Background: Except for influenza pandemics, different observational studies have failed to demonstrate differences in mortality between various etiologies in adult patients hospitalized for respiratory infections. Aim: To compare clinical and mortality differences between different viral pathogens associated with severe acute respiratory infections (SARI) in hospitalized adults. Material and Methods: One-year prospective study in a sentinel center. We included 132 patients with SARI hospitalized for any of the nine viruses under study by PCR. Clinical variables were compared, excluding cases of coinfection. Results: A viral coinfection was identified in 12% and influenza infection in 56% of cases. Eighty percent of patients were aged ≥ 65 years, with a high frequency of comorbidities, 27% were bedridden. Twenty four percent were admitted to critical care units, 20% required ventilatory assistance and 16% died. Cases occurred throughout the year, with an expected seasonal peak between autumn and spring and a predominance of infections not associated with influenza during summer months. In the multivariate analysis, only being bedridden was significantly associated with mortality at discharge (Odds ratio 23.46; 95% confidence intervals 3.33-165.12, p < 0.01), without association with age, comorbidity, viral pathogen involved, laboratory parameters, clinical presentation or CURB65 score. No major clinical dissimilarities were found between different viral pathogens. Conclusions: In our series of patients, mostly elderly, only bedridden status was significantly associated with mortality at discharge in patients hospitalized for SARI. Viral pathogens were not relevant.

Los factores del huésped son más importantes que el tipo viral para predecir el desenlace en pacientes hospitalizados por infecciones respiratoria aguda grave. Exceptuando las pandemias de influenza, diferentes estudios observacionales no han logrado demostrar diferencias en mortalidad entre diferentes patógenos en pacientes adultos hospitalizados por infecciones respiratorias. Objetivo: Comparar diferencias clínicas y en mortalidad entre diferentes patógenos virales asociados a infección respiratoria aguda grave (IRAG) en adultos hospitalizados. Método: Estudio prospectivo durante un año en un centro centinela. Se incluyeron casos de IRAG hospitalizados por alguno de los 9 virus bajo estudio por RCP. Se compararon variables clínicas y desenlace. Resultados: Ingresaron 132 pacientes con IRAG. Se identificó coinfección viral en 12,1% e infección por influenza en 56,1%. La mayor parte era de la tercera edad (80,3%) con una alta frecuencia de comorbilidad y 27,3% estaba postrado. Veintitres coma cinco por ciento ingresó a unidad de cuidados críticos, 19,7% requirió asistencia ventilatoria y 15,9% fallecieron. Los casos ocurrieron todo el año, con un aumento estacional esperado entre otoño y primavera y predominio de infecciones no asociadas a influenza en verano. En el análisis multivariado, sólo la postración se asoció significativamente a mortalidad al egreso (ORa 23,46 IC95 3,33-165,12, p = 0,002), sin asociación con la edad, comorbilidad, patógeno viral involucrado, parámetros de laboratorio, presentación clínica o puntuación CURB65. No se encontraron discordancias clínicas mayores entre diferentes agentes virales. Conclusiones: En nuestra serie de pacientes, mayoritariamente de la tercera edad, sólo la postración se asoció significativamente a mortalidad al egreso en pacientes hospitalizados por IRAG. El patógeno viral no resultó ser relevante.

