Abstract Researchers have been utilizing matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) to identify bacteria and fungi directly from isolates obtained on culture plates; the resulting mass spectrum is then compared with spectra stored in the instrument software. Hence, a fast analytical response is obtained, and the more spectra are known to compare, the safer and more reliable the interpretation of the method will be. Thus, this study sought to identify the diversity of strains found in 10 samples of artisan cheese produced and commercialized in Vale do Taquari (Rio Grande do Sul State, Brazil) using MALDI-TOF MS. From the analyzed cheese, 22 strains were identified at the species level; one sample presented the pathogen Staphylococcus aureus, two showed the presence of lactic acid bacteria (Lactococcus lactis), and the vast majority (68.18%) of strains were composed of species of the Enterobacteriaceae family, with the prevalence of the genera Escherichia, Enterobacter, and Klebsiella. Escherichia coli was present in 50% of the samples analyzed. This demonstrates the need for greater control during all stages of artisanal cheese production and evaluation of the raw material, including safe practices during milking, so that the product meets the identity and quality parameters suitable for human consumption.

Resumo MALDI-TOF MS vendo sendo utilizado em laboratórios para identificar bactérias e fungos diretamente de isolados obtidos em placas de cultura. O espectro de massa resultante é então comparado com espectros armazenados no software do equipamento. Assim, obtém-se uma resposta analítica rápida, sendo que, quanto mais espectros forem conhecidos para comparar, mais seguro e confiável será a interpretação do método. Desta maneira, o presente trabalho teve por objetivo, identificar por MALDI-TOF MS, a diversidade de cepas encontrados em 10 amostras de queijos artesanais produzidos e comercializados no Vale do Taquari, Rio Grande do Sul, Brasil. Dos queijos analisados, 22 cepas foram identificadas a nível de espécie, sendo uma (1) amostra apresentou o patógeno Staphylococcus aureus, duas a presença da bactéria ácido láctica (Lactococcus lactis) e a grande maioria (68,18%) das cepas era composta por espécies da família Enterobacteriaceae, com prevalência dos gêneros Escherichia, Enterobacter e Klebsiella. E. coli estava presente em 50% das amostras analisadas. Isso demonstra a necessidade de um maior controle durante todas as etapas de produção do queijo artesanal, bem como a avaliação da matéria-prima, incluindo práticas seguras durante a ordenha para que o produto atenda aos parâmetros de identidade e qualidade, sendo apto ao consumo humano.

RESUMEN La colonización fecal en lactantes por bacterias resistentes a los antimicrobianos es un potencial riesgo para futuras terapias antibióticas. Nuestro objetivo fue determinar la frecuencia y características sociodemográficas de lactantes portadores fecales de enterobacterias resistentes a ciprofloxacina (PFRC) y sus genes de resistencia asociados. Analizamos muestras fecales de 41 niños lactantes residentes en el distrito de Talara-Piura, Perú, en 2019. Evaluamos la presencia de 3 genes de resistencia a quinolonas: aac(6’)-Ib-cr, qnrB y oqxA y 2 de betalactamasas: bla CTX-M, bla PER-2.El 68% de lactantes fueron PFRC, Escherichia coli (83,3%) fue el más frecuente. El análisis genotípico detectó: oqxA (41,1%), qnrB (26,7%) y aac(6’)-Ib-cr (20%) y al gen bla CTX-M en el 93,3% de los aislados con betalactamasas. La elevada frecuencia de PFRC nos alertan sobre el potencial riesgo en la pérdida de utilidad de esta familia antibiótica en el área de estudio.

ABSTRACT Fecal colonization by antimicrobial-resistant bacteria in infants is a potential risk for future antibiotic therapy. We aimed to determine the sociodemographic characteristics and frequency of infants who were fecal carriers of ciprofloxacin-resistant enterobacteriaceae (FCCRE) and their associated resistance genes. We analyzed fecal samples from 41 infants from the district of Talara, Piura, Peru in 2019. The presence of 3 quinolone resistance genes was evaluated: aac(6’)-Ib-cr, qnrB and oqxA as well as of 2 beta-lactamase genes: bla CTX-M,bla PER-2. We found that 68% of infants were FCCRE, Escherichia coli (83.3%) was the most frequent bacteria. The genotypic analysis detected: oqxA (41.1%), qnrB (26.7%), aac(6’)-Ib-cr (20%) and the bla CTX-M gene (93.3%) of the isolates with beta-lactamases. The high frequency of FCCRE alerts us of the potential risk of this antibiotic family becoming less useful over time.

