AbstractIntroduction: This paper aims to develop a data warehouse (AD-SISCOLO) in order to support the management of the cervical cancer screening program in the municipality of Rio de Janeiro/Brazil. As a part of the management process, the program managers of the municipality perform tedious manual work in order to calculate a series of performance indicators and then take decisions based on them. Methods AD-SISCOLO was implemented using the Pentaho BI Suite Business Intelligence Platform and the MySQL database management system. The indicators to be calculated and visualized in the tool were based on the municipal data of the cytopathology and histopathology tests from January 2012 until December 2014, which was obtained from the Information System of Cervical Cancer (SISCOLO) after a record linkage process. The follow-up indicators were based on a simplified version of the Brazilian guidelines for the cervical cancer screening. Results AD-SISCOLO allows the visualization of a set of test-based and follow-up indicators from different views and dimensions, which enable managers to monitor all the phases of the screening process and to identify the process’ failures. Conclusions Compared with the current available environments in Brazil, AD-SISCOLO is unique in its visualization of the follow-up indicators of groups of women, according to their test results and age. Thereby it provides presentation flexibility to suit the program manager's needs.

AbstractIntroductionThis paper's aim is to develop a data warehouse from the integration of the files of three Brazilian health information systems concerned with the production of ambulatory and hospital procedures for cancer care, and cancer mortality. These systems do not have a unique patient identification, which makes their integration difficult even within a single system.MethodsData from the Brazilian Public Hospital Information System (SIH-SUS), the Oncology Module for the Outpatient Information System (APAC-ONCO) and the Mortality Information System (SIM) for the State of Rio de Janeiro, in the period from January 2000 to December 2004 were used. Each of the systems has the monthly data production compiled in dbase files (dbf). All the files pertaining to the same system were then read into a corresponding table in a MySQL Server 5.1. The SIH-SUS and APAC-ONCO tables were linked internally and with one another through record linkage methods. The APAC-ONCO table was linked to the SIM table. Afterwards a data warehouse was built using Pentaho and the MySQL database management system.ResultsThe sensitivities and specificities of the linkage processes were above 95% and close to 100% respectively. The data warehouse provided several analytical views that are accessed through the Pentaho Schema Workbench.ConclusionThis study presented a proposal for the integration of Brazilian Health Systems to support the building of data warehouses and provide information beyond those currently available with the individual systems.

Introduction The lack of a terminology to compare medical devices together with the arbitrary and opaque nature of product registration systems are major obstacles to a more informed decision process regarding the use and acquisition of new medical devices. This paper describes the systematization of information to help in the identification of similar cardiovascular implantable devices. Methods The systematization was developed in four stages: definition of the technical attributes of each device group; classification of a sample of devices; implementation of the proposed systematization in Protégé; and evaluation of the application. The systematization dealt with a set of common attributes – indication of use, anatomic location, manufacturer, device model and lifetime; and a set of attributes specific for each type of device. Results The systematization was performed by means of a hierarchy of classes with the respective properties in Protégé, which support three basic functions: data entry, query, and maintenance. 38 queries were designed to allow the identification of similar devices according to their technical characteristics. The users’ evaluation showed that the application fulfilled the requirements to monitor the price of these devices on the market. Conclusions Protégé was a useful tool for the systematization of cardiovascular implantable devices that can be used for the post-market vigilance of medical device safety. To better fulfill this aim, other attributes may be incorporated to better characterize the safety aspects of these devices.

Este estudo visa avaliar a utilização dos modelos escondidos de Markov (HMM) para a segmentação de nomes de pessoas e sua influência na vinculação de registros. Um modelo HMM foi aplicado à segmentação dos nomes do paciente e da mãe nas bases do Sistema de Informações sobre Mortalidade (SIM), Subsistema de Informação de Procedimentos de Alta Complexidade (APAC), e Sistema de Informação Hospitalar (AIH). Uma amostra de 200 pacientes de cada uma das bases foi segmentada via HMM e o resultado foi comparado com a realizada pelos autores. As bases APAC-SIM e APAC-AIH foram vinculadas usando-se três diferentes estratégias de segmentação dos nomes, sendo uma delas via HMM. A conformidade da segmentação via HMM variou de 90,5% a 92,5%. As estratégias de segmentação produziram resultados similares na vinculação de registros. Este estudo sugere que a segmentação de nomes brasileiros por meio do HMM não é mais eficaz no processo de vinculação que segmentações tradicionais.

