Abstract Objective: To estimate the economic burden associated with COVID-19 in Córdoba, Colombia, 2020 and 2021. Methods: Economic burden study. Direct costs were analyzed from the third-party payer perspective using healthcare administrative databases and interviews from a cohort of confirmed COVID-19 cases from Córdoba. Costing aggregation was performed by the bottom-up method. Indirect costs were estimated using the productivity loss approach. Contrast tests and statistical models were estimated at 5% significance. Results: We studied 1,800 COVID-19 cases. The average economic cost of COVID-19 per episode was estimated at US$ 2,519 (95%CI 1,980;3,047). The direct medical cost component accounted for 92.9% of the total; out-of-pocket and indirect costs accounted for 2% and 5.1%, respectively. Conclusion: COVID-19 economic cost was mainly due to direct medical costs. This study provided evidence of the economic burden faced by households due to COVID-19, with the most vulnerable households bearing much of the burden on their income. Objective COVID19 COVID 19 COVID-1 Córdoba Colombia 202 2021 Methods thirdparty third party bottomup bottom up method approach 5 significance Results 1800 1 800 1,80 US 2519 2 519 2,51 95%CI 95CI CI 95 1,9803,047. 19803047 1,980 3,047 . 980 3 047 1,980;3,047) 929 92 9 92.9 total outofpocket out pocket 51 5.1% respectively Conclusion COVID19, 19, income COVID1 COVID- 20 180 80 1,8 251 2,5 9803 1,9803,047 1980304 1980 1,98 3047 3,04 98 04 1,980;3,047 92. 5.1 18 8 1, 25 2, 1,9803,04 198030 198 1,9 304 3,0 0 1,980;3,04 5. 1,9803,0 19803 30 3, 1,980;3,0 1,9803, 1,980;3, 1,9803 1,980;3 1,980;

Resumen Objetivo: Estimar la carga económica asociada al COVID-19 en Córdoba, Colombia, entre 2020 y 2021. Métodos: Estudio de carga económica. Los costos directos se analizaron desde la perspectiva del tercer pagador usando bases de datos administrativas y entrevistas. La agregación del costeo se realizó por el método de bottom-up. Los costos indirectos se estimaron usando el enfoque de pérdida de productividad. Los test de contraste y modelos estadísticos se estimaron al 5% de significancia. Resultados: Se analizaron 1.800 casos de COVID-19. El costo económico promedio por episodio fue US$ 2.519 (IC95% 1.980;3.047). Los costos directos médicos explicaron el 92,9% del total; el gasto de bolsillo y los costos indirectos un 2% y 5,1%, respectivamente. Conclusión: El costo económico del COVID-19 fue principalmente por el costo directo médico. Este estudio evidenció la carga económica que enfrentan los hogares debido al COVID-19, siendo los más vulnerables quienes asumieron la mayor parte en sus ingresos. Objetivo COVID19 COVID 19 COVID-1 Córdoba Colombia 202 2021 Métodos entrevistas bottomup. bottomup bottom up. up bottom-up productividad 5 significancia Resultados 1800 1 800 1.80 COVID19. 19. US 2519 2 519 2.51 IC95% IC95 IC (IC95 1.9803.047. 19803047 1.980 3.047 . 980 3 047 1.980;3.047) 929 92 9 92,9 total 51 5,1% respectivamente Conclusión médico COVID19, 19, ingresos COVID1 COVID- 20 180 80 1.8 251 2.5 IC9 (IC9 9803 1.9803.047 1980304 1980 1.98 3047 3.04 98 04 1.980;3.047 92, 5,1 18 8 1. 25 2. (IC 1.9803.04 198030 198 1.9 304 3.0 0 1.980;3.04 5, 1.9803.0 19803 30 3. 1.980;3.0 1.9803. 1.980;3. 1.9803 1.980;3 1.980;

