Resumen Los sistemas de cultivo in vitro son importantes en el área de la biotecnología vegetal. Se ha observado que algunos factores, incluyendo a la luz, afectan el desarrollo de los tejidos en condiciones de cultivo in vitro. El objetivo de este trabajo es conocer el efecto de la intensidad lumínica en el desarrollo de tejidos a partir de semillas bajo condiciones de cultivo in vitro para la generación de plántulas y callos, con la finalidad de favorecer los tiempos y la regeneración de especies de interés agronómico para su aprovechamiento integral. En este trabajo, se probaron diferentes intensidades lumínicas, se lograron obtener plántulas con callos, demostrando que la intensidad de la luz influye en el tipo y desarrollo de estructuras desdiferenciadas y que este efecto varía inter e intraespecie. Mediante la regeneración de tejidos vegetales de las plántulas, se encontró que los brotes de meristemos apicales son el tipo de explante más eficiente para la regeneración clonal de plantas de tabaco y tomate. Este estudio es el primero en presentar el efecto de la intensidad de la luz sobre semillas para la producción de plántulas y callos en diferentes especies vegetales, incluida una combinación de diferentes tejidos y explantes que podrían utilizarse para la obtención de diferentes estructuras vegetales con fines biotecnológicos.

Abstract In vitro culture systems are important in the field of plant biotechnology. It has been observed that some factors, including light, affect tissue development under in vitro culture conditions. The objective of this work is to know the effect of light intensity on the development of tissues from seeds under in vitro culture conditions for the generation of seedlings and calluses, in order to favor the times and the regeneration of species of agronomic interest for their comprehensive use. In this work, different light intensities were tested, it was possible to obtain seedlings with calluses, demonstrating that the intensity of light influences the type and development of dedifferentiated structures and that this effect varies inter and intraspecies. By regenerating plant tissues from seedlings, it was found that apical meristem shoots are the most efficient type of explant for clonal regeneration of tobacco and tomato plants. This study is the first to present the effect of light intensity on seeds for the production of seedlings and calluses in different plant species, including a combination of different tissues and explants that could be used to obtain different plant structures for biotechnological purposes.

ABSTRACT: Staphylococcus aureus is an important pathogen responsible for a variety of infectious diseases. The increase of resistant strains is an issue of concern. There are very few studies reporting the resistant strains isolated from oral cavity. Aim: To determine the antimicrobial susceptibility of Staphylococcus aureus isolated from oral mucosa of Peruvian young healthy carriers. The study included 64 healthy individuals whose oral mucosa, nasal mucosa and hand swabs were collected and seeded in salt mannitol agar for primary isolation. Then, coagulase test was performed to confirm the presence of Staphylococcus aureus. After that, colonies of Staphylococcus aureus underwent antibiogram by using the Kirby Bauer method. The prevalence of Staphylococcus aureus positive strains isolated from oral mucosa, nasal mucosa, and hand, was 7.8 %, 15.6 %, 50.0 %, respectively. There was less than 40 % and 11 % of prevalence of susceptibility to erythromycin and penicillin, respectively, in the three studied samples. There was equal or more than 60% of prevalence of susceptibility to amoxicillin/clavulanic acid, cotrimoxazole, gentamicin, oxacillin, ciprofloxacin, vancomycin and ampicillin/sulbactam in all the studied samples. Vancomycin resistance was found in 10 - 20 % of all samples. A high prevalence in susceptibility to amoxicillin/ clavulanic acid, gentamicin, co-trimoxazole, oxacillin, ciprofloxacin, vancomycin and ampicillin /sulbactam in healthy carriers was found. Vancomycin resistance percentage is higher than previous reports.

