Resumo Esta revisão apresenta o contexto atual da produção de trigo no Brasil, as estratégias de manejo para reduzir perdas de rendimento de grãos devido à brusone e as abordagens biotecnológicas para melhorar a resistência do trigo. A brusone do trigo é causada pelo fungo Magnaporthe oryzae patótipo Triticum (MoT) que pode infectar toda a parte aérea da planta. O principal sintoma da doença é o branqueamento das espigas que prejudica a produção de grãos, com perdas que podem chegar a 100% em cultivares suscetíveis. O primeiro relato mundial de brusone em espigas de trigo foi feito no Brasil, em 1985, e a doença atualmente é a principal restrição ao cultivo de trigo nas áreas tropicais e subtropicais dos biomas Cerrado e Mata Atlântica. Por muito tempo, o uso de fungicidas foi considerado ineficaz sob condições de alta pressão de doença. No entanto, trabalhos recentes apontam que a eficácia dos fungicidas depende da integração de outras medidas de controle, principalmente da escolha de cultivares com resistência moderada. Neste artigo de revisão, apresentam-se a alta variabilidade de reação do trigo ao MoT, bem como um painel de cultivares resistentes ou moderadamente resistentes (incluindo não portadoras da translocação 2NS), prontamente disponíveis para cultivo em regiões onde a brusone é endêmica.

Abstract This review paper presents the current context of wheat production in Brazil, the management strategies to reduce yield losses due to blast, and the biotechnological approaches to improve wheat resistance. Wheat blast or brusone is caused by the Magnaporthe oryzae Triticum (MoT) pathotype fungus that can infect all the aboveground parts of the plant. The main symptom of the blast disease is spike bleaching that impairs grain production, causing yield losses up to 100% in susceptible wheat cultivars. The first world report of blast in wheat spikes was in Brazil, in 1985, and, currently, the disease is the main constraint to wheat cultivation in tropical and subtropical areas of the Cerrado and Mata Atlântica biomes. For a long time, the use of fungicides has been found to be ineffective under high-pressure disease conditions. However, recent works have pointed out that fungicide efficiency depends on the integration of other control measures, particularly the choice of cultivars with moderate resistance. In this review paper, the high variability of wheat reaction to MoT is presented, as well as a panel of resistant or moderately resistant cultivars (including non-2NS carriers), promptly available for cultivation in regions where blast is endemic.

The Genosoja consortium is an initiative to integrate different omics research approaches carried out in Brazil. Basically, the aim of the project is to improve the plant by identifying genes involved in responses against stresses that affect domestic production, like drought stress and Asian Rust fungal disease. To do so, the project generated several types of sequence data using different methodologies, most of them sequenced by next generation sequencers. The initial stage of the project is highly dependent on bioinformatics analysis, providing suitable tools and integrated databases. In this work, we describe the main features of the Genosoja web database, including the pipelines to analyze some kinds of data (ESTs, SuperSAGE, microRNAs, subtractive cDNA libraries), as well as web interfaces to access information about soybean gene annotation and expression.

Plants have the ability to recognize and respond to a multitude of pathogens, resulting in a massive reprogramming of the plant to activate defense responses including Resistance (R) and Pathogenesis-Related (PR) genes. Abiotic stresses can also activate PR genes and enhance pathogen resistance, representing valuable genes for breeding purposes. The present work offers an overview of soybean R and PR genes present in the GENOSOJA (Brazilian Soybean Genome Consortium) platform, regarding their structure, abundance, evolution and role in the plantpathogen metabolic pathway, as compared with Medicago and Arabidopsis. Searches revealed 3,065 R candidates (756 in Soybean, 1,142 in Medicago and 1,167 in Arabidopsis), and PR candidates matching to 1,261 sequences (310, 585 and 366 for the three species, respectively). The identified transcripts were also evaluated regarding their expression pattern in 65 libraries, showing prevalence in seeds and developing tissues. Upon consulting the SuperSAGE libraries, 1,072 R and 481 PR tags were identified in association with the different libraries. Multiple alignments were generated for Xa21 and PR-2 genes, allowing inferences about their evolution. The results revealed interesting insights regarding the variability and complexity of defense genes in soybean, as compared with Medicago and Arabidopsis.