Resumo Objetivo: Estimar a carga econômica associada à covid-19 em Córdoba, Colômbia, entre 2020 e 2021. Métodos: Estudo de avaliação da carga econômica da covid-19. Os custos diretos foram analisados segundo terceiros pagadores, usando-se bases de dados administrativas e entrevistas. A agregação dos custos foi realizada usando-se o método bottom-up. Os custos indiretos foram estimados pela perda de produtividade. Testes de contraste ortogonais e modelos de regressão estatísticos foram estimados com 5% de significância. Resultados: Foram estudadas 1.800 pessoas com covid-19. O custo econômico médio da covid-19 por episódio foi estimado em US$ 2.519 (IC95% 1.980;3.047). O componente de custo médico direto representou 92,9% do total; as despesas diretas e custos indiretos representaram 2,0% e 5,1%, respectivamente. Conclusão: O custo econômico da covid-19 deveu-se principalmente aos custos médicos diretos. Este estudo forneceu avaliações da carga econômica enfrentada pelas famílias devido à covid-19; as mais vulneráveis tiveram grande parte da carga sobre os seus rendimentos. Objetivo covid19 covid 19 covid-1 Córdoba Colômbia 202 2021 Métodos covid19. 19. pagadores usandose usando se entrevistas bottomup. bottomup bottom up. up bottom-up produtividade 5 significância Resultados 1800 1 800 1.80 US 2519 2 519 2.51 IC95% IC95 IC (IC95 1.9803.047. 19803047 1.980 3.047 . 980 3 047 1.980;3.047) 929 92 9 92,9 total 20 0 2,0 51 5,1% respectivamente Conclusão deveuse deveu rendimentos covid1 covid- 180 80 1.8 251 2.5 IC9 (IC9 9803 1.9803.047 1980304 1980 1.98 3047 3.04 98 04 1.980;3.047 92, 2, 5,1 18 8 1. 25 2. (IC 1.9803.04 198030 198 1.9 304 3.0 1.980;3.04 5, 1.9803.0 19803 30 3. 1.980;3.0 1.9803. 1.980;3. 1.9803 1.980;3 1.980;

Resumen Objetivo: Estimar la carga económica asociada al COVID-19 en Córdoba, Colombia, entre 2020 y 2021. Métodos: Estudio de carga económica. Los costos directos se analizaron desde la perspectiva del tercer pagador usando bases de datos administrativas y entrevistas. La agregación del costeo se realizó por el método de bottom-up. Los costos indirectos se estimaron usando el enfoque de pérdida de productividad. Los test de contraste y modelos estadísticos se estimaron al 5% de significancia. Resultados: Se analizaron 1.800 casos de COVID-19. El costo económico promedio por episodio fue US$ 2.519 (IC95% 1.980;3.047). Los costos directos médicos explicaron el 92,9% del total; el gasto de bolsillo y los costos indirectos un 2% y 5,1%, respectivamente. Conclusión: El costo económico del COVID-19 fue principalmente por el costo directo médico. Este estudio evidenció la carga económica que enfrentan los hogares debido al COVID-19, siendo los más vulnerables quienes asumieron la mayor parte en sus ingresos.

Abstract Objective: To estimate the economic burden associated with COVID-19 in Córdoba, Colombia, 2020 and 2021. Methods: Economic burden study. Direct costs were analyzed from the third-party payer perspective using healthcare administrative databases and interviews from a cohort of confirmed COVID-19 cases from Córdoba. Costing aggregation was performed by the bottom-up method. Indirect costs were estimated using the productivity loss approach. Contrast tests and statistical models were estimated at 5% significance. Results: We studied 1,800 COVID-19 cases. The average economic cost of COVID-19 per episode was estimated at US$ 2,519 (95%CI 1,980;3,047). The direct medical cost component accounted for 92.9% of the total; out-of-pocket and indirect costs accounted for 2% and 5.1%, respectively. Conclusion: COVID-19 economic cost was mainly due to direct medical costs. This study provided evidence of the economic burden faced by households due to COVID-19, with the most vulnerable households bearing much of the burden on their income.

