RESUMO: No Brasil, a Mata Atlântica vem sofrendo com o desmatamento, que tem impactado sua flora, fauna e microbiota. No entanto, a diversidade fúngica presente nesses ambientes é pouco conhecida e estudada. Neste trabalho, um total de 90 amostras de 45 aves silvestres (45 penas e 45 fezes) foram coletadas na Ilha da Marambaia, Sudeste do Brasil. Fungos filamentosos isolados dessas amostras foram identificados por meio de características macroscópicas e microscópicas. Alguns isolados foram identificados por biologia molecular usando a técnica de PCR. Foram identificados Acremonium, Alternaria, Aspergillus, Cunninghamella, Curvularia, Eurotium, Fusarium, Geotrichum, Neosartorya, Pestalotia, Paecilomyces, Penicillium, Rhizopus, Mucor e Syncephalastrum. Esses resultados indicam a presença de espécies de fungos saprofíticos nas penas e fezes de aves silvestres do local de captura. Novos estudos devem ser realizados a fim de elucidar se o perfil da micobiota se modifica com a antropização e se interfere na saúde das aves e na recuperação ambiental. RESUMO Brasil desmatamento flora microbiota entanto estudada trabalho 9 4 (4 Marambaia microscópicas PCR Acremonium Alternaria Aspergillus Cunninghamella Curvularia Eurotium Fusarium Geotrichum Neosartorya Pestalotia Paecilomyces Penicillium Rhizopus Syncephalastrum captura ambiental (

ABSTRACT: In Brazil, the Atlantic Forest has been suffering from deforestation, which has had impacts on its flora, fauna, and microbiota. However, the fungal diversity present in these environments is little known and studied. In this study, a total of 90 samples of 45 wild birds (45 feathers and 45 feces) were collected in Ilha da Marambaia, southeastern Brazil. Filamentous fungi isolated from these samples were identified through macroscopic and microscopic characteristics. Some isolates were identified by molecular biology using the PCR technique. Acremonium, Alternaria, Aspergillus, Cunninghamella, Curvularia, Eurotium, Fusarium, Geotrichum, Neosartorya, Pestalotia, Paecilomyces, Penicillium, Rhizopus, Mucor and Syncephalastrum were identified. These results indicate the presence of saprophytic fungi species in the feathers and feces of wild birds of the capture site. Further studies should be conducted to elucidate if the mycobiota profile modifies with anthropization and if it interferes with bird health and environmental recovery. ABSTRACT Brazil deforestation flora fauna microbiota However studied study 9 4 (4 Marambaia characteristics technique Acremonium Alternaria Aspergillus Cunninghamella Curvularia Eurotium Fusarium Geotrichum Neosartorya Pestalotia Paecilomyces Penicillium Rhizopus site recovery (

RESUMO: O trinca-ferro Saltator similis (d’Orbigny & Lafresnaye, 1837) é um pássaro muito valorizado por criadores de aves e pelo tráfico ilegal de animais silvestres. Os cromistas coccídios são agentes etiológicos da coccidiose, a qual pode ser assintomática e enzoótica em populações de aves quando as condições ambientais são favoráveis, mas surtos epizoóticos com doença grave podem ocorrer como resultado de mudanças ambientais. Nesse contexto, este artigo relata um caso de coccidiose em um espécime juvenil de vida livre de S. similis capturado no Parque Nacional de Itatiaia, no sudeste do Brasil. Foram observados sinais clínicos típicos de coccidiose, associados a diarreia mucóide esverdeada contendo alta densidade de oocistos. Três Isospora spp. foram especificamente identificadas em 14 defecações coletadas durante um período de duas horas. Isospora saltatori (Berto, Balthazar, Flausino & Lopes, 2008) foi a espécie com maior densidade e positividade durante a maior parte do período de coleta. Por fim, este artigo discute a importância da avaliação contínua da saúde das aves como bioindicadores, e de seus biomarcadores ecológicos coccídios, como uma das estratégias para avaliação do estado de conservação do Parque Nacional de Itatiaia. RESUMO trincaferro trinca ferro dOrbigny d Orbigny Lafresnaye 1837 silvestres favoráveis contexto S Itatiaia Brasil oocistos spp 1 horas Berto, Berto (Berto Balthazar Lopes 2008 coleta fim bioindicadores 183 200 18 20 2

