ABSTRACT Bovine leukemia virus (BLV) is a retroviral agent that primarily affects dairy cattle. Colostrum is the main source of immunoglobulins for calves; however, it is also a vehicle for the vertical transmission of BLV. The aim of this work was to determine the presence of BLV in colostrum and its potential to infect newborn calves. Seven mothers and their seven daughter calves were evaluated. Blood, colostrum, and milk samples were taken. An ELISA was performed to detect BLV in blood, colostrum and milk serums. Furthermore, a PCR test (env gene) was used for BLV detection in blood and colostrum. An identity analysis was used (phylogeny) to verify the origin of the sequences obtained from the DNA of mothers, calves, and colostrum. Six of the seven cows were positive for BLV by ELISA, while five of them were positive by PCR. None of the calves was positive by PCR at birth. However, the BLV provirus was found in two calves on day 15 and in one calf on day 30. The identity of the sequences was confirmed as BLV. Colostrum and milk are vehicles for the vertical transmission of BLV, which explains that three of the seven calves evaluated showed BLV infection during the early postpartum period.

RESUMEN El virus de la leucemia bovina (BLV) es un agente retroviral que afecta principalmente al ganado lechero. El calostro es la principal fuente de inmunoglobulinas para terneros. Sin embargo, también es un vehículo para la transmisión vertical del BLV. El objetivo de este trabajo fue determinar la presencia de BLV en muestras de calostro y su potencial para infectar terneros recién nacidos. Se evaluó un grupo de siete madres y sus siete terneras hijas. Se tomaron muestras de sangre, calostro y leche. Se realizó una prueba ELISA para determinar la presencia de anticuerpos anti-BLV en sueros de sangre, calostro y leche. Además, se realizó la técnica de PCR (gen env) en muestras de sangre de las madres y terneras, y en muestras de calostro. Se realizó un análisis de identidad (filogenia) para verificar el origen de las secuencias obtenidas del ADN de las madres, las terneras y el calostro. Seis de las siete vacas fueron positivas para BLV por ELISA, y cinco de ellas fueron positivas por PCR. Ninguno de los terneros fue positivo por PCR al nacer. Sin embargo, se encontró ADN proviral en dos terneras el día 15 y en otra ternera el día 30. Se confirmó que la identidad de todas las secuencias obtenidas era del BLV. El calostro y la leche son vehículos para la transmisión vertical de BLV, lo que explica que tres de las terneras evaluadas mostraron infección por BLV durante el período posparto temprano.

RESUMEN En las primeras semanas de lactancia, generalmente, el balance energético de la vaca lechera es negativo, determinando una descompensación en diferentes tejidos y sistemas, en especial, el inmunológico. Los niveles de energía en la dieta de vacas, en primer tercio de lactancia en lechería especializada, modularán la funcionalidad del sistema inmune en glándula mamaria. El objetivo del presente trabajo fue evaluar la calidad sanitaria de la leche, a través de la medición de células somáticas (SCS), las unidades formadoras de colonias (UFC) y las bacterias aisladas de vacas Holstein, con diferentes niveles de energía en la dieta. Se usaron 24 vacas Holstein en el primer tercio de gestación, posterior al pico de lactancia (entre 50 y 100 días de lactancia), dispuestas en 4 tratamientos, de acuerdo con el cubrimiento de los requerimientos energéticos del animal: isoenergético (ISO), hipoenergético (HIPO), hiperenergetico (HIPER) e isoenergético más suplementación con aceite de girasol (ACEITE). Se tomaron muestras de leche para el recuento de células somáticas (RCS) y UFC y se identificaron patógenos en leche, por cultivos microbiológicos. La dieta tuvo un efecto significativo sobre el SCS, con un valor p de 0.0331 y no sobre las UFC (p<0.5141). Se identificaron 11 patógenos y en 33,96% de las muestras no se aislaron microorganismos. La dieta isoenergética favorece la presencia de algunos microorganismos y el aumento del SCS.

ABSTRACT During the first weeks of lactation, the energy balance of dairy cows is generally negative, allowing for decompensation in a variety of tissues and systems, especially the immune system. The energy levels of a cow's diet during the first third of lactation, in specialized dairying, will modulate the immune system functionality of the mammary glands. The aim of this study was to assess the sanitary quality of milk through the somatic cell score (SCS), the colony-forming units (CFU), and the isolated bacteria of Holstein cows with different energy levels in the diet. Thus, 24 Holstein cows were studied during their first third of lactation, after the lactation peak (50 to 100 lactation days). They were assigned into 4 treatments, taking into account the energy requirements of each animal: Isoenergetic (ISO), Hypoenergetic (HYPO), Hyper energetic (HYPER), and Isoenergetic plus sunflower oil supplementation (OIL). Milk samples were taken for the somatic cell count (SCC) and CFUs, and isolated pathogens in milk were identified by microbiological culture. The diet had a significant effect on SCS with a value p of 0.0331, but not on the CFUs (p< 0.5141). 11 pathogens were identified and in 33.9% of samples, microorganisms were not isolated. The Isoenergetic diet favors the presence of some microorganisms and the increase of SCS.

Resumo Este estudo tem como objetivo analisar a influência do bloqueio direto e o 1x1 na efetividade dos arremessos nas quartas de final da Euroliga de basquete da temporada 2016-2017. Um total de 1.122 ações ofensivas foram analisadas usando um instrumento ad hoc chamado sistema de observação de conceitos-chave no basquetebol (SOCCB), onde são destacadas as seguintes conclusões: a) bloqueio direto é o conceito mais utilizado, seguido pelo exterior 1x1 e interior 1x1 ; b) o uso limitado do interior 1x1 e a especialização dos jogadores do interior em ações de bloqueio e finalização em vez de criação são confirmados; c) quase 60% dos procedimentos estudados terminam em passe, o que aumenta a importância de ser competente no passe e no jogo sem bola; e d) o bloqueio e o 1x1 interno foram ações que geraram vantagens e o 1x1 externo uma ação com maior tendência à conclusão.