Resumo Objetivo: Estimar a carga econômica associada à covid-19 em Córdoba, Colômbia, entre 2020 e 2021. Métodos: Estudo de avaliação da carga econômica da covid-19. Os custos diretos foram analisados segundo terceiros pagadores, usando-se bases de dados administrativas e entrevistas. A agregação dos custos foi realizada usando-se o método bottom-up. Os custos indiretos foram estimados pela perda de produtividade. Testes de contraste ortogonais e modelos de regressão estatísticos foram estimados com 5% de significância. Resultados: Foram estudadas 1.800 pessoas com covid-19. O custo econômico médio da covid-19 por episódio foi estimado em US$ 2.519 (IC95% 1.980;3.047). O componente de custo médico direto representou 92,9% do total; as despesas diretas e custos indiretos representaram 2,0% e 5,1%, respectivamente. Conclusão: O custo econômico da covid-19 deveu-se principalmente aos custos médicos diretos. Este estudo forneceu avaliações da carga econômica enfrentada pelas famílias devido à covid-19; as mais vulneráveis tiveram grande parte da carga sobre os seus rendimentos.

Resumo: Durante a pandemia, os países latino-americanos sofreram o colapso de seus sistemas de saúde. Isso foi causado pela alta demanda de atendimento aos infectados pelo SARS-CoV-2, que somou-se, em paralelo, ao atendimento de pacientes com outros tipos de doenças. O aumento significativo na demanda por serviços de saúde levou à rápida diminuição dos suprimentos médicos e laboratoriais. A pandemia de COVID-19 acelerou, nos países em desenvolvimento, uma crise sanitária causada principalmente por uma política sistemática e insuficiente de apropriação do conhecimento científico. O atual governo colombiano deve formular uma Lei de Soberania Biotecnológica ou de Biossegurança que garanta a autonomia científica, o que leva à autonomia que garante que a Colômbia seja autossuficiente em Ciência, Tecnologia e Inovação. O governo da Colômbia também deve se concentrar em estabelecer e desenvolver a produção de produtos químicos farmacêuticos, adquirindo ingredientes químicos ativos de outros países. Essa estratégia reduz os custos de produção e o preço final dos medicamentos, além de gerar empregos de alto nível e riqueza para o país. Desta forma, não haveria escassez de medicamentos essenciais, nem estaríamos sujeitos a aumentos excessivos de preços por intermediação comercial. Em conclusão, o manuscrito foca na fracassada soberania biotecnológica na Colômbia. Propomos um modelo de ecossistema latino-americano de Ciência e Tecnologia para alcançar a soberania biotecnológica por meio do financiamento estatal do fortalecimento da pesquisa das universidades, com a participação de empresas privadas e Ministérios da Ciência, Educação, Comércio e Saúde. A autonomia científica é baseada em processos de inovação que fortalecem a autonomia biotecnológica. Resumo latinoamericanos latino americanos SARSCoV2, SARSCoV2 SARSCoV SARS CoV 2, 2 SARS-CoV-2 somouse, somouse somou se, somou-se paralelo doenças laboratoriais COVID19 COVID 19 COVID-1 acelerou desenvolvimento científico Inovação farmacêuticos país forma essenciais comercial conclusão latinoamericano americano universidades Educação Saúde SARS-CoV- COVID1 1 COVID- SARS-CoV

