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Detection and genome characterisation of SARS-CoV-2 P.6 lineage in dogs and cats living with Uruguayan COVID-19 patients SARSCoV2 SARSCoV SARS CoV 2 SARS-CoV- P6 P 6 P. COVID19 COVID 19 COVID-1 SARS-CoV COVID1 1 COVID-
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Panzera, Yanina

; Mirazo, Santiago

; Baz, Mariana

; Techera, Claudia

; Grecco, Sofía

; Cancela, Florencia

; Fuques, Eddie

; Condon, Emma

; Calleros, Lucía

; Camilo, Natalia

; Fregossi, Andrea

; Vaz, Inés

; Pessina, Paula

; Deshpande, Nikita

; Pérez, Ruben

; Benech, Alejandro

Memórias do Instituto Oswaldo Cruz

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2022, Volume 117 elocation e220177

Resumo: En | Texto: En | PDF: En

BACKGROUND Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) infections in domestic animals have occurred from the beginning of the pandemic to the present time. Therefore, from the perspective of One Health, investigating this topic is of global scientific and public interest. OBJECTIVES The present study aimed to determine the presence of SARS-CoV-2 in domestic animals whose owners had coronavirus disease 2019 (COVID-19). METHODS Nasopharyngeal and faecal samples were collected in Uruguay. Using quantitative polymerase chain reaction (qPCR), we analysed the presence of the SARS-CoV-2 genome. Complete genomes were obtained using ARTIC enrichment and Illumina sequencing. Sera samples were used for virus neutralisation assays. FINDINGS SARS-CoV-2 was detected in an asymptomatic dog and a cat. Viral genomes were identical and belonged to the P.6 Uruguayan SARS-CoV-2 lineage. Only antiserum from the infected cat contained neutralising antibodies against the ancestral SARS-CoV-2 strain and showed cross-reactivity against the Delta but not against the B.A.1 Omicron variant. MAIN CONCLUSIONS Domestic animals and the human SARS-CoV-2 P.6 variant comparison evidence a close relationship and gene flow between them. Different SARS-CoV-2 lineages infect dogs and cats, and no specific variants are adapted to domestic animals. This first record of SARS-CoV-2 in domestic animals from Uruguay supports regular surveillance of animals close to human hosts. SARSCoV2 SARSCoV SARS CoV (SARS-CoV-2 time Therefore Health interest SARS-CoV- 201 COVID19. COVID19 COVID 19 . (COVID-19) qPCR, qPCR , (qPCR) genome sequencing assays P6 P 6 P. lineage crossreactivity cross reactivity BA1 BA B A 1 B.A. them cats hosts (SARS-CoV- SARS-CoV 20 COVID1 (COVID-19 (qPCR B.A (SARS-CoV (COVID-1 (COVID- (COVID

https://doi.org/10.1590/0074-02760220177

Transmission cluster of COVID-19 cases from Uruguay: emergence and spreading of a novel SARS-CoV-2 ORF6 deletion
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Panzera, Yanina

; Ramos, Natalia

; Calleros, Lucía

; Marandino, Ana

; Tomás, Gonzalo

; Techera, Claudia

; Grecco, Sofía

; Frabasile, Sandra

; Fuques, Eddie

; Coppola, Leticia

; Goñi, Natalia

; Ramas, Viviana

; Sorhouet, Cecilia

; Bormida, Victoria

; Burgueño, Analía

; Brasesco, María

; Garland, Maria Rosa

; Molinari, Sylvia

; Perez, Maria Teresa

; Somma, Rosina

; Somma, Silvana

; Morel, Maria Noelia

; Mogdasy, Cristina

; Chiparelli, Héctor

; Arbiza, Juan

; Delfraro, Adriana

; Pérez, Ruben

Memórias do Instituto Oswaldo Cruz

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2021, Volume 116 elocation e210275

Resumo: En | Texto: En | PDF: En

BACKGROUND Evolutionary changes in severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) include indels in non-structural, structural, and accessory open reading frames (ORFs) or genes. OBJECTIVES We track indels in accessory ORFs to infer evolutionary gene patterns and epidemiological links between outbreaks. METHODS Genomes from Coronavirus disease 2019 (COVID-19) case-patients were Illumina sequenced using ARTIC_V3. The assembled genomes were analysed to detect substitutions and indels. FINDINGS We reported the emergence and spread of a unique 4-nucleotide deletion in the accessory ORF6, an interesting gene with immune modulation activity. The deletion in ORF6 removes one repeat unit of a two 4-nucleotide repeat, which shows that directly repeated sequences in the SARS-CoV-2 genome are associated with indels, even outside the context of extended repeat regions. The 4-nucleotide deletion produces a frameshifting change that results in a protein with two inserted amino acids, increasing the coding information of this accessory ORF. Epidemiological and genomic data indicate that the deletion variant has a single common ancestor and was initially detected in a health care outbreak and later in other COVID-19 cases, establishing a transmission cluster in the Uruguayan population. MAIN CONCLUSIONS Our findings provide evidence for the origin and spread of deletion variants and emphasise indels’ importance in epidemiological studies, including differentiating consecutive outbreaks occurring in the same health facility.