RESUMEN: Staphylococcus aureus es un patógeno importante responsable de una variedad de enfermedades infecciosas. La emergencia de cepas resistentes a la meticilina es un tema preocupante. Existen escasos estudios que hayan reportado la resistencia de cepas aisladas de la cavidad bucal. Determinar la sensibilidad antimicrobiana de cepas de Staphylococcus aureus aisladas de mucosa bucal de portadores asintomáticos jóvenes peruanos. Se incluyeron 64 individuos a quienes se tomaron muestras de mucosa oral, mucosa nasal y de manos. Las muestras fueron cultivadas en agar manitol salado. La prueba coagulasa fue empleada para confirmar la presencia de Staphylococcus aureus. Luego se realizó el antibiograma usando el método de Kirby-Bauer. La prevalencia de colonias positivas de S. aureus provenientes de la mucosa oral, mucosa nasal y de la palma de la mano fue 7,8 %, 15,6 % y 50,0 %, respectivamente. En todas las muestras, se observaron una prevalencia de sensibilidad menor de 40 % y 11 % a la eritromicina y penicilina, respectivamente. Las colonias de la mucosa oral mostraron resistencia a la penicilina. En todas las muestras, se observó una prevalencia de sensibilidad ³ 60% en amoxicilina/ácido clavulánico, co-trimoxazol, gentamicina, oxacilina, ciprofloxacino, vancomicina y ampicilina/sulbactam. Se encontró resistencia a vancomicina en un 10 - 20 % de todas las muestras. Se encontró una alta prevalencia en la sensibilidad a amoxicilina/ácido clavulánico, gentamicina, cotrimoxazol, oxacilina, ciprofloxacino y ampicilina/sulbactam. Se encontró un elevado porcentaje de resistencia a la vancomicina en muestras de mucosa oral en comparación a otros estudios.

Abstract: In Mexico, 99 tick species have been registered and 26 species of Amblyomma genus are known; the Hidalgo state does not have updated catalogs of Amblyomma spp. Between October 2019 and March 2020, were samples of ticks done in the Otomi-Tepehua Region directly from cattle, horses, dogs, cats, humans, leaf litter, weeds, resting places of animals and animal corpses. In the municipalities of Huehuetla, Tenango de Doria and San Bartolo Tutotepec were gathered 735 samples from warm weather rangelands; 494 of the no engorged ticks were randomly selected and taxonomically recognized as A. mixtum Koch, 1844 (Acari: Ixodidae). The ticks were caught from domestic hosts (n = 177), horses (n = 172), animals resting places (n = 51), humans (n = 34), animal corpses (n = 31) and cattle (n = 29). The locality that yielded the highest number of ectoparasites was Río Blanco (16.5%), followed by San Antonio (12.7%), El Canjoy (11.1%), San Isidro (9.5%) and La Esperanza Uno (8.9%); the highest infestation rates found were in horses (34.8%) and canines (32.9%), with all other host types under 10%. 13 ixodides A. mixtum were identified from humans that presented a clinical profile of fever (≥ 102.2 °F), severe muscle pain, lethargy, headache, papules and scoriations at the point of the tick bite. The tick A. mixtum is present in peridomestic environments of the Otomi Tepehua Region, where animal horses and canines serve as the principal disseminators from the rangelands to the rural housing.

Resumen: En México, se han registrado 99 especies de garrapatas y se conocen 26 especies pertenecientes al género Amblyomma; el estado de Hidalgo no cuenta con catálogos actualizados de Amblyomma spp. Durante el periodo de octubre 2019 a marzo de 2020, se realizaron recolecciones directas dentro de la Región Otomí-Tepehua sobre ganado vacuno y equino, perros, gatos, humanos, hojarasca, arvenses, lugares de descanso de los animales y animales atropellados. En los municipios de Huehuetla, Tenango de Doria y San Bartolo Tutotepec, se obtuvieron 735 muestras de garrapatas procedentes de agostaderos con climas cálidos y se seleccionaron al azar 494 ixódidos adultos no ingurgitados, identificados taxonómicamente como Amblyomma mixtum Koch, 1844 (Acari: Ixodidae). Las garrapatas fueron capturadas en hospedantes domésticos (n = 177), equinos (n = 172), sitios de descanso de animales (n= 51), de humanos (n = 34), animales atropellados (n = 31) y ganado vacuno (n = 29). La localidad que presentó mayor incidencia de ectoparásitos fue Río Blanco (16,5%), seguida de San Antonio (12,7%), El Canjoy (11,1%), San Isidro (9,5%) y La Esperanza Uno (8,9%); los hospedantes con mayor índice de infestación fueron el ganado equino (34,8%) y los caninos (32,9%), mientras que el resto presentó valores menores al 10%. Se obtuvieron 13 ixódidos A. mixtum de humanos que padecieron fiebre (≥ 39 °C), dolor muscular intenso, letargo, cefalea, pápulas y escoriaciones en el sitio de la picadura. La garrapata A. mixtum está presente en ambientes peridomésticos de la Región Otomí-Tepehua, donde los equinos y caninos fungen como los principales diseminadores de los agostaderos hacia las viviendas rurales.