ABSTRACT: The green-winged saltator Saltator similis (d’Orbigny & Lafresnaye, 1837) is a passerine bird highly valued by bird breeders and a target of illegal wildlife trafficking. Coccidian chromists are etiological agents of coccidiosis, which may be asymptomatic and enzootic in bird populations when environmental conditions are favorable. However, epizootic outbreaks with severe disease can occur due to environmental changes. In this context, this study reports a case of coccidiosis in a free-living juvenile specimen of S. similis captured at the Itatiaia National Park in southeastern Brazil. Typical clinical signs of coccidiosis were observed, and it was associated with greenish mucoid diarrhea containing a high density of coccidian oocysts. Three Isospora spp. were specifically identified in 14 fecal samples (fecal droplets) collected over two hours. Isospora saltatori (Berto, Balthazar, Flausino & Lopes, 2008) had the highest density and positivity throughout most of the collection period. Finally, this paper discusses the importance of the continuous evaluation of the health of birds as bioindicators and their coccidian ecological biomarkers as one of the strategies for evaluating the conservation status of Itatiaia National Park. ABSTRACT greenwinged green winged dOrbigny d Orbigny Lafresnaye 1837 trafficking favorable However changes context freeliving free living S Brazil observed oocysts spp 1 droplets hours Berto, Berto (Berto Balthazar Lopes 2008 period Finally 183 200 18 20 2

ABSTRACT A new coccidian species parasitizing white-necked thrushes Turdus albicollis Vieillot, 1818 is described from the Parque Nacional do Itatiaia, in Southeastern Brazil. Isospora machadoae sp. nov. has oocysts that are sub-spherical, 22.2 × 21.2 µm, with bilayered wall, ~1.3 μm thick. Outer layer is rough with micropyle and micropyle cap. Oocyst residuum is absent, but one or two polar granules are present. Sporocysts are ellipsoidal, 13.3 × 9.7 µm. The Stieda body is flattened to half-moon-shaped and substieda body rounded. Sporocyst residuum is present, composed of scattered spherules of different sizes. Sporozoites are vermiform with a refractile body and a nucleus. These parasitized thrushes had no apparent clinical signs of coccidiosis or high densities of oocysts in feces. This condition may be associated with a specific low pathogenicity of I. machadoae sp. nov. and/or with the conserved habitat of these birds, which ensures the ecological niches and thus the immunocompetence to wildlife.

Resumo: Tritrichomonas foetus, um parasito bem conhecido por seu significado como um agente patogênico transmitido venereamente em bovinos, também foi identificado como causa de diarreia crónica do intestino grosso em gatos domésticos em muitos países. No Brasil, vários estudos sobre o diagnóstico de tricomonose bovina foram realizados, mas até agora, não há informação disponível em relação à trichomonose felina. Assim, este é o primeiro estudo a relatar a ocorrência de T. foetus e Pentatrichomonas hominis em gatos por meio de análise morfológica e molecular. Fezes de 77 gatos foram examinadas, a partir da qual quatro (5,2%) foram positivas para a presença de parabasalídeos. A análise morfológica de esfregaços corados revelou trophozoitos piriformes com três flagelos anteriores, núcleo alongado e axóstilo cuja projeção termina abruptamente em formato de filete, características estas de identificação morfológica T. foetus. Além disso, microscopia eletrônica de varredura e transmissão, revelaram caracteres morfológicos semelhantes aos descritos na literatura para esta espécie. A análise molecular de culturas utilizando iniciadores específicos para trofozoítos de T. foetus (TFR3 e TFR4), mostrou que as quatro amostras foram positivas para este parasito e osequenciamento dos fragmentos amplificados demonstraram 99,7-100% de similaridade com seqüências depositadas no GeneBank de T. foetus. Nenhum trofozoíto com morfologia consistente com a descrição de P. hominis foi visualizado nas amostras. No entanto, a análise molecular, utilizando iniciadores específicos para esta espécie (TH3 e TH5) detectou que três das quatro amostras (75%) também foram positivas para P. hominis e o sequenciamento de nucleotideos revelou 100% de similaridade dos amplicons quando comparada com o mesmo fragmento de DNA de P. hominis depositado no GenBank. Como tal, o presente estudo relata a coinfecção de gatos com T. foetus e P. hominis e destacou a exigência de uma combinação de métodos para o diagnóstico de coinfecções. Estes resultados demonstram a importância do diagnóstico correto para a aplicação da terapia apropriada por parte dos veterinários.