Resumen: Durante la pandemia, los países latinoamericanos vieron colapsar sus sistemas de salud. Esto se debió a la alta demanda de atención para las personas contagiadas con SARS-CoV-2 y a la atención de pacientes con otros tipos de enfermedades. El aumento significativo de la demanda de los servicios de salud llevó a la rápida disminución de los suministros médicos y de laboratorio. La pandemia de la COVID-19 intensificó la crisis sanitaria en los países en desarrollo, principalmente por una política sistemática e insuficiente de apropiación del conocimiento científico. Si el actual gobierno colombiano formulara una Ley de Soberanía Biotecnológica o de Bioseguridad por la cual se garantizaría la autonomía científica, esto conduciría a una autonomía de Colombia en Ciencia, Tecnología e Innovación. El Gobierno de Colombia también debería centrarse en fomentar y desarrollar la producción de productos químicos farmacéuticos mediante el abastecimiento de ingredientes químicos activos de otros países. Esta estrategia favorece la reducción de costos de producción y del precio final de los medicamentos, además de generar empleos de alto nivel y riqueza para el país. De esta manera, no habría escasez de medicamentos esenciales, ni alzas excesivas de precios en la intermediación comercial. Pero, la realidad es que hay una débil soberanía biotecnológica en Colombia. En este texto se propone un modelo de ecosistema basado en Ciencia y Tecnología para que Latinoamérica logre la soberanía biotecnológica mediante el financiamiento estatal a la investigación en universidades, con la participación de entidades privadas y Ministerios de Ciencia, Educación, Comercio y Salud. La autonomía científica se basa en procesos de innovación que implican el fortalecimiento de la autonomía biotecnológica. Resumen SARSCoV2 SARSCoV SARS CoV 2 SARS-CoV- enfermedades laboratorio COVID19 COVID 19 COVID-1 desarrollo científico Innovación país manera esenciales comercial Pero universidades Educación Salud SARS-CoV COVID1 1 COVID-

Abstract: During the pandemic, Latin American countries suffered the collapse of their health systems. This was caused by the high demand for care of patients infected with SARS-CoV-2, which was added to the care of patients with other diseases. The significant increase in demand for health services caused medical and laboratory supplies to decline rapidly. The COVID-19 pandemic exacerbated a health crisis in several developing countries, mainly caused by insufficient systematic policies for integrating scientific knowledge. The current Colombian government must formulate a Biotechnological or Biosecurity Sovereignty Law that guarantees scientific autonomy, ensuring that Colombia is self-sufficient in Science, Technology, and Innovation. Colombian government should also focus on establishing and developing pharmaceutical chemical production by acquiring active chemical ingredients from other countries. This strategy could reduce the production costs and final prices of medicines, as well as generate high-level employment and wealth for the country. In this way, the Colombian government could prevent shortage of essential medicines and excessive price increases by commercial intermediation. In conclusion, the manuscript focuses on the lack of biotechnological sovereignty in Colombia. We propose a model of a Latin American Science and Technology ecosystem to achieve biotechnological sovereignty via state funding of research, strengthening universities, and fostering participation among private companies and Ministries of Science, Education, Trade, and Health. Scientific autonomy based on innovative processes that strengthen biotechnological independence can contribute to the economy by generating gross added value, creating high-quality employment, and facilitating the appropriation and social dissemination of knowledge, and cost reduction. Abstract systems SARSCoV2, SARSCoV2 SARSCoV SARS CoV 2, 2 SARS-CoV-2 diseases rapidly COVID19 COVID 19 COVID-1 knowledge selfsufficient self sufficient Innovation highlevel level country way intermediation conclusion research universities Education Trade Health value highquality quality reduction SARS-CoV- COVID1 1 COVID- SARS-CoV