Resumo Estudos microbiológicos da sanidade de psitacídeos que serão reintroduzidos são importantes para avaliar se esses animais atuam como portadores de agentes patogênicos para outros animais e humanos. A espectrometria de massa por ionização/dessorção de matriz assistida por laser/tempo de vôo (MALDI-TOF MS) é um método mais rápido e preciso para identificar bactérias na comparação com métodos convencionais de microbiologia. O objetivo deste estudo foi avaliar o estado de saúde de psitacídeos cativos, identificando bactérias Gram-negativas da microbiota fecal por MALDI -TOF MS. Os resultados indicaram alta frequência de bactérias Gram-negativas nas fezes (96,5%), principalmente da família Enterobacteriaceae (88,7%). As mais prevalentes foram Escherichia coli (39,0%), Proteus vulgaris (12,2%), Klebsiella spp. (12,1%) e Raoultella ornithinolytica (8,7%). Proteus hauseri, Citrobacter spp., Morganella morgannii, Providencia rettgeri, Enterobacter spp. e Escherichia hermannii foram isolados com menor frequência. Todos esses agentes são potencialmente patogênicos para os papagaios e podem causar infecções sistêmicas em outros animais e seres humanos. Esses achados reforçam que o MALDI- TOF MS é um método rápido e preciso de identificação do microrganismo e avaliação do estado de saúde dos psitacídeos, fornecendo dados relevantes para auxiliar na tomada de decisões sobre os protocolos sanitários em centros de triagem de animais selvagens e sobre a possibilidade de reintrodução futura.

Abstract Microbiological studies of the sanitary and health status of psittacine birds that will be reintroduced is important in evaluating whether these animals act as carriers of pathogenic agents to other animals and humans. Matrix-assisted laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF MS) is a faster and more accurate method to identify bacteria than conventional microbiology methods. The aim of this study was to evaluate the health status of psittacines housed in captivity, by assessment of Gram-negative bacteria from fecal microbiota through MALDI- TOF MS identification. The results indicate high frequency of Gram-negative bacteria in feces (96.5%), especially from the Enterobacteriaceae family (88.7%). The most prevalent bacteria were Escherichia coli (39.0%), Proteus vulgaris (12.2%), Klebsiella spp. (12.1%) and Raoultella ornithinolytica (8.7%). Proteus hauseri, Citrobacter spp., Morganella morgannii, Providencia rettgeri, Enterobacter spp. and Escherichia hermannii were isolated with lower frequency. . All these agents are potentially pathogenic for parrots and can cause systemic infections in other animals and humans. These findings reinforce that MALDI- TOF MS proved to be a rapid and accurate method of identification of the microorganism and evaluation of the health status of psittacines, providing relevant data to assist decision-making regarding the sanitary protocols in wildlife centers, and possible future reintroduction of wild birds.

ABSTRACT Background: Antibiotic resistance is considered to be the next worldwide epidemic. Urinary tract infections (UTI) are the second most common cause of infection, which also has the highest resistance frequency. Nevertheless, in high Andean regions, little is known about the antibiotic resistance. Objectives: Determine the antimicrobial resistance patterns of the enterobacteriaceae family isolated from urinary tract infections of a Peruvian Andean region. Methods: A retrospective cross-sectional review of 1717 records from the microbiology service of a private health institution from Puno - Peru, was done between the years 2014 and 2017. Antibiotic resistance by uropathogens was studied among different age groups. Statistical analysis included Chi2 test with a p<0.05. Poisson regression was used to calculate the prevalence ratio (PR) with a 95% confidence interval. Findings: There was a wide distribution of antibiotic resistance among all the antibiotics, mainly in Escherichia coli and Proteus spp. The elderly had the highest prevalence of antibiotic resistance. As age increased, resistance to all drugs also increased (p<0.01). Furthermore, the elderly had a risk probability of resistance of 1.22, 1.42, 1.20 and 1.32 to penicillins, cephalosporins, quinolones and other antibiotics respectively. Conclusion: The antimicrobial resistance patterns of the Peruvian Andean region were lower than national and international patterns.

RESUMEN Introducción: La resistencia a antibióticos es considerada la próxima epidemia mundial. Las infecciones del tracto urinario (ITU) son la segunda causa más común de infecciones y la que presenta mayor frecuencia de resistencia. Sin embargo, poco se ha reportado en regiones altos-andinas. Objetivo: Evaluar los patrones de resistencia antimicrobiana de la familia enterobacteriaceae aisladas de infecciones del tracto urinario de pacientes ambulatorios de una región altoandina peruana y sus factores asociados. Material y Métodos: Estudio transversal analítico retrospectivo, a partir de 1717 registros del Servicio de Microbiología de una institución de salud en la región Puno - Perú, entre los años 2014 al 2017. Se estudió la resistencia a antibióticos según uropatógeno en diferentes grupos etarios. Se empleó la prueba de Chi2 de Pearson y un modelo de regresión de de Poisson para calcular la razón de prevalencias (RP). En todos los análisis se consideró un valor de p<0.05 como significativo y se estimaron intervalos de confianza al 95%. Resultados: Se presentó una amplia distribución de resistencia en todos los fármacos evaluados, siendo mayor en Escherichia coli y Proteus spp. El grupo etario, ≥ 60 años, presentó la mayor prevalencia de resistencia bacteriana. A medida que la edad aumentaba, la resistencia a todos los fármacos estudiados también aumentó (p <0.01). Así mismo, los pacientes ≥ 60 años presentaron mayor probabilidad de presentar resistencia bacteriana a penicilinas, cefalosporinas y quinolonas. Conclusión: El patrón de resistencia a los antibióticos utilizados en ITUs en la zona altoandina peruana incrementa con la edad.