Abstract: Tritrichomonas foetus, a parasite well known for its significance as a venereally transmitted pathogen in cattle, has been identified as a cause of chronic large bowel diarrhea in domestic cats in many countries of the world. In Brazil, several studies on the diagnosis of bovine trichomoniasis have been performed, but until now, no study was made regarding feline trichomoniasis. Thus, this is the first study to report the occurrence of T. foetus and Pentatrichomonas hominis in cats using morphological and molecular analysis. Feces from 77 cats were examined, four of which (5.2%) were positive for the presence of parabasalids. Morphological analysis of stained smears revealed piriform trophozoites showing the three anterior flagella, elongated nucleus and axostyle ending abruptly in fillet, characteristic of T. foetus. In scanning and transmission electron microscopy, identification characters similar to those previously reported for T. foetus were observed. The cultures containing trophozoites were submitted for molecular analysis, which resulted positive for T. foetus DNA using specific primers (TFR3 and TFR4), and all samples were positive and subjected to sequencing in which they showed 99.7-100% similarity with another isolate sequencing of T. foetus (JX960422). Although no trophozoite with consistent morphology of P. hominis has been visualized in the samples, differential diagnosis was performed using specific primers for P. hominis (TH3 and TH5) amplicon. In three of the four samples (3.89%) sequencing revealed 100% similarity when compared with another sequence of P. hominis deposited in Genbank (KC623939). Therefore, the present study revealed through the diagnostic techniques employed the simultaneous infection by T. foetus and P. hominis in the feces of cats. However, it was necessary to use more than one technique for the diagnosis of the co-infection. These results demonstrate the importance of a correct diagnosis to allow an appropriate treatment by the veterinarian.

A codorna japonesa Coturnix japonica originária do norte da África, Europa e Ásia, é utilizada mundialmente como um animal experimental e modelo para avicultura. O presente trabalho caracteriza Eimeria bateri, Eimeria tsunodai e Eimeria uzura recuperadas de C. japonica. Baseado no fato de que as codornas têm uma distribuição global, como são os seus coccídios, os resultados deste estudo devem propiciar o diagnóstico destas Eimeria spp. em outras regiões e continentes. Eimeria bateri demonstrou a maior intensidade de infecção e eliminaram oocistos a partir do quarto dia após infecção, em contraste E. tsunodai e E. uzura eliminaram oocistos a partir do quinto dia após infecção. As três espécies foram morfometricamente semelhantes e polimórficas. No entanto, a aplicação da regressão linear, histogramas e ANOVA proveram meios para a identificação destas espécies. Finalmente, o algoritmo foi totalmente eficiente uma vez que valores resultantes não foram sobrepostos.

The Japanese quail Coturnix japonica originated from North Africa, Europe and Asia, is used worldwide as an experimental animal and model for aviculture. The current paper characterizes Eimeria bateri, Eimeria tsunodai and Eimeria uzura recovered from C. japonica. Based on the fact that quails have a global distribution, as are their coccidia, the findings of this study should provide the means for diagnosis of those Eimeria spp. in other regions and continents. Eimeria bateri showed the greatest intensity of infection and shed oocysts from the fourth day after infection; in contrast, E. tsunodai and E. uzura shed oocysts from the fifth day after infection. The three species shared a high degree of similarity and were all polymorphic. Yet, the application of line regressions, histograms and ANOVA provided means for the identification of these species. Finally, the algorithm was very efficient since verified that resultant values were not superimposed.