Abstract Incontinentia pigmenti is an X-linked genodermatosis generally lethal in males; thus, it presents almost exclusively in females. It is caused by a loss-of-function mutation in the IKBKG (inhibitor of kappa polypeptide gene enhancer in B cells, kinase gamma) gene that prevents the NFкβ (nuclear factor kappa-light-chain-enhancer of activated B cells) protein from migrating to the nucleus to begin the transcription of factors that amplify the immune response and prevent apoptosis. Consequently, mutant cells become vulnerable to apoptosis when exposed to cytokines and, in turn, lead to vaso-occlusion and ischemia of tissues, such as the skin, the central nervous system and the retina. Dermatological lesions are characteristic and occur in 100% of patients; they are distributed along Blaschko lines, which follow the pattern of migration of skin cells in embryogenesis. The cutaneous manifestations follow a sequence of four phases since birth: vesicular, verrucous, hyperpigmented and hypopigmented. These lesions are relevant for the disease because they guide the clinician towards the diagnosis. Additionally, they are accompanied by neurological abnormalities, such as seizures, and multiple ophthalmological manifestations, such as retinal detachment. Incontinentia pigmenti patients with no clinically significant ophthalmic or neurological compromise have a good prognosis and a normal life expectancy. The abnormalities present are permanent, which can be a cause of concern for the patients.

Resumen La incontinentia pigmenti es una genodermatosis ligada al cromosoma X, generalmente letal en los hombres. Está causada por una mutación con pérdida de función en el gen IKBKG (inhibitor of kappa polypeptide gene enhancer in B cells kinase gamma), que impide que la proteína NFкβ (nuclear factor kappa-light-chain-enhancer of activated B cells) migre al núcleo y comience la transcripción de factores que amplifican la respuesta inmunitaria y previenen la apoptosis. Por tanto, las células mutantes se vuelven vulnerables a la apoptosis cuando son expuestas a citocinas y provocan vaso-oclusión e isquemia de tejidos como la piel, el sistema nervioso central y la retina. Las lesiones dermatológicas son características; se distribuyen a lo largo de las líneas de Blaschko, las cuales siguen el patrón de migración de las células de la piel en la embriogénesis, y ocurren en el 100% de los pacientes. Las manifestaciones cutáneas aparecen en una secuencia de cuatro fases que inicia desde el nacimiento: vesicular, verrucosa, hiperpigmentada e hipopigmentada. Estas lesiones son relevantes, puesto que orientan al clínico hacia el diagnóstico. Además, se acompañan de anomalías neurológicas, como crisis convulsivas, y múltiples manifestaciones oftalmológicas, como el desprendimiento de la retina. Los pacientes con incontinentia pigmenti, pero sin compromiso oftalmológico o neurológico clínicamente significativo, tienen un pronóstico bueno y una esperanza de vida normal. Las anomalías que se presentan son permanentes, lo que puede generar preocupación en los pacientes.

Abstract Background: systemic inflammation and oxidative stress are important factors in the pathogenesis of bronchiectasis. Pulmonary rehabilitation (PR) is recommended for bronchiectasis, but there is no data about its effect on the inflammatory and REDOX status of these patients. Aims: to investigate the effect of PR in non-cystic-fibrosis bronchiectasis (NCFB) patients, and to compare it with the effect of PR plus a hyperproteic oral nutritional supplement (PRS) enriched with beta-hydroxy-beta-methylbutyrate (HMB) on serum inflammatory and oxidative biomarkers. Materials and methods: this was an open randomized, controlled trial. Thirty individuals (65 years old or younger with a body mass index over 18.5, older than 65 years with a body mass index over 20) were recruited from September 2013 to September 2014, and randomly assigned to receive PR or PRS. Total neutrophils, and inflammatory and oxidative biomarker levels were measured at baseline, and then at 3 and 6 months. Results: in the PRS group neutrophil levels were decreased from baseline at 6 months. A significantly different fold change was found between the PR and PRS groups. In the PR group, IL-6 and adiponectin were increased by the end of the study while TNFα levels were decreased from baseline at 6 months. REDOX biomarkers remained stable throughout the study except for 8-isoprostane levels, which were increased from baseline at 6 months in both groups of patients. Conclusion: a PR program induced a pro-oxidative effect accompanied by changes in circulating inflammatory cytokine levels in NCFB patients. Our results would also suggest a possible beneficial effect of the HMB enriched supplement on neutrophil level regulation in these patients. The information provided in this study could be useful for choosing the right therapeutic approach in the management of bronchiectasis.