RESUMO INTRODUÇÃO: A notificação seletiva dos resultados do teste de suscetibilidade aos antimicrobianos (antibiograma seletivo) é conhecida como uma das estratégias-chave dos programas de apoio à prescrição de antibióticos. O objetivo deste estudo foi determinar o impacto do antibiograma seletivo no consumo de ciprofloxacino e a suscetibilidade da bactéria Escherichia coli ao ciprofloxacino nos cuidados primários. MATERIAL E MÉTODOS: A política de notificação seletiva foi criada e implementada em 2011 e envolveu a não transmissão, no antibiograma, da suscetibilidade da família Enterobacteriaceae ao ciprofloxacino em amostras urinárias quando existia suscetibilidade a outros agentes com menor espectro. Os desfechos avaliados foram consumo de ciprofloxacino e evolução da suscetibilidade de E. coli ao ciprofloxacino entre janeiro de 2011 e dezembro de 2018. RESULTADOS: Nesse período, um aumento foi detectado na taxa de suscetibilidade de E. coli ao ciprofloxacino, de 79% a 87% (p < 0,001). A taxa de incidência de E. coli resistente ao ciprofloxacino diminuiu de 2,52 para 0,87 (p < 0,001). O consumo de ciprofloxacino teve uma queda de 0,75 doses diárias definidas (DHD) para 0,36 DHD. Simultaneamente, um aumento compensatório foi observado no consumo de nitrofurantoína e fosfomicina. DISCUSSÃO: Nosso estudo demonstrou que a utilização do antibiograma seletivo influenciou a prática de prescrição dos antimicrobianos e incentivou os clínicos gerais a selecionar antimicrobianos de espectro de ação mais reduzido e com melhor relação custo-benefício. CONCLUSÃO: Nossos resultados sugerem que a utilização de antibiogramas seletivos deve ser considerada uma estratégia eficaz na redução do consumo de determinados antimicrobianos.

ABSTRACT INTRODUCTION: Selective reporting of antibiotic susceptibility test results (selective antibiogram), is increasingly recognized as one of the key strategies of antibiotic stewardship programs. The objective of this study is to determine the impact of selective susceptibility reporting on ciprofloxacin utilization and Escherichia coli susceptibility to ciprofloxacin in the outpatient setting. MATERIAL AND METHODS: A selective reporting policy was created and implemented in 2011. The policy involves the non-reporting of ciprofloxacin susceptibility to Enterobacteriaceae isolated in a urine sample when there was susceptibility to other agents with narrow spectrum. The outcomes evaluated were outpatient ciprofloxacin utilization and E. coli susceptibility to ciprofloxacin between January 2011 and December 2018 RESULTS: Between 2011 and 2018 we detected an increased susceptibility rate of E. coli to ciprofloxacin from 79% to 87% (p < 0.001) and a decreased incidence rate of E. coli resistant to ciprofloxacin from 2.52 to 0.87 (p < 0.001). The ciprofloxacin dropped from 0.75 defined daily doses (DHD) to 0.36 DHD and there was a compensatory increase in nitrofurantoin and fosfomycin utilization. DISCUSSION: Our study showed that selective reporting can influence prescribing practice in a community level and encourages clinicians to select more narrow-spectrum and cost-effective antimicrobial agents in UTIs. CONCLUSION: Our results suggest that selective antibiogram should be considered an effective prevention strategy to reduce targeted antimicrobial utilization.

RESUMEN INTRODUCCIÓN: La notificación selectiva de resultados de la prueba de susceptibilidad bacteriana (antibiograma selectivo) es conocida como una de las estrategias clave de los programas de optimización de antimicrobianos. El objetivo de este estudio fue determinar el impacto del antibiograma selectivo en el consumo de ciprofloxacino y la sensibilidad de la bacteria Escherichia coli al ciprofloxacino en la atención básica. MATERIAL Y MÉTODOS: La política de informe selectivo fue creada e implementada en 2011 e incluyó la no trasmisión, en el antibiograma, de sensibilidad de Enterobacteriaceae al ciprofloxacino en muestras urinarias cuando había sensibilidad a otros agentes de espectro reducido. Los desenlaces evaluados fueron el consumo de ciprofloxacino y la evolución de sensibilidad de E. coli al ciprofloxacino entre enero de 2011 y diciembre de 2018. RESULTADOS En esse período, se detectó un aumento en la tasa de sensibilidad de E. coli al ciprofloxacino, del 79% al 87% (p < 0,001). La tasa de incidencia de E. coli resistente al ciprofloxacino descendió de 2,52 a 0,87 (p < 0,001). El consumo de ciprofloxacino tuvo un descenso de 0,75 doses por mil habitantes día (DHD) a 0,36 DHD. Al mismo tiempo, un aumento compensatorio se observó en el consumo de nitrofurantoína y fosfomicina. DISCUSIÓN: Nuestro estudio demostró que el uso del antibiograma selectivo influyó en la práctica de prescripción de antimicrobianos y animó a los médicos generales a elegir antimicrobianos de espectro más reducido y con mejor relación de costo-beneficio. CONCLUSIÓN: Nuestros resultados sugieren que la utilización de antibiogramas selectivos debe ser considerada una estrategia efectiva en la reducción del consumo de determinados antimicrobianos.