Amostras do músculo Pectoralis major foram coletadas e uma RT-PCR foi conduzida para avaliar a sequência do mRNA do αRYR, região compreendida entre os resíduos de aminoácido 386-540, numerado de acordo com a sequência de perus. Os resultados revelaram duas classes de transcritos. O primeiro teve 97% e 74% de identidade com as sequências de αRyR e RyR1 de perus e humanos, respectivamente, e incluiu todos os transcritos com substituições de nucleotídeos. A segunda classe de transcritos foi caracterizada pela deleção de bases que levaram a um stop códon prematuro e a uma proteína truncada não-funcional. Esses resultados são até o momento, o primeiro relato de sequenciamento do αRYR, região hotspot1 de frangos e podem servir como guia para estudos futuros na tentativa de se encontrar uma solução para os problemas na cadeia de produção de frangos relacionados com as carnes PSE (pálida, flácida e exsudativa).

Samples of Pectoralis major m. were collected, and an RT-PCR analysis of the a-Ryanodine receptor (a RYR) from chicken mRNA hotspot region spanning aminoacid residues 386 to 540, numbered according to the turkey sequence, revealed two classes of transcripts. The sequences of the first class were similar to turkey and human with 97% and 74% of identity, respectively, and included all transcripts with substitutions in the nucleotide sequence. The second class was characterized by the deletion of nucleotides, leading to a premature stop codon and coding for a truncated and nonfunctional protein. These results are to date the first report related to the sequencing of the chicken αRYR hotspot region 1, which will possibility serve as a guide for further studies regarding a solution in the poultry production chain related to the problem of pale, soft and exudative (PSE) meat.

Em março de 2006, plantas de soja (Glycine max) doentes foram encontradas em Passo Fundo e em Coxilha, Rio Grande do Sul, Brasil. O quadro sintomatológico caracterizava-se por plantas com folhas secas e de coloração marrom; necrose (cancro) na metade inferior da haste, de coloração marrom-clara a marrom-avermelhada, envolvendo a mesma, seguindo-se murcha e morte da planta. Características culturais em batata dextrose ágar mostraram padrões idênticos àqueles publicados para Diaporthe phaseolorum varcaulivora (Dpc). Os dados de seqüenciamento de DNA do isolado brasileiro CH 40/06 (número de acesso GenBank EU622854) foram comparados às seqüências homólogas de NCBI GenBank, e alta similaridade foi verificada com outros isolados de Dpc. Árvore filogenética foi elaborada a fim de comparar EU622854 com outras seqüências de Dpc, cujo agrupamento foi altamente confirmado pelo teste bootstrap (99%). Características morfológicas foram similares às descritas para Dpc na literatura, embora os ascosporos do espécime brasileiro fossem mais estreitos que o original americanoNa safra 2006/07, Dpc foi também encontrado em outros cinco municípios do RS.

In March 2006, diseased soybean plants (Glycine max) were found in the municipalities of Passo Fundo and Coxilha, state of Rio Grande do Sul, Brazil, showing withered, brown leaves and light to reddish-brown discoloration and necrosis (canker) of the lower half of the stem. Cultural characteristics in potato dextrose agar showed identical patterns to those described for Diaporthe phaseolorum varcaulivora (Dpc). The rDNA-ITS sequence data from the Brazilian strain CH 40/06 (GenBank accession number EU622854) were compared to homologous sequences from the NCBI GenBank database, and a high similarity with Dpc strains was verified. A phylogenetic reconstruction was performed to compare EU622854 with other related sequences and grouped with Dpc. This group was highly supported by the bootstrap test (99%). Morphology of the Brazilian specimen was also similar to that described in the literature for Dpc, but the ascospores were slightly narrower than the American original material of Dpc. In field surveys performed in the 2006/07 crop season, Dpc was also found in five additional municipalities in RS.

