Care Access and Quality Improvement in 2012. Based on the Item Response Theory, Samejima’s Gradual Response Model was used to estimate the score related to the level of coordination. The Cronbach’s alpha and Spearman’ coefficients and the point-biserial correlation were used to analyze the internal consistency and the correlation between the items and between the items and the total score. We evaluated the assumptions of unidimensionality and local independence of the items. Cloud-type word charts aided in the interpretation of coordination levels. RESULTS The Program items with the greatest discrimination in coordination level were: telephone/Internet existence, institutional communication flows, and matrix support actions. The specialists’ contact frequency with the primary care and integrated electronic medical record required a greater level of coordination among the teams. The Cronbach’ alpha was 0.8018. The institutional communication flows and telephone/Internet items had a higher correlation with the total score. Coordination scores ranged from -2.67 (minimum) to 2.83 (maximum). More communication, information exchange, matrix support, health care in the territory and the domicile had a significant influence on the levels of coordination. CONCLUSIONS The ability to provide information and the frequency of contact among professionals are important elements for a comprehensive, continuous and high-quality care.

https://doi.org/10.11606/s1518-8787.2017051007024 287 downloads

Care coordination in PMAQ-AB: an Item Response Theory-based analysis
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Souza, Miriam Francisco de

; Santos, Alaneir de Fatima dos

; Reis, Ilka Afonso

; Santos, Marcos Antônio da Cunha

; Jorge, Alzira de Oliveira

; Machado, Antônio Tomaz Gonzaga da Matta

; Andrade, Eli Iola Gurgel

; Cherchiglia, Mariangela Leal

Revista de Saúde Pública

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2017, Volume 51 elocation 87

Resumo: Pt En | Texto: Pt En | PDF: Pt | PDF: En

https://doi.org/10.11606/s1518-8787.2017051007024 1723 downloads

Effects of exercise training with blood flow restriction on blood pressure in medicated hypertensive patients
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Cezar, Marcos Antônio

; De Sá, Clodoaldo Antônio

; Corralo, Vanessa da Silva

; Copatti, Sedinei Lopes

; Santos, Guilherme Augusto Gonzaga dos

; Grigoletto, Marzo Edir da Silva

Motriz: Revista de Educação Física

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Jun 2016, Volume 22 Nº 2 Páginas 9 - 17

Resumo: En | Texto: En | PDF: En

Abstract The development of non-pharmacological approaches to hypertension (HA) is critical for both prevention and treatment. This study examined the hemodynamic and biochemical responses of medicated hypertensive women to resistance exercise with blood flow restriction (vascular occlusion). Twenty-three women were randomly assigned to one of three groups: High intensity strength training (n = 8); low-intensity resistance exercise with occlusion (n = 8); and control (n = 7). The first two groups underwent eight weeks of training performed twice a week, including three series of wrist flexion exercises with or without vascular occlusion. The exercised with occlusion group showed pre- to post-test reduction in systolic and diastolic blood pressure, mean arterial pressure, and double product, whereas the other groups showed no significant hemodynamic changes. In conclusion, resistance exercise during 8 weeks was effective in lowering blood pressure in medicated hypertensive subjects.

https://doi.org/10.1590/S1980-6574201600020002 6065 downloads

Footprints of a trypanosomatid RNA world: pre-small subunit rRNA processing by spliced leader addition trans-splicing
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Mayer, Mario Gustavo

; Santos, Marcos Gonzaga dos

; Silva, Maria Fernanda Laranjeira da

; Floeter-Winter, Lucile Maria

Memórias do Instituto Oswaldo Cruz

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Jun 2012, Volume 107 Nº 4 Páginas 522 - 531

Resumo: En | Texto: En | PDF: En

The addition of a capped mini-exon [spliced leader (SL)] through trans-splicing is essential for the maturation of RNA polymerase (pol) II-transcribed polycistronic pre-mRNAs in all members of the Trypanosomatidae family. This process is an inter-molecular splicing reaction that follows the same basic rules of cis-splicing reactions. In this study, we demonstrated that mini-exons were added to precursor ribosomal RNA (pre-rRNA) are transcribed by RNA pol I, including the 5' external transcribed spacer (ETS) region. Additionally, we detected the SL-5'ETS molecule using three distinct methods and located the acceptor site between two known 5'ETS rRNA processing sites (A' and A1) in four different trypanosomatids. Moreover, we detected a polyadenylated 5'ETS upstream of the trans-splicing acceptor site, which also occurs in pre-mRNA trans-splicing. After treatment with an indirect trans-splicing inhibitor (sinefungin), we observed SL-5'ETS decay. However, treatment with 5-fluorouracil (a precursor of RNA synthesis that inhibits the degradation of pre-rRNA) led to the accumulation of SL-5'ETS, suggesting that the molecule may play a role in rRNA degradation. The detection of trans-splicing in these molecules may indicate broad RNA-joining properties, regardless of the polymerase used for transcription.

