Abstract Diarrheagenic Escherichia coli comprises a heterogeneous group of pathotypes or pathogenic variants that share phenotypic characteristics with marked differences in virulence genes, colonization sites, pathogenesis, clinical presentation, and epidemiology of infection. The most studied pathotypes are Shiga toxin-producing E.coli (STEC), enterotoxigenic E.coli (ETEC), enteropathogenic E.coli (EPEC), enteroaggregative E.coli (EAEC), and enteroinvasive E.coli (EIEC). The objective of the study was to characterize the isolates of diarrheagenic E.coli from an outpatient pediatric population with diarrhea attended in two public hospitals from Buenos Aires, Argentina. Diarrheagenic E.coli pathotypes were investigated by amplifying characteristic virulence gene fragments: intimin (eae), heat-labile toxin (lt), heat-stable toxins (stp, sth), invasion plasmid antigen H (ipaH), transcriptional activator R (aggR) and Shiga toxins (stx1, stx2). Molecular subtyping of isolates was performed using PFGE (XbaI). Diarrheagenic E.coli was detected in 14% (84/601) of cases. The EAEC pathotype was prevalent, while ETEC, STEC, EPEC and EIEC were found in a lower proportion. EAEC isolates exhibited a high degree of genetic diversity. All pathotypes were found in children under 5years of age, while only EAEC, EIEC and ETEC were detected in the older population. Future studies that include the characterization of isolates from a greater number of genes and populations from other geographical areas will be necessary to determine the relevance of diarrheagenic E.coli in Argentina.

Resumen Escherichia coli diarreogénica abarca un grupo heterogéneo de patotipos o variantes patogénicas que comparten características fenotípicas con marcadas diferencias en genes de virulencia, sitios de colonización, patogenia, presentación clínica y epidemiología de la infección. Los patotipos más estudiados son E.coli productora de toxina Shiga (STEC), E.coli enterotoxigénica (ETEC), E.coli enteropatogénica (EPEC), E.coli enteroagregativa (EAEC) y E.coli enteroinvasiva (EIEC). El objetivo del estudio fue caracterizar los aislamientos de E.coli diarreogénica provenientes de población pediátrica ambulatoria con diarrea, atendida en dos hospitales públicos de Buenos Aires, Argentina. Los patotipos de E.coli diarreogénica se investigaron mediante la amplificación de fragmentos de genes de virulencia característicos: intimina (eae), toxina termolábil (lt), toxinas termoestables (stp, sth), antígeno plasmídico de invasiónH (ipaH), activador transcripcional R (aggR) y toxinas Shiga (stx1, stx2). La subtipificación molecular de aislamientos se realizó mediante PFGE (XbaI). E.coli diarreogénica fue detectada en el 14% (84/601) de los casos. El patotipo EAEC fue prevalente, mientras que ETEC, STEC, EPEC y EIEC fueron hallados en menor proporción. Los aislamientos de EAEC presentaron un alto grado de diversidad genética. Todos los patotipos fueron hallados en niños menores de 5años, mientras que solamente EAEC, EIEC y ETEC fueron detectados en población de mayor edad. Futuros estudios que incluyan la caracterización de aislamientos a partir de un mayor número de genes y población de otras áreas geográficas serán necesarios para determinar la relevancia de E.coli diarreogénica en Argentina.

Resumen Introducción. La diversidad genética, el registro y la trazabilidad del material vegetal del cacao son esenciales para apoyar su cultivo sostenible. En Nicaragua, el material de plantación de cacao se obtiene mayoritariamente a partir de semillas, lo que provoca una gran variabilidad en rendimiento, calidad del grano y tolerancia a plagas y enfermedades. Los agricultores, el personal técnico, los proyectos de desarrollo y los inversores dependen de una oferta limitada de árboles élites como fuente fiable de material genético para apoyar nuevos frentes de cacao y cumplir con los estándares de calidad del mercado. Por lo tanto, el desarrollo de un programa nacional de mejoramiento genético y un sistema de trazabilidad del material de siembra en Nicaragua son necesarios para mejorar la sostenibilidad del cultivo. Objetivo. Evaluar los recursos genéticos en las fincas y aportar información para futuros programas de mejoramiento, así como sentar las bases de un sistema nacional de trazabilidad y certificación. Materiales y métodos. Se muestrearon 49 árboles élites seleccionados por los agricultores en las principales regiones productoras en Nicaragua entre 2018 y 2020. Se utilizaron 93 marcadores SNP para caracterizarles y resolver sus orígenes genéticos. Resultados. Los árboles de cacao evaluados tenían un fondo genético estrecho, compuesto principalmente por híbridos con orígenes Amelonado (36 %), Criollo (17 %) e Iquitos (15 %). Se identificó un conjunto de árboles con alta diversidad genética que podría incorporarse a un programa de selección y mejoramiento. Conclusión. El fingerprinting con marcadores SNP fue una herramienta útil para evaluar los vínculos genéticos del cacao cultivado y puede servir para realizar pruebas de identidad varietal a nivel de finca. El estudio proporcionó las bases para desarrollar tanto un programa de mejoramiento como un sistema de trazabilidad del material vegetal de cacao en Nicaragua.

