Abstract: Syndromic surveillance using primary health care (PHC) data is a valuable tool for early outbreak detection, as demonstrated by the potential to identify COVID-19 outbreaks. However, the potential of such an early warning system in the post-COVID-19 era remains largely unexplored. We analyzed PHC encounter counter of respiratory complaints registered in the database of the Brazilian Unified National Health System from October 2022 to July 2023. We applied EARS (variations C1/C2/C3) and EVI to estimate the weekly thresholds. An alarm was determined when the number of encounters exceeded the week-specific threshold. We used data on hospitalization due to respiratory disease to classify as anomalies the weeks in which the number of cases surpassed predetermined thresholds. We compared EARS and EVI efficacy in anticipating anomalies. A total of 119 anomalies were identified across 116 immediate regions during the study period. The EARS-C2 presented the highest early alarm rate, with 81/119 (68%) early alarms, and C1 the lowest, with 71 (60%) early alarms. The lowest true positivity was the EARS-C1 118/1,354 (8.7%) and the highest was EARS-C3 99/856 (11.6%). Routinely collected PHC data can be successfully used to detect respiratory disease outbreaks in Brazil. Syndromic surveillance enhances timeliness in surveillance strategies, albeit with lower specificity. A combined approach with other strategies is essential to strengthen accuracy, offering a proactive and effective public health response against future outbreaks.

Resumo: A vigilância sindrômica utilizando dados de atenção primária à saúde (APS) é uma ferramenta valiosa para a detecção precoce de surtos, conforme demonstrado no potencial de identificar surtos de COVID-19. No entanto, o potencial desse sistema de alerta antecipado na era pós-COVID-19 continua amplamente inexplorado. Foram analisadas as contagens de atendimentos na APS por queixas respiratórias registradas na base de dados do Sistema Único de Saúde de outubro de 2022 a julho de 2023. O EARS (variações C1/C2/C3) e o EVI foram aplicados para estimar os limiares semanais. Um alarme foi criado para quando o número de atendimentos excedesse o limite específico da semana. Dados de hospitalização por doença respiratória foram utilizados para classificar semanas em que o número de casos ultrapassou os limites predeterminados como anomalias. Comparamos a eficácia do EARS e do EVI na antecipação de anomalias. Um total de 119 anomalias foram identificadas em 116 regiões imediatas durante o período do estudo. O EARS-C2 apresentou a maior taxa de alarmes precoces, com 81 de 119 (68%) alarmes precoces, enquanto o C1 apresentou a menor, com 71 (60%) alarmes precoces. A menor taxa de verdadeiros positivos foi a EARS-C1 118/1.354 (8,7%) e a maior EARS-C3 99/856 (11,6%). Os dados de APS coletados rotineiramente podem ser usados com sucesso para detectar surtos de doenças respiratórias no Brasil. A vigilância sindrômica melhora a prontidão das estratégias de vigilância, embora com menor especificidade. Uma abordagem combinada com outras estratégias é essencial para fortalecer a precisão, oferecendo uma resposta proativa e eficaz de saúde pública contra futuros surtos.

Resumen: La vigilancia sindrómica, que utiliza datos de la atención primaria de salud (APS), es una herramienta valiosa para la detección temprana de brotes, como lo demuestra el capacidad para identificar brotes de COVID-19. Sin embargo, el uso de este sistema de alerta temprana en la era posterior a la COVID-19 sigue en gran medida inexplorado. Se analizaron los conteos de atenciones en la APS por afecciones respiratorias registradas en la base de datos del Sistema Único de Salud desde octubre del 2022 hasta julio del 2023. Se aplicaron el EARS (rangos C1/C2/C3) y el EVI para estimar los umbrales semanales. Se emitió una alarma en caso de que el número de atenciones excediera el límite específico para la semana. Los datos de hospitalización por enfermedad respiratoria se utilizaron para clasificar como anómalas las semanas en las que el número de casos superó los umbrales predeterminados. Comparamos la eficacia del EARS y del EVI para anticipar anomalías. Durante el período del estudio se identificó un total de 119 anomalías en 116 regiones. El EARS-C2 presentó la tasa más alta de alarmas tempranas, con 81 de 119 (68%) alarmas tempranas, mientras que el C1 tuvo la más baja, con 71 (60%) alarmas tempranas. La tasa de positividad más baja fue la EARS-C1 118/1.354 (8,7%) y la más alta EARS-C3 99/856 (11,6%). Los datos de APS recopilados de forma rutinaria pueden utilizarse con éxito para detectar brotes de enfermedades respiratorias en Brasil. La vigilancia sindrómica aumenta la prontitud de las estrategias de vigilancia, aunque con menor especificidad. Un enfoque combinado con otras estrategias es esencial para fortalecer la precisión y proporcionar una respuesta de salud pública proactiva y eficaz contra futuros brotes.

