RESUMO A alface (Lactuca sativa L.) pertencente à família Asteraceae e é uma das hortaliças mais consumidas no Brasil. O Lettuce mosaic virus (LMV) é um dos vírus mais importantes da cultura e, atualmente, a principal forma de controle é a utilização de genótipos portadores do gene de tolerância mol1 e mo12. Um isolado de LMV proveniente de Botucatu (SP), denominado LMV-Bot, foi identificado quanto as suas características biológicas e moleculares. Ao ser inoculado nas variedades de alface diferenciadoras de patótipos de LMV em alface (‘Ithaca - gene Mo’, ‘Malika - mo11’, ‘Vanguard 75 – Mo e mo12’ e ‘Salinas 88 - mo12’), o LMV-Bot induziu sintomas somente em ‘Salinas 88’. A porção N’ terminal que codifica a proteína capsidial foi amplificada, sequenciada e seu posicionamento filogenético revelou similaridade com dois isolados brasileiros denominados Br6 e A435 e também com um coletado na França (Fr4). Porém, o LMV-Bot não se enquadrou no sub-grupo Most e Common. Os resultados sugerem que apesar de raros, isolados atípicos de LMV são encontrados na natureza infectando alface, e podem contornar o gene de resistência mol2.

ABSTRACT Lettuce (Lactuca sativa L.) belongs to the Asteraceae family and is one of the most consumed vegetables in Brazil. Lettuce mosaic virus (LMV) an important virus for this crop and, currently, its main control form is based on the utilization of genotypes carrying the tolerance gene mol1 and mol2. A LMV isolate from Botucatu (SP), named LMV-Bot, was identified considering its biological and molecular characteristics. When inoculated in distinctive lettuce varieties that classifies LMV pathotypes (‘Ithaca - Mo gene’, ‘Malika – mol1’ ‘Vanguard 75 - Mo and mol2’ and ‘Salinas 88 - mo12’), LMV-Bot induced symptoms only in ‘Salinas 88’. The N’ terminal coding region for the capsid protein was amplified and sequenced, and its phylogenetic position revealed similarity to two Brazilian isolates named BR6 and A435 and to another one from France (FR4). However, LMV-Bot did not fit in the sub-group Most and Common. Results suggest that, although rare, atypical isolates of LMV are found in nature infecting lettuce and can break the resistance gene mol2.

Resumo: O objetivo deste trabalho foi avaliar genótipos de alface quanto à reação ao Lettuce mosaic virus (LMV; Most-type, isolado AF-199) e variações no fator eucariótico de tradução eIF4E. Todos os genótipos inoculados foram suscetíveis ao LMV, que foi detectado por RT-PCR com primers específicos. Porém, os acessos 169501, 169501C, 172918A e 162499, apresentaram sintomas tardios e somente nas folhas inoculadas. O sequenciamento da porção codificadora para eIF4E mostrou que estes genótipos apresentam padrão eIF4E0 (mol0), típico para suscetibilidade ao LMV, o que indica que o fenótipo encontrado não está correlacionado com as variações de nucleotídeos neste fator de tradução.

Abstract: The objective of this work was to evaluate lettuce genotypes for their reaction to Lettuce mosaic virus (LMV; Most-type, isolate AF-199) and variations of the eukaryotic translation initiation factor eIF4E. All inoculated genotypes were susceptible to LMV, which was detected by RT-PCR using specific primer pairs. However, the accessions 169501, 169501C, 172918A, and 162499 showed late development of symptoms that appeared only on the inoculated leaves. Sequencing of the coding region of eIF4E showed that these genotypes have an eIF4E0 (mol 0 ) standard typical for their susceptibility to LMV, indicating that the phenotype found is not correlated to nucleotide variations in this translation factor.