Nos últimos anos, alguns coccídios de aves foram registrados na Ilha da Marambaia, que é um ambiente protegido com uma grande biodiversidade de aves, principalmente traupídeos. No presente estudo Isospora tiesangui, I. sepetibensis, I. ramphoceli, I. navarroi, I. cadimi e I. marambaiensis foram identificadas de acordo com suas respectivos hospedeiros da Ilha da Marambaia, RJ. Essas espécies foram caracterizadas com histogramas, regressão linear e análise de variância (ANOVA). A principal característica de identificação foi a morfologia do esporocisto, principalmente os corpos de stieda e substieda, uma vez que a morfometria não forneceu diferenciação suficiente. Além disso, Dacnis cayana e Thraupis palmarum foram registrados como novos hospedeiros para I. sepetibensis e I. navarroi respectivamente.

In recent years some coccidian parasites of birds were recorded in Marambaia Island, which is a protected environment with a great biodiversity of birds, mainly tanagers. In this current study Isospora tiesangui, I. sepetibensis, I. ramphoceli, I. navarroi, I. cadimi and I. marambaiensis were identified according to their respective thraupid hosts of the Marambaia Island. These species were characterized with histograms, linear regression and analysis of variance (ANOVA). The main feature of identification was the morphology of the sporocyst, mainly Stieda and substieda bodies, since the morphometry did not provide sufficient differentiation. Besides, Dacnis cayana and Thraupis palmarum were reported as new hosts to I. sepetibensis and I. navarroi respectively.

O objetivo deste estudo foi caracterizar os oocistos de Eimeria bateri e avaliar o efeito da aflatoxina na morfometria destes oocistos em codornas japonesas naturalmente infectadas. Cinqüenta codornas naturalmente parasitadas por E. bateri foram separadas aleatoriamente em dois grupos com 25 aves cada. Um dos grupos foi intoxicado experimentalmente com aflatoxina, por via oral, na dose de 0,04 mg/kg de peso vivo. Os dois grupos experimentais eliminaram oocistos de E. bateri nas fezes. Esses oocistos foram de subesféricos a elipsóides, 25,1 x 18,9 Lm, com parede dupla. A micrópila e o resíduo estavam ausentes, mas um ou vários grânulos polares estavam presentes. Esporocistos ovóides alongados, 12,5 x 7,4 L m. Os corpos de Stieda e substieda estavam presentes. O resíduo do esporocisto estava disperso e os esporozoítas apresentaram um núcleo e um corpo refráctil. Os histogramas confirmaram a presença de uma única espécie, E. bateri. A regressão linear comprovou que os oocistos de E. bateri são polimórficos, devido, basicamente, à forma desses oocistos. A morfometria comparativa entre os dois grupos experimentais, demonstrou que a aflatoxina influiu significativamente nos oocistos de E. bateri.

The purpose of this study was to characterize Eimeria bateri oocysts and to evaluate the aflatoxin effect in the morphometry of sporulated oocysts in Japanese quails infected naturally. Of a total of 50 quails naturally infected by E. bateri were randomly divided into two groups with 25 birds each. In one of them, quails were orally administered with aflatoxin in dose of 0.04 mg/kg body weight previously. Both experimental groups shed E. bateri oocysts. These oocysts were subspherical to ellipsoidal, 25.1 x 18.9 Lim, with bi-layered wall. Micropyle and residuum were absent, but one or more polar granules were present. Sporocysts elongate ovoid, 12.5 x 7.4 μm. Stieda and substieda bodies were present. Sporocyst residuum was dispersed and sporozoites presented a nucleus and a refractile body. Histograms confirmed the presence of a single species, E. bateri. Linear regression proved that E. bateri oocysts are polymorphic, due, basically, to shape of these oocysts. The comparative morphometry between two experimental groups demonstrated that the aflatoxin influenced significantly in the E. bateri oocysts.

