Protein supply and requirements by ruminants have been studied for more than a century. These studies led to the accumulation of lots of scientific information about digestion and metabolism of protein by ruminants as well as the characterization of the dietary protein in order to maximize animal performance. During the 1980s and 1990s, when computers became more accessible and powerful, scientists began to conceptualize and develop mathematical nutrition models, and to program them into computers to assist with ration balancing and formulation for domesticated ruminants, specifically dairy and beef cattle. The most commonly known nutrition models developed during this period were the National Research Council (NRC) in the United States, Agricultural Research Council (ARC) in the United Kingdom, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA) in France, and the Commonwealth Scientific and Industrial Research Organization (CSIRO) in Australia. Others were derivative works from these models with different degrees of modifications in the supply or requirement calculations, and the modeling nature (e.g., static or dynamic, mechanistic, or deterministic). Circa 1990s, most models adopted the metabolizable protein (MP) system over the crude protein (CP) and digestible CP systems to estimate supply of MP and the factorial system to calculate MP required by the animal. The MP system included two portions of protein (i.e., the rumen-undegraded dietary CP - RUP - and the contributions of microbial CP - MCP) as the main sources of MP for the animal. Some models would explicitly account for the impact of dry matter intake (DMI) on the MP required for maintenance (MPm; e.g., Cornell Net Carbohydrate and Protein System - CNCPS, the Dutch system - DVE/OEB), while others would simply account for scurf, urinary, metabolic fecal, and endogenous contributions independently of DMI. All models included milk yield and its components in estimating MP required for lactation (MPl) and calf birth weight and some form of an empirical, exponential equation to compute MP for pregnancy (MPp). The MP required for growth (MPg) varied tremendously among the original models and their derivative works mainly due to the differences in computing growth pattern and the composition of the gain. The calculation of MCP differs among models; some rely on the total digestible nutrient (TDN; e.g., NRC, CNCPS level 1) intake to estimate MCP, while others use fermentable organic matter (FOM; e.g., INRA, DVE/OEB), fermentable carbohydrate (e.g., CNCPS level 2, NorFor), or metabolizable energy (ME; e.g., ARC, CSIRO, Rostock). Most models acknowledged the importance of ruminal recycled N, but not all accounted for it. Our Monte Carlo simulation indicated the prediction of most models for required MPl overlapped, confirming uniformity among models when predicting requirements for lactating animals, but a large variation in required MPg for growing animals exists.

OBJECTIVE: To ascertain the microbiological consequences of WHO's recommendation for presumptive co-trimoxazole prophylaxis for infants with perinatal HIV exposure. METHODS: Using a longitudinal cohort design, we followed HIV-exposed and HIV-unexposed infants trimonthly for up to 18 months per infant. HIV-exposed infants received daily co-trimoxazole prophylaxis from 6 weeks to > 12 months of age. Using Streptococcus pneumoniae as our sentinel pathogen, we measured how co-trimoxazole altered nasopharyngeal colonization, pneumococcal resistance to antibiotics and serotype distribution as a function of co-trimoxazole exposure. FINDINGS: From 260 infants followed for 3096 patient-months, we detected pneumococci in 360/1394 (25.8%) samples. HIV-exposed infants were colonized more frequently than HIV-unexposed infants (risk ratio, RR: 1.4; 95% confidence interval, CI: 1.0-1.9, P = 0.04). Co-trimoxazole prophylaxis reduced colonization by ca 7% but increased the risk of colonization with co-trimoxazole-resistant pneumococci within 6 weeks of starting prophylaxis (RR: 3.2; 95% CI: 1.3-7.8, P = 0.04). Prophylaxis with co-trimoxazole led to a small but statistically significant increase of nasopharyngeal colonization with pneumococci not susceptible to clindamycin (RR: 1.6; 95% CI: 1.0-2.6, P = 0.04) but did not increase the risk of non-susceptibility to penicillin (RR: 1.1; 95% CI: 0.7-1.7), erythromycin (RR: 1.0; 95% CI: 0.6-1.7), tetracycline (RR: 0.9; 95% CI: 0.6-1.5) or chloramphenicol (RR: 0.8; 95% CI: 0.3-2.3). Co-trimoxazole prophylaxis did not cause the prevailing pneumococcal serotypes to differ from those that are targeted by the 7-valent conjugate pneumococcal vaccine (RR: 1.0; 95% CI: 0.7-1.6). CONCLUSION: Co-trimoxazole prophylaxis modestly suppresses pneumococcal colonization but accelerates infant acquisition of co-trimoxazole- and clindamycin-resistant pneumococci. Co-trimoxazole prophylaxis appears unlikely to compromise the future efficacy of conjugate vaccines.