Abstract Introduction. Genetic diversity, registration, and traceability of cacao planting material are the essential tripod to support its sustainable cultivation. In Nicaragua, cocoa planting material is mostly obtained from seeds, which leads to great variability in yield, bean quality, and tolerance to pests and diseases. Farmers, technical staff, development projects, and investors depend on a limited supply of elite trees as a reliable source of genetic material to support new cacao fronts and meet market quality standards. Therefore, the development of a national genetic improvement program and a planting material traceability system in Nicaragua are necessary to improve the sustainability of cacao cultivation. Objective. To evaluate the genetic resources on farms and provide information for future breeding programs, as well as to lay foundation for a national traceability and certification system. Materials and methods. Fourty-nine elite trees selected by farmers in the main producing regions in Nicaragua between 2018 and 2020 were sampled. Ninety-three SNP markers were used to characterize them and resolve their genetic origins. Results. The evaluated cacao trees had a narrow genetic background, mainly composed of hybrids with Amelonado (36 %), Criollo (17 %) and Iquitos (15 %) origins. A set of trees with high genetic diversity that could be incorporated into a selection and breeding program was identified. Conclusion. Fingerprinting with SNP markers was a useful tool for evaluating the genetic links of cultivated cacao and can be used for varietal identity test at the farm level. The study provided the basis for developing both a breeding program and a traceability system of cacao planting material in Nicaragua.

Resumen CD36 es un receptor involucrado en procesos fisiológicos, metabólicos y patológicos. Debido a su afinidad por ácidos grasos de cadena larga es uno de los principales receptores de lípidos provenientes de la dieta. En esta revisión se analiza la evidencia genética emergente que vincula a CD36 en la percepción oral de grasa. Se realizó una búsqueda sistemática en la base de datos PubMed considerando artículos publicados en el periodo 2000-2022. Múltiples estudios asocian a algunas variantes genéticas en CD36 con las preferencias por alimentos con contenido graso y se ha postulado que estas variantes pueden modificar los umbrales de percepción oral de grasas, sin embargo, la evidencia es heterogénea; esto puede ser explicado por la diversidad genética de las poblaciones, el estado nutricional y características de los participantes, así como a otros aspectos metodológicos. Se identificaron y se discuten otros factores implicados en la percepción oral de grasas, incluyendo la interacción con otros sabores, hormonas y factores epigenéticos. Se concluye que la evidencia que apoya el papel de CD36 como receptor de los lípidos provenientes de la dieta es intermedio y son necesarias más investigaciones en diversas poblaciones con un gran número de participantes, así como considerar la interacción entre distintas hormonas y la expresión de CD36.

Abstract CD36 is a receptor involved in physiologic, metabolic and pathologic processes. Due to its affinity for long-chain fatty acids, it has been postulated as a taste receptor of fatty taste. In this review, the emerging genetic evidence linking CD36 to oral fat perception is analyzed. A systematic literature search was conducted in PubMed, published articles from 2000 to 2022 were considered. Multiple studies have shown an association of some genetic variants in CD36 with fat foods preferences and it has been suggested that these variants can modify oral fat perception thresholds however the evidence is still heterogeneous; this can be explained by the genetic diversity of populations, the nutritional status and participant's characteristics, as well as other methodological aspects. Other factors involved in oral fat perception were and identified and discussed including the interaction with other flavors, hormones, and epigenetic factors. The conclusion is that the evidence supporting the role of CD36 as a dietary lipid receptor, the role of its genetic variants in fat acids oral perception thresholds and food preferences is intermediate level and more research is necessary in other populations with large number of participants as well as considering the interaction between different hormones and the expression of CD36.

Abstract Introduction: The spotted snapper is a high-consumption and commercially important marine fish in Costa Rica, subjected to heavy fishing pressures, which can affect genetic diversity and generate problems due to inbreeding depression. Objective: To evaluate the genetic status of the population of Lutjanus guttatus using microsatellites. Methods: Samples were collected between 2018 and 2019, and 44 individuals from each of the localities of the Gulf of Nicoya and the Gulf of Dulce were studied. DNA extraction and amplification of ten loci with microsatellites using PCR were performed, followed by genotyping, analysis of genetic diversity, and population structure. Results: Diversity parameters indicate a high polymorphism associated with a high number of alleles obtained per locus, but with low levels of observed heterozygosity compared to expected (Ho= 0.774 and 0.800, and He= 0.948 and 0.954 for the Gulf of Nicoya and Gulf of Dulce, respectively). There is not enough evidence to say that the two populations are distinct (FST= 0.00264, P > 0.05). Deviation from Hardy-Weinberg equilibrium was recorded, indicating possible mixing of organisms of different origin from the wild environment. Conclusions: L. guttatus presents high levels of genetic diversity, without evidence of differentiation in genetic subpopulations. For fisheries management purposes, they would be considered a single panmictic population. The possible mixing with wild individuals suggests the presence of organisms derived from a restocking or commercial cultivation program carried out in the region. The use of genetic markers is recommended to maintain monitoring, follow up on restocking programs and evaluate their effect.

