The aim of this study was to determine the CYP2D6: * 4, * 6 and * 10 gene variants frequency and to predict the metabolizer phenotype in a sample of 145 unrelated apparently healthy individuals residing in the state of Aragua, Venezuela. Genotypes were determined by Polymerase chain reaction assays followed by restriction endonucleases digestion. The metabolizer phenotype prediction was made based on the activity score system. The frequencies of CYP2D6 * 4, * 6 and * 10 allelic variants were 14.5%, 0.3% and 1%. A significant percentage of individuals were categorized as heterozygote-extensive/intermediate (23.5%) and poor metabolizers (4.1%), this information has potential clinical impact, because the CYP2D6 protein is involved in the metabolism of drugs frequently prescribed as: carvedilol, captopril, chloroquine, codeine, fluoxetine, fluvastatin, haloperidol, idarubicin, indinavir, imatinib, loperamide, nifedipine, ondansetron and tamoxifen

El objetivo del estudio fue determinar la frecuencia de las variantes del gen CYP2D6: *4, *6 y *10 y predecir el fenotipo metabolizador en una muestra de 145 individuos no consanguíneos, aparentemente sanos, residentes del estado Aragua, Venezuela. Los genotipos fueron determinados mediante ensayos de reacción en cadena de la polimerasa seguidos de digestión con endonucleasas de restricción. La predicción del fenotipo metabolizador se realizó con base al sistema Activity score. Las frecuencias de CYP2D6 *4, *6 y *10 fueron de 14,5%, 0,3% y 1%, respectivamente; un porcentaje significativo de individuos fueron categorizados como metabolizador rápido heterocigoto/metabolizador intermedio (23,5%) y metabolizador lento (4,1%). Esta información tiene impacto clínico potencial, porque CYP2D6 interviene en el metabolismo de fármacos de prescripción frecuente como: carvedilol, captopril, cloroquina, codeína, fluoxetina, fluvastatina, haloperidol, idarrubicina, indinavir, imatinib, loperamida, nifedipina, ondansetrón y tamoxifeno

The aim of this study was to determine the CYP2D6: * 4, * 6 and * 10 gene variants frequency and to predict the metabolizer phenotype in a sample of 145 unrelated apparently healthy individuals residing in the state of Aragua, Venezuela. Genotypes were determined by Polymerase chain reaction assays followed by restriction endonucleases digestion. The metabolizer phenotype prediction was made based on the activity score system. The frequencies of CYP2D6 * 4, * 6 and * 10 allelic variants were 14.5%, 0.3% and 1%. A significant percentage of individuals were categorized as heterozygote-extensive/intermediate (23.5%) and poor metabolizers (4.1%), this information has potential clinical impact, because the CYP2D6 protein is involved in the metabolism of drugs frequently prescribed as: carvedilol, captopril, chloroquine, codeine, fluoxetine, fluvastatin, haloperidol, idarubicin, indinavir, imatinib, loperamide, nifedipine, ondansetron and tamoxifen

El objetivo del estudio fue determinar la frecuencia de las variantes del gen CYP2D6: *4, *6 y *10 y predecir el fenotipo metabolizador en una muestra de 145 individuos no consanguíneos, aparentemente sanos, residentes del estado Aragua, Venezuela. Los genotipos fueron determinados mediante ensayos de reacción en cadena de la polimerasa seguidos de digestión con endonucleasas de restricción. La predicción del fenotipo metabolizador se realizó con base al sistema Activity score. Las frecuencias de CYP2D6 *4, *6 y *10 fueron de 14,5%, 0,3% y 1%, respectivamente; un porcentaje significativo de individuos fueron categorizados como metabolizador rápido heterocigoto/metabolizador intermedio (23,5%) y metabolizador lento (4,1%). Esta información tiene impacto clínico potencial, porque CYP2D6 interviene en el metabolismo de fármacos de prescripción frecuente como: carvedilol, captopril, cloroquina, codeína, fluoxetina, fluvastatina, haloperidol, idarrubicina, indinavir, imatinib, loperamida, nifedipina, ondansetrón y tamoxifeno