Resumo: Durante a pandemia, os países latino-americanos sofreram o colapso de seus sistemas de saúde. Isso foi causado pela alta demanda de atendimento aos infectados pelo SARS-CoV-2, que somou-se, em paralelo, ao atendimento de pacientes com outros tipos de doenças. O aumento significativo na demanda por serviços de saúde levou à rápida diminuição dos suprimentos médicos e laboratoriais. A pandemia de COVID-19 acelerou, nos países em desenvolvimento, uma crise sanitária causada principalmente por uma política sistemática e insuficiente de apropriação do conhecimento científico. O atual governo colombiano deve formular uma Lei de Soberania Biotecnológica ou de Biossegurança que garanta a autonomia científica, o que leva à autonomia que garante que a Colômbia seja autossuficiente em Ciência, Tecnologia e Inovação. O governo da Colômbia também deve se concentrar em estabelecer e desenvolver a produção de produtos químicos farmacêuticos, adquirindo ingredientes químicos ativos de outros países. Essa estratégia reduz os custos de produção e o preço final dos medicamentos, além de gerar empregos de alto nível e riqueza para o país. Desta forma, não haveria escassez de medicamentos essenciais, nem estaríamos sujeitos a aumentos excessivos de preços por intermediação comercial. Em conclusão, o manuscrito foca na fracassada soberania biotecnológica na Colômbia. Propomos um modelo de ecossistema latino-americano de Ciência e Tecnologia para alcançar a soberania biotecnológica por meio do financiamento estatal do fortalecimento da pesquisa das universidades, com a participação de empresas privadas e Ministérios da Ciência, Educação, Comércio e Saúde. A autonomia científica é baseada em processos de inovação que fortalecem a autonomia biotecnológica.

Resumen: Durante la pandemia, los países latinoamericanos vieron colapsar sus sistemas de salud. Esto se debió a la alta demanda de atención para las personas contagiadas con SARS-CoV-2 y a la atención de pacientes con otros tipos de enfermedades. El aumento significativo de la demanda de los servicios de salud llevó a la rápida disminución de los suministros médicos y de laboratorio. La pandemia de la COVID-19 intensificó la crisis sanitaria en los países en desarrollo, principalmente por una política sistemática e insuficiente de apropiación del conocimiento científico. Si el actual gobierno colombiano formulara una Ley de Soberanía Biotecnológica o de Bioseguridad por la cual se garantizaría la autonomía científica, esto conduciría a una autonomía de Colombia en Ciencia, Tecnología e Innovación. El Gobierno de Colombia también debería centrarse en fomentar y desarrollar la producción de productos químicos farmacéuticos mediante el abastecimiento de ingredientes químicos activos de otros países. Esta estrategia favorece la reducción de costos de producción y del precio final de los medicamentos, además de generar empleos de alto nivel y riqueza para el país. De esta manera, no habría escasez de medicamentos esenciales, ni alzas excesivas de precios en la intermediación comercial. Pero, la realidad es que hay una débil soberanía biotecnológica en Colombia. En este texto se propone un modelo de ecosistema basado en Ciencia y Tecnología para que Latinoamérica logre la soberanía biotecnológica mediante el financiamiento estatal a la investigación en universidades, con la participación de entidades privadas y Ministerios de Ciencia, Educación, Comercio y Salud. La autonomía científica se basa en procesos de innovación que implican el fortalecimiento de la autonomía biotecnológica.

Abstract: During the pandemic, Latin American countries suffered the collapse of their health systems. This was caused by the high demand for care of patients infected with SARS-CoV-2, which was added to the care of patients with other diseases. The significant increase in demand for health services caused medical and laboratory supplies to decline rapidly. The COVID-19 pandemic exacerbated a health crisis in several developing countries, mainly caused by insufficient systematic policies for integrating scientific knowledge. The current Colombian government must formulate a Biotechnological or Biosecurity Sovereignty Law that guarantees scientific autonomy, ensuring that Colombia is self-sufficient in Science, Technology, and Innovation. Colombian government should also focus on establishing and developing pharmaceutical chemical production by acquiring active chemical ingredients from other countries. This strategy could reduce the production costs and final prices of medicines, as well as generate high-level employment and wealth for the country. In this way, the Colombian government could prevent shortage of essential medicines and excessive price increases by commercial intermediation. In conclusion, the manuscript focuses on the lack of biotechnological sovereignty in Colombia. We propose a model of a Latin American Science and Technology ecosystem to achieve biotechnological sovereignty via state funding of research, strengthening universities, and fostering participation among private companies and Ministries of Science, Education, Trade, and Health. Scientific autonomy based on innovative processes that strengthen biotechnological independence can contribute to the economy by generating gross added value, creating high-quality employment, and facilitating the appropriation and social dissemination of knowledge, and cost reduction.

