This is the first report by the COVID19 Observatory - Group: Contagion Networks analyzing mortality data from the city of São Paulo. In this report, we integrated mortality data for the city of São Paulo between 04/02/2020 and 04/28/2020, with information on the flow of victims between hospitals and cemeteries/crematoriums. We included in our analyzes both confirmed and suspected deaths from COVID-19. The main objectives of this report were: (1) to describe the structure of the flow of victims between locations and (2) to suggest changes in the current flow based on geographical distances in order to avoid a potential overload of the mortuary system. We suggest that the city of São Paulo should plan for a potential overload of the mortuary system (that is, the number of burials), based on the presented results. Thus, our results reinforce the need to adopt specific planning for the management of the extraordinary number of victims of this pandemic. Our predictions are based on the structural analysis of the COVID-19 victim flow network, which shows several hotspots with high vulnerability to system overload. These hotspots concentrate with either the greatest number of deaths (hospital) or of burials (cemetery or crematorium), and therefore have high potential to become overwhelmed by receiving many bodies due to the increase in victims of the pandemic. We recommend special attention to be given to localities on the east side of São Paulo, which has both the most vulnerable hospitals in the city, and also houses cemeteries and crematoriums that have a central role in the network and / or are vulnerable. Based on our optimization analysis, we suggest logistical changes in the current flow of bodies from hospitals to cemeteries/crematoriums so as not to overload the funeral system and minimize transportation costs. In this sense, our results are potentially useful for improving the operational planning of the Municipality of São Paulo, ratifying or rectifying actions underway at the municipal level.

Este é o primeiro relatório do Observatório COVID19 - Grupo: Redes de Contágio analisando os dados de óbitos da cidade de São Paulo. Neste relatório, integramos os dados de óbitos da cidade de São Paulo entre os dias 02/04/2020 e 28/04/2020 com informações sobre o fluxo de vítimas entre os hospitais e os cemitérios e crematórios da cidade de São Paulo. Incluímos em nossas análises óbitos confirmados e óbitos suspeitos de COVID-19. Os principais objetivos deste relatório são: (1) descrever a estrutura do fluxo de vítimas entre localidades e (2) sugerir mudanças no fluxo com base em distâncias geográficas de maneira a evitar uma potencial sobrecarga do sistema funerário. Sugere-se à prefeitura da cidade de São Paulo que seja realizado um planejamento para uma potencial sobrecarga do sistema funerário (isto é, número de sepultamentos) da cidade de São Paulo com base nos resultados apresentados. Desta forma, nossos resultados reforçam a necessidade de ser adotado planejamento específico para a gestão dos casos extraordinários visualizados no contexto da pandemia. Esta previsão está baseada na análise estrutural da rede de fluxos de vítimas da COVID-19, que indica a concentração de vários locais com alta vulnerabilidade à sobrecarga do sistema. Tais locais concentram a maior quantidade de óbitos (hospitais) ou a maior concentração de sepultamentos (cemitérios ou crematórios) e tem portanto alto potencial de tornarem-se sobrecarregados por receberem muitos corpos devido ao aumento de vítimas da pandemia. Recomenda-se especial atenção à localidades da zona leste de São Paulo, que apresenta os hospitais mais vulneráveis da cidade e abriga cemitérios e crematórios que possuem papel central na rede e/ou encontram-se vulneráveis. Com base em nossa análise de otimização, sugerimos mudanças logísticas no atual fluxo de corpos de hospitais para cemitérios/crematórios de modo a não sobrecarregar o sistema funerário e minimizar os custos de transporte. Neste sentido, nossos resultados são potencialmente úteis ao aperfeiçoamento do planejamento operacional da Prefeitura Municipal de São Paulo, ratificando ou retificando ações em curso no âmbito municipal.

This is the first report of the ‘Observatório COVID191 - Grupo: Redes de Contágio – Laboratório de Estudos de Defesa’ for the South region of Brazil. We have combined data of confirmed cases of the new coronavirus (SARS-CoV-2) for the South available up to 17/04/2020, with structural analyses of road networks, from within and between states, to estimate the vulnerability and potential influence of the South micro-regions to propagate the disease.

