Abstract Background: Phenotypic and functional traits of plant populations vary with environmental conditions at local and regional scales. The analysis of these traits along environmental gradients provides information on the differential response of populations to climate changes. Objective: We analyzed the leaf morphological variation of an endemic oak to identify the degree of population differentiation along an environmental gradient. Study species: Quercus mexicana Bonpl. (Fagaceae). Study site and dates: Samples were collected from 39 populations in the Sierra Madre Oriental and east of the Trans-Mexican Volcanic Belt from 2014 to 2016. Methods: We measured eight macromorphological traits in 5,507 leaves and three micromorphological traits in 228 leaves. We performed univariate and multivariate statistical analyses to assess the morphological differentiation among populations, and the relationship between variation in leaf traits and environmental variables related to temperature and water availability. Results: Populations of Q. mexicana showed leaf morphological differentiation along its distribution. Significant linear correlations were found between leaf traits and environmental variables. Smaller and thicker leaves with lower density of trichomes and smaller stomata were found in populations located in more arid regions. In contrast, larger and thinner leaves with higher trichome density and larger stomata occurred in more humid places. Conclusions: Populations of Q. mexicana are adapted to a wide range of climatic conditions. Considering the predictive future climatic changes for the region (i.e., warmer and drier conditions), Q. mexicana populations with traits better adapted to a more humid and cooler environments could be negatively affected.

Resumen Antecedentes: Los caracteres fenotípicos y funcionales de las poblaciones de plantas varían a escalas local y regional. El análisis de estos caracteres a lo largo de gradientes ambientales proporciona información sobre la respuesta diferencial de las poblaciones a cambios climáticos. Objetivo: Analizamos la variación foliar morfológica de un encino endémico para identificar el grado de diferenciación poblacional a un gradiente ambiental. Especie de estudio: Quercus mexicana Bonpl. (Fagaceae). Sitio de estudio y fechas: Se colectaron 39 poblaciones en la Sierra Madre Oriental y del este de la Faja Volcánica Transmexicana de 2014 al 2016. Métodos: Medimos ocho caracteres macromorfológicos en 5,507 hojas y tres micromorfológicos en 228 hojas. Se realizaron análisis estadísticos univariados y multivariados para evaluar la diferenciación morfológica entre poblaciones, y las relaciones entre la variación foliar y variables relacionadas con la temperatura y la disponibilidad de agua. Resultados: Las poblaciones de Q. mexicana están diferenciadas a lo largo de su distribución. Se encontraron correlaciones significativas entre caracteres foliares y variables ambientales. Hojas pequeñas y gruesas con baja densidad de tricomas y estomas pequeños se encontraron en sitios más áridos. En contraste, hojas más grandes y delgadas con mayor densidad de tricomas y estomas más grandes ocurrieron en sitios más húmedos. Conclusiones: Las poblaciones de Q. mexicana están adaptadas a un amplio intervalo de condiciones climáticas. Considerando los futuros cambios climáticos para la región (i.e., condiciones más secas y cálidas), las poblaciones de Q. mexicana con caracteres adaptados a ambientes más húmedos y fríos podrían afectarse negativamente.

Resumen Como en cualquier campo del quehacer científico, la publicación de nuevos hallazgos es una tarea fundamental de la investigación botánica. Desde su creación en 1944, Botanical Sciences (antes Boletín de la Sociedad Botánica de México), la revista científica de la Sociedad Botánica de México, ha jugado un papel importante en la difusión del conocimiento botánico, con un fuerte énfasis en las plantas y la vegetación mexicanas. En este ensayo, cuya preparación fue impulsada por la publicación en 2022 del Volumen 100 de Botanical Sciences, revisamos la trayectoria de esta revista científica desarrollada en casi ocho décadas de actividad, durante las cuales ha llegado a ser un miembro honorable de una comunidad internacional de revistas dedicadas a publicar investigaciones en todas las subdisciplinas botánicas. Con esta base, reflexionamos sobre su futuro, sopesando los desafíos que enfrenta, la necesidad de adaptarse a las circunstancias emergentes y las oportunidades que abren las prácticas editoriales nacionales e internacionales actuales. Además, ofrecemos una síntesis breve de los contenidos de las contribuciones incluidas en este Número Especial, con énfasis en las conclusiones principales a las que llegaron sus autores. Esperamos que estos artículos llegarán a ser referencias clave que guiarán el trabajo futuro en sus respectivas subdisciplinas de la botánica.

