The aim of this study was to compare iterative and direct solvers for estimation of marker effects in genomic selection. One iterative and two direct methods were used: Gauss-Seidel with Residual Update, Cholesky Decomposition and Gentleman-Givens rotations. For resembling different scenarios with respect to number of markers and of genotyped animals, a simulated data set divided into 25 subsets was used. Number of markers ranged from 1,200 to 5,925 and number of animals ranged from 1,200 to 5,865. Methods were also applied to real data comprising 3081 individuals genotyped for 45181 SNPs. Results from simulated data showed that the iterative solver was substantially faster than direct methods for larger numbers of markers. Use of a direct solver may allow for computing (co)variances of SNP effects. When applied to real data, performance of the iterative method varied substantially, depending on the level of ill-conditioning of the coefficient matrix. From results with real data, Gentleman-Givens rotations would be the method of choice in this particular application as it provided an exact solution within a fairly reasonable time frame (less than two hours). It would indeed be the preferred method whenever computer resources allow its use.

Os efeitos no desenvolvimento de bezerros submetidos a: a) três tratamentos, consitindo de cargas animais pós-parto (CA) de 240 kg de peso vivo (PV)/ha (tratamento 1, T1), de 320 kg de PV/ha (T2), ambas em campo nativo, e de 400 kg de PV/ha em pastagem melhorada de azevém (Lolium multiflorum L.) por 80 dias pós-parto e, posteriormente, em CA igual à do T2 em campo nativo (T3); b) duas idades de desmame, consistindo de desmame aos 100 (DP) ou 180 (DC) dias de idade, foram avaliados utilizando 92 bezerros filhos de vacas primíparas Hereford e Braford. O sexo dos bezerros influenciou significativamente o peso ao nascer, não sendo observado efeito da raça da vaca. Os tratamentos e a raça da vaca não influenciaram o ganho médio diário (GMD) dos bezerros do nascimento ao desmame precoce. Bezerros filhos de vacas Braford tiveram maiores pesos no DP (PDP) que os filhos de vacas Hereford, enquanto os tratamentos não influenciaram o PDP. Os bezerros filhos de vacas Braford no T2 tiveram GMD até os 180 dias (GMD180) e PV aos 180 dias (PAJ180) superiores aos bezerros filhos de vacas Braford no T1 e Hereford no T2. Os bezerros do DP tiveram GMD180 e PAJ180 significativamente inferiores aos bezerros do DC. Entretanto, não se verificaram efeitos de tratamentos e idade de desmame sobre o GMD até os 365 dias e o peso ajustado aos 365 dias de idade. Portanto, os três manejos pós-parto das vacas e as duas idades de desmame dos bezerros avaliados não influenciaram o desenvolvimento dos bezerros a um ano de idade.

The effects on the performance of calves submitted to: a) three treatments, consisted of post-partum stocking rates (CA) of 240 kg of live weight (LW)/ha (treatment 1, T1), of 320 kg of LW/ha (T2), both on natural pastures, and of 400 kg of LW/ha on improved pasture of Italian ryegrass (Lolium multiflorum L.) during the first 80 days post-partum, and after on natural pasture at the same stocking rate as T2 afterwards (T3); b) two weaning ages, consisted of weaning at 100 (EW) and at 180 (CW) days of age, were evaluated using 92 beef calves from Hereford and Braford primiparous cows. The sex of the calves affected significantly the birth weight, and no effect was observed for the breed of cow. The treatments and breed of cow did not affect the average daily gain (ADG) of the calves from birth to early weaning (GEW). Calves born from Braford cows had higher LW at EW (WEW) than calves born from Hereford cows, while the WEW was not affected by the treatments. Calves born from Braford cows on T2 had ADG up to 180 days (ADG180) and LW at 180 days (LW180) greater than calves born from Braford cows on T1 and Hereford cows on T2. Calves from CW had greater LW180 and ADG180 than calves from EW. However, treatments and weaning ages did not affect the LW at 365 days and the ADG up to 365 days of age. The three cows post-partum management schemes and the two calves weaning ages evaluated did not affect the calves performance up to one year of age.

