ABSTRACT Forest-to-agriculture conversion and soil management practices for soybean cropping are frequently performed in the Cerrado (Brazilian tropical savanna). However, the effects of these practices on the soil microbial communities are still unknown. We evaluated and compared the fungal community structure in soil from soybean cropland with soil under native Cerrado vegetation at different times of the year in the Tocantins State. Soil samples were collected in two periods after planting (December) and in two periods during the soybean reproductive growth stage (February). Concomitantly, soil samples were collected from an area under native Cerrado vegetation surrounding the agricultural area. The soil DNA was analyzed using a fingerprinting method termed Automated Ribosomal Intergenic Space Analysis (ARISA) to assess the fungal community structure in the soil. Differences in the fungal community structure in the soil were found when comparing soybean cropland with the native vegetation (R = 0.932 for sampling 1 and R = 0.641 for sampling 2). Changes in the fungal community structure after management practices for soybean planting in Cerrado areas were related to changes in soil properties, mainly in copper, calcium, and iron contents, cation exchange capacity, base saturation, and calcium to magnesium ratio. These results show the changes in the fungal community structure in the soil as an effect of agricultural soil management in Cerrado vegetation in the state of Tocantins.

Lipases produced by a newly isolated Sporidiobolus pararoseus strain have potential catalytic ability for esterification reactions. After production, the enzymatic extracts (conventional crude and precipitated, 'CC' and 'CP', and industrial crude and precipitated, 'IC' e 'IP') were partially characterized. The enzymes presented, in general, higher specificity for short chain alcohols and fatty acids. The precipitated extract showed a good thermal stability, higher than that for crude enzymatic extracts. The 'CC' and 'CP' enzymes presented high activities after exposure to pH 6.5 and 40 ºC. On the other hand, the 'IC' and 'IP' extracts kept their activities in a wide range of pH memory but presented preference for higher reaction temperatures. Preliminary studies of application of the crude lipase extract in the enzymatic production of geranyl propionate using geraniol and propionic acid as substrates in solvent-free system led to a reaction conversion of 42 ± 1.5%.

The lipase produced by a newly isolate Sporidiobolus pararoseus strain has potential catalysis ability for esterification reactions. In order to improve its synthetic activity, this work aimed at optimizing 'synthetic lipase' production by submerged fermentation of a conventional media based on peptone, yeast extract, NaCl and olive oil using experimental design technique. According to the results obtained in the first experimental design (2(4-1)), yeast extract and NaCl concentrations were tested to further optimization by response surface methodology. The maximum 'synthetic lipase' activity obtained was 26.9 U/mL in the optimized media (5.0, 6.8, 7.0 and 1.0% (wt/v) of peptone, yeast extract, NaCl and olive oil, respectively), representing a 6.36-fold increase compared to the initial medium. The time course of 'synthetic lipase' production in the optimized condition was evaluated in terms of synthetic activity, protease activity, biomass and total carbon and the maximum synthetic activity was observed during the stationary phase of growth.

O objetivo deste trabalho foi avaliar a diversidade de genes catabólicos quanto à degradação bacteriana de hidrocarbonetos aromáticos, em solos de terra preta de índio (TPI) e seu "biochar" (BC). Análises da diversidade funcional em solos TPI podem fornecer dados sobre como os microrganismos adaptativos podem influenciar a fertilidade dos solos e qual é sua participação nos ciclos biogeoquímicos. Para isso, foram construídas bibliotecas que continham o gene que codifica a subunidade alfa de dioxigenases aromáticas (α-ARHD gene bacteriano), no total de 800 clones. Estas bibliotecas foram preparadas a partir de amostras de um solo TPI localizado na Estação Experimental do Caldeirão, sob dois diferentes usos da terra - floresta secundária (SF) e agricultura (AG) - e de "biochar" (SF_BC e AG_BC, respectivamente). Os estimadores de heterogeneidade apresentaram maior diversidade nas bibliotecas BC, e o diagrama de Venn mostrou mais famílias proteicas operacionais (OPC) únicas na biblioteca SF_BC do que o solo TPI, o que indica que processos metabólicos específicos podem ocorrer no "biochar". A análise filogenética mostrou dioxigenases ainda não identificadas em solos de TPI. Bibliotecas para o gene funcional da subunidade alfa de dioxigenases aromáticas (ARHD) obtidas do "biochar", mostraram maiores índices de diversidade do que as da TPI sob floresta secundária ou agricultura.

