RESUMEN La región norte del departamento de Caldas, Colombia es considerada como una zona endémica de tifo murino. Estudios recientes realizados en pacientes con enfermedad febril aguda, demostraron la infección con rickettsias, del grupo de las fiebres manchadas, debido al aumento en el título de IgG, por inmunofluorescencia indirecta (IFI), en sueros pareados, obtenidos de dichos pacientes. El objetivo de la investigación fue el de identificar las especies de garrapatas presentes en animales domésticos, de la región norte de Caldas y establecer la presencia de material genómico de rickettsias, en las garrapatas recolectadas. En siete municipios, se recolectaron garrapatas de bovinos, de equinos y de caninos. Las garrapatas, se almacenaron en etanol al 90 %, hasta su identificación taxonómica. Se extrajo el ADN, utilizando técnicas comerciales y se amplificó por reacción de cadena de la polimerasa (PCR) convencional el gen gltA. Se obtuvieron 713 garrapatas de 593 animales domésticos. La más alta infestación se presentó en bovinos, seguido de los caninos y equinos. Las garrapatas encontradas correspondieron a las especies Riphicephalus microplus, Dermacentor nitens, Amblyomma sp. y Riphicephalus sanguineus s.l. En ninguna de las muestras, se comprobó la presencia de ADN del gen gltA específico de Rickettsia. Se puede inferir que las garrapatas obtenidas no serían una fuente de infección rickettsial para las personas, en esta región del departamento; sin embargo, su presencia es un factor de riesgo para la adquisición de rickettsiosis asociadas con las fiebres manchadas.

ABSTRACT The northern region of the Caldas department in Colombia is considered an endemic area for murine typhus. Recent studies in patients with acute febrile disease demonstrated infection with the spotted fever group's rickettsiae due to an increase in the IgG titer by indirect immunofluorescence in paired sera obtained from these patients. The objective of the current research was to identify the species of ticks present in domestic animals in the northern region of Caldas and establish the presence of rickettsial genomic material in the collected ticks. Ticks were obtained from bovines, horses, and dogs in seven municipalities in the north of Caldas. Ticks were stored in 90 % ethanol until processing and were identified using taxonomic keys, DNA was extracted using commercial techniques, and the gltA gene was amplified by conventional chain reaction polymerase (PCR). Seven hundred thirteen ticks were obtained from 593 domestic animals. The highest infestation occurred in cattle, followed by canines and horses. Ticks found corresponded to the species Riphicephalus microplus, Dermacentor nitens, Amblyomma sp., and Riphicephalus sanguineus s.l. In none of the tick samples, Rickettsia-specific gltA gene DNA was found. It can be inferred that the ticks obtained are not a source of rickettsial infection for people in this department region, despite finding different species associated with the transmission of this disease.

RESUMEN Los estudios sobre salud pública y biodiversidad de mamíferos silvestres incluyen un componente genético. Para las muestras de sangre, se debe tener condiciones óptimas de colección, ya que pueden afectar la preservación y la extracción del ADN. Este estudio evaluó el uso de métodos de preservación de ADN líquido y seco y métodos de extracción de ADN comerciales y no comerciales, en muestras de sangre, recolectadas en campo. Para ello, se recogieron 264 muestras de sangre totales de mamíferos salvajes. Se preservó un primer grupo de muestras en clorhidrato de guanidina (GuHCl) y se extrajo el ADN, utilizando seis kits comerciales: Bioline, Norgen, Invitrogen, Promega y Qiagen, además de dos protocolos no comerciales: fenol-cloroformo isoamil alcohol (PC) y guanidina tiocianato (GIT). Otro grupo de muestras, se preservó en tarjetas Whatman® FTA® y se extrajo el ADN, con PC y GIT. Las extracciones con GIT y PC mostraron los valores y variaciones más altas en la concentración de ADN (ng/µL), mientras que el kit comercial mostró una baja variación. La preservación de la muestra en tarjetas Whatman® FTA® proporcionó una baja variación y cantidad de ADN extraído, en comparación con el uso de GuHCl. En cuanto a la calidad del ADN, los kits comerciales produjeron una mayor pureza (A260/280), mientras que los protocolos basados en GIT y PC proporcionaron resultados muy variables. Además, el uso de GIT y PC originó una mayor cantidad de ADN, pero de calidad variable. En general, la extracción basada en kits comerciales y la conservación Whatman® FTA® permitió obtener calidades y cantidades de ADN más estandarizadas.