RESUMO Objetivo Descrever as características clínicas de pacientes adultos com infecção respiratória aguda grave (SARI) associada ao vírus da influenza e analisar os subtipos virais identificados em amostras coletadas destes pacientes, os recursos hospitalares empregados no tratamento clínico, a evolução clínica e os fatores de risco clínicos associados a um desfecho fatal, a partir de dados observacionais da rede de vigilância de SARI (SARInet) no Chile. Métodos Foram identificados os adultos hospitalizados com SARI associada a influenza em um hospital-sentinela de vigilância de SARI, em Santiago, de 1o de julho de 2011 a 31 de dezembro de 2015. A ocorrência de influenza foi confirmada em amostras respiratórias em todos os casos com a reação em cadeia da polimerase via transcriptase reversa (RT-RCP). Resultados Ao todo, 221 pacientes (idade média de 74,1 anos) foram hospitalizados com SARI associada a influenza no período de estudo. Nesta coorte, 91,4% apresentavam fatores de risco para complicação e 34,3% haviam sido vacinados na última campanha de vacinação. Pneumonia foi a manifestação clínica mais frequente, ocorrendo em 57,0% da coorte. Outras manifestações foram doença gripal, bronquite crônica exacerbada, insuficiência cardíaca descompensada e crise asmática. Os casos estiveram distribuídos ao longo do ano, com pico epidêmico no outono–inverno. Houve circulação simultânea dos vírus da influenza A (H1N1pdm09 e H3N2) e B. Leitos de terapia intensiva foram necessários em 26,7% da coorte e suporte ventilatório, em 19,5%. Na análise multivariada, quatro fatores importantes associados à mortalidade hospitalar foram identificados: estar restrito ao leito (odds ratio ajustado [ORaj] 22.3; intervalo de confiança de 95% [IC 95%] 3.0–164); ser admitido na unidade de terapia intensiva (ORaj 8.9, IC 95% 1.4 4–55); relação Pa02/Fi02 <250 (ORaj 5.8; IC 95% 1.02–33) e aumento da creatinina sérica (>1 mg/dl) (ORaj 5.47; IC 95% 1.20–24). A vacinação sazonal contra influenza foi identificada como importante fator de proteção (ORaj 0.14; IC 95% 0.021–0.90). Conclusões A SARI associada a influenza acometeu sobretudo pacientes idosos com doenças preexistentes. A maioria dos pacientes evoluiu com insuficiência respiratória e mais de um quarto precisou de cuidados intensivos. O quadro clínico foi variável. Morte foi associada às características do hospedeiro e problemas relacionados à doença. A vacinação teve efeito protetor e o tipo viral não influiu no desfecho.

ABSTRACT Objective To 1) describe clinical characteristics of adult patients in Chile with severe acute respiratory infections (SARI) associated with influenza viruses, and 2) analyze virus subtypes identified in specimens collected from those patients, hospital resources used in clinical management, clinical evolution, and risk factors associated with a fatal outcome, using observational data from the SARI surveillance network (SARInet). Methods Adults hospitalized from 1 July 2011 to 31 December 2015 with influenza-associated SARI at a SARI sentinel surveillance hospital in Santiago were identified and the presence of influenza in all cases confirmed by reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR), using respiratory samples. Results A total of 221 patients (mean age: 74.1 years) were hospitalized with influenza-associated SARI during the study period. Of this study cohort, 91.4% had risk factors for complications and 34.3% had been vaccinated during the most recent campaign. Pneumonia was the most frequent clinical manifestation, occurring in 57.0% of the cohort; other manifestations included influenza-like illness, exacerbated chronic bronchitis, decompensated heart failure, and asthmatic crisis. Cases occurred year-round, with an epidemic peak during autumn–winter. Both influenza A (H1N1pdm09 and H3N2) and B virus co-circulated. Critical care beds were required for 26.7% of the cohort, and 19.5% needed ventilatory assistance. Multivariate analysis identified four significant factors associated with in-hospital mortality: 1) being bedridden (adjusted odds ratio (aOR): 22.3; 95% confidence interval (CI): 3.0–164); 2) admission to critical care unit (aOR: 8.9; CI: 1.44–55); 3) Pa02/Fi02 ratio < 250 (aOR: 5.8; CI: 1.02–33); and 4) increased serum creatinine concentration (> 1 mg/dL) (aOR: 5.47; CI: 1.20–24). Seasonal influenza vaccine was identified as a significant protective factor (aOR: 0.14; CI: 0.021–0.90). Conclusions Influenza-associated SARI affected mainly elderly patients with underlying conditions. Most patients evolved to respiratory failure and more than one-quarter required critical care beds. Clinical presentation was variable. Death was associated with host characteristics and disease-associated conditions, and vaccine was protective. Virus type did not influence outcome.