Abstract The aim of this study is to analyze the influence of the ball screen and 1x1 situations on the shooting effectiveness in the Euroleague Final Four of the 2016-2017 season. A total of 1122 offensive actions were analyzed by means of an ad hoc instrument called SOCCB, where the following findings stand out: a) ball screen is the most used concept followed by one-on-one played outside the three-point line and finally, the one-on-one played close to the zone; b) the limited use of the one-on-one played close to the zone and specialization of the big men in screening and shooting actions rather than team behavior is confirmed; c) almost 60% of basketball procedures (ball screen and one-on-one) studied finish in a pass, which increases the importance of being competent in this aspect of the game and play without the ball; and d) ball screen and one-on-one played close to the zone were actions generating benefits and the one-on-one played outside the three-point line was an action with greater tendency towards shooting.

Resumo O presente estudo investigou o efeito da sobrecarga excêntrica em jogadores profissionais de basquetebol. Os participantes foram 8 jogadores de uma equipe da Leb Gold League entre 18 e 25 anos. Um ciclo de treinamento de 8 semanas foi realizado com 1 sessão semanal no exercício de meio agachamento. O grupo controle realizou o treinamento com metodologia tradicional, com pesos livres, e o grupo experimental, por meio de tecnologia inercial, com a máquina ProSquat, Proinertial®. O salto vertical e o sprint de 30 metros foram avaliados antes e após a intervenção. As seguintes conclusões foram obtidas: a) o treinamento de força com um componente no vetor vertical mostra melhorias no teste de 30 metros e no salto vertical; b) um programa que afeta a sobrecarga de movimento excêntrico apresenta resultados com melhores desempenhos do que o treinamento tradicional; c) o treinamento no vetor vertical também afeta uma expressão da força no vetor horizontal, mostrando melhorias no sprint de 30 metros.

Abstract The present study investigated the effect of eccentric overload on professional basketball players. Participants were 8 players aged 18-25 years who play in a Leb Oro League team. There was an 8 week training cycle with 1 weekly session of half squats. The control group performed training following a traditional methodology –using free weights– whereas the experimental group used inertial technology, that is, the ProSquat machine from Proinertial®. Both vertical jump and 30-meter sprint were assessed before and after intervention. The following conclusions were reached: a) strength training with vertical vector improves the 30-meter sprint test and also the vertical jump; b) training program that affects the eccentric overload of the movement results in more improvements than traditional training with the same duration; c) training in the vertical vector also has an impact on the way force is manifested in the horizontal vector, showing improvements in the 30-meter sprint.

RESUMO Este trabalho investigou a capacidade preditiva das características do jogo e dos protagonistas para predizer a intensidade das emoções, assim como a orientação motivacional (para o rendimento ou resultado final) dos participantes. Participaram 183 estudantes de ensino fundamental e ensino médio de quatro regiões espanholas (meninos = 43.7 % e meninas = 56.2%), faixa etária de 12 a 17 anos. Se realizaram 2 sessões de intervenção de 60 minutos (15-20’ por jogo), a intensidade emocional foi avaliada ao final da sessão mediante o questionário GES e os perfís motivacionais foram avaliados com o questionario BREQ3. Para a análise dos datos foi utilizada a técnica denominada árvores de clasificação CHAID. Entre os resultados destaca-se que: a) o resultado da competição e o tipo de jogo podem predizer a intensidade emocional dos participantes; b) o resultado durante o jogo e o gênero podem predizer os perfís motivacionais orientados ao rendimento; c) o gênero e o resultado, além do histórico esportivo ajudam a predizer os perfís motivacionais que não estão orientados ao rendimento.

ABSTRACT This research investigated the capacity that game characteristics and protagonists have to predict emotional intensity, as well as motivational orientation (towards performance or outcome). A total of 183 elementary and high school students from four Spanish regions joined the study (boys = 43.7% and girls = 56.2%), aged 12 to 17 years old. Two 60-minute intervention sessions were carried out (15-20’ per game); emotional intensity was assessed at the end of the session using the GES, whereas motivational profiles were assessed through the BREQ3. For data analysis, the decision tree technique known as CHAID was employed. The findings allow highlighting that: a) competition result and game type can predict the participants' emotional intensity; b) result during the match, along with gender, can predict performance-oriented motivational profiles; and c) gender and result, in addition to sports background, help predict motivational profiles not oriented to performance.

RESUMEN Objetivo. El objetivo de este estudio fue determinar la precisión y el sesgo de predicción de valores genómicos directos (VGD) usando genotipos imputados a densidad media, en características productivas y reproductivas en ganado Holstein de Antioquia, Colombia. Materiales y métodos. Fueron genotipificados 31 animales con el chip Illumina BovineLD, 64 con el chip Illumina BovineSNP50v2 y 48 con el chip Illumina BovineHD. La imputación se realizó usando dos paneles de SNPs (6K y 40K) a una densidad 44K, usando el programa FINDHAP.f90 v4. Los efectos de los SNPs fueron estimados mediante el método bayes C, usando genotipos de baja densidad (6K) y genotipos imputados a una densidad media (44_imputado). La precisión y el sesgo de los VGDs fueron determinados mediante validación cruzada. Las características evaluadas fueron: producción de leche (PL), porcentaje de proteína (PRO), porcentaje de grasa (GRA), puntaje de células somáticas (SCS), intervalo entre partos (IEP) y días abiertos (DA). Resultados. Las precisiones de VGD (rpVGD.EBV) en todas las características evaluadas oscilaron entre 0.19 y 0.24 y el sesgo (bVGD.EBV) entre 0.03 y 0.16 cuando se usó el panel 6K y usando el panel 44K_imputado las precisiones fueron mayores, oscilado entre 0.24 y 0.33 y sesgo entre 0.03 y 0.26. Conclusiones. La precisión de predicción de los VGDs fue mayor cuando se usaron genotipos imputados a densidad media, en comparación con la precisión de predicción obtenida empleando genotipos de baja densidad. Por lo cual, en este estudio se concluye que la imputación de genotipos es muy útil dado que aumenta la confiabilidad de la evaluación genómica.

