Resumo O Circovírus suíno tipo 2 (PCV2) é um importante patógeno para suínos e causador das doenças associadas a circovirose suína (PCVD). Apesar da PCVD ser controlada pelas vacinas comerciais, a sua apresentação está mudando. Além disso, o PCV2 está evoluindo geneticamente e novos genótipos foram identificados em suínos vacinados e não vacinados. O objetivo deste trabalho foi verificar a presença dos genótipos PCV2a, PCV2b e PCV2d em amostras previamente positivas para PCV2. Além disso, identificar coinfecções entre genótipos de PCV2 e/ou com PCV3, que também podem causar doenças em suínos, utilizando um teste de diagnóstico PCR rápido, eficaz e de baixo custo. Foram analisadas 333 amostras clínicas positivas para PCV2 por qPCR e provenientes de diferentes fases de produção e rebanhos do Brasil. Destas, 266 foram genotipadas, sendo o PCV2b o genótipo mais predominante (56,77% das amostras positivas), principalmente provenientes de animais da creche. O PCV2d também foi detectado em 33,10% das amostras, principalmente em suínos de terminação e porcas reprodutoras. O teste PCR utilizado neste estudo foi comparado a um kit comercial e foi eficaz na genotipagem do PCV2. Este estudo demonstrou a importância da genotipagem do PCV2 e que o PCV2b continua sendo o genótipo predominante responsável pela doença em granjas de suínos no Brasil. O PCV2a, genótipo mais comum utilizado nas vacinas comerciais, não foi detectado em nenhuma amostra analisada. Embora os suínos infectados com outros genótipos de PCV2 possam obter alguma proteção heteróloga das vacinas contra PCV2a, diagnósticos adequados e monitoria da vacina para atualizações devem ser considerados. PCV (PCV2 PCVD. . (PCVD) comerciais mudando disso PCV2a PCVa PCVb b PCVd d eou ou PCV3 rápido custo 33 Brasil Destas 26 genotipadas 56,77% 5677 56 77 (56,77 positivas, , positivas) creche 3310 10 33,10 reprodutoras analisada considerados (PCV (PCVD 3 56,77 567 5 7 (56,7 331 1 33,1 56,7 (56, 33, 56, (56 (5 (

Abstract Porcine circovirus type 2 (PCV2), an important pathogen in swine, causes PCV disease (PCVD). Although PCVD is effectively controlled using commercial vaccines, its clinical presentation is changing. Moreover, PCV2 is genetically evolving, with new genotypes emerging in vaccinated or unvaccinated pigs. In this study, we aimed to verify the presence of the PCV2a, PCV2b, and PCV2d genotypes in PCV-positive porcine samples. Furthermore, to identify coinfections between the PCV2 genotypes and/or PCV3, which can also induce disease in pigs, we employed a quick, effective, and low-cost PCR diagnostic test. In this study, 333 PCV2 PCR and clinically positive samples from various production stages and herds across Brazil were analyzed. Among these, 266 samples were genotyped, with PCV2b emerging as the most predominant genotype (56.77% of the positive samples), mainly observed in nursery pigs. PCV2d was also identified in 33.10% of the samples, primarily from finishing pigs and breeding sows. The employed PCR test was compared with a commercial kit, proving effective in PCV2 genotyping. This study demonstrates the significance of PCV2 genotyping, showing PCV2b as the most predominant genotype responsible for disease in pig farms in Brazil. PCV2a, the prevalent genotype used in commercial vaccines, was not detected in any of the analyzed samples. While pigs infected with other PCV2 genotypes may receive some heterologous protection from PCV2a vaccines, adequate diagnosis and vaccine monitoring for updates must be considered. PCV2, , (PCV2) swine PCVD. . (PCVD) vaccines changing Moreover evolving PCVa PCVb b PCVd d PCVpositive Furthermore andor PCV3 quick lowcost low cost 33 these 26 genotyped 56.77% 5677 56 77 (56.77 samples) 3310 10 33.10 sows kit genotyping considered (PCV2 (PCVD 3 56.77 567 5 7 (56.7 331 1 33.1 (PCV 56.7 (56. 33. 56. (56 (5 (

RESUMO: O incremento de resistência frente aos antimicrobianos, observado em bactérias isoladas de humanos e animais, tem sido motivo de preocupação mundial e levado ao monitoramento dos perfis de resistência em bactérias patogênicas e comensais. O objetivo desse estudo foi avaliar o perfil de resistência em Escherichia coli isolada de carcaças suínas e descrever a ocorrência de alguns genes de resistência relevantes. Um total de 319 isolados de E. coli foi testado quanto à suscetibilidade frente a diversos antimicrobianos. A presença de isolados produtores de β-lactamases (ESBL) de espectro estendido e β-lactamase induzível do tipo ampC foi também investigada. Dezoito cepas multirresistentes foram escolhidas para investigação de genes de resistência e caracterização por macro-restrição (PFGE). Os resultados demonstraram que a resistência a antimicrobianos está disseminada, pois 86,2% dos isolados de E. coli foram resistentes ao menos a um antimicrobiano e 71,5% apresentaram perfil de multirresistência. Uma cepa de E. coli produtora de ESBL e nenhuma produtora de ampC induzível foram identificadas. Os genes strA (n=15); floR (n=14);aac(3)-IVa (n=13); tetB (n=13); sul2 (n=12); tetA (n=11); aph(3’)Ia (n=8); sul3 (n=5) foram detectados por PCR. A análise de PFGE demonstrou que cepas de E. coli multirresistentes apresentaram similaridade inferior a 80% entre si. Concluiu-se que cepas multirresistentes de E. coli são frequentes em carcaças de suínos e apresentam uma alta diversidade genotípica, bem como de fenótipos e genes de resistência.

ABSTRACT: The increasing antimicrobial resistance observed worldwide in bacteria isolated from human and animals is a matter of extreme concern and has led to the monitoring of antimicrobial resistance in pathogenic and commensal bacteria. The aim of this study was to evaluate the antimicrobial resistance profile of Escherichia coli isolated from pig carcasses and to assess the occurrence of relevant resistance genes. A total of 319 E. coli isolates were tested for antimicrobial susceptibility against different antimicrobial agents. Moreover, the presence of extended-spectrum β-lactamase (ESBL) and inducible ampC-β-lactamase producers was investigated. Eighteen multi-resistant strains were chosen for resistance gene detection and PFGE characterization. The study showed that resistance to antimicrobials is widespread in E. coli isolated from pig carcasses, since 86.2% of the strains were resistant to at least one antimicrobial and 71.5% displayed multi-resistance profiles. No ampC-producing isolates were detected and only one ESBL-producing E. coli was identified. Genes strA (n=15), floR (n=14), aac(3)IVa (n=13), tetB (n=13), sul2 (n=12), tetA (n=11), aph(3)Ia (n=8) and sul3 (n=5) were detected by PCR. PFGE analysis of these multi-resistant E. coli strains showed less than 80% similarity among them. We conclude that antimicrobial multi-resistant E. coli strains are common on pig carcasses and present highly diverse genotypes and resistance phenotypes and genotypes.