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Non-typhoidal salmonellosis is an important cause of acute diarrhea in children. Generally they are acquired by consumption of contaminated food, but contact with reptiles is an increasing cause of this zoonoses. We describe three pediatric cases of gastroenteritis by Salmonella (Montevideo, Newport and Pomona), related to having turtles as pets. In two cases, the bacteria were isolated from the patient’s stools and the turtle’s droppings. The same genetic subtype by PFGE was obtained in both isolates. All the children recovered. Information and public health measures should be undertaken to control this zoonoses which affects young children.

Las infecciones por Salmonella no tíficas, son una importante causa de diarrea aguda en niños. Generalmente adquiridas por alimentos contaminados, el contacto con animales, especialmente reptiles, también es responsable de esta zoonosis. Describimos tres casos de lactantes con gastroenteritis por Salmonella (S. Montevideo, S. Newport y S. Pomona), relacionados a contacto con tortugas mascotas. En dos de los casos se aisló Salmonella en las deposiciones de los niños y de las tortugas. En todos hubo proximidad entre los niños y los acuarios y/o tortugas, siendo probable la contaminación en la preparación de alimentos. El estudio de clonalidad por electroforesis de campo pulsado demostró el mismo subtipo genético en el aislado correspondiente al paciente y en el procedente de la mascota, lo cual confirmó la fuente zoonótica de los casos. Esta zoonosis debe ser abordada por las autoridades de salud y las sociedades científicas, ya que representa un importante riesgo para la salud, especialmente de niños pequeños.

Influenza A (H1N1) 2009 infection was an important cause of morbidity and mortality in Chile. Aim: To characterize the clinical pattern of hospitalized patients, identify risk factors associated with ICU admission or death, and evaluate its economic impact. Patients and Methods: Twenty five adult patients admitted to 2 hospitals in the Metropolitan Area from May 2009 to December 2010 with PCR confirmed H1N1 infection were analyzed. Total hospital charges were obtained and, using data of registered cases, expenses for the whole country during the first epidemic wave were estimated. Results: Aill cases presented a risk factor: age over 60 years old (n = 13, 52%), co-morbid conditions (n = 24, 96%) or pregnancy (n = 1, 4%). Pneumonia was present in 64% (n = 16) and 16% (n = 4) had hypotension. Only 6 patients (24%) had a CURB-65 score ≥ 2 and 36% (n = 9) requiring ICU admission. Case fatality rate was 16% (n = 4). By multivariate analysis, diabetes mellitus type 2 was independently associated with ICU admission or death (OR 8.12; IC95 1.11-59.2, p < 0.05). Hospital charges for those admitted to ICU or the intermediate care unit reached US$ 20,304, and US$ 1,262 for those admitted in general wards. We estimated US$ 20 million in hospital charges for influenza related hospitalizations during the first wave for the whole country. Conclusions: A high proportion of patients affected by influenza A (H1N1) 2009 infection required ICU admission during 2009-2010. Case fatality rate associated to this infection was high, and diabetes mellitus type 2 was a risk factor for ICU admission or death. Hospital charges were higher for those admitted in critical care units and represented an important expenditure for Chile during the first wave. The CURB-65 score was inappropriate to recognize patients at risk of hospitalization or ICU admission.

