Resumo Este estudo teve como objetivo investigar as alterações patológicas induzidas por carbofurano (CF) em garças-vaqueiras. Duzentas dessas garças foram criadas e divididas igualmente em quatro grupos e receberam diferentes concentrações de CF: 0,03 mg/L; 0,02 mg/L; 0,01 mg/L; e 0 mg/L (grupo controle). Foram realizadas análises de hematologia, bioquímica sérica, histopatologia e marcadores imunológicos. Nossos resultados confirmaram que CF induz condições anêmicas, leucocitose, atividade enzimática hepática elevada e alterações nos biomarcadores renais. Além disso, lesões microscópicas específicas, como necrose multifocal, núcleos picnóticos, hemorragias, congestão e proliferação de células inflamatórias, foram observadas no fígado, rim, baço e timo. Esses achados sugerem que o CF pode causar efeitos nocivos, portanto a aplicação desse agrotóxico no campo deve ser rigorosamente monitorada para mitigar a possibilidade de exposição a espécies não alvo.

Abstract This study was aimed to investigate Carbofuran (CF)-induced pathological changes in cattle egret. Two hundred cattle egrets were reared and equally divided into four groups and given different CF concentrations (0.03 mg/L, 0.02 mg/L, 0.01 mg/L and 0 mg/L (control group)). Hematology, serum biochemistry, histopathology, and immunological markers were studied. Our results confirm that CF induces anemic conditions, leukocytosis, elevated liver enzymatic activity, and alterations in renal biomarkers. Moreover, specific microscopic lesions such as multifocal necrosis, pyknotic nuclei, hemorrhages, congestion, and inflammatory cell proliferation were observed in the liver, kidney, spleen, and thymus. These findings suggest that CF can induce harmful effects, so the application of this pesticide in the field must be strictly monitored to mitigate the possibility of exposure to non-target species.

Resumo O presente estudo examina as correlações entre 15 caracteres morfométricos e 10 caracteres merísticos e comprimento total (CT) de machos, fêmeas e sexos combinados de Alepes vari (Cuvier, 1833), coletados do porto de Karachi, West Wharf, na costa de Karachi. As análises estatísticas das relações de regressão linear mostraram, principalmente, correlações fortes (r ≥ 0,70; p < 0,05) entre o CT e a maioria dos caracteres morfométricos em machos, fêmeas e sexos combinados, exceto a altura da nadadeira peitoral e o comprimento da base da nadadeira pélvica, enquanto os caracteres merísticos foram constantes, indicando correlações fracas ou negativas (r ≤ 0,50; p > 0,05) com o CT. Portanto, de acordo com nossos resultados, existe uma relação direta entre o CT dos peixes e todos os caracteres morfométricos, que foram considerados os melhores indicadores de crescimento do padrão alométrico positivo em peixes. Além disso, a análise do teste t de duas amostras revelou (teste t; p > 0,05) que nenhum dimorfismo sexual foi relatado em A. vari. Assim, o presente estudo pode ser valioso na classificação sistemática, dimorfismo sexual e manejo dessa espécie na costa de Karachi.

Abstract The present study examines the correlations between fifteen morphometric and ten meristic characters and total length (TL) of males, females, and combined sexes of Alepes vari (Cuvier, 1833) collected from Karachi fish harbor, West Wharf of Karachi Coast. Statistical analyses of linear regression relationships show mostly strong correlations (r≥0.70; p<0.05) between total length (TL) and most morphometric characters in males, females, and combined sexes, except the height of pectoral-fin (PFH), and pelvic-fin base length (PelFL); whereas, meristic characters were found to be constant and indicate weak or negative type correlations (r≤0.50; p>0.05) with total length (TL). Hence, according to our present results, there is a direct relationship between the total length of fish and all morphometric characters, which were found to be the best indicators of positive allometric pattern growth in fish. Moreover, analysis of the 2-sample t-test revealed (t-test; p>0.05) that no sexual dimorphism was reported in Alepes vari. Thus, our present study could be valuable in systematic classification, sexual dimorphism, and management of this species on the Karachi coast.

Resumo Os antioxidantes são materiais que eliminam ou removem os radicais livres dos sistemas vivos. O processo de oxidação termina na produção de radicais livres. Esses radicais livres são o principal local de nascimento das células cancerosas. Os agentes antioxidantes removem os intermediários dos radicais livres ao encerrar os processos de oxidação ao serem eles próprios oxidados. Por outro lado, as doenças infecciosas afetam o mundo em grande escala. Para combater essas doenças, diversos compostos sintéticos têm sido utilizados. Os medicamentos à base de plantas desempenham um papel importante a este respeito. Assim, o objetivo da pesquisa atual é investigar o efeito antibacteriano e antioxidante do extrato da casca da raiz de Berberis lycium Royle (BLR). Berberis lycium Royle foi utilizado para análises fitoquímicas e também como agentes antimicrobianos e antioxidantes. A atividade antimicrobiana foi avaliada pelo método de difusão em ágar em poço. A partir do estudo atual, observou-se que o BLR era rico em fitoquímicos e tóxico contra bactérias patogênicas testadas. BLR apresentou maior atividade contra S. pyogenes (13,3 ± 0,8 mm). A menor atividade antibacteriana foi relatada contra E. coli (0 ± 0 mm). No caso de concentração inibitória mínima, observou-se que BLR com concentração de 10 μg / mL apresentou maior atividade, enquanto BLR 2,5 μg / mL apresentou menor atividade inibitória. A maior atividade antioxidante in vitro foi registrada como 65% a 100 µg / mL. No caso do nível de atividade antioxidante in vivo de CAT, GSH e SOD diminuiu, enquanto o de MDA aumentou nos grupos tratados com CCl4 em comparação com o grupo controle. O tratamento com extrato de BLR reverteu todas essas mudanças significativamente. Os resultados atuais indicam que o BLR é eficaz contra patógenos bacterianos e também tem atividade antioxidante.