The objective of this work was to evaluate the catabolic gene diversity for the bacterial degradation of aromatic hydrocarbons in anthropogenic dark earth of Amazonia (ADE) and their biochar (BC). Functional diversity analyses in ADE soils can provide information on how adaptive microorganisms may influence the fertility of soils and what is their involvement in biogeochemical cycles. For this, clone libraries containing the gene encoding for the alpha subunit of aromatic ring-hydroxylating dioxygenases (α-ARHD bacterial gene) were constructed, totaling 800 clones. These libraries were prepared from samples of an ADE soil under two different land uses, located at the Caldeirão Experimental Station - secondary forest (SF) and agriculture (AG) -, and the biochar (SF_BC and AG_BC, respectively). Heterogeneity estimates indicated greater diversity in BC libraries; and Venn diagrams showed more unique operational protein clusters (OPC) in the SF_BC library than the ADE soil, which indicates that specific metabolic processes may occur in biochar. Phylogenetic analysis showed unidentified dioxygenases in ADE soils. Libraries containing functional gene encoding for the alpha subunit of the aromatic ring-hydroxylating dioxygenases (ARHD) gene from biochar show higher diversity indices than those of ADE under secondary forest and agriculture.

O conhecimento acerca da ecologia de comunidades microbianas do solo em relevantes escalas espaciais é primordial na ampla região da Amazônia devido às mudanças de uso da terra. Neste estudo, a diversidade do Domínio Archaea (estrutura da comunidade) e Archaea oxidadora de amônia (riqueza e composição da comunidade) foi investigada usando-se técnicas moleculares em solos sob diferentes sistemas de uso da terra na Amazônia ocidental brasileira. Amostras de solo foram coletadas em dois períodos distintos de elevada intensidade pluviométrica (março de 2008 e janeiro de 2009) em Cambissolos sob floresta primária, floresta secundária (5 a 20 anos de regeneração), sistemas agrícolas de povos indígenas e pastagem. A eletroforese em gel com gradiente desnaturante de produtos amplificados pela reação em cadeia da polimerase (PCR-DGGE) usando o gene 16S rRNA como marcador filogenético indicou que as estruturas de comunidades de Archaea em solos sob cultivo agrícola e pastagem são diferentes daquelas encontradas em solos sob floresta primária. Estas, por sua vez, foram mais similares às estruturas de comunidades em solos sob floresta secundária. A análise de sequências de bandas excisadas de géis de DGGE revelou a presença de organismos dos filos Crenarchaeota e Euryarchaeota. Com base em análise de bibliotecas de clones do gene que codifica para a subunidade A da enzima amônia monoxigenase (amoA ) de Archaea (306 sequências), os índices de Shannon-Wiener e Simpson mostraram maior diversidade de Archaea oxidadora de amônia em solos sob floresta primária (H' = 2,1486; D = 0,1366), seguido por menor diversidade em solos sob pastagem (H' = 1,9629; D = 0,1715), cultivo agrícola (H' = 1,4613; D = 0,3309) e floresta secundária (H' = 0,8633; D = 0,5405). Todos os insertos clonados foram similares a clones do gene amoA de Crenarchaeota (identidade >95 %) previamente detectados em solos e sedimentos; e distribuíram-se em três agrupamentos filogenéticos principais. Os resultados indicaram que a estrutura de comunidades de Archaea e a diversidade de Archaea oxidadora de amônia na Amazônia ocidental são afetadas em solos sob sistemas agrícolas de povos indígenas e pastagem.