RESUMO O bacurizeiro (Platonia insignis Mart.) é uma espécie frutífera nativa da Amazônia muito utilizada na cultura alimentar nas regiões Norte e Nordeste do Brasil. Devido a seu grande potencial econômico regional, a espécie vem sendo conservada em bancos ativos de germoplasma (BAG) para apoiar programas de melhoramento genético. Dessa forma, o objetivo deste trabalho foi caracterizar molecularmente acessos de P. insignis pertencentes ao BAG da Embrapa Amazônia Oriental por meio de marcadores ISSR (Inter Simple Sequence Repeat). Foram coletados 78 acessos de P. insignis pertencentes a 16 progênies coletadas em dois locais diferentes na Ilha de Marajó, PA. Das 16 progênies, sete foram coletadas em Soure e nove em Salvaterra. Os 78 acessos foram genotipados com 23 primers ISSR pré-selecionados. Obteve-se 121 produtos amplificados, dos quais 54 foram polimórficos. Os primers mais polimórficos foram UBC 834, UBC 899 e UBC 900. Já os primers UBC810 e UBC884 não apresentaram bandas polimórficas. Das 54 marcas, 49 foram selecionadas para as análises genéticas. A AMOVA entre e dentro de progênies identificou baixa diferenciação genética (ΦPT = 0,064, P<0,001) com maior diversidade dentro de progênies (96%), bem como baixa diferenciação genética entre os locais de coleta (ΦPT = 0,025, P<0,013), com maior diversidade dentro (98%) do que entre locais. O agrupamento pelo método UPGMA, com base nas similaridades de Jaccard entre os acessos, não separou as amostras por progênie ou local de coleta. Recomenda-se que novas coletas de germoplasma considerem maior esforço de coleta em cada local amostrado.

ABSTRACT The bacurizeiro (Platonia insignis Mart.) is a tree native to the Amazon whose fruit is much used in the gastronomy in the North and Northeast regions of Brazil. Due to its great economic potential for these regions, the species is being conserved in germplasm banks to support genetic breeding programs. The aim of this work was the molecular characterization of P. insignis accessions belonging to the germplasm bank of the Embrapa Eastern Amazon research unit using ISSR (Inter Simple Sequence Repeat) markers. Seventy-eight accessions of P. insignis belonging to 16 progenies were sampled in two different localities on Marajó Island, state of Pará, Brazil. Among the 16 progenies, seven were collected in Soure and nine in Salvaterra. The 78 accessions were genotyped with 23 pre-selected primers. We obtained 121 amplified products, of which 54 were polymorphic. The most polymorphic primers were UBC 834, UBC 899 and UBC 900. Primers UBC810 and UBC884 did not amplify polymorphic bands. Forty-nine markers out of 54 were selected for genetic analyses. AMOVA within and among progenies showed low genetic differentiation (ΦPT = 0.064, P<0.001) with higher diversity within progenies (96%), low genetic differentiation among sampling localities (ΦPT = 0.025, P<0.013), and higher diversity within (98%) than among localities. Clustering by UPGMA based on Jaccard similarities among pairs of accessions did not separate genotypes according to progeny or sampling localitiy. We recommend that new germplasm surveys consider a greater sampling effort within sampling localitites.

Resumo: O objetivo deste trabalho foi avaliar o efeito da aplicação de fungicidas na concentração de Tomato severe rugose virus (ToSRV, Begomovirus) no híbrido de tomateiro 'Mariana' coinfectado por ToSRV e Tomato chlorosis virus (ToCV, Crinivirus) e a progressão da concentração viral por qPCR, bem como quantificar a produção e a qualidade de frutos. O experimento I consistiu na aplicação dos fungicidas após a semeadura (pré-tratamento): piraclostrobina+metiram (P+M) (a 3 g L-1) + boscalida (B) (a 0,3 g L-1), seguida de pulverizações quinzenais com P+M (4 g L-1); no experimento II, não houve aplicação na semeadura (controle), apenas 4 g L-1 de P+M quinzenalmente. As transmissões de ToSRV e ToCV foram realizadas com uso de moscas-brancas (Bemisia tabaci, biótipo B), aos 15, 30, 45, 60 e 70 dias após o transplante (DAT). Houve aumento da produção, melhor qualidade dos frutos e redução da concentração de ToSRV nas plantas, quando os vírus foram transmitidos tardiamente e o pré-tratamento foi realizado. O pré-tratamento na bandeja, na semeadura, com P+M (3 g L-1) e B (0,3 g L-1), seguido de pulverizações quinzenais com P+M (4 g L-1), aumenta a produção e a qualidade dos frutos, em tomateiro híbrido 'Mariana' coinfectado aos 45, 60 e 75 DAT por ToSRV e ToCV, e há redução da concentração de ToSRV.