RESUMO Estações de tratamento de esgotos (ETEs) estão entre as principais fontes de disseminação de bactérias resistentes a antibióticos (BRAs) e genes de resistência (GRAs) no ambiente. Este trabalho quantificou a ocorrência de bactérias resistentes aos antibióticos ampicilina e cloranfenicol no esgoto bruto (EB), no efluente tratado (ET) e no lodo de duas ETEs em escala plena por um período de nove meses. As unidades investigadas utilizavam os seguintes sistemas de tratamento: ETE-A, sistema de lodos ativados convencional; e a ETE-B, reatores anaeróbios (UASB) seguidos de filtros biológicos percoladores (FBP). Os resultados evidenciaram que a ETE-A foi mais eficiente na redução das concentrações de bactérias resistentes à ampicilina e ao cloranfenicol (cerca de 1,1 e 0,7 log10UFC.mL−1 de remoção, respectivamente), quando comparada com a ETE-B (0,5log10 UFC.mL−1 de remoção para as bactérias resistentes ao cloranfenicol e nenhuma remoção para as resistentes à ampicilina). As amostras de lodo, de ambas ETEs, apresentaram elevadas concentrações de bactérias heterotróficas totais — BHTs (4,8–7,6 log10UFC.mL−1) e de BRAs (3,0–6,3 log10UFC.mL−1). A maioria das cepas resistentes à ampicilina e ao cloranfenicol isoladas foi identificada como sendo da família Enterobacteriaceae. Algumas das espécies identificadas são bactérias potencialmente patogênicas, tais como: Klebsiella pneumoniae, Aeromonas hydrophila, Escherichia coli, Enterococcus faecium, Salmonella spp. Os resultados chamam a atenção para a disseminação de BRAs, potencialmente patogênicas, no meio ambiente a partir do efluente final (proveniente do tratamento secundário) das ETEs, independentemente do tipo de sistema adotado. Fica evidente que para reduzir significativamente a concentração das BRAs no ET, este deveria passar por tratamento adicional e desinfecção.

ABSTRACT Sewage treatment plants (STP) are among the main sources of dissemination of antibiotic-resistant bacteria (ARB) and antibiotic-resistance genes (ARG) into the environment. This work quantified the occurrence of cultivable ampicilin-resistant and chloramphenicol-resistant bacteria in raw sewage, treated effluent and sludge samples from two full-scale STP over nine months. The STP investigated used the following treatment systems: STP-A used conventional activated sludge system; and STP-B, anaerobic reactors (UASB) followed by percolating biological filters (PBF). Results showed that was more efficient in reducing the concentrations of ampicilin- and chloramphenicol-resistant bacteria (around 1.1 and 0.7 log10UFC.mL−1, respectively) when compared to STP-B (0.5 log10 UFC.mL−1 removal of cloramphenicol-resistant bacteria and no-removal of ampicilin-resistant bacteria). Sludge samples, from both STP, showed high concentrations of total heterotrophic bacteria (THB; 4.8–7.6 log10UFC.mL−1) and ARB (3.0–6.3 log10UFC.mL−1). Most of the isolated ampicilin- and chloramphenicol-resistant strains were identified as members of the Enterobacteriaceae family. Some of the identified species are potential pathogenic bacteria, such as Klebsiella pneumoniae, Aeromonas hydrophila, Escherichia coli, Enterococcus faecium, Salmonella spp. These results call attention to the spread of ARB, potentially pathogenic, in the environment from the final effluent (from secondary effluent) on the STP, regardless of the type of system adopted. It is evident that in order to significantly reduce the concentration of ARB in the treated effluent, it should undergo additional treatment and disinfection.

RESUMO A proximidade dos primatas não humanos (PNH) com o ser humano pode ser considerada um fator de risco para transmissão de bactérias entre essas duas populações. Neste estudo, foi investigada a microbiota anfibiôntica aeróbica oral e retal de calitriquídeos em um fragmento de Mata Atlântica localizado no Rio de Janeiro, Brasil, e foram realizados testes fenotípicos para detecção de bactérias multirresistentes nos isolados encontrados. Foram capturados 14 calitriquídeos e coletadas 21 amostras (14 de cavidade oral e sete de cavidade retal) em dois pontos da mata próximos às habitações humanas. As espécies mais frequentes, na cavidade oral, foram Klebsiella oxytoca (50,0%), K. pneumoniae (28,6%), Kluyvera ascorbata (21,4%) e Stenotrophomonas maltophilia (21,4%) e, na cavidade retal, K. pneumoniae (85,7%), Escherichia coli (28,6%) e Enterobacter spp. (42,9%). Todos os 48 isolados da família Enterobacteriaceae foram negativos para ESBL (betalactamase de espectro ampliado), mostrando-se não produtores da enzima nos dois métodos utilizados: disco-aproximação e método de detecção automatizado. Na pesquisa de ERC (enterobactérias resistentes a carbapenêmicos), esses mesmos isolados não apresentaram resistência aos antibióticos imipenem, meropenem e ertapenem. Todas as bactérias isoladas apresentam um potencial zoonótico, o que representa um risco à saúde pública e à conservação das espécies.