The study of the ecology of soil microbial communities at relevant spatial scales is primordial in the wide Amazon region due to the current land use changes. In this study, the diversity of the Archaea domain (community structure) and ammonia-oxidizing Archaea (richness and community composition) were investigated using molecular biology-based techniques in different land-use systems in western Amazonia, Brazil. Soil samples were collected in two periods with high precipitation (March 2008 and January 2009) from Inceptisols under primary tropical rainforest, secondary forest (5-20 year old), agricultural systems of indigenous people and cattle pasture. Denaturing gradient gel electrophoresis of polymerase chain reaction-amplified DNA (PCR-DGGE) using the 16S rRNA gene as a biomarker showed that archaeal community structures in crops and pasture soils are different from those in primary forest soil, which is more similar to the community structure in secondary forest soil. Sequence analysis of excised DGGE bands indicated the presence of crenarchaeal and euryarchaeal organisms. Based on clone library analysis of the gene coding the subunit of the enzyme ammonia monooxygenase (amoA) of Archaea (306 sequences), the Shannon-Wiener function and Simpson's index showed a greater ammonia-oxidizing archaeal diversity in primary forest soils (H' = 2.1486; D = 0.1366), followed by a lower diversity in soils under pasture (H' = 1.9629; D = 0.1715), crops (H' = 1.4613; D = 0.3309) and secondary forest (H' = 0.8633; D = 0.5405). All cloned inserts were similar to the Crenarchaeota amoA gene clones (identity > 95 %) previously found in soils and sediments and distributed primarily in three major phylogenetic clusters. The findings indicate that agricultural systems of indigenous people and cattle pasture affect the archaeal community structure and diversity of ammonia-oxidizing Archaea in western Amazon soils.

A presença de altos teores de glicosídeos cianogênicos pode predispor a planta ao secamento de painel. O objetivo deste trabalho foi verificar a influência do estado nutricional na formação dos glicosídeos cianogênicos na seringueira, utilizando dois experimentos: a) jardim clonal com copa de híbridos de Hevea pauciflora e H. guianensis var. marginata (CPAA C 01) e de H. rigidifolia (CPAA C 81); e b) viveiro com H. brasiliensis. No jardim clonal foram coletadas ao acaso, folhas de 23 plantas, enquanto no viveiro, foi realizado experimento em delineamento inteiramente casualisado com cinco repetições, com tratamentos em esquema fatorial 2 x 4, com duas doses de nitrogênio - N (0,8 e 1,6%, fonte: uréia) e quatro de manganês - Mn (0, 10, 50 e 100 mg kg-1). Na seringueira, independentemente da idade e da espécie de Hevea, os teores foliares de N, Mn e clorofila tiveram correlação positiva com o HCNp das folhas novas e diagnóstico, podendo assim serem utilizados em futuros processos de seleção. Em concentrações baixas de N (0,8%), as doses de Mn influenciaram a absorção de N, P, K, Ca, S, Fe e Mn pelas plantas de seringueira (Hevea brasiliensis), na fase de viveiro.

The presence of high cyanogenic glycosides concentrations may predispose plant to the tapping panel dryness (TPD). The aim of this work was to evaluate the effect of nutritional status in formation of cyanogenic glycosides in rubber tree. Two experiments were carried out: a) clonal nursery with crow clones hybrids of Hevea pauciflora x H. guianensis var. Marginata (CPAA C 01) and H. rigidifolia (CPAA C 81); and b) nursery with H. brasiliensis. In clonal nursery, twenty three foliar samples were collected, while in nursery, the experiment was carried out using a completely randomized design in factorial scheme 2 x 4 with five replicates. Two nitrogen doses (0.8 and 1.6%, urea as source) and four manganese doses (0, 10, 50 and 100 mg kg-1, MnSO4 as source) were used. Regardless of age and species of Hevea, only the N, chlorophyll and Mn concentrations showed relationship with the HCNp in young leaves. These variables should be used in future selection processes. At low N (0.8%) concentration, the Mn doses influenced the N, P, K, Ca, S, Fe and Mn uptake by rubber tree (Hevea brasiliensis) in the nursery condition.

Os sideróforos provenientes de Xylella fastidiosa de videiras foram investigados. Tais metabólitos seqüestram ferro, um elemento essencial, do hospedeiro, o que os torna um potencial fator de patogenicidade. Em um meio de cultura em placa com limitação de ferro, tais sideróforos foram detectados pela reação com o complexo cromoazurol S (CAS). Diferentes métodos de análise instrumentais foram utilizados para caracterização dos sideróforos, como: cromatografia de afinidade por metal imobilizado (IMAC), cromatografia micelar eletrocinética capilar (MEKC) e espectrometria de massas com ionização por electrospray (ESI-MS). Os resultados obtidos confirmaram a produção de sideróforos. A extração do(s) composto(s) por IMAC com Fe3+ imobilizado foi uma etapa importante. O(s) sideróforo(s) não foi separado por eletroforese capilar de zona, indicando sua neutralidade sob os pHs investigados. As análises por MEKC apresentaram um pico diferente (quando comparadas à análise do controle), com caráter levemente hidrofóbico. A espectrometria de massas mostrou que os compostos alvos podem ter uma massa molecular relativa dentro da esperada para sideróforos, como: 875, 1004 e 1092 Da.