Resumen Introducción: la inflamación sistémica y el estrés oxidativo son factores importantes en la patogénesis de la bronquiectasia. La rehabilitación pulmonar (PR) está recomendada en los sujetos con bronquiectasias, pero no hay datos sobre sus posibles efectos sobre el estado inflamatorio y REDOX de estos pacientes. Objetivos: investigar el efecto de la PR en pacientes con bronquiectasias no asociadas a fibrosis quística (NCFB) sobre los biomarcadores oxidativos e inflamatorios, y compararlo con los efectos de la PR junto con la suplementación oral de un suplemento hiperproteico (PRS) enriquecido con beta-hidroxi-beta-metilbutirato (HMB). Material y métodos: ensayo clínico abierto, aleatorizado y controlado. Treinta pacientes (de 65 años o menos con un índice de masa corporal por encima de 18,5, y mayores de 65 años con un índice de masa corporal de más de 20) se aleatorizaron para recibir PR o PRS. Los niveles circulantes de neutrófilos totales y los de biomarcadores de estado inflamatorio y oxidativo se determinaron al inicio del estudio y a los 3 y 6 meses. Resultados: los niveles de neutrófilos en el grupo de PRS se redujeron desde el inicio a los 6 meses, presentando una tasa de cambio significativamente diferente según el tratamiento. En el grupo de PR, la IL-6 y la adiponectina aumentaron al final del estudio, mientras que los niveles de TNFα disminuyeron desde el inicio a los 6 meses. Los biomarcadores de estrés oxidativo se mantuvieron estables durante todo el estudio excepto por los niveles de 8-isoprostano, que aumentaron desde el inicio a los 6 meses en ambos grupos de pacientes. Conclusión: el programa de PR indujo un efecto pro-oxidativo acompañado de cambios en los niveles de citoquinas inflamatorias circulantes en pacientes con NCFB. Nuestros resultados también sugieren un posible efecto beneficioso del suplemento nutricional sobre la regulación de los niveles de neutrófilos de estos pacientes.

ABSTRACT Introduction Food servings are standard amounts of food stuffs or drinks to help dietetic advice to promote and preserve health. The aim is to establish the serving size of fruits and vegetables (FH) to be used in food based dietary guidelines (FBDG). Material and Methods: Methodology of the United States Department of Agriculture (USDA) was adapted to establish serving sizes for FBDG, along of the followed by the food exchange system. Data was collected from the FH portion sizes reported in nutritional surveys and common sizes available in the Spanish market, and they were adjusted to an easily recognisable quantities of food with equivalence on key nutrients: the compliance with public health goals for FH consumption was evaluated. Results Portion sizes typically reported in Spanish nutrition surveys are scarce and not homogeneous, and no data published in scientific journals on portion sizes were available. The Spanish FBDG, in spite of showing a range of serving size for FH, do not assure that they are interchangeable nor specify the method to obtain them. The serving of vegetables was 139,44g (DS:± 21.98, CV:0.16), 137,68g (DS:± 49,61, CV:0,36) for fruits and 28.00g (DS:± 7,53, CV:0.27) for dried fruits. Conclusions With the established servings, the recommendation of consuming “at least 5 servings of FH a day” would allow reaching the Public Health goals for FH established in 600g(net weight)/person/day. It is recommended that the Spanish Agency for Consumers, Food Safety and Nutrition (AECOSAN) uses this methodology to establish serving sizes for the rest of food groups that make up the FBDG for the Spanish population.

