Neste estudo, 16 cepas de F. verticillioides isoladas de amostras de ração de milho foram caracterizadas com base na produção de fumonisinas (FB) e em marcadores de polimorfismos de DNA amplificado ao acaso (RAPD). Todas as cepas produziram FB1 e FB2, com níveis variando, respectivamente, de 2,41 a 3996,36 µg/g e 1,18 a 1209,91 µg/g. De acordo com a produção de fumonisinas totais (FB1 + FB2) e a distribuição por análise de quartis, do total de 16 cepas de F. verticillioides, quatro foram identificadas como baixas produtoras de fumonisinas (3,59 a 1289,84 µg/g), oito como intermediárias (>1289,84 a 3772,44 µg/g) e quatro como altas produtoras de fumonisinas (>3772,44 µg/g). Os 10 primers utilizados amplificaram 105 locos, 60 (57,14%) dos quais foram polimórficos. As análises de RAPD mostraram padrões muito similares entre as cepas baixas, médias e altas produtoras de fumonisinas. Embora os marcadores RAPD tenham se mostrado capazes de discriminar as diferentes cepas de F. verticillioides, não foi detectada nenhuma associação entre estes marcadores e a produção de fumonisinas.

In this study a total of 16 Fusarium verticillioides strains isolated from corn feed samples were characterized by fumonisin (FB) production and random amplified polymorphic DNA (RAPD). All the strains produced FB1 and FB2 with levels ranging from 2.41 to 3996.36 µg/g, and from 1.18 to 1209.91 µg/g, respectively. From the 16 F. verticillioides strains, four were identified as low (3.59 to 1289.84 µg/g), eight as intermediate (>1289.84 to 3772.44 µg/g) and four strains as high (>3772.44 µg/g) fumonisin producers. From the total of 105 loci amplified, 60 (57.14%) were polymorphic. RAPD analysis showed very similar patterns among low, moderate and high fumonisin-producing strains. Although RAPD markers were capable of discriminating the different F. verticillioides strains, there was no clear association between these makers and fumonisin production.

Em seres humanos, as infecções múltiplas pelo papilomavírus têm sido demonstradas em vários estudos. Em bovinos, somente recentemente foram conduzidas investigações com o objetivo de avaliar infecções mistas pelo papilomavírus. O presente trabalho teve como objetivo descrever a co-infecção por dois tipos de papilomavírus bovino (BPV) em um papiloma de teto. A amostra clínica foi obtida de uma vaca pertencente a um rebanho de corte localizado na região norte do estado do Paraná, Brasil. Inicialmente, a técnica de PCR foi realizada com o par de oligonucleotídeos iniciadores FAP, que amplificam um segmento do gene L1, sendo que o amplicon gerado foi submetido ao sequenciamento direto. Entretanto, como as sequências obtidas não apresentaram qualidade aceitável, o amplicon foi clonado e dez clones foram selecionados para um novo sequenciamento. A análise das sequências dos insertos revelou a presença de dois diferentes tipos de BPV. O BPV-1 (gênero Deltapapillomavirus) foi detectado em seis clones, enquanto o BPV-6 (gênero Xipapillomavirus) foi detectado em quatro clones. Esse resultado confirma a ocorrência da co-infecção pelo BPV associada a papilomas cutâneos em bovinos.

The common occurrence of multiple papillomavirus infections has been shown in several studies involving the human host. However, investigations with the aim of identifying mixed papillomavirus infections in cattle have been conducted only recently. In the current work we describe a co-infection with two different bovine papillomavirus (BPV) types that was identified in a bovine teat papilloma. The skin wart was obtained from a cow belonging to a Brazilian beef herd. A PCR assay was carried out with the FAP primer pair, which amplifies a partial segment of the L1 gene (approximately 478 bp), and the amplicon was submitted to direct sequencing. Because nucleotide sequences with satisfactory quality scores were not obtained, the amplicon was cloned and further sequencing, involving ten selected clones, was performed. The sequence analysis of the cloned inserts revealed the presence of two different BPV types. BPV-1 (Deltapapillomavirus genus) was detected in six clones, while BPV-6 (Xipapillomavirus genus) was detected in four clones. This finding confirms the presence of BPV co-infection associated with cutaneous papillomatosis in cattle.