Resumen Introducción: El pargo mancha es un pez marino de alto consumo e interés comercial en Costa Rica que está sometido a una fuerte presión pesquera, la cual puede afectar la diversidad genética y generar problemas por depresión endogámica. Objetivo: Evaluar el estado genético de la población de Lutjanus guttatus mediante el uso microsatélites. Métodos: Se recolectaron muestras entre el 2018 y 2019 y se estudiaron 44 individuos de cada una de las localidades del Golfo de Nicoya y Golfo Dulce. Se realizó la extracción de ADN y la amplificación de diez loci con microsatélites mediante PCR, para la determinación del genotipo, análisis de diversidad genética y estructura poblacional. Resultados: Los parámetros de diversidad indican un elevado polimorfismo asociado con un alto número de alelos obtenidos por locus, pero con bajos niveles de heterocigosidad observada en comparación con la esperada (Ho= 0.774 y 0.800 y He= 0.948 y 0.954 para Golfo de Nicoya y Golfo Dulce, respectivamente). No hay evidencia suficiente para decir que las dos poblaciones son distintas (FST= 0.00264, P > 0.05). La desviación del Equilibrio de Hardy-Weinberg indica la posible mezcla de organismos de origen distinto a los del medio silvestre. Conclusiones: L. guttatus tiene niveles altos de diversidad genética, no hay evidencia de diferenciación en subpoblaciones genéticas, lo que en manejo pesquerías se considera una sola población panmíctica. La posible mezcla de individuos de origen distinto al silvestre sugiere la presencia de organismos de un programa de repoblación o de cultivos comerciales en la región. El uso de marcadores genéticos se recomienda para el monitoreo, además, en programas de repoblación y evaluar su efecto.

Resumen Introducción: Rhizophora mangle se considera un nicho para microorganismos con enzimas degradantes potencialmente novedosas y complejas. Objetivo: Caracterizar poblaciones de Vibrio con métodos dependientes de cultivo, provenientes de muestras de sedimentos y de agua recolectadas a lo largo de un transecto de R. mangle compuesto por tres sitios. Métodos: Las cepas se caracterizaron según su distribución, diversidad, degradación de materia orgánica y parámetros ambientales. Resultados: Las densidades bacterianas estuvieron fuertemente asociadas con la temperatura y la salinidad. Un total de 87 secuencias de buena calidad que representan los aislamientos de los tres sitios se agruparon en 8 OTUs (Unidad taxonómica operativa). La asignación taxonómica indicó que los miembros dominantes eran Vibrionaceae. Los análisis de diversidad beta mostraron que las comunidades bacterianas se agruparon por fuente de la muestra en lugar de distribución espacial, y se encontró que la diversidad alfa era mayor en el agua que en los sedimentos. El 3 % de las cepas de muestras de agua fueron capaces de degradar carboxi-metilcelulosa con índices enzimáticos más bajos en comparación con el 4 % de las cepas de muestras de sedimentos que mostraron los índices enzimáticos más altos. Dos cepas identificadas como Vibrio agarivorans degradaron celulosa y agarosa, produciendo los índices enzimáticos más altos. Conclusiones: Encontramos mayor densidad bacteriana y diversidad en comunidades bacterianas de muestras de agua que en las de sedimento, con diferentes OTUs, incluyendo aquellos similares a Ferrimonas, Providencia, o Shewanella, que no fueron aislados en el sedimento. OTUs de Vibrio degradaron celulosa en ambos tipos de muestras. Los resultados del estudio resaltan la importancia de mangle rojo como hábitat de Vibrio y reservorio de fuentes potenciales de enzimas con aplicaciones biotecnológicas.

Abstract Introduction: Rhizophora mangle is considered an ecological niche for microorganisms with potentially novel and complex degrading enzymes. Objective: To characterize Vibrio populations using culture-dependent methods, using samples collected from sediments and water along a red mangrove transect composed of three sites. Methods: Strains were characterized according to their distribution, capacity to degrade of organic matter and other environmental parameters. Additionally the sequence diversity was assessed using 16S rRNA sequencing. Results: Bacterial densities were strongly associated with temperature and salinity. A total of 87 good-quality sequences representing the isolates from the three sites, were binned into eight OTUs (Operational taxonomic units). Taxonomic assignment indicated that the dominant members were Vibrionaceae. Beta diversity analyses showed that bacterial communities clustered by sample source rather than spatial distribution, and that alpha diversity was found to be higher in water than in sediment. Three percent of the strains from water samples could degrade carboxyl-methyl cellulose with the smallest enzymatic indexes compared to 4 % of the strains from sediment samples that showed the highest enzymatic indexes. Two strains identified as Vibrio agarivorans degraded cellulose and agarose, producing the highest enzymatic indexes. Conclusions: We found higher bacterial densities and diversity in the bacterial communities of the water samples compared to the sediment, with different OTUs including those similar to Ferrimonas, Providencia, or Shewanella which were not isolated in the sediment. Vibrio OTUs were shown to degrade cellulose in both sample types. The results of this study highlight the importance of red mangroves as Vibrio habitats and as reservoirs of potential enzyme sources with biotechnological applications.

