RESUMO Este trabalho é resultado do estudo taxonômico de três gêneros de Euglenophyceae pigmentadas na Área de Proteção Ambiental do Ibirapuitã, localizada no sudoeste do Bioma Pampa, cujo clima é subtropical. Quatro expedições de coletas foram realizadas entre março/2011 e maio/2013 abrangendo 10 locais, sendo seis no rio Ibirapuitã e quatro em ambientes lóticos e lênticos próximos a esse rio. Da análise qualitativa resultou a identificação de 33 táxons específicos e infraespecíficos, sendo um de Cryptoglena, dois de Monomorphina e 30 de Phacus. São registradas pela primeira vez no Estado do Rio Grande do Sul: Phacus formosus e P. triqueter. Apesar da alta riqueza específica em alguns locais, a maioria dos táxons teve distribuição de ocorrência pouco frequente (61%). Distinguindo-se por serem frequentes: Phacus curvicauda Swir., P. hamatus Pochm., P. longicauda (Ehr.) Duj. var. longicauda, P. orbicularis Hübner var. orbicularis e P. tortus (Lemm.) Skv. (totalizando 15%), enquanto os demais foram esporádicos.
ABSTRACT This work is the result of a taxonomic study of three genera of pigmented Euglenophyceae in the Área de Proteção Ambiental do rio Ibirapuitã, located in the southwest of the Pampa Biome, where the climate is subtropical. Four samplings were carried out between March 2011 and May 2013 covering 10 sites, six at Ibirapuitã River and four in surrounding environments. Qualitative analysis resulted in the identification of 33 specific and infraspecific taxa, one of Cryptoglena, two of Monomorphina, and 30 of Phacus. We recorded Phacus formosus and P. triqueter, which are first reports for Rio Grande do Sul State. Despite the high diversity and species richness in some places, most taxa had infrequent distribution (61%). Phacus curvicauda Swir, P. hamatus Pochm, P. longicauda (Ehr.) Duj. var. longicauda, P. orbicularis var. orbicularis Hübner, and P. tortus (Lemm.) Skv. were frequent (totaling 15%), while the others were sporadic.