Abstract Antioxidants are materials that scavenge or remove free radicals from living systems. The oxidation process ends in the production of free radicals. These free radicals are the chief birthplace of cancerous cells. Antioxidizing agents remove free radical intermediates by terminating oxidation processes by being oxidized themselves. On the other hand, infectious diseases affect the world on a large scale. To fight these diseases several synthetic compounds have been used. Plant based medications play important role in this regard. So, the current research aimed to investigate the antibacterial and antioxidant effect of Berberis lycium Royle root bark (BLR) extract. Berberis lycium Royle was used for phytochemical analysis and also as antimicrobial and antioxidant agents. The antimicrobial activity was evaluated by the agar well diffusion method. Current study revealed that BLR was rich in phytochemicals and toxic against tested pathogenic bacteria. BLR showed the highest activity against S. pyogenes (13.3±0.8 mm). The lowest antibacterial activity was reported against E. coli (0±0 mm). In case of minimum inhibitory concentration, it was observed that BLR with 10 μg/mL concentration showed the highest activity while 2.5 μg/mL of BLR showed the least inhibitory activity. The highest In vitro antioxidant activity was recorded as 65% at 100 µg/mL. In case of in vivo antioxidant activity level of CAT, GSH and SOD were decreased while that of MDA was enhanced in groups treated with CCl4 as compared to the control group. BLR extract treatment reversed all these changes significantly. Current results indicate that BLR is effective against bacterial pathogens and also has antioxidant potential.

Resumo Os produtos naturais têm se mostrado muito eficazes contra várias doenças desafiadoras, incluindo câncer e infecções bacterianas. O gálio tricorne é uma importante fonte de produtos naturais, ainda pouco explorada, apesar de sua profunda proeminência etnomedicinal. O presente estudo foi desenvolvido para explorar o potencial biológico de G. tricorne e extrair e isolar constituintes químicos de sua parte aérea e sementes, respectivamente, juntamente com a identificação de seus constituintes químicos. A triagem fitoquímica foi realizada para descobrir a presença de metabólito secundário em G. tricorne, extrato metanólico bruto (Gt.Crd) que foi obtido da parte aérea enquanto os ácidos graxos foram extraídos das sementes, que posteriormente foram analisadas por GCMS. Da mesma forma, os métodos Well Diffusion e MTT foram usados para atividade antibacteriana e ensaio de linha de células cancerígenas, respectivamente. Para avaliar o potencial citotóxico, foram utilizadas artémias. Da mesma forma, na análise de cromatografia gasosa-espectroscopia de massa (GC-MS) um número total de 23 compostos foi identificado no extrato de Gt.Crd, dos quais 7 compostos foram selecionados para ter algum tipo de perfil de toxicidade. Da mesma forma, 5 ácidos graxos foram identificados nas sementes de G. tricorne. Além disso, entre as frações, a fração clorofórmio (Gt.Chf) apresentou maior zona de inibição (ZOI), 20,37 mm, seguida de Gt.Crd 18,40 mm contra S. aureus e S. pyogenes, respectivamente. Na citotoxicidade Gt.Chf foi mais ativo seguido pela fração acetato de etila (Gt.Eta), exibindo 88,32±0,62% (LC50=60 µg/mL) e 73,95±2,25% (LC50=80 µg/mL) respectivamente a 1000 µg/ concentração de mL da amostra testada. Gt.Chf exibiu maior atividade inibitória da linha celular (IC50 = 61 µg/mL) contra a linha celular HeLa. Da mesma forma, Gt.Crd apresentou valores de IC50 de 167,84 µg/mL e 175,46 µg/mL contra linha celular HeLa e NIH/3T3, respectivamente. Com base na revisão de literatura e triagens, pode-se concluir que a parte aérea e as sementes de G. tricorne são as ricas fontes de compostos bioativos. Os resultados do presente estudo também autenticam a base científica para os usos etnomedicinais de G. tricorne.

Abstract Natural products have long been proven very effective against various challenging diseases including cancer and bacterial infections. Galium tricorne is one of the important source of natural products, which has not been explored till date in spite of its profound ethnomedicinal prominence. The current study has been designed to explore the biological potential of G. tricorne and to extract and isolate chemical constituents from its aerial part and seeds respectively along with identification of their chemical constituents. Phytochemical screening was performed to figure out the presence of secondary metabolite in G. tricorne. Crude Methanolic extract (Gt.Crd), which was obtained from the aerial part while the fatty acids were extracted from the seeds, which were later on analyzed by GCMS. Similarly, Well Diffusion and MTT method were used for antibacterial activity and cancer cell line assay respectively. To evaluate the cytotoxic potential, brine shrimps were used. Likewise, in Gas Chromatography-Mass Spectroscopy (GC-MS) analysis a total number of 23 compounds were identified in Gt.Crd extract out of which 7 compounds were sorted out to have some sort of toxicity profile. In the same fashion, 5 fatty acids were identified in the seeds of G. tricorne. Moreover, among the fractions, chloroform fraction (Gt.Chf) exhibited greater zone of inhibition (ZOI) 20.37 mm followed by Gt.Crd 18.40 mm against S. aureus and S. pyogenes respectively. In cytotoxicity Gt.Chf was more active followed by ethyl acetate fraction (Gt.Eta) by exhibiting 88.32±0.62% (LC50=60 µg/mL) and 73.95±2.25% (LC50=80 µg/mL) respectively at 1000 µg/mL concentration of the tested sample. Gt.Chf exhibited greater cell line inhibitory activity (IC50=61 µg/mL) against HeLa cell line. Similarly, Gt.Crd displayed IC50 values of 167.84 µg/mL and 175.46 µg/mL against HeLa and NIH/3T3 cell line respectively. Based on the literature review and screenings, it may be concluded that the aerial part and seeds of G. tricorne are the rich sources of bioactive compounds. The results of the current study also authenticate the scientific background for the ethnomedicinal uses of G. tricorne.