Siderophore molecules from grapevine Xylella fastidiosa were investigated. Such metabolites sequester iron, an essential element, from the host, making them a potential factor of pathogenicty. In an iron-limited medium, siderophores were detected in culture plates of X. fastidiosa containing the complex Chromeazurol S (CAS). A combination of different instrumental analyses was used for siderophore(s) characterization, such as: immobilized metal affinity chromatography (IMAC), micelar electrokinetic capillary chromatography (MEKC) and electrospray-mass spectrometry (ESI-MS). The results show that grapevine X. fastidiosa produced siderophore(s), as confirmed by the CAS plate assay. The extraction of the compound(s) using IMAC with immobilized Fe3+ was important for analyte purification. The chelator was not separated by capillary zone electrophoresis, indicating the possibility of a neutral compound under the investigated pHs. MEKC runs presented a different peak (when compared to the control analysis) which represented a slightly hydrophobic compound. Mass spectrometry showed that the compound(s) may have a relative molecular mass within the expected range for siderophore molecules, such as 875, 1004 and 1092 Da.

A Araucaria angustifolia é uma importante conífera brasileira, mas encontra-se ameaçada de extinção. Levantaram-se dados sobre a diversidade de fungos micorrízicos arbusculares (FMAs) em florestas de Araucaria angustifolia, visando a discriminar entre as comunidades de FMAs associadas com ecossistemas natural, implantado e impactado pela ação antrópica. Foram selecionados três ecossistemas representativos da região de Campos do Jordão (estado de São Paulo), sendo: (i) Floresta nativa com predominância de araucária, em clímax, sem interferência antrópica (FN); (ii) Floresta de araucária introduzida em 1959 (RE); e (iii) Floresta de araucária introduzida em 1958, submetida a uma queima acidental em julho de 2001 (RF). As coletas de solo rizosférico foram realizadas, na profundidade 0-20 cm, ao redor de cada árvore e a 2 m do tronco, nos meses de maio e outubro de 2002. Determinaram-se a densidade, diversidade, esporulação, colonização radicular e realizou-se a identificação morfológica dos FMAs. Os índices ecológicos R (Riqueza de espécies), Is (índice de dominância de Simpson) e H (índice de diversidade de Shannon) foram calculados. Os dados foram submetidos à análise univariada (two-way ANOVA) e análise de correspondência (AC). Considerando os dois períodos de amostragem e os três ecossistemas estudados, foram identificadas 26 espécies de FMAs, sendo os gêneros Acaulospora e Glomus os mais freqüentes. Não houve diferenças para R, Is e H entre as três áreas estudadas. A AC demonstrou que houve separação espacial entre as três áreas e quais foram às espécies de FMAs preferencialmente associadas em cada área.

Araucaria angustifolia is an important Brazilian conifer, but it is endangered of extinction due to excessive logging. The objective of the present case study was to survey data on the diversity of AMF in Araucaria angustifolia forests, and to learn whether it is possible to discriminate between the AMF communities associated with natural, introduced, and impacted-by-anthropogenic-action ecosystems. Three ecosystems representative of the Campos do Jordão (São Paulo State, Brazil) region were selected, as follows: (i) a native climax forest, with predominance of Araucaria trees, without anthropogenic interference (NF), (ii) Araucaria forest introduced in 1959 (RE), and (iii) Araucaria forest introduced in 1958, submitted to accidental fire in July 2001 (RF). Sampling of rhizosphere soil was performed at a 0-20 cm depth around each Araucaria tree, and 2 m from the trunk, in the months of May and October, 2002. AMF spores were separated from the soil, counted, and taxonomically identified, while the roots were evaluated for mycorrhizal colonization. The ecological indices R (Richness), Is (Simpson's dominance index) and H (Shannon's diversity index) were calculated. All the data were submitted to univariate (two-way ANOVA) and correspondence analysis (CA). Considering both samplings and the three areas, twenty-six AMF species were found, distributed among five genera, Acaulospora and Glomus being the most frequent ones. There were no differences among the three areas for R, Is, and H. CA demonstrated that there is a spatial separation among the three areas, and the AMF that preferentially associated with each area.