Abstract: The objective of this work was to evaluate the effect of fungicide application on the concentration of Tomato severe rugose virus (ToSRV, Begomovirus) in the 'Mariana' hybrid tomato coinfected with ToSRV and Tomato chlorosis virus (ToCV, Crinivirus) and the progression of viral concentration by qPCR, as well as to quantify fruit yield and quality. Experiment I consisted in the application of fungicides after sowing (pretreatment): pyraclostrobin+metiram (P+M) (at 3 g L-1) + boscalid (B) (at 0.3 g L-1), followed by biweekly sprayings with P+M (4 g L-1); in experiment II, there was no application at sowing (control treatment), only 4 g L-1 P+M biweekly. ToSRV and ToCV transmissions were performed using sweetpotato whiteflies (Bemisia tabaci, biotype B), at 15, 30, 45, 60, and 70 days after transplanting (DAT). There was an increase in yield, better fruit quality, and a reduction in the ToSRV concentration in the plants, when the viruses were transmitted late and pretreatment was performed. Tray pretreatment in sowing with P+M (3 g L-1) and B (0.3 g L-1), followed by biweekly sprayings with P+M (4 g L-1), increases fruit yield and quality in the 'Mariana' hybrid tomato coinfected at 45, 60, and 75 DAT by ToSRV and ToCV, and there is a reduction in the concentration of ToSRV.

A murcha-de-curtobacterium é umas principais doenças do feijoeiro e o uso de cultivares com níveis de resistência é fundamental para o manejo adequado da doença. A reação de 54 genótipos de feijoeiro comum a um isolado de Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens (Cff) foi avaliada, assim como a colonização de cultivares e a obstrução de vasos de xilema primário da base de pecíolos de plantas inoculadas foram quantificadas. Ensaios conduzidos em casa-de-vegetação e laboratório evidenciaram resistência nas cultivares IAC Diplomata, IAC Alvorada, IAC Imperador, IPR Corujinha e IPR Tangará e nas linhagens P5-4-4-1 e C4-5-4-1-2. Uma menor velocidade de colonização por Cff também foi evidenciada nas cultivares resistentes (IAC Diplomata, IAC Carioca Tybatã e IAC Carioca Pyatã), assim como uma menor porcentagem de obstrução dos vasos de xilema primários na base de pecíolos, em comparação às cultivares suscetíveis (IAC Carioca e Pérola).

Bacterial wilt is one of the main diseases of common beans and the use of cultivars with some level of resistance is fundamental for an adequate disease management. The reaction of 54 common bean genotypes to Curtobacterium flaccumfaciens pv. flaccumfaciens (Cff) was evaluated, and the colonization of cultivars and obstruction of primary xylem vessels at the petiole base were assessed. In greenhouse and laboratory tests, resistance was detected in the cultivars IAC Diplomata, IAC Alvorada, IAC Imperador, IPR Corujinha, and IPR Tangará, and in the lines P5-4-4-1 and C4-5-4-1-2. The Cff colonization rate was also slower in the resistant cultivars (IAC Diplomata, IAC Carioca Tybatã, and IAC Carioca Pyatã) and the percentage of obstruction of primary xylem vessels at the petiole base lower than in the susceptible cultivars (IAC Carioca and Pérola).