ABSTRACT Objective. The goal of this study was to determine the accuracy and bias of direct genomic values (DGV) using imputed genotypes at medium density in yield- and reproduction-related traits for Holstein cattle from Antioquia, Colombia. Materials and Methods. A total of 31 animals were genotyped with the Illumina BovineLD chip, 64 with Illumina BovineSNP50v2 and 48 with Illumina BovineHD. Two SNP panels (6K and 40K) were imputed to a density of 44K using the FINDHAP.f90 v4 program. The effects of the SNPs were estimated using the Bayes C method, using low-density (6K) genotypes as well as medium-density imputed genotypes (44_imputed). The accuracy and bias of the DGVs were determined by cross-validation. The evaluated traits were: milk yield (MY), percentage of protein (PP), percentage of fat (PF), somatic cell score (SCS), calving interval (CI) and open days (OD). Results. When using the 6K panel, the accuracy values for DGV (rpDGV.EBV) in all the studied traits ranged from 0.19 to 0.24, and the bias (bDGV.EBV) from 0.03 to 0.16. In contrast, using the 44K_imputed panel generated higher accuracy values ranging from 0.24 to 0.33 and a bias ranging from 0.03 to 0.26. Conclusions. The accuracy of prediction the DGV was higher with genotypes imputed to medium densities when compared to the accuracy of prediction obtained using low-density genotypes. Therefore, in this study it is concluded that the imputation of genotypes is very useful, because it improves the reliability of the genomic evaluation.

Abstract: Of the many animal reproduction biotechnologies, in vitro embryo production has developed most over the past twenty years. Procedure success depends on many factors, including the presence of reactive oxygen species in adequate proportions. Both in vitro fertilization and gamete and embryo manipulation exposes cells to endogenous and/or exogenous factors that can affect antioxidant defense mechanisms and quality. This review discusses some sources of reactive oxygen species, the use of enzymatic, nonenzymati and polyphenolic antioxidants to reduce oxidative stress in in vitro embryo production processes, and their effects on oocyte and embryo quality, gene expression and embryo developmental competence.

Resumen: La producción de embriones in vitro es una de las biotecnologías de la reproducción animal que ha presentado mayor desarrollo en las últimas dos décadas; sin embargo, los resultados exitosos en estos procedimientos dependen de múltiples factores, entre ellos la presencia de especies reactivas de oxígeno, debido a que el proceso de fertilización in vitro y la manipulación de los gametos y embriones expone a las células a factores endógenos y exógenos que pueden afectar los mecanismos de defensa antioxidante y por consiguiente la calidad de los gametos y embriones. En esta revisión se discutirán algunas fuentes de especies reactivas de oxígeno, el uso de antioxidantes enzimáticos, no enzimáticos y polifenólicos para disminuir el estrés oxidativo en los procesos de producción in vitro de embriones, y su efecto sobre la calidad de los oocitos y embriones, la expresión génica y su competencia para el desarrollo embrionario.

RESUMEN El virus de la leucosis bovina (BLV) es un retrovirus inmuno-supresor que afecta, principalmente, al ganado lechero; sus células diana son los linfocitos B, en los cuales, integra su genoma, infectando al ganado de por vida. Es importante identificar la distribución del BLV en la región y reconstruir su historia evolutiva, a través de árboles filogenéticos; para el departamento de Antioquia, este es el primer reporte de los genotipos del BLV. El objetivo de este estudio fue identificar el genotipo de BLV que circula en ganado lechero de diferentes regiones del departamento de Antioquia, Colombia. Se extrajo ADN de 8 vacas Holstein. Se realizó una PCR anidada, para amplificar un fragmento del gen env de 444 pb. El gen env viral codifica la proteína de superficie gp51, altamente conservado y es usado en análisis filogenéticos. Los amplicones obtenidos se secuenciaron, se alinearon manualmente en el programa MEGA V7 y se compararon con 53 secuencias del gen env viral, registradas en GenBank. El análisis filogenético, se realizó por métodos de Máxima Verosimilitud y Bayesianos. Se encontraron dos genotipos circulantes: el genotipo más común fue 1, hallado en siete muestras, agrupadas con secuencias de EE. UU, Argentina y Japón; solo una muestra se clasificó como genotipo 3 y se agrupó con muestras de EE. UU y Japón. Al menos dos genotipos (1 y 3) de BLV están circulando en Antioquia; sin embargo, se deben evaluar más bovinos y hatos para elucidar la diversidad y la distribución de BLV en Colombia.