ABSTRACT Introduction: Rodents are potential transmitters of Leptospira spp. In the municipality of Villavicencio, Colombia, leptospirosis is a disease that, although notifiable, is still underreported. In this region, rodent species that can host pathogenic leptospira remain unknown. Objective: To detect the presence of Leptospira spp. through molecular analysis in rodents (Rodentia) from peri-urban and rural areas belonging to the municipality of Villavicencio in Colombia. Methods: Peri-urban and rural areas of the townships belonging to Villavicencio municipality were selected for sampling. These areas presented similar ecological conditions: they were near water bodies and peridomiciliary areas, and some of them included fields of agricultural crops. Rodents´ kidneys were removed and frozen in liquid nitrogen. DNA was extracted using a commercial kit and subsequently amplified through conventional polymerase chain reaction. Results: The rodent species collected were: Rattus rattus, Mus musculus, Zygodontomys brevicauda, Oligoryzomys sp, Hylaeamys (formerly Oryzomys) and Proechimys cf. oconnelli. Leptospira DNA was amplified in six rodents and the purified amplicons were sent to Macrogen Inc. (Seoul, Korea) for sequencing. The alignment analysis of the sequenced products demonstrated 98.64% of coverage and identity with Leptospira interrogans. Conclusions: This is the first study carried out on wild and synanthropic rodents in the municipality of Villavicencio. The incidence of leptospirosis raises the alarm due to the important role of these small mammals in the transmission of this zoonosis, which is considered the second cause, after dengue, of undifferentiated febrile illness in Villavicencio.

RESUMEN Introducción: Los roedores son potenciales transmisores de Leptospira spp. En el municipio de Villavicencio, Colombia, la leptospirosis es una enfermedad que, aunque debe notificarse obligatoriamente, sigue subreportada. En esta región, algunas especies de roedores pueden ser reservorios de leptospiras patógenas, situación que se desconoce. Objetivo: Detectar la presencia de Leptospira spp. a través del análisis molecular en roedores (Rodentia) de áreas periurbanas y rurales del municipio de Villavicencio, Colombia. Métodos: Para el trampeo se seleccionaron áreas periurbanas y rurales de las veredas pertenecientes al municipio de Villavicencio. Las áreas escogidas presentaban condiciones ecológicas similares: cerca de cuerpos de agua y áreas peridomiciliarias; algunas de ellas localizadas en campos de cultivos de la agricultura. Se extirparon los riñones de los roedores y se conservaron en nitrógeno líquido. Se extrajo el ADN usando un estuche comercial y posteriormente se amplificó mediante reacción en cadena de la polimerasa convencional. Resultados: Las especies de roedores colectadas fueron: Rattus rattus, Mus musculus, Zygodontomys brevicauda, Oligoryzomys sp., Hylaeamys (ahora Oryzomys) y Proechimys oconnelli. El ADN de leptospira se amplificó en seis roedores y los amplicones purificados se enviaron a Macrogen Inc. (Seoul, Korea) para secuenciación. El análisis de alineamiento de los productos secuenciados demostró un 98,64 % de cobertura e identidad con Leptospira interrogans. Conclusiones: Este es el primer estudio llevado a cabo en roedores silvestres y sinantrópicos en el municipio de Villavicencio. La incidencia de la leptospirosis genera una alarma con respecto a la importancia del papel de esos pequeños mamíferos en la transmisión de esta zoonosis, la cual es la segunda causa de los síndromes febriles indiferenciados en Villavicencio, después del dengue.