A ocratoxina A é uma micotoxina frequentemente encontrada em uma grande variedade de produtos alimentares e apresenta efeitos nefrotóxicos e potencial carcinogênico para animais e humanos. É naturalmente produzida por algumas espécies fúngicas, como Aspergillus carbonarius, que é considerado um potente produtor. Apesar disso, o número de estudos que visam identificar genes que são essenciais para a biossíntese de ocratoxina em A. carbonarius é ainda reduzido. Um mutante de A. carbonarius com baixa produção de ocratoxina A previamente obtido por transformação mediada por Agrobacterium tumefaciens foi investigado com o objetivo de encontrar uma associação entre o gene interrompido e a biossíntese desta micotoxina. Os resultados mostraram a ocorrência de uma junção não exata entre o T-DNA e o DNA genômico do fungo durante o evento de integração. A integração do T-DNA no genoma do mutante T188 provocou deleção de 727 nucleotídeos. Esta deleção inclui uma porção final do gene coativador de splicing e uma região não-codificante entre este gene e o gene F-actina. A expressão relativa do gene coativador de splicing na linhagem selvagem cultivada em quatro diferentes meios mostrou associação entre a quantidade de ocratoxina A e os níveis dos transcritos.

Ochratoxin A is a mycotoxin produced by some fungi species. Among them, Aspergillus carbonarius is considered a powerful producer. Genes involved in the ochratoxin A biosynthesis pathway have been identified in some producer species. However, there are few studies that purpose to identify these genes in A. carbonarius. The use of insertion mutants to identify genes associated with certain properties has been increased in the literature. In this work, the region of T-DNA integration was investigated in one A. carbonarius ochratoxin-defective mutant previously obtained by Agrobacterium tumefaciens-mediated transformation, in order to find an association between interrupted gene and the biosynthesis of ochratoxin A. The integration occurred in a gene that possibly encodes a splicing coactivator protein. The analysis of the relative expression of the splicing coativator gene from A. carbonarius wild type strain in four different media showed high correlation between the transcript levels and the ochratoxin A production.

A papilomatose cutânea é comumente observada nos rebanhos bovinos e caracterizada pela presença de tumores proliferativos benignos causados pela infecção pelo papilomavírus bovino (BPV). Enquanto a infecção múltipla pelo papilomavírus humano (HPV) é um achado comum tanto em seres humanos saudáveis quanto em pacientes com imunodeficiência, na medicina veterinária esses relatos ainda são escassos. O objetivo desse estudo foi descrever a ocorrência de infecções múltiplas pelo BPV em rebanhos afetados pela papilomatose cutânea. Quinze papilomas foram obtidos, de pelo menos duas regiões anatômicas diferentes, de seis bovinos com papilomatose e provenientes de três rebanhos de corte localizados no estado do Paraná, Brasil. Os tipos virais presentes nas lesões foram identificados por PCR, utilizando o par de oligonucleotídeos iniciadores FAP, seguidos de sequenciamento direto ou clonagem e novo sequenciamento dos insertos. A análise das sequências obtidas permitiu a identificação do BPV-1, -2, -6 e -8, além de supostos novos tipos (BPV/BR-UEL3, BPV/BR-UEL4, e BPV/BR-UEL5), descritos anteriormente. Infecções por dois tipos diferentes de BPV foram identificadas em quatro animais (A, B, D e E) dos seis incluídos nesse estudo. A estratégia adotada neste estudo permitiu a identificação de infecção múltipla por dois ou três diferentes tipos virais do BPV no mesmo animal. Além disso, a avaliação de quatro animais de um mesmo rebanho demonstrou a presença de seis tipos virais circulantes. Esses resultados sugerem que tanto as infecções múltiplas quanto a grande diversidade viral podem ser frequentes nos bovinos, assim como o observado nos humanos. O reconhecimento da multiplicidade e complexidade das infecções pelo BPV pode colaborar para o entendimento dos aspectos epidemiológicos, clínicos e imunológicos da papilomatose cutânea nos rebanhos bovinos.