Garlic (Allium sativumL.) is a host to several viruses, most commonly those belonging to theAllexivirus,Carlavirus, orPotyvirusgenera. Nine species distributed among these three genera have been reported in Brazil: two species within carlaviruses, two within potyviruses, and five within allexiviruses. To quantify the prevalence of these viruses, young leaves from 520 plants (plants either symptomatic or asymptomatic) were collected from commercial fields grown in four Brazilian states and analyzed using universal and species-specific primers via the reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR). Potyvirus presence was positive in 306 samples (81 %), 151 of them (38 %) in mixed infections with other viruses. The most frequent potyviruses wereOnion yellow dwarf virus(OYDV, 56 %) andLeek yellow stripe virus(LYSV, 55 %). 187 samples (49 %) were positive for allexivirus, with 33 (9 %) showing single infections and 154 (41 %) showing mixed infections withGarlic virus A (GarV-A),Garlic virus B(GarV-B),Garlic virus C(GarV-C),Garlic virus D(GarV-D), and species belonging to theCarlavirus andPotyvirusgenera. The predominant species in which allexiviruses were found were GarV-A and GarV-D. Only 15 samples (4 %) were infected solely by a carlavirus, and 63 (17 %) showed mixed infections with viruses from different genera. The dominant species of carlavirus wasGarlic commom latent virus(GarCLV). Carlaviruses and allexiviruses are frequently associated with mixed infections with potyviruses, whereas mixed infections with carlaviruses and allexiviruses are rare. About 70 % of the plants collected were positive for at least one species of virus.

Em campos de produção comercial de alho é comum observar plantas naturalmente infectadas por vírus dos gêneros Allexivirus, Carlavirus e Potyvirus. Os bulbilhos aéreos podem ser uma alternativa para a propagação de plantas de alho livres de vírus. Desta forma, o objetivo deste trabalho foi analisar a taxa de perpetuação dos vírus de plantas infectadas para os bulbilhos aéreos. Os bulbilhos aéreos obtidos de plantas infectadas foram analisados por RT-PCR utilizando oligonucleotídeos universais para os gêneros Allexivirus, Carlavirus e Potyvirus. A taxa de perpetuação foi de 65% para allexivírus, 20% para carlavírus e 82,22% para potyvírus. Os resultados demonstraram que a perpetuação dos diferentes vírus do bulbo para os bulbilhos aéreos é elevada, inviabilizando a utilização direta dos bulbilhos aéreos provenientes de plantas matrizes infectadas por vírus. Esta metodologia deve ser utilizada somente a partir de plantas isentas de vírus.

In commercial garlic fields, plants naturally infected by viruses of the genera Allexivirus, Carlavirus and Potyvirus are commonly observed. Aerial bulbils may be an alternative for the propagation of virus-free garlic plants. Thus, the aim of this study was to analyze the rate of virus perpetuation from infected plants to aerial bulbils. Aerial bulbils obtained from infected plants were analyzed by RT-PCR using universal primers for the genera Allexivirus, Carlavirus and Potyvirus. Results showed that the perpetuation of different viruses from the bulb to aerial bulbils is high, impairing the direct use of aerial bulbils from virus-infected matrix plants. This methodology should use solely virus-free plants.

As plantas daninhas podem atuar como importantes reservatórios de vírus. Solanum americanum (Maria Pretinha) é uma planta daninha comum no Brasil e amostras com mosaico foram coletadas em áreas produtoras de pimentão, para verificar a presença de vírus. Uma amostra apresentou infecção mista com Cucumber mosaic virus (CMV) e Potato virus Y (PVY) e uma amostra apresentou infecção simples com PVY. As duas espécies virais foram transmitidas por extrato vegetal e ocasionaram mosaico em tomate (Solanum lycopersicum cv. Santa Clara), pimentão (Capsicum annuum cv. Magda), Nicotiana benthamiana e N. tabaccum TNN, lesões locais em Chenopodium quinoa, C. murale e C. amaranticolor. As sequências de proteína capsidial para o CMV e PVY encontradas em S. americanum estão filogeneticamente mais relacionadas com isolados de tomate. Conclui-se que S. americanum pode atuar como reservatório de diferentes vírus, durante e entre as épocas de cultivo de pimentão.