BACKGROUND Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) is a virus of zoonotic origin that can bind to ACE2 receptors on the cells of many wild and domestic mammals. Studies have shown that the virus can circulate among animals mutate, lead to animal-to-human zoonotic jump, and further onward spread between humans. Infection in pets is unusual, and there are few human-to-pet transmission reports worldwide. OBJECTIVE To describe the SARS-CoV-2 infection in a domestic animal in Córdoba, Colombian Caribbean region. METHODS A cross-sectional molecular surveillance study was carried out, oral and rectal swabs were taken from cats and dogs living with people diagnosed with coronavirus disease 2019 (COVID-19). RESULTS SARS-CoV-2 was found in a cat living with a person with COVID-19. Genome sequencing showed that the B.1.111 lineage caused the infection in the cat. The owner’s sample could not be sequenced. The lineage is predominant in Colombia, and this variant is characterised by the presence of the D614D and Q57H mutation. CONCLUSION The present work is the first report of an infected cat with SARS-CoV-2 with whole-genome sequencing in Colombia. It highlights the importance of detecting SARS-CoV-2 mutations that could promote the transmissibility of this new coronavirus. There is still a significant information gap on human-to-cat-to-human infection; we encourage self-isolation measures between COVID-19 patients and companion animals. The findings of this study give a preliminary view of the current panorama of SARS-CoV-2 infection in animals in Colombia.

Resumen Se formulan recomendaciones de un grupo de consenso de expertos sobre los criterios para evaluar el desempeño diagnóstico (tamaño y selección de muestras para sensibilidad y especificidad analíticas, criterios para establecer límites de detección, criterios para establecer el estándar de oro para las serologías) que deberían ser tenidos en cuenta al evaluar y validar las pruebas diagnósticas para SARS CoV-2. Con el propósito de asegurar la calidad de las pruebas serológicas a utilizar en el país, se recomienda la participación en un programa de control de calidad externo, que garantice la idoneidad y desempeño en la realización de las pruebas diagnósticas serológicas y moleculares durante esta pandemia, ya que su uso tiene profundas implicaciones para las medidas de intervención clínicas individuales y de seguimiento y control en salud pública.

Abstract We formulate recommendations from a consensus working group on the criteria to evaluate the diagnostic performance (size and criteria of selection of samples to determine sensitivity, analytical specificity, criteria for limit of detection, criteria for gold standard to evaluate serological assays) that should be taken into account during the evaluation and validation/verification of diagnostic tests for SARS CoV-2 infection. A national external quality control program should be established to guarantee the suitability and performance of these diagnostic serological and molecular tests during this pandemic, that will have deep implications for decisions on clinical and public health.

Abstract INTRODUCTION: In Colombia, there is insufficient epidemiological surveillance of zoonotic hemorrhagic viruses. METHODS: We performed a sero-epidemiological study in indigenous populations of Wayuü, Kankuamos, and Tuchin communities using Maciel hantavirus and Junin arenavirus antigens for IgG detection by ELISA. RESULTS IgG antibodies to hantavirus and arenavirus were found in 5/506 (1%) and 2/506 (0.4%) serum samples, respectively. CONCLUSIONS: Arenavirus and hantavirus circulate in indigenous populations from the Colombian Caribbean region, and the results indicate that the indigenous populations are exposed to these zoonotic agents, with unknown consequences on their health, despite low seroprevalence.

ABSTRACT Introduction: Rickettsia is a genus of Gram-negative obligate intracellular bacteria that cause several epidemics around the world and are transmitted mainly by ticks, fleas, lice and mites. Rickettsiosis is a re-emergent infectious disease without epidemiological surveillance in Colombia. Until few years ago, Rickettsia rickettsi was the only tick-borne Rickettsioses in America; however, new species are being described, and although their pathogenicity has not been confirmed, they should be considered as potential pathogens. Objective: The aim of this study was to determine the presence of rickettsial agents in ticks in the state of Meta, Colombia. Material and Methods: A descriptive cross-sectional study was conducted; ticks were collected and, after their taxonomic identification, gltA,ompAand ompB genes were amplified and sequenced. Results: A total of 169 pools were obtained to which PCR were carried out, of which 2 PCR were amplified for the gltA, ompA and ompB genes. Conclusions: These results demonstrate the presence of Rickettsia spp in ticks in the State of Meta.