This study aimed to evaluate the use of hidden Markov models (HMM) for the segmentation of person names and its influence on record linkage. A HMM was applied to the segmentation of patient’s and mother’s names in the databases of the Mortality Information System (SIM), Information Subsystem for High Complexity Procedures (APAC), and Hospital Information System (AIH). A sample of 200 patients from each database was segmented via HMM, and the results were compared to those from segmentation by the authors. The APAC-SIM and APAC-AIH databases were linked using three different segmentation strategies, one of which used HMM. Conformity of segmentation via HMM varied from 90.5% to 92.5%. The different segmentation strategies yielded similar results in the record linkage process. This study suggests that segmentation of Brazilian names via HMM is no more effective than traditional segmentation approaches in the linkage process.

Este estudio tiene como objetivo evaluar el uso de los modelos ocultos de Markov (HMM) para la segmentación de nombres y de su influencia en la vinculación de registros médicos. Los modelos HMM se aplicaron a la segmentación de los nombres del paciente y de la madre en las bases del Sistema de Información sobre Mortalidad (SIM), Subsistema de Información para los procedimientos de alta complejidad (APAC), y Sistema de Información Hospitalaria. Una muestra de 200 pacientes de cada base fue segmentada por HMM y el resultado se comparó con la obtenida por los autores. Las bases APAC-SIM y APAC-AIH se vincularon con 3 diferentes estrategias de segmentación, siendo una de ellas por HMM. La conformidad de la segmentación por HMM varió de 90,5% a 92,5%. Las estrategias dieron resultados similares en la vinculación. Este estudio sugiere que la segmentación de nombres brasileños por HMM no es más eficaz en el proceso de vinculación que la segmentación tradicional.

Este estudo visa avaliar a utilização dos modelos escondidos de Markov (HMM) para a segmentação de nomes de pessoas e sua influência na vinculação de registros. Um modelo HMM foi aplicado à segmentação dos nomes do paciente e da mãe nas bases do Sistema de Informações sobre Mortalidade (SIM), Subsistema de Informação de Procedimentos de Alta Complexidade (APAC), e Sistema de Informação Hospitalar (AIH). Uma amostra de 200 pacientes de cada uma das bases foi segmentada via HMM e o resultado foi comparado com a realizada pelos autores. As bases APAC-SIM e APAC-AIH foram vinculadas usando-se três diferentes estratégias de segmentação dos nomes, sendo uma delas via HMM. A conformidade da segmentação via HMM variou de 90,5% a 92,5%. As estratégias de segmentação produziram resultados similares na vinculação de registros. Este estudo sugere que a segmentação de nomes brasileiros por meio do HMM não é mais eficaz no processo de vinculação que segmentações tradicionais.

This study aimed to evaluate the use of hidden Markov models (HMM) for the segmentation of person names and its influence on record linkage. A HMM was applied to the segmentation of patient’s and mother’s names in the databases of the Mortality Information System (SIM), Information Subsystem for High Complexity Procedures (APAC), and Hospital Information System (AIH). A sample of 200 patients from each database was segmented via HMM, and the results were compared to those from segmentation by the authors. The APAC-SIM and APAC-AIH databases were linked using three different segmentation strategies, one of which used HMM. Conformity of segmentation via HMM varied from 90.5% to 92.5%. The different segmentation strategies yielded similar results in the record linkage process. This study suggests that segmentation of Brazilian names via HMM is no more effective than traditional segmentation approaches in the linkage process.

Este estudio tiene como objetivo evaluar el uso de los modelos ocultos de Markov (HMM) para la segmentación de nombres y de su influencia en la vinculación de registros médicos. Los modelos HMM se aplicaron a la segmentación de los nombres del paciente y de la madre en las bases del Sistema de Información sobre Mortalidad (SIM), Subsistema de Información para los procedimientos de alta complejidad (APAC), y Sistema de Información Hospitalaria. Una muestra de 200 pacientes de cada base fue segmentada por HMM y el resultado se comparó con la obtenida por los autores. Las bases APAC-SIM y APAC-AIH se vincularon con 3 diferentes estrategias de segmentación, siendo una de ellas por HMM. La conformidad de la segmentación por HMM varió de 90,5% a 92,5%. Las estrategias dieron resultados similares en la vinculación. Este estudio sugiere que la segmentación de nombres brasileños por HMM no es más eficaz en el proceso de vinculación que la segmentación tradicional.