Podridão de carvão, causada por Macrophomina phaseolina é uma das mais importantes doenças da soja. Variabilidade genética tem sido observada entre isolados. Entretanto, o efeito de especialização deste fungo, de acordo com a planta hospedeira, não foi ainda relatado. Isolados de soja, milho e girassol foram avaliados, em inoculações cruzadas, quanto à capacidade de formação de microesclerócios em raiz. A maior e menor produção significativa de microesclerócios (P<0.005) foram observadas em raízes de soja (863 microesclerócios/g de raiz) e girassol (578 microesclerócios/g de raiz), respectivamente, independente da origem do isolado. Além disso, estudou-se a variabilidade de isolados do fungo, obtidos de sistemas de rotação de culturas estabelecido há 20 anos utilizando-se RAPD. Oitenta e nove isolados, oriundos de cinco populações foram coletados em amostras de solo de quatro sistemas de rotação e uma amostra de solo virgem. Sete agrupamentos foram observados com 85% de similaridade. As análises indicaram que M. phaseolina é uma espécie com alta variabilidade genética com forte efeito do sistema de rotação. AMOVA foi realizada com os dados de RAPD. Da variabilidade genética total, 21% (P<0.0001) foi explicada pelas diferenças entre populações e, 79% foi explicada por diferenças dentro das populações ( Φst = 0.2110; P<0.0001). A média do coeficiente de diferenciação gênica (G ST) estimada entre as cinco populações foi de 27%, similar aos resultados da AMOVA ( Φst= 0.2110). A diversidade genética total mostrou que as cinco populações têm alto grau de variabilidade (H T =0.3484). Os resultados sugerem que a diferenciação genética de M. phaseolina pode ser alterada pela rotação de culturas.

Charcoal rot, caused by Macrophomina phaseolina, is one of the most important diseases of soybean. Genetic variability among soybean isolates has been observed but the effect of host specialization on genetic variability has not been reported. In this work, isolates from soybean, corn and sunflower were evaluated based on cross inoculations and number of microsclerotia/g of roots. The highest and lowest significant (P<0.005) production of microsclerotia was obtained in soybean (863 microsclerotia/g of roots) and sunflower (578 microsclerotia/g of roots), respectively, regardless of the origin of the isolate. Additionally, the effect of a 20-year crop rotation on genetic variability based on RAPD was studied. Eighty-nine isolates from five populations were obtained from soil samples under four crop rotation systems and an uncropped soil. Seven clusters were obtained considering a similarity level of 85%. Analysis indicated that M. phaseolina is a highly diverse species and also revealed a strong effect of the rotation system on genetic diversity. AMOVA was conducted for the RAPD data. From the total genetic variability, 21% (P<0.0001) could be explained by the differences between populations while 79% could be explained by differences within populations ( Φst = 0.2110; P<0.0001). The mean coefficient of gene differentiation (G ST) estimated among the five populations indicated 27% of differentiation between populations similar to the AMOVA results where Φst= 0.2110. Total gene diversity estimated indicated high levels of variability (H T =0.3484). Results suggest that genetic differentiation of M. phaseolina can be altered by crop rotation.