Abstract: The objective of this study was to characterize the morphological composition of five populations of native maize and estimate their yields using agricultural practices without the use of agrochemicals. The study conducted in 2021, in the municipality of Cintalapa, Chiapas, within the experimental field of the Regional Academic Center of the Antonio Narro Autonomous Agrarian University. The five populations of native maize were provided by farmers from different regions of the state, with prior informed consent. The Agricultural practices consisted of using plant extracts and potassium soap with neem extract (Azadirachta indica) to prevent and combat pests. For fertilization, Californian red earthworm (Eisenia foetida) leachate and bat guano were applied in their commercial presentation. Morphological characters were evaluated with a descriptive statistical analysis considering days to male and female flowering, plant and ear height ear length and diameter, number of rows per ear and number of kernels per row. Grain yield was estimated by the weight of the ear harvested from a random sample of 20 plants per population. Numerical differences of the studied variables were identified, which demonstrates an existing genetic diversity. The populations with the highest yields were Campeón and Olotillo, with 5.37 and 4.4 ton ha-1 (± 1.24), respectively. The data provide information to design native maize conservation strategies through agrochemical-free management.

Resumen: El objetivo de este estudio fue caracterizar morfológicamente cinco poblaciones de maíz nativo y estimar sus rendimientos, empleando prácticas agrícolas sin uso de agroquímicos. El estudio se realizó en el año 2021, en el municipio de Cintalapa, Chiapas, dentro del campo experimental del Centro Académico Regional de la Universidad Autónoma Agraria Antonio Narro. Las cinco poblaciones de maíz nativo fueron proporcionadas por campesinos de diferentes regiones de la entidad, con previo consentimiento informado. Las prácticas agrícolas consistieron en uso de extractos vegetales y jabón potásico con extracto de neem (Azadirachta indica) para la prevención y combate de plagas. Para la fertilización se aplicó lixiviado de lombriz roja californiana (Eisenia foetida) y guano de murciélago en su presentación comercial. Los caracteres morfológicos se evaluaron con un análisis estadístico descriptivo considerando: días de floración masculina y femenina, alturas de planta y mazorca, longitud y diámetro de la mazorca, y número de hileras por mazorca y número de granos por hilera. El rendimiento de grano se estimó mediante el peso de la mazorca cosechada de una muestra aleatoria de 20 plantas por población. Se identificaron diferencias numéricas de las variables estudiadas, lo que demuestra una diversidad genética existente. Las poblaciones que presentaron mayores rendimientos fueron Campeón y Olotillo, con 5,37 y 4,4 ton ha-1 (± 1,24), respectivamente. Los datos aportan información para diseñar estrategias de conservación de maíces nativos con manejo libre de agroquímicos.

ABSTRACT The climatic cycles of the Pleistocene affected the distribution of the vegetation of different bio-mes, determining the distribution and evolution of the associated fauna. Many studies of Atlantic Forest (AF) organisms suggest that the Pleistocene glacial and interglacial cycles have produced demographically stable populations in the forest’s central region and unstable populations in its southern regions (known as the Car-naval-Moritz model). We studied the phylogeographic structure of an AF passerine, the Black-goggled Tanager (Trichothraupis melanops, Thraupidae) and evaluated questions related to the history of the AF. We analyzed three independent genes, two nuclear and one mitochondrial, using population genetic methods based on summary statistics and traditional phylogeographic methods. Our results suggest that T. melanops shares phylogeographic features with other AF taxa. Even though an effective population size gradient was found between the central and southern populations, which is in agreement with the results of other phylogeographic studies and the forest refugia model (the Carnaval-Moritz model), there is no evidence of a gradient of genetic diversity. In addition, we have found that T. melanops populations show the demographic dynamics expected according to the Carnaval-Moritz model: the inland-southern population was found to be the one with the greatest signs of recent demographic expansion, compared to the central and coastal-southern populations. Although this species is ecologically generalist and not very sensitive to forest fragmentation and degradation, it has been impacted by the historical dynamism of the AF.

RESUMEN Los ciclos climáticos del Pleistoceno afectaron la distribución de la vegetación de diferentes bio-mas, condicionando la distribución y evolución de la fauna asociada. Muchos estudios sobre organismos de la Selva Atlántica (SA) sugieren que los ciclos glaciales e interglaciales del Pleistoceno han producido poblaciones demográficamente estables en la región central de la selva y poblaciones inestables en sus regiones del sur (conocido como modelo Carnaval-Moritz). Estudiamos la estructura filogeográfica de un paseriforme que se distribuye en la SA, el Frutero de Anteojos Negros (Trichothraupis melanops, Thraupidae), y evaluamos preguntas relacionadas con la historia de la SA. Analizamos tres genes independientes, dos nucleares y uno mitocondri Editora Asociada: Bettina Mahler al, utilizando métodos de genética de poblaciones basados en estadísticas sumarias y métodos filogeográficos tradicionales. Nuestros resultados sugieren que T. melanops comparte características filogeográficas con otros taxones de la SA. Si bien se encontró un gradiente de tamaño poblacional efectivo entre las poblaciones del centro y del sur, lo que concuerda con los resultados de otros estudios filogeográficos y el modelo de refugios (el modelo Carnaval-Moritz), no hay evidencia de un gradiente de diversidad genética. Además, hemos encontrado que las poblaciones de T. melanops presentan la dinámica demográfica esperada por el modelo Carnaval-Moritz: la población del centro-sur resultó ser la que presenta mayores signos de expansión demográfica reciente, en comparación con las poblaciones central y de la costa sur. Aunque esta especie es ecológicamente generalista y poco sensible a la fragmentación y degradación forestal, ha sido impactada por el dinamismo histórico de la Selva Atlántica.

