Abstract Antimicrobial resistance is a threat to the achievements of modern medicine and one of the most effective measures to counteract it is antimicrobial use optimization programs (AMS), in which the microbiology laboratory is one of the main components. The effective application of information technology in the processes is fundamental, but there is little information in Latin America on the development and articulation of technological tools to support AMSs. This consensus makes recommendations on the management of microbiological data for decision making. In Part I, recommendations on the use of a computerized microbiological data management system in clinical practice, data and reporting requirements in the microbiology laboratory, as well as the contents of the advanced quality management system in the laboratory are presented. In Part II, the information requirements for AMS management in intermediate, initial, and advanced stages by the laboratory and pharmacy are discussed; as well as the integration of the AMS team with the Infection Prevention and Control Committee and the information for AMS management at the management level.

Resumen La resistencia antimicrobiana es una amenaza para los logros de la medicina moderna y una de las medidas más efectivas para contrarrestarla son los programas de optimización del uso de antimicrobianos (PROA), en el cual el laboratorio de microbiología es uno de los principales componentes. La aplicación efectiva de tecnología de la información en los procesos es fundamental, pero existe poca información en Latinoamérica sobre el desarrollo y la articulación de las herramientas tecnológicas para apoyar los PROA. Este consenso hace recomendaciones sobre la gestión de los datos microbiológicos para la toma de decisiones. En la Parte I, se presentan las recomendaciones en cuanto al uso de un sistema informatizado de gestión de datos microbiológicos en la práctica clínica, los requerimientos de datos y de reporte en el laboratorio de microbiología, y los contenidos del sistema de gestión de calidad avanzado en el laboratorio. En la Parte II, se discuten los requerimientos de información para la gestión de PROA en estadios intermedios, iniciales y avanzados por el laboratorio y la farmacia; así como la integración del equipo de PROA con el Comité de Prevención y Control de Infecciones y la información para la gestión de PROA a nivel gerencial.

Abstract Antimicrobial resistance is a threat to the achievements of modern medicine and one of the most effective measures to counteract it is antimicrobial use optimization programs (AMS), in which the microbiology laboratory is one of the main components. The effective application of information technology in the processes is fundamental, but there is little information in Latin America on the development and articulation of technological tools to support AMSs. This consensus makes recommendations on the management of microbiological data for decision making. In the first part, recommendations on the use of a computerized microbiological data management system in clinical practice, data, and reporting requirements in the microbiology laboratory, as well as the contents of the advanced quality management system in the laboratory are presented. In the second part, the information requirements for AMS management in intermediate, initial, and advanced stages by the laboratory and pharmacy are discussed; as well as the integration of the AMS team with the Infection Prevention and Control Committee and the information for AMS management at the management level.

Resumen La resistencia antimicrobiana es una amenaza para los logros de la medicina moderna y una de las medidas más efectivas para contrarrestarla son los programas de optimización del uso de antimicrobianos (PROA), en los cuales el laboratorio de microbiología es uno de los principales componentes. La aplicación efectiva de tecnología de la información en los procesos es fundamental, pero existe poca información en Latinoamérica sobre el desarrollo y la articulación de las herramientas tecnológicas para apoyar los PROA. Este consenso, hace recomendaciones sobre la gestión de los datos microbiológicos para la toma de decisiones. En la Parte I, se presentan las recomendaciones en cuanto al uso de un sistema informatizado de gestión de datos microbiológicos en la práctica clínica, los requerimientos de datos y de reporte en el laboratorio de microbiología, así como y los contenidos del sistema de gestión de calidad avanzado en el laboratorio. En la Parte II, se discuten los requerimientos de información para la gestión de PROA en estadios intermedios, iniciales y avanzados por el laboratorio y la farmacia; así como la integración del equipo de PROA con el Comité de Prevención y Control de Infecciones y la información para la gestión de PROA a nivel gerencial.