Resumo Este estudo tem como objetivo relatar o conhecimento indígena sobre a flora medicinal dos habitantes do entorno da maior floresta artificial plantada do mundo, a Changa Manga, no Paquistão. Os dados foram coletados por meio de entrevistas diretas e reuniões em grupo de 81 habitantes, incluindo 32 curandeiros locais, com informações sobre o uso de plantas medicinais indígenas durante o período de um ano. Diferentes ferramentas estatísticas foram aplicadas para analisar os dados, incluindo citação de frequência (FC), citação de frequência relativa (RFC), valor de uso, fator de consenso dos informantes e nível de fidelidade. Este estudo relatou 73 espécies de plantas pertencentes a 37 famílias de plantas e 46 gêneros. A maioria das espécies de plantas pertence à família Compositae. As plantas medicinais mais utilizadas foram P. hysterophorus L., P. dactylifera L., S. indicum L., P. harmala L., P. emblica L. e A. indica A. Juss. O maior número de espécies foi usado para curar distúrbios gastrointestinais. O maior nível de fidelidade (68,18%) foi de E. helioscopia para cura de distúrbios gastrointestinais. Os usos máximos em fresco (17) foram relatados por C. dactylon (L.) Pars. enquanto o maior número de espécies relatando usos frescos em número semelhante foi de 13. Neste estudo, cinco novas plantas estão sendo relatadas pela primeira vez no Paquistão por seu valor etnomedicinal. Nossos dados refletem o uso exclusivo das plantas medicinais na área de estudo. As ferramentas estatísticas utilizadas no estudo mostraram-se úteis para apontar as plantas mais importantes e específicas da categoria de doença. Plantas de alto valor de uso e as novas plantas medicinais relatadas podem ser uma importante fonte de isolamento de compostos farmacologicamente ativos.

Abstract This study aims at reporting the indigenous knowledge of the medicinal flora from the inhabitants of surroundings of the World’s largest artificial planted forest “Changa Manga”, Pakistan. Data were collected by direct interviews and group meetings from 81 inhabitants including 32 local healers having information regarding the use of indigenous medicinal plants over a period of one year. Different statistical tools were applied to analyze the data including Frequency citation (FC), Relative frequency citation (RFC), Use Value, Factor of informants consensus and fidelity level. This study reported 73 plant species belonging to 37 plant families and 46 genera. The majority of plant species belong to compositae family. The most commonly used medicinal plants were P. hysterophorus L., P. dactylifera L., S. indicum L, P. harmala L., P. emblica L., and A. indica A.Juss. The greatest number of species was used to cure gastrointestinal disorders. The highest fidelity level (68.18%) was of E. helioscopia to cure gastrointestinal disorders. Maximum fresh uses (17) were reported by C. dactylon (L.) Pars. While the highest number of species reporting fresh uses in similar number was 13. In this study, five novel plants are being reported for the first time in Pakistan for their ethnomedicinal worth. Our data reflect unique usage of the medicinal plants in the study area. The statistical tools used in the study proved useful in pointing the most important and disease category specific plants. High use value plant and the new reported medicinal plants might prove an important source of the isolation of pharmacologically active compounds.

Resumo O protocolo de imersão floral mediado por Agrobacterium é o método de transformação mais amplamente utilizado para uma planta-modelo Arabidopsis thaliana. Existem vários métodos úteis para transformações de Arabidopsis mediados por Agrobacterium tumefaciens, mas são demorados e com baixa eficiência de transformação. Aqui, desenvolvemos uma linha transgênica de Arabidopsis TET12p::TET12-RFP em um curto período de tempo e eficiência de transformação aprimorada usando um método de transformação modificado por meio da aplicação de estresse hídrico após o mergulho floral. Neste protocolo, células de Agrobacterium transportando vetores recombinantes TET12p::TET12-RFP foram ressuspensas em uma solução de 5% de sacarose, 0,05% (v/v) silwet L-77 para transformar gametas femininos de inflorescências de Arabidopsis em desenvolvimento. Arabidopsis tratadas foram então aplicadas com diferentes níveis de estresse hídrico para estimular as plantas a utilizar o máximo de energia da planta no processo de maturação das sementes. Os estresses aplicados alcançaram a rápida maturação das inflorescências já tratadas enquanto paravam o crescimento de inflorescências não tratadas recém-surgidas, diminuindo, assim, as chances de coleta errada de sementes não transformadas. Consequentemente, as sementes coletadas eram principalmente transgênicas, com uma frequência de transformação de pelo menos 10%; portanto, a triagem para seleção dos transformantes positivos foi mais vantajosa em um meio seletivo em comparação com um método clássico de imersão floral. Dentro de 2-3 meses, 200 plantas transgênicas individuais foram produzidas a partir de apenas 10 plantas infiltradas. Este estudo conclui que a aplicação de estresse hídrico em um estágio específico da planta é uma estratégia benéfica para alcançar a Arabidopsis transgênica em um curto período de tempo com alta eficiência de transformação.

Abstract The Agrobacterium-mediated floral dip protocol is the most extensively used transformation method for a model plant Arabidopsis thaliana. Several useful methods for Agrobacterium tumefaciens–mediated transformations of Arabidopsis are existing, but they are time consuming and with low transformation efficiency. Here, we developed a transgenic Arabidopsis lines TET12p::TET12-RFP in a short period of time and enhanced transformation efficiency by using a modified transformation method by applying drought stress after floral dip. In this protocol, Agrobacterium cells carrying TET12p::TET12-RFP recombinant vectors were resuspended in a solution of 5% sucrose, 0.05% (v/v) silwet L-77 to transform female gametes of developing Arabidopsis inflorescences. Treated Arabidopsis were then applied with different levels of drought stresses to stimulate plants for the utilization of maximum plant energy in seed maturation process. The applied stresses achieved the fast maturation of already treated inflorescences while stopped the growing of newly arising untreated inflorescence, thus decreased the chances of wrong collection of untransformed seeds. Consequently, the collected seeds were mostly transgenic with a transformation frequency of at least 10%, thus the screening for positive transformants selection was more advantageous on a selective medium as compared to a classical floral dip method. Within 2-3 months, two hundred of individual transgenic plants were produced from just 10 infiltrated plants. This study concludes that application of drought stresses in a specific stage of plant is a beneficial strategy for achieving the transgenic Arabidopsis in a short period of time with high transformation efficiency.