Um protocolo simples, rápido e fácil foi padronizado para extração de DNA total da bactéria Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli. O DNA obtido por esse método foi de ótima qualidade e quantidades suficientes para reações de RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) com "primers" randômicos e PCR (Polymerase Chain Reaction) com "primers" do gene de hipersensibilidade e patogenicidade (hrp). O DNA obtido não apresentou nenhuma contaminação por proteínas ou carboidratos, sendo a razão 260 nm/ 380nm entre 1,7 a 1,8. O agrupamento do gene hrp (reação de hipersensibilidade e patogenicidade) é requerido através do patogeno bacteriano de planta para produzir sintomas nos hospedeiros suscetíveis e reação hipersensível em hospedeiros resistentes é encontrado em diferentes bactérias e também em Xanthomonas campestris pv. vesicatoria (9). Os primers RST21 e RST22 (9) foram usados para ampliar o gene de hrp de nove diferentes isolados de Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli, sendo oito de Botucatu, São Paulo, Brasil, e um de "Davis" (EUA). Foi encontrado o produto de PCR amplificado em todos os isolados testados e todos eram patogênicos ao feijão. A presença do gene em isolados patogênicos de Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli foi discutido geneticamente.

A simple, quick and easy protocol was standardized for extraction of total DNA of the bacteria Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli. The DNA obtained by this method had high quality and the quantity was enough for the Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) reactions with random primers, and Polymerase Chain Reaction (PCR) with primers of the hypersensitivity and pathogenicity gene (hrp). The DNA obtained was free of contamination by proteins or carbohydrates. The ratio 260nm/380nm of the DNA extracted ranged from 1.7 to 1.8. The hrp gene cluster is required by bacterial plant pathogen to produce symptoms on susceptible hosts and hypersensitive reaction on resistant hosts. This gene has been found in different bacteria as well as in Xanthomonas campestris pv. vesicatoria (9). The primers RST21 and RST22 (9) were used to amplify the hrp gene of nine different isolates of Xanthomonas axonopodis pv. phaseoli from Botucatu, São Paulo State, Brazil, and one isolate, "Davis". PCR amplified products were obtained in all isolates pathogenic to beans.

O conhecimento sobre a distribuição de espécies de fungos micorrízicos arbusculares (FMAs) ainda é restrito e as variações morfológicas observadas em isolados de uma mesma espécie podem proporcionar subsídios adicionais para o entendimento dos caracteres usados na taxonomia do grupo. Os objetivos deste trabalho foram implementar dados sobre a ocorrência de Acaulospora koskei Blaszk. e Acaulospora bireticulata Rothwell & Trappe encontradas em áreas de Floresta de Araucaria angustifolia em São Paulo, Brasil, bem como comparar a descrição dessas espécies com a de outras similares.

Our knowledge of species distribution in arbuscular mycorrhizal fungi (AMF) is still limited and morphological variations found in isolates of one species may provide additional insight for understanding the characters used in the taxonomy of this group. The aims of this work were to expand biogeographical data regarding Acaulospora koskei Blaszk. and Acaulospora bireticulata Rothwell & Trappe, both found in an Araucaria Forest in São Paulo state, Brazil, as well as to compare the descriptions of these species with those of other similar AMF.

O objetivo deste trabalho foi estudar a produção de sideróforos pelas bactérias endofíticas Methylobacterium spp., que ocupam o mesmo nicho ecológico que Xylella fastidiosa subsp. pauca (Xfp), em plantas cítricas. A produção de sideróforos, pelas linhagens de Methylobacterium, foi testada por meio do ensaio de cromoazarol-ágar (chromeazurol agar assay-CAS), teste de Csáky (tipo hidroxamato) e do teste de Arnow (tipo catecol). Além disso, a habilidade de Xfp em utilizar sideróforos produzidos por bactérias endofíticas, como fonte de ferro, in vitro, foi avaliada. Todas as 37 linhagens de Methylobacterium spp. testadas foram positivas para a produção de sideróforos, pelo teste CAS-ágar. Methylobacterium spp. foram capazes de produzir sideróforos do tipo hidroxamato, mas não do tipo catecol. O crescimento in vitro de Xfp foi estimulado pela presença de sideróforos no sobrenadante de Methylobacterium mesophilicum endofítica.