O objetivo deste trabalho foi avaliar o efeito de duas cargas animais (CA280= 280 e CA360= 360 kg PV/ha) em campo nativo e de duas composições raciais (½ Nelore ½ Hereford e ¼ Nelore ¾ Hereford) na produção de leite de vacas primíparas e no desenvolvimento de seus bezerros. A carga animal não afetou significativamente a produção de leite das vacas (CA280 = 6,16 e CA360 = 5,88 kg leite/vaca/dia). A composição racial das vacas influenciou significativamente a produção de leite, tendo as vacas ½ Nelore ½ Hereford maior produção diária que as ¼ Nelore ¾ Hereford (6,21 vs 5,84 kg leite/vaca/dia, respectivamente). A carga animal não influenciou significativamente o peso e o ganho médio diário (GMD) dos bezerros até a desmama. Bezerros filhos de vacas ½ Nelore ½ Hereford tiveram GMD do nascimento à desmama e pesos à desmama significativamente maiores que filhos de vacas ¼ Nelore ¾ Hereford (0,799 vs 0,727 kg/dia e 211,51 vs 193.12 kg, respectivamente). O sexo dos bezerros não influenciou significativamente a produção de leite das vacas e o GMD e o peso à desmama dos bezerros. Portanto, o desempenho dos bezerros não diferiu significativamente entre as cargas animais e foi melhor para bezerros filhos de vacas ½ Nelore ½ Hereford do que de vacas ¼ Nelore ¾ Hereford.

The aim of the experiment was to evaluate the effect of two stocking rates (CA280= 280 kg and CA360= 360 kg of live weight/ha) on natural pasture and of two breed compositions (½ Nelore ½ Hereford and ¼ Nelore ¾ Hereford) on milk production of primiparous beef cows and on growth of their calves. The stocking rate did not affect milk production (CA280 = 6.16 and CA360 = 5.88 kg/cow/day). Breed composition of cows significantly affected milk production, with ½ Nelore ½ Hereford cows showing higher daily yield production than ¼ Nelore ¾ Hereford cows (6.21 vs. 5.84 kg, respectively). The stocking rate did not affect daily live weight gain (ADG) and live weight of the calves at weaning. Calves born from ½ Nelore ½ Hereford cows had significantly higher ADG and live weight at weaning than calves born from ¼ Nelore ¾ Hereford (0.799 vs. 0.727 kg/day and 211.51 vs. 193.12 kg, respectively). Calves sex did not affect cow milk production and ADG and live weight of calves at weaning. Therefore, the calves performance did not significantly differ between stocking rates and was better for calves born from ½ Nelore ½ Hereford cows than from ¼ Nelore ¾ Hereford cows.

O experimento foi conduzido na Estação Experimental da Universidade Federal do Rio Grande do Sul, município de Eldorado do Sul, Brasil, a fim de avaliar o desempenho de 40 bezerros filhos de vacas cruzas Bos indicus x Bos taurus até os dois anos de idade, desmamados precocemente (DP), com média de idade de 91 dias e mínimo de 70 kg de peso vivo, ou desmamados à idade convencional (DC), média de 170 dias de idade e peso médio de 131,2 kg, suplementados (Su) ou não (NSu) com ração energético-protéica com 14% de proteína bruta e 75% de nutrientes digestíveis totais, durante 91 dias no primeiro inverno. O delineamento experimental utilizado foi o delineamento completamente casualizado. Os novilhos do DP foram mais leves até um ano de idade (DP=208,7 kg x DC=233,5 kg). Aos 18-20 meses de idade, os novilhos não eram mais estatisticamente diferentes em seus pesos vivos (DP=279,9 kg x DC=292,5 kg). Ao abate, os pesos vivos médios foram de 432,3 kg (DC) e 414,0 kg (DP), não diferindo também no rendimento, acabamento, conformação e classificação das carcaças. O desmame precoce não impediu o desenvolvimento e o abate dos novilhos aos dois anos de idade. A suplementação no primeiro inverno não alterou o desempenho dos novilhos ao abate.

The experiment run at the Agronomic Experimental Station of the Federal University of Rio Grande do Sul, located in the district of Eldorado do Sul, Brazil, to evaluate the performance of 40 crossbred Bos indicus x Bos taurus calves until two years old, early weaned (EW) with average age of 91 days and minimum liveweight of 70 kg, or weaned at conventional age (CW), averaging 170 days old and liveweight of 131.2 kg, supplemented (Su) or not (NSu) with energy-protein diet with 14% crude protein and 75% total digestible nutrients during 91 days in the first winter. A completely randomized experimental design was used. EW steers were lighter at one year of age (EW=208.7 kg x CW=233.5 kg). Steers with 18-20 months of age were not different in average liveweight (EW=279.9 kg x CW=292.5 kg). Steers were slaughtered at average liveweights of CW= 432.3 kg and EW=414.0 kg. Early weaning did not affect performance and carcass characteristics of steers with two years old. Supplementation in the first winter also did not affect performance of steers at slaughter.

