Resumo Duas linhagens de Rhipicephalus sanguineus são conhecidas no Brasil: populações da linhagem temperada ou do sul, e tropical ou do norte. Os padrões de distribuição de ambas as linhagens de R. sanguineus têm implicações epidemiológicas, podendo afetar a competência vetorial de Ehrlichia canis, o agente etiológico da erliquiose monocítica canina. Com a intenção de identificar os microbiomas de ambas as linhagens e comparar microrganismos de R. sanguineus, foi utilizada a metataxonomia, baseada no gene 16S rRNA (região V4-V5), por meio do sequenciamento de nova geração na plataforma MiSeq Illumina. Foram selecionadas amostras de fêmeas do ambiente e cultivo primário de células embrionárias, considerando-se as duas linhagens conhecidas do Brasil. Este é o primeiro estudo que investiga o microbioma procariótico de células de cultura de carrapato. Os resultados mostram que muitos grupos de bactérias detectadas nas amostras são membros típicos do ambiente do hospedeiro. Uma diversidade significativa de microrganismos em fêmeas e cultura de células embrionárias nas duas linhagens de R. sanguineus foi encontrada, com ênfase na presença de Coxiella em todas as amostras, ainda que em diferentes proporções. Possivelmente, as espécies de Coxiella presentes nas duas linhagens de carrapatos são diferentes e co-evoluíram com essas linhagens, conduzindo a diferentes padrões de interação entre carrapatos e patógenos que podem abrigar ou transmitir aos hospedeiros vertebrados.

Abstract Two lineages of Rhipicephalus sanguineus are known in Brazil: the temperate or southern and the tropical or northern populations. The distribution patterns of both lineages of R. sanguineus have epidemiological implications that can affect vectorial competence concerning Ehrlichia canis, the agent of canine monocytic ehrlichiosis. Intending to identify the microbiomes of both lineages and compare microorganisms in R. sanguineus, we used the 16S rRNA (V4-V5 region) gene-based metataxonomic approach, through NGS sequencing on the MiSeq Illumina platform. We selected specimens of females from the environment and samples of primary embryonic cell cultures, from both lineages, and this was the first study to investigate the prokaryotic microbiome in tick cell cultures. The results showed that many bacterial taxa detected in the samples were typical members of the host environment. A significant diversity of microorganisms in R. sanguineus females and in embryonic cell cultures from both lineages was found, with emphasis on the presence of Coxiella in all samples, albeit in different proportions. The Coxiella species present in the two lineages of ticks may be different and may have co-evolved with them, thus driving different patterns of interactions between ticks and the pathogens that they can harbor or transmit to vertebrate hosts.

Abstract Human activities on the Earth's surface change the landscape of natural ecosystems. Mining practices are one of the most severe human activities, drastically altering the chemical, physical and biological properties of the soil environment. Bacterial communities in soil play an important role in the maintenance of ecological relationships. This work shows bacterial diversity, metabolic repertoire and physiological behavior in five ecosystems samples with different levels of impact. These ecosystems belong to a historical area in Iron Quadrangle, Minas Gerais, Brazil, which suffered mining activities until its total depletion without recovery since today. The results revealed Proteobacteria as the most predominant phylum followed by Acidobacteria, Verrucomicrobia, Planctomycetes, and Bacteroidetes. Soils that have not undergone anthropological actions exhibit an increase ability to degrade carbon sources. The richest soil with the high diversity was found in ecosystems that have suffered anthropogenic action. Our study shows profile of diversity inferring metabolic profile, which may elucidate the mechanisms underlying changes in community structure in situ mining sites in Brazil. Our data comes from contributing to know the bacterial diversity, relationship between these bacteria and can explore strategies for natural bioremediation in mining areas or adjacent areas under regeneration process in iron mining areas.