ABSTRACT Studies on public health and wild mammal biodiversity include a genetic component. For blood samples, there must be optimal sample collection conditions since these can affect DNA preservation and extraction. This study evaluated the use of liquid and dry DNA preservation methods and commercial and non-commercial DNA extraction methods on field-collected blood samples. For this, 264 total blood samples were collected from wild mammals. A first group of samples was preserved in guanidine hydrochloride (GuHCl) and DNA was extracted using six commercial kits: Bioline, Norgen, Invitrogen, Promega, and Qiagen, in addition to phenol-chloroform isoamyl alcohol (PC) and guanidine thiocyanate (GIT). Another group of samples was preserved in Whatman® FTA® cards and DNA was extracted with PC and GIT. The extractions with GIT and PC showed the highest values (ng/µL) and variation in DNA concentration, while the commercial kit showed low variation. Sample preservation in Whatman® FTA® cards provided low variation and quantity of the extracted DNA compared with the use of GuHCl. Concerning DNA quality, the commercial kits yielded higher purity, while GIT and PC-based protocols provided highly variable results. Furthermore, the use of GIT and PC yielded a higher amount of DNA, yet, of variable quality. Overall, extraction based on commercial kits and Whatman® FTA® preservation allowed obtaining more standardized DNA qualities and quantities.

Abstract: Breeding biology in a population of Rufous-collared Sparrow (Zonotrichia capensis, Statius Müller, 1776) at different elevations in the Tropical Andes. Elevation strongly influences the evolution of life history traits associated with bird physiology and reproduction. Since life history traits in birds are modulated by environmental factors that vary with elevation, we expected to find changes in breeding biology traits of Z. capensis at different elevations. In this study, we compared the breeding biology (clutch size, egg volume, and reproductive activity) of a non-migratory population of Z. capensis in two localities at different elevations (low and high elevations, 1 800 m a.s.l., and 3 800 m a.s.l., respectively) and same latitude in the Colombian Tropical Andes for a one-year period. We found no differences in clutch size between the localities; however, egg volume was higher at high elevation. Furthermore, the reproductive activity differed significantly between localities. We propose that clutch size is likely conserved throughout the altitudinal distribution of Z. capensis since the species evolved in Tropical lowlands. On the other hand, the larger egg volume at high elevation could obey local environmental factors that may favor the reproductive success of the population.

Resumen: Biología reproductiva en una población de Gorrión Copetón (Zonotrichia capensis, Statius Müller, 1776) a diferente elevación en los Andes tropicales. La elevación influye fuertemente en la evolución de los rasgos de historia de vida asociados con la fisiología y reproducción de las aves. Dado que los rasgos de historia de vida en las aves están modulados por factores ambientales que varían con la elevación, esperábamos encontrar cambios en los rasgos de la biología reproductiva de Z. capensis a diferentes elevaciones. En este estudio, comparamos la biología reproductiva (tamaño de puesta, volumen del huevo y actividad reproductiva) de una población no migratoria de Z. capensis en dos localidades a diferente elevación (elevación baja 1 800 m snm, y elevación alta 3 800 m snm,) y a la misma latitud en los Andes tropicales colombianos por un período de un año. No encontramos diferencias en el tamaño de puesta entre las localidades; sin embargo, el volumen del huevo fue mayor en elevación alta. Además, la actividad reproductiva difirió entre las localidades. Proponemos que el tamaño de puesta probablemente se conserve en toda la distribución altitudinal de Z. capensis, ya que la especie evolucionó en las tierras bajas tropicales. Por otro lado, el mayor volumen del huevo a elevación alta podría obedecer a factores ambientales locales que pueden favorecer el éxito reproductivo de la población.

Abstract Bat ectoparasites have a complex natural history narrowly tied to their hosts at ecological, behavioral, and evolutionary scales. As flying and social organisms, bats represent a potential mechanism of dispersal, a source of feeding, and a roost for ectoparasite reproduction. The chiggerflea Hectopsylla pulex (Siphonaptera: Tungidae) is widely distributed across the Neotropics. Females of this ectoparasite have been found in their neosomal form on bats of the family Molossidae, Noctilionidae, Phyllostomidae, and Vespertilionidae. Here we present the record of infestation of chiggerfleas on the Argentine bat, Eptesicus furinalis (Vespertilionidae) in Colombia, representing the first record of the flea on this species, and providing novel genetic information of this poorly known flea species.