A investigação foi realizada para avaliar os efeitos de duas cargas animais (CA280= 280 kg PV/ha e CA360= 360 kg PV/ha) e de duas idades de desmama dos bezerros (DC = Desmama convencional aos sete meses de idade e DP= Desmama precoce aos três/quatro meses) no comportamento reprodutivo de vacas de corte primíparas de duas composições raciais (½ Nelore ½ Hereford e ¼ Nelore ¾ Hereford). Foram avaliados os ganhos de peso médios diários (GMD) do pós-parto à data da desmama convencional, durante o acasalamento, da desmama precoce à desmama convencional (GPC), a condição corporal (CC) ao início do acasalamento, ao final do acasalamento e na data da desmama convencional, a taxa de prenhez (TP) e o intervalo de partos (IEP). As vacas conduzidas na CA280 tiveram significativamente maiores GMD do que vacas na CA360 nos três períodos estudados. Vacas submetidas ao tratamento de desmama precoce tiveram GPC maiores que vacas submetidas à desmama convencional (0,539 vs. 0,257 kg/dia, respectivamente). Vacas da CA280 tiveram significativamente maiores condições corporais do início do acasalamento à data da desmama convencional do que vacas da CA360, sendo que vacas submetidas à desmama precoce apresentaram condição corporal na data da desmama convencional superior àquela das vacas da desmama convencional sob ambas cargas animais (4,33 vs. 3,68 para CA280 e 3,14 vs. 2,92 para CA360). A composição racial das vacas não influenciou significativamente o GMD e a condição corporal das vacas no período experimental. A TP da CA280 (67,56%) foi significativamente superior à da CA360 (22,56%), bem como o seu IEP foi significativamente inferior ao da CA360 (395,4 vs. 409,9 dias). Portanto, a carga animal menor permitiu que as vacas apresentassem maiores recuperações de peso e condição corporal no pós-parto, determinando melhores taxas de reconcepção e menores intervalos de partos.

The investigation was carried out to evaluate the effects of two stocking rates (CA280= 280 kg LW/ha and CA=360= 360 kg LW/ha) and two weaning ages of calves (DC = Conventional weaning at seven months of age and DP= Early weaning at three/four months of age) on reproductive performance of primiparous beef cows of two breed compositions (½ Nelore ½ Hereford and ¼ Nelore ¾ Hereford). Average daily weight gain (GMD) from calving to DC, during the mating period, and in the period from DP to DC (GPC), the body condition score (CC) at beginning and at the end of mating period and at DC, the pregnancy rate (TP), and the calving interval (IEP) of the cows were evaluated. Cows managed under CA280 had significantly higher GMD than cows under CA360 in all three periods considered. Cows submitted to DP had higher GPC (P<0.01) than cows submitted to DC(0.539 vs. 0.257 kg/day, respectively). Cows under CA280 had signicantly higher CC from the beginning of the mating period to the date of DC than cows under CA360, while cows submitted to DP showed higher CC at the date of DC than cows submitted to DC under both stocking rates (4.33 vs. 3.68 for CA280 and 3.14 vs. 2.92 for CA360). The breed composition of the cows did not significantly influence on GMD and CC of the cows over the experimental period. The TP of cows under CA280 (67.56%) was significantly better than cows under CA360 (22.56%), as well as their IEP were significantly lower than cows under CA360 (395.4 vs. 409.9 days). Therefore, the lowest stocking rate allowed cows to better recover their weight and body condition after calving, causing improvement of conception rate and calving interval.

Os objetivos deste trabalho foram a obtenção de fatores de correção para efeitos de idade do bezerro, idade da vaca e data juliana do nascimento sobre o ganho de peso do nascimento à desmama (GND) e sobre os escores visuais de conformação (C), precocidade (P) e musculatura (M) e a estimação dos efeitos das heteroses materna e individual nessas características. Foram utilizados dados dos Programas de Melhoramento Genético Natura e Conexão Delta G, totalizando 187.610 bezerros puros e cruzas, nascidos no período de 1989 a 1999 em vários estados do Brasil. Os modelos estatísticos utilizados nas análises consideraram os efeitos fixos de grupo contemporâneo, idade do bezerro (regressão quadrática), idade da vaca (regressão polinomial quadrática-quadrática com nó aos 7 anos), data juliana de nascimento (regressão polinomial quadrática-quadrática-quadrática com nós aos 165 e 260 dias para GND, 150 e 240 dias para C, 165 e 270 dias para P e 155 e 260 dias para M) e heterozigoses materna e individual (regressões lineares). Todos os efeitos considerados no modelo influenciaram de forma significativa o GND e os escores de C, P e M. Os valores estimados de heterose materna e individual foram, respectivamente, 8,9% e 9,9% para GND, 10,0% e 6,6% para C, 8,5% e 4,8 % para P e 10,9% e 5,0% para M.