Cutaneous papillomatosis is a pathological condition commonly found in cattle and is characterized by the presence of benign proliferative tumors caused by bovine papillomavirus (BPV) infection. While multiple infections with human papillomavirus (HPV) are common in healthy and immunodeficient humans, studies with the aim of identifying mixed infections are still sporadic in veterinary medicine. The aim of this study is to describe the occurrence of multiple BPV infections in cattle affected by cutaneous papillomatosis. Fifteen skin warts were collected from at least two diverse anatomical regions of six bovines with papillomatosis belonging to three cattle herds from the Paraná state in Brazil. The BPV types present in the skin wart samples were determined by a PCR assay performed with the FAP primer pair for partial L1 gene amplification followed by direct sequencing or by cloning and sequencing of the inserts. Sequence analysis of the obtained amplicons allowed the identification of four characterized BPV types (BPV-1, -2, -6, and -8) and three previously described putative new BPV types (BPV/BR-UEL3, BPV/BR-UEL4, and BPV/BR-UEL5). Double infections were identified in four (A, B, D, and E) of the six animals included in this study. In this work, the strategy adopted to evaluate skin warts from diverse anatomical sites of the same animal allowed the identification of multiple infections with two or three different BPV types. The analysis of four animals belonging to a single cattle herd also showed the presence of six different viral types. These results clearly suggest that both multiple papillomaviral infection and a high viral diversity can be as frequent in cattle as in human beings.

Dentre as micotoxinas que contaminam produtos destinados à alimentação humana e animal, a ocratoxina A (OTA) é uma das mais freqüentemente encontrada. A sua ocorrência em vários produtos agrícolas tem sido considerada um problema de amplitude mundial. Esta toxina é produzida principalmente por fungos do gênero Aspergillus. A OTA tem efeitos nefrotóxico, imunossupressor e carcinogênico. A contaminação de alimentos com esta toxina representa risco para a saúde animal e humana. Nos últimos cinco anos, vários investigadores têm desenvolvido métodos moleculares para identificação e quantificação de fungos produtores de OTA em amostras de grãos de café. O objetivo desta revisão é apresentar e discutir as várias estratégias desenvolvidas recentemente para a detecção de fungos potencialmente produtores de OTA.

Ochratoxin A (OTA) is one of the most abundant food-contaminating mycotoxins. Its occurrence in several agricultural commodities has been considered a worldwide problem. This toxin is mainly produced by Aspergillus species. OTA has nephrotoxic, immunosuppressive, and carcinogenic effects and consequently the contamination with this toxin represents a high risk for human and animal health. In the last 5 years, several investigators have applied molecular methods in order to develop PCR assays for identifying and quantifying OTA-producing fungi in coffee beans samples. The main objective is to allow the detection of microorganisms capable of producing OTA, preferentially prior to ochratoxin production and accumulation. In this contribution several of these attempts will be reviewed and discussed.

Neste trabalho foi analisada a relação genética entre 51 isolados obtidos de amostras de frutas secas provenientes de diferentes regiões do previamente identificados como pertencentes ao agregado A. niger e 7 isolados de Aspergillus tubingensis obtidos de amostras de café do Brasil. Maior diversidade fúngica foi encontrada em uvas passas escuras. Aspergillus niger sensu stricto foi a espécie mais frequente. Esta espécie foi encontrada em todos os substratos e origens geográficas analisadas. Baseando-se nos dados de Polimorfismo de DNA Amplificado ao Acaso (RAPD) e sequências de nucleotídeos do gene da β-tubulina, dois grupos de A. niger foram observados. Apesar do pequeno número de isolados do grupo IV uma associação entre padrão de extrólitos e agrupamento molecular foi encontrada. A. tubingensis foi a segunda espécie mais frequente e foi claramente subdivida em dois grupos. Como os grupos de A. tubingensis são formados somente por linhagens não produtoras de ocratoxina A, a identificação destes grupos não explica a controvérsia encontrada na literatura sobre a capacidade desta espécie em produzir a referida toxina.

We analyzed the genetic relationships between 51 fungal isolates previously identified as A. niger aggregate, obtained from dried fruit samples from worldwide origin and 7 A. tubingensis obtained from Brazilian coffee beans samples. Greater fungal diversity was found in black sultanas. Aspergillus niger sensu stricto was the most prevalent species. It was found in all fruit substrates of all geographical origins. Based on Random Amplification of Polymorphic DNA (RAPD) and β-tubulin sequences data two groups of A. niger were found. In spite of the small number of isolates from Group IV an association between extrolite patterns and molecular clustering is speculated. A. tubingensis were the second most frequent species and this species were clearly subdivided into two groups. The finding of two groups for A. tubingensis strains could not yet explain the contradictions found in the literature about the capability this species for ochratoxin production, because both of them were formed by only non-ochratoxin-producing strains.

