Los programas de repoblamiento de ríos vienen siendo usados con mayor frecuencia como métodos de conservación de la ictiofauna. Sin embargo, el monitoreo genético y evaluación de procedimientos reproductivos son necesarios para obtener resultados viables en los ecosistemas impactados negativamente por el hombre. El objetivo de este estudio fue analizar la diversidad genética de Brycon orbignyanus utilizado en programas de repoblamiento, en el sistema reproductivo semi-natural (SRSN), con el marcador RAPD. Fueron analizados 15 reproductores (Rp;10 machos y 5 hembras) y 95 larvas de la progenie. El SRSN permitió la obtención de una baja mortalidad de los Rp utilizados en el cruzamiento y todos presentaron desova/espermiación. Los 9 iniciadores utilizados produjeron 90 fragmentos (fg), de los cuales 73,33% fueron polimórficos. Encontrándose diferencias (P<0,05) en la frecuencia de 17 fg, sin la presencia de fg exclusivos. El índice de diversidad genética de Shannon y porcentaje de fg polimórficos fueron inferiores en los individuos de la progenie. La similaridad genética fue mayor en la progenie. El análisis de variancia molecular mostró que la mayor parte de la variación está dentro de cada lote (81,49%) y no entre los lotes (18,51%). La identidad y distancia genética fue 0,953 y 0,049, respectivamente. A pesar que el SRSN permitió la obtención de una baja mortalidad y adecuado comportamiento reproductivo de los Rp, hubo disminución de la variabilidad genética en la progenie por el efecto del bajo número de Rp utilizados durante la reproducción y por la baja variabilidad genética existente entre ellos
The stock enhancement programs are being used more frequently as methods of fish conservation. However, the genetic monitoring and the reproductive procedures evaluation are necessary to achieve viable and reliable results. The purpose of this study was to analyze the genetic diversity of Brycon orbignyanus used in stock enhancement programs, in the semi-natural reproductive system, with the RAPD marker. Fifteen broodstocks (10 male and 5 female) and 95 larvae of the offspring were analyzed. The semi-natural reproductive system allowed the obtaining of a low mortality of the broodstocks using in the mating and all presented spawing/spermiation. The nine primers used yielded 90 fragments, of which 73,33% were polymorphic. Differences (P <0,05) in the frequency of 17 fragments were observed, without the presence of exclusive fragments. The Shannon genetic diversity index and percentage of polymorphic fragments were lower in the offspring individuals. Genetic similarity was higher in the offspring. The analysis of molecular variance results showed that the major part of the genetic variation is within the groups (81,49%) and not between them (18,51%). The identity and genetic distance among the groups were 0,953 and 0,049; respectively. In spite of the semi-natural reproductive system to allow the decrease of mortality and an appropriate reproductive broodstocks behavior, was decrease of the genetic variability in the offspring for the effect of the small number of broodstocks used during the reproduction and for the low existent genetic variability among them