Objective: To determine genetic variants among peruvian Yellow Fever (YF) isolates. Materials and methods: Carboxiterminal ends from the envelope protein gene of five YF isolates obtained from patients living in Ayacucho 1978 (PER1), Junin 1995 (PER2), Cerro de Pasco (PER3), Cusco (1998) y San Martín (1999) were amplified using PCR, and they were sequenced and analyzed using DNA software. Results: The identity index using nucleotide sequences among five yellow fever isolates showed values between 94,3% and 99.3%, while amino acid sequences revealed 97,6% to 99,7% similarity. Likewise, the phylogenetic analysis showed that the values for genetic distance among these isolates were between 0,40 y 6,50 using nucleotide sequences; and using aminoacid sequencing, the range was from 0,30 to 4,29. However, important regions, such as glycosilation sites and humoral-recognising sites were preserved among the five isolates excepting some reference isolates previously reported. Conclusions: Peruvian Yellow Fever viruses are grouped in a phylogenetic cluster different to other South American YF viruses, based on the E gene analysis.
Objetivo: Determinar las variantes genéticas de aislamientos del virus peruano de la Fiebre Amarilla (FA). Materiales y métodos: la región carboxiterminal del gen de la envoltura (E) de cinco aislamientos de FA obtenidas de pacientes provenientes de Ayacucho 1978 (PER1), Junín 1995 (PER2), Cerro de Pasco (PER3), Cusco (1998) y San Martín (1999) fue amplificada por PCR, secuenciada y analizada con programas software de ADN. Resultados: el índice de similaridad de la secuencia de nucleótidos entre los cinco aislamientos reveló valores oscilantes entre 94,3% y 99,3%, mientras que la secuencia de aminoácidos presentó valores entre 97,6% y 99,7% de similaridad. El análisis filogenético demostró una distancia genética entre 0,40 y 6,50 mediante la secuencia de nucleótidos y a través de la secuencia de aminoácidos se observó un rango de 0,30 y 4,29. Sin embargo, las secuencias correspondientes a los sitios de glicosilación y a los epítopes de reconocimiento humoral fueron conservadas entre los cinco aislamientos, con excepción de algunos aislamientos de referencia reportados por otros autores. Conclusiones: los virus de FA peruanos forman un grupo filogenético distinto a otros virus de FA sudamericanos, basados en el análisis genéticos del gen E.