Abstract The nanche (Byrsonima crassifolia (L.) H.B.K) belongs to the Malpighiaceae family. The genus Byrsonima has a noetropical distribution and is highly diverse with more than 100 species. The objective of this work was to characterize the morphological and genetic variability of the native nanche fruit. The work was carried out during the year 2020, a collection was made in commercial orchards in San Lorenzo (SL’s), municipality of Ruiz, Nayarit, a morphological, physicochemical and molecular characterization was carried out, the statistical analysis was carried out with the package (SAS) ver.9.0 and the genetic data were analyzed with the GenAlEx software. The SL-4 and SL-8 genotypes (cultivated) and the native NAT-5 and NAT-6, are selected by the producer, who opts for the following characteristics: large, sweet, bittersweet or sour nanche, and yellow in color. Eight ISSRs microsatellite markers were found with which polymorphism is obtained, the cluster analysis formed four groups with the 15 nanche accessions, the number of alleles was seven maximums, the expected heterozygosity (He) was obtained in a range of 0.58-0.62, which is a measure of genetic diversity, these indices indicate high genetic diversity of nanche in the municipalities of Nayarit.

Resumen El nanche (Byrsonima crassifolia (L.) H.B.K) pertenece a la familia Malpighiaceae. El género Byrsonima tiene distribución noetropical y presenta gran diversidad con más de 100 especies. El objetivo del trabajo fue caracterizar la variabilidad morfológica y genética del fruto de nanche nativo. El trabajo se realizó durante el año 2020, se hizo una recolecta en huertos comerciales en San Lorenzo (SL’s), municipio de Ruiz, Nayarit, se realizó una caracterización morfológica, fisico-química y molecular, el análisis estadístico se efectuó con el paquete (SAS) ver.9.0 y los datos genéticos fueron analizados con el software GenAlEx. Los genotipos SL-4 y SL-8 (cultivados) y de los nativos NAT-5 y NAT-6, son de selección del productor, que optan por las siguientes características: nanche grande, dulce, agridulce o agrio, y de color amarillo. Se encontraron ocho marcadores microsatélites ISSRs con los cuales se obtiene polimorfismo, el análisis de conglomerados formo cuatro grupos con las 15 accesiones de nanche, el número máximo de alelos fue siete, la heterocigosis esperada (He) se obtuvo en un rango de 0.58-0.62, la cual es una medida de la diversidad genética, estos índices indican alta diversidad genética de nanche en los municipios de Nayarit.

Resumen Antecedentes: La tala selectiva en el Bosque Mesófilo de Montaña es una práctica frecuente y que puede impactar su regeneración y la composición genética de los árboles de generaciones sucesivas. El agrupamiento de individuos relacionados en el espacio, estructura genética espacial a escala fina (FSGS), puede desarrollarse debido a la reducción en el flujo genético y en el número de individuos reproductivos a escala local debido a la tala selectiva. Preguntas: ¿La FSGS difiere en sitios de bosque en regeneración con historia de tala selectiva comparado con un sitio sin tala selectiva? ¿La FSGS es mayor en plántulas y brinzales en comparación con juveniles y adultos? ¿Hay diferencias en la diversidad genética entre los estadios de vida y sitios? Especies de estudio: Magnolia iltisiana, un árbol endémico. Sitio y años de estudio: Reserva de la Biosfera Sierra de Manantlán, Jalisco, México. 2020 Métodos: Evaluamos la diversidad genética, estructura genética y la FSGS en plántulas, brinzales, juveniles y adultos a través del genotipado de 211 individuos con siete microsatélites en dos sitios en regeneración y uno conservado. Resultados: Encontramos FSGS significativa en sitios en regeneración sólo en plántulas y brinzales, mientras que no encontramos evidencia en el sitio conservado. No hubo diferencias en la diversidad genética y estructura entre los estadios de vida. Conclusiones: Nuestro estudio no sugiere efectos de la tala selectiva sobre la diversidad genética entre las condiciones contrastadas, y un patrón de FSGS sólo en los estadios tempranos para los sitios en regeneración en M. iltisiana.