2558 downloads Citado 1 vez em SciELO

Correlation of meta 1 expression with culture stage, cell morphology and infectivity in Leishmania (Leishmania) amazonensis promastigotes
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Santos, Marcos Gonzaga dos

; Silva, Maria Fernanda Laranjeira da

; Zampieri, Ricardo Andrade

; Lafraia, Rafaella Marino

; Floeter-Winter, Lucile Maria

Memórias do Instituto Oswaldo Cruz

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Mar 2011, Volume 106 Nº 2 Páginas 190 - 193

Resumo: En | Texto: En | PDF: En

The parasitic protozoan Leishmania (Leishmania) amazonensis alternates between mammalian and insect hosts. In the insect host, the parasites proliferate as procyclic promastigotes andthen differentiate into metacyclic infective forms. The meta 1 gene is preferentially expressed during metacyclogenesis. Meta 1 expression profile determination along parasite growth curves revealed that the meta 1 mRNA level peaked at the early stationary phase then decreased to an intermediate level. No correlation was observed between meta 1 expression and infectivity. Conversely, infectivity correlated with the increase of apoptotic cells in the late stationary phase.

2319 downloads

Body composition and nutritional requirements of protein and energy for body weight gain of lambs browsing in a tropical semiarid region
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Silva, Aderbal Marcos de Azevêdo

; Santos, Ecileide Mamede dos

; Pereira Filho, José Morais

; Bakke, Olaf Andreas

; Gonzaga Neto, Severino

; Costa, Roberto Germano da

Revista Brasileira de Zootecnia

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Jan 2010, Volume 39 Nº 1 Páginas 210 - 216

Resumo: Pt En | Texto: Pt En | PDF: Pt | PDF: En

Este trabalho foi realizado com o objetivo de avaliar a composição corporal em gordura, proteína e energia e as exigências nutricionais para ganho de peso em cordeiros em sistema de pastejo na região semi-árida. Foram utilizados 32 cordeiros Santa Inês, castrados, com peso inicial de 15,8 kg ± 1,4 kg e idade variando entre 3 e 4 meses. Desses animais, oito cordeiros foram abatidos no início do experimento, como animais-referência, para determinação da composição corporal inicial na metodologia do abate comparativo. Os 24 animais remanescentes foram utilizados em delineamento em blocos casualizados, com três tratamentos e oito blocos. Cada um dos oito blocos experimentais foi composto inicialmente de três cordeiros de 15 kg, aos quais foram aplicados os tratamentos (0,0, 1,0 e 1,5% do peso vivo do animal de suplementação diária com mistura concentrada composta de fubá de milho, farelo de soja e mistura mineral, ajustada para ganho de peso médio diário estimado em 200 g) aleatoriamente designados. Quando um dos animais de cada lote atingiu 30 kg de peso, os três animais do lote foram abatidos. Os valores estimados de composição corporal variaram de 171,59 a 145,84 g de proteína/kg de peso do corpo vazio (PCV); 0,53 a 319 g de gordura/kg de PCV; e 2,06 a 3,90 Mcal/kg de PCV para animais de 15 a 30 kg de PCV. As exigências líquidas para ganho médio de 200 g/dia variaram de 25,99 a 22,09 g de proteína e de 0,311 a 0,591 Mcal de energia para animais de 15 a 30 kg de PV, respectivamente. Cordeiros Santa Inês em pastejo na região semi-árida necessitam de mais proteína e menos energia que cordeiros confinados em regiões temperadas ou confinados em áreas tropicais como reportado na literatura.

This study evaluated body fat, protein and energy contents and nutritional requirements for body weight (BW) gain of lambs in tropical semiarid conditions. Thirty-two castrated Santa Inês 3-to-4-month old lambs (initial BW: 15.8 kg ± 1.4 kg) were used. Eight lambs were initially slaughtered to serve as the reference for initial body weight composition. The remaining 24 animals were placed in a randomized block with three treatments and eight replications. Each one of the eight experimental blocks consisted initially of three 15 kg lambs to which treatments (daily supplement levels: 0.0, 1.0, and 1.5% of body weight of a corn, soybean and minerals concentrate mixture adjusted for a daily 200 g BW gain at 1.5% level) were randomly assigned. As one of the lambs reached 30 kg all three were slaughtered. Body composition (per kg of empty body weight - EBW), ranged from 171.59 to 145.84 g protein, from 0.53 to 319.00 g fat, and from 2,06 to 3,90 Mcal energy, for lambs from 15 to 30 kg EBW, respectively. Net requirements for 200 g BW gain/day ranged from 25.99 to 22.09 g protein and from 0.311 to 0.591 Mcal energy for lambs from 15 to 30 kg EBW, respectively. Santa Inês lambs browsing in tropical semiarid regions require more protein and less energy than lambs raised in temperate regions or kept in feedlots in tropical areas, as reported in the literature.