ABSTRACT Proximity of nonhuman primates (NHP) to humans can be considered a risk factor for transmission of pathogens between these two populations. This study investigated the oral and rectal aerobic bacterial microbiota of marmosets in an anthropized area of the Atlantic Forest located in Rio de Janeiro, Brazil, and performed phenotypic tests for detection of multidrug-resistant bacteria. Twenty-one samples (14 from the oral cavity and seven from the rectum) were collected from 14 Callithrix sp. captured in two sites of the forest near human dwellings. The most frequent species identified from the oral cavity swabs were Klebsiella oxytoca (50.0%), K. pneumoniae (28.6%), Kluyvera ascorbata (21.4%) and Stenotrophomonas maltophilia (21.4%), whereas the species most commonly identified from the rectum swabs were K. pneumoniae (85.7%), Enterobacter spp. (42.9%) and Escherichia coli (28.6%). All isolates of family Enterobacteriaceae showed no extended spectrum β-lactamase production by disk-diffusion and automated detection tests. In the search for carbapenem-resistant enterobacteriaceae these isolates presented no resistance to the imipenem, meropenem and ertapenem antibiotics. The isolate of Staphylococcus aureus was susceptible to oxacillin and the isolate of Enterococcus was susceptible to vancomycin. All isolated bacteria showed zoonotic potential, thus posing a risk to species conservation and public health.

RESUMO Foram padronizados os graus de lesões dos sacos aéreos em perus com aerossaculite, associadas com a presença de isolados de enterobactérias nesses órgãos. Um total de 110 amostras de sacos aéreos de perus machos com aerossaculite foi coletado para o estudo. Durante o processo de abate, as amostras foram coletadas por meio de swabs e submetidas a três métodos de armazenamento (imediato, congelado ou pré-incubado após congelamento) para posterior comparação das suas eficiências de isolamento. Os gêneros da família Enterobacteriaceae foram identificados pelas séries bioquímicas EPM, MILi e citrato de Simmons. O crescimento bacteriano ocorreu em 43,64% das amostras. Neste estudo, quatro padrões de lesões de aerossaculite foram identificados de acordo com as características patológicas dos sacos aéreos. Os principais gêneros de enterobactérias identificadas foram: Escherichia coli, Citrobacter, Proteus, Edwardsiella, Morganella, Kluyvera, Salmonella e Klebsiella. Foi observado que os graus padronizados como 3 e 4 apresentaram maior variedade de gêneros bacterianos. O armazenamento imediato apresentou maior porcentagem de positividade, 41,82%, no entanto o pré-incubado após congelamento se apresentou mais eficaz em relação à quantidade de colônias.

ABSTRACT The degrees of air sac lesions in turkeys with airsacculitis were standardized, associated with the presence of Enterobacteriaceae isolated from these organs. A total of 110 samples of air sacs from male turkeys with airsacculitis were collected and analyzed. During the slaughtering process, the sample collection was done using swabs and submitted to three storage methods (immediate, frozen, or pre incubated after freezing) for further comparison of their isolated efficiency. The bacterial genera of the family Enterobacteriaceae were identified biochemical series EPM, MILi and Simmons citrate. Bacterial growth occurred in 43.64% of samples. In this study, four patterns of aerossaculitis lesions were identified according to the pathological characteristics of air sacs. The frequencies of the Enterobacteriaceae isolated identified in the samples were: Escherichia coli, Citrobacter, Proteus, Edwardsiella, Morganell, Kluyvera, Salmonella and Klebsiella. Otherwise, it was observed that the levels already standardized as level three and four showed higher variety of genus. The immediate storage showed higher percentage of positivity at 41.82%, however, the pre incubated after freezing showed more efficiency in relation to the quantity of colonies.

RESUMEN De acuerdo a las estadísticas en Colombia los brotes de enfermedades transmitidas por alimentos se han incrementado, encontrándose los restaurantes e instituciones educativas dentro de los lugares más implicados. El objetivo principal de este estudio fue evaluar la inocuidad microbiana de las superficies vivas e inertes en contacto con alimentos en restaurantes formales e informales y puestos de comida ambulante cercanos a un campus universitario. En total se seleccionaron 41 superficies para el análisis de bacterias mesófilas aerobias y Coliformes totales, que fueron posteriormente identificadas mediante pruebas bioquímicas rápidas. Los resultados evidenciaron contaminación cruzada, con altos porcentajes en bacterias mesófilas aerobias, y aunque la mayoría de los recuentos de coliformes totales se encontraron dentro del límite permisible, la identificación bacteriana demostró la presencia de varios géneros de la familia Enterobacteriaceae. Además, se demostró que la capacitación en manipulación higiénica de alimentos es un buen instrumento para minimizar los recuentos de bacterias en superficies.

ABSTRACT In Colombia, foodborne illnesses have increased, being the restaurants and educational institutions within the most involved places. The main objective of this study was to evaluate the microbial safety of living and inert surfaces in contact with food in formal and informal restaurants and street food stalls near a university campus. In total, 41 surfaces were selected for the analysis of aerobic mesophilic bacteria and total Coliform, which were subsequently identified by rapid biochemical tests. The results showed cross contamination, with high percentages in aerobic mesophilic bacteria, and although most total coliform counts are within the allowable limit, bacterial identification demonstrates the presence of several genera of the Enterobacteriaceae family In addition, training in hygienic food modifications was shown to be a good instrument to minimize bacterial counts on surfaces.