Abstract: Bats of genus Eptesicus are represented in South America by nine species of short-eared taxa (subgenus Eptesicus), and 10 species of long-eared species (subgenus Histiotus). Here we describe a new species of short-eared Eptesicus based on 19 specimens collected in the sub-Andean Bolivian-Tucumanian forest of Santa Cruz, between 1800-2020 masl. For this, we include morphological, morphometric, and molecular comparisons; we use principal component, discriminant function and mitochondrial genes (cytochrome-b, cytochrome c oxidase subunit I, and nicotinamide adenine dinucleotide dehydrogenase) to compare the new species with other taxa of the subgenus Eptesicus from South America. The new species is distinguished from its congeners by cranial shape, body measurements, and genetic distances. Furthermore, the new species is similar in cranial morphology to Eptesicus andinus but presents a highly developed frontal preorbital process, poorly developed in other related species (i. e., E. andinus, E. furinalis, and E. brasiliensis). All males were consistently darker than females in the new species. This taxon increases to 10 the number of species of bats of the subgenus Eptesicus in South America.

Resumen: Los murciélagos del género Eptesicus en Sudamérica están representados por nueve especies de murciélagos de orejas cortas (subgénero Eptesicus) y 10 especies de orejas largas (subgénero Histiotus). Describimos una nueva especie de Eptesicus de orejas cortas, con base en 19 especímenes, que fueron colectados en el Bosque Boliviano-Tucumano del subandino de Santa Cruz, entre los 1800-2020 msnm. Para esto, incluimos comparaciones morfológicas, morfométricas y moleculares; utilizamos los análisis de componente principal, función discriminante y genes mitocondriales (citocromo-b, citocromo c oxidasa subunidad I y nicotinamida adenina dinucleótido deshidrogenasa) para comparar la nueva especie con otros taxones del subgénero Eptesicus de Sudamérica. La nueva especie se distingue de sus congéneres por su forma craneal, medidas corporales, dicromatismo sexual notable y las distancias genéticas. Además, la nueva especie es similar en la morfología craneal con Eptesicus andinus, pero esta presenta un proceso preorbital frontal muy desarrollado el cual es pobremente desarrollado en las especies relacionadas (i. e., E. andinus, E. furinalis y E. brasiliensis). Todos los machos en la nueva especie fueron evidentemente más oscuros que las hembras. Este nuevo taxón aumenta a 10 el número de las especies del subgénero Eptesicus en Sudamérica.

ABSTRACT Some species of mastiff bats, Molossus Geoffroy, 1805, inhabit human shelters such as houses and barns. Among them, the Pallas’s mastiff bat, Molossus molossus Pallas, 1766, is the most common species in South America. There are a few studies on this bat in Colombia, mostly on colony size, diet, ectoparasite records, and activity patterns in the Andean and Caribbean regions. Here, we provide information on the prevalence of chiggerfleas, Hectopsylla pulex (Haller, 1880), on M. molossus, along with molecular data on the flea, and its distribution in Colombia. In addition, we describe the size and sex ratio of the infested bat colony, located in the central Andes of Colombia. The bat colony was represented by ca. 45 individuals, of which 33 were captured. The colony had more females (25 individuals) than males (8 individuals). A total of four Pallas’s mastiff bats had chiggerfleas, H. pulex, most of which were attached to the bat’s faces and ears. The composition of the colony (sex ratio) and the observed activity times match those reported for other colonies of the species in Colombia. The cytochrome oxidase subunit 1, and the 12S rRNA mitochondrial gene obtained from H. pulex represent the second and first available sequences for the species, respectively. The level of infestation of individuals in the colony was low, similar to that observed in other South American countries, such as Brazil. Finally, the new locality is the seventh confirmed and the highest elevational record of H. pulex in Colombia.

Abstract Populations that breed along steep elevation gradients show diverse physiological and morphological changes in response to the different environmental conditions. The latter has been discussed by Bergmann’s and Allen’s ecogeographic rules about body and appendage sizes and environmental temperature. We compared morphometric measures (mass, bill width, tarsus, wing, and tail length) of a Zonotrichia capensis population in two localities at different elevations with similar latitudes and photoperiods on the western slope of the Colombian Central Andes. We compared a Low Elevation locality (LE) at 1800 m a.s.l. and a High Elevation locality (HE) at 3853 m a.s.l. that have approximate wind speeds of 1.3 m/s and 8.4 m/s, respectively. During 12 months of sampling, we captured 46 adults using mist-nets; 26 in the LE and 20 in the HE. Each individual was sexed using molecular techniques at the Laboratory of Genetics of the Department of Biological Sciences of Universidad de Caldas. Individuals (males + females) from the HE had longer wings and tails than those from the LE (F1,44 = 5.93; P = 0.019). Also, wings of males in the HE were longer than those of females in both localities and tails of males in the HE were longer than those of LE males. Our results did not agree with what was expected according to Allen’s and Bergmann’s ecogeographic rules. Longer wings and tails increase sustainment, maneuverability, and balance in low atmospheric pressures and strong air currents and these conditions are found at high elevation habitats. Most likely, the longer wings found for HE males allow greater movement during territorial behavior. Further, these differences in morphological traits along elevational gradients could result from micro-evolutionary changes between localities or phenotypic plasticity of individuals exposed to different environmental conditions.