RESUMEN Introducción Las raciones de consumo son cantidades estándar de alimentos o bebidas sugeridas para asesorar sobre la cantidad de alimento a consumir para preservar un estado de salud adecuado. El objetivo principal de este trabajo es establecer los tamaños de ración de consumo de frutas y hortalizas (FH) para uso en guías alimentarias. Material y Métodos Se adaptó la metodología de la United States Department of Agriculture (USDA) para el establecimiento de los tamaños de ración de consumo para guías, y la del Sistema de Intercambios. Se recopilaron datos de porción reportados en encuestas y calibres comunes en el mercado, se ajustó a cantidades de alimento fácilmente reconocibles y con equivalencia de nutrientes clave y se evaluó el grado de cumplimiento de los objetivos de salud pública para el consumo de FH. Resultados Los tamaños de porción típicamente reportados en encuestas españolas son escasos y poco homogéneos, y no se encontraron datos publicados en revistas científicas sobre los calibres. Las guías alimentarias españolas, a pesar de mostrar un rango de tamaño de ración para FH no aseguran que sean intercambiables ni especifican el método para llegar a las mismas. La ración de hortalizas obtenida ha sido de 139,44g (DS:±21,98; CV:0,16), de 137,68g (DS:±49,61; CV:0,36) para frutas y 28,00g (DS:±7,53; CV:0,27) para frutas desecadas. Conclusiones Con las raciones establecidas, el mensaje “consume al menos 5 raciones entre FH al día” permitiría alcanzar los objetivos de Salud Pública para FH establecidos en 600g (peso neto)/persona/día. Se recomienda a la Agencia Española de Consumo, Seguridad Alimentaria y Nutrición (AECOSAN) que use esta misma metodología para el establecimiento de raciones en el resto de grupos de alimentos que configuran la Guía Dietética Basada en Alimentos para la población española.

ABSTRACT The evolutionary and ecological success of insects is largely due to their associated bacteria and fungi that expand their metabolic capacities or allow them to resist stress or parasites. Some of these associations possibly originated hundreds of millions of years ago and have resulted in such interdependence that in some cases the insect and bacteria may not exist separately. This has also led to a significant reduction in the genome size of bacterial symbionts and to the maternal transfer of symbionts to progeny. The study of insect symbionts has recently gained great interest and some of the biological functions of symbionts within hosts have been identified. Scale insects or cochineals feed on the sap of plants, which is rich in carbon but poor in nitrogen and so they require symbionts to compensate for diet deficiencies. Some scale insects are devastating crop pests. In this article, we review the symbionts of some scale insects focusing on carmine- and wax cochineals, which have commercial, art and craft interest. In the cochineals studied we found diverse microbial communities that can synthesize amino acids, vitamins, fix nitrogen or recycle the waste products of nitrogen metabolism.

RESUMEN Parte del éxito evolutivo y ecológico de los insectos se atribuye a las bacterias y hongos asociados a ellos que amplían sus capacidades metabólicas o les permiten resistir estrés o parasitosis. Las asociaciones posiblemente se originaron hace cientos de millones de años y el resultado es una interdependencia que, en algunos casos, insecto y bacteria no pueden existir separadamente, lo que ha llevado a una reducción significativa de los genomas de los simbiontes bacterianos y a la transferencia por vía materna de éstos a la progenie. Recientemente, el estudio de los simbiontes de insectos ha cobrado gran interés y se han identificado algunas de sus funciones biológicas dentro de los hospederos. Los insectos escama o cochinillas se alimentan de la savia de las plantas, por lo que requieren simbiontes para compensar las deficiencias de su dieta, rica en carbono pero pobre en compuestos nitrogenados. Algunas de las plagas más agresivas de los cultivos agrícolas son los insectos escama. En este artículo revisamos los simbiontes de la cochinilla del carmín y de la laca, de gran interés comercial y artesanal. En las cochinillas que se estudiaron encontramos diversas comunidades microbianas con la capacidad de sintetizar aminoácidos, vitaminas, fijar nitrógeno o reciclar los productos de desecho del metabolismo nitrogenado.