Retroelements are a diversified fraction of eukaryotic genomes, with the Ty1/copia and Ty3/gypsy groups being very common in a large number of plant genomes. We isolated an internal segment of the Ty3/gypsy retroelement of Cestrum strigilatum (Solanaceae) using PCR amplification with degenerate primers for a conserved region of reverse transcriptase. The isolated segment (pCs12) was sequenced and showed similarity with Ty3/gypsy retroelements of monocotyledons and dicotyledons. This segment was used as probe in chromosomes of C. strigilatum and Cestrum intermedium. Diffuse hybridization signals were observed along the chromosomes and more accentuated terminal signals in some chromosome pairs, always associated with nucleolus organizer regions (NORs). The physical relationship between the hybridization sites of pCs12 and pTa71 ribosomal probes was assessed after sequential fluorescence in situ hybridization (FISH). Hybridization signals were also detected in the B chromosomes of these species, indicating an entail among the chromosomes of A complement and B-chromosomes.

Algumas espécies pertencentes ao gênero Aspergillus possuem potencial para produção de Ocratoxina A (OA), uma micotoxina de efeitos nefrotóxicos, imunossupressivos, teratogênicos e carcinogênicos. Com o objetivo de identificar as espécies de Aspergillus que contaminam o interior de grãos de café, foram coletadas amostras em diferentes estádios de maturação do produto, em 16 propriedades produtoras do norte do estado do Paraná. Um total de 108 isolados de Aspergillus spp. foram identificados ao nível de espécie, pelo sequenciamento dos espaços internos transcritos (ITS1-5,8S-ITS2) do DNA ribossomal (rDNA). Os resultados revelaram a presença de espécies potencialmente ocratoxigênicas em 82% das regiões analisadas, sendo dentre estas, Aspergillus niger a espécie mais freqüentemente detectada,seguida por A. ochraceus, e A. carbonarius. É relatada pela primeira vez a presença de A. carbonarius em frutos de café coletados na árvore.

Some species belonging to the genus Aspergillus are potential producers of ochratoxin A (OA), a mycotoxin with nephrotoxic, immunosuppressive, teratogenic and carcinogenic effects. The aim of the present study was to identify the species of Aspergillus that contaminate the inside of coffee beans collected in the stage of maturation and drying, from 16 producing areas located in the northern region of the State of Paraná, in the South of Brazil. A total of 108 isolates of Aspergillus spp. was identified at the species level, by sequencing the internal transcribed spacer (ITS1-5.8S-ITS2) of ribosomal DNA (rDNA). The results revealed the presence of potentially ochratoxigenic species in 82% of the geographic regions studied, among which Aspergillus niger was the species most frequently detected, followed by A. ochraceus and A. carbonarius. The presence of A. carbonarius in immature coffee fruits harvested from trees is reported for the first time.

The RADP (Random amplified polymorphic DNA) technique was used to detect tissue-culture-induced variations in sugarcane. Plants of the Brazilian variety RB83-5486 propagated via rhizomes and via meristem cultures were studied. The polymorphism rate for 98 RAPD loci was 6.93% when the plants derived from meristems. Besides, in order to evaluate the influence of the number of subcultures on the generation of somaclonal variation, field-grown RB83-5486 plants derived from 10 meristems were studied after five subcultivations. Although different rates of polymorphism were observed, there was no direct association with the stage of subcultivation. The analysis of plants of two sugarcane varieties cultivated in vitro from meristems showed that variety RB83-5486 was more unstable than variety SP80-185.

Extracellular proteases have been shown to be factors of virulence in fungal entomopathogenicity. We examined the production of the cuticle-degrading extracellular proteases chymoelastase (Pr1) and trypsin (Pr2) in isolates of the fungus Metarhizium flavoviride. Fungal growth was in a mineral medium (MM) containing nitrate, and in MM supplemented with either cuticle from Rhammatocerus schistocercoides or with the non-cuticular substrate casein. The substrates used for growth influenced the expression of both analyzed proteases, the highest protease activities of nearly all isolates having been observed in the medium containing insect cuticle, with more Pr1 than Pr2 being produced. There was a natural variability in the production of cuticle-degrading proteases among isolates, although this was less evident for Pr2. Our data support the hypothesis that the production of Pr1 on insect cuticle is a useful characteristic for the analysis of intraspecific variability of M. flavoviride isolates.

