Resumo Os mamíferos são organismos carismáticos que desempenham um papel fundamental na função ecológica e nos serviços ecossistêmicos, como polinização, dispersão de sementes, ciclagem de nutrientes e controle de pragas. O Estado de São Paulo representa apenas 3% do território brasileiro, mas detém 33% da diversidade de mamíferos. A maior parte de seu território é dominado pela agricultura, pastagens e áreas urbanas que afetam diretamente a diversidade e a persistência dos mamíferos na paisagem. Além disso, São Paulo possui o maior porto da América Latina e o maior reservatório de petróleo costeiro do Brasil, com 600 km de extensão de litoral com diversas espécies de mamíferos marinhos. Essas infraestruturas afetam a diversidade, distribuição, ecologia e o futuro dos mamíferos no estado. Aqui, respondemos cinco perguntas principais: 1) Qual é a diversidade de mamíferos silvestres no Estado de São Paulo? 2) Onde eles ocorrem? 3) Qual é o seu impacto positivo e negativo no bem-estar humano? 4) Como os mamíferos persistem em paisagens modificadas pelo homem? 5) Qual é o futuro dos mamíferos no estado? O estado de São Paulo possui 255 espécies de mamíferos nativos, com quatro espécies endêmicas, duas delas globalmente ameaçadas de extinção. Pelo menos seis espécies (dois marsupiais, ariranha, veado-campeiro, veado-cambuta e tatu-canastra) foram extirpadas do estado devido à caça e perda de habitat. O intenso uso humano da terra no estado forçou muitas espécies de mamíferos a mudar sua dieta para lidar com a intensa fragmentação e agricultura. A monocultura em larga escala facilitou a invasão de espécies exóticas, como porcos selvagens (javaporco) e a lebre europeia. Várias espécies de áreas abertas estão expandindo suas áreas de distribuição (lobo-guará, veado-catingueiro) sobre áreas desmatadas e provavelmente refletem mudanças em direção a um clima mais seco. Como o estado possui o maior sistema rodoviário do Brasil, cerca de 40 mil mamíferos de 33 espécies são mortos por ano em colisões, causando um prejuízo econômico de 12 milhões de dólares/ano. A diversidade de mamíferos está concentrada nos maiores remanescentes florestais da Serra do Mar e no interior do Estado, principalmente nas regiões de Ribeirão Preto e Jundiaí. As lacunas amostrais estão concentradas em todo o interior do estado, principalmente na região noroeste. Os mamíferos silvestres desempenham um papel fundamental em muitos serviços ecossistêmicos, mas também podem ser uma preocupação em trazer novas doenças emergentes para as populações humanas. Embora a taxonomia de mamíferos pareça ser bem conhecida, mostramos que novas espécies estão sendo continuamente descobertas no estado. Portanto, pesquisas usando tecnologias tradicionais e novas (eDNA, iDNA, drones), monitoramento populacional de longo prazo, a investigação da interface do conflito homem-vida selvagem e a compreensão do papel único no ecossistema desempenhado pelos mamíferos são um caminho futuro para promover uma paisagem verde sustentável aliada ao bem-estar humano no estado. O plantio de corredores florestais ou de cerrado, principalmente junto aos principais sistemas fluviais, no planalto, o controle da caça ilegal nas áreas costeiras, o manejo dos regimes de fogo no Cerrado e a mitigação dos atropelamentos devem ser uma prioridade para proteger essa notável diversidade de mamíferos.