Abstract: Objective: To compare the genetic determinants involved in plant colonization or virulence in the reported genomes of K. variicola, K. quasipneumoniae and K. pneumoniae. Materials and methods: In silico comparisons and Jaccard analysis of genomic data were used. Fimbrial genes were detected by PCR. Biological assays were performed with plant and clinical isolates. Results: Plant colonization genes such as cellulases, catalases and hemagglutinins were mainly present in K. variicola genomes. Chromosomal β-lactamases were characteristic of this species and had been previously misclassified. K. variicola and K. pneumoniae isolates produced plant hormones. Conclusions: A mosaic distribution of different virulence- and plant-associated genes was found in K. variicola and in K. quasipneumoniae genomes. Some plant colonizing genes were found mainly in K. variicola genomes. The term plantanosis is proposed for plant-borne human infections.

Resumen: Objetivo: Comparar genes de colonización de plantas o de virulencia en los genomas reportados de K. variicola, K. quasipneumoniae y K. pneumoniae. Material y métodos: Se utilizaron análisis in silico y de Jaccard. Por PCR se detectaron genes de fimbrias. Se realizaron ensayos biológicos con aislados de plantas y clínicos. Resultados: Los genes de colonización de plantas como celulasas, catalasas y hemaglutininas se encontraron principalmente en genomas de K. variicola. Las β-lactamasas cromosómicas son características de la especie y en algunos casos estaban mal clasificadas. K. variicola y K. pneumoniae producen hormonas vegetales. Conclusiones: Se encontró una distribución en mosaico de los genes de asociación con plantas y de virulencia en K. variicola y K. quasipneumoniae. Principalmente en K. variicola se encontraron algunos genes involucrados en la colonización de plantas. Se propone el término plantanosis para las infecciones humanas de origen vegetal.

Abstract: Objective: Due to the fact that K. variicola, K. quasipneumoniae and K. pneumoniae are closely related bacterial species, misclassification can occur due to mistakes either in normal biochemical tests or during submission to public databases. The objective of this work was to identify K. variicola and K. quasipneumoniae genomes misclassified in GenBank database. Materials and methods: Both rpoB phylogenies and average nucleotide identity (ANI) were used to identify a significant number of misclassified Klebsiella spp. genomes. Results: Here we report an update of K. variicola and K. Quasipneumoniae genomes correctly classified and a list of isolated genomes obtained from humans, plants, animals and insects, described originally as K. pneumoniae or K. variicola, but known now to be misclassified. Conclusions: This work contributes to recognize the extensive presence of K. variicola and K. quasipneumoniae isolates in diverse sites and samples.

Resumen: Objetivo: Identificar genomas mal clasificados de K. variicola, y K. quasipneumoniae en la base de datos del GenBank. Material y métodos: En el presente estudio se usaron tanto análisis filogenéticos usando rpoB como la identidad media de nucleótidos (ANI, por sus siglas en ingles) para identificar un número significativo de genomas del género Klebsiella. Resultados: Se reportó una actualización de genomas de K. variicola y K. quasipneumoniae correctamente clasificados y una lista de aquellos aislamientos obtenidos de seres humanos, plantas, animales e insectos, descritos originalmente como K. pneumoniae o K. variicola pero ahora se conoce que están mal clasificados. Conclusiones: Este trabajo contribuye a la presencia extensiva de aislamientos de K. variicola y K. quasipneumoniae en diversos sitios y muestras.

Abstract: Objective: To compare the genetic determinants involved in plant colonization or virulence in the reported genomes of K. variicola, K. quasipneumoniae and K. pneumoniae. Materials and methods: In silico comparisons and Jaccard analysis of genomic data were used. Fimbrial genes were detected by PCR. Biological assays were performed with plant and clinical isolates. Results: Plant colonization genes such as cellulases, catalases and hemagglutinins were mainly present in K. variicola genomes. Chromosomal β-lactamases were characteristic of this species and had been previously misclassified. K. variicola and K. pneumoniae isolates produced plant hormones. Conclusions: A mosaic distribution of different virulence- and plant-associated genes was found in K. variicola and in K. quasipneumoniae genomes. Some plant colonizing genes were found mainly in K. variicola genomes. The term plantanosis is proposed for plant-borne human infections.