As análises de RAPD (Polimorfismo de DNA Amplificado ao Acaso) e ITS (Sequências Internas Transcritas) foram utilizadas para investigar a variabilidade molecular entre isolados de Paecilomyces e para identificar cinco isolados morfologicamente atípicos, obtidos a partir de mosca branca no Norte do Estado do Paraná, que possuíam alguma semelhança com P. fumosoroseus. O produto da amplificação com os primers ITS4 e ITS5 apresentou 700 pares de bases para todos os isolados investigados. Os cinco isolados não identificados deram origem a padrões de restrição idênticos a todas as linhagens de P. fumosoroseus utilizadas como referência. A variabilidade observada nos perfis de RAPD foi suficiente para discriminar todos os isolados. A similaridade genética entre os isolados não identificados e as linhagens de P. fumosoroseus foi maior do que aquela observada entre as linhagens referência desta espécie. Este fato permitiu concluir que os isolados CNPso-P77, CNPso-P78, CNPso-P80, CNPso-P85 and CNPso-P91 pertencem à espécie P. fumosoroseus.

ITS and RAPD analyses were used to investigate molecular variations within samples of Paecilomyces isolates and to resolve five morphologically atypical isolates resembling P. fumosorosus, obtained from whitefly in Northern Paraná State. The ITS4-ITS5 amplicon was 700 base pairs (bp) long in all isolates. The five isolates of Paecilomyces not assigned to species produced restriction profiles identical to all the reference strains of P. fumosoroseus. The extent of fingerprint variability observed by RAPD was sufficient to discriminate all the isolates. The genetic similarity among unidentified isolates and strains of P. fumosoroseus was even higher than that observed among reference strains of this species, allowing us to conclude that isolates CNPso-P77, CNPso-P78, CNPso-P80, CNPso-P85 and CNPso-P91 are P. fumosoroseus.

Os eventos de mutação são responsáveis pela geração de variabilidade genética nas populações, permitindo a ação da seleção natural que favorece os tipos mais adaptados. A exploração dessa variabilidade, embora de forma empírica, teve início há cerca de dez mil anos, quando se deu a domesticação das primeiras culturas agrícolas. Com o advento da genética, práticas racionais de seleção passaram a ser adotadas visando o melhoramento genético de plantas, animais e microrganismos de interesse para o homem. Recentemente, surgiram as técnicas de manipulação de DNA, permitindo a transferência de genes entre organismos, transpondo barreiras de cruzamento entre os reinos vegetal, animal, protista e fungi. A geração dos organismos geneticamente modificados, ou transgênicos, tem sido alvo de polêmica e discussão nos diversos segmentos da sociedade. Porém, não se deve generalizar o uso dos transgênicos, pois cada um deve ser analisado quanto às suas vantagens, desvantagens e contribuição à melhoria da qualidade de vida. Métodos recentes de mutação e recombinação gênica in vitro são também apresentados no texto.

Mutation events are responsible for the generation of genetic variability in the populations enabling the occurrence of natural selection which favors the better-adapted types. The exploitation of this variability, though carried out empirically, dates from ten thousand years ago with the domestication of the first cultivated crops. With the advent of genetics, rational selection procedures were adopted with a view to the genetic breeding of plants, animals and microorganisms which might be of interest to men. Recently, new DNA manipulation techniques came up enabling the transference of genes between organisms, cutting across barriers which hindered crossings between the vegetable, animal, protist and fungus kingdoms. The generation of genetically modified organisms, or transgenics, has aroused a heated and controversial debate in various sectors of our society. Yet we must be cautious before generalizing the use of transgenics since each one should be analyzed at a time for its particular advantages and drawbacks, and for its contribution to the improvement of life quality. This paper also considers recent methods of mutation and in vitro genic recombination.

Bandas de dsRNA foram detectadas em três dos doze isolados de Paecilomyces fumosoroseus. A identidade destas bandas foi provada através de tratamentos com RNAse, DNAse e S1 nuclease. A cura do dsRNA para um dos isolados (P92) foi obtida através do isolamento de colônias monospóricas. Linhagens isogênicas, com e sem dsRNA, foram submetidas ao teste de virulência contra a mosca branca Bemisia tabaci biotipo B. Ao contrário do que ocorre para vários fungos fitopatogênicos, os fragmentos de dsRNA não causaram hipovirulência em P. fumosoroseus.

Bands of double-stranded RNA (dsRNA) were detected in three out of twelve isolates of Paecilomyces fumosoroseus. Identity of these bands was confirmed by RNAse, DNAse and S1 nuclease treatments. The cure of dsRNA for one isolate (P92) was successfully carried out for a single conidium subculture. Isogenic strains, with or without dsRNA, were submitted to virulence tests against the whitefly Bemisia tabaci strain B. In contrast to findings for some phytopathogenic fungi, these dsRNA fragments did not cause hypovirulence in P. fumosoroseus.