Abstract Background: Selective logging is a frequent practice in the Tropical Montane Cloud Forest which can impact forest regeneration and the genetic makeup of successive generations of trees. The spatial clustering of genetically related individuals, fine-scale genetic structure (FSGS), can develop from the reduction of gene dispersal and the decrease in the number of reproductive individuals at the local scale due to selective logging. Questions: In regeneration sites with a history of selective logging, does FSGS differ from a site without such a history? Is FSGS stronger in seedlings and saplings relative to juveniles and adults? Is genetic diversity similar among life stages and sites? Studied species: Magnolia iltisiana an endemic tree. Study site and dates: Sierra de Manantlan Biosphere Reserve, Jalisco, Mexico. 2020. Methods: We evaluated genetic diversity, genetic structure, and FSGS across four life stages (seedlings, saplings, juveniles, and adults) by genotyping 211 individuals with seven nuclear microsatellite loci in two regeneration and one conserved site. Results: We found statistically significant FSGS in the two regeneration sites only for seedlings and saplings, while no evidence of FSGS was detected in the conserved site. No differences in genetic diversity estimates and structure were found among life stages. Conclusions: Our study does not suggest an effect of selective logging on genetic diversity on the contrasted conditions and an FSGS pattern only in the earlier stages of the regeneration sites in M. iltisiana.

SUMMARY In forest conservation, especially in a changing climate, it is essential to understand the intraspecific variation of multiple functional traits in a species. Accordingly, the analysis of Nothofagus alessandrii, an endangered species from Chile, could play an important role as a basis for future conservation of genetic resources and restoration of its forests. This study aims to analyze the variation of this species, considering its spatial distribution, variation in ecological distribution, populations associated with forest typology, genecological differentiation, variation in growth, and genetic variation. The information analyzed shows that these forests cover 314 hectares in a very restricted area, with little variation in environmental conditions, only showing variation in sun exposure and in fertility of soils. Although there are no differentiated growth zones, there is evidence that growth can vary. Genetic studies have shown varying levels of genetic diversity and differences between populations. Habitat fragmentation is emerging as the main threat to the survival of the species, as it can cause genetic isolation, inbreeding depression, genetic drift, and loss of adaptive potential. Based on existing research and the analysis carried out, a second experimental phase is proposed in order to select populations capable of adapting to changing environmental conditions due to climate change. It is important to take into account the microbiome of this species and establish efficient conservation and restoration measures for its forests. In summary, the analysis of the variation of N. alessandrii is crucial for the conservation of this species in a changing climate.

RESUMEN En la conservación de los bosques, especialmente en un escenario de cambio climático, es fundamental conocer la variación intraespecífica de múltiples rasgos funcionales en una especie. En este sentido, es importante analizar Nothofagus alessandrii, una especie altamente amenazada en Chile, para servir como base en futuros programas de conservación de recursos genéticos y restauración de sus bosques. Este trabajo tiene como objetivo analizar la variación de esta especie, considerando su distribución espacial, variación en la distribución ecológica, poblaciones asociadas a la tipología forestal, diferenciación genecológica, variación en el crecimiento y variación genética. La información analizada muestra que estos bosques abarcan 314 hectáreas en un área muy restringida, con poca variación en las condiciones ambientales, solamente en exposiciones de umbría y en suelos de baja fertilidad. Aunque no existen zonas diferenciadas de crecimiento, hay evidencia de que este puede variar. Los estudios genéticos han demostrado niveles variables de diversidad genética y diferencias entre poblaciones. La fragmentación del hábitat se perfila como la principal amenaza para la supervivencia de la especie, ya que puede provocar aislamiento genético, depresión endogámica, deriva genética y pérdida de potencial de adaptación. A partir de la investigación existente y al análisis realizado, se propone una segunda fase experimental para seleccionar poblaciones capaces de adaptarse a las nuevas condiciones ambientales, debido al cambio climático. Es importante tener en cuenta el microbioma de esta especie y establecer medidas eficientes de conservación y restauración de sus bosques. En resumen, el análisis de la variación de N. alessandrii es crucial para la conservación de esta especie en un escenario de cambio climático.

RESUMEN La cebadilla criolla (Bromus catharticus Vahl) es la gramínea forrajera nativa anual/bianual de clima templado de mayor importancia y difusión en la Argentina. Varios autores han estudiado la variabilidad fenotípica en caracteres morfofisiológicos en cultivares y poblaciones nativas de cebadilla criolla. Las primeras variedades cultivadas comerciales de cebadilla criolla, eran poblaciones heterogéneas a las que se las consideraba de mejor adaptación a toda la región de cultivo. Con los estudios de caracterización genética, agronómica y molecular de las poblaciones base de selección y del germoplasma conservado en el banco activo de INTA Pergamino, se contribuyó a conocer y conservar la diversidad genética disponible y al mismo tiempo, disponer de variabilidad genética utilizable en programas de mejoramiento. Los cultivares públicos más representativos considerados en este trabajo fueron: Pergamino Martín Fierro MAG, Fierro Plus INTA, Bar INTA 200, Rosalía INTA e INTA Calvu, en los que se desarrollaron paquetes tecnológicos asociados a la utilización en producción animal.