Um grande problema em estimativas demográficas no Brasil diz respeito ao nível e padrão da mortalidade. Os demógrafos que trabalham com mortalidade, no país, ainda não se sentem tão seguros sobre o real comportamento desta componente da dinâmica populacional. Por outro lado, necessita-se da disponibilidade de indicadores de mortalidade para níveis geográficos mais desagregados, sobretudo municípios. O problema é que quanto mais desagregado, mais complexo se torna o trabalho de estimar qualquer indicador social ou demográfico. Neste trabalho, objetiva-se estimar e propor correção de sub-registros de óbitos no nível municipal, segundo grupos etários, por meio de dois métodos: estimador bayesiano empírico (BE) e algoritmo EM (Expectation-Maximization). Para que os dois métodos fossem operacionalizados entre municípios semelhantes, foram realizados dois exercícios: agruparam-se os municípios segundo a mesorregião; e agruparam-se os municípios em grupos homogêneos, gerados a partir de uma análise de cluster utilizando as variáveis grau de urbanização, proporção de óbitos por causas externas e a população de cada município. Foram utilizados dados do Estado do Rio Grande do Norte, referentes a 2000. Para o total do Estado, estimou-se um sub-registro de 11% com o estimador BE e de 12,9% com o algoritmo EM. Outro resultado importante é a possibilidade de avaliar o grau de cobertura de óbitos por grupos etários em municípios e em qualquer nível de agregação a partir deste.

Level and standard of mortality are major demographic estimation problems in Brazil. Demographists dealing with mortality in Brazil still do not fell assured of the real behavior of this population dynamics component. On the other hand, there is a need for mortality indicators available for more disaggregated geographic levels, mostly municipalities. The difficulty is that the more disaggregated, the more complex is the task for estimating any social or demographic indicator. In this study, we aimed to estimate and to propose the correction of death underreporting at the municipal level, according to age, using two methods: the empiric Bayesian estimator (BE) and the EM (Expectation-Maximization) algorithm. For the two methods to be operational within comparable municipalities, two steps were performed: we grouped the municipalities according to a mesoregion; and we grouped them into two homogeneous groups, created from a cluster analysis using the variables level of urbanization, proportion of death from external causes and the population of each municipality. We used data collected in 2000 from the State of Rio Grande do Norte. For the entire State, we estimated underreporting to be 11% using the BE estimator, and 12.9 % using the EM algorithm. Another important finding was the capability to assess the level of death coverage by age groups in the municipalities and, at any level of aggregation.

Un gran problema, en lo que se refiere a estimativas demográficas en Brasil, está relacionado con el nivel y patrón de la mortalidad. Los demógrafos que trabajan con mortalidad en el país todavía no se sienten muy seguros sobre el comportamiento real de este componente de la dinámica poblacional. Por otro lado, es necesario que se disponga de indicadores de mortalidad para niveles geográficos más desagregados, sobre todo municipios. El problema es que cuanto más desagregado, más complejo se hace el trabajo de estimar cualquier indicador social o demográfico. Este trabajo tiene por objetivo estimar y proponer una corrección de subregistros de fallecimientos en el nivel municipal, según grupos de edad, por medio de dos métodos: estimador bayesiano empírico (BE) y algoritmo EM (Expectation-Maximization). Con el objeto de que los dos métodos fueran puestos en funcionamiento entre municipios semejantes, se realizaron dos ejercicios: se agruparon los municipios según la mesorregión; y se agruparon los municipios en grupos homogéneos, generados a partir de un análisis de cluster, utilizando las variables grado de urbanización, proporción de óbitos por causas externas y la población de cada municipio. Se utilizaron datos del Estado de Río Grande do Norte, referentes al año 2000. Para el total del Estado, se estimó un subregistro de un 11% con el estimador BE y de un 12,9% con el algoritmo EM. Otro resultado importante es la posibilidad de evaluar el grado de cobertura de óbitos por grupos de edad en municipios y en cualquier nivel de agregación a partir de este nivel.