Resumo As proteínas do tipo germin (GLPs) desempenham um papel importante contra vários estresses. O genoma de Vitis vinifera L. contém 7 GLPs; muitos deles são funcionalmente inexplorados. No entanto, a análise computacional pode fornecer informações importantes sobre sua função. Atualmente, as propriedades físico-químicas, localização subcelular, arquitetura de domínio, estruturas 3D, sítios de N-glicosilação e fosforilação e estudos filogenéticos dos VvGLPs foram conduzidos usando as ferramentas computacionais mais recentes. Suas funções foram previstas usando a ferramenta Search para recuperação de genes/proteínas em interação (STRING) e servidores Blast2Go. A maioria dos VvGLPs são extracelulares (43%) na natureza, mas também mostraram expressão periplasmática (29%), na membrana plasmática (14%) e específica para mitocôndrias ou cloroplastos (14%). A análise funcional previu atividades enzimáticas únicas para essas proteínas, incluindo terpeno sintase, isoprenoide sintase, lipoxigenase, fosfato permease, receptor quinase e hidrolases geralmente mediadas por cátion Mn +. VvGLPs mostraram similaridade na estrutura geral, forma e posição do domínio cupin. Funcionalmente, os VvGLPs controlam e regulam a produção de metabólitos secundários para lidar com vários estresses. Filogeneticamente, VvGLP1, -3, -4, -5 e VvGLP7 mostraram maior similaridade devido à duplicação, enquanto VvGLP2 e VvGLP6 revelaram uma relação distante. A análise do promotor revelou a presença de diversos elementos cis-reguladores, entre os quais CAAT box, MYB, MYC, sem nome-4, sendo comum a todos eles. A análise ajudará a utilizar VvGLPs e seus promotores em programas alimentares futuros, desenvolvendo cultivares resistentes contra vários estresses bióticos (Erysiphe necator e no oídio, etc.) e abióticos (sal, seca, calor, estresse hídrico, etc.).

Abstract Germin-like proteins (GLPs) play an important role against various stresses. Vitis vinifera L. genome contains 7 GLPs; many of them are functionally unexplored. However, the computational analysis may provide important new insight into their function. Currently, physicochemical properties, subcellular localization, domain architectures, 3D structures, N-glycosylation & phosphorylation sites, and phylogeney of the VvGLPs were investigated using the latest computational tools. Their functions were predicted using the Search tool for the retrieval of interacting genes/proteins (STRING) and Blast2Go servers. Most of the VvGLPs were extracellular (43%) in nature but also showed periplasmic (29%), plasma membrane (14%), and mitochondrial- or chloroplast-specific (14%) expression. The functional analysis predicted unique enzymatic activities for these proteins including terpene synthase, isoprenoid synthase, lipoxygenase, phosphate permease, receptor kinase, and hydrolases generally mediated by Mn+ cation. VvGLPs showed similarity in the overall structure, shape, and position of the cupin domain. Functionally, VvGLPs control and regulate the production of secondary metabolites to cope with various stresses. Phylogenetically VvGLP1, -3, -4, -5, and VvGLP7 showed greater similarity due to duplication while VvGLP2 and VvGLP6 revealed a distant relationship. Promoter analysis revealed the presence of diverse cis-regulatory elements among which CAAT box, MYB, MYC, unnamed-4 were common to all of them. The analysis will help to utilize VvGLPs and their promoters in future food programs by developing resistant cultivars against various biotic (Erysiphe necator and in Powdery Mildew etc.) and abiotic (Salt, drought, heat, dehydration, etc.) stresses.

Resumo A fibrose hepática é a fase inicial de qualquer doença hepática crônica, e em sua fase final desenvolve-se para cirrose. As doenças hepáticas crônicas são uma questão de saúde global crucial e a causa de aproximadamente 2 milhões de mortes por ano em todo o mundo. A cirrose, hoje em dia, é a 11ª causa mais comum de morte globalmente. O tratamento da célula-tronco mesenquimal (MSCs) é uma maneira eletiva de tratar a doença hepática aguda e crônica. O objetivo deste estudo é melhorar o potencial terapêutico dos MSCs combinados com a melatonina (MLT) para superar a fibrose hepática induzida por CCl4 e também investigar o impacto individual da melatonina e MSCs contra o comprometimento do fígado induzido por CCl4 no modelo animal. Os ratos BALB / C fêmeas foram usados como modelo de animal fibrótico de fígado induzido por CCl4. Cinco grupos de modelo animal foram feitos: Controle Negativo, Controle Positivo, CCl4 + MSCs Tratados Grupo, Grupo Tratado CCl4 + MLT e Grupo Tratado CCl4 + MSCs + MLT. MSCs cultivados da medula óssea dos ratos foram transplantados para o modelo de camundongos de fígado induzido por CCl4, individualmente, bem como em conjunto com a melatonina. Duas semanas após a administração MSCs e MLT, todos os grupos de camundongos foram sacrificados para o exame. Os resultados morfológicos e histopatológicos mostraram que a terapia combinada do MSCs + MLT mostrou impacto benéfico substancial no modelo ferido no fígado induzido pelo CCl4, em comparação com o MSCs e o MLT individualmente. A redução bioquimicamente considerável foi observada em bilirrubina sérica e níveis ALT de ratinhos tratados com MLT + MSCs, em comparação com outros grupos. Os resultados de PCR mostraram regulação negativa do BAX e regulação positiva do BCL-XL e da albumina, confirmando um efeito terapêutico significativo do MSCs + MLT na fibrose hepática induzida por CCl4. Dos resultados, conclui-se que a terapia combinada de MSCs e MLT mostram um forte efeito terapêutico na fibrose hepática induzida por CCl4, em comparação com MSCs e MLT individualmente.

