O objetivo deste estudo é compilar o inventário de quase 100 anos de pesquisa sobre a composição de espécies do fitoplâncton do litoral do Estado de São Paulo, Brasil. O retrato atualizado da biodiversidade local é necessário para establecer um dignóstico para comparações futuras. Este tipo de informação encontra-se dispersa em antigas publicações e em material considerado como "literatura cinza" e requer atualização nomenclatural. Vinte e seis publicações foram consideradas neste estudo. O registro mais antigo é de 1913 (?) e o mais recente de 2002. Esta lista de espécies, compilada a partir de dados pretéritos, foi complementada com dados primários coletados entre agosto de 2004 e julho de 2006 nas zonas de arrebentação de 20 praias paulistas e em área de maricultura da praia da Cocanha em Caraguatatuba. A lista de espécies completa inclui 572 táxons: a maioria de diatomáceas (82%), seguidas por dinoflagelados (16%), com uma pequena contribuição de silicoflagelados, cocolitoforídeos, ebriideas e cianobactérias. As áreas mais estudadas foram: Ubatuba, São Sebastião, Santos e Cananéia. O levantamento atual tem uma cobertura espacial mais abrangente. Ao longo dos anos, os objetivos dos estudos pretéritos variaram desde puramente taxonômicos até investigações de aspectos funcionais do ecossistema. Desta forma, os inventários mais longos e a maioria dos primeiros registros foram publicados antes de 1980 e as publicações mais recentes fazem menção apenas a espécies mais abundantes/freqüentes. Microscopia eletrônica foi empregada pela primeira vez no levantamento atual e novos registros incluem 38 diatomáceas, 42 dinoflagelados, 1 silicoflagelado, 1 ebriidea e 2 cianobactérias. O uso e interpretação deste inventário exige cautela. Se por um lado, não é viável questionar a identificação feita por outros pesquisadores, por outro lado, a capacidade de amostrar, analisar e identificar espécies evoluiu ao longo do tempo. Algumas considerações sobre esta questão são apresentadas.

The objective of this study is to compile the inventory of nearly 100 years of research about the phytoplankton species cited for the coast of the state of São Paulo, Brazil. A state-of-the-art study on the local biodiversity has long been needed to provide a baseline for future comparisons. This type of data is scattered in old scientific journals and in the so-called "grey literature", and are in need of nomenclature updating. Twenty-six publications are considered. The earliest sampling record is from 1913 (?) and the most recent from 2002. This checklist compiled from the literature was complemented with primary data collected between August 2004 and July 2006, recent surveys of the surf-zone of 20 beaches located along the coast and of a mariculture farm at the Cocanha Beach, Caraguatatuba. The complete species list includes 572 taxa: most are diatoms (82%), seconded by dinoflagellates (16%), with a minor contribution of silicoflagellates, coccolithophorids, ebriideans and cyanobacteria. The most investigated areas were: Ubatuba, São Sebastião, Santos and Cananéia. The recent surveys have a broader spatial coverage. The objectives of the studies have changed over the years from purely taxonomic to process-oriented investigations. Therefore, the longest species lists and most first records for the area were published before the 1980's and later publications, even those in which cell counts were performed, mention only the most abundant/frequent species. Electron microscopy was used for the first time in the present surveys, and new records include 38 diatoms, 42 dinoflagellates, 1 silicoflagellate, 1 ebriidean and 2 cyanobacteria. The use and interpretation of this species list require the perception of some constraints. It is not our role to question the identification made by other researchers. On the other hand, the ability to sample, analyze and identify species has evolved over the years and some considerations in this regard are presented.