Resumen Las poblaciones que se reproducen en gradientes altitudinales, adoptan diversos cambios morfológicos para afrontar las condiciones ambientales. En el presente estudio se compararon las medidas morfológicas (peso corporal, longitud del tarso, ala, cola y culmen) de una población de Zonotrichia capensis, a diferente altitud en los Andes colombianos. Las localidades de tierra baja (TB) y alta (TA) se encuentran a 1800 m.s.n.m. y 3853 m.s.n.m., con velocidad aproximada del viento de 1.3 m/s y 8.4 m/s, respectivamente. Durante 12 meses se realizó la captura de 46 individuos (TB n=26, TA n=20) para la medición de los rasgos morfológicos. La longitud del ala de los individuos de TA fue mayor que en TB. Así mismo, en machos de TA la longitud del ala fue mayor que en hembras en general. Es posible que a las más grandes incrementen la eficiencia del vuelo en zonas ventosas y con baja presión atmosférica, como ocurre en TA. Probablemente la diferencia del tamaño del ala entre los machos de TA y las hembras, se deba a un mayor desplazamiento dentro de la conducta territorial. Estas diferencias podrían ser el resultado de cambios microevolutivos entre localidades o la plasticidad fenotípica de individuos expuestos a diferentes condiciones ambientales.

Resumen Ginandromorfismo es una condición donde un organismo exhibe simultáneamente características morfológicas de macho y hembra. En Colombia el taxón Amblyomma cajennense está representado por las especies Amblyomma patinoi y Amblyomma mixtum. En septiembre de 2014 en la Orinoquía colombiana, de infecciones naturales de bovinos y equinos, se colectaron y determinaron garrapatas adultas. En una infección natural de bovino se describió un ginandromorfo clasificado morfológicamente como A. mixtum. Éste es el primer registro en la literatura de un ginandromorfo A. mixtum, y la primera descripción de un ginandromorfo para una especie de garrapata en Colombia.

Abstract Gynandromorphism is a condition in which an organism simultaneously exhibits male and female morphological characteristics. In Colombia, the taxon Amblyomma cajennense is represented by the species Amblyomma patinoi and Amblyomma mixtum. In September of 2014, in the Colombian Orinoco region, adult ticks were collected and determined from natural infections in bovines and equines. A gynandromorph was described from a natural infestation on a bovine, and morphologically classified as A. mixtum. This is the first literature report of a gynandromorph of A. mixtum, and the first description of a gynandromorph for a tick species in Colombia.

Moniliophthora perniciosa presenta discrepancias en su taxonomía y es el agente causal de la escoba de bruja del cacao, que en Colombia es la segunda enfermedad después de la moniliasis (Moniliophthora roreri). En este estudio se analizaron 12 muestras del patógeno, obtenidas de diferentes materiales de cacao de la Granja Casa Luker S.A. (Palestina, Caldas, Colombia). El ADN fue obtenido de cultivos monospóricos y de fructificaciones del hongo. Cada muestra se evaluó a partir de cultivos microbiológicos utilizando marcadores moleculares tipo ITS (genes ITS1, ITS2 y 5.8S). La caracterización molecular del ADN obtenido de la extracción directa de fructificaciones del hongo, evita la selección artificial en los medios de cultivo y garantiza un diagnóstico más real de la diversidad del patógeno en las plantaciones. La caracterización molecular permitió diferenciar entre M. perniciosa y M. roreri.

Moniliophthora perniciosa presents discrepancies in its taxonomy and is the causal agent of cocoa witches' broom, which in Colombia is the second disease after moniliasis (Moniliophthora roreri). In this study 12 samples of the pathogen obtained from different cocoa materials from the Casa Luker S.A. Farm (Palestina, Caldas, Colombia) were analyzed. The DNA was obtained from monosporic cultures and from the fungus fructification. Each sample was evaluated from microbiological cultures using molecular markers ITS (ITS1, ITS2 and 5.8S genes). The Molecular ADN characterization obtained from direct extraction from the fungus fructification avoids artificial selection in the culture means and ensures a more realistic diagnosis of the pathogen diversity in the plantations. The molecular characterization allowed differentiation between M. pernicious and M. roreri.