Abstract As in every field of scientific research, the publication of new findings is a fundamental task of botanical investigations. Since its launching in 1944, Botanical Sciences (formerly Boletín de la Sociedad Botánica de México), the scientific periodical of the Botanical Society of Mexico, has played a major role in the dissemination of botanical knowledge, with a strong emphasis on Mexican plants and vegetation. In this essay, whose preparation was propelled by the publication of the 100th Volume of Botanical Sciences in 2022, we revisit this scientific periodical’s trajectory for almost eight decades of activity, during which it has become an honorable member of an international assembly of journals devoted to publishing research in all botanical subdisciplines. On this ground, we reflect on its future, pondering the challenges it faces, the need to adjust to emerging circumstances, and the opportunities created by current national and international editorial practices. Additionally, we provide a brief overview of the contents of the contributions included in this Special Issue, with emphasis on the main conclusions drawn by their authors. We hope that these articles will become key references guiding future work in their respective botanical subdisciplines.

Abstract The weevil Trichobaris compacta occurs in southwest USA where it uses Datura wrightii as host plant and to oviposit into its fruits. Previously, we showed that T. compacta can use 4 other Datura species as host plants also, but the mitochondrial lineages of T. compacta do not appear to be specifically associated to any Datura species. Thus, given that T. compacta is distributed from the southwest USA up to the Tehuantepec Isthmus in the Pacific coast ranges of Mexico, we aimed to determine how the genetic variation of T. compacta is distributed along the geographical space. To determine how geography has shaped the genetic population structure of T. compacta we used a 663-bp region of the COI gene in a sample of 232 individuals from 29 different localities. We detected 49 haplotypes, one of which is widely distributed. The un-rooted haplotype network and phylogeny showed that T. compacta integrates one single lineage. Also, the population genetic structure of T. compacta is made up of the admixture of 3 groups, 2 of them slightly associated geographically to the Colorado River basin. No other apparent geographic barrier to gene flow was identified despite weevils from southwest North America use D. wrightii and D. discolor as host plants, in the Pacific coasts of Mexico T. compacta uses D. reburra and D. discolor as host plants, whereas in southern Mexico it uses D. inoxia, D. pruinosa and D. discolor.

Resumen El gorgojo Trichobaris compacta se distribuye en el suroeste de EUA y oviposita en el fruto de Datura wrightii. Previamente, demostramos que T. compacta interactúa con otras 4 especies de Datura, pero no hay linajes mitocondriales específicos asociados a éstas. ¿Cómo se distribuye la variación genética de T. compacta en el espacio geográfico? es una pregunta particularmente interesante debido a que se distribuyen desde el suroeste de los EUA hasta el centro de México. Para determinar cómo la geografía ha conformado la estructura genética poblacional de T. compacta utilizamos una región de 663 pb del gen COI de 232 individuos de 29 localidades. Detectamos 49 haplotipos, uno de ellos ampliamente distribuido. La red de haplotipos sin enraizar y la filogenia mostraron que T. compacta integra un solo linaje. También detectamos que la estructura genética de T. compacta se compone de la mezcla de 3 grupos, 2 de ellos ligeramente influenciados por la cuenca del río Colorado, pero no se detectó ninguna otra barrera a pesar de que T. compacta se distribuye desde el suroeste de EUA, donde utiliza como plantas huésped a D. wrightii y D. discolor, hasta la costa del Pacífico de México, donde utiliza a D. reburra y D. discolor, y hacia el sur, donde usa a D. inoxia, D. pruinosa y D. discolor como huéspedes.

Abstract The study of the basic biology of panchronic species could help understand their persistence through geological time. One of the least studied panchronic species is Baronia brevicornis Salvin (Lepidoptera: Papilionidae), the oldest known butterfly species endemic to Mexico. Here we report on our findings from studying a population of B. brevicornis in Sierra de Huautla, Morelos, for 3 years. In this population we identified 3 male and 3 female color morphs, making it perhaps the most complex polymorphism described yet for a panchronic species. We found a balanced sex ratio in newly emerged adults but a sex ratio biased to males at reproductive sites. Significantly, we found adults of the butterfly only on patches of the host plant Vachellia campechiana (Mill.) Seigler & Ebinger (Fabaceae) that also offered feeding sources for adults and report for the first-time adults feeding on 5 plant species. Additionally, differences in water use in trees of V. campechiana in zones with or without B. brevicornis suggest a relationship between butterfly food sources and plant water expenditure. Our findings on B. brevicornis could be used to develop conservation plans for this species.