SUMMARY Bovine leukemia virus (BLV) is an immunosuppressant retrovirus that primarily affects dairy livestock, its target cells are B lymphocytes in which it integrates its genome infecting cattle for life. It is important to identify the distribution of the BLV in the region and to reconstruct its evolutionary history through phylogenetic trees, for the province of Antioquia this is the first report of the BLV genotypes. The aim of this study was to identify the genotype of BLV circulating in dairy cattle of different regions of the province of Antioquia, Colombia. DNA was extracted from 8 Holstein cows. Nested PCR was performed to amplify a fragment of 444 pb of the env gene. The env viral gene codes for surface protein gp51, gene is highly conserved and it is used for phylogenetic analysis. Obtained amplicons were sequenced, manually aligned in MEGA V7 program, and compared to 53 viral env gene sequences registered in GenBank. Phylogenetic analysis was performed by Maximum Likelihood and Bayesian methods. Two circulating genotypes were found: the most common genotype was 1, found in seven samples; they grouped with sequences from EE. UU, Argentina and Japan; only one sample was classified as genotype 3 and was grouped with samples from EE. UU and Japan. At least two genotypes (1 and 3) of BLV are circulating in Antioquia; however, more cattle and herds should be evaluated to elucidate the diversity and distribution of BLV in Colombia.

Abstract: Enzootic bovine leukemia (EBL) is a malignant, systemic disease, high morbidity (70 %) and low mortality, caused by infection with the bovine leukemia virus (BLV). EBL mainly affects dairy cattle; the milk production decreases of 2.5 to 5 % from the herd; also cause immunosuppression allowing other pathogens affecting the production and reproduction of animals. The aim was to determine the presence or absence of BLV through two diagnostic methodologies: a serological technique (ELISA) and a molecular technique (PCR). A total of 1,000 blood samples were taken from Holstein cows distributed in 10 municipalities in Antioquia Department. A PCR was performed to obtain a 444 bp PCR product corresponding to a highly conserved region of the viral env gene, this gene encodes the envelope protein gp51. An indirect ELISA was performed against the gp51 protein for these animals. The PCR detected fewer positive samples (474) that ELISA test (546). The sensitivity of PCR was 74.91 % and the specificity was 85.68 %, compared with the ELISA. The degree of agreement between tests was moderate (kappa=0.59). The municipality with the highest molecular prevalence was Rionegro (73.91 %), while the highest seroprevalence went to the municipality of El Retiro (85.19 %). The BLV has increased its presence in the dairy municipalities in the region; the detection of this pathogen will not only allow to determine the prevalence, it will also allow to use the data obtained in programs of prevention and control of the disease.

Resumen: La leucosis bovina enzoótica (LBE) es una enfermedad maligna, sistémica, de alta morbilidad (70 %) y baja mortalidad, ocasionada por la infección con el virus de la leucosis bovina (BLV). La LBE afecta principalmente los bovinos de leche, disminuyendo la producción de leche de 2.5 a 5 % respecto al hato; además, causa inmunosupresión, permitiendo que otros patógenos afecten la producción y reproducción de los animales. El objetivo fue determinar la presencia o ausencia del BLV a través de dos metodologías de diagnóstico: una técnica serológica (ELISA) y una técnica molecular (PCR). Se tomaron 1,000 muestras de sangre de vacas Holstein distribuidas en 10 municipios lecheros del Departamento de Antioquia. Se realizó una PCR para obtener un producto de PCR de 444 pb correspondiente a una región altamente conservada del gen env viral, que codifica para la proteína de envoltura gp51. Se realizó un ELISA indirecta contra la proteína gp51 para estos mismos animales. La PCR detectó un número menor de muestras positivas (474) que la prueba ELISA (546). La sensibilidad de la PCR fue de 74.91 % y su especificidad fue de 85.68 % respecto al ELISA. El grado de concordancia entre pruebas fue moderado (kappa=0.59). El municipio con la mayor prevalencia molecular fue Rionegro (73.91 %), mientras que la mayor seroprevalencia se registró en el municipio de El Retiro (85.19 %). El BLV ha aumentado su presencia en la región; la detección de este patógeno no solo permitirá determinar la prevalencia, sino también usar los datos obtenidos en programas de prevención y control de la enfermedad.

Resumen El objetivo del presente estudio fue determinar la frecuencia de aislamiento de microorganismos de tipo infeccioso y ambiental en leche de un grupo vacas clínicamente sanas en dos diferentes tipos de ordeño. Para ello se utilizaron muestras de leche de 289 vacas ubicadas en hatos de cuatro municipios del Norte del departamento de Antioquia en diferentes sistemas de ordeño (manual y mecánico), a cada muestra de leche se le hizo cultivo bacteriológico para determinar la presencia de microorganismos. De 289 muestras de leche evaluadas, 193 (66,78%) fueron positivas para aislamiento de cualquier tipo de patógeno (ocho diferentes patógenosaislados), de las cuales 81 (28,02%) muestras provenían de ordeño manual y 112 (38,75%) pertenecían a ordeño mecánico, encontrando un mayor porcentaje de aislamiento de patógenos bacterianos en muestras de leche provenientes de sistema de ordeño mecánico (p=0,0236). El patógeno de mayor aislamiento fue el Arcanobacterium haemolyticum (antes clasificado como Corinebacterium sp), microorganismo que hace parte de la flora saprófita del animal, con presencia de manera individual en el 20,14% de las muestras analizadas y en confección con otros patógenos en 0,7% de las muestras. El microorganismo que siempre se reporta como mayor productor de mastitis subclínica en bovinos es el Streptococcus agalactiae, un patógeno infeccioso, que en el presente estudio se aisló del 12,50% de las muestras de leche. Se determinó el Odds ratio (OR), entre aislamiento de Streptococcus agalactiae y Score de Células somáticas (SCS) que fue estadísticamente significativo, indicando que cuando está presente este patógeno el SCS aumenta y los animales son más susceptibles a padecer mastitis.