https://doi.org/10.1590/0074-02760210275

La educación occidental del indio como medio de desarrollo del Estado Boliviano en el Periodo Liberal (1898-1935)
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Gamarra Pérez, Ruben Alejandro

Fides et Ratio - Revista de Difusión cultural y científica de la Universidad La Salle en Bolivia

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Set 2015, Volume 10 Nº 10 Páginas 115 - 127

Resumo: Es En | Texto: Es En | PDF: Es | PDF: En

El Problema del indio, como era denominado por los intelectuales de principios del siglo XX, fue abordado desde diferentes perspectivas dentro de lo que se denominó el periodo liberal de la historia de Bolivia, dentro de éste nació una rama intelectual indigenista basada en los conceptos de raza que buscó la aplicación de políticas civilizatorias que buscaran insertar al indígena dentro del concepto moderno de ciudadanía comenzando por la educación. La presente investigación explora, a través de un análisis literario, dichas concepciones raciales indigenistas con la finalidad de determinar si es que éstas influyeron de alguna manera en la redacción de la Constitución de 2009.

The indian problem, as it was called by the intellectuals of the first decades of the 20th century, was addressed form different perspectives within what was named the liberal period in Bolivia's history, in this period an indigenist line of thinking based in the concepts of race was born looking forward to apply civilizatory policies that would insert the indigenous people in the modern concept of citizenship starting from its education. The present investigation explores, using literature analysis, those lines of thinking to determine if they, in any way, had influenced in the writing of the 2009 Constitution.

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Algunas consideraciones al modelo de desarrollo capitalista vigente en américa latina
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GAMARRA PÉREZ, RUBEN ALEJANDRO

Fides et Ratio - Revista de Difusión cultural y científica de la Universidad La Salle en Bolivia

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Mar 2015, Volume 9 Nº 9 Páginas 81 - 96

Resumo: Es En | Texto: Es En | PDF: Es | PDF: En

Desarrollo económico y desarrollo no son términos iguales. El discutir sobre desarrollo humano o desarrollo sostenible es imposible si se identifica este tipo de desarrollo exclusivamente con la acumulación del capital. Durante el siglo XX América Latina ha aplicado una cepa específica del modelo económico capitalista que perdura hasta nuestros días, este modelo genera la depredación de la naturaleza y la ampliación de la brecha de la desigualdad. La presente investigación busca explorar alunas de las alternativas que se plantean para la modificación de este modelo.

Economic development and plain development are not equal terms. Discussing about human development or sustainable development is impossible when we identify this kind of development exclusively with the accumulation of capital. During de twentieth century Latin America has applied a specific strain of the capitalist economic model that lasts until our days, this generates the depredation of nature and the widening of the inequality gap. The present investigation looks to explore some of the alternatives that are being presented for the modification of this model.

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Chromosome variability in the Chagas disease vector Rhodnius pallescens (Hemiptera, Reduviidae, Rhodniini)
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Gómez-Palacio, Andrés

; Jaramillo-Ocampo, Nicolás

; Triana-Chávez, Omar

; Saldaña, Azael

; Calzada, José

; Pérez, Ruben

; Panzera, Francisco

Memórias do Instituto Oswaldo Cruz

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Mar 2008, Volume 103 Nº 2 Páginas 160 - 164

Resumo: En | Texto: En | PDF: En

Rhodnius pallescens is the main vector of Trypanosoma cruzi in Panama and one of the most relevant secondary vectors in Colombia. Despite the importance of this species, there is limited knowledge about the genetic variability along its geographical distribution. In order to evaluate the degree of karyotype variability we analyzed the meiotic behavior and banding pattern of the chromosomes of 112 males of R. pallescens coming from different regions of Colombia and Panama. Using the C-banding technique we identified two chromosomal patterns or cytotypes characterized by differences in the amount, size and distribution of constitutive heterochromatic regions in the chromosome complement (2n = 20 autosomes plus XY in males). The individuals can be easily classified in each cytotype by the analysis of the chromosomes during first meiotic prophase. The frequencies of the cytotypes are variable according to the geographic origin of the populations. This chromosomal divergence together with morphological data supports the existence of three genetically different populations of R. pallescens and provides new information to understand the distribution dynamics of this species.