Abstract Liver fibrosis is initial stage of any chronic liver disease and its end stage is develops into cirrhosis. Chronic liver diseases are a crucial global health issue and the cause of approximately 2 million deaths per year worldwide. Cirrhosis is currently the 11th most common cause of death globally. Mesenchymal stem cell (MSCs) treatment is the best way to treat acute and chronic liver disease. The aim of this study is to improve the therapeutic potential of MSCs combined with melatonin (MLT) to overcome CCl4-induced liver fibrosis and also investigate the individual impact of melatonin and MSCs against CCl4-induced liver impairment in animal model. Female BALB/c mice were used as CCL4-induced liver fibrotic animal model. Five groups of animal model were made; negative control, Positive control, CCl4+MSCs treated group, CCl4+MLT treated group and CCl4+MSCs+MLT treated group. Cultured MSCs from mice bone marrow were transplanted to CCl4-induced liver injured mice model, individually as well as together with melatonin. Two weeks after MSCs and MLT administration, all groups of mice were sacrificed for examination. Morphological and Histopathological results showed that combined therapy of MSCs+MLT showed substantial beneficial impact on CCl4-induced liver injured model, compared with MSCs and MLT individually. Biochemically, considerable reduction was observed in serum bilirubin and ALT levels of MLT+MSC treated mice, compared to other groups. PCR results shown down-regulation of Bax and up-regulation of Bcl-xl and Albumin, confirm a significant therapeutic effect of MSCs+MLT on CCI4-induced liver fibrosis. From the results, it is concluded that combined therapy of MSCs and MLT show strong therapeutic effect on CCL4-induced liver fibrosis, compared with MSCs and MLT individually.

Resumo O objetivo básico deste estudo foi determinar a diversidade ictiofaunística do rio Panjkora nos distritos de Lower e Upper de Dir, na província de Khyber Pakhtunkhwa, no Paquistão. Amostras de peixes foram coletadas com redes de arrasto de março a setembro de 2020. Foram coletados 724 espécimes, classificados em 5 famílias, 14 gêneros e 18 espécies. Os resultados gerais revelaram que a maioria da ictiofauna do rio Panjkora contém 8 espécies da família Cyprinidae (56,49%), seguidas por 4 espécies de Nemacheilidae (24,44%), 2 espécies de Channidae (10,63%) e Sisoridae (7,04%) e 1 espécie de Mastacembelidae (1,38%). Entre todas as espécies de peixes, Schizothorax plagiostomus (16,57%) foi altamente predominante, seguida por Carassius auratus (11,87%) e Racoma labiata (9,66%), e elas foram relatadas como altamente abundantes, especialmente nos meses de abril, maio e junho. As espécies menos abundantes foram Glyptothorax punjabensis, Glyptothorax sufii e Mastacembelus armatus, que constituíram 2,48%, 2,20% e 1,38%, respectivamente, do total de peixes amostrados. O índice de diversidade de Simpson (1-D = 0,919), o índice recíproco de Simpson (1/D = 12,3876) e o índice de Shannon (H = 2,68) indicaram que o rio Panjkora contém um grupo bastante rico e diversificado de espécies de peixes. Os microplásticos mais altos foram observados no local 7 em comparação com outra área de estudo. Medidas de conservação devem ser tomadas como prioridade máxima para proteger e conservar o ambiente marinho e o patrimônio natural de novas perdas e extinção e para parar ou minimizar as perdas ocorridas por práticas de pesca irresponsáveis.

Abstract The basic aim of this study was aimed to determine the ichthyofaunal diversity of River Panjkora in both upper and lower Dir districts in Khyber Pakhtunkhwa province of Pakistan.Fish samples were collected by using fishnets from March to September 2020. A total of 724 specimens were collected and classified into 5 families, 14 genera, and 18 species. The overall results revealed that most fish fauna of river Panjkora contains 8 species of family Cyprinidae (56.49%) followed by 4 species of Nemacheilidae (24.44%), 2 species of Channidae (10.63%), and Sisoridae (7.04%), and 1 species of Mastacembelidae (1.38%), respectively. Among all kinds of fish species, Schizothorax plagiostomus (16.57%) was highly dominated and followed by Carassius auratus (11.87%) and Racoma labiata (9.66%) and were reported as highly abundant, especially during April, May, and June. The least abundant species were Glyptothorax punjabensis, Glyptothorax sufii, and Mastacembelus armatus, that constituting 2.48%, 2.20%, and 1.38% of the total fish samples. The Overall Simpson’s diversity (1-D= 0.919) and Simpson’s Reciprocal index values (1/D= 12.3876), and Shannon’s index (H= 2.68) were indicating that river Panjkora contains a quite rich and diverse group of fish species. The highest microplastics observed in site 7 compared to other study area. Conservation steps should be taken as a top priority to protect and conserve the marine environment and natural heritage from further loss, extinction and stop or minimize losses incurred through irresponsible fishery practices

Resumo O presente estudo teve como objetivo investigar a relação entre polimorfismos em genes desintoxicantes (GSTM1, GSTT1 e GSTP1) e sua associação com câncer colorretal (CCR) em tabagistas da etnia pashtun. Os polimorfismos nos genes selecionados foram genotipados em um estudo de caso-controle composto por 100 pacientes do sexo masculino com CCR, confirmados histologicamente, e 100 controles saudáveis, pareados por ano de nascimento e sexo usando o método PCR-RFLP. Os genótipos GSTM1 nulo e GSTT1 nulo contribuíram significativamente para o risco de CCR nos casos (OR = 3,131, IC 95%: 1,451-6,758, P = 0,004; OR = 3,541, IC 95%: 1,716-7,306, P = 0,001, respectivamente), enquanto a associação observada para GSTP1 Val/Val (1,139, IC 95%: 0,356-3,644, P = 0,826) não apresentou significância estatística. O GSTM1 nulo e o GSTT1 nulo combinados mostraram um risco 41 vezes maior (IC 95%: 4,945-351,950, P = 0,001) para CCR, enquanto os genótipos GSTM1 nulo e GSTP1 Ile/Val ou Val/Val combinados apresentaram risco cerca de 3 vezes maior (IC 95%: 1,196-7,414, P = 0,019) para CCR. Da mesma forma, os genótipos combinados GSTT1 nulo e GSTP1 Ile/Val ou Val/Val tiveram um risco para CRC cerca de 3 vezes maior (95% CI: 1,285-8,101, P = 0,013). Na combinação de três genótipos GST, os genótipos GSTM1 nulo, GSTT1 nulo e GSTP1 Ile/Val ou Val/Val apresentaram um risco 22 vezes maior (IC 95%: 2,441-212,106, P = 0,006) para CRC. Nossos achados sugerem que o polimorfismo GSTM1 e GSTT1 e sua combinação com GSTP1 podem estar associados à suscetibilidade ao CRC da população pashtun de Khyber Pakhtunkhwa, Paquistão, viciada em Naswar.