Este trabalho visa ao desenvolvimento de um sistema para integrar os dados da produção mensal da assistência oncológica ambulatorial no Sistema Único de Saúde (SUS). O sistema foi modelado para recuperar a evolução do tratamento de cada caso de câncer e a produção dos serviços, tendo como vantagens: ser orientado ao caso de câncer, não requerer do usuário conhecimentos para a manipulação de bancos de dados e permitir a atualização da base à medida que novos dados vão surgindo. Os resultados das consultas ao sistema, quando comparados com os obtidos na inspeção direta da base original e com os obtidos com outra rotina de integração, foram idênticos. A utilização de uma ferramenta com essas características pelos gestores públicos pode contribuir para a melhoria da gestão da assistência oncológica ambulatorial prestada pelo SUS.

This study focuses on the development of a system to integrate monthly outpatient cancer care data in the Unified National Health System (SUS). The system was modeled to retrace the treatment evolution in each cancer case and services output, with the following advantage: the system focuses on the cancer case, does not require knowledge by the user in order to handle the database, and allows updating the base as new data emerge. The results of direct queries in the system were identical to those obtained from direct inspection of the original database and those from another integration approach. The use of a tool with these characteristics by public administrators can help improve the quality of outpatient cancer care provided by the National Health System.

Este trabalho visa ao desenvolvimento de um sistema para integrar os dados da produção mensal da assistência oncológica ambulatorial no Sistema Único de Saúde (SUS). O sistema foi modelado para recuperar a evolução do tratamento de cada caso de câncer e a produção dos serviços, tendo como vantagens: ser orientado ao caso de câncer, não requerer do usuário conhecimentos para a manipulação de bancos de dados e permitir a atualização da base à medida que novos dados vão surgindo. Os resultados das consultas ao sistema, quando comparados com os obtidos na inspeção direta da base original e com os obtidos com outra rotina de integração, foram idênticos. A utilização de uma ferramenta com essas características pelos gestores públicos pode contribuir para a melhoria da gestão da assistência oncológica ambulatorial prestada pelo SUS.

This study focuses on the development of a system to integrate monthly outpatient cancer care data in the Unified National Health System (SUS). The system was modeled to retrace the treatment evolution in each cancer case and services output, with the following advantage: the system focuses on the cancer case, does not require knowledge by the user in order to handle the database, and allows updating the base as new data emerge. The results of direct queries in the system were identical to those obtained from direct inspection of the original database and those from another integration approach. The use of a tool with these characteristics by public administrators can help improve the quality of outpatient cancer care provided by the National Health System.

OBJETIVO: Avaliar a relação do índice de resistência (IR) obtido pela ultra-sonografia Doppler transfontanela com o neurodesenvolvimento até um ano de idade, em recém-nascidos (RN) a termo com encefalopatia hipóxica-isquêmica (EHI) leve a moderada, secundária à asfixia intra-parto. MÉTODO: Estudo prospectivo em 20 RN com EHI leve a moderada, IR elevado no primeiro exame de Doppler, e sem doenças associadas ou anormalidades morfológicas cerebrais. Foram realizados exames seriados bimensais de Doppler transfontanela a partir do sétimo dia de vida, e avaliações clínicas mensais do neurodesenvolvimento no primeiro ano de vida. RESULTADOS: Houve normalização progressiva dos valores de IR até o último exame realizado. Cinco pacientes apresentaram normalização clínico-neurológica no período neonatal, após o primeiro exame de Doppler. Quinze lactentes apresentaram alterações neurológicas com resolução a partir do segundo trimestre de vida. CONCLUSÃO: Houve relação entre os períodos em que ocorreu a normalização dos valores de IR e a melhora clínica-neurológica.

OBJECTIVE: To evaluate the relation between the resistance index (RI) obtained by transfontanellar Doppler ultrasonography, and the neurodevelopment until one year of life, at term newborns with mild or moderate hypoxic-ischaemic encephalopathy due to intrapartum asphyxia. METHOD: 20 term newborns, with mild or moderate hypoxic-ischemic encephalopathy, high values of resistance index in the first exam, and without cerebral morfologic abnormalities or other diseases. They were submitted to serial bimonthly transfontanellar Doppler ultrasonography, from the seventh day of life on, and monthly clinical neurodevelopment assessment until one year of life. RESULTS: There was a progressive normalization of RI values until the last examination. In five cases there were clinical neurologic normalization in the neonatal period after the first Doppler exam. Fifteen infants presented neurologic abnormalities, with normalization after the second trimester of life. CONCLUSION: There was a relation between the normal RI values with the normalization of the clinical assessment.