O oídio da soja, causado por Erysiphe diffusa, foi considerado uma doença de menor importância, desde a sua identificação no Brasil. Entretanto, após o surto na safra de 1996/97, em todas as áreas cultivadas, a doença tornou-se uma ameaça constante para os agricultores, com perdas relatadas de até 25%. A identificação de uma nova espécie (E. glycines) no Japão e a ocorrência em outras espécies de plantas comumente encontradas próximas a campos de soja (Phaseolus vulgaris,Helianthus annuus,Sonchus oleraceus,Hypochaeris brasiliensis e Bidens pilosa) levantou questões em relação à taxonomia dos oídios encontrados nas lavouras. Análises moleculares da região espaçadora interna transcrita (ITS) do rDNA foi utilizada para a identificação molecular das espécies presentes em cada planta hospedeira. Oídios isolados de soja (Glycine max) foram identificados como E. diffusa. Isolados de feijão (P. vulgaris) foram similares a E. diffusa, com 4 nt diferentes, e diferiram de E. poligony em 11 nt. Isolados de H. annuus e S. oleraceus agruparam-se com a espécie Golovinomyces cichoracearum, enquanto isolados de H. brasiliensis e B. pilosa foram similares a Podosphaera fusca e Neoerysiphe cumminsiana, respectivamente. Ao nosso conhecimento esta é a primeira identificação molecular de oídios no Brasil, através da comparação de seqüências de rDNA. Esta também é uma evidência da ocorrência de N. cumminsiana na América.

Soybean powdery mildew (Erysiphe diffusa) was considered a minor disease in Brazil in the decades immediately after its identification. However, since the outbreak in 1996/97 in all cultivated areas the disease has become a constant threat to farmers and losses of up to 25% have been reported. The report of a new species, E. glycines, infecting soybean in Japan, and the occurrence of the disease in other plant species (Phaseolus vulgaris, Helianthus annuus,Sonchus oleraceus,Hypochaeris brasiliensis, and Bidens pilosa) commonly found growing nearby soybean fields, raised questions in relation to the taxonomy of the powdery mildew strains found in or around soybean fields in Brazil. Analysis of the internal transcribed sequence (ITS) of the rDNA was undertaken to ascertain the pathogen species associated to each of the hosts. Powdery mildew strains isolated from Glycine max were identified as E. diffusa. Strains from P. vulgaris were very similar to E. diffusa, with 4 nt differences, and differed from Erysiphe poligony by 11 nt. Strains from H. annuus and S. oleraceus grouped with the species Golovinomyces cichoracearum, while strains from H. brasiliensis and B. pilosa were similar to Podosphaera fusca and Neoerysiphe cumminsiana, respectively. To our knowledge this is the first molecular identification of powdery mildew in Brazil based on rDNA sequence comparison. In addition, this study presented evidence for the occurrence of N. cumminsiana in America.

Drought cause serious yield losses in soybean (Glycine max), roots being the first plant organ to detect the water-stress signals triggering defense mechanisms. We used two drought induction systems to identify genes differentially expressed in the roots of the drought-tolerant soybean cultivar MG/BR46 (Conquista) and characterize their expression levels during water deficit. Soybean plants grown in nutrient solution hydroponically and in sand-pots were submitted to water stress and gene expression analysis was conducted using the differential display (DD) and real time polymerase chain reaction (PCR) techniques. Three differentially expressed mRNA transcripts showed homology to the Antirrhinum majus basic helix-loop-helix transcription factor bHLH, the Arabidopsis thaliana phosphatidylinositol transfer protein PITP and the auxin-independent growth regulator 1 (axi 1). The hydroponic experiments showed that after 100 min outside the nutrient solution photosynthesis completely stopped, stomata closed and leaf temperature rose. Both stress induction treatments produced significant decrease in the mitotic indices of root cells. Axi 1, PITP and bHLH were not only differentially expressed during dehydration in the hydroponics experiments but also during induced drought in the pot experiments. Although, there were differences between the two sets of experiments in the time at which up or down regulation occurred, the expression pattern of all three transcripts was related. Similar gene expression and cytological analysis results occurred in both systems, suggesting that hydroponics could be used to simulate drought detection by roots growing in soil and thus facilitate rapid and easy root sampling.