Resumen La infección del tracto urinario (ITU) es una de las infecciones bacterianas más frecuentes en la infancia. Un adecuado diagnóstico es esencial para poder realizar un tratamiento racional, eficiente y eficaz; sin embargo, existe gran heterogeneidad en los métodos diagnósticos, específicamente en el estudio de la susceptibilidad antimicrobiana. El objetivo de estas recomendaciones es entregar herramientas para uniformar los criterios diagnósticos, el estudio de susceptibilidad bacteriana in vitro y el tratamiento antimicrobiano de la ITU en la población pediátrica, con un enfoque de uso racional de los antimicrobianos. En la primera parte, se presentaron las recomendaciones en cuanto a cómo obtener una adecuada muestra de orina, el diagnóstico de laboratorio incluyendo puntos de corte-unidades formadoras de colonias/mL de orina-, además de consideraciones microbiológicas como estudio de susceptibilidad y finalmente, el manejo de la ITU en pediatría. En esta segunda parte se detalla el tratamiento antimicrobiano de sus complicaciones, el manejo de ITU en situaciones especiales y consideraciones farmacocinéticas y farmacodinámicas de los antimicrobianos a indicar en ITU.

Abstract The urinary tract infection (UTI) is one of the most common bacterial infections in childhood. An adequate diagnosis is essential to be able to carry out a rational, efficient and effective treatment, however, there is great heterogeneity in diagnostic methods, specifically in the study of antimicrobial susceptibility. The aim of these recommendations is to provide tools to homogenize the diagnosis criteria, susceptibility study and antimicrobial treatment of urinary tract infection in the pediatric population, with a rational use of antibiotics approach. In the first part, the recommendations regarding diagnosis were presented, such as sampling and cut-off points, as well as microbiological considerations for susceptibility study and management of UTI in pediatrics. This second part details the management of complications, UTI in special situations, and pharmacokinetic and pharmacodynamic considerations of antimicrobials to be prescribed in UTI.

Resumen La infección del tracto urinario (ITU) es una de las infecciones bacterianas más frecuentes en la infancia. Un adecuado diagnóstico es esencial para poder realizar un tratamiento racional, eficiente y eficaz; sin embargo, existe gran heterogeneidad en los métodos diagnósticos, específicamente en el estudio de la susceptibilidad antimicrobiana. El objetivo de estas recomendaciones es entregar herramientas para uniformar los criterios diagnósticos, el estudio de susceptibilidad bacteriana in vitro y el tratamiento antimicrobiano de la ITU en la población pediátrica, con un enfoque de uso racional de los antimicrobianos. En esta primera parte, se presentan las recomendaciones en cuanto a cómo obtener una adecuada muestra de orina, el diagnóstico de laboratorio incluyendo puntos de corte –unidades formadoras de colonias/mL de orina–, además de consideraciones microbiológicas para el estudio de susceptibilidad y finalmente, el manejo de la ITU en pediatría. En la segunda parte se detalla el tratamiento antimicrobiano de sus complicaciones, el manejo de ITU en situaciones especiales y consideraciones farmacocinéticas y farmacodinámicas de los antimicrobianos a indicar en ITU.

Abstract The urinary tract infection (UTI) is one of the most common bacterial infections in childhood. An adequate diagnosis is essential to be able to carry out a rational, efficient and effective treatment, however, there great heterogeneity in diagnostic methods, specifically in the study of antimicrobial susceptibility. The aim of these recommendations is to provide tools to homogenize the diagnosis criteria, susceptibility study and antimicrobial treatment of urinary tract infection in the pediatric population, with a rational use of antibiotics approach. In the first part, the recommendations regarding diagnosis are presented, such as sampling and cut-off points, as well as microbiological considerations for susceptibility study and management of UTI in pediatrics. The second part details the management of complications, UTI in special situations, and pharmacokinetic and pharmacodynamic considerations of antimicrobials to be prescribed in UTI.