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10.

Etiologic diagnosis of bovine infectious abortion by PCR
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Silva, Teane Milagres Augusto da

; Oliveira, Raquel Gonzaga de

; Mol, Juliana Pinto da Silva

; Xavier, Mariana Noyma

; Paixão, Tatiane Alves da

; Cortez, Adriana

; Heinemann, Marcos Bryan

; Richtzenhain, Leonardo José

; Lage, Andrey Pereira

; Santos, Renato de Lima

Ciência Rural

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Dez 2009, Volume 39 Nº 9 Páginas 2563 - 2570

Resumo: Pt En | Texto: Pt En | PDF: Pt | PDF: En

Aborto infeccioso é uma causa significativa de falhas reprodutivas e perdas econômicas na bovinocultura. O objetivo deste estudo foi detectar ácidos nucleicos de vários agentes infecciosos reconhecidos como causadores de aborto, incluindo-se Arcanobacterium pyogenes, Herpesvirus bovino tipo 1, Brucella abortus, Campylobacter fetus subsp. venerealis, Chlamydophila abortus, Leptospira sp., Listeria monocytogenes, Salmonella sp., Mycoplasma bovis, Mycoplasma bovigenitalium, Neospora caninum e Tritrichomonas foetus. Homogenados de tecidos de 42 fetos e tecidos incluídos em parafina de 28 fetos e 14 placentas/endométrio foram incluídos neste estudo. Brucella abortus foi detectada em 14,2% (12/84) das amostras. DNA de Salmonella sp. foi amplificado de dois fetos e houve um feto positivo para Neospora caninum e outro para Listeria monocytogenes. Essa metodologia baseada em PCR resultou na identificação da etiologia em 19% das amostras ou 20% se considerados somente os tecidos fetais.

Infectious abortion is a significant cause of reproductive failure and economic losses in cattle. The goal of this study was to detect nucleic acids of several infectious agents known to cause abortion including Arcanobacterium pyogenes, Bovine Herpesvirus 1, Brucella abortus, Campylobacter fetus subsp. venerealis, Chlamydophila abortus, Leptospira sp., Listeria monocytogenes, Salmonella sp., Mycoplasma bovis, Mycoplasma bovigenitalium, Neospora caninum, and Tritrichomonas foetus. Tissue homogenates from 42 fetuses and paraffin-embedded tissues from 28 fetuses and 14 placentas/endometrium were included in this study. Brucella abortus was detected in 14.2% (12/84) of the samples. Salmonella sp. DNA was amplified from 2 fetuses, and there was one positive for Neospora caninum, and another for Listeria monocytogenes. This PCR-based approach resulted in identification of the etiology in 19% of samples, or 20% if considered fetal tissues only.

6150 downloads Citado 1 vez em SciELO

11.

Brazilian coffee genome project: an EST-based genomic resource
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Vieira, Luiz Gonzaga Esteves

; Andrade, Alan Carvalho

; Colombo, Carlos Augusto

; Moraes, Ana Heloneida de Araújo

; Metha, Ângela

; Oliveira, Angélica Carvalho de

; Labate, Carlos Alberto

; Marino, Celso Luis

; Monteiro-Vitorello, Claúdia de Barros

; Monte, Damares de Castro

; Giglioti, Éder

; Kimura, Edna Teruko

; Romano, Eduardo

; Kuramae, Eiko Eurya

; Lemos, Eliana Gertrudes Macedo

; Almeida, Elionor Rita Pereira de

; Jorge, Érika C.

; Albuquerque, Érika V. S.

; Silva, Felipe Rodrigues da

; Vinecky, Felipe

; Sawazaki, Haiko Enok

; Dorry, Hamza Fahmi A.

; Carrer, Helaine

; Abreu, Ilka Nacif

; Batista, João A. N.