Abstract A microbiological analysis was performed to determine the frequency of isolation of microorganisms of infectious and environmental type in milk from a group of clinically healthy cows in two different types of milking (manual and mechanical). To each sample of milk was made bacteriological culture to determine the presence of microorganisms. Of 289 milk samples evaluated, 193 (66.78%) were positive for isolation of any type of pathogen, of which 81 (28.02%) samples came from manual milking and 112 (38.75%) belonged to mechanical milking, finding a higher percentage of isolation of bacterial pathogens in milks coming from mechanical milking system (p = 0.0236). The most isolated pathogen was the Arcanobacterium haemolyticum, A microorganism that forms part of the saprophytic flora of the animal, with an individual presence in 20.14% and in coinfection with other pathogens in 0.7% of the samples. The most common microorganism of subclinical mastitis in cattle is Streptococcus agalactiae, which in the present study was isolated from 12.50% of milk samples. The odds ratio (OR) between the isolation of Streptococcus agalactiae and the Somatic Cell Score (SCS) was determined, which was statistically significant, indicating that when this pathogen is present the SCS increases and the animals are more susceptible to mastitis.

Resumo O objetivo deste estudo foi determinar a frequência de isoLamento de microorganismos de tipo infecciosos e ambientaL no Leite de um grupo de vacas cLinicamente saudáveL em dois diferentes tipos de ordenha. Para este fim utiLizaram-se amostras do Leite de 289 vacas LocaLizadas em rebanhos de quatro municipaLidades do Norte de Antioquia com dois tipos diferentes de ordenha (manuaL e mecânica), a cada amostra do Leite foi feito um cuLtivo bacterioLógico para determinar a presença de microorganismos. De 289 amostras do Leite avaLiadas, 193 (66,78%) foram positivas para o isoLamento de quaLquer tipo de agente patogênico (oito diferentes agentes patogênicos isoLados), das quais 81 (28,02%) amostras eram de ordenha manuaL e 112 (38, 75%) foram de ordenha mecânica, encontrando uma maior percentagem de isoLamento dos agentes patogênicos bacterianos nos Leites provenientes do sistema de ordenha mecânica (p = 0,0236). O agente patogênico mais isoLado foi Arcanobacterium haemolyticum (Corinebacterium sp), microrganismo que faz parte da flora saprófita do animaL, presentes individuaLmente em 20,14% das amostras anaLisadas, e em reLação com outros agentes patogênicos o 0,7% das amostras. O microrganismo que sempre se reporta como o maior produtor de mastite subcLínica em gado é o Streptococcus agalactiae, um agente patogênico infeccioso, que neste estudo foi isoLado no 12,50% das amostras do Leite. Foi determinado o Odds ratio (OR) entre o isoLamento de Streptococcus agalactiae e Pontuação das céLuLas somáticas (SCS), e foi estatisticamente significativo, indicando que quando o agente patogênico está presente, o SCS aumenta e os animais são mais susceptíveis à mastite.

Resumen Antecedentes: El ganado Holstein ha sido sometido a procesos fuertes de selección en el mundo. Estas señales de selección pueden ser reconocidas y utilizadas para identificar regiones del genoma importantes para la producción de leche. Objetivo: Identificar señales de selección recientes en ganado Holstein de la Provincia de Antioquia (Colombia), mediante la metodología de puntaje haplotípico integrado (iHS). Métodos: A 150 animales se les extrajo DNA de sangre o semen mediante un kit comercial y posteriormente se genotiparon los animales con el chip BovineLD (6909 SNPs). Se realizó edición conservando los loci con frecuencia del alelo menor (MAF) superior a 0,05. Además, se descartaron los genotipos con errores mendelianos, usando el software R y PLINK v1.07. La determinación de la homocigosidad haplotípica extendida (EHH), iHS y el valor p se realizó utilizando el paquete “rehh” de R. Resultados: Las frecuencias del alelo menor mostraron una tendencia hacia alelos de frecuencias intermedias. En total, 144 marcadores focales fueron significativos (p<0,001) para las señales de selección. Algunos cromosomas presentaron mayor número de señales de selección que otros. Muchas de las variantes focales se encontraron al interior de genes, aunque comúnmente en regiones intrónicas. Algunas de las regiones importantes estuvieron asociadas con genes como TRAPPC12, PANK3, ZNF16, OPLA y DPYSL4 que en general se encuentran asociados con funciones relacionadas con el transporte, excreción o metabolismo celular. Conclusión: La identificación de señales de selección usando el método iHS permitió determinar algunas regiones importantes para la selección en ganado Holstein del trópico alto, algunas de las cuales han sido previamente reportadas por su asociación a loci de características cuantitativas (QTLs).

Abstract Background: Holstein cattle have undergone strong selection processes in the world. These selection signatures can be recognized and utilized to identify regions of the genome that are important for milk yield. Objective: To identify recent selection signatures in Holstein from the Province of Antioquia (Colombia), using the integrated haplotype score (iHS) methodology. Methods: Blood or semen was extracted from 150 animals with a commercial kit. The animals were genotyped with the BovineLD chip (6909 SNPs). The editing process was carried out while preserving the loci whose minor allele frequency (MAF) was greater than 0.05. In addition, genotypes with Mendelian errors were discarded using R and PLINK v1.07 software programs. Furthermore, the extended haplotype homozygosity (EHH), iHS and the p-value were determined with the “rehh” package of R language. Results: The minor allele frequencies showed a tendency toward intermediate frequency alleles. In total, 144 focal markers were significant (p<0.001) for selection signatures. Some chromosomes showed a greater number of signatures than others. Many of the variants were found inside genes, although they were in intronic regions. Some important regions were associated with genes TRAPPC12, PANK3, ZNF16, OPLA and DPYSL4, which are related with cellular transport, excretion or metabolism. Conclusion: Identifying signatures of selection using the iHS method made it possible to determine some important regions for selection in Holstein cattle in the high tropics, some of which had been previously reported to be associated with quantitative traits loci (QTLs).