Este é o primeiro relatório do Observatório COVID19 - Grupo: Redes de Contágio – Laboratório de Estudos de Defesa para a região Sul do Brasil. Combinamos dados de casos confirmados do novo coronavírus (SARS-CoV-2) para o Sul, disponíveis até o dia 17/04/2020, com análises estruturais da rede de rotas rodoviárias intra e interestaduais para estimarmos a vulnerabilidade e potencial influência das microrregiões sulinas na propagação da doença.

Report from “Observatório COVID19 - Grupo: Redes de Contágio – Laboratório de Estudos de Defesa” for the Northeast Region of Brazil. We combined data on confirmed cases of the new coronavirus (SARS-CoV-2) as reported by public authorities by 02/04 and structural analyses of road transport networks within and between the nine States of Northeast Brazil to predict the potential influence of the 187 micro-regions on the geographic propagation of the pandemic.  

Este é o primeiro relatório do Observatório COVID1920 - Grupo: Redes de Contágio – Laboratório de Estudos de Defesa para a região Nordeste do Brasil. Combinamos dados de casos confirmados do novo coronavírus (SARS-CoV-2) para o Nordeste, conforme disponível até o dia 02/04, com análises estruturais da rede de rotas rodoviárias intra e interestaduais para estimarmos a vulnerabilidade e potencial influência das microrregiões nordestinas na propagação da doença.

RESUMO Parâmetros populacionais são essenciais para compreender a ecologia das espécies, além de auxiliar a avalição do seu status de conservação. Dentre as espécies de cavalo-marinho que ocorrem no Brasil, Hippocampus reidi é a mais abundante, o que expõe suas populações a frequentes ameaças antropogênicas. Entretanto, esta espécie ainda consta como Deficiente em Dados (DD) na lista vermelha da IUCN. Considerando esta falta de informações sobre populações de H. reidi, utilizamos métodos de marcação e recaptura para avaliar como parâmetros de uma população de ambiente subtropical variam ao longo do tempo. Baseado em históricos de captura individuais, combinamos modelos de populações abertas e fechadas para estimar abundância, taxa de sobrevivência, probabilidade de emigração e probabilidade de captura. Ao todo, marcamos 111 indivíduos, em proporção sexual de 1:1, e tamanho médio de 10,5 cm. Esta população relativamente pequena apresentou alta taxa de sobrevivência, baixa probabilidade de emigração temporária e probabilidade de captura e abundância variáveis. A partir dos nossos modelos que consideraram critérios biológicos relevantes, fornecemos estimativas de parâmetros chave que auxiliarão a compreensão da ecologia e da história de vida de cavalos-marinhos. Nossa expectativa é que este método passe a ser amplamente utilizado em outras populações, em um esforço coletivo para avaliar o estado de conservação desta espécie.

ABSTRACT Estimating population parameters is essential for understanding the ecology of species, which ultimately helps to assess their conservation status. The seahorse Hippocampus reidi is directly exposed to anthropogenic threats along the Brazilian coast, but the species still figures as Data Deficient (DD) at IUCN’s Red List. To provide better information on the ecology of this species, we studied how population parameters vary over time in a natural subtropical environment. By combing mark-recapture models for open and closed populations, we estimated abundance, survival rate, emigration probability, and capture probability. We marked 111 individuals, which showed a 1:1 sex ratio, and an average size of 10.5 cm. The population showed high survival rate, low temporary emigration probability and variable capture probability and abundance. Our models considering relevant biological criteria illuminate the relatively poorly known population ecology and life history of seahorses. It is our hope that this study inspires the use of mark-recapture methods in other populations of H. reidi in a collective effort to properly assess their conservation status.

Hábitats artificiais têm se tornado comum em áreas costeiras no mundo todo, podendo influenciar a estrutura e funcionamento de ecossistemas bênticos. Nós analisamos a influência de trapiches nos grupos morfofuncionais bênticos de algas associadas a substrato consolidado e de macrofauna em substrato inconsolidado, no canal da Lagoa da Conceição (sul do Brasil). O principal impacto da presença de trapiches é a redução da irradiação disponível para atividade fotossintética, o que está diretamente relacionado com o decréscimo na biomassa microfitobentônica no sedimento e de macroalga de formas de vida mais complexas. Contrário ao esperado os morfotipos com alto potencial de produtividade de biomassa, como macroalgas calcárias articuladas, corticadas e coriáceas, em geral foram menos abundantes, sendo que macroalgas foliáceas e filamentosas de menor biomassa foram encontradas exclusivamente em áreas controle. Os efeitos do trapiche nos grupos funcionais de epifauna e infauna foram específicos ao ponto de coleta e provavelmente relacionados com redução generalizada de produtores primários e com o novo hábitat criado. A infauna discretamente móvel foi o único grupo funcional capaz de prosperar embaixo dos trapiches, devido à sua mobilidade reduzida e frágil estrutura morfológica, beneficiando-se do abrigo oferecido pelos hábitats artificiais. Nossos resultados mostraram que os trapiches podem ter um efeito negativo sobre os organismos da base da cadeia trófica, responsáveis pelo controle bottom-up.