Resumen El estudio de la biología básica de especies pancrónicas podría ayudar a entender su persistencia a través del tiempo geológico. Una de las especies pancrónicas menos estudiadas es Baronia brevicornis Salvin (Lepidoptera:Papilionidae), una mariposa endémica de México y la especie más antigua del mundo. Estudiamos por 3 años una población de B. brevicornis en la sierra de Huautla, Morelos. En esta población identificamos 3 morfos de color en los machos y 3 en las hembras, quizás el polimorfismo más complejo descrito para especies pancrónicas. También encontramos que la proporción sexual es balanceada en los adultos recién emergidos, pero sesgada hacia los machos en los sitios reproductivos. De manera importante, solamente encontramos mariposas en los parches de Vachellia campechiana (Mill.) Seigler & Ebinger (Fabaceae), que además tenían plantas de las que se podían alimentar los adultos, y aquí reportamos por primera vez que los adultos se alimentan de 5 especies de plantas. Asimismo, las diferencias en uso del agua de V. campechiana en zonas con y sin B. brevicornis sugieren una relación entre las fuentes de alimentos de las mariposas y el gasto de agua de las plantas. Nuestros hallazgos pueden ser fundamentales para desarrollar planes de conservación para B. brevicornis.

Abstract Background: Analyzing interactions between vegetation and environmental factors at regional scales provide information for the understanding of species assemblages. Hypotheses: Environmental restrictions at higher elevations produce a decreasing species richness pattern along an elevational gradient and the climatic variables related to temperature and precipitation are the main filters of species distribution. Objectives: (1) To identify the different assemblages of tree species occurring in a biodiversity hotspot; (2) to analyze the pattern of tree species richness along an elevational gradient; and (3) to analyze the environmental filters that determine the species distribution. Study site: Serranías Meridionales of Jalisco in western Mexico. Period of study: 2016-2018. Methods: Thirty-three rectangular 0.1 ha plots were established for vegetation and environmental characterization. Cluster and canonical correspondence analyses were conducted to analyze tree species composition. We defined three groups of variables (climatic, relief and soil) to evaluate the influence of environmental filters. We used generalized linear models to assess the contribution of each group to the spatial variation in species richness. Results: A total of 63 tree species were recorded. The cluster analysis defined eight groups within three forest types. The species richness showed a hump-shaped pattern along the elevational gradient and the climatic and soil variables explained a considerable amount of variation in the species richness. Conclusions: The tree species richness in the Serranías Meridionales of Jalisco is dominated by a striking number of Pinus and Quercus species. This biodiversity hotspot is an important site for the understanding of tree ecological diversification in Mexico.

Resumen Antecedentes: El análisis de las interacciones entre la vegetación y el ambiente a escalas regionales permite entender el ensamblaje de especies. Hipótesis: Restricciones ambientales en sitios elevados generan un patrón decreciente de riqueza de especies en gradientes altitudinales y la temperatura y la precipitación son los principales filtros de la distribución de especies. Objetivos: (1) Identificar los diferentes ensamblajes de especies de árboles en una región crítica de biodiversidad; (2) analizar la riqueza de especies arbóreas en un gradiente altitudinal; (3) analizar los filtros ambientales que determinan la distribución de especies. Sitio de estudio: Serranías Meridionales of Jalisco, México. Período de estudio: 2016-2018. Métodos: Se establecieron 33 parcelas de 0.1 ha para la caracterización de la vegetación y las variables ambientales. Se realizaron análisis de clasificación y canónicos de correspondencia. Utilizamos tres grupos de variables (climáticas, relieve y suelo) y modelos lineales generalizados para estimar las contribuciones de estas variables a la variación espacial en la riqueza de especies. Resultados: Se registraron 63 especies de árboles. El análisis de agrupación definió ocho grupos dentro de tres tipos de bosques. La riqueza de especies presenta un patrón de joroba en el gradiente altitudinal y las variables climáticas y de suelo explicaron la variación de la riqueza de especies. Conclusiones: La riqueza de árboles en las Serranías Meridionales of Jalisco es dominado por un número notable de especies de Pinus y Quercus. Este hotspot de biodiversidad es un sitio importante para el entendimiento de la diversificación de árboles en México.

Abstract Background: Phenotypic variability of tree species is often associated to environmental factors. Quercus castanea is a Mexican red oak with a wide geographical and altitudinal distribution along contrasting environments. It is the most abundant oak species in the Cuitzeo basin, which is characterized by highly heterogeneous environmental conditions. Hypothesis: We hypothesized that gradients in temperature, precipitation and soil characteristics across the distribution of Q. castanea within the Cuitzeo basin promote variability in functional traits related to the adjustment to differential water availability at a landscape level. Studied species: Quercus castanea Née (Fagaceae). Study site and years of study: Cuitzeo basin in Central Mexico. 2015-2016. Methods: We quantified leaf chlorophyll concentration (CC), leaf area (LA), leaf thickness (LT), leaf mass per area (LMA) and the Huber value (HV) in 10 individuals from 22 populations of Q. castanea throughout the basin. Results: Despite the relatively small geographical area (4,000 km2), our results revealed significant differentiation among populations in the studied functional traits. The strongest variation found was in LT, which was negatively correlated with precipitation seasonality. This pattern is opposite to previous reports on Mediterranean oaks but similar to tropical oaks and suggests that the combination with other traits such as leaf phenology is important in the response to water availability. Conclusions: Significant functional differences exist among populations of Q. castanea separated by a few kilometers in the heterogenous landscape of the Cuitzeo basin. This species shows clearly sclerophyllous leaves, but leaf thickness varies to a considerable degree across populations.