RESUMO De acordo com as estatísticas na Colômbia, os surtos de doenças de origem alimentar aumentaram, estando os restaurantes e instituições de ensino entre os mais envolvidos. O principal objetivo deste estudo foi avaliar a segurança microbiana de superfícies de contato com alimentos vivos e inertes em restaurantes formais e informais e barracas de comida de rua próximas a um campus universitário. Foram seleccionadas 41 superfícies para análise de bactérias aeróbias mesófilas e coliformes totais, que foram posteriormente identificadas através de testes bioquímicos rápidos. Os resultados mostraram contaminação cruzada, com altas percentagens de bactérias aeróbias mesófilas, e embora a maioria das contagens totais de coliformes estivesse dentro do limite permitido, a identificação bacteriana demonstrou a presença de vários gêneros da família Enterobacteriaceae. Além disso, o treinamento no manuseio higiênico de alimentos demonstrou ser uma boa ferramenta para minimizar a contagem de bactérias na superfície.

RESUMO: A indústria avícola brasileira gera grandes quantidades de resíduos orgânicos, como a cama de frango, utilizada frequentemente na agricultura. Entre as bactérias presentes neste fertilizante orgânico estão os membros da família Enterobacteriaceae, entre eles a Escherichia coli. O objetivo deste estudo foi analisar o perfil de fatores de virulência e resistência antimicrobiana de isolados de E. coli provenientes do fertilizante orgânico aviário. Um total de 47 cepas de E. coli foram testadas por meio da reação em cadeia da polimerase para detectar genes de virulência (hlyF, iss, ompT, iutA e iroN). Quatorze antimicrobianos foram utilizados para testar a susceptibilidade antimicrobiana nos isolados. Genes característicos de E. coli Patogênica Aviária (APEC) foram encontrados entre os isolados, sendo os genes hlyF, iss e ompT os mais prevalentes. Os isolados apresentaram alta resistência (˃50%) à tetraciclina, gentamicina, cefotaxima, nitrofurantoína, trimetoprima-sulfametoxazole e ampicilina. Múltipla resistência a drogas antimicrobianas foi encontrada em grande número de isolados (>70%). Os resultados obtidos mostraram a presença de células APEC portando genes de virulência e resistência a antimicrobianos após 15 dias de processo de empilhamento nas granjas, indicando que o processo necessita de um aperfeiçoamento para eliminar estas células.

ABSTRACT: Brazilian poultry industry generates large amounts of organic waste, such as chicken litter, which is often used in agriculture. Among the bacteria present in organic fertilizer are members of the Enterobacteriaceae family, such as Escherichia coli. The aim of this study was to analyze the profile of virulence factors and antimicrobial resistance of E. coli isolates from avian organic fertilizer. A total of 47 E. coli strains were tested through Polymerase chain reaction to detect virulence genes (hlyF, iss, ompT, iutA and iroN). Fourteen antimicrobials were used to test antimicrobial susceptibility in the strains. Genes characteristic of Avian Pathogenic E. coli (APEC) were reported among the strains, with the hlyF, iss and ompT genes being the most prevalent. The isolates showed high resistance (˃50%) to tetracycline, gentamicin, cefotaxime, nitrofurantoin, trimethoprim-sulfamethoxazole and ampicillin. Multidrug resistance was reported in a great number of strains (>70%). The results showed the presence of APEC cells with virulence genes and antimicrobial resistance after 15 days of the windrowing process in poultry houses, it means this process should be improved to eliminate these cells.

RESUMO Objetivo: identificar o perfil sociodemográfico, microbiológico e de resistência bacteriana em pacientes com pé diabético infectado. Métodos: tratou-se de estudo observacional, transversal que avaliou os perfis sóciodemográfico e microbiológico de pacientes portadores de pé diabético infectado internados em Pronto Socorro de referência. Os dados sociodemográficos foram coletados por meio de entrevista. Foram colhidos, durante os procedimentos cirúrgicos, fragmentos de tecidos das lesões podais infectadas para realização de cultura/antibiograma. Resultados: a amostra foi composta por 105 pacientes. O perfil sociodemográfico mais prevalente foi o de pacientes do sexo masculino, acima dos 50 anos, casados e com baixa escolaridade. Das 105 amostras de fragmentos de tecidos colhidos para realização de cultura e antibiograma, 95 foram positivas, com crescimento de um único germe em cada um dos exames. Houve predomínio de germes da família Enterobacteriaceae (51,5%). Germes Gram-negativos foram isolados em 60,0% das culturas e os espécimes mais isolados individualmente foram os cocos Gram-positivos, Staphylococcus aureus (20,0%) e Enterococcus faecalis (17,9%). Considerando-se os perfis de resistência bacteriana, verificou-se alta taxa de Staphylococcus aureus resistente à meticilina (63,0%) e à ciprofloxacino (55,5%); verificou-se, também, que 43,5% dos germes Gram-negativos eram resistentes à ciprofloxacino. Conclusões: o perfil sociodemográfico majoritário, foi o de homens, com mais de 50 anos e com baixa escolaridade. Concluímos que os germes mais prevalentes nas lesões podais dos pacientes diabéticos foram os Gram-negativos, resistentes ao ciprofloxacino e que o germe mais isolado individualmente foi o Staphylococcus aureus resistente à meticilina.