Resumo Antecedentes: O gado holandês tem sido objeto de processos de seleção fortes no mundo. Estes sinais de seleção podem ser reconhecidos e utilizados para identificar regiões do genoma importantes para a produção de leite. Objetivo: Identificar sinais de seleção recente em gado Holandês de la Província de Antioquia (Colômbia), através da metodologia de pontuação haplotípica integrada (iHS). Métodos: Foram usados 150 animais para a extração de DNA a partir de sangre ou sêmen usando kit comercial, os animais foram posteriormente genotipados com o chip BovineLD (6909 SNPs). A edição foi feita mantendo os loci com frequência do alelo menor (MAF) de 0,05; além disso, genótipos com erros mendelianos foram descartados usando o programa R e PLINK v1.07. A determinação da homozigosidade haplotípica estendida (EHH), iHS e valor p foi realizada utilizando o pacote estatístico R “reeh”. Resultados: As frequências do alelo menor mostraram uma tendência inclinada a frequências intermédias. No total, 144 marcadores focais foram significativos (p<0,001) para os sinais de seleção. Alguns cromossomos apresentaram mais numero de sinais de seleção que outros. Muitas dos variantes focais foram encontradas dentro dos genes, embora comumente em regiões intrônicas. Algumas das regiões importantes foram associadas com genes como TRAPPC12, PANK3, ZNF16, OPLA e DPYSL4 que geralmente estão associadas a funções relacionadas com o transporte, a excreção ou metabolismo celular. Conclusão: A identificação de sinais de seleção usando o método iHS permitiu determinar algumas regiões importantes para a seleção no gado holandês do tropico alto, algumas destas regiões foram previamente relatados por sua associação com loci de características quantitativas (QTLs).

RESUMO. O Objetivo deste estudo foi determinar a associação genômica entre os marcadores do chip bovino LD (LD BeadChip) com características importantes na produção de leite. Foram utilizadas informações do programa de melhoramento genético da Universidade Nacional de Colômbia. BLUP-EBVs foram utilizados para a produção de leite (DY), porcentagem de gordura (FP), porcentagem de proteína (PP) e escore de células somáticas (SCS). 150 animais foram selecionados para extração de DNA do sangue ou sêmen e genotipados com o chip BovineLD (Illumina). A informação autossômica foi mantida e a edição da informação foi executada usando o programa Plink v1.07. Os efeitos dos SNPs foram determinados por Bayes C com o programa GS3. A frequência do alelo menor para a maioria dos marcadores no chip foi alta, o que aumenta a probabilidade de encontrar locos importantes segregando na população. As estimativas da fração de marcadores, com efeito, foram próximas de zero em quase todas as situações. Os marcadores mais importantes foram mapeados com ENSEMBL. Um total de 6510 SNPs autossômicos foram preservados, dos quais apenas uma proporção foi tomada com efeito a partir da função mista de Bayes C. Para cada característica foram encontrados genes importantes, como ANKS1B, CLCN1, NMBR e CTSD, para AL, FP, PP e SCS, respectivamente. Finalmente, a estimativa de Bayes-C permitiu a identificação de SNPs com possível associação com QTLs.

ABSTRACT. The objective of this study was to determine the genome association between markers of bovine LD BeadChip with dairy important traits. Information of breeding program of the Universidad Nacional de Colombia was used. BLUP-EBVs were used for dairy yield (DY), fat percentage (FP), protein percentage (PP) and somatic cell score (SCS). 150 animals were selected for blood or semen DNA extraction and genotyping with BovineLD BeadChip (Illumina). Autosomal information was retained and the editing information was performed using Plink v1.07 software. The effects of SNPs were determined by Bayes C with GS3 software. The minor allele frequency for most of the markers on the bead chip was high, which increases the probability of finding important loci segregating in the population. Estimations of fraction markers with an effect were close to zero in almost all cases. The most important markers were mapped by trait using ENSEMBL. A total of 6,510 autosomal SNPs were retained, out of which only a proportion with effect was taken from the mixed function of Bayes C. Important genes as ANKS1B, CLCN1, NMBR and CTSD, were found for each trait for AL, FP, PP and SCS respectively. Finally, Bayes C estimation allowed to identify specific SNPs possibly associated with QTLs.

Resumen Los genes CAPN1 y CAST codifican la (-calpaína y la calpastatina, las cuales participan en la degradación de las fibras musculares luego del rigor mortis, además, el gen LEP codifica a la leptina, una hormona que regula la deposición de grasa en el músculo. Éstos genes presentan SNPs relacionados con la terneza y la jugosidad de la carne y con características de la canal. Con el fin de conocer el potencial genético de la raza Brahman, se genotipificaron los SNPs CAPN316, CAPN4751, CAST282, CAST2959, E2FB y E2JW mediante PCR-HRM en 270 machos de ganaderías de cuatro regiones y se hizo un estudio de estructura y diferenciación poblacional. No hubo diferencia (p>0,05) en las frecuencias alélicas y genotípicas de los marcadores evaluados entre las subpoblaciones, las frecuencias genotípicas en la población general fueron: CAPN316 (CG = 0,078, GG = 0,922), CAPN4751 (CC = 0,289, CT = 0,104, TT = 0,606), CAST282 (CC = 0,285, CG = 0,448, GG = 0,267), CAST2959 (AA = 0,400, AG = 0,370, GG = 0,230), E2FB (CC = 0,633, CT = 0,356, TT = 0,011) y E2JW (AA = 0,985, AT = 0,010, TT = 0,004). Los marcadores CAPN316, CAST282 y E2JW se encontraron en HWE (p>0,05), mientras que CAPN4751 y CAST2959 presentaron Ho < He y en E2FB Ho > He. Los valores de los estadísticos F fueron: FIS = 0,153, FIT = 0,157 y FST= 0,005. De lo anterior se deduce que las ganaderías Brahman estudiadas presentan un leve grado de endogamia y constituyen una sola población, todos los marcadores evaluados son polimórficos, excepto E2JW, sin embargo existe la posibilidad de producir carne más tierna y jugosa debido a que aunque con frecuencias muy bajas, se pueden encontrar animales portadores de todos los alelos asociados.

