This study presents the characterization of an X-ray irradiator through dosimetric tests, which confirms the actual dose rate that small animals and cells will be exposed to during radiobiological experiments. We evaluated the linearity, consistency, repeatability, and dose distribution in the positions in which the animals or cells are placed during irradiation. In addition, we evaluated the performance of the X-ray tube (voltage and tube operating current), the radiometric survey (leakage radiation) and safety devices. The irradiator default setting was established as 160 kV and 25 mA. Tests showed that the dose rate was linear overtime (R2=1) and remained stable for long (constant) and short (repeatability) intervals between readings. The mean dose rate inside the animal cages was 1.27±0.06 Gy/min with a uniform beam of 95.40% (above the minimum threshold guaranteed by the manufacturer). The mean dose rate inside the cell plates was 0.92±0.19 Gy/min. The dose rate dependence with tube voltage and current presented a quadratic and linear relationship, respectively. There was no observed mechanical failure during evaluation of the irradiator safety devices and the radiometric survey obtained a maximum ambient equivalent dose rate of 0.26 mSv/h, which exempts it from the radiological protection requirements of the International Atomic Energy Agency. The irradiator characterization enables us to perform radiobiological experiments, and assists or even replaces traditional therapy equipment (e.g., linear accelerators) for cells and small animal irradiation, especially in early research stages.

This study was conducted in UTFPR, Campus Dois Vizinhos-PR and divided into two experiments with 600 male broilers of the same lineage and origin. The objective of this study was to evaluate different methodologies for measurement of footpad and locomotors lesions in broilers and the effect of housing density on the incidence of these injuries. For the experiment the incidence of locomotor problems in a completely randomized design and factorial 3 x 3 x 2 (density x evaluators x methods of locomotor problems). For the experiment of footpad dermatitis, the birds were distributed in a completely randomized design and factorial 3 x 3 x 3 (density x evaluators x methods of footpad lesions), with four replicates. For the evaluation of each methodology, we used three different evaluators who were previously trained on the application of methods and without any interaction between them. The averages were compared by Tukey tests at 5% probability of error. The repeatability of the method was analyzed from scores measurements taken by evaluators. The intraclass correlation coefficient (ICC) was applied with a significant level of 5%. Density of housing affects the higher intensity of locomotor problems and foot pad dermatitis of the birds, increasing their development. In general, the methods were not available to be interpreted and applied.

Este estudo foi conduzido na UTFPR, Campus Dois Vizinhos-PR, dividido em dois experimentos com 600 pintainhos de corte machos, de mesma linhagem (Cobb) e origem. O objetivo deste estudo foi avaliar distintas metodologias para mensuração de lesões no coxim plantar e lesões locomotoras em frangos de corte, bem como o efeito da densidade de alojamento na incidência de lesões. Para o experimento de incidência de problemas locomotores, em delineamento inteiramente casualizado e em esquema fatorial 3 x 3 x 2 (avaliadores x densidade x metodologias de problemas de locomoção). Para o experimento de incidência de lesões no coxim plantar, as aves foram distribuídas em delineamento inteiramente casualizado e em esquema fatorial 3 x 3 x 3 (avaliadores x densidade x metodologias de lesões no coxim plantar), com quatro repetições cada. Para a avaliação de cada metodologia adotada, foram utilizados três avaliadores distintos e previamente treinados sobre a aplicação dos métodos e sem qualquer interação entre si. As médias obtidas foram comparadas pelo Testes de Tukey ao nível de 5% de probabilidade do erro. A repetibilidade do método foi analisada pelos escores mensurados pelos avaliadores. O coeficiente de correlação intraclasse (ICC) foi aplicado com nível de significância de 5 %. Densidades de alojamento mais elevadas afetaram a intensidade de problemas locomotores e de lesões no coxim plantar das aves, aumentando com o desenvolvimento das mesmas. No geral, as metodologias de mensuração de problemas locomotores e de lesão no coxim plantar avaliadas neste estudo são passíveis de aplicação, porém não tão acessíveis de serem interpretadas.

RESUMO O objetivo do presente trabalho foi verificar a presença de Erysipelothrix spp. em suínos abatidos em frigorífico, procedentes de granjas que usam ou não a vacinação e desenvolver técnica de nested PCR baseada na amplificação do gene do antígeno protetor de superfície (spaA) específico de Erysipelothrix rhusiopathiae e testar a sua utilização na análise de culturas padrão. Foram isoladas 56 (14,9%) amostras de Erysipelothrix spp. de tonsilas de suínos abatidos em frigorífico no Estado do Rio Grande do Sul, Brasil, sendo 13/275 de suínos vacinados (4,7%) entre 275 tonsilas e 43/100 de suínos não vacinados (43%), bem como foi obtido um isolado de lesão de pele também colhida em frigorífico. Os micro-organismos foram identificados por características fenotípicas por meio de exame bacteriológico e foi realizado teste de nested PCR em 13 isolados de suínos procedentes de granjas que utilizavam vacinação contra a erisipela suína, sendo positivo para 8 isolados, classificados como E. rhusiopathiae. As oito amostras confirmaram a classificação como E. rhusiopathiae também por exames sorológicos. Entre as amostras isoladas de suínos não vacinados, foram testados, por sorologia e PCR, 19 cultivos de Erysipelothrix spp., sendo classificados 9 como E. rhusiopathiae por ambos os testes, todos do sorotipo 2 e 7 negativos. Três isolados de Erysipelothrix sp. foram positivos somente por PCR e negativos por imunodifusão para os sorotipos 1A, 1B e 2, que são os encontrados com maior frequência em casos clínicos de erisipela suína.