Abstract The current study aimed to investigate the relationship between polymorphisms in detoxifying (GSTM1, GSTT1, and GSTP1) genes and their association with colorectal cancer (CRC) in tobacco addicts of Pashtun ethnicity. Polymorphisms in the selected genes were genotyped in a case-control study consisting of 100 histologically confirmed male CRC patients and 100 birth-year and gender-matched healthy controls using the PCR−RFLP method. The GSTM1 null, and GSTT1 null genotypes were significantly contributed to the risk of CRC in the cases (OR= 3.131, 95% CI: 1.451−6.758, P = 0.004, and OR= 3.541, 95% CI: 1.716−7.306, P = 0.001, respectively), whereas the association observed for GSTP1 Val/Val (1.139, 95% CI: 0.356−3.644, P = 0.826) did not show statistical significance. The combined GSTM1 null and GSTT1 null showed a 41-fold increased risk (95% CI: 4.945−351.950, P = 0.001), while, the combined GSTM1 null and GSTP1 Ile/Val or Val/Val variant genotypes exhibited about 3-fold (95% CI: 1.196−7.414, P = 0.019) increased risk to CRC. Similarly, the combined GSTT1 null and GSTP1 Ile/Val or Val/Val variant genotypes showed about a 3-fold (95% CI: 1.285−8.101, P = 0.013) increased risk of CRC. In the combination of three GST genotypes, the GSTM1 null, GSTT1 null, and GSTP1 Ile/Val or Val/Val variant genotypes demonstrated a more than a 22-fold (95% CI: 2.441−212.106, P = 0.006) increased risk of CRC. Our findings suggest that GSTM1 and GSTT1 polymorphism and its combination with GSTP1 may be associated with CRC susceptibility in the Naswar addicted Pashtun population of Khyber Pakhtunkhwa, Pakistan.

Resumo A seca é um dos estresses abióticos mais prejudiciais que dificultam o crescimento e o desenvolvimento das plantas. O presente estudo teve como objetivo determinar os efeitos de vários quocientes de Ca/Mg sob estresse osmótico induzido por polietilenoglicol (PEG) no crescimento, absorção e translocação de Ca e Mg em Avena sativa L. As plantas foram cultivadas em solução nutritiva suplementada com três diferentes quocientes molares de Ca/Mg (0,18, 2 e 4). Após 30 dias, as plantas foram expostas a duas concentrações diferentes de PEG (0,6 MPa e 0,2 MPa) por 8 dias, e as soluções foram renovadas após 4 dias. Uma solução contendo os nutrientes Ca e Mg mitigou o impacto negativo causado por estresse osmótico na taxa de crescimento relativo (RGR), taxa de crescimento absoluto (AGR), taxa de crescimento da cultura (CGR), razão de área foliar (LAR), razão de índice foliar (LAI), razão raiz-parte aérea (RSR), eficiência do uso da água (WUE) e taxa de assimilação líquida (NAR). Além disso, afetou negativamente os parâmetros de germinação, incluindo porcentagem final de emergência (FEP), tempo médio de germinação (MGT), índice de germinação de Timson (TGI), índice de taxa de germinação (GRI) e capacidade de campo percentual (%FC) de aveia (Avena sativa L.). O Mg e o Ca na parte aérea e raiz e o fator de translocação de Ca diminuíram com o aumento de Ca em solução, enquanto o fator de translocação de Mg aumentou com o aumento de Ca em solução nutritiva. Neste trabalho, são examinados os efeitos combinados de vários quocientes de Ca/Mg e estresse osmótico produzido por PEG em diferentes concentrações (0,6 MPa e 0,2 MPa) no crescimento e na absorção de elementos de Avena sativa L. Como resultado, o quociente de Ca/Mg pode combater naturalmente o estresse hídrico moderado experimentado pelas lavouras.

Abstract Drought is one of the most damaging abiotic stress that hinder plant growth and development. The present study aimed to determine the effects of various Ca/Mg quotients under polyethylene glycol (PEG)–induced osmotic stress on growth, uptake and translocation of Ca and Mg in Avena sativa (L). Plants were grown in nutrient solution supplemented with three different Ca/Mg molar quotients (0.18, 2, and 4). After 30 days plants were exposed to two different PEG (Polyethylene glycol) concentrations (0.6 MPa & 0.2 MPa) for 8 days, and solutions were renewed after 4 days. A solution containing Ca and Mg nutrients has mitigated the negative impact caused via osmotic stress on relative growth rate (RGR), absolute growth rate (AGR), crop growth rate (CGR), leaf area ratio (LAR), Leaf index ratio (LAI), root-shoot ratio (RSR), water use efficiency (WUE) and net assimilation rate (NAR). In addition, it adversely affected germination parameters, including final emergence percentage (FEP), mean germination time (MGT), Timson germination Index (TGI), germination rate index (GRI) and percent field capacity (%FC), of oat (Avena sativa L.). Mg and Ca in shoot and root and Ca translocation factor decreased with increasing Ca in solution, while Mg translocation factor increased with increasing Ca in nutrient solution. In this work, the combined effects of various Ca/Mg quotients and osmotic stress produced by polyethylene glycol (PEG) in different concentrations (0.6 MPa, 0.2 MPa) on the growth and element uptake of Avena sativa L. are examined. As a result, the Ca/Mg Quotient may naturally combat the moderate drought stress experienced by field crops.