Resumen: Objetivo: Comparar genes de colonización de plantas o de virulencia en los genomas reportados de K. variicola, K. quasipneumoniae y K. pneumoniae. Material y métodos: Se utilizaron análisis in silico y de Jaccard. Por PCR se detectaron genes de fimbrias. Se realizaron ensayos biológicos con aislados de plantas y clínicos. Resultados: Los genes de colonización de plantas como celulasas, catalasas y hemaglutininas se encontraron principalmente en genomas de K. variicola. Las β-lactamasas cromosómicas son características de la especie y en algunos casos estaban mal clasificadas. K. variicola y K. pneumoniae producen hormonas vegetales. Conclusiones: Se encontró una distribución en mosaico de los genes de asociación con plantas y de virulencia en K. variicola y K. quasipneumoniae. Principalmente en K. variicola se encontraron algunos genes involucrados en la colonización de plantas. Se propone el término plantanosis para las infecciones humanas de origen vegetal.

Abstract: Objective: Due to the fact that K. variicola, K. quasipneumoniae and K. pneumoniae are closely related bacterial species, misclassification can occur due to mistakes either in normal biochemical tests or during submission to public databases. The objective of this work was to identify K. variicola and K. quasipneumoniae genomes misclassified in GenBank database. Materials and methods: Both rpoB phylogenies and average nucleotide identity (ANI) were used to identify a significant number of misclassified Klebsiella spp. genomes. Results: Here we report an update of K. variicola and K. Quasipneumoniae genomes correctly classified and a list of isolated genomes obtained from humans, plants, animals and insects, described originally as K. pneumoniae or K. variicola, but known now to be misclassified. Conclusions: This work contributes to recognize the extensive presence of K. variicola and K. quasipneumoniae isolates in diverse sites and samples.

Resumen: Objetivo: Identificar genomas mal clasificados de K. variicola, y K. quasipneumoniae en la base de datos del GenBank. Material y métodos: En el presente estudio se usaron tanto análisis filogenéticos usando rpoB como la identidad media de nucleótidos (ANI, por sus siglas en ingles) para identificar un número significativo de genomas del género Klebsiella. Resultados: Se reportó una actualización de genomas de K. variicola y K. quasipneumoniae correctamente clasificados y una lista de aquellos aislamientos obtenidos de seres humanos, plantas, animales e insectos, descritos originalmente como K. pneumoniae o K. variicola pero ahora se conoce que están mal clasificados. Conclusiones: Este trabajo contribuye a la presencia extensiva de aislamientos de K. variicola y K. quasipneumoniae en diversos sitios y muestras.

Abstract Introduction: The primary objective of this study was to find out the prevalence of overweight and obese status, as well as their association to pulmonary function, total cholesterol and vitamin D in patients with cystic fibrosis (CF). Materials and methods: This is a multicenter descriptive and cross-sectional study. Twelve Spanish hospitals participated. 451 patients with CF were included. Adults were classified according to body mass index (BMI) and children were classified according to BMI percentiles (WHO tables). Pearson's correlation, Anova, Student's t-test and multiple linear regression were conducted. Results: Mean age was 12.3 (range 4-57) years old, 51% were male and 18% had pancreatic sufficiency. Participants were classified in five nutritional status categories: 12% were malnourished; 57%, at nutritional risk; 24%, normally nourished; 6%, overweight; and 1%, obese. Pulmonary function in overweight or obese patients (91 ± 19%) was better than in malnourished patients (77 ± 24%) (p = 0.017). However, no difference was observed between those at nutritional risk (86 ± 19%) or normally nourished (90 ± 22%) groups. Overweight and obese patients had higher levels of total cholesterol (p = 0.0049), a greater proportion of hypercholesterolemia (p = 0.001), as well as lower levels of 25 OH vitamin D (p = 0.058). Conclusions: Prevalence of overweight and obese was 6 and 1%. Excess weight status does not offer any benefit in pulmonary function in comparison to normally nourished patients.