RESUMO: O objetivo deste trabalho foi introduzir a técnica de espectrometria de massa com fonte de ionização e dessorção a laser assistida por matriz e analisador de tempo-de-voo (MALDI-TOF) para incrementar o método tradicional microbiológico na detecção de Salmonella spp. e Escherichia coli em carcaças bovinas. Foram avaliadas 270 amostras de 90 carcaças de bovinos. Para isolamento de Salmonella spp. e E. coli, foram utilizadas, respectivamente, as metodologias descritas na ISO 6579:2002 e no Compendium of Methods for the Microbiological Examination of Foods. As análises por MALDI-TOF foram realizadas a partir de isolados cultivados em ágar nutriente ou em caldo triptona de soja, provenientes das amostras com características bioquímicas positivas (n=7), inconclusivas (n=4) e negativas (n=85) para Salmonella spp. e bioquímicas positivas (n=37) e negativas (n=85) para E. coli. Os perfis de massas foram adquiridos com o espectrômetro de massas MALDI-TOF Autoflex III SmartBeam e os espectros brutos foram processados usando o programa MALDI Biotyper (Bruker Daltonics). De acordo com a identificação preliminar, com base na morfologia das colônias e nas reações bioquímicas, sete isolados foram considerados positivos para Salmonella spp. Através do MALDI Biotyper, esses sete isolados foram classificados como pertencentes ao gênero Salmonella e, além disso, identificados como S. enterica. Quatro isolados que apresentaram características fenotípicas não usuais e resultados inconclusivos nos testes bioquímicos para Salmonella foram identificados como pertencentes aos gêneros Citrobacter e Proteus após análise por MALDI. Para E. coli, 37 amostras foram positivas pelos testes bioquímicos da espécie, o que foi confirmado por MALDI Biotyper. A metodologia MALDI-TOF permitiu a rápida confirmação da identidade de Salmonella spp. e E. coli, podendo ser utilizada para detecção desses microrganismos em isolados bacterianos de carcaças bovinas.

ABSTRACT: The aim of this study was to introduce matrix-assisted laser desorption/ionization (MALDI) time-of-flight (TOF) mass spectrometry to improve the traditional microbiological method for the detection of Salmonella spp. and Escherichia coli in beef carcasses. Two hundred seventy samples from 90 beef carcasses were evaluated. The methodologies described in ISO 6579:2002 and in the Compendium of Methods for the Microbiological Examination of Foods were used for Salmonella spp. and E. coli isolation, respectively. MALDI-TOF analysis were performed on tryptone soya broth suspension isolates or directly from nutrient agar colonies, from the positive, inconclusive or negative biochemically tested samples for Salmonella and E. coli. Mass profiles were acquired on an Autoflex III SmartBeam MALDI-TOF mass spectrometer and the raw spectra were processed using the MALDI Biotyper software (Bruker Daltonics). According to the preliminary identification based on colony morphology and the biochemical reactions, seven isolates were positive for Salmonella spp. Through MALDI Biotyper these seven isolates were also classified as belonging to the genus Salmonella and further identified as S. enterica. Four isolates showing unusual phenotypic characteristics and inconclusive results in biochemical tests for Salmonella were identified as belonging to Citrobacter and Proteus genera after MALDI analysis. Regarding Escherichia coli, 37 were positive for species biochemical testing which MALDI Biotyper confirmed. MALDI-TOF methodology allowed rapid Salmonella spp. and E. coli identity confirmation and may be used to detect these microrganisms within bacterial isolates from beef carcasses.

RESUMO Este trabalho investigou atributos de assembleias (composição, abundância, riqueza, diversidade e equitabilidade) e os gêneros mais representativos de Odonata, Anisoptera nos riachos Água Boa e Perobão, bacia do rio Iguatemi, MS, Brasil. Os riachos são de primeira ordem, apresentam extensão similar e são impactados pela remoção da mata ripária e assoreamento. As amostragens foram realizadas trimestralmente de março a dezembro/2008 nos trechos superior, intermediário e inferior de ambos os riachos. O teste de Mantel foi utilizado para verificar a influência da autocorrelação espacial sobre a composição de Odonata. Variações espaciais na composição foram sumarizadas através da Análise de Coordenadas Principais (PCoA) utilizando-se os resíduos do teste de Mantel. Os efeitos da correlação espacial na riqueza e abundância foram investigados através do correlograma espacial dos coeficientes do I de Moran. Para identificar os gêneros mais representativos em cada riacho foi utilizado o Método do Valor Indicador. As variações espaciais dos atributos das assembleias foram avaliadas por meio de análises de variância de modelos nulos. Foram coletados 500 indivíduos imaturos distribuídos em 23 gêneros e três famílias. Dentre os atributos analisados, apenas a composição e abundância apresentaram diferenças espaciais significativas, sendo o maior valor médio do último atributo registrado no riacho Perobão. Miathyria e Zenithoptera foram os gêneros indicadores do riacho Água Boa e Erythrodiplax, Libellula, Macrothemis, Progomphus e Tramea do Perobão.

ABSTRACT This study investigated the assemblages attributes (composition, abundance, richness, diversity and evenness) and the most representative genera of Odonata, Anisoptera at Água Boa and Perobão Streams, Iguatemi River basin, Brazil. Both are first order streams with similar length that are impacted by riparian forest removal and silting. Quarterly samplings were conducted from March to December 2008 in the upper, intermediate and lower stretch of each stream. The Mantel test was used to check the influence of spatial autocorrelation on the Odonata composition. Spatial variations in the composition were summarized by the Principal Coordinates Analysis (PCoA) using Mantel test residuals. The effects of spatial correlation on richness and abundance were investigated by the spatial correlogram of Moranʼs I coefficients. The most representative genera in each stream were identified by the Indicator Value Method. The spatial variations in the attributes of the assemblages were assessed using analysis of variance of null models. We collected 500 immature individuals of 23 genera and three families. Among the attributes analyzed only the composition and abundance showed significant spatial differences, with the highest mean abundance found in the Perobão Stream. Miathyria and Zenithoptera were the indicator genera of the Água Boa Stream and Erythrodiplax, Libellula, Macrothemis, Progomphus and Tramea were the indicator genera of the Perobão Stream.