Resumen Antecedentes: La variación fenotípica de especies arbóreas con frecuencia se asocia a factores ambientales. Quercus castanea, un encino rojo mexicano de amplia distribución geográfica y altitudinal en ambientes contrastantes es el encino más abundante en la cuenca de Cuitzeo, caracterizada por presentar condiciones ambientales heterogéneas. Hipótesis: Los gradientes de temperatura, precipitación y características del suelo en la cuenca de Cuitzeo promueven la variación en los atributos funcionales de Q. castanea relacionados con el ajuste a la disponibilidad de agua a nivel de paisaje. Especie en estudio: Quercus castanea Née (Fagaceae). Sitio de estudio y fechas: Cuenca de Cuitzeo, centro de México. 2015-2016. Métodos: Cuantificamos la concentración de clorofila de la hoja (CC), el área foliar (LA), el grosor foliar (LT), la masa por área foliar (LMA) y el valor de Huber (HV) en 10 individuos de 22 poblaciones de Q. castanea distribuidas en la cuenca. Resultados: A pesar del área geográfica pequeña (4,000 km2), nuestros resultados mostraron una diferenciación significativa en los atributos funcionales entre las poblaciones. La variación más marcada fue en LT, que se correlacionó negativamente con la estacionalidad de la precipitación. Este patrón es opuesto a resultados previos en encinos mediterráneos pero similar a encinos tropicales y sugiere que la combinación con otros atributos, como la fenología foliar, es importante en la respuesta a la disponibilidad de agua. Conclusiones: Existen diferencias funcionales entre las poblaciones de Q. castanea separadas unos pocos kilómetros dentro de la cuenca. En particular el grosor de la hoja varía considerablemente.

Abstract Background: Variation in leaf morphology is an important indicator of how plants respond to different environmental conditions. Leaf trait variation is associated with physiological responses of plants to gradients of humidity and temperature. Objective: We analyzed the variation in the leaf morphological and functional traits of Quercus elliptica and its relationships with environmental and geographic variables across the distribution of this species to evaluate population differentiation using ecological niche models. Study species: Quercus elliptica Née (Fagaceae). Study sites and dates: Plants were collected in diverse forest types between 350 and 2,400 m in elevation in Mexico and Central America during 2016 and 2017. Methods: We measured and analyzed the differentiation in morphological and functional traits of 4,017 leaves from 402 trees from 41 populations using univariate and multivariate analyses. Results: The leaf length and thickness and specific leaf area (SLA) of Q. elliptica were significantly correlated with the seasonality of temperature, precipitation, elevation and aridity. We identified two divergent morphological groups: (1) populations distributed along the Pacific coast with broad and thin elliptical leaves with high SLA values and inhabited humid forests at more than 1,200 m elevation, and (2) populations located along the Gulf of Mexico coast, and in southern Mexico and Central America with thicker, narrower leaves and lower SLA values and inhabited seasonal tropical forests in less than 1,200 m in elevation. Conclusions: Climate and geographic barriers and the ecological niche models supported the population differentiation of Q. elliptica.

Resumen Antecedentes: La variación morfológica foliar es un indicador de las respuestas de las plantas a diferentes condiciones ambientales. La variación foliar está asociada con respuestas fisiológicas de las plantas a gradientes de humedad y temperatura. Objetivo: Analizamos la variación morfológica y funcional foliar de Q. elíptica en toda su distribución y sus relaciones con variables ambientales y geográficas para evaluar su diferenciación poblacional utilizando modelos de nicho ecológico. Especie de estudio: Quercus elliptica Née (Fagaceae). Sitio de estudio y fechas: Las plantas fueron colectadas en diversos tipos de bosques entre 350 y 2,400 m en altitud en México y América Central en 2016-2017. Métodos: Medimos y analizamos la diferenciación morfológica y funcional de 4,017 hojas de 402 árboles de 41 poblaciones utilizando análisis univariados y multivariados. Resultados: La longitud y el grosor de la hoja y el área foliar específica (AFE) de Q. elliptica se correlacionaron significativamente con la estacionalidad de la temperatura, precipitación, elevación y aridez. Identificamos dos diferentes grupos morfológicos: (1) poblaciones distribuidas a lo largo de la costa del Pacífico, con hojas elípticas anchas y delgadas, con altos valores de AFE que habitan en bosques húmedos a más de 1,200 m en altitud y (2) poblaciones en el Golfo de México, el sur de México y América Central con hojas gruesas y estrechas y bajos valores de SLA en bosques tropicales estacionales de menos de 1,200 m. Conclusiones: Las barreras climáticas y geográficas y los modelos de nicho ecológico apoyan la diferenciación de poblaciones en Q. elliptica.