A artrite reumatóide (AR) é uma doença auto-imune, crônica, caracterizada pelo comprometimento inflamatório das articulações sinoviais periféricas. A proteína amilóide A sérica (SAA) é uma das principais proteínas de fase aguda (PFA), porém seu uso na rotina do laboratório clínico ainda é pouco difundido. OBJETIVO: O objetivo deste trabalho foi analisar a utilidade da SAA na avaliação da atividade clínica da AR. MÉTODOS: Foram estudados 113 pacientes com AR, diagnosticados segundo os critérios do Colégio Americano de Reumatologia. Para a caracterização da atividade de doença, foi utilizado o Índice de Atividade de Doença (IAD), proposto pela Liga Européia Contra o Reumatismo. RESULTADOS: A SAA apresentou correlação positiva, estatisticamente significativa, com a proteína C-Reativa (PCR), tanto como a α-1-glicoproteína ácida (AGP), quanto com o IAD. Nossos resultados demonstraram que a SAA apresentou, particularmente, uma maior sensibilidade na determinação da atividade inflamatória da AR, em comparação às outras PFA. Apresentou, também, uma boa capacidade de discriminar os grupos de atividade moderada e alta do IAD. Como o IAD não mede unicamente o componente inflamatório da AR, a dosagem de uma PFA é de grande utilidade para a caracterização da atividade dessa enfermidade. CONCLUSÕES: Os resultados deste estudo sugerem que a SAA pode ser de grande valor na determinação da atividade inflamatória da AR.

Rheumatoid arthritis (RA) is a systemic autoimmune disease, with chronic inflammation of synovial peripheral joints as the most prominent feature. The serum amyloid A (SAA) is one of the major acute phase proteins (APP), however its use in the clinical laboratory routine is uncommon. OBJECTIVE: The aim of this work was to analyze the usefulness of SAA in the evaluation of RA clinical activity. METHODS: We studied 113 patients diagnosed with RA according to the criteria of the American College of Rheumatology. The disease activity was evaluated by the Disease Activity Score (DAS) according to the European League Against Rheumatism. RESULTS: SAA presented positive correlation, statistically significant, with C-reactive protein (CRP), as well as α-1-acid glycoprotein (AGP) and DAS. The results demonstrated that SAA presented a higher sensibility in relation to other APP in the determination of the inflammatory activity on RA patients. SAA also shows a good capability to discriminate the groups of moderate and high activity of DAS. As DAS doesn't measure only the inflammatory behavior of RA, the determination of APP is of great usefulness for the activity characterization of this illness. CONCLUSIONS: Our data suggest that SAA can be of great value in the determination of the RA inflammatory activity.

OBJECTIVE: To analyze the association of thiamin, selenium, and copper serum levels with cardiac function in patients with idiopathic dilated cardiomyopathy using diuretics, and also to compare them with levels in control patients with no evidence of disease. METHODS: The study comprised 30 patients with heart disease and 30 healthy control individuals. Thiamin was analyzed by measuring the activity of erythrocytic transketolase and the effect of thiamin pyrophosphate. Selenium and copper serum levels were measured by hydride generation and flame atomic absorption spectrophotometry, respectively. RESULTS: Thiamin deficiency was observed in 10% of the control individuals and in 33% of the patients with heart disease (p=0.02). The mean selenium and copper serum levels in control individuals and patients with heart disease were, respectively, 73.2±9.9 µg/L (56.5 to 94.5 µg/L) and 72.3±14.3 µg/L (35.5 to 94 µg/L) (p=0.77); 1.1±0.4mg/L (0.6 to 1.8mg/L) and 1.2± 0.4mg/L (0.6 to 2.2mg/L) (p=0.27). No association between the levels of these nutrients and cardiac function was observed. CONCLUSION: Thiamin deficiency was significantly more frequent in patients with heart disease. No significant difference was observed between the mean selenium and copper serum levels in control individuals and in patients with heart disease. The results suggest possible benefits with thiamin replacement in patients taking diuretics.