Uma descrição do coccídio Isospora hemidactyli da lagartixa doméstica Hemidactylus mabouia, muito comum em residências da região metropolotana do Rio de Janeiro, foi feita neste estudo. Os histogramas e a regressão linear para esta espécie confirmaram a homogeneidade de seus oocistos apesar da grande amplitude de variação. Além disto, oocistos polisporocísticos também foram recuperados das fezes de H. mabouia e foram semelhantes aos descritos anteriormente no gênero Adelina. Esta espécie devia estar parasitando um invertebrado ingerido pela lagartixa doméstica, e por essa razão, é um pseudoparasita. Oocistos de I. hemidactyli foram sub-esféricos a elipsóides, 24,4 × 22,3μm, com parede simples e um grânulo polar. Os esporocistos foram subesféricos a elipsóides, 11,8 × 9,8μm com corpos de Stieda e substieda, resíduo e esporozoítas com corpo refráctil. Oocistos do pseudoparasita Adelina sp. foram elipsóides, 36,3 × 30,9μm, com parede dupla e sem micrópila, resíduo e grânulo polar. Oito a 15 esporocistos estavam presentes e foram subesféricos a elipsóides, 12,4 × 11,2μm. Os corpos de Stieda e substieda estavam ausentes. Os esporozoítas apresentam corpos refrácteis em ambas as extremidades.

A description of the coccidium Isospora hemidactyli from the house gecko Hemidactylus mabouia, a very common at dwellings in Rio de Janeiro Metropolitan Region, was made in this study. Histograms and linear regression were made for this species and determined the homogeneity of these oocysts despite of large range. Besides it, polysporocystid oocysts also were recovered from feces of the H. mabouia house gecko and they were similar to those described previously as the genus Adelina. This species should be parasitizing an invertebrate ingested by house gecko, and for that reason, is a pseudoparasite. Oocysts of I. hemidactyli were subspherical to ellipsoidal, 24.4 × 22.3μm, with single-layered wall and one polar granule. Sporocysts were subspherical to ellipsoidal, 11.8 × 9.8μm with Stieda and substieda bodies, residuum and sporozoites with refractile body. Oocysts of the pseudoparasite Adelina sp. were ellipsoidal, 36.3 × 30.9μm, with bi-layered wall and without micropyle, residuum and polar granule. Eight to 15 sporocysts were presents and were subspherical to broadly ellipsoidal, 12.4 × 11.2μm. Stieda and substieda bodies were absent. Sporozoites present refractile bodies at both ends.

Duas espécies de Eimeria foram relatadas em capivaras Hydrochaeris hydrochaeris cativas no sul da Bahia, nordeste do Brasil (14º 47' 57.89"S and 39º 10' 10.58" W). Os oocistos de Eimeria ichiloensis são sub-esferoidais a elipsoidais, 26,2 x 21,7mm. Apresentam parede dupla, sendo a externa amarela e esculpida e a interna, escura e lisa. Resíduo está ausente, mas usualmente 2-3 grânulos polares estão presentes. Os esporocistos são ovóides, 12,0 x 7,6mm. Corpo de Stieda e resíduo do esporocisto estão presentes. Oocistos de Eimeria trinidadensis são sub-esferoidais a elipsoidais, 22,2 x 19,6mm. Apresentam parede dupla, sendo a externa amarela e lisa e a interna, escura e lisa. Resíduo está ausente, mas um grânulo polar está presente. Os esporocistos são ovóides, 11,0 x 6,9mm. Corpo de Stieda e resíduo do esporocisto estão presentes. Baseado nestas descrições e em descrições prévias foi possível concluir que estas espécies estão amplamente dispersas em capivaras na América do Sul.

Two eimerid coccidia are reported in a capybara (Hydrochoerus hydrochaeris) population kept in captivity in the south of Bahia, northeastern Brazil (14º 47' 57.89"S and 39º 10' 10.58" W). Oocysts of Eimeria ichiloensis are subspheroidal to ellipsoidal, 26.2 x 21.7mm with bi-layered wall, the outer yellow and sculptured and the inner, dark and smooth. Residuum is absent, but usually 2-3 polar granules are present. Sporocysts are ovoid, 12.0 x 7.6mm. Stieda body and sporocyst residuum are present. Oocysts of Eimeria trinidadensis are subspheroidal to ellipsoidal, 22.2 x 19.6mm with bi-layered wall, the outer yellow and smooth, and the inner dark and smooth. Residuum is absent, but one polar granule is present. Sporocysts are ovoid, 11.0 x 6.9mm. Stieda body and sporocyst residuum are present. Based on these descriptions and previous ones it can be concluded that these coccidea species are widely dispersed in capybaras in South America.