Introducción: La infección por influenza A (H1N1) pandémica representó una importante carga de morbilidad y mortalidad en Chile. Objetivo: Caracterización clínica de pacientes hospitalizados durante los años 2009 y 2010, identificar factores de riesgo asociados con ingreso a UCI o muerte y determinar el impacto económico de esta enfermedad. Pacientes y Métodos: Análisis de las características clínicas y evolución en un grupo de 25 pacientes adultos ingresados a dos hospitales institucionales en la Región Metropolitana confirmados por RPC desde mayo de 2009 a diciembre de 2010. Estudio de gastos hospitalarios y estimación de gasto nacional según registro de casos atendidos desde mayo a agosto de 2009. Resultados. Todos los pacientes presentaron una condición de riesgo: edad > 60 años (n: 13, 52%), co-morbilidad (n: 24, 96%) o embarazo ((n: 1, 4%). El 64% (n: 16) presentó neumonía y 16% tuvieron hipotensión arterial (n: 4). Sólo 6 pacientes (24%) tuvieron puntuación CURB-65 ≥ 2. Un 36% (n: 9) requirió manejo en Unidad de Cuidados Intensivos (UCI) y 4 pacientes fallecieron (16%). Por análisis multivariado, el antecedente de diabetes mellitus tipo 2 se asoció en forma significativa e independiente al ingreso a UCI o a un desenlace fatal (OR 8,12; IC95 1,11-59,2, p < 0,05). El gasto por paciente en aquellos que ingresaron a la UCI o Intermedio alcanzó los US$ 20.304 y US$ 1.262, para los que no ingresaron a estas unidades. Para Chile, se estimó un gasto mínimo de 20 millones de dólares por concepto de hospitalización para los primeros cuatro meses de la pandemia el 2009, asumiendo que 60% ingresó a UCI o Unidades Intermedias. Conclusiones: Una alta proporción de los pacientes afectados por influenza A (H1N1) 2009 requirió ingreso a UCI durante los años 2009-2010. La letalidad de esta infección fue elevada y la diabetes mellitus tipo 2 fue un factor de riesgo para ingreso a UCI o muerte. Los gastos hospitalarios fueron elevados, especialmente en los que ingresaron a unidades críticas. El sistema CURB-65 tiene una baja capacidad para reconocer riesgo de hospitalización o muerte en estos pacientes.

Since the appearance of Vancomicin-resistant enterococci (VRE) in our country, the Chilean Ministry of Health recommended the surveillance of intestinal colonization in patients in critical wards. We report the results of surveillance in ICU and onco-hematological wards from 2002 to 2008, with analysis of possible risk factors: demographical data, use and type of antibiotic, days of hospitalization prior to sampling, and year of hospitaliza-tion. Colonization rate increased from 0.03 cases per lOOObed-days in2003 to 0.18 cases during2008. Univariate analysis identified 7 risk factors associated with ERV colonization: hospitalization in ICU, use of antibiotics, use of 3 or more compounds, use of imipenem or colistin, > 10 days of hospitalization prior to the study and year of hospitalization ( before 2007 or after). Multivariate analysis by logistic binary regression showed that only the last two: >10 days of hospitalization prior to the study and year of hospitalization (before 2007 or after), were significantly associated to colonization by ERV.

Desde la emergencia de Enterococcus resistente a vancomicina (ERV) en Chile, el Ministerio de Salud recomendó la vigilancia de colonización intestinal por ERV en pacientes hospitalizados en unidades de pacientes críticos. Describimos los resultados de vigilancia en UCI y Unidad de Aislamiento de Pacientes Hemato-oncológicos desde 2002 a 2008, analizando probables factores de riesgo: datos demográficos, uso y tipo de antimicrobiano, días de hospitalización previo a la toma de muestra y año de hospitalización. La tasa de colonización aumentó de 0,03 casos por 1000 días cama en 2003 a 0,18 durante 2008. El análisis univariado permitió identificar siete factores asociados al riesgo de colonización por ERV: hospitalización en UCI, uso previo o actual de antimicrobianos, haber recibido tres o más antibióticos, terapia con imipenem o colistin, más de 10 días de hospitalización y el año de hospitalización. El análisis multivariado mediante regresión logística binaria, señaló la duración de la hospitalización hasta el momento del estudio (> 10 días) y el año de hospitalización (2007 o después) como factores significativamente asociados al riesgo de colonización por ERV.

The Chilean Public Health Institute and the Chilean Infectious Diseases Society have joined efforts to coordinate and co-manage a national surveillance network for bacterial antimicrobial resistance by clinical syndromes. The aim of this network is to establish a national surveillance system of antimicrobial bacterial resistance, standardized and coordinated, to obtain current information about the most relevant pathogens by well defined clinical syndromes, age of patients and origin of strains: community or nosocomial acquired infection. The participation of all National Public Health Divisions is considered of great importance, to obtain solid data, representative of the whole national epidemiological situation, in order to offer the best treatment to our patients.