An understanding of the relationship of geographically different soybean gene pools, based on selectively neutral DNA markers would be useful for the selection of divergent parental cultivars for use in breeding. We assessed the relationships of 194 Chinese, 59 Japanese, and 19 Brazilian soybean cultivars (n = 272) using 12 simple sequence repeat (SSR) markers. Quantification Theory III and clustering analyses showed that the Chinese and Japanese cultivars were genetically quite distant to each other but not independent, while Brazilian cultivars were distantly related to the cultivars from the other two countries and formed a cluster that was distant from the other two gene pool clusters. Our results indicated that the Brazilian soybean gene pool is different from the Chinese and Japanese pool. Exchanges of these gene pools might be useful to increase the genetic variability in soybean breeding.

Cercospora kikuchii está envolvido na desfolha da soja (Glycine max), normalmente em associação com Septoria glycines, no final do ciclo da cultura. Setenta e dois isolados, obtidos principalmente de sementes com mancha púrpura e oriundas de diferentes regiões do Brasil, mostraram variabilidade fenotípica. O teor de cercosporina e a velocidade de crescimento de colônias foram bastante variáveis entre os isolados. Uma forte correlação foi identificada entre o teor de cercosporina e virulência. Diferenças genéticas, entre e dentro da população analisada, foram observadas por RAPD com a análise de 86 loci. As análises de RAPD permitiram agrupar os isolados em sete grupos. Nenhuma relação foi identificada entre os grupos de RAPD e a origem geográfica ou teor de cercosporina. A sequência da região espaçadora do DNA ribossomal (ITS1-5,8S-ITS2) foi determinada em 13 isolados escolhidos nos diferentes agrupamentos. A similaridade das sequências obtidas comparadas às sequências de C. kikuchii depositadas no GenBank (AY266160, AY266262, AY152577 e AF291708) variou de 97 a 100%. Este trabalho demonstrou que os isolados brasileiros de C. kikuchii de diferentes origens são variáveis quanto à virulência, aos padrões de RAPD e ao teor de cercosporina. O teor de cercosporina pode ser um bom parâmetro na escolha de um isolado adequado para seleção de cultivares tolerantes ou resistentes a esse patógeno. Considerando que ele é facilmente transmitido por sementes não é surpresa encontrar os mesmos haplotipos em diferentes regiões. A migração poderia ser favorecida por sementes infetadas como demonstrado na análise de RAPD.

Cercospora kikuchii, involved with the defoliation of soybean (Glycine max) plants, is normally associated with Septoria glycines in late season. Seventy-two isolates from different regions in Brazil, obtained mainly from purple stained seeds, showed phenotypic variation. Cercosporin content and rate of colony growth was higly variable among isolates. A strong correlation between cercosporin content and virulence was identified. Genetic variation among and within populations was evaluated based on 86 RAPD loci. The RAPD analysis clustered all isolates into seven groups. No relationship was observed between RAPD groups and geographic origin or cercosporin content. The sequence of the internal spacer regions (ITS1-5.8S-ITS2) from 13 isolates chosen according to the previous RAPD and clustering analysis showed high similarity (97%-100%) to the GenBank sequences of C. kikuchii (AY266160, AY266161, AY152577 and AF291708). It is clear from this work that Brazilian isolates of C. kikuchii from different geographic regions, are variable in relation to virulence, RAPD profiles and cercosporin content. Cercosporin content could be a good parameter for choosing an adequate isolate for screening resistant or tolerant cultivars. Considering that this pathogen is easily seed-borne, findings are expected to show the same haplotypes in different regions. Migration could be favoured by infected seeds as demonstrated by RAPD analysis.