Abstract: Background: Epiphytic plants exist within the complex three-dimensional habitat of the tree canopy. This can have a profound effect on patterns of both genetic diversity and structure and may be important for conservation of epiphytic species. Objective: To evaluate how the epiphytic habit affects fine-scale three-dimensional genetic structure in single canopy tree populations. Studied species: Laelia speciosa, a threatened endemic Mexican epiphytic orchid. Study site and dates: Field sampling occurred during Spring 2006 in the municipality of Caurio de Guadalupe, Michoacán. Methods: All individuals occurring in two trees of Q. deserticola (178 in Tree 1 and 276 in Tree 2) were mapped, assigned to four discrete age classes, and genotyped at six microsatellite loci to understand patterns of genetic diversity and structure. Results: High levels of genetic diversity (polymorphic loci = 100 %, Ho = 0.398 - 0.506) occurred across size classes and trees but were not significantly different between the two trees. Significant fine-scale genetic structure was found in the Juvenile (plants 2-10 years old) and Adults I (11-20 years old) age classes in distances up to 15 cm. This significant structure was larger (up to 25 cm) when all individuals were treated as a single age class. Conclusion: The distribution and structure of genetic diversity is attributable to the epiphytic habit, particularly localized seed dispersal, limited selfing, and selection of adaptive traits. Conservation implications related to the sampling for in vitro propagation are given in light of the metapopulation genetic variability maintained within single-tree populations.

Resumen: Antecedentes: Las plantas epifitas, por su distribución compleja en un espacio tridimensional, proveen un sistema único para el estudio de la diversidad y estructura genética de poblaciones. Objetivos: Evaluar las consecuencias del hábito epifito en la estructura y diversidad genética. Especie de estudio: Laelia speciosa es una orquídea epifita amenazada endémica a México. Sitio y años de estudio: Municipio de Caurio de Guadalupe, Michoacán. El trabajo de campo se realizó en la primavera del 2006. Métodos: Se analizó la diversidad y estructura genética, usando seis loci de microsatélites, de todos los individuos encontrados en dos árboles de Quercus desertícola (178 y 276 individuos). Estos individuos fueron mapeados en su espacio tridimensional y asignados a cuatro categorías de edad. Resultados: Se encontraron niveles altos de diversidad genética en todas las categorías de edad y en los dos árboles (loci polimórficos = 100 %, Ho = 0.398 - 0.506). No se encontraron diferencias significativas entre los árboles. Una estructura genética a fina escala se encontró en los Juveniles (plantas de 2-10 años) y en los Adultos I (11-20 años) en distancias hasta de 15cm. Esta estructura se incrementó a 25 cm si todos los individuos se analizan juntos. Conclusiones: La distribución y estructura genética encontradas en L. speciosa se pueden atribuir a su hábito epífito, en particular a una baja dispersión de semillas, autofecundación reducida y selección de características adaptativas para dicho hábito. Se sugieren estrategias de muestreo para su propagación in vitro.

Abstract: Background: Gall-inducing insects make up a guild of highly specialized endophagous herbivores. The cynipids (Hymenoptera: Cynipidae: Cynipini) are highly diversified gall-inducing wasps that are largely associated with oaks (Fagaceae: Quercus). Mexico is one of the centers of diversification for the Quercus genus with 161 described species, of which 109 are endemic. Questions / hypothesis: The present study aims to identify the gall richness, gall morphological variation and degree of specificity to oaks in Mexico. Methods: An intensive collection was conducted from March to September each year from 2008 to 2012 for a total of 80 oak species in 120 localities in Mexico. Results: A total of 224 morphologically distinct galls associated with 73 of the 80 oak species were found. The largest number of morphotypes was found in leaves (125), followed by branches (37), buds (31), petioles (20), catkins (5), acorns (3) and roots (3). The degree of specificity between the gall-inducing wasps and their hosts was highly variable; between one to 20 distinct gall morphotypes were found in each species. Only 23 oak species had a single gall morphotype associated. Conclusions: This study demonstrates the important interaction between oaks and gall-inducing wasps, which is a very complex co-evolutionary process. It also shows the relevance of basic taxonomic studies of little-known groups such as gall-inducing wasps, especially in a highly biodiverse country such as Mexico.

