Abstract The decision-making process in plant breeding is driven by data. The machine learning framework has powerful tools that can extract useful information from data. However, there is still a lack of understanding about the underlying algorithms of these methods, their strengths, and pitfalls. Machine learning has two main branches: supervised and unsupervised learning. In plant breeding, supervised learning is used for genomic prediction, where phenotypic traits are modeled as a function of molecular markers. The key supervised learning algorithms for genomic prediction are linear methods, kernel methods, neural networks, and tree ensembles. This manuscript provides an insight into the implementation of these algorithms and how cross-validations can be used to compare methods. Examples for genomic prediction come from plant breeding.

A conversão de área natural para área de uso agrícola pode degradar a estrutura do solo, favorecendo a ocorrência de compactação. Este trabalho teve por objetivo avaliar as alterações nas propriedades físico-hídricas e mecânicas de um Gleissolo Háplico provocadas pela conversão de um campo natural antropizado para área de cultivo de arroz irrigado. Propriedades físico-hídricas (densidade, porosidade total, macro e microporosidade, índice de vazios e retenção de água) e mecânicas (pressão de preconsolidação, índice de compressão, coeficiente de descompressão e índice de recuperação) foram avaliadas nos horizontes A1 (0,0-0,25 m), A2 (0,25-0,51 m), Cg1 (0,51-0,92 m) e Cg2 (0,92-1,20+ m) em solo sob campo antropizado sem uso agrícola e nos horizontes Ap (0,0-0,17 m), A (0,17-0,40 m), Cg1 (0,40-0,70 m) e Cg2 (0,70-1,00+ m), em solo cultivado com arroz irrigado. Oito anos de cultivo de arroz sob preparo convencional e irrigação por inundação não alteraram significativamente as propriedades físico-hídricas e mecânicas, de acordo com a análise de agrupamentos. Porém, o cultivo de arroz aumentou a densidade do solo e reduziu o índice de vazios, a porosidade total e a macroporosidade. A relação da elasticidade com a densidade do solo, a porosidade total e o índice de vazios foi influenciada pelo tipo de estrutura, pois maiores compressões e descompressões ocorreram nos horizontes de estrutura prismática, em comparação aos horizontes de estrutura maciça.

The conversion of natural areas for agricultural use can degrade the soil structure and increase the occurrence of compression. This study aimed to evaluate changes in the physico-mechanical and hydro-physical properties of an Endoaqualf, caused by the conversion of a natural area into a rice field. Hydro-physical (density, porosity, macroporosity, microporosity, void ratio, and water retention) and mechanical properties (preconsolidation pressure, compression index, coefficient of decompression, and recovery rate) were evaluated in the horizons A1 (0.0-0.25 m), A2 (0.25-0.51 m), Cg1 (0.51-0.92 m) and Cg2 (0.92-1.20+ m) in soil of a natural area and in Ap (0.0-0.17 m), A (0.17-0.40 m), Cg1 (0.40-0.70 m) and Cg2 (0.70-1.00+ m) of soil under rice. Cluster analysis showed that eight years of conventionally tilled rice under flood irrigation did not significantly alter the physico-mechanical and hydro-physical properties. However, rice cultivation increased bulk density and reduced the void ratio, total porosity and macroporosity. The ratio of elasticity with bulk density, porosity and void ratio was affected by the type of soil structure, since compression and decompression were higher in horizons with prismatic than with massive structure.

Louro-pardo (Cordia trichotoma (Vell.) Arrab. ex Steudel) é espécie arbórea que possui raízes gemíferas, nas quais, após a ocorrência de distúrbios de origem natural ou antrópica, ocorre a formação de brotos. Nessa espécie, ao considerar a habilidade natural de regeneração pelo sistema radicular, presume-se que esses propágulos constituem material com elevado potencial morfogenético. O objetivo deste trabalho foi avaliar a propagação vegetativa de louro-pardo por estaquia radicular. No primeiro experimento, raízes de mudas de louro-pardo foram seccionadas em estacas com 5,0 cm de comprimento, classificadas quanto ao diâmetro em grossas (1,6 - 2,5 cm) e finas (1,0 - 1,5 cm) e tratadas em solução de 0, 10, 20 e 30 mM de AIB, por 10 seg. No segundo experimento, os propágulos foram classificados quanto à posição de coleta na raiz das mudas em basais, medianas e apicais, seccionadas em estacas de 1,0; 3,0 e 5,0 cm de comprimento e tratadas em solução de 30 mM de AIB. O uso de AIB favoreceu o enraizamento das estacas radiculares, com maiores respostas nos tratamentos com a dose de 30 mM. Estacas radiculares com maior diâmetro mostraram-se mais aptas à brotação quando comparadas com as estacas radiculares menos espessas. As melhores respostas de brotação e enraizamento ocorreram em estacas radiculares basais e medianas com 3,0 e 5,0 cm de comprimento. Portanto, é possível realizar a propagação vegetativa de louro-pardo pela técnica de estaquia radicular.

Cordia trichotoma (Vell.) Arrab. ex Steudel is a tree species that has roots with buds and, after the occurrence of natural or anthropic disturbances, sprouts develop from these buds. Considering the natural ability of regeneration by root system, it is assumed that these propagules contain tissues with high morphogenetic potential. The objective of this study was to evaluate the vegetative propagation of C. trichotoma root cuttings. In the first experiment, seedling roots were sectioned into 5.0 cm-long cuttings, classified into thick (1.6-2.5 cm) and thin (1.0-1.5 cm) according to its diameter. The root cuttings were treated in a solution of 0, 10, 20 or 30 mM IBA for 10 seconds. In the second experiment, roots were classified into basal, median and apical according to the position of collection and cut in cuttings with 1.0, 3.0 and 5.0 cm of length. The root cuttings were treated in a solution of 30 mM IBA. The use of IBA favored rooting of root cuttings, with the highest responses in treatments with a dose of 30 mM. Thick root cuttings had a greatest potential for sprouting when compared to thin root cuttings. The highest responses of sprouting and rooting occurred in basal and median root cuttings with 3.0 and 5.0 cm length. In conclusion, it is possible to perform the vegetative propagation of C. trichotoma by the technique of root cuttings.