RESUMEN Introducción: Las Rickettsias son un género de bacterias Gram negativas intracelulares obligadas causantes de muchas epidemias en el mundo y son transmitidas principalmente por garrapatas, pulgas, piojos y ácaros. Las rickettsiosis son enfermedades infecciosas reemergentes sin vigilancia epidemiológica en Colombia. Hasta hace pocos años Rickettsia rickettsi era la única Rickettsia transmitida por garrapatas presente en América; sin embargo, nuevas especies están siendo descritas, y aunque su patogenicidad no ha sido confirmada pueden ser consideradas patógenos potenciales. Objetivo: Determinar la presencia de rickettsias en garrapatas del departamento del Meta, Colombia. Material y Métodos: Se realizó un estudio descriptivo de corte transversal, fueron colectadas garrapatas y después de su identificación taxonómica, los genes gltA, ompA y ompB fueron amplificados y secuenciados. Resultados: Se obtuvieron un total de 169 grupos a los que se les realizó PCR de los cuales 2 grupos amplificaron para los genes gltA, ompA y ompB. Conclusiones: Los resultados demuestran la presencia de Rickettsia spp en garrapatas del departamento del Meta.

Resumen Objetivo. El objetivo de este estudio fue proporcionar evidencia molecular de infección por C. burnetii en ovinos y caprinos de algunos rebaños de Valledupar, Cesar, Colombia. Materiales y métodos. Quince rebaños de ovinos y caprinos fueron seleccionados a conveniencia para investigar la infección por C. burnetii, durante marzo y abril de 2013. En este estudio se incluyeron 328 caprinos y 66 ovinos de 15 rebaños. La leche procedente de ovinos y muestras de moco vaginal de caprinos fueron analizados mediante PCR (Reacción en Cadena de Polimerasa) para la detección de ADN del gen transposasa (IS1111) de C. burnetii. Resultados. Se encontró ADN de C. burnetii en 6% (4/66) de leche de oveja y 0,6% (2/328) de moco vaginal de cabras. El 13% (2/15) de los rebaños tenían al menos un animal infectado. Discusión. Nuestros hallazgos sugieren la circulación de C. burnetii en ovinos y caprinos de algunos rebaños de Valledupar, Colombia, y destaca la posibilidad de ocurrencia de infecciones en humanos y animales. Conclusiones. La detección de C. burnetii en la leche de oveja podría representar un factor de riesgo para la salud pública de las personas que consumen con frecuencia leche cruda, quesos o personas que trabajan en la agricultura y manipulación de ganado. Otros estudios son necesarios para evaluar otras rutas como la mordedura de la garrapata, las heces, la leche de las cabras y el moco vaginal de las ovejas de esta región de Colombia.

Abstract Objective. The aim of this study was to provide molecular evidence of C. burnetii in sheep and goats from some herds of Valledupar, Cesar, Colombia. Materials and methods. Fifteen herds of sheep and goats were chosen by convenience to investigate the infection by C. burnetii, during March and April of 2013. 328 female goats and 66 sheep from 15 herds were included in this study. Milk from ewes and vaginal mucus samples from goats were analyzed by Polymerase Chain Reaction for DNA detection of transposase gene (IS1111) of C. burnetii. Results. DNA of C. burnetii in 6% (4/66) of sheep’s milk and 0.6% (2/328) vaginal mucus from goats was found. 13% (2/15) of the herds had at least one infected animal. Discussion. Our findings suggest the circulation of C. burnetii in sheep and goats from some herds of Valledupar, Colombia, and it highlights the possibility of occurrence of infections in humans and animals. Conclusions. The detection of C. burnetii in sheep milk could represent a public health risk factor for people who consuming raw milk, cheeses or people associated to agriculture and livestock handling. Further studies are necessary to evaluate other routes such as tick’s bite, feces, milk from goats and vaginal mucus from sheep of this region of Colombia.