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Chromosome homogeneity in populations of Triatoma brasiliensis Neiva 1911 (Hemiptera - Reduviidae - Triatominae)
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Panzera, Francisco

; Pérez, Ruben

; Nicolini, Paula

; Hornos, Sonia

; Costa, Jane

; Borges, Érika

; Diotaiuti, Liléia

; Schofield, Christopher J.

Cadernos de Saúde Pública

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2000, Volume 16 Supl. 2 Páginas S83 - S88

Resumo: Pt En | Texto: Pt En | PDF: Pt | PDF: En

Vários autores têm reportado a ocorrência de quatro padrões cromáticos e diferentes padrões morfológicos, genéticos e ecológicos de Triatoma brasiliensis no semi-árido nordestino do Brasil, região onde é o mais importante vetor da doença de Chagas. Para verificar diferenças citogenéticas nessas populações, foram analisados seus cariótipos e o comportamento cromossomial durante o processo meiótico em exemplares machos. Observou-se que o T. brasiliensis mostra características cromossômicas distintas e específicas entre as quatro populações, diferindo daquelas observadas em outras espécies de triatomíneos. No entanto, diferenças citogenéticas não foram observadas entre as quatro populações de T. brasiliensis, o que poderia indicar que as referidas populações ainda se encontram em uma etapa inicial do processo de diferenciação, ainda não envolvendo a organização cromossomial.

Triatoma brasiliensis is the most important vector of Chagas disease in the semiarid zone of the Northeast of Brazil. Several authors have reported the occurrence of four chromatic patterns with morphological, ecological, and genetic differences. In order to determine the existence of cytogenetic differentiation between these chromatic forms, we analyzed their karyotypes and the chromosome behavior during the male meiotic process. Triatoma brasiliensis shows distinct and specific chromosome characteristics, which differ from those observed in all other triatomine species. However, no cytogenetic differences were observed between the four chromatic forms of T. brasiliensis. The lack of chromosome differentiation among them could indicate that the populations of this species are in a process of differentiation that does not involve their chromosomal organization.

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Chromosome homogeneity in populations of Triatoma brasiliensis Neiva 1911 (Hemiptera - Reduviidae - Triatominae)
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Panzera, Francisco

; Pérez, Ruben

; Nicolini, Paula

; Hornos, Sonia

; Costa, Jane

; Borges, Érika

; Diotaiuti, Liléia

; Schofield, Christopher J.

Cadernos de Saúde Pública

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2000, Volume 16 Supl. 2 Páginas S83 - S88

Resumo: Pt En | Texto: Pt En | PDF: Pt | PDF: En

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Mitochondrial DNA variation of Triatoma infestans populations and its implication on the specific status of T. melanosoma
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Monteiro, Fernando A

; Pérez, Ruben

; Panzera, Francisco

; Dujardin, Jean-Pierre

; Galvão, Cleber

; Rocha, Deyse

; Noireau, Francois

; Schofield, Chris

; Beard, Charles B

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Set 1999, Volume 94 Supl. 1 Páginas 229 - 238

Resumo: En | Texto: En | PDF: En

DNA sequence comparison of 412 base-pairs fragments of the mitochondrial cytochrome B gene was used to infer the genetic structure of nine geographical Triatoma infestans populations and their phylogenetic relationship with T. melanosoma and T. brasiliensis. T. infestans and T. melanosoma were compared by morphometry, allozyme and cytogenetic analyses, as well as subjected to reciprocal crosses, in order to clarify the taxonomic status of the latter. No differences were found to distinguish the two species and the crosses between them yielded progeny. T. infestans populations presented four haplotypes that could be separated in two clusters: one formed by the samples from Bolivia (Andes and Chaco) and the other formed by samples from Argentina and Brazil. Silvatic and domestic T. infestans populations from Bolivia (Andes) were genetically identical.

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Chromosome numbers in the Triatominae (Hemiptera-Reduviidae): a review
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Panzera, Francisco

; Pérez, Ruben

; Hornos, Sonia

; Panzera, Yanina

; Cestau, Rosario

; Delgado, Verónica

; Nicolini, Paula

Memórias do Instituto Oswaldo Cruz

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Ago 1996, Volume 91 Nº 4 Páginas 515 - 518

Resumo: En | Texto: En | PDF: En

The chromosome numbers of 46 out of the 122 currently recognized species of Triatominae (Hemiptera, Reduviidae) are summarized. We present the number of autosomes, the sex mechanism and the first reference for each karyotype.

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