The objective of this work was to study the production of siderophores by endophytic bacteria Methylobacterium spp., which occupy the same ecological niche as Xylella fastidiosa subsp. pauca (Xfp) in citrus plants. The siderophore production of Methylobacterium strains was tested according to chromeazurol agar assay test (CAS), Csáky test (hydroxamate-type) and Arnow test (catechol-type). In addition, the ability of Xfp to use siderophores, in vitro, produced by endophytic bacteria as source of iron, was evaluated. All 37 strains of Methylobacterium spp. tested were CAS-positive for siderophore production. Methylobacterium spp. produced hydroxamate-type, but not catechol-type siderophores. In vitro growth of Xfp was stimulated by the presence of supernatant siderophores of endophytic Methylobacterium mesophilicum.

O pinheiro brasileiro, Araucaria angustifolia (Bert.) O. Ktze é uma espécie arbórea ameaçada de extinção, quase exterminada pela exploração descontrolada de madeira. Essa espécie demonstra alta dependência de fungos micorrízicos arbusculares (FMA), de grande importância para a estabilidade do ecossistema e manutenção da biodiversidade. Avaliou-se a colonização radicular, a densidade e a diversidade de esporos de FMA em duas florestas com araucária, distintas no processo sucessional, em duas épocas de amostragem: maio e outubro. As florestas, localizadas no Parque Estadual Turístico do Alto do Ribeira (PETAR), correspondem a 1) Floresta Ombrófila Mista nativa (FN), em estágio clímax, sem sinais de interferência antrópica, e a 2) floresta de araucária plantada em 1987 (R), submetida a pastoreio. Foram avaliados: colonização radicular, número de esporos e riqueza de espécies de FMA e calculados os índices de dominância de Simpson (Is) e de diversidade de Shannon (H). A colonização radicular não diferiu entre as duas comunidades na primeira amostragem (maio). Na segunda amostragem (outubro), houve maior colonização radicular na floresta nativa do que na floresta plantada e a colonização radicular foi mais intensa em comparação com as coletas de maio. No total, foram encontradas 27 espécies de FMA, com maior número de esporos em FN em relação a R. A análise canônica discriminante (ACD) indicou que o índice de diversidade de Shannon foi o atributo ecológico que mais contribuiu para distinguir os dois ecossistemas florestais, com altos valores de H para FN em relação a R. ACD mostrou ser importante ferramenta para o estudo dos atributos ecológicos.

Araucaria angustifolia (Bert.) O. Ktze. is an endangered Brazilian coniferous tree that has been almost exterminated in the native areas because of uncontrolled wood exploitation. This tree has been shown to be highly dependent on arbuscular mycorrhizal fungi (AMF) and, therefore, AMF may be essential for forest sustainability and biological diversity. Root colonization, density and diversity of AMF spores were assessed in two Araucaria forest stands at the State Park of Alto Ribeira (PETAR), at two sampling dates: May and October. A comparison was made between a mature native stand composed of Araucaria trees mixed into a variety of tropical trees and shrubs, without any sign of anthropogenic interference (FN) and an Araucaria stand planted in 1987 (R), which has been used as a pasture. Assessments included percent root colonization, AMF spore numbers and species richness, Simpson's dominance index (Is), and Shannon's diversity index (H). Mycorrhizal root colonization did not differ between ecosystems in May. In October, however, the native stand (FN) presented a higher colonization than the planted forest (R), and the root colonization was more intense than in May. When considering both sampling periods and forests, 27 species of AM fungi, with higher numbers of spores in FN than in R were found. Canonical discriminant analysis (CDA) indicated Shannon's diversity index as the ecological attribute that contributed the most to distinguish between forest ecosystems, with higher value of H in FN in relation to R. CDA showed to be a useful tool for the study of ecological attributes.

