RESUMO A cadeia produtiva do Caiman yacare tem-se destacado no Mato Grosso com a exportação de 143.386 peles em 2015, cujo sistema de manejo (ranching) implica a incubação artificial dos ovos. Nesse processo, a contaminação bacteriana de ovos influencia a taxa de eclosão. O conhecimento da microbiota de ovos incubados naturalmente orienta o manejo sanitário adequado no incubatório. No presente estudo, são apresentadas informações sobre essa microbiota e sua correlação com a de outros crocodilianos, apontando-se as espécies com potencial patogênico. Amostras de 20 ninhos de C. yacare foram coletadas e semeadas em ágar sangue e ágar Mac Conckey. A colônia condizente com Salmonella sp. foi confirmada pela técnica de reação em cadeia de polimerase. Das 22 espécies bacterianas isoladas, 59% pertencem à família Enterobacteriaceae e 41% a outros táxons bacterianos. A semelhança dos achados com as bactérias isoladas na microbiota oral e/ou intestinal/cloacal de crocodilianos foi de 77,27%. As bactérias mais e menos frequentes foram, respectivamente, Bacillus cereus, Flavobacterium multivorum, Citrobacter freundii, Escherichia hermannii, Hafnia alvei, Morganella, morganni, Salmonella sp., Serratia marcescens e Shigella sonnei. Das bactérias isoladas, 86,36% têm potencial patogênico para crocodilianos. A origem materna e a ambiental da microbiota de ovos incubados naturalmente são, respectivamente, de 77,27% e 27,27%.
ABSTRACT The Pantanal caiman productive chain has grown in Mato Grosso with the exportation of 143.383 leather pieces in 2015, whose management system (ranching) implies the artificial incubation of eggs. In this process, the bacterial contamination of the eggs influences the hatching rate. Knowledge of the naturally incubated microbiota of eggs guides the appropriate sanitary management in the incubator room. Here we present information about this microbiota and correlate it with that of other crocodilians, indicating the species with pathogenic potential. Samples were collected in 20 nests at Pantanal, and sown in blood and Mac Conckey agar. Salmonella sp. was confirmed through polymerase chain reaction technique. From the twenty-two different species of bacteria isolated, 59% are from the Enterobacteriaceae Family and 41% from other bacterial taxonomies. The similarity of findings to isolated bacteria in the crocodilians oral and/or intestinal/cloacal microbiota was of 77,27%. The most and least frequent bacteria were, respectively, Bacillus cereus, Flavobacterium multivorum and Citrobacter freundii and Escherichia hermannii, Hafnia alvei, Morganella, morganni, Salmonella sp., Serratia marcescens and Shigella sonnei. Among the isolated bacteria, 86,36% are pathogenic for crocodilians. The maternal and environmental origin of the microbiota of eggs naturally incubated is, respectively, of 77,27% and 27,27%.