O gênero Coffea L., com cerca de 100 espécies nativas de regiões tropicais e subtropicais da África, tem as espécies Coffea arabica e C. canephora como comercialmente importantes. C. arabica é uma exceção no gênero por ser o único poliplóide natural com 2n=4x=44 cromossomos e autocompatível sendo considerado um alopoliplóide segmental devido à herança dissômica e comportamento meiótico regular. As demais espécies são diplóides autoincompatíveis com 2n=2x=22. Estudos citogenéticos em Coffea têm sido realizados, desde 1912, com diferentes finalidades. Os primeiros visaram apenas a contagem de cromossomos. Em seguida, estudos morfológicos em cromossomos somáticos com técnicas citológicas convencionais objetivaram a caracterização das diferentes espécies. Devido o fato dos cromossomos de café serem relativamente pequenos (1 - 3 µm), e morfologicamente simétricos, estes estudos revelaram cariótipos homogêneos entre as diferentes espécies. O melhoramento genético do cafeeiro, realizado através de hibridações interespecífcas envolvendo espécies selvagens diplóides, demandou estudos da microsporogênese, em espécies e híbridos, com vistas ao estabelecimento de relações de afinidade genética entre as mesmas. O mapeamento do padrão cromomérico, na fase de paquíteno, juntamente com o surgimento do bandeamento C e NOR, conduziu às primeiras tentativas de se diferenciar longitudinalmente os cromossomos de café, e resultaram em relativo sucesso. A partir de 1998 o bandeamento com os fluorocromos DAPI e CMA3 e aplicação da técnica de FISH, com sondas de rDNA, vêm incrementando a diferenciação dos cromossomos e a aplicação da técnica GISH, com sondas de DNA genômico total, confirmaram as espécies parentais de C. arabica.
The genus Coffea L. has around 100 native species distributed in tropical and subtropical areas in Africa, and the most important economic species are C. arabica and C. canephora. C. arabica is exceptional in the genus since it is the only species so far analyzed which is self-compatible, and a natural polyploid with 2n=4x=44 chromosomes; it is considered to be a segmental allopolyploid because it presents a disomic inheritance and a regular meiotic behavior. All other species in the genus are self-incompatible diploids with 2n=2x=22. Cytogenetic studies in Coffea, undertaken since 1912, have followed various phases: initial studies were limited only to establishing chromosome counts. Subsequent studies characterized the karyotypes of various species using conventional cytological techniques. As the somatic metaphase chromosomes of coffee are very small (1 - 3 µm) and morphologically symmetrical, these studies resulted in uniform karyotypes that show almost no differences among species. Since genetic improvement of coffee trees has progressed mainly by means of interspecific hybridizations involving wild species, analyses of microsporogenesis in species and hybrids were needed to establish their genetic affinity and relationships. The first successful attempts to differentiate coffee chromosomes longitudinally were made by mapping pachytene chromomeric patterns and by C and NOR banding techniques. From 1998 onwards, the use of banding techniques with the fluorochromes DAPI and CMA3, and also the cytomolecular technique FISH using rDNA probes, has increased the longitudinal differentiation of coffee chromosomes. The use of the GISH technique with total genomic DNA has revealed the parental species that originated C. arabica species.