El Instituto de Salud Pública de Chile y la Sociedad Chilena de Infectología han aunado sus esfuerzos para coordinar y co-dirigir una red nacional para la vigilancia de resistencia de agentes patógenos a antimicrobianos según síndromes clínicos. El objetivo de esta red es establecer un sistema nacional de vigilancia de la resistencia a antimicrobianos, estandarizado y coordinado, que proporcione información actualizada acerca de los agentes infecciosos más relevantes por síndromes clínicos bien definidos, por edad y por lugar de origen: hospitalaria o de la comunidad. Nos parece fundamental la participación de todos los Servicios de Salud del país en esta red, para obtener datos de calidad, representativos de nuestra realidad nacional, que sean de real utilidad en el manejo de los pacientes.

Pasteurella spp is a common cause of infection following animal bites. We report 20 cases of infections in which Pasteurella spp was isolated during a 15-year period at the Hospital Militar in Santiago. Sixteen patients had soft tissue and bone infections, two respiratory tract infections, one bacteremia without known localized site and one postoperative wound infection. The demographic and clinical characteristics are described.

The urinary tract infection (UTI), a highly prevalent disease, must be confirmed by microbiological diagnosis. The Clinical Microbiology Committee of the Chilean Infectious Diseases Society did a retrospective survey in order to know the methodology and diagnostic criteria employed for UTI microbiological diagnosis by a representative number of clinical laboratories. The information about 49.632 urine cultures collected was obtained from fifteen public hospitals and private laboratories. All the laboratories employed the same criteria for UTI diagnosis: a microbial count > 100.000 cfu/ml. We couldn't analize lesser counts, (data was not available neither for sample collecting methods, concomitant microscopic urine analysis -urinary sediment- nor clinical symptoms). Utilizing this diagnostic criteria the yield varied among 2.3% in men and 33% in women, with more dispersed rates in children. Only the 13% of institutions processed the urine samples knowing the time transcurred since the sample collection. All the laboratories employed the same criteria to consider as contaminated a culture with: > 3 microorganisms; some of them registered 17% of contamination. Although this survey was retrospectively done diminishing the quality of the situation diagnosis, it motivated the Clinical Microbiology Advisory Committee to prepare Guidelines for the Microbiological Diagnosis of UTI

La infección del tracto urinario (ITU), patología infecciosa altamente prevalente, debe ser confirmada por un diagnostico microbiológico. El Comité de Microbiología Clínica de la Sociedad Chilena de Infectología realizó una encuesta retrospectiva para conocer la situación actual de algunos laboratorios asistenciales sobre la metodología y criterios diagnósticos empleados en el diagnóstico de ITU. Respondieron la encuesta 15 centros hospitalarios y laboratorios privados recopilándose información sobre 49.632 urocultivos. Es destacable que la totalidad de los laboratorios consideraron como criterio microbiológico de ITU un recuento microbiano > 100.000 ufc/ml. No fue posible analizar datos con recuentos inferiores por no disponerse de datos métodos sobre obtención de muestra, resultados del estudio microscópico (sedimento urinario) concomitante y sintomatología clínica. Utilizando este criterio diagnóstico la positividad varió entre 2,3% en varones y 33% en mujeres, porcentajes con una mayor dispersión en niños. Sólo 13% de las instituciones procesaron la muestra de orina en conocimiento del tiempo transcurrido desde la obtención de la muestra. Todos los laboratorios utilizaron el mismo criterio para considerar contaminada una muestra: > 3 microorganismos; algunos de ellos registraron 17% de contaminación. Si bien esta encuesta fue retrospectiva limitando la calidad del diagnóstico de situación, ella motivó al Comité de Microbiología Clínica a elaborar recomendaciones para el diagnóstico microbiológico de la infección urinaria