Artificial habitats have become common in coastal areas worldwide and may influence the structure and functioning of benthic ecosystems. We analyze the influence of piers on the benthic morphofunctional groups of rocky seaweeds and of soft bottom macrofauna in the channel of Conceição Lagoon (southern Brazil). The main impact is a reduction in the luminosity available for photosynthetic activity which is directly related to a decrease in the biomasses of sediment microphytobenthos and of more highly structured macroalgae life-forms. Contrary to expectations, the morphotypes of potentially high biomass productivity, such as articulated coralline, corticated and leathery macroalgae, were in general less abundant and the low biomass foliose and filamentous macroalgae occurred in reference areas but not under the piers. The piers' effects on motile epifauna and infauna functional groups were site-specific and probably related to the general reduction in primary producer organisms in the new habitats. The discretely motile infauna was the only functional group able to thrive under the piers due to their reduced motility and fragile morphological structures, being benefited by the shelter provided by the artificial habitats. Our results showed that the piers might have a negative effect on the base-trophic level organisms responsible for bottom-up controls.

Florestas urbanas são geralmente isoladas e altamente degradadas; contudo são importantes abrigos para espécies de animais tolerantes. Os hábitos alimentares destes animais explicitam os diferentes papéis ecológicos que eles desempenham no hábitat. Nós analisamos a contribuição de Didelphis albiventris Lund (1840) como dispersor de sementes para a regeneração da vegetação de um fragmento florestal urbano. Para isso, descrevemos sua dieta frugívora e testamos a viabilidade das sementes por ele ingeridas. Tanto machos quanto fêmeas de gambá-de-orelha-branca incluiram uma grande variedade de itens alimentares na dieta, principalmente invertebrados e frutos. Frutos foram consumidos durante todo o ano e a sazonalidade não foi observada. A maioria das sementes defecadas era proveniente de plantas pioneiras, comuns em ambientes perturbados, o que concorda com seu hábito oportunista. A viabilidade das sementes ingeridas, verificada mediante modelos de regressão logística linear aplicada a dados de testes de germinação, foi diferente das sementes obtidas de frutos maduros e variou entre espécies, talvez devido a características intrínsecas da planta. Enquanto uma espécie generalista, D. albiventris é capaz de habitar ambientes perturbados, e dispersar as sementes de plantas de estágio inicial de sucessão, onde a vegetação necessita ser restaurada. É essencial que este processo não dependa exclusivamente de frugívoros especialistas, que na maioria das vezes estão ausentes nos fragmentos florestais urbanos. Consequentemente, a presença de espécies generalistas de ambientes secundários tem sua importância enfatizada.

Urban forests are usually isolated and highly disturbed, however they are important shelters for tolerant animal species. Their food habits expose the different ecological roles these animals perform in the habitat. We analyzed the contribution of Didelphis albiventris Lund (1840), as a seed disperser, to the vegetation renewal of an urban forest fragment, describing its frugivorous diet and testing the viability of ingested seeds. Both male and female of white-eared opossum included a vast variety of items in their diet, mainly invertebrates and fruits. Fruits were consumed during all year round and seasonality was not observed. The majority of consumed fruits was from pioneer plant species, which is common in disturbed areas, in accordance to the opossum's opportunistic habits. The viability of ingested seeds, evaluated by linear logistic regression models applied to data from germination tests, was different of the seeds collected directly from ripe fruits; it varied among species, maybe due to the intrinsic characteristics of plant species. As a highly generalist species, D. albiventris can inhabit disturbed environments and then disperse seeds from pioneer plants, where the vegetation must be restored. It is crucial that this process does not depend only on the specialist frugivores, which are frequently absent in urban forest fragments. Therefore, the presence of generalist species of secondary environments has its importance emphasized.