Abstract Mammals are charismatic organisms that play a fundamental role in ecological functions and ecosystem services, such as pollination, seed dispersal, nutrient cycling, and pest control. The state of São Paulo represents only 3% of the Brazilian territory but holds 33% of its mammalian diversity. Most of its territory is dominated by agriculture, pastures, and urban areas which directly affect the diversity and persistence of mammals in the landscape. In addition, São Paulo has the largest port in Latin America and the largest offshore oil reservoir in Brazil, with a 600 km stretch of coastline with several marine mammal species. These human-made infrastructures affect the diversity, distribution, ecology, and the future of mammals in the state. Here, we answer five main questions: 1) What is the diversity of wild mammals in São Paulo state? 2) Where are they? 3) What is their positive and negative impact on human well-being? 4) How do mammals thrive in human-modified landscapes? 5) What is the future of mammals in the state? The state of São Paulo holds 255 species of native mammals, with four endemic species, two of them globally endangered. At least six species (two marsupials, Giant otter, Pampas deer, Brazilian dwarf brocket deer, and Giant armadillo) were extirpated from the state due to hunting and habitat loss. The intense human land use in the state forced many mammalian species to change their diet to cope with the intense fragmentation and agriculture. Large-scale monoculture has facilitated the invasion of exotic species such as wild boars (javali) and the European hare. Several “savanna-dwelling” species are expanding their ranges (Maned wolf, Brocket deer) over deforested areas and probably reflect changes towards a drier climate. Because the state has the largest road system, about 40,000 mammals from 33 species are killed per year in collisions causing an economic loss of 12 million dollars/year. The diversity of mammals is concentrated in the largest forest remnants of Serra do Mar and in the interior of the State, mainly in the regions of Ribeirão Preto and Jundiaí. Sampling gaps are concentrated throughout the interior of the state, particularly in the northwest region. Wild mammals play a fundamental role in many ecosystem services, but they can also be a concern in bringing new emergent diseases to humans. Although the taxonomy of mammals seems to be well known, we show that new species are continuously being discovered in the state. Therefore, continuous surveys using traditional and new technologies (eDNA, iDNA, drones), long-term population monitoring, investigation of the interface of human-wildlife conflict, and understanding of the unique ecosystem role played by mammals are future avenues for promoting sustainable green landscapes allied to human well-being in the state. The planting of forest or savanna corridors, particularly along with major river systems, in the plateau, controlling illegal hunting in the coastal areas, managing fire regimes in the Cerrado, and mitigating roadkill must be prioritized to protect this outstanding mammal diversity.

Resumo Objetivo Neste estudo buscamos compreender como os fatores ambientais extrínsecos medidos no curso d’água e a paisagem circundante influenciam a ictiofauna em rios de primeira ordem. Métodos Os dados foram coletados na Bacia do Rio Corumbataí, São Paulo, região sudeste do Brasil, durante a estação seca de 2012. A ictiofauna foi amostrada em 13 trechos de riachos distribuídos em quatro sub-bacias. Os trechos diferiam em relação à presença/ausência de mata ciliar, tipo predominante de matriz e porcentagem de cobertura vegetal. A riqueza de espécies e a ocorrência dos grupos funcionais foram as variáveis resposta, enquanto as variáveis explanatórias incluíram tanto estruturas locais como da paisagem do entorno. As variáveis locais foram compostas por pH, temperatura, condutividade, turbidez, vazão, profundidade, largura, tipo de substrato. As variáveis da paisagem incluíram presença/ausência de vegetação ripária, tipo de vegetação, tipo de matriz e cobertura de dossel. Resultados Coletamos 268 indivíduos distribuídos em 12 espécies. A estrutura da paisagem influenciou a ocorrência da ictiofauna em rios de primeira ordem, em especial das espécies de alimentação alóctone, nectônicas e intolerantes a hipóxia. A presença de mata ciliar foi o preditor mais importante. A riqueza de espécies foi negativamente relacionada à presença de vegetação ripária, corroborando a hipótese de que paisagens mais degradadas levam a uma redução na diversidade. Conclusão A preservação da vegetação ripária é fundamental para a manutenção da diversidade da ictiofauna. A presença ou ausência da vegetação ripária pode afetar diferentemente a ocorrência de diferentes espécies, dependendo de suas características funcionais, sobretudo relacionadas à tolerância à hipóxia, entrada de alimento no riacho ou posição na coluna d’água.