; Teixeira, João Batista

; Kitajima, João Paulo

; Xavier, Karem Guimarães

; Lima, Liziane Maria de

; Camargo, Luis Eduardo Aranha de

; Pereira, Luiz Filipe Protasio

; Coutinho, Luiz Lehmann

; Lemos, Manoel Victor Franco

; Romano, Marcelo Ribeiro

; Machado, Marcos Antonio

; Costa, Marcos Mota do Carmo

; Sá, Maria Fátima Grossi de

; Goldman, Maria Helena S.

; Ferro, Maria Inês T.

; Tinoco, Maria Laine Penha

; Oliveira, Mariana C.

; Van Sluys, Marie-Anne

; Shimizu, Milton Massao

; Maluf, Mirian Perez

; Eira, Mirian Therezinha Souza da

; Guerreiro Filho, Oliveiro

; Arruda, Paulo

; Mazzafera, Paulo

; Mariani, Pilar Drummond Sampaio Correa

; Oliveira, Regina L.B.C. de

; Harakava, Ricardo

; Balbao, Silvia Filippi

; Tsai, Siu Mui

; Mauro, Sonia Marli Zingaretti di

; Santos, Suzana Neiva

; Siqueira, Walter José

; Costa, Gustavo Gilson Lacerda

; Formighieri, Eduardo Fernandes

; Carazzolle, Marcelo Falsarella

; Pereira, Gonçalo Amarante Guimarães

Brazilian Journal of Plant Physiology

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Mar 2006, Volume 18 Nº 1 Páginas 95 - 108

Resumo: Pt En | Texto: Pt En | PDF: Pt | PDF: En

O café é um dos principais produtos agrícolas, sendo considerado o segundo item em importância do comércio internacional de "commodities". O gênero Coffea pertence à família Rubiaceae que também inclui outras plantas importantes. Este gênero contém aproximadamente 100 espécies, mas a produção comercial é baseada somente em duas espécies, Coffea arabica e Coffea canephora, que representam aproximadamente 70 % e 30 % do mercado total de café, respectivamente. O Projeto Genoma Café Brasileiro foi desenvolvido com o objetivo de disponibilizar os modernos recursos da genômica à comunidade científica e aos diferentes segmentos da cadeia produtiva do café. Para isso, foram seqüenciados 214.964 clones escolhidos aleatoriamente de 37 bibliotecas de cDNA de C. arabica, C. canephora e C. racemosa representando estádios específicos do desenvolvimento de células e de tecidos do cafeeiro, resultando em 130.792, 12.381 e 10.566 seqüências de cada espécie, respectivamente, após processo de trimagem. Os ESTs foram agrupados em 17.982 contigs e em 32.155 singletons. A comparação destas seqüências pelo programa BLAST revelou que 22 % não tiveram nenhuma similaridade significativa às seqüências no banco de dados do National Center for Biotechnology Information (de função conhecida ou desconhecida). A base de dados de ESTs do cafeeiro resultou na identificação de cerca de 33.000 unigenes diferentes. Os resultados de anotação das seqüências foram armazenados em base de dados "online" em <A HREF="http://www.lge.ibi.unicamp.br/cafe">http://www.lge.ibi.unicamp.br/cafe</A>. Os recursos desenvolvidos por este projeto disponibilizam ferramentas genéticas e genômicas que podem ser decisivas para a sustentabilidade, a competitividade e a futura viabilidade da agroindústria cafeeira nos mercados interno e externo.

Coffee is one of the most valuable agricultural commodities and ranks second on international trade exchanges. The genus Coffea belongs to the Rubiaceae family which includes other important plants. The genus contains about 100 species but commercial production is based only on two species, Coffea arabica and Coffea canephora that represent about 70 % and 30 % of the total coffee market, respectively. The Brazilian Coffee Genome Project was designed with the objective of making modern genomics resources available to the coffee scientific community, working on different aspects of the coffee production chain. We have single-pass sequenced a total of 214,964 randomly picked clones from 37 cDNA libraries of C. arabica, C. canephora and C. racemosa, representing specific stages of cells and plant development that after trimming resulted in 130,792, 12,381 and 10,566 sequences for each species, respectively. The ESTs clustered into 17,982 clusters and 32,155 singletons. Blast analysis of these sequences revealed that 22 % had no significant matches to sequences in the National Center for Biotechnology Information database (of known or unknown function). The generated coffee EST database resulted in the identification of close to 33,000 different unigenes. Annotated sequencing results have been stored in an online database at <A HREF="http://www.lge.ibi.unicamp.br/cafe">http://www.lge.ibi.unicamp.br/cafe</A>. Resources developed in this project provide genetic and genomic tools that may hold the key to the sustainability, competitiveness and future viability of the coffee industry in local and international markets.

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