ABSTRACT - The objectives of this study were to obtain adjustment factors for effects of calf age, dam age and calf Julian birth date on weight gain from birth to weaning (GND) and on visual scores of conformation (C), precocity (P), and muscling (M) and to estimate effects of maternal and individual heterosis on those traits. The analyzed records were from two breeding programs named Natura and Conexão Delta G, totalizing 187,610 purebred and crossbred Nellore x Angus and Nellore x Hereford calves. Calves were born between 1989 and 1999 in herds located in different states of Brazil. The statistical models applied to analyze GND and visual scores of C, P, and M included fixed effects of contemporary group, calf age (quadratic regression), dam age (quadratic-quadratic polynomial regression with junction point at seven years), calf Julian birth date (quadratic-quadratic-quadratic polynomial regression with junctions at 165 and 260 days for GND, 150 and 240 days for C, 165 and 270 days for P, and 155 and 260 days for M), and individual and maternal heterozygosity (linear regressions). All effects included in the model showed significant influence on GND and on visual scores of C, P, and M. The estimated values of maternal and individual heterosis were, respectively, 8.9% and 9.9% for GND; 10.0% and 6.6% for C; 8.5% and 4.8% for P; and 10.9% and 5.0% for M.

O experimento foi conduzido na Estação Experimental Agronômica da Universidade Federal do Rio Grande do Sul, município de Eldorado do Sul, Brasil. O objetivo do estudo foi avaliar o efeito da data do desmame precoce (05/01/99) ou do convencional (26/03/99) sobre o desempenho reprodutivo de vacas de corte multíparas em duas estações de monta, 98/99, e a subseqüente, 99/00. Cinqüenta vacas tiveram seus bezerros desmamados em média aos 91 dias de vida, com peso mínimo de 70 kg (desmame precoce = DP), e 43 vacas desmamaram em média aos 170 dias, com peso médio de 131,2 kg (desmame convencional = DC). Os períodos de acasalamento ocorreram de 01/12/98 a 26/02/99, de 06/12/99 a 28/02/00. As vacas do DP apresentaram ganho médio diário (GMD) superior e melhor condição corporal (CC) que as do DC no primeiro acasalamento (0,828 kg x 0,549 kg; 2,4 x 2,0; P<0,05). O índice de prenhez em 1999 foi de 40,0% x 11,1% e em 2000 de 51,4% x 20,0%, para o DP e DC, respectivamente. Não foi observada diferença no intervalo entre partos. A taxa de prenhez no primeiro acasalamento foi menor que o esperado, devido possivelmente à baixa CC no início do acasalamento e à baixa recuperação durante o mesmo. Mesmo assim, o DP propiciou melhor CC às vacas durante o primeiro acasalamento, possibilitando índices reprodutivos significativamente melhores aos do desmame convencional.

The experiment was run at the Agronomic Experimental Station of the Federal University of Rio Grande do Sul, located in the district of Eldorado do Sul, Brazil. The objective of the study was to evaluate the effect of the date of early (01/05/99) or conventional (03/26/99) weaning on the reproductive performance of multiparous beef cows during two mating seasons, 98/99, and the subsequent, 99/00. Fifty cows had their calves weaned with an average age of 91 days old and a minimum liveweight of 70 kg (early weaning = EW), and 43 cows had calves weaned with an average age of 170 days old and mean liveweight of 131.2 kg (conventional weaning = CW). The mating periods were from 12/01/98 to 02/26/99 and from 12/06/99 to 02/28/00. Cows of EW had higher daily liveweight gains and better body condition (BC) than CW during the first breeding season (0.828 kg x 0.549 kg; 2.4 x 2.0; P<0.05). The pregnancy rate in 1999 was 40.0% x 11.1% and in 2000 it was 51.4% x 20.0% for EW and CW, respectively. There was no difference in the calving intervals. The pregnancy rate at first mating was lower than the expected, probably due to the low BC at beginning of the mating season and to the low recovery during the mating period. The EW improved cows BC during the first mating, making possible significantly better reproductive rates than the CW.