Weeds can act as important reservoirs for viruses. Solanum americanum (Black nightshade) is a common weed in Brazil and samples showing mosaic were collected from sweet pepper crops to verify the presence of viruses. One sample showed mixed infection between Cucumber mosaic virus (CMV) and Potato virus Y (PVY) and one sample showed simple infection by PVY. Both virus species were transmitted by plant extract and caused mosaic in tomato (Solanum lycopersicum cv. Santa Clara), sweet pepper (Capsicum annuum cv. Magda), Nicotiana benthamiana and N. tabaccum TNN, and local lesions on Chenopodium quinoa, C. murale and C. amaranticolor. The coat protein sequences for CMV and PVY found in S. americanum are phylogenetically more related to isolates from tomato. We conclude that S. americanum can act as a reservoir for different viruses during and between sweet pepper crop seasons.

O Potato virus Y (PVY) e Pepper yellow mosaic virus (PepYMV) são as únicas espécies de potyvirus encontradas em pimenta e pimentão no Brasil. A região codificadora para a proteína capsidial de isolados de PepYMV e PVY coletados em pimentão, foi avaliada quanto à variabilidade e presença de motivos específicos aos potyvirus. A identidade da seqüência de aminoácidos na CP entre os isolados de PepYMV foi de 93% a 100%, enquanto que para os de PVY 94% a 98%. Entre os vírus esta variou de 73% a 79%. Foi observada variabilidade nas regiões conservadas da CP. Todos os isolados de PepYMV seqüenciados não apresentaram o motivo DAG na CP, relacionada a transmissão dos vírus por afídeos, enquanto que para as seqüências obtidas de PVY foi observada. Demais domínios como MVWCIENG, ENTERH, QMKAAA e PYMPRYG foram verificadas em ambas espécies.

Potato virus Y (PVY) and Pepper yellow mosaic virus (PepYMV) are the only potyvirus species found in pepper and sweetpepper in Brazil. The region encoding the coat protein of PVY and PepYMV isolates collected in sweetpepper was evaluated for the presence of specific motifs of potyviruses. The identity of the amino acid sequence in CP among PepYMV isolates was 93% to 100%, while for PVY was 94% to 98%. Among the viruses that ranged from 73% to 79%. It was observed variability in the conserved regions of the CP. All PepYMV isolates sequenced did not show the DAG motif in the CP, related to virus transmission by aphids, while for sequences of PVY this motif was observed. Other motifs, such MVWCIENG, ENTERH, QMKAAA and PYMPRYG were found in both species.

Plantas de Capsicum annuum cv. Magali R, resistentes ao Pepper yellow mosaic virus (PepYMV), exibindo sintomas severos de mosaico amarelo, malformação foliar e subdesenvolvimento foram encontradas em plantios na região de Lins, SP, Brasil, em 2003/04. Partículas semelhantes àquelas do gênero Potyvirus foram observadas em extrato foliar de planta infectada examinado em microscópio eletrônico de transmissão. O extrato foliar também reagiu com anti-soro contra o PepYMV em PTA-ELISA. Além de C. annuum cv. Magali R, esse potyvirus também infectou sistemicamente C. annuum cv. Rubia R, que é resistente ao PepYMV. A seqüência de nucleotídeos de parte do gene da proteína capsidial (CP) desse potyvirus apresentou 96-98% de identidade com a de outros isolados do PepYMV. A seqüência parcial de nucleotídeos da região 3' não traduzida (3' NTR) apresentou 94-96% de identidade com a do PepYMV. Esses resultados são indicativos de que o potyvirus que quebrou a resistência em pimentão é um isolado do PepYMV.

Plants of Capsicum annuum cv. Magali R, resistant to Pepper yellow mosaic virus (PepYMV), which showed severe yellow mosaic, leaf malformation and stunting were observed during the 2003/04 growing season in Lins, São Paulo State, Brazil. Potyvirus-like particles observed in leaf sap from infected plants under the electron microscope reacted with an antiserum against PepYMV in PTA-ELISA. In addition to C. annuum cv. Magali R, this potyvirus also infected systemically the resistant C. annuum cv. Rubia R. The nucleotide sequence of part of the CP gene of this potyvirus shared 96-98% identity with that of other PepYMV isolates. The partial nucleotide sequence of the 3' NTR showed 94-96% identity with that of PepYMV. These data indicate that this potyvirus is a resistance-breaking isolate of PepYMV.