ABSTRACT Purpose: the purpose of this research was to identify the sociodemographic and microbiological characteristics and antibiotic resistance rates of patients with diabetic foot infections, hospitalized in an emergency reference center. Methods: it was an observational and transversal study. The sociodemographic data were collected by direct interview with the patients. During the surgical procedures, specimens of tissue of the infected foot lesions were biopsied to be cultured, and for bacterial resistance analysis. Results: the sample consisted of 105 patients. The majority of patierns were men, over 50 years of age, married and with low educational level. There was bacterial growth in 95 of the 105 tissue cultures. In each positive culture only one germ was isolated. There was a high prevalence of germs of the Enterobacteriaceae family (51,5%). Gram-negative germs were isolated in 60% of cultures and the most individually isolated germs were the Gram-positive cocci, Staphylococcus aureus (20%) and Enterococcus faecalis (17,9%). Regarding antibiotic resistance rates, a high frequency of Staphylococcus aureus resistant to methicillin (63,0%) and to ciprofloxacin (55,5%) was found; additionally, 43,5% of the Gram-negative isolated germs were resistant to ciprofloxacin. Conclusions: the majority of patients were men, over 50 years of age, married and with low educational level. The most prevalent isolated germs from the infected foot lesions were Gram-negative bacteria, resistant to ciprofloxacin, and the individually most isolated germ was the methicillin resistant Staphylococcus aureus.

SUMMARY: Within the framework of undergraduate and postgraduate medical education, cadavers have been used to teach anatomy by dissection or by using prosected specimens. To accomplish this, an appropriated preservation process must guarantee that the cadaver is kept safe for harm, destruction, and decomposition. Embalming fluid contains fixatives, disinfectants, surfactants, buffers, salt, and water, making the cadaver safe for teaching anatomy. However, it remains unclear if there is any risk of dissemination of microorganisms during anatomy teaching, research, and dissection procedures on fixed cadavers. The purpose of this study is to identify bacterial and fungal species in fixed cadaveric material used in anatomy teaching. Samples of cadavers and anatomical sections were cultured and biochemical tests and molecular identification by polymerase chain reaction (PCR) were performed to identify the microorganisms. The results indicate that fixed cadaveric material has viable bacteria on its surfaces and almost all these correspond to gram-negative bacilli of the Enterobacteriaceae family. In conclusion, fixed cadavers could be a reservoir of bacteria. This study underscores the importance of generating safe manipulation protocols to avoid eventual contamination and disease.

RESUMEN: Dentro del curriculum de los programas de postgrado y pregrado de las carreras de la salud, los cadáveres han sido utilizados para la enseñanza de la anatomía mediante la disección o utilizando preparados anatómicos. Para poder llevar a cabo esto, el cadáver debe pasar por un adecuado proceso de preservación; en el que se utilizan fluidos que contienen fijadores, desinfectantes, surfactantes, buffers, sal y agua, los cuales lo protegen del deterioro y la descomposición. Las soluciones fijadoras y conservadoras contienen desinfectantes, surfactantes, fijadores, buffers, sal y agua, que hacen que el cadáver sea seguro para la enseñanza de la anatomía. Sin embargo, no está claro si existe algún riesgo de diseminación de microorganismos durante la enseñanza, investigación y/o disección en estos cadáveres. El propósito del estudio es identificar especies bacterianas y/o fúngicas en material cadavérico previamente fijado, usado en la enseñanza de la anatomía. Se realizaron cultivos y técnicas de identificación molecular mediante reacción en cadena de polimerasa de muestras tomadas desde material cadavérico para identificar los microorganismos encontrados. Los resultados indican que el material cadavérico previamente fijado posee bacterias en sus superficies, la mayoría corresponde a bacilos gram negativos de la familia de las Enterobacteriaceae. En conclusión, los cadáveres previamente fijados pueden ser reservorio de bacterias. Este estudio destaca la importancia de generar protocolos de manipulación con el fin de evitar una posible contaminación y enfermedad.

Resumo O controle higiênico e sanitário nas Unidades de Alimentação e Nutrição (UAN) é considerado um procedimento padrão para produzir refeições adequadas e reduzir o risco de doenças transmitidas pelos alimentos e infecções hospitalares. Este estudo teve como objetivo isolar e identificar bactérias de equipamentos e superfícies de contato com alimentos em uma UAN hospitalar, bem como avaliar a condição sanitária. Do mesmo modo, analisou-se a adesão dos micro-organismos em tábuas de corte de polietileno. A presença de micro-organismos aeróbios mesófilos, leveduras, fungos, Sthapylococcus coagulase-positivos, coliformes, coliformes fecais e Escherichia coli foi analisadas na superfície de mesas do refeitório, superfícies de bancada e tábuas de corte usadas para manuseio de carne ou vegetais e, em equipamentos como micro-ondas e refrigeradores. A identificação molecular foi feita pelo sequenciamento do gene 16S rRNA. A adesão dos micro-organismos (formação de biofilmes) em tábuas de corte de carne e de vegetais também foi avaliada por microscopia eletrônica de varredura. Os resultados mostraram elevada contagem para todos os micro-organismos analisados, exceto para E. coli, a qual não foi observada nas amostras. A análise molecular identificou espécies da família Enterobacteriaceae e Pseudomonadaceae. A análise de microscopia eletrônica de varredura revelaram adesão bacteriana nas superfícies das placsa de corte. Os resultados obtidos neste estudo indicaram que as condições higiênicas das superfícies e de equipamentos nesta UAN hospitalar estavam inadequadas. A aplicação de procedimentos operacionais padrão poderia auxiliar positivamente na padronização do controle higiênico-sanitário, reduzindo a contaminação microbiana e fornecendo um alimento seguro para pacientes hospitalizados.