Abstract Staphylococcus aureus colonizes the nasopharynx in one third of healthy individuals and is also responsible for several infections in pediatrics such as endocarditis, pneumonia and osteoarticular infections. It has several virulence mechanisms, such as Panton Valentine leukocidin (PVL), which is an exotoxin that causes cell death. It is commonly related to methicillin-resistant Staphylococcus aureus (MRSA) and more serious pulmonary and musculoskeletal infections. However, PVL is not exclusive to MRSA. Two clinical cases of patients with infection by methicillin-sensitive Staphylococcus aureus producing this exotoxin are presented.

Resumen Staphylococcus aureus coloniza la nasofaringe en un tercio de los individuos sanos y además es causante de infecciones graves en pediatría, como endocarditis, neumonía e infecciones osteoarticulares. Posee varios mecanismos de virulencia, siendo la leucocidina de Panton Valentine (LPV) uno de ellos, una exotoxina que causa muerte celular. Su producción está comúnmente relacionada con Staphylococcus aureus resistente a meticilina (SARM) e infecciones pulmonares y musculo-esqueléticas graves. Sin embargo, la producción de LPV no es exclusiva de SARM. Se presentan dos casos clínicos de pacientes con infección por Staphylococcus aureus sensible a meticilina productora de esta exotoxina.

Introduction: Enterobacteriaceae are a group of gram-negative rods that can cause serious infections in humans. A susceptibility in Klebsiella pneumoniae of 79.4% to piperacillin/tazobactam (PIP/TAZO) is reported in pediatric hospitals in Chile. There is no published data published to date regarding PIP/TAZO susceptibility to other Enterobacteriaceae species in this population. Aim: To measure the in vitro PIP/TAZO susceptibility in Enterobacteriaceae isolates from patients in a pediatric hospital in Chile. Methods: Descriptive and prospective study of Enterobacteriaceae positive cultures from patients assisting to the “Hospital de niños Roberto del Río” (HRRIO) between January 2013 and August 2014. PIP/TAZO susceptibility was established by gradient diffusion method (E-test®) according to the 2014 CLSI standards. Results: 163 cases were included. The average age was 4 years and 15 days. 70.6% were female. 79.7% of samples were urine cultures. PIP/TAZO susceptibility in Enterobacteriaceae was 95.1% (n = 155). The intermediate susceptibility was 1.8% (n = 3). Discussion: The isolates studied present high susceptibility to PIP/TAZO. This finding could be explained by the fact that this population has not been exposed to this antimicrobial therapy and also the low rates for ESBL in pediatric infections.

Resumen Introducción: Las enterobacterias son bacilos gram-negativos responsables de infecciones graves en el ser humano. Se reporta una susceptibilidad en Klebsiella pneumoniae de 79,4% a piperacilina/tazobactam (PIP/TAZO) en hospitales pediátricos de Chile, pero según nuestro conocimiento, no existen datos publicados a la fecha respecto a la susceptibilidad de otras enterobacterias a PIP/TAZO en la población pediátrica chilena. Objetivo: Determinar la susceptibilidad in vitro a PIP/TAZO en cepas obtenidas de infecciones por Enterobacteriaceae en un hospital pediátrico de Chile. Material y Método: Estudio descriptivo y prospectivo de cepas de Enterobacteriaceae en Hospital de Niños Roberto del Río (HRRIO) entre 1 de enero de 2013 y el 27 de agosto de 2014. Se definió la susceptibilidad a PIP/TAZO por método de gradiente (E-test®) según puntos de corte CLSI 2014. Resultados: Se incluyeron 163 casos. El promedio de edad fue de 4 años 15 días. 70,6% de sexo femenino. El 79,7% de las cepas fueron aisladas en urocultivos. La susceptibilidad de Enterobacteriaceae a PIP/TAZO fue 95,1% (n = 155). La susceptibilidad intermedia fue 1,8% (n = 3). Discusión: Los aislados estudiados presentan alta susceptibilidad a PIP/TAZO. Este hallazgo puede explicarse por la baja circulación de microrganismos productores de BLEE y el limitado uso de PIP/TAZO en esta población pediátrica.