O objetivo deste trabalho foi detectar a presença de arqueias no rúmen bovino por meio das sequências gênicas da região conservada 16S rDNA. As amostras foram coletadas de bovinos alimentados com duas dietas experimentais contendo diferentes relações volumoso e concentrado. Para amplificação da região ribossomal 16S rDNA foi feita PCR e a análise das sequências foi realizada pelos programas Phred/Phrap/Consed. As análises do BLAST permitiram identificar no tratamento com 70% de feno, 96 sequências relacionadas à família Methanobacteriaceae, 47 sequências a arqueias não cultiváveis e 60 sequências foram de arqueias desconhecidas e no tratamento com 30% de feno foram 125 sequências relacionadas à família Methanobacteriaceae, 42 sequências a arqueias não cultiváveis e 32 sequências foram de arqueias desconhecidas. A análise das sequências da região 16S rDNA de arqueias do rúmen bovino permitiu detectar maior número de sequências relacionadas com arqueias desconhecidas no tratamento com 70% de feno.

The objective of this research was to detect the presence of archaea in the bovine rumen using genetic sequences from the conserved region of the 16S rDNA. Samples were collected from bovines that were fed two different experimental dietetic ratios of roughage to concentrate. The 16S rDNA region was amplified using PCR and analyzed using the Phred/Phrap/Consed programs. For the treatment with 70% hay diet 96 sequences related to the Methanobacteriaceae family, 47 sequences from non-cultured archaea, and 60 sequences from unknown archaea were identified by the BLAST analysis. For the treatment with 30% hay diet the BLAST analysis identified 125 sequences belonging to the Methanobacteriaceae fa-mily 42 sequences from non-cultured archaea, and 32 sequences from unknown archaea. The analysis of the 16S rDNA sequences of archaea collected from the bovine rumen, allows more sequences matching the unknown archaea were identified in the treatment with 70% hay.

A primeira bactéria fitopatogênica a ter seu genoma totalmente seqüenciado foi detectada e isolada em diferentes hospedeiros em diferentes regiões geográficas. Embora seja causadora de doenças em culturas economicamente importantes, como citros, cafeeiro e videira, pouco se conhece acerca das relações genéticas estabelecidas entre isolados da bactéria. Atualmente, todos os isolados são agrupados como uma única espécie, Xylella fastidiosa, apesar de colonizarem diferentes hospedeiros que desenvolvem sintomas diferenciados e possuir diferentes condições fisiológicas e microbiológicas. A existência de diversidade genética entre isolados da bactéria foi detectada da por métodos culturais e moleculares, embora pouco se conheça acerca das relações genéticas de isolados brasileiros obtidos de citros e cafeeiro. Este trabalho teve por objetivo verificar, através de marcadores moleculares fAFLP a existência de diversidade genética e as relações filogenéticas estabelecidas pelos isolados das bactérias brasileiras e estrangeiras. Estes marcadores foram selecionados por sua alta reproducibilidade e por ser de uso comum para tipagem e classificação bacteriana. Os resultados obtidos mostraram que os isolados brasileiros apresentam diversidade genética e que os isolados deste estudo agruparam-se de acordo com o hospedeiro e origem geográfica, a saber, citros-cafeeiro, temécula-videira-amoreira e ameixeira-elmo.

The first phytopathogenic bacterium with its DNA entirely sequenced is being detected and isolated from different host plants in several geographic regions. Although it causes diseases in cultures of economic importance, such as citrus, coffee, and grapevine little is known about the genetic relationships among different strains. Actually, all strains are grouped as a single species, Xylella fastidiosa, despite colonizing different hosts, developing symptoms, and different physiological and microbiological observed conditions. The existence of genetic diversity among X. fastidiosa strains was detected by different methodological techniques, since cultural to molecular methods. However, little is know about the phylogenetic relationships developed by Brazilian strains obtained from coffee and citrus plants. In order to evaluate it, fAFLP markers were used to verify genetic diversity and phylogenetic relationships developed by Brazilian and strange strains. fAFLP is an efficient technique, with high reproducibility that is currently used for bacterial typing and classification. The obtained results showed that Brazilian strains present genetic diversity and that the strains from this study were grouped distinctly according host and geographical origin like citrus-coffee, temecula-grapevine-mulberry and plum-elm.