ABSTRACT The objective of the present work was to detect Erysipelothrix spp in slaughtered pigs, from erysipelasvaccinated and nonvaccinated herds, developing nested PCR based on the amplification of the surface protective antigen (spa A) gene specific for E. rhusiopathiae. Samples of Erysipelothrix spp. were isolated from the tonsils of slaughtered pigs in the state of Rio Grande do Sul, Brazil, respectively 13 (4.7%) from vaccinated (total of 275 tonsils examined) and 43 (43%) from nonvaccinated pigs (100 tonsils examined). Also 1 isolate from a skin lesion was obtained from the abattoir. Erysipelothrix rhusiopathiae isolated from vaccinated pigs (8 samples) were identified by phenotypic characteristics and by nested PCR. Identical results were obtained by serological classification, showing the usefulness of the molecular test. Nineteen strains isolated from nonvaccinated pigs were examined by serology and PCR. Results for both tests identified serotype 2 of E. rhusiopathiae in 9 samples, there being 7 nonreactors to the tests. Three isolates were positive only by PCR and negative by the immunodiffusion test.

Relatam-se dois casos de listeriose ocorridos em ovinos leiteiros da raça Lacaune, mantidos em confinamento e alimentados com silagem de milho. O exame histológico do tecido nervoso mostrou meningoencefalite supurada, e a imunoistoquímica foi positiva para Listeria monocytogenes com isolamento da bactéria do tecido nervoso. Enfatiza-se a ocorrência dessa enfermidade em ovinos leiteiros que apresentavam lesões na cavidade oral e eram alimentados com silagem de baixa qualidade.

Clinical cases of listeriosis in two Lacaune rams, fed silage in a lot, are reported. Histological examination of nervous tissue revealed purulent meningoencephalitis, and L. monocytogenes was detected in nervous tissue by immunohistochemistry procedures. This disease should be suspected when oral lesions are visible in dairy sheep fed low quality silage.

A Rottboellia exaltata é uma das mais importantes espécies de plantas daninhas da cultura da cana-de-açúcar da região Norte Fluminense, sendo responsável pela redução na produtividade da cultura e pelo aumento dos custos de produção. Com o objetivo de avaliar a eficiência de trifloxysulfuron-sodium+ametryn no controle de R. exaltata, foi realizado este trabalho em área com alta infestação desta espécie, utilizando o cultivar RB 72454. Utilizou-se o delineamento experimental em blocos casualizados, com quatro repetições. Os herbicidas foram aplicados em pós-emergência, utilizando-se pulverizador costal pressurizado, operando em pressão constante de 3,5 kgf cm-2, com bico XR 8003 e volume de calda de 250 L ha-1. Aplicaram-se os seguintes tratamentos: MSMA+diuron, trifloxysulfuron-sodium+ametryn, trifloxysulfuron-sodium, ametryn, diuron+paraquat, testemunha com capina e testemunha sem capina. Os tratamentos MSMA+diuron, diuron+paraquat e trifloxysulfuron-sodium+ametryne, na maior dose, proporcionaram excelente controle de R. exaltata (acima de 90%). Maiores produtividades de cana-de-açúcar foram obtidas nos tratamentos trifloxysulfuron-sodium+ametryne, MSMA+diuron e diuron+paraquat.

Rottboellia exaltata (itchgrass) is one of the major weeds infesting sugarcane in the Norte-Fluminense area, reducing culture yield and increasing production costs. The objective of this study was to evaluate the efficiency of trifloxysulfuron-sodium in controlling R. exaltata. The experiment was installed in an area cultivated with the sugar cane cultivar RB 72454, on a randomized complete block design, with four replications. The herbicides were applied at post-emergence with a pressurized knapsack sprayer, operating at a constant pressure of 3.5 kgf cm², nozzle XR 8003 and 250 L ha¹. The following treatments were used: MSMA + diuron, trifloxysulfuron-sodium + ametryne, trifloxysulfuron-sodium, ametryne, diuron + paraquat,control with weeding and control without weeding. The herbicides MSMA + diuron, diuron + paraquat and trifloxysulfuron-sodium + ametryne provided excellent control of R. exaltata (over 90%) at the highest rate. The treatments providing the highest sugarcane yield were trifloxysulfuron-sodium + ametryne, MSMA + diuron and diuron + paraquat.

We have developed a software called pp-Blast that uses the publicly available Blast package and PVM (parallel virtual machine) to partition a multi-sequence query across a set of nodes with replicated or shared databases. Benchmark tests show that pp-Blast running in a cluster of 14 PCs outperformed conventional Blast running in large servers. In addition, using pp-Blast and the cluster we were able to map all human cDNAs onto the draft of the human genome in less than 6 days. We propose here that the cost/benefit ratio of pp-Blast makes it appropriate for large-scale sequence analysis. The source code and configuration files for pp-Blast are available at http://www.ludwig.org.br/biocomp/tools/pp-blast.