Abstract The CAPN1 and CAST genes encodes μ-calpain and calpastatin, both genes participate on degradation of muscle fibers after rigor mortis; in addition the LEP gene codes for leptin, which regulates the fat deposition in muscle. These genes shows SNPs related to tenderness and juiciness of meat and productive characteristics of the carcass. In order to know the genetic potential of Brahman cattle the CAPN316, CAPN4751, CAST282, CAST2959, E2FB and E2JW SNPs were genotyped by PCR-HRM in 270 Brahman males from four different geographical areas, also the study of differentiation of population structure was made. There was no difference (p> 0.05) in genotype and allele frequencies of these markers between subpopulations, the genotypic frequencies in the general population were: CAPN316 (CG = 0.078, GG = 0.922), CAPN4751 (CC = 0.289, CT = 0.104, TT = 0.606), CAST282 (CC = 0.285, CG = 0.448, GG = 0.267), CAST2959 (AA = 0.400, AG = 0.370, GG = 0.230), E2FB (CC = 0.633, CT = 0.356, TT = 0.011) and E2JW (AA = 0.985, AT = 0.010, TT = 0.004). The CAPN316, CAST282 and E2JW markers were found in HWE (p> 0.05), while CAPN4751 and CAST2959 showed Ho < He and in E2FB Ho > He. The F statistics values were: FIS = 0.153, FIT = 0.157 and FST = 0.005. Was conclude that the Brahman herds studied present a slight degree of inbreeding and constitute a single population; all markers evaluated are polymorphic, except for E2JW, however the production of more tender and juicy meats could be possible, because the associated alleles with this characteristics were founds although in low frequencies.

Resumo Os genes CAPN1 e CAST codificam (-calpaína e calpastatina, que participam da degradação das fibras musculares após o rigor mortis, além disso, o gene LEP codifica a leptina, um hormônio que regula a deposição de gordura no músculo. Estes genes apresentam SNPs relacionados à ternura e suco de carne e com características do canal. Para conhecer o potencial genético da raça Brahman, os SNPs CAPN316, CAPN4751, CAST282, CAST2959, E2FB e E2JW foram genotipados por PCR-HRM em 270 homens de quatro regiões e um estudo sobre a estrutura e diferenciação da população. Não houve diferenças (p>0,05) nas freqüências alélicas e genotípicas dos marcadores avaliados entre as subpopulações, as freqüências genotípicas na população geral foram: CAPN316 (CG = 0,078, GG = 0,922), CAPN4751 (CC= 0,289, CT= 0,104, TT = 0,606), CAST282 (CC = 0,285, CG = 0,448, GG= 0,267), CAST2959 (AA = 0,400, AG= 0,370, GG = 0,230), E2FB (CC = 0,633, CT= 0,356, TT= 0,011) e E2JW (AA= 0,985, AT = 0,010, TT = 0,004). Os marcadores CAPN316, CAST282 e E2JW foram encontrados em HWE (p>0,05), enquanto CAPN4751 e CAST2959 mostraram Ho <He e em E2FB Ho> He. Os valores das estatísticas F foram: FIS = 0,153, FIT = 0,1557 e FST = 0,005. A partir do acima, deduz-se que os rebanhos de Brahman estudaram apresentar um ligeiro grau de endogamia e constituem uma população única, todos os marcadores avaliados são polimórficos, exceto E2JW, porém existe a possibilidade de produzir carne mais suave e suculenta porque, embora com freqüências muito baixo, podem ser encontrados animais que transportam todos os alelos associados.

El Virus de la Leucosis Bovina (BLV) es el agente etiológico de la Leucosis Bovina Enzoótica (LBE), esta enfermedad es infecciosa, crónica y específica del ganado bovino, presentando alta prevalencia, pero un bajo porcentaje de enfermos con manifestaciones clínicas. Entre 30-70% los animales infectados puede desarrollar Linfocitosis Persistente (LP) y entre el 0,1-10% de los bovinos con más de tres años de infección sufre algún tipo de Linfosarcoma (LS). El objetivo de este trabajo fue detectar serológicamente el BLV en muestras de leche de vacas Holstein en tres hatos lecheros del departamento de Antioquia. Se tomaron 133 muestras de leche de vacas Holstein de tres hatos lecheros ubicados en los municipios de Medellín y Belmira, se realizó una ELISA indirecta contra la proteína de envoltura gp51 viral. La prueba ELISA mostró una seroprevalencia del 79,69% (106/133) para el total de muestras evaluadas. El hato con la mayor seroprevalencia fue el hato 1 (82,86%), seguido por el hato 2 (80%) y por último el hato 3 (77,08%). La presencia del BLV ha aumentado en Antioquia durante los últimos años, el diagnóstico rápido y eficiente a través de metodologías confiables permitiría el control sobre la diseminación de la enfermedad en los hatos lecheros.

The Bovine Leukosis Virus (BLV) is the etiological agent of the Enzootic Bovine Leukemia (EBL), this disease is infectious, chronic and specifically cattle, presenting a low percentage of patients with clinical manifestations. Between 30-70% of infected animals can develop persistent lymphocytosis (LP) and between 0,1-10% of cattle over three years of infection suffers some form of lymphosarcoma (LS). The aim of this work was serologically detection of BLV in milk samples from Holstein cows in three dairy herds in the department of Antioquia. Were taken 133 milk samples from Holstein cows three dairy herds located in the municipality of Medellin and Belmira, was conducted an indirect ELISA against gp51 envelope protein of the virus. The ELISA test showed a seroprevalence of 79,69% (106/133) for all samples tested. The herd was the largest herd seroprevalence 1 (82,86%), followed by the herd 2 (80%) and finally the herd 3 (77,08%). The presence of the BLV has increased in recent years in Antioquia, so fast and efficient diagnosis through reliable methodologies allow control over the spread of the disease in dairy herds.