Buscando automatizar o processo de identificação de cultivares pelo método de eletroforese de proteínas, o presente trabalho teve por objetivo avaliar a viabilidade da utilização de valores de intensidade das bandas como dados adicionais de polimorfismos na discriminação de cultivares e comparar o comportamento de vários coeficientes de similaridade na análise dos eletroforegramas de gliadinas. Os eletroforegramas de gliadinas de quatro cultivares de triticale estreitamente relacionadas foram comparados pela análise computacional utilizando seis coeficientes de similaridade binários (presença/ausência) (Jaccard, Sorensen-Dice, Nei & Li, Simple Matching, Yule e Baroni-Urbani) e cinco quantitativos (Pearson product moment correlation, Spearman, Percent Similarity, Modified Morisita e Gower). As análises quantitativas dos eletroforegramas levaram em conta a intensidade das bandas, disposta em diferentes números de classes, possibilitando avaliar o efeito da variabilidade desse parâmetro. Foram utilizadas cerca de 60 amostras individuais de sementes de cada cultivar. Apesar do baixo polimorfismo intervarietal, os coeficientes médios de similaridade dentro das cultivares sempre foram maiores do que entre cultivares, o que indica o alto poder discriminatório dos testes. O estudo demonstra a viabilidade de identificar cultivares de triticale pela comparação numérica dos dados de eletroforese de gliadinas, obtidos das amostras, com uma biblioteca de eletroforegramas. Esse procedimento garante uma comparação mais objetiva dos eletroforegramas, em relação à análise visual. Foi constatado também, que a intensidade (densidade) das bandas nos eletroforegramas de gliadinas é muito variável, sendo portanto um parâmetro pouco confiável na análise de polimorfismos de gliadinas em triticale. Ainda com relação ao parâmetro intensidade, há uma perda progressiva na confiabilidade dos resultados de comparação com o aumento no número de classes de intensidade.

Aiming the automatization of cultivar identification by protein electrophoresis, the objective of this work was evaluate the feasibility of using band intensity values as polimorphism aditional data on cultivar discrimination and compare different similarity coefficients on the analysis of gliadins electophoregrams data. Electrophoregrams of gliadinas take from four cultivars of triticale closely related were compared by the computer-assisted analysis using six binary (presence/absence) coefficients of similarity (Jaccard, Sorensen-Dice, Nei & Li, Simple Matching, Yule and Baroni-Urbani) and five quantitative coefficients (Pearson product moment correlation, Spearman, Percent Similarity, Modified Morisita and Gower). The intensity of bands used on the quantitative analysis of electrophoregrams was distributed in different number of classes of intensity, making possible to evaluate the effect of variability on this parameter. It was used about 60 single seed samples of each cultivar. In spite of low inter-varietal polymorphism, the coefficient means within of the cultivars was always greater than between cultivars. That clearly shows the high discriminating power of the tests. With this study we demonstrate the viability of identifying triticale cultivars by the numeric comparison of gliadin electrophoresis data with a library of electrophoregrams. It allows a more objective comparison of the electrophoregrams, comparing to visual analysis. We also found a great variability on intensity (density) data of bands. The parameter intensity is therefore not much reliable on gliadins polymorphism analysis in triticale. Hence about the intensity, there is a progressive lost on reliability of the results as increase the number of intensity classes.

O objetivo deste trabalho foi determinar os padrões de eletroforese em gel de poliacrilamida das hordeínas e isoenzimas de cinco cultivares brasileiras de cevada (Hordeum vulgare L.): Embrapa 43, Embrapa 127, Embrapa 128, Embrapa 129 e BR 2, visando a identificação das cultivares. A uniformidade (homogeneidade) desses padrões também foi determinada por meio da análise individual de 90 amostras de sementes de cada cultivar. A maioria das cultivares foi prontamente discriminada pelos eletroforegramas de hordeínas. Três cultivares apresentaram padrões únicos de hordeínas, enquanto as outras duas (Embrapa 128 e BR 2) apresentaram padrões diferentes de esterases (EC 3.1.1.1). As medidas de similaridade calculadas a partir dos dados de hordeínas e esterases conjugados, utilizando o coeficiente de Jaccard, possibilitaram discriminar todas as cultivares e biótipos encontrados. A cultivar Embrapa 43 apresentou dois biótipos bem definidos de hordeínas e esterases. A variação do perfil de hordeínas nessa cultivar foi diretamente relacionada com a variação nos zimogramas de esterase. Essa relação não foi observada em todas as cultivares que apresentaram biótipos. Pode-se constatar que a análise de dados de eletroforese de hordeínas e esterases em conjunto é um método útil para a identificação de cultivares de cevada.

