RESUMO Os badnavírus (família Caulimoviridae) possuem genoma de dsDNA semicircular encapsidado em partículas baciliformes. Dioscorea bacilliform virus (DBV) é um importante Badnavirus infectando várias espécies de Dioscorea (inhame) no hemisfério sul. No presente estudo, 235 amostras foliares de inhame foram coletadas em diferentes bancos de germoplasma mantidos pela Escola Superior de Agricultura Luiz (ESALQ/USP), Universidade Federal de Viçosa (UFV) e Universidade Federal do Recôncavo Baiano (UFRB). A incidência média de badnavírus nas amostras avaliadas foi de 75,3%. As análises moleculares e filogenéticas, realizadas a partir de 42 sequências nucleotídicas, da região da RT/RNaseH de badnavírus, revelaram a ocorrência do Dioscorea bacilliform AL virus (DBALV) e Dioscorea bacilliform SN virus (DBSNV) em diferentes espécies de inhame. Até o momento, somente o DBALV havia sido relatado em inhame no Brasil, estando restrito à região Nordeste. Portanto, este é o primeiro relato do DBSNV infectando a cultura do inhame, no país. Além das espécies espissomais, também foram detectadas sequências endógenas, com porcentagem de identidade de nucleotídeos variando entre 89% e 100% com endogenous Dioscorea bacilliform virus (eDBV), pertencentes aos grupos 9 e 12. Os resultados obtidos corroboram com a hipótese de que o DBALV e o DBSNV estão presentes em materiais propagativos de inhame e amplamente disseminados no Brasil.
ABSTRACT Badnaviruses (family Caulimoviridae) have semicircular dsDNA genomes encapsidated into bacilliform particles. Dioscorea bacilliform virus (DBV) is an important Badnavirus infecting several species of Dioscorea (yam) in the southern hemisphere. In this study, 235 yam leaf samples were collected from different germplasm banks maintained by “Luiz de Queiroz” College of Agriculture (ESALQ/USP), Federal University of Viçosa (UFV) and Federal University of Recôncavo da Bahia (UFRB). The average incidence of badnavirus in the evaluated samples was 75.3%. Molecular and phylogenetic analyses, carried out from 42 nucleotide sequences, of the badnavirus RT/RNaseH region, revealed the occurrence of Dioscorea bacilliform AL virus (DBALV) and Dioscorea bacilliform SN virus (DBSNV) in different yam species. So far, only DBALV has been reported in yams in Brazil, being restricted to the Northeast region. Therefore, this is the first report of DBSNV infecting yam crop in the country. In addition to the episomal species, endogenous sequences were detected, and the percentage of nucleotide identity varied between 89% and 100% with endogenous Dioscorea bacilliform virus (eDBV), belonging to groups 9 and 12. The obtained results corroborate the hypothesis that DBALV and DBSNV are present in yam propagating materials and are widely disseminated in Brazil.