A leucose vírus (BLV) é o agente etiológico da Leucose Bovina Enzootica (EBL), esta doença é infecciosa, crônica, e, gado especifica, apresentando uma baixa percentagem de pacientes com manifestações clínicas. Entre 30-70% dos animais infectados podem desenvolver linfocitose persistente (LP) e entre 0,1-10% dos bovinos com mais de três anos de infecção sofre alguma forma de linfossarcoma (LS). LBE. O objetivo deste trabalho foi detecção sorologicamente o BLV em amostras de leite de vacas da raça Holstein em três rebanhos leiteiros no departamento de Antioquia. 133 amostras de leite de vacas da raça Holstein em três rebanhos leiteiros localizados no município de Medellín e Belmira tomaram um ELISA indireto contra a proteína do envelope gp51 do vírus foi realizado. O teste de ELISA mostrou uma soroprevalência de 79,69% (106/133) para todas as amostras testadas. a maior seroprevalência era evidente no rebanho (82,86%), seguido do rebanho 2 (80%) e, finalmente, o rebanho 3 (77,08%). A presença do BLV tem aumentado Antioquia nos últimos anos, o diagnóstico rápido e eficiente através de metodologias fiáveis permitem o controle sobre a propagação da doença em rebanhos leiteiros.

Resumen El pasto kikuyo (Cenchrus clandestinus) representa cerca del 80% de la base de toda la alimentación forrajera de la lechería especializada del país. El objetivo de este trabajo fue evaluar y comparar algunos caracteres morfológicos en poblaciones del pasto kikuyo ubicadas en el trópico alto Antioqueño. Se recolectaron 384 muestras de material vegetativo en tres zonas del departamento de Antioquia. Para cada muestra se estableció ancho y largo de la lámina, longitud de entrenudos, diámetro de entrenudos, ancho de los nudos, y ancho y largo de la vaina. Con el fin de representar en un espacio geométrico bidimensional las proximidades existentes entre las unidades experimentales colectadas en los diferentes municipios, se realizó un análisis de escalamiento multidimensional (MDS). Adicionalmente los resultados se analizaron mediante modelos lineales generalizados (GLM) usando cada medida como variable dependiente. El municipio tuvo un efecto altamente significativo (p<0.01) sobre todos los caracteres morfológicos medidos. Para la característica diámetro entrenudos, ancho entrenudos, lamina y vaina; los días del descanso y la altitud, tuvieron un efecto altamente significativo (p<0.01). Aunque no se encontró un patrón de similitudes entre las características morfológicas, los efectos incluidos en los modelos fueron todos estadísticamente significativos para cada uno de estos caracteres Para establecer mejores resultados que puedan ser potenciales para futuros programas de mejoramiento genético se recomienda asociar dicha información con estudios de diversidad y variación genética.

Abstract The kikuyu grass (Cenchrus clandestinus) represents about 80% of the base of all the forage supply of specialized dairy country. The aim of this study was to evaluate and compare some morphological characters in kikuyu grass populations located in the high tropics Antioqueño. 384 samples of plant material were collected in three areas of the department of Antioquia. For each sample width and length of the lamina, internode length, diameter internode, width node, width and length of the sheath it was established. In order to represent a two-dimensional geometric space in existing proximity between experimental units collected in different municipalities, an analysis of multidimensional scaling (MDS) it was performed. In addition the results were analyzed using generalized linear models (GLM) using each measure as dependiente variable. The municipality had a highly significant (p <0.01) on all measured morphological characters. For the characteristic diameter internodes, wide internodes, lamina and sheath; the days of rest and altitude, had a highly significant effect (p <0.01). Although a pattern of similarities between morphological characteristics were found, the effects included in the models were all statistically significant for each of these characters To establish better results that may be potential for future breeding programs is recommended to associate this information with studies diversity and genetic variation.

Resumo A grama kikuyu (Cenchrus clandestinus) representa cerca de 80% da base de toda a oferta de forragem país leiteiro especializado. O objetivo deste estudo foi avaliar e comparar alguns caracteres morfológicos em populações pennisetums Antioqueño localizadas nas altas trópicos. 384 amostras de material vegetal foram coletadas em três áreas do departamento de Antioquia. Para cada largura da amostra e comprimento da lâmina, comprimento dos entrenós, entrenudos diâmetro, nós largura, largura e comprimento da bainha foi estabelecido. A fim de representar um espaço geométrico bidimensional na proximidade existente entre as unidades experimentais coletados em diferentes municípios, uma análise de escalonamento multidimensional (MDS) foi realizada. Além disso, os resultados foram analisados usando modelos lineares generalizados (GLM), utilizando cada medida como variável dependiente. O município tinha uma correlação altamente significativa (p <0,01) em todos os caracteres morfológicas medidos. Para a função de diâmetro entrenudos, entrenós de largura, lâmina e bainha; os dias de descanso e a altitude, teve um efeito altamente significativo (p <0,01). Embora um padrão de semelhanças entre as características morfológicas não foi foram encontrados, os efeitos incluídas nos modelos foram todas estatisticamente significativas para cada um desses personagens Para estabelecer melhores resultados que podem ser potencial para futuros programas de melhoramento é recomendado para associar esta informação com estudos diversidade e variação genética.