Abstract Heart and blood vessel disorders, such as coronary heart disease, brain vessel disease, rheumatic heart disease, and others, are together referred to as cardiovascular disease (CVD). In this study, we sought to determine how mitochondrial Leucine Transfer RNA genes and CVDs are related (MT-L1 and MT-L2). From CVD patients in Peshawar, a total of 27 saliva samples were taken. Leu-tRNA genes expressed by mitochondria were amplified using polymerase chain reaction after DNA was removed. Ten samples were sent for sequencing after PCR and gene cleaning. We obtained all of the sequenced results, which were subsequently aligned and evaluated against the mitochondrial revised Cambridge Reference Sequence (rCRS). However, in our sequenced samples, Leu-tRNA MT-L1 and MT-L2 genes were determined to be unaltered. Thus, it is suggested that a large population be taken into account while screening for mutations in the mitochondrial encoded Leu-tRNA MT-L1 and MT-L2 genes of cardiac patients in areas of Pakistan. Additionally, it is recommended that patients with cardiac problems should also have other mitochondrial encoded genes checked for potential mutations. This could result in the identification of genetic markers that could be used for early CVD screening in Pakistan.

Resumo Distúrbios do coração e dos vasos sanguíneos, como doença cardíaca coronária, doença dos vasos cerebrais, doença cardíaca reumática entre outros, são referidos juntos como doença cardiovascular (DCV). Neste estudo, procuramos determinar como os genes mitocondriais do RNA de transferência de leucina e as DCVs estão relacionados (MT-L1 e MT-L2). Foi coletado um total de 27 amostras de saliva de pacientes com DCV em Peshawar. Genes de Leu-tRNA expressos por mitocôndrias foram amplificados usando reação em cadeia da polimerase (PCR) após a remoção do DNA. Dez amostras foram enviadas para sequenciamento após PCR e limpeza gênica. Obtivemos todos os resultados sequenciados, que foram posteriormente alinhados e avaliados em comparação com a Sequência de Referência de Cambridge revisada (rCRS). No entanto, em nossas amostras sequenciadas, os genes Leu-tRNA MT-L1 e MT-L2 foram determinados como inalterados. Assim, sugere-se que uma grande população seja levada em consideração durante a triagem de mutações nos genes Leu-tRNA MT-L1 e MT-L2 mitocondriais codificados de pacientes cardíacos em áreas do Paquistão. Além disso, recomenda-se que outros genes mitocondriais codificados de pacientes com problemas cardíacos também sejam verificados quanto a possíveis mutações. Isso pode resultar na identificação de marcadores genéticos que podem ser usados para triagem precoce de DCV no Paquistão.

Abstract The presence of microplastics in aquatic environments has raised concerns about their abundance and potential hazards to aquatic organisms. This review provides insight into the problem that may be of alarm for freshwater fish. Plastic pollution is not confined to marine ecosystems; freshwater also comprises plastic bits, as the most of plastic fragments enter oceans via rivers. Microplastics (MPs) can be consumed by fish and accumulated due to their size and poor biodegradability. Furthermore, it has the potential to enter the food chain and cause health problems. Evidence of MPs s ingestion has been reported in >150 fish species from both freshwater and marine systems. However, microplastic quantification and toxicity in freshwater ecosystems have been underestimated, ignored, and not reported as much as compared to the marine ecosystem. However, their abundance, influence, and toxicity in freshwater biota are not less than in marine ecosystems. The interaction of MPs with freshwater fish, as well as the risk of human consumption, remains a mystery. Nevertheless, our knowledge of the impacts of MPs on freshwater fish is still very limited. This study detailed the status of the toxicity of MPs in freshwater fish. This review will add to our understanding of the ecotoxicology of microplastics on freshwater fish and give subsequent research directions.

Resumo A presença de microplásticos em ambientes aquáticos levantou preocupações sobre sua abundância e perigos potenciais para os organismos que vivem nesse meio. Esta revisão fornece informações sobre o problema que pode ser alarmante para os peixes de água doce. A poluição plástica não se limita aos ecossistemas marinhos; a água doce também contém pedaços de plástico, já que a maioria dos fragmentos de plástico entra nos oceanos por meio dos rios. Os microplásticos (MPs) podem ser consumidos pelos peixes e acumulados devido ao seu tamanho e baixa biodegradabilidade. Além disso, tem o potencial de entrar na cadeia alimentar e causar problemas de saúde. Evidências de ingestão de MPs foram relatadas em mais de 150 espécies de peixes de sistemas de água doce e marinhos. No entanto, a quantificação e a toxicidade de microplásticos em ecossistemas de água doce foram subestimadas, ignoradas e não relatadas tanto quanto em comparação com o ecossistema marinho. No entanto, sua abundância, influência e toxicidade na biota de água doce não são menores que nos ecossistemas marinhos. A interação de MPs com peixes de água doce, bem como o risco de consumo humano, permanece um mistério. Todavia, nosso conhecimento sobre os impactos das MPs em peixes de água doce ainda é muito limitado. Este estudo detalhou o status da toxicidade de MPs em peixes de água doce. Esta revisão aumentará nossa compreensão da ecotoxicologia de microplásticos em peixes de água doce e fornecerá direções de pesquisa subsequentes.