A enzima Timidilato Sintetase (TS) codificada pelo gene TYMS é inibida por agentes quimioterapêuticos como 5-fluorouracil (5-FU) e Metotrexato (MTX). Diversos estudos postularam que existe uma relação inversa entre os níveis da enzima e os benefícios terapêuticos do 5-FU e MTX. O gene TYMS apresenta polimorfismos associados com a expressão de TS, um deles consiste numa inserção ou deleção de 6 pb na posição 1494 em 3’UTR (1494del6); a deleção é vinculada a menor expressão enzimática. O objetivo do trabalho foi determinar o polimorfismo 1494del6, em 260 indivíduos saudáveis não consanguíneos da região central da Venezuela. Depois de obter o consentimento informado, foi tomada uma amostra sanguínea para isolar o DNA e amplificar mediante PCR uma sequencia de 142/148 pb do gene TYMS. O produto foi digerido com Dra I, foi realizada eletroforese em géis de poliacrilamida 8%, determinando-se os genótipos e comparando com os obtidos em outras populações. Os três genótipos achados foram: -6pb/-6pb (15,8%) +6pb/-6pb (45,4%) e +6pb/+6pb (38,8%), o ultimo foi associado a uma resposta deficiente ao tratamento com 5-FU y MTX. Este estudo é um passo inicial na geração de dados com importância farmacogenética, em relação ao gene TYMS na população venezuelana.

Thymidylate synthase enzyme (TS) codified by the TYMS gene is inhibited by chemotherapeutic agents such as 5-Fluoruacil (5-FU) and Methotrexate (MTX). Several studies have postulated the existence of an inverse relationship between enzyme levels and 5-FU and MTX therapeutic benefits. In the TYMS gene, there are polymorphisms associated with the TS expression, one of them consisting of an insertion (+6pb) or deletion (-6pb) of 6 bp at position 1494 in the 3’UTR region (1494del6); the deletion is associated with low levels of enzyme. The aim of this work was to determine the 1494del6 polymorphism of the TYMS gene in a sample of 260 no-consanguineous healthy individuals from the Central region of Venezuela. Informed consent was obtained and a blood sample was taken to isolate DNA and to amplify a sequence of 142/148 pb by PCR. The PCR product was digested with Dra I enzyme, the restriction patterns were checked by electrophoresis on 8% polyacrylamide gel, and genotypes were determined and compared with those obtained in other populations. Three genotypes were found, whose frequencies were: -6pb/-6pb (15,8%), +6pb/-6pb (45,4%) and +6pb/+6pb (38,8%), the latter being associated with deficient response to treatment with 5-FU and MTX. This research is an initial step in generating data of pharmacogenetics importance with reference to TYMS gene in a Venezuelan population.

La enzima Timidilato Sintasa (TS) codificada por el gen TYMS es inhibida por agentes quimioterapéuticos como 5-Fluorouracilo (5-FU) y Metotrexato (MTX). Varios estudios han postulado que existe una relación inversa entre los niveles de enzima y los beneficios terapéuticos de 5-FU y MTX. El gen TYMS presenta polimorfismos asociados con la expresión de TS; uno de ellos consiste en una inserción o deleción de 6 pb en la posición 1494 en 3’UTR (1494del6); la deleción se vincula con menor expresión enzimática. El objetivo del trabajo fue determinar el polimorfismo 1494del6 en 260 individuos sanos no consanguíneos de la región central de Venezuela. Luego de obtener el consentimiento informado, se tomó una muestra sanguínea para aislar ADN y amplificar mediante PCR una secuencia de 142/148 pb del gen TYMS. El producto fue digerido con Dra I y se realizó electroforesis en geles de poliacrilamida 8%, determinándose los genotipos y se compararon con los obtenidos en otras poblaciones. Se encontraron tres genotipos: -6pb/-6pb (15,8%), +6pb/-6pb (45,4%) y +6pb/+6pb (38,8%). Este último ha sido asociado con respuesta deficiente al tratamiento con 5-FU y MTX. Esta investigación es un paso inicial en la generación de datos de importancia farmacogenética en relación con gen TYMS en población venezolana.