Eimeria divinolimi sp. n. do caneleiro (Casiornis rufus) foi descrita no Brasil. Os oocistos são subsféricos medindo 17,84 ± 1,52 por 15,90 ± 0,99 µm (15,61-20,00 x 14,15-17,80). O índice morfométrico de 1,12 ± 0,05 (1,01-1,20). Parede do oocisto lisa e dupla, sendo a externa amarelada e a interna escura, medindo 2,13 ± 0,16 µm (2,00-2,38). A micrópila e o resíduo estão ausentes, mas um grânulo polar subesférico está presente. Os esporocistos são ovóides medindo de 14,98 ± 0,85 por 7,50 ± 0,44 µm (13,81-16,19 x 6,76-8,09). A parede do esporocisto é única, lisa e fina. O corpo de Stieda é proeminente, sem corpo de substieda e com resíduo granular. Os esporozoítas com corpos refráteis em uma das extremidades.

Eimeria divinolimai sp. n. from the rufous casiornis, Casiornis rufus (Passeriformes: Tyrannidae) was described in Brazil. Oocysts are subspherical 17.84 ± 1.52 by 15.90 ± 0.99µm (15.61-20.00 x 14.15-17.80). Shape-index (length/ width) of 1.12 ± 0.05 (1.01-1.20). Wall smooth and bilayered, being yellowish outer and darker inner, 2.13 ± 0.16 µm (2.00-2.38) thick. Micropyle and residuum are absents, but one subspherical polar granule is present. Sporocysts are ovoid ranging from 14.98 ± 0.85 by 7.50 ± 0.44 µm (13.81-1619 x 6.76-8.09), with smooth, thin and single-layered wall. Stieda body prominent, without substiedal body and with residuum granulated. Sporozoites with refractile body at one end.

Isospora vanriperorum de trinca-ferro verdadeiro (Saltator similis) é descrita no sudeste do Brasil. Os oocistos são esféricos a subesféricos medindo 19,4-26 por 18,3-26μm (23,1 por 22,4μm), índice morfométrico de 1,04 com parede única, fina, lisa e amarelada. A micrópila e o resíduo estão ausentes, mas um grânulo polar elíptico está presente. Os esporocistos são ovóides medindo 14,5-20,2 por 8,1-12,5μm (16,3 por 10,8μm), índice morfométrico de 1,53 com corpo de Stieda proeminente, corpo de substieda mal discernível e resíduo central e granular.

Isospora vanriperorum from the green-winged saltator (Saltator similis) is described in Southeastern Brazil. Oocysts are spherical to subspherical, 19.4-26 by 18.3-26μm (23.1 by 22.4μm), shape index 1.04 with a single layered wall, fine, smooth and yellowish. Micropyle and residuum are absents, but one elliptical polar granule is present. Sporocysts are ovoid, 14.5-20.2 by 8.1-12.5μm (16.3 by 10.8μm), shape index 1.53 with prominent Stieda body, barely discernible substieda body and residuum centered and granulated.

Tyzzeria parvula é descrita no sudeste do Brasil em ganso doméstico, Anser anser. Os oocistos com parede constituída de duas membranas, a externa lisa e translúcida, e a interna verde pálido, variando de esféricos a subesféricos e sem micrópila. Os diâmetros, maior e menor mediram de 12,4 a 18,0 por 10,7 a 15,9µm (15,4 x 13,4µm) respectivamente com índice morfométrico de 1,15. Possuíam oito esporozoítas livres dentro do oocisto embebidos pelo corpo residual do oocisto. Uma das extremidades dos esporozoítas era arredondadas, enquanto a outra era estreita e levemente curvada.

Tyzzeria parvula from the greylag goose (Anser anser) is described in Southeastern Brazil. Oocysts are spherical to subspherical ranging from 12.4-180 to 10.7-15.9µm (15.4 X 13.4 µm), shape index 1.15, with a double layered wall 0.4 to 0.7 µm thick (n=20), outer smooth and colorless, inner pale greenish. Micropyle is absent, but oocyst residuum is present containing numerous granules and spherules. Surrounded by residuum there are eight sporozoites having one end round and other fine and slightly curved.