Abstract We report the first description of a rare catalase-negative strain of Staphylococcus aureus in Chile. This new variant was isolated from blood and synovial tissue samples of a pediatric patient. Sequencing analysis revealed that this catalase-negative strain is related to ST10 strain, which has earlier been described in relation to S. aureus carriers. Interestingly, sequence analysis of the catalase gene katA revealed presence of a novel nonsense mutation that causes premature translational truncation of the C-terminus of the enzyme leading to a loss of 222 amino acids. Our study suggests that loss of catalase activity in this rare catalase-negative Chilean strain is due to this novel nonsense mutation in the katA gene, which truncates the enzyme to just 283 amino acids.

Postsurgical aspergillosis occurs primarily in immunocompetent patients whose main predisposing factor is the loss of skin and mucosal integrity during surgery. Local infection tends to be destructive and refractory to treatment and relapses are common. It is important to consider aspergillosis in the differential diagnosis of slowly progressive and destructive surgical site infections with negative bacterial cultures. We present the case of a child who developed Aspergillus fumigatus mediastinitis months after heart surgery.

Background: The isolation of vancomycin-resistant Enterococcus spp (ERV) has increased significantly within the last few years, along with the risk of infection and dissemination of these bacteria. Our aim was to determine risk factors (RF) for intestinal colonization in hospitalized pediatric patients with oncological disease at Hospital de Niños Roberto del Río. Methods: Between January 2012 and December 2013 a transversal study was performed with 107 rectal swabs and processed with a PCR for ERV. The patients were classified as "colonized with ERV" and "not colonized with ERV" and we evaluated possible RF for intestinal colonization in both groups. Results: VRE colonization was found in 51 patients (52%). The median of time elapsed between oncological diagnosis and VRE colonization was 35 days. The significant RF associated with VRE colonization were days of hospitalization prior to study, neutropenia and treatment with antibiotics within 30 days prior to study and mucositis. Conclusions: According to the RF revealed in this study we may suggest prevention standards to avoid ERV colonization. This is the first investigation in our country in hospitalized pediatric patients with oncological disease and processed with a multiplex PCR for ERV, therefore it is a great contribution about this subject in Chile.

Introducción: El aislamiento de Enterococcus spp resistentes a vancomicina (ERV) ha presentado un incremento significativo en los últimos años, aumentando el riesgo de infección por esta bacteria y favoreciendo su diseminación. Nuestro objetivo es determinar los factores de riesgo (FR) de colonización intestinal de ERV en pacientes oncológicos internados en el Hospital de Niños Roberto del Río. Método: Entre enero de 2012 y diciembre de 2013 se realizó un estudio transversal de colonización rectal por ERV mediante muestras de hisopado rectal obtenidas en 107 pacientes efectuando RPC múltiple para ERV. Se dividió en grupo "portador" y "no portador" y se evaluó los posibles FR para colonización por ERV. Resultados: Se encontró colonización por ERV en 51 pacientes (52%). El tiempo transcurrido desde el diagnóstico oncológico y la colonización presentó una mediana de 35 días. Los FR encontrados con asociación significativa fueron el número de días de hospitalización previa, neutropenia, uso de antimicrobianos 30 días previos y mucositis. Conclusión: De acuerdo a los FR encontrados podemos sugerir medidas de prevención para colonización por ERV. Esta es la primera investigación realizada en nuestro país en pacientes oncológicos pediátricos y que utiliza la técnica de RPC múltiple para ERV, lo que permite un aporte significativo sobre este tema en Chile.

Staphylococcus aureus is a known pathogen in pediatric patients that produces skin infections, cutaneous abscess, cellulitis and osteoarticular infections. Most of these infections are produced by a meticilin susceptible strain. The community associated methicillin resistant Staphylococcus aureus was published for the first time in 1993, ever since then is has been recognized as a cosmopolite pathogen. The first report in Latin America was published in 2003, and in Chile in 2008 from adult patients that have reported traveling to other countries. The following series describes four pediatric cases, all school-aged children, diagnosed since 2012 with clinical followups and molecular studies. Two cases presented as osteomyelitis of the lower extremity; and one presented as arm cellulitis. These three cases had Panton Valentine leukocidine (PV-L) negative strains from the clone complex 8. The last case presented a renal abscess, the strain was PV-L positive from the clone complex 30. This case series constitutes the first pediatric case report in Chile.