OBJETIVO: Evaluar los efectos microbiológicos de la profilaxis de presunción con cotrimoxazol recomendada por la OMS para los lactantes con exposición perinatal al VIH. MÉTODOS: Mediante un estudio longitudinal de cohortes, se siguió la evolución de lactantes expuestos al VIH y no expuestos al VIH con periodicidad trimestral por espacio de hasta 18 meses por lactante. Los expuestos al virus recibieron cotrimoxazol profiláctico desde las 6 semanas hasta como mínimo los 12 meses de edad. Usando Streptococcus pneumoniae como agente patógeno centinela, medimos los efectos del cotrimoxazol en la colonización nasofaríngea, la resistencia a los antibióticos y la distribución de los serotipos en función de la exposición al cotrimoxazol. RESULTADOS: Entre los 260 lactantes sometidos a seguimiento durante 3096 meses-paciente, detectamos neumococos en 360/1394 (25,8%) muestras. Los lactantes expuestos al VIH presentaron colonización más a menudo que los no expuestos al virus (conciente de riesgos, RR: 1,4, intervalo de confianza (IC) del 95%: 1,0-1,9, p = 0,04). La profilaxis con cotrimoxazol redujo la colonización en un 7% aproximadamente pero aumentó el riesgo de colonización por neumococos resistentes al cotrimoxazol en las 6 semanas siguientes al comienzo de la profilaxis (RR: 3,2, IC95%: 1,3-7,8, p = 0,04). La profilaxis con contrimoxazol provocó un aumento ligero pero estadísticamente significativo de la colonización nasofaríngea por neumococos insensibles a la clindamicina (RR: 1,6, IC95%: 1,0-2,6, p = 0,04), pero no aumentó el riesgo de insensibilidad a la penicilina (RR: 1,1; IC95%: 0,7-1,7), eritromicina (RR: 1,0; IC95%: 0,6-1,7), tetraciclina (RR: 0,9; IC95%: 0,6-1,5) o cloranfenicol (RR: 0,8; IC95%: 0,3-2,3). La profilaxis con cotrimoxazol no alteró el perfil de serotipos neumocócicos en comparación con los establecidos como diana de la vacuna antineumocócica conjugada heptavalente (RR: 1,0, IC95%: 0,7-1,6). CONCLUSIÓN: La profilaxis con cotrimoxazol suprime moderadamente la colonización por neumococos y acelera la adquisición de neumococos resistentes al cotrimoxazol y la clindamicina en los lactantes. Es improbable que esa profilaxis reste eficacia a las vacunas conjugadas en el futuro.

OBJECTIF: Evaluer les conséquences microbiologiques de la recommandation de l'OMS concernant le traitement présomptif par le cotrimoxazole des nourrissons exposés au VIH pendant la période périnatale. MÉTHODES: Dans le cadre d'une étude longitudinale de cohorte, nous avons suivi trois fois par mois des nourrissons exposés et non exposés au VIH sur une durée allant jusqu'à 18 mois par enfant. Les nourrissons exposés au VIH ont reçu un traitement prophylactique quotidien par le cotrimoxazole de l'âge de 6 semaines à celui de 12 mois au moins. En utilisant Streptococcus pneumoniae comme agent pathogène sentinelle, nous avons mesuré l'effet obtenu sur la colonisation nasopharyngée, la résistance aux antibiotiques et la distribution par sérotypes des pneumocoques, en fonction de l'exposition au cotrimoxazole. RÉSULTATS: Parmi 260 nourrissons suivis sur 3096 patients-mois, nous avons détecté des pneumocoques sur 360/1394 échantillons (25,8 %). Les nourrissons exposés au VIH étaient colonisés plus fréquemment que ceux non exposés à ce virus (rapport des risques, RR = 1,4 ; intervalle de confiance à 95 %, IC : 1,0-1,9, p = 0,04). La prophylaxie par le cotrimoxazole réduit la colonisation d'environ 7 %, mais accroît le risque de colonisation par des pneumocoques résistants à ce médicament dans les 6 semaines après le début du traitement (RR = 3,2 ; IC à 95 % = 1,3-7,8, p = 0,04). Ce traitement entraîne une augmentation faible, mais statistiquement significative de la colonisation nasopharyngée par des pneumocoques non sensibles à la clindamicyne (RR = 1,6 ; IC à 95 % = 1,0-2,6, p = 0,04), mais n'accroît pas le risque de non sensibilité à la pénicilline (RR = 1,1 ; IC à 95 % = 0,7-1,7), à l'érythromycine (RR = 1,0 , IC à 95 % = 0,6-1,7), à la tétracycline (RR = 0,9 ; IC à 95 % = 0,6-1,5) ou au chloramphénicol (RR = 0,8 ; IC à 95 % = 0,3-2,3). Le cotrimoxazole n'entraîne pas de divergence de la distribution sérotypique dominante des pneumocoques par rapport à celle visée par le vaccin antipneumococcique conjugé heptavalent (RR = 1,0 ; IC à 95 % = 0,7-1,6). CONCLUSION: Le traitement prophylactique par le cotrimoxazole élimine modérément la colonisation pneumococcique et accélère l'acquisition par les nourrissons de pneumocoques résistants au cotrimoxazole et à la clindamycine. Il semble peu probable qu'il compromette l'efficacité future des vaccins antipneumococciques conjugués.