Abstract Aim: To document the recent experiences on the implementation of sampling and culturing Helicobacter pylori in Costa Rica, to compare it with other diagnostic methods: rapid urease test and histopathology and to describe the diagnoses associated with the obtained isolates. Methods: Descriptive research involving patients who visited the digestive endoscopy department of the Clínica Bíblica hospital in San José, Costa Rica between February and July of 2019 for gastroscopy. Gastric biopsies were obtained and histopathological analysis, rapid urease test, and bacteriological culture for Helicobacter pylori were performed. For culture techniques, the sample was transported in an in-house semi-solid medium. Biopsy fragments were macerated and plated on Skirrow agar and Helicobacterselective in-house agar, and incubated in microaerophilic atmosphere for 48 hours to 10 days. Culture positivity was determined by observation of the colonial morphology and microscopic observation; Gram staining and biochemical tests (urease, catalase, and oxidase) were used for bacterial identification. Results: 44 patients (mean aged 50.6 ± 10.0 years old, 54.5% male) were included in the study. Helicobacter pylori was recovered in biopsies from 27 patients (61.4% success rate). Bacterial growth was similar regardless the culture medium, but the physiological state of the bacteria was better in the Helicobacter-selective agar than in Skirrow. The weekly recovery rate increased to reach a 100% recovery plateau on week 11. Culture was compared with the rapid urease test in 27 patients, and the concordance between both methods using Cohen's kappa coefficient was 0.48. Whilst the culture detected Helicobacter pylori in 56% of the patients, and the rapid urease test in 37%, the combination of both allowed a 60% rate. The most frequent endoscopic diagnosis in patients with positive cultures were erythematous gastritis and chronic superficial gastritis, and the predominant histopathological diagnosis was chronic atrophic gastritis. Culture-based diagnosis was consistent with the histopathology detection of Helicobacter pylori in 80.4% of the cases. Conclusions: The implementation of H. pylori culture in Costa Rica is possible. This study had a 61.4% recovery rate. The combination of culture with rapid urease test and histopathology increases the probability of an accurate and timely diagnosis. We recommend that, based on previously described protocols such as ours, each laboratory adjusts the conditions to allow a good recovery rate and implement H. pylori diagnostic methods most suitable to their routine activities.

Resumen Objetivo: Determinar la viabilidad del cultivo de la bacteria Helicobacter pylori en Costa Rica por medio de la documentación de toma de muestras, la comparación del diagnóstico histopatológico y la descripción de los diagnósticos asociados a los aislamientos obtenidos con los resultados de la ureasa rápida. Métodos: Investigación descriptiva que involucró a pacientes de entre los 35 y 70 años, de ambos sexos, que asistieron al Servicio de Endoscopia Digestiva del Hospital Clínica Bíblica entre febrero y junio del 2019 para estudio gastroscópico. Se obtuvieron biopsias gástricas para diagnóstico histopatológico, prueba de ureasa rápida y cultivo de Helicobacter pylori. Para este último, se transportaron las biopsias en un medio de transporte semisólido, se maceró el tejido y se cultivó enagar Skirrow y agar selectivo para Helicobacter; una placa de cada medio se incubó a 37 °C en microaerofilia entre 48 horas y 10 días. La positividad del cultivo se realizó por observación de la morfología colonial y la bacteria se identificó por análisis microscópico al fresco, tinción de Gram y pruebas bioquímicas (catalasa, ureasa y oxidasa). Resultados: Se incluyó a 44 pacientes (edad: 50.6 ± 10.0, 54.5% masculinos). Se recuperó Helicobacter pylori en biopsias de 27 pacientes (61.4% de éxito). La recuperación de la bacteria fue similar en el medio Skirrow y en el selectivo para Helicobacter. El porcentaje de éxito de recuperación semanal aumentó durante el estudio hasta alcanzar un éxito del 100% en la semana 11. Se comparó el cultivo con la ureasa rápida en 27 pacientes y la concordancia entre ambos métodos fue de un coeficiente kappa de Cohen de 0.48. El cultivo detectó la bacteria en un 56% de los pacientes, la ureasa rápida en un 37% y la combinación de ambas técnicas permitió la detección en un 60%. El diagnóstico endoscópico más frecuente en los pacientes con cultivo positivo fue la gastritis eritematosa y gastritis crónica superficial y el diagnóstico histopatológico predominante fue gastritis crónica con atrofia gástrica. El diagnóstico por cultivo coincidió con la detección por azul de toluidina en un 80.4% de los casos. Conclusiones: Se puede implementar el cultivo de Helicobacter pylori en Costa Rica. Este estudio tuvo un porcentaje de recuperación de la bacteria de 61.4%. La combinación del método de cultivo con la prueba de ureasa rápida y la detección histológica contribuye a un diagnóstico certero y oportuno. Recomendamos que, con base en protocolos descritos en esta investigación, cada laboratorio estandarice las condiciones que le permitan un buen porcentaje de recuperación y una implementación adaptada a sus actividades de rutina.