Staphylococcus aureus es un patógeno conocido como causa de infecciones de piel, tejidos blandos, osteoarticulares y celulitis en niños. Estas infecciones son principalmente causadas por cepas sensibles a meticilina. Staphylococcus aureus resistente a meticilina asociado a la comunidad fue publicado por primera vez en población australiana nativa en 1993 y desde entonces se ha transformado en un patógeno cosmopolita. En Latinoamérica se publicó el primer caso en 2003 y en Chile se comunicaron los primeros casos en 2008, casi todos adultos y con antecedentes de viaje al extranjero. Nuestra serie describe cuatro casos clínicos en niños escolares, pesquisados desde el 2012 con seguimiento clínico y estudio molecular. Dos casos se presentaron como una osteomielitis de extremidad inferior y uno como una celulitis de brazo. Los tres primeros casos correspondieron a cepas leucocidina Panton Valentine (PV-L) negativa, del complejo clonal 8. El último caso fue un absceso renal, cepa PV-L positiva, perteneciente al complejo clonal 30. Esta serie es el primer reporte de casos pediátricos en Chile.

Background: Shigella sonnei gastroenteritis improves clinically and microbiologically with antibacterial treatment; however choosing a useful drug is a universal challenge because of in vitro susceptibility of S. sonnei frequently evolves to be resistant. Objective: To evaluate in vitro susceptibility of S. sonnei strains isolated from patients attending at the Chilean Región Metropolitana and to know the evolution that resistant patterns of S. sonnei have experienced. Material: In this study, the antimicrobial susceptibility profile of 277 isolates of Shigella sonnei was compared. The analyzed periods of time were: period I (1995-1997) 85 strains; period II (2004-2006) 92 strains and period III (2008-2009) 100 strains, in Santiago, Chile. The method performed to analyze susceptibility patterns was the disc diffusion (Kirby-Bauer). Results: The strains showed rates of resistance to ampicillin: period I, 85.8%; period II, 53.3%; period III, 100%, trimethoprim/sulfamethoxazole: period I, 50.5%; period, II 46.7%; period III, 100%, chloramphenicol: period I, 36.4%; period II, 12%; period III, 100% and tetracycline: period I, 38.8%; period II, 30.4%; period III, 100%. 98.9% of the strains showed susceptibility to quinolones. Significant differences were observed in patterns of antimicrobial resistance for both individuals and for multidrug resistance (≥ 3 antimicrobials) in the three periods (p < 0.001, χ2 test). Of all resistant strains, 17% were resistant to 1 or 2 antibiotics, while 65.7% showed a pattern of multidrug resistance; 100% of the period III strains presented multidrug resistance. Conclusion: These results showed the temporal resistance dynamics of S. sonnei circulating strains in the Chilean Región Metropolitana. Due to the endemic behavior of shigellosis in Chile, it is urgent to maintain permanent surveillance of antimicrobial resistance profiles to improve both prevention and treatment of shigellosis.

