Abstract We determined the prevalence of Salmonella enterica (SE) in retail ground beef sold across eight state capital cities from Central Mexico (n = 115) as well as the antimicrobial resistance (AMR) phenotype and genotype of the isolates obtained. SE was detected in 48/115 samples, with variable prevalence (10-80 %) across geographical regions (χ2 = 24.2, P = 0.0021). We collected 116 isolates and observed circulation of serovars implicated in human salmonellosis in Mexico (Agona, Anatum, Infantis, Newport, Derby, Give y Typhimurium). Resistance was more frequently observed for tetracycline (39.7 %), chloramphenicol (37.9 %), streptomycin (37.1 %), trimeto-prim-sulfamethoxazole (31.0 %), and ampicillin (28.4 %). Resistance against azithromycin was moderate (14.7 %), few isolates resisted cephalosporins (2.6-3.4 %), all were susceptible to carbapenems, and 38.8 % of the isolates were multidrug resistant (MDR). The sequenced genomes carried AMR alleles against aminoglycosides (aadA, aac, aph), beta-lactams (bla-CARB, bla-PSE, bla-TEM, bla-CTX-M, bla-CMY), phenicols (floR), folate pathway inhibitors (sul, dfrA), fluoroquinolones (qnrAB, oqxAB), tetracyclines (tetABM), and macrolides: mph(A) y lnu(F). In conclusion, the beef under study works as a reservoir of SE with worrisome MDR phenotypes. The pathogen has acquired AMR genes against antibiotics used in human and veterinary medicine. The emergence of resistance to azithromycin is particularly alarming and has not been reported to date. Further studies are needed to better characterize AMR in SE populations associated with cattle.
Resumen Se determinó la frecuencia de contaminación con Salmonella enterica (SE) en la carne molida de res que se comercializa en ocho capitales estatales del centro de México (n = 115), así como el fenotipo y genotipo de resistencia a antimicrobianos (RAM) de los aislamientos obtenidos. Se detectó SE en 48/115 muestras, con tasas variables de contaminación (10-80 %) por zona geográfica (χ2 = 24.2, P = 0.0021). Se obtuvieron 116 aislamientos y se observó circulación de serotipos implicados en salmonelosis humana en México (Agona, Anatum, Infantis, Newport, Derby, Give y Typhimurium). La resistencia fue más frecuente en tetraciclina (39.7 %), cloranfenicol (37.9 %), estreptomicina (37.1 %), trimetoprima-sulfametoxazol (31.0 %) y ampicilina (28.4 %), moderada en azitromicina (14.7 %), escasa en cefalos-porinas (2.6-3.4 %) y nula en carbapenémicos, mientras que 38.8 % de los aislamientos fue multi-drogo resistente (MDR). Los genomas secuenciados portaban alelos de resistencia contra aminoglucósidos (aadA, aac, aph), beta-lactámicos (bla-CARB, bla-PSE, bla-TEM, bla-CTX-M, bla-CMY), fenicoles (floR), inhibidores de la vía del folato (sul, dfrA), fluoroquinolonas (qnrAB, oqxAB), tetraciclinas (tetABM) y macrólidos: mph(A) y lnu(F). Se concluye que la carne bajo estudio es reservorio de SE con preocupantes fenotipos de MDR y que el patógeno ha adquirido genes de RAM contra antibióticos usados en medicina humana y veterinaria. El auge de resistencia contra azitromicina es particularmente alarmante y no se había reportado hasta el momento. Se requieren estudios más amplios para una mejor caracterización de la RAM en las poblaciones de SE asociadas con bovinos.