Abstract The hygienic and sanitary control in Food and Nutrition Units (FNU) is considered a standard procedure to produce adequate meals and reduce the risk of foodborne diseases and hospital infections. This study aimed to evaluate the isolation and identification of bacteria from equipment and food contact surfaces in a hospital FNU as well as to evaluate the sanitary condition. Likewise, it was analyzed the adhesion of the microorganisms on polyethylene cutting boards. The presence of aerobic mesophilic microorganisms, yeasts, molds, coagulase-positive staphylococci, coliform and fecal coliform, and Escherichia coli were analyzed on eating tables, countertop surfaces and cutting boards used for meat or vegetable handling, and equipment such as microwaves and refrigerators. The molecular identification it was done by 16S rRNA gene sequencing. The adhesion of the microorganisms (biofilm formation) on meat and vegetable cutting boards was also evaluated by scanning electron microscopy. The results showed high numbers of all microorganisms, except for E. coli , which was not observed in the samples. The molecular analysis identified species of the Enterobacteriaceae family and species of the Pseudomonadaceae family. Scanning electron microscopy analyses revealed bacterial adhesion on the cutting board surfaces. The results obtained in this study indicated that the hygienic conditions of surfaces like plastic cutting boards and equipment in this hospital FNU were inadequate. The achievement and application of standard operating procedures could positively help in the standardization of sanitary control, reducing the microbial contamination and providing a safe food to hospitalized patients.

Abstract The plasmid-encoded toxin (Pet) is one of the most studied Enterobacteriaceae autotransporters produced by the enteroaggregative Escherichia coli (EAEC). It is responsible of morphological changes in enterocytes during EAEC infection. Recently, Pet was found in the genome of the Proteus mirabilis RTX339 strain [P. mirabilis (Pet+)]. P. mirabilis causes complicated urinary tract infections (UTI) in patients having urinary catheters and structural or functional abnormalities. In this study, an UTI was induced in BALB/c female mice with the P. mirabilis (Pet+) strain. Mice infected by P. mirabilis (Pet+) showed bacterial colonization in bladder and kidney, from the second up to the tenth day post-infection. Morphological changes were evidenced by histology. Multiple exfoliated rounded cells were observed in the bladder transitional epithelium, as well as, structural cell alterations in the kidney cortex. The presence of Pet into exfoliated and parenchymal cells was confirmed by confocal microscopy. Cytoskeleton alterations were observed in those sites where Pet was detected. Pet expressed by P. mirabilis (Pet+) strain, contributes to its pathogenicity, affecting urinary tissues during the course of the infection.

Resumen La toxina Pet (plasmid-encoded toxin) producida por Escherichia coli (EAEC) es uno de los autotransportadores más estudiados en la familia Enterobacteriaceae. Es responsable de cambios morfológicos en enterocitos durante la infección por EAEC. Recientemente, Pet fue encontrada en el genoma de una cepa de Proteus mirabilis RTX339 [P. mirabilis (Pet+)]. P. mirabilis causa infección en el tracto urinario (ITU) en pacientes que usan catéteres o que presentan anomalías estructurales o funcionales. En este estudio una ITU con P. mirabilis (Pet+) fue inducida en ratones hembras BALB/c. Los ratones infectados con P. mirabilis (Pet+) muestran una colonización bacteriana en vejiga y riñón desde el segundo hasta el día decimo de la infección. Los cambios morfológicos fueron evidenciados por histología. Se observaron múltiples células exfoliadas del epitelio de transición de la vejiga, así como alteraciones morfológicas en la corteza renal. Se confirmó la presencia de Pet en las células exfoliadas y en las del parénquima por microscopía confocal. Las alteraciones del citoesqueleto fueron observadas en los sitios donde se detectó Pet. La toxina Pet expresada por la cepa de P. mirabilis (Pet+) contribuye a la patogenicidad y afecta tejidos urinarios durante el curso de la infección.

Resumen Leclercia adecarboxylata es un miembro de la familia Enterobacteriaceae que ha sido aislada tanto de muestras de animales como medioambientales, sin embargo raramente produce enfermedad en seres humanos. Tiene resistencia natural a varios antibióticos y se ha encontrado que tiene enzimas capaces de hidrolizar la mayoría de los antibióticos utilizados en la práctica clínica, lo cual hace un verdadero tratar una infección por este microorganismo en humanos. Aquí reportamos el primer caso de infección por Leclercia adecarboxylata luego de un trauma con material vegetal, en un paciente de 69 años y con una diabetes tipo 2, mal controlada.

Abstract Leclercia adecarboxylata is a member of the Enterobacteriaceae family that has been isolated from several environmental and animal specimens, however it rarely causes diseases in human beings. It has natural resistance to several antibiotics, and has shown the ability to harbor and produce enzymes capable of hydrolyzing most of the antibiotics used in daily clinical practice, making its treatment a challenge when a strain with such characteristics causes disease. Here we report the first known case of infection by Leclercia adecarboxylata after a trauma with plant material, in a 69-year-old male patient, with poorly controlled Diabetes Mellitus type 2.