Classicamente, a identificação de cultivares do cafeeiro utiliza descritores morfológicos da semente e da planta em crescimento. O uso de marcadores moleculares, além de permitir uma identificação genética precisa, possibilita a caracterização dos genótipos com menor custo de mão-de-obra e de tempo, pois a descrição é realizada com pequenas quantidades de DNA genômico, extraído em qualquer etapa de crescimento da planta. Este estudo visou a identificação de cultivares/linhagens de Coffea arabica, de interesse comercial para o IAPAR, utilizando-se marcadores do tipo PCR-RAPD. O DNA de sementes moídas de 12 lotes de cultivares e/ou linhagens foi avaliado com cinco primers (Operon OPA 01, OPA 04, OPG 11, OPY 16 e OPX 09) obtidos de uma pré-seleção de 56 primers. Os perfis eletroforéticos mostraram diferenças entre oito cultivares/linhagens e uma baixa heterogeneidade foi detectada dentro de um lote de IAPAR59 e entre dois lotes deste mesmo cultivar.

This study aimed the identification of cultivars and/or lines of Coffea arabica of commercial interest, using PCR-RAPD markers. The DNA of ground seeds lots of 12 cultivars and/or lines were evaluated with five primers (Operon OPA 01, OPA 04, OPG 11, OPY 16, and OPX 09) were obtained from a selection of 56 primers. The electrophoretic profiles allowed distinction among eight cultivars and/or lines as well as heterogeneity between and within lots of IAPAR59.

A diversidade genética de Passiflora spp. tem sido estudada basicamente através de características morfológicas e agronômicas, levando à uma classificação até espécie. A caracterização intraespecífica por meio destes descritores necessita de um ciclo integral de cultivo, e é pouco discriminante. O objetivo deste estudo foi caracterizar a variação genética de uma coleção de Passiflora através da técnica RAPD. Análises moleculares foram realizadas em 70 acessos, envolvendo 11 espécies do gênero Passiflora. A utlização de apenas cinco primers permitiu a obtenção de 136 fragmentos polimórficos. A classificação hierárquica obtida mostrou alto nível de dissimilaridade entre e dentro das espécies. Nítida separação foi obtida entre acessos de P. edulis e da forma flavicarpa, de alto interesse comercial, fracamente diferenciados pelas características morfológicas e agronômicas. A utilização desses marcadores na avaliação dos recursos genéticos de Passiflora, é atrativa para o melhorista e poderá muito auxiliar na identificação dos acessos, pela facilidade, rapidez e pelo baixo custo na condução das avaliações.

The objective of this study was to characterize the genetic diversity within a Passiflora collection by PCR-RAPD markers. Genetic analysis was performed in 70 accessions, representing 11 species of the genus Passiflora. The use of only five primers produced 136 reproducible polymorphic bands. The hierarchical classification showed high levels of dissimilarities between and within the species studied. A clear separation was obtained among species and accessions of P. edulis and P. edulis f. flavicarpa, which were forms of the high commercial value species. The fingerprints produced from the studied genotypes would allow the identification of improved varieties/populations in an easy, fast and inexpensive manner.

Esse estudo descreve a variação genética de 55 acessos de Passiflora spp., constituídos de P. edulis, P. alata, P. coccinea, P. caerulea, P. foetida, P. giberti, P. macrocarpa, P. macrocarpa x alata, P. serrato digitata, P. suberosa e um acesso Passiflora sp. Vinte e dois descritores morfológicos foram avaliados sobre plantas isoladas em sistema de espaldeira e permitiram estruturar a diversidade encontrada. As relações filogenéticas entre os acessos, avaliadas pela análise de componentes principais e de distâncias genéticas, mostraram existir ampla diversidade entre as espécies estudadas. Algumas espécies mostraram caracteres monomórficos. Importante variabilidade foi observada dentro de P. alata e de P. edulis, e pequenas divergências foram encontradas entre os acessos da forma flavicarpa.

The germoplasm evaluated is composed by 55 accessions of P. edulis, P. alata, P. coccinea, P. caerulea, P. foetida, P. giberti, P. macrocarpa, P. macrocarpa x P. alata, P. serrato digitata and P. suberosa; and one Passiflora sp. accession. On isolated plants field cultivated under trellising system, 22 morphological descriptors were studied. The phylogenetic relationships evaluated by the Principal Component Analysis and genetic distances showed a wide genetic diversity among the species studied. Monomorphics characters were showed by some species. Important variability is observed within P. alata and P. edulis and small divergences are found between accessions of the flavicarpa form.

A identificação e caracterização da diversidade genética de plantas por meio de técnicas moleculares envolvem a avaliação de vários indivíduos, necessitando-se, portanto, de métodos rápidos e precisos de extração do DNA. O co-isolamento de polissacarídeos, fenóis e compostos secundários é o principal problema encontrado no isolamento e purificação de DNA vegetal. Folhas das diversas espécies de Passiflora possuem níveis variados desses compostos que podem comprometer este procedimento. O presente estudo foi realizado com o objetivo de avaliar a qualidade e quantidade de DNA de folhas de variedades de Passiflora spp., utilizando-se de três métodos de extração. Os três métodos forneceram DNA em qualidade e quantidade suficientes para a realização da técnica PCR-RAPD.

The identification and characterization of the genetic diversity of plants by molecular techniques involve the evaluation of several individuals, therefore requiring fast and precise extraction methods of DNA. Co-isolation of polysaccharides, phenols and secondary products is the main problem during isolation and purification of plant DNA. The leaves of several species of Passiflora have different levels of those compounds that can compromise this procedure. The objective of this study was to evaluate the quality and amount of DNA extracted from Passiflora spp. varieties using three extraction methods. The three methods supplied DNA in quality and quantity sufficient amount for PCR-RAPD analyses.