Introducción: La infección entérica producida por Shigella sonnei mejora clínicamente y microbiológicamente con antibioterapia; sin embargo, la elección del antimicrobiano es un problema universal pues la susceptibilidad in vitro de S. sonnei evoluciona frecuentemente hacia la resistencia. Objetivo: Evaluar la susceptibilidad in vitro a antimicrobianos de S. sonnei y conocer la evolución que han experimentado los patrones de resistencia de cepas aisladas de cuadros clínicos en pacientes de la Región Metropolitana, Chile. Material y Métodos: Se comparó el perfil de susceptibilidad a antimicrobianos, de 277 cepas clínicas de S. sonnei aisladas durante tres períodos: período I (1995-1997) 85 cepas; período II (2004-2006) 92 cepas y período III (2008-2009) 100 cepas, en Santiago, Chile. El perfil de susceptibilidad a antimicrobianos se determinó mediante test de difusión en agar. Resultados: Las tasas de resistencia de las cepas en los periodos I, II y III respectivamente fueron: ampicilina: 85,8%; 53,3%; 100%, cotrimoxazol: 50,5%; 46,7%; 100%, cloranfenicol: 36,4%; 12%; 100% y tetraciclina: 38,8%; 30,4%; 100%. El 98,9% de las cepas fue susceptible a quinolonas. Se observó diferencias significativas en los porcentajes de resistencia para antimicrobianos individuales y multi-resistencia (≥ 3 antimicrobianos) en los tres períodos (p < 0,001; Test de χ2). De las cepas resistentes, 17% presentó resistencia a uno ó dos antimicrobianos, 65,7% mostró multi-resistencia antimicrobiana. El 100% de las cepas del período III presentó multi-resistencia. Discusión: Estos resultados evidencian la dinámica temporal de la resistencia en cepas de S. sonnei circulantes en la Región Metropolitana. Dado que en Chile la shigelosis tiene un carácter endémico, es prioritario mantener una vigilancia constante de los perfiles de resistencia a antimicrobianos, para mejorar la prevención y el tratamiento de la shigelosis.

The use of intensive chemotherapy has improved survival of children with cancer. However, this is associated to severe and maintained neutropenia, increasing risks of severe infections like bacteremia. Aim: To update information on microorganisms involved in bloodstream infections in cancer patients and their antimicrobial resistance patterns during the last 3 years in our hospital, comparing it with our previous experience and with other Chilean centres. Material and Methods: Analysis of positive blood cultures belonging to cancer patients during 2006-2008 registered in the Microbiology Lab at the Roberto Del Rio Children's Hospital. Results: In 52 patients, 96 blood cultures yielded bacteria: 59.4% gram positive cocci and 34.4%, gram negative rods. Coagulase negative Staphylococci (CNS) were the most frequent bacteria isolated and enterobacteria were in the second place. Susceptibility to cloxacillin was 11% in CNS and 70 % in Staphylococcus aureus isolates. Enterobacteria maintained susceptibility to third generation cephalosporins and aminoglycosides. Conclusion: Despite the low sensitivity of CNS to cloxacillin, the empirical antibiotic treatment in our unit must include cloxacillin because of the high susceptibility of S. aureus. Switching to vancomycin should be considered only if SCN is isolated or there is an unfavorable evolution.

El uso de quimioterapia más intensiva ha mejorado la sobrevida de los niños con cáncer. Sin embargo, esto se asocia a neutropenia intensa y mantenida, aumentando el riesgo de infecciones graves como bacteriemias. Objetivo: Actualizar la información sobre los microorganismos implicados en las infecciones del torrente circulatorio en pacientes oncológicos atendidos en nuestro hospital, comparar con la literatura médica y describir el patrón de resistencia antimicrobiana. Material y Métodos: Se revisaron los registros de hemocultivos del Laboratorio de Microbiología del Hospital de Niños Roberto Del Río entre los años 2006 y 2008, seleccionando aquellos con resultado positivo y que pertenecieran a pacientes con cáncer. Resultados: En 52 pacientes, 96 hemocultivos resultaron positivos: cocáceas grampositivas 59,4% (Staphylococcus coagulasa negativa-SCN fue el más frecuente); bacilos gramnegativos 34,4%, predominando las enterobacterias, en segundo lugar. Se observó en SCN una susceptibilidad a cloxacilina de 11% y en Staphylo-coccus aureus de 70%. Las enterobacterias mantuvieron una susceptibilidad estable para cefalosporinas de tercera generación y aminoglucósidos. Conclusión: A pesar de la baja susceptibilidad de SCN a cloxacilina, el tratamiento antimicrobiano empírico de primera línea en nuestra unidad debe incluir cloxacilina dada la alta susceptibilidad de S. aureus, y el cambio a vancomicina debería plantearse frente al aislamiento de SCN o evolución desfavorable.