The goal of this study was to determine the polyacrylamide gel electrophoretic patterns (electrophoregrams) of the hordeínas and isozymes from five Brazilian barley cultivars: Embrapa 43, Embrapa 127, Embrapa 128, Embrapa 129 e BR 2. The uniformity (homogeneity) of these patterns also was determined through the 90 single seed samples of each cultivar. Most of the cultivars were readily discriminated by hordein electrophoregrams; five barley cultivars presented four different eletroforegrams of hordeins. Three cultivars gave unique hordein patterns, whereas the two others (Embrapa 128 e BR 2) presented different esterases (EC 3.1.1.1) patterns. Jaccard similarity measures of conjugated data of hordeínas and esterases allowed discrimination of all cultivars and biotypes. The cultivar Embrapa 43 showed two biotypes well defined of hordeins and esterases. The variation of the hodeins pattern on that cultivar have direct relation with the variation on zimograms of esterases. This relation was not found in all cultivars that presented biotypes. It was established that electrophoresis data of hordeins and esterases can be helpful on barley cultivars identification.

Caracteres morfológicos têm sido utilizados tradicionalmente como assinaturas da identidade e pureza varietal e genética. Esses descritores se constituem em uma base pobre, por ser uma medida indireta da composição genética do material. Uma vez que caracteres moleculares revelam diferenças genéticas mais rapidamente, com maior precisão e sem o obscurecimento causado pelo efeito ambiental, oferecem vantagens significantes em termos de discriminação, confiabilidade, rapidez e custo reduzido. Um método molecular relativamente novo, DNA polimórfico amplificado ao acaso (RAPD), baseado na reação em cadeia da polimerase (PCR), tem sido adotado por alguns pesquisadores envolvidos no desenvolvimento de métodos de identificação de cultivares principalmente por ser uma técnica simples que não requer nenhuma informação prévia sobre seqüências de nucleotídeos do genoma da espécie, além de ser bastante acessível e de custo relativamente baixo. Mas, infelizmente, a análise de RAPD apresenta sérios problemas, principalmente em relação à reprodutibilidade e caracterização da homologia dos produtos. Se esses problemas podem ser efetivamente resolvidos então a análise de RAPD pode se tornar um método eficiente e aplicável, mas talvez o investimento em tempo e dinheiro seja mais útil no desenvolvimento e adaptação de técnicas mais promissoras. Há um grande volume de publicações sobre a técnica de RAPD na literatura, todas evidenciando o mesmo problema: a variabilidade inerente aos produtos de amplificações com primers decâmeros limita a sua utilização na indústria e em programas de certificação. O objetivo deste trabalho foi discorrer sobre a eficiência da técnica de RAPD na identificação de cultivares, ressaltando as suas vantagens e limitações.

Morphological characters have traditionally been used as signatures of varietal identity and purity. Because provide an indirect means of assessing genetic composition, those characters provide a poor base for measures of genetic identities. However, molecular characters that more quickly and accurately reveal genetic differences without the obscurance of environment provide significant advantages in discrimination, reliability, timeliness and reduced cost. A relatively new molecular method, Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD), that are based on Polymerase Chain Reaction (PCR), whose simplicity, low cost, accessibility and no require of previous information about nucleotide sequence of genome from the species have encouraged the application by researchers involved in the development of methods for cultivar identification. Unfortunately, the RAPD analysis presents serious problems on reproducibility and homology knowledge of products. If these problems can be effectively overcome then RAPD analysis may become an effective and applicable method, but perhaps the investment in time and money be more useful on the development and adaptation of more promissory techniques. There is considerable work in the literature on this method. All suffer from say the same problem. The inherent variability of the product from amplifications whit decamer primers limits its utility to industry and certification programs. The objective of this work was discuss about the RAPD analysis efficiency on cultivar identification, showing the vantages and limitations of the technique.