ABSTRACT The prairie grass (Bromus catharticus Vahl) is the annual/biennial native forage grass of temperate climates of most importance and diffusion in Argentina. Several authors have studied the phenotypic variability in morphophysiological characters in cultivars and native populations of prairie grass. The first commercial cultivars were heterogeneous populations that were considered the best adapted in the temperate region of Argentina. Genetic, agronomic and molecular characterization of the selection base populations and of the germplasm conserved in the active bank of INTA Pergamino, contributed to knowing and conserving the available genetic diversity and, at the same time, provided usable genetic variability in breeding. The most representative cultivars considered in this work were Pergamino Martín Fierro MAG; Fierro Plus INTA, Bar INTA 200, Rosalía INTA and INTA Calvu, in which technological packages associated with the utilization in animal production were developed.

Abstract Background: Abies hidalgensis is an endemic species from Hidalgo sate, Mexico, listed on the IUCN Red List in the VuD2 category. It has been confused with A. guatemalensis in some population where there is roundwood extraction reported as A. religiosa, which generates confusion on the taxonomic identity of species distributed and being harvested in Hidalgo. Questions and / or Hypotheses: What species or species of the Abies genus are distributed and harvested in Hidalgo, Mexico? What is the geographic distribution of A. hidalgensis? Studied species: Abies hidalgensis, A. religiosa. Study sites and dates: Municipalities of Acaxochitlan, Acoculco, Agua Blanca de Iturbide, Epazoyucan, Mineral del Monte, Pachuca, Singuilucan, Tenango de Doria, Tepeapulco and Zimapan, in Hidalgo state. Years 2015 to 2017. Methods: Eighteen morphological characters were analyzed by discriminant function analysis. Genetic differentiation was estimated from the analysis of three microsatellites developed for A. guatemalensis. Results: Abies hidalgensis is distributed to the southeast and A. religiosa is in the central-southern zone of Hidalgo. The distinctive morphological characters are: resin ducts, shape of the apex and morphological characters associated with the ovulate cones and seeds. Genetic studies showed that Abies sp. have greater divergence and genetic diversity with respect to A. hidalgensis and A. religiosa. The inbreeding coefficient is higher in A. religiosa. Conclusions: Two species of the Abies genus are distributed in the state of Hidalgo, Mexico.

Resumen Antecedentes: Abies hidalgensis es una especie endémica del estado de Hidalgo, México, adscrita en la Lista Roja de la IUCN en la categoría VuD2, que se ha confundido con A. guatemalensis en algunas poblaciones donde hay extracción de madera en rollo reportada como A. religiosa, lo que genera duda sobre las o la especie que se distribuyen y aprovechan en el estado de Hidalgo. Preguntas y / o Hipótesis: ¿Qué especie o especies del género Abies se distribuyen y aprovechan en Hidalgo, México?,¿Cuál es la distribución geográfica de A. hidalgensis? Especies de estudio: Abies hidalgensis, A. religiosa. Sitio y años de estudio: Municipios de Acaxochitlán, Acoculco, Agua Blanca de Iturbide, Epazoyucan, Mineral del Monte, Pachuca, Singuilucan, Tenango de Doria, Tepeapulco y Zimapán, en el estado de Hidalgo. Años 2015 a 2017. Métodos: Se analizaron 18 caracteres morfológicos mediante análisis de funciones discriminantes. Se estimó la diferenciación genética a partir del análisis de tres microsatélites nucleares desarrollados para A. guatemalensis. Resultados: Abies hidalgensis se distribuye al sureste y Abies religiosa en la zona centro-sur de Hidalgo. Los caracteres morfológicos distintivos son: canales resiníferos, forma del ápice, y caracteres morfológicos asociados a los conos ovulados y las semillas. Los estudios genéticos indican que Abies sp. muestra mayor divergencia y diversidad genética con respecto a A. hidalgensis y A. religiosa. El coeficiente de endogamia es mayor en A. religiosa. Conclusiones: En el estado Hidalgo se distribuyen dos especies del género Abies.

ABSTRACT The sheep populations of the Colombian Caribbean Region are characterized by having a high phenotypic heterogeneity mainly due to the use of Creole animals in crossbreeding with exotic breeds. The aim of this study was to estimate the genetic diversity and the population structure of sheep in this region. In total, 459 sheep from 26 farms in 19 municipalities were selected. The DNA samples were genotyped with the ovine low-density chip (15K). Analyses of molecular variance, genetic diversity and population structure were performed. At the phenotypic level, 65.8% of the sampled animals were assigned to the Criollo population, while 15.7% showed signs of introgression with other commercial breeds (mestizos). The populations presented a high degree of genetic diversity within individuals (90.6%) and low levels of genetic variation between populations (FST = 0.075). This low differentiation, together with the low levels of genetic variation between populations, could be attributed to a lack of selection pressure and the existence of gene flow (crossbreeding) between populations.