Resumen: Antecedentes: Los insectos inductores de agallas son un gremio de organismos endófagos altamente especializados. Los cinípidos (Hymenoptera: Cynipidae: Cynipini) son avispas inductoras de agallas ampliamente diversificados que se encuentran asociados principalmente a los encinos (Fagaceae: Quercus). México es uno de los centros de diversificación para el género Quercus con 161 especies descritas de las cuales 109 son endémicas. Preguntas / hipótesis: El presente estudio contribuyó a identificar la riqueza de agallas, su variación morfológica y el grado de especificidad a los encinos en México. Métodos: Se realizó una colecta intensiva de marzo a septiembre de cada año de 2008 a 2012 en un total de 80 especies de encinos en 120 localidades en México. Resultados: Un total de 224 morfotipos distintos de agallas se encontraron asociados a 73 de las 80 especies de encinos estudiadas. El mayor número de morfotipos se encontraron en hojas (125), seguidos por ramas (37), yemas (31), peciolos (20), inflorescencias (5), bellotas (3) y raíces (3). El grado de especificidad entre las avispas inductoras de agallas y sus hospederos fue muy variable; se encontraron entre uno y 20 morfotipos distintos de agallas en cada especie. Únicamente 23 especies de encinos estuvieron asociadas a un solo morfotipo de agalla. Conclusiones: Este estudio demuestra la importancia de la interacción entre los encinos y las avispas inductoras de agallas, el cual es un proceso coevolutivo muy complejo. También muestra la relevancia de estudios taxonómicos básicos de grupos poco conocidos como las avispas inductoras de agallas, especialmente en un país con una alta biodiversidad como lo es México.

Abstract: The Baird’s tapir (Tapirus bairdii) is the largest terrestrial mammal dwelling in the neotropics and the only native representative of the order Perissodactyla. This species is under a great threat due to the impacts of hunting and habitat loss. Therefore, implementation of conservation strategies, in situ and ex situ, is urgent. However, to improve effectiveness of these strategies knowledge of the species level of genetic variability is needed. We collected samples (hair, feces and blood) from T. bairdii individuals kept in captivity in 4 zoos in Mexico and the field (feces) to extract DNA. We analyzed tapir levels of genetic variability focusing on a 511 bp region of the mtDNA D-loop and a set of 6 microsatellite loci. We found a relatively low allelic richness Rs = 3.94 but a relatively high frequency of private alleles (6 out of 24) and a variability of mother lines higher than reported in other studies (7 haplotypes with 15 polymorphic sites, Hd = 0.846 and Pi = 0.0128). Our results suggest that there might be a relatively high genetic diversity in tapir population inhabiting southern Mexico.

Resumen: El tapir centroamericano (Tapirus bairdii) es el mamífero terrestre de mayor talla en el neotrópico y el único representante nativo del orden Perissodactyla. Esta especie se encuentra bajo un fuerte peligro de extinción por la cacería y la destrucción de su hábitat. Resulta urgente la implementación de estrategias de conservación in situ y ex situ de la especie; sin embargo, se requiere contar con información sobre su variabilidad genética. Obtuvimos ADN de T. bairdii a partir de muestras (pelo, excretas y sangre) de individuos en cautiverio en 4 zoológicos de México y excretas recolectadas en el campo. Analizamos los niveles de variabilidad genética en un fragmento de 511 pares de base de la región D-loop del ADN mitocondrial y en microsatélites para 6 loci. Encontramos una riqueza alélica baja (Rs = 3.94) pero un número relativamente alto de alelos exclusivos (6 de un total de 24) en microsatélites así como una variabilidad de las líneas maternas más altas que la registrada en otros estudios (7 haplotipos con 15 sitios polimórficos, Hd = 0.846 and Pi = 0.0128). Esto sugiere la existencia de una diversidad genética relativamente alta en las poblaciones de tapir que habitan en el sureste de México.