Resumo O presente estudo teve como objetivo determinar o efeito de diferentes níveis de proteína sobre o crescimento, composição corporal, perfil de aminoácidos e sorologia de alevinos de Channa marulius. O experimento foi conduzido em dez happas instalados em tanques de terra, cada um abastecido com 10 peixes, por 90 dias. Quatro alimentos para peixes comerciais com níveis de 25%, 30%, 32% e 40% de proteína bruta (PB) foram dados aos peixes com 3% de seu peso corporal úmido três vezes ao dia. Os resultados do estudo revelaram que maior ganho de peso, taxa de conversão alimentar e taxa de sobrevivência foram observados em 30% de proteína alimentar. Enquanto isso, o conteúdo de umidade foi maior em peixes alimentados com 30% de PB, enquanto a proteína bruta mais alta foi registrada em peixes alimentados com 40% de PB. O menor conteúdo de gordura foi observado em rações com 32% de PB. O perfil de aminoácidos dos peixes revelou melhores resultados na ração com 30% de PB. Proteína total, glicose e globulina também foram maiores em peixes alimentados com ração com 30% de PB, enquanto a albumina foi mais alta com 40% de PB. Conclui-se que a ração com 30% de PB apresentou melhores resultados em termos de crescimento, perfil de aminoácidos e parâmetros sorológicos sem afetar a composição corporal dos peixes.

Abstract The present study aimed to determine the effect of different levels of protein on the growth, body composition, amino acid profile and serology of Channa marulius fingerlings. The experiment was conducted in ten happas installed in earthen ponds, each stocked with 10 fishes for 90 days. Four commercial fish feeds having 25%, 30%, 32% and 40% crude protein (CP) levels were fed to fish at 3% of their wet body weight three times a day. The results of the study revealed that highest weight gain, feed conversion ratio and survival rate were observed in 30% protein feed. Meanwhile, moisture content was higher in fish fed with 30% CP feed while highest crude protein was recorded in 40% CP fed fish. Lowest fat content was observed in 32% CP feed. Amino acid profile of fish revealed better results in 30% CP feed. Total protein, glucose and globulin were also highest in fish feeding 30% CP feed, while albumin was highest in 40% CP feed. It is concluded that 30% CP feed showed better results in terms of growth, amino acid profile and serological parameters without effecting fish body composition.

Resumo O câncer é uma doença maligna fatal e sua crescente prevalência mundial exige a descoberta de biomarcadores moleculares mais sensíveis e confiáveis. Investigar o nível de expressão de GINS1 e seu valor prognóstico em cânceres humanos distintos, usando uma série de abordagens in silico em várias camadas, pode ajudar a estabelecê-lo como um potencial biomarcador de diagnóstico e prognóstico compartilhado de diferentes subtipos de câncer. O mRNA de GINS1, a expressão da proteína e a metilação do promotor foram analisados usando UALCAN e Human Protein Atlas (HPA), enquanto a expressão de mRNA foi posteriormente validada via GENT2. Os valores prognósticos potenciais de GINS1 foram avaliados por meio do plotter KM. Em seguida, o cBioPortal foi utilizado para examinar as mutações genéticas relacionadas ao GINS1 e as variações do número de cópias (CNVs), enquanto a análise de enriquecimento da via foi realizada usando DAVID. Além disso, uma análise correlacional entre a expressão de GINS1 e células imunes T CD8 + e a construção de uma rede de interação gene-droga foi realizada usando TIMER, CDT e Cytoscape. O GINS1 foi encontrado regulado negativamente em um único subtipo de câncer humano, enquanto comumente regulado positivamente em 23 outros subtipos diferentes. A regulação positiva de GINS1 foi significativamente correlacionada com a sobrevida global pobre (OS) de Carcinoma Hepatocelular de Fígado (LIHC), Adenocarcinoma de Pulmão (LUAD) e Carcinoma de Células Claras Renais de Rim (KIRC). O GINS1 também foi encontrado regulado positivamente em pacientes LIHC, LUAD e KIRC de diferentes características clínico-patológicas. A análise de enriquecimento de vias revelou o envolvimento de GINS1 em duas vias diversas, enquanto poucas correlações interessantes também foram documentadas entre a expressão de GINS1 e seu nível de metilação do promotor, nível de células imunes T CD8 + e CNVs. Além disso, também previmos poucos medicamentos que poderiam ser usados no tratamento de LIHC, LUAD e KIRC, regulando a expressão de GINS1. O perfil de expressão de GINS1 no estudo atual sugeriu que é um novo biomarcador de diagnóstico e prognóstico compartilhado de LIHC, LUAD e KIRC.

Abstract Cancer is a fatal malignancy and its increasing worldwide prevalence demands the discovery of more sensitive and reliable molecular biomarkers. To investigate the GINS1 expression level and its prognostic value in distinct human cancers using a series of multi-layered in silico approach may help to establish it as a potential shared diagnostic and prognostic biomarker of different cancer subtypes. The GINS1 mRNA, protein expression, and promoter methylation were analyzed using UALCAN and Human Protein Atlas (HPA), while mRNA expression was further validated via GENT2. The potential prognostic values of GINS1 were evaluated through KM plotter. Then, cBioPortal was utilized to examine the GINS1-related genetic mutations and copy number variations (CNVs), while pathway enrichment analysis was performed using DAVID. Moreover, a correlational analysis between GINS1 expression and CD8+ T immune cells and a the construction of gene-drug interaction network was performed using TIMER, CDT, and Cytoscape. The GINS1 was found down-regulated in a single subtypes of human cancer while commonly up-regulated in 23 different other subtypes. The up-regulation of GINS1 was significantly correlated with the poor overall survival (OS) of Liver Hepatocellular Carcinoma (LIHC), Lung Adenocarcinoma (LUAD), and Kidney renal clear cell carcinoma (KIRC). The GINS1 was also found up-regulated in LIHC, LUAD, and KIRC patients of different clinicopathological features. Pathways enrichment analysis revealed the involvement of GINS1 in two diverse pathways, while few interesting correlations were also documented between GINS1 expression and its promoter methylation level, CD8+ T immune cells level, and CNVs. Moreover, we also predicted few drugs that could be used in the treatment of LIHC, LUAD, and KIRC by regulating the GINS1 expression. The expression profiling of GINS1 in the current study has suggested it a novel shared diagnostic and prognostic biomarker of LIHC, LUAD, and KIRC.