Resumen Introducción y objetivos: conocer la prevalencia de sobrepeso y obesidad, así como su asociación con la función pulmonar, el colesterol total y la vitamina D en pacientes con fibrosis quística (FQ). Material y métodos: estudio multicéntrico descriptivo y transversal. Participaron 12 hospitales españoles. Fueron incluidos 451 pacientes con FQ, clasificados según el índice de masa corporal (IMC) en adultos y el IMC percentilado (tablas OMS) en niños. Análisis estadístico: C.Pearson, Anova, t de Student y regresión lineal múltiple. Resultados: la mediana de edad fue 12,3 (rango 4-57) años. Un 51% eran varones y el 18%, suficientes pancreáticos (SP). El 12% estaba desnutrido; el 57%, en riesgo nutricional; el 24%, normonutrido; el 6% presentaba sobrepeso; y un 1%, obesidad. La función pulmonar en los pacientes con sobrepeso (91 ± 19%) era mejor que en los desnutridos (77 ± 24%) (p = 0,017), sin embargo, no se observaron diferencias con respecto a los que estaban en riesgo nutricional (86 ± 19%) o normonutridos (90 ± 22%). Los pacientes con sobrepeso tenían más elevado el colesterol total (p = 0,0049), mayor proporción de hipercolesterolemia (p = 0,001), así como niveles más bajos de 25 OH vitamina D (p = 0,058). Conclusiones: la prevalencia de sobrepeso y obesidad fue del 6 y el 1%. El sobrepeso y la obesidad no ofrecen beneficio sobre la función pulmonar en comparación con los normonutridos.

Introduction and objectives: evaluate vitamin D status and its association with chronic lung colonisation in Cystic Fibrosis patients. Material and methods: descriptive cross-sectional multicenter study. From November 2012 to April 2014, at 12 national hospitals, 377 patients with Cystic Fibrosis were included. Vitamin D levels < 30 ng/ml were classified as insufficient. Chronic colonisation was considered if they had at least two positive cultures in the past year. Results: the median age was 8.9 years (2 months to 20 years). 65% had insufficient levels of vitamin D. There was an inverse correlation between age and vitamin D levels (r = -0.20 p < 0.001). Those diagnosed by screening, were younger and had higher levels of vitamin D. There was an inverse correlation between the number of colonisations and vitamin D levels (r = -0.16 p = 0.0015). Adjusting for age, pancreatic status and diagnosis by screening, colonization by S. aureus in <6 years and Pseudomonas sp. in > 6 years, increased the risk of insufficient levels of vitamin D: OR 3.17 (95% CI 1.32 to 7.61) (p = 0.010) and OR 3.77 (95% CI 1.37 to 10 , 37) (p = 0.010), respectively. Conclusions: despite adequate supplementation, more than half of our patients did not achieve optimal levels of vitamin D. Regardless of age, diagnosis by screening or pancreatic status, chronic colonization by Pseudomonas sp. in children and adolescents and S. Aureus in infants and preschoolars increases the risk of developing vitamin D deficiency in these patients.

Introducción y objetivos: conocer la situación en la que se encuentran los pacientes con fibrosis quística en relación con sus niveles de vitamina D y su asociación con las colonizaciones pulmonares crónicas. Material y métodos: estudio multicéntrico transversal. Participaron 12 hospitales nacionales. De noviembre a abril del 2012 al 2014 se incluyeron 377 pacientes con fibrosis quística. Se consideraron insuficientes niveles de vitamina D < 30 ng/ml. Presentar al menos dos cultivos positivos en el último año fue considerado un criterio de colonización crónica. Resultados: los pacientes tenían una mediana de edad de 8,9 años (2 meses-20 años). Un 65% presentaban niveles insuficientes de vitamina D. Se observó una correlación inversa entre edad y niveles de vitamina D (r = -0,20 p < 0,001). Los diagnosticados por cribado eran más jóvenes y tenían niveles de vitamina D más altos. Los niveles de vitamina D presentaron una correlación inversa con el número de colonizaciones pulmonares (r = -0,16 p = 0,0015). Ajustando por edad, función pancreática y diagnóstico mediante cribado, la colonización por S. Aureus en menores de seis años y por Pseudomonas sp. en los mayores de esa edad, incrementaban el riesgo de presentar niveles insuficientes de vitamina D: OR 3,17 (IC95% 1,32-7,61) (p=0,010) y OR 3,77 (IC95% 1,37- 10,37)(p = 0,010), respectivamente. Conclusiones: a pesar de una suplementación adecuada, más de la mitad de nuestros pacientes no alcanzan niveles óptimos de vitamina D. La colonización crónica por Pseudomonas sp. en escolares y adolescentes y por S. Aureus en lactantes y preescolares se asocia de forma independiente con la deficiencia de vitamina D.