O objetivo deste trabalho foi avaliar o efeito da aplicação do benzotiadiazole (BTH) e do silício sobre o controle da doença causada pela Xylella fastidiosa subsp. pauca em Nicotiana tabacum. Os experimentos foram conduzidos em condições de casa de vegetação, onde as plantas de N. tabacum receberam inoculação de X. fastidiosa (linhagem 9a5c) com 4,7x10(7) UFC mL-1. Os tratamentos consistiram da pulverização das folhas, com soluções de BTH (0,6 e 1,2 mM), e aplicação ao solo de soluções de metassilicato de sódio (2 e 4 µM de Si). Cinco plantas foram utilizadas, por tratamento. Plantas de N. tabacum tratadas com BTH não demonstraram redução de sintomas da bacteriose. Entretanto, plantas tratadas com metassilicato de sódio, sim. A indução de resistência pelo Si poderá ser útil no controle da clorose variegada dos citros.

The objective of this work was to evaluate the effects of benzothiadiazole (BTH) and silicon applications on the control of the disease caused by Xylella fastidiosa subsp. pauca on Nicotiana tabacum. The experiments were carried out under greenhouse conditions, where X. fastidiosa (9a5c strain) containing 4.7x10(7) CFU mL-1 was inoculated in N. tabacum plants. The BTH and silicon treatments consisted of BTH (0.6 and 1.2 mM) application to plant leaves, and sodium metasilicate solution (2 and 4 µM of Si) application to soil. Plants of N. tabacum treated with BTH showed no reduction in symptoms. However, plants treated with sodium metasilicate (source of Si) were rendered asymptomatic. Disease resistance induced by Si can be useful to control citrus variegated chlorosis.

Linhagens de Xylella fastidiosa de diferentes hospedeiros (café, uva, amêndoa, ameixa, etc.) foram caracterizados analisando as sequências de nucleotídeos do espaço intergênico 16S-23S (ITS). Os métodos atuais para o sequenciamento da região ITS produzem fragmentos parciais das sequências que não contribuem com informações significantes. Em vista disso, novos primers foram desenhados a fim de obter uma sequência completa e facilitar o sequenciamento. A sequencia completa da região ITS de 08 linhagens de X. Fastidiosa foram amplificadas via PCR, sequenciadas e comparadas com outras 52 sequencias depositadas no GenBank. Os resultados revelaram um alto nível de variação sendo maior que os níveis encontrados quando se utiliza o gene 16S para este tipo de análise, com valores variando entre 0.79 a 1.00. O dendograma baseado em dados de similaridade agrupou as linhagens de X. fastidiosa em 5 grupos principais. Duas sequencias codificadoras de tRNA's foram encontradas (tRNAala e tRNAile) e mostram-se conservadas entre as linhagens analisadas com pouca diferença entre a composição nucleotídica.

Strains of Xylella fastidiosa from several hosts (coffee, citrus, grape, almond, oleander, peach, plum, etc.) were characterized by analyzing the content of the nucleotide sequences of 16S-23S rDNA (coding for a small subunit ribosomal RNA) spacer region (ITS). Current methods for sequencing the ITS region yields partial sequences that do not contribute with significant information. According to this fact, new primers have been designed in order to obtain a complete sequence and facilitate the sequencing. The complete 16S-23S sequences from 08 strains were amplified through PCR using the primers designed in our lab. The 16S-23S sequences obtained were compared with 52 others sequences entries in GenBank database. The results revealed a higher level of variation than that found in 16S gene sequences, with similarity values ranging from 0.79-1.00. The dendogram based on similarity data revealed 5 main groups. This spacer sequence contains two genes for tRNA (tRNAala and tRNAile). The sequence analysis of the tRNA content showed a conserved region with a few differences in the nucleotide composition.

Pleiotropic drug resistance (PDR) proteins, a subfamily of the ATP-binding cassette (ABC) transporters, have been recently shown to play a role in plant defense against biotic and abiotic stresses. However, nothing is known about their expression in citrus. To investigate the occurrence of PDR homologues in citrus species, we have surveyed EST sequences from different tissues and conditions of the Citrus Expressed Sequence Tags (CitEST) database, through sequence similarity search analyses and inspections for characteristic PDR domains. Multiple sequence alignments, prediction of transmembrane topology and phylogenetic analysis of PDR-like proteins were additionally performed. This study allowed the identification of nine putative proteins showing characteristic PDR features in citrus species under various conditions, which may indicate a potential correlation between PDRs and stress and metabolism of citrus plants. Moreover, a tissue-specific putative PDR-like protein was found in sweet orange fruits. To our knowledge, this is the first report regarding the identification of citrus ESTs encoding PDR-like proteins as well as the first to identify a putative full ABC transporter with specific expression in fruits.