Abstract: Background. Abiotic constraints, historical effects of the last glaciation, and differential dispersal, have been proposed as potential explanations to account for the latitudinal decrease in acorn size of wide-ranging oak species distributed in the U.S. and Canada. Hypothesis. We specifically tested the abiotic constraints hypothesis on oak acorn size in a geographical area without the counfounding influence of glaciation and related dispersal history. Data description. Acorns from seven populations of the white oak Quercus rugosa were collected, encompassing the distribution of the species in Mexico. Study site and years of study. Mexico, 2009-2010. Results. Acorn length, width, mass and volume differed significantly among populations and indicated a marked clinal latitudinal reduction in acorn size. A multiple regression model revealed that this reduction in size (measured as acorn volume) can be explained by two important bioclimatic variables (growing season precipitation and growing season degree-days above 5 °C), while spatial variables (latitude and longitude) are not significant. Furthermore, germination percentage was significantly correlated to acorn mass and volume. Conclusions. The main determinants of the latitudinal decline in acorn size are climate factors constraining seed development. This decline is maladaptive for seedling establishment, with important implications for the delination of northern limits of species ranges.

Resumen: Antecedentes. Las restricciones abióticas, el efecto histórico de la última glaciación y la dispersión diferencial son posibles explicaciones para la disminución latitudinal del tamaño de las bellotas en especies de encinos de amplia distribución en los EE.UU. y Canadá. Hipótesis. Se probó específicamente la hipótesis de las restricciones abióticas sobre el tamaño de las bellotas de encinos en un área geográfica sin influencia de la historia de colonización postglacial. Descripción de datos. Se colectaron bellotas procedentes de siete poblaciones del encino blanco Quercus rugosa, abarcando la distribución de la especie en México. Sitio de estudio y fechas. México, 2009-2010. Resultados. La longitud de las bellotas, el ancho, la masa y el volumen difirieron significativamente entre las poblaciones y mostraron una marcada reducción latitudinal clinal en el tamaño de la bellota. Un modelo de regresión múltiple reveló que esta reducción en el tamaño (medido como volumen de bellota) puede explicarse por dos variables bioclimáticas importantes (precipitación en la temporada de crecimiento y días-grado por encima de 5 °C de la temporada de crecimiento), mientras que las variables espaciales (latitud y longitud) no fueron significativas. Adicionalmente, el porcentaje de germinación se correlacionó significativamente con el volumen y la masa de las bellotas. Conclusiones. Los principales determinantes de la disminución latitudinal del tamaño de las bellotas son los factores climáticos que limitan su desarrollo. Esta disminución afecta el establecimiento de las plántulas, lo cual tiene implicaciones importantes en el estudio de los factores que limitan la distribución de las especies.

Abstract: A review of studies on Molecular Ecology in Mexico is presented. Between 1990 and 2016, we identified 656 published studies on Molecular Ecology. The best represented subject areas were population genetics (35.3% of the studies) and phylogeography (30.3%), while emergent fields in molecular ecology, such as landscape genomics, DNA-based trophic ecology, and kinship, parentage and behavior were scarcely represented. Most frequently studied systems were animals (58.5%) and plants (32.5%), while other organisms such as fungi, protozoa and bacteria have received much less attention. In general, a considerable development of Molecular Ecology is observable in our country. However, for this tendency to continue it will be necessary to incorporate more extensively technological advances such as next generation sequencing and bioinformatics, as well as to venture into the emergent areas of the discipline.

Resumen: Se presenta una revisión de las investigaciones en el campo de la Ecología Molecular en México. Entre 1990 y 2016 se identificaron 656 artículos científicos relacionados. Los temas mejor representados son la genética de poblaciones (35.3% de los estudios) y la filogeografía (30.3%), mientras que los campos emergentes de la Ecología Molecular, como la genómica del paisaje, la ecología trófica basada en secuencias de ADN y el análisis del parentesco y la conducta, estuvieron poco representados. Los sistemas más estudiados han sido los animales (58.5%) y las plantas (32.5%), mientras que otros organismos como hongos, protozoarios y bacterias han recibido mucho menos atención. En general, se observa un desarrollo considerable de la Ecología Molecular en nuestro país. Sin embargo, para continuar esta tendencia será necesario incorporar extensivamente los avances tecnológicos como la secuenciación de nueva generación y la bioinformática, así como incursionar en las áreas emergentes de esta disciplina.

Abstract Elucidating the factors determining plant distribution is still on discussion. It has been stated that the distribution is mostly determined by environmental factors, but the evidence on whether this or other processes are the determinants remains inconclusive. In the present study, we hypothesized that oak species differ in their distribution, which might be mostly influence by the environment. Particularly, we explored: i) the patterns of distribution of Quercus species at a landscape scale; ii) the climatic, soil and topographic factors that might determine their distribution, and iii) the degree of association between the species within fragments. The study included the analysis of 78 oak forest fragments at the Cuitzeo lake Basin in Michoacán state, Mexico in which nine oak species were registered. The species showed clear differences in their distribution; three groups of oak species that differ significantly in their spatial arrangement were detected with a NMDS (Non-metric Multidimensional Scaling) analysis. We observed a relationship between oak species distribution with temperature and precipitation. In particular, Q. candicans, Q. crassipes and Q. rugosa were frequently distributed at sites with higher rainfall and lower temperature; in contrast, Q. deserticola, Q. gentryi and Q. glaucoides were at more arid areas. We found associations between pairs of oak species; the most recurrent one was between species from the Quercus and the Lobatae sections. Overall, the pattern of distribution among oak species was determined by environmental factors, which suggests that they partition their habitat to avoid competition for resources.