RESUMEN Las poblaciones ovinas de la Región Caribe colombiana se caracterizan por tener una alta heterogeneidad fenotípica debido principalmente al uso de animales criollos en cruzamiento con razas exóticas. El presente estudio tuvo como objetivo estimar la diversidad genética y la estructura poblacional de ovinos de esta región. Se seleccionaron 459 animales ovinos de 26 granjas de 19 municipios. Las muestras de ADN fueron genotipadas con el chip ovino de baja densidad (15K). Se realizaron análisis de varianza molecular, diversidad genética y estructura poblacional. A nivel fenotípico, se asignó el 65.8% de los animales muestreados a la población Criollo mientras que 15.7% presentaron señales de introgresión con otras razas comerciales (mestizos). Las poblaciones presentaron un alto grado de diversidad genética dentro de los individuos (90.6%) y bajos niveles de variación genética entre poblaciones (FST = 0.075). Esta baja diferenciación, junto con los bajos niveles de variación genética entre poblaciones podría atribuirse a una falta de presión de selección y a la existencia de un flujo genético (mestizaje) entre las poblaciones.

Resumen Las relaciones serológicas y la diversidad genética de cepas argentinas de grapevine leafroll associated virus 4 (GLRaV-4) fueron analizadas. El análisis filogenético de la cápside proteica (CP) conducido sobre las secuencias obtenidas mostró un agrupamiento de las primeras con GLRaV-4 raza 5, GLRaV-4 raza 6 y GLRaV-4 raza 9. El análisis evolutivo de las secuencias locales y las disponibles en bases de datos infirió eventos de recombi nación y sugirió que tanto los extremos C-terminal como N-terminal de la CP están bajo presión de selección purificante, pero la región N-terminal mostró siete sitios bajo presión de selección positiva, con una relación d N/d S cinco veces mayor que aquellas posiciones de la región C-terminal. La reactividad serológica contra anticuerpos monoclonales sustenta la probabilidad de ocurrencia de epitopes lineales en la región N-terminal inferida en el análisis evolutivo. Los resultados obtenidos reflejan un comportamiento evolutivo inusual de la CP y junto con la reactividad serológica de dicha proteína, permiten postular una significancia biológica de dicha variabilidad.

Abstract This research studied serological relationships and genetic diversity of Argentinean isolates of grapevine leafroll-associated virus-4 (GLRaV-4). Phylogenetic analysis of coat protein (CP) sequences from 19 local isolates revealed clustering with the previously described GLRaV-4 strain 5, strain 6, and strain 9 groups. Evolutionary sequence analysis of the obtained and database-available sequences showed evidence of recombination events. Additionally, both CP N- and C-terminal regions appeared to be under purifying selection, but the N-terminal region presented seven sites under positive selection, with a d N/d S ratio 5-fold greater than that of the C-terminal region. Serological reactivity against monoclonal antibodies supports a higher occurrence probability for linear epitopes in the N-terminal region, as inferred by the sequence analysis. The obtained results reflect an unusual evolutionary behavior of the CP that, together with protein serological reactivity, suggests biological significance of the observed variability.

Resumen El bovino Criollo Mixteco es un recurso genético poco explorado, pero de gran valor por su potencial para ser empleado en sistemas de producción respetables con el entorno y adaptables a las condiciones del mismo. La identificación y caracterización de este recurso local es un punto primordial para su conservación y mejora, es por esto que en el presente estudio se llevó a cabo el análisis de la diversidad y relaciones genéticas de la población de bovinos Criollos Mixtecos de Oaxaca, mediante el empleo de 19 marcadores de ADN microsatélites y 32 poblaciones bovinas de referencia, pertenecientes al consorcio BIOBOVIS de la Red CONBIAND. El número medio de alelos detectados fue de 8.8 ± 2.1 y el número efectivo de alelos estimado fue de 4.5 ± 1.2. La diversidad genética representada por los valores de heterocigosidad esperada (0.7700 ± 0.0682) y observada (0.7170 ± 0.0998), se encontró dentro del rango de estimadores obtenidos en estudios previos con poblaciones bovinas locales empleando marcadores microsatélites. El análisis de la estructura poblacional reveló una influencia predominante de germoplasma ibérico (Bos taurus). Se observa además una estrecha relación entre el Criollo Mixteco y el resto de poblaciones bovinas criollas mexicanas a excepción del Criollo Lechero Tropical.

Abstract The Mixteco Creole cattle is a little explored genetic resource, which, however, has great value due to its potential to be used in production systems that are respectful of the environment and adaptable to its conditions. The identification and characterization of this local resource is essential for its conservation and improvement. For this reason, in the present study it was carried out the analysis of the diversity and genetic relationships of the Mixteco Creole cattle population of Oaxaca, using 19 microsatellite DNA markers and 32 reference cattle populations belonging to the BIOBOVIS consortium of the CONBIAND Network. The mean number of alleles detected was 8.8 ± 2.1 and the estimated effective number of alleles was 4.5 ± 1.2. The genetic diversity represented by the expected (0.7700 ± 0.0682) and observed (0.7170 ± 0.0998) heterozygosity values was within the range of estimators obtained in previous studies with local cattle populations using microsatellite markers. An analysis of the population structure revealed a predominant influence of Iberian germplasm (Bos taurus). There is also a close relationship between the Mixteco Creole and the rest of the Mexican Creole cattle populations, with the exception of the Tropical Dairy Creole.