Resumen Elucidar los factores que determinan la distribución de las plantas todavía se encuentra en debate. Se ha dicho que la distribución es principalmente determinada por factores ambientales, pero la evidencia de si estos u otros procesos son los más determinantes aún no es concluyente. En el presente estudio, se predijo que las especies de Quercus difieren en su distribución, y está principalmente determinada por el ambiente. En particular, se exploró: i) los patrones de distribución de especies de Quercus en una escala de paisaje; ii) si los factores climáticos, edáficos y topográficos determinan su distribución; y iii) el grado de asociación entre especies dentro de los fragmentos. En este estudio se censaron 78 fragmentos de encinares en la Cuenca de Cuitzeo en el estado de Michoacán, México, en los cuales se registraron nueve especies de encinos. Las especies mostraron claras diferencias en su distribución; tres grupos de especies de Quercus que difieren significativamente en su arreglo espacial fueron detectados con un análisis NMDS (Escalamiento Multidimensional No-métrico). Así mismo, se observó una relación entre la distribución de las especies de encinos, y la temperatura y la precipitación. En particular, Q. candicans, Q. crassipes y Q. rugosa frecuentemente se distribuyen en sitios con mayor precipitación y menor temperatura; en contraste, Q. deserticola, Q. gentryi y Q. glaucoides estuvieron en zonas más áridas. Se detectaron asociaciones entre pares de especies de Quercus; las más frecuentes fueron entre especies de las secciones Quercus y Lobatae. En general, el patrón de distribución entre especies de encinos está determinado por factores ambientales, lo cual sugiere que las especies se reparten el hábitat para evitar competir por recursos.

Abstract: Chamaedorea alternans is a palm species that has suffered from selective extraction, and habitat loss. We collected 11 populations from fragmented and conserved forest. We assess genetic variation of C. alternans, genetic exchange, differentiation, bottlenecks, effective population size and signals of natural selection. Genetic diversity was higher in conserved than in fragmented forest but not significant. Fragmentation did not play a significant role in genetic diversity, possibly due to the populations heterogeneity. C. alternans has been subject to a pronounced isolation of trees as a product of logging, thus raising inbreeding. Bayesian clustering show a trend towards an increased structuring over the course of generations but also, indicates that populations have recently gone through a bottleneck. The bottleneck following deforestation was not severe enough to lower the effective size, this could lead to high standing genetic diversity, providing a buffer against genetic erosion. We observed directional and balancing selection in C. alternans. Maintenance of variability and increased differentiation signify that their populations have been subject to a differential selective pressure at the ecological and the landscape level, combined effect could lead to disturb pollination and dispersion processes, modifying in the long term the effective population size.

Resumen: Chamaedorea alternans es una especie de palma que ha sufrido extracción selectiva y pérdida del hábitat. Se colectaron 11 poblaciones de bosques fragmentados y conservados. Se calculó la variación genética de C. alternans, intercambio genético, diferenciación, cuellos de botella, el tamaño efectivo y las señales de selección natural. La diversidad genética fue mayor en el bosque conservado que en el fragmentado, pero no fue significativa posiblemente debido a la heterogeneidad de las poblaciones. La fragmentación no ha desempeñado un papel importante en la diversidad genética. C. alternans ha sido objeto de un marcado aislamiento de árboles, elevando así los coeficientes de endogamia. El agrupamiento bayesiano indica una tendencia hacia la estructuración con el curso de las generaciones, incluso, muestra evidencias de poblaciones que han sufrido cuellos de botella. Si el cuello de botella no fue tan severo para reducir el tamaño efectivo, esto pudo resultar en una alta diversidad genética, sirviendo como buffer contra la erosión genética. Observamos selección direccional y balanceadora en C. alternans. La disminución y el mantenimiento de la variabilidad y el aumento de la diferenciación significan que sus poblaciones han sido objeto de una presión diferencial a nivel ecológico y a nivel de paisaje; el efecto combinado podría llevar a alterar los procesos de polinización y dispersión, modificando a largo plazo el tamaño de la población.