Abstract Objective In this study we aimed to understand how extrinsic environmental factors measured in the watercourses and the surrounding landscape influence the ichthyofauna of first-order streams. Methods Data were collected within the Corumbataí River Basin, São Paulo, southeastern Brazil, during the dry season of 2012. We sampled the ichthyofauna in 13 stretches of streams distributed across four river sub-basins. The stretches differed in relation to the presence/absence of riparian forest, the predominant type of matrix and the percentage of forest. Response variables were species richness and the occurrence of functional groups and explanatory variables include both local and landscape structures from the surrounding environment. Local variables comprised the following water quality and structural attributes: pH, temperature, conductivity, turbidity, flow rate, depth, width, type of substrate. Landscape variables included presence/absence of riparian vegetation, type of vegetation, type of matrix, percentage of forest and canopy cover. Results A total of 268 individuals were recorded, which were distributed among 12 species. The landscape structure influenced the occurrence of functional groups in first-order streams, especially allochthonous-feeders, nektonic and hypoxia-intolerant species. The presence of riparian forest was the most important predictor. Species richness was negatively related to the presence of riparian vegetation, supporting the hypothesis that degraded landscapes lead to a reduction in diversity. Conclusion The protection of riparian vegetation is critical to the maintenance of ichthyofauna diversity in first-order streams. The presence or absence of riparian vegetation differently affected the occurrence of species depending on their functional characteristics, particularly those related to the tolerance to hypoxia, source of alimentary items and the position in the water column.

Fueron mapeados los árboles con diámetro a la altura del pecho ≥ 10,0 cm en un bosque tropical lluvioso "terra firme" de la amazonia brasileña, en el Sitio Experimental de EMBRAPA, Manaus, Brasil. Las relaciones de 68 especies arbóreas con las propiedades del suelo fueron determinadas mediante análisis de correspondencia canónica sobre la base de nueve variables del suelo. En este análisis, las especies fueron agrupadas en dos grupos: uno, donde estas crecen principalmente en arena, con suelos de bajo contenido de materia orgánica, y otro, con especies que se desarrollan principalmente en suelos secos y arcillosos. La función K de Ripley fue utilizada para analizar la distribución de las especies en 32 parcelas de 2.500 hasta 20.000 m², con el fin de determinar si cada grupo presenta cierto grado de agregación espacial como resultado de variaciones del suelo. Una agregación espacial significativa para los dos grupos solo se encontró en unidades de muestreo > 10.000 m², en particular, para especies en suelos arcillosos y ambientes más secos, en los que las unidades de muestreo parecían cumplir con los requisitos de las especies. Variables del suelo, mediadas por la posición topográfica, influyeron la agregación espacial de especies, principalmente en la gama de distancias intermedia a grande (≥ 20 m). Según los resultados, se concluye que la heterogeneidad ambiental y tamaños de unidades de muestreo de por lo menos 10.000 m² se deben considerar en los estudios de dinámica de bosques con el fin de entender los procesos espaciales que estructuran la selva tropical "terra firme" en la amazonia brasileña.

All trees with diameter at breast height dbh ≥ 10.0 cm were stem-mapped in a "terra firme" tropical rainforest in the Brazilian Amazon, at the EMBRAPA Experimental Site, Manaus, Brazil. Specifically, the relationships of tree species with soil properties were determined by using canonical correspondence analyses based on nine soil variables and 68 tree species. From the canonical correspondence analyses, the species were grouped into two groups: one where species occur mainly in sandy sites, presenting low organic matter content; and another one where species occur mainly in dry and clayey sites. Hence, we used Ripley's K function to analyze the distribution of species in 32 plots ranging from 2,500 m² to 20,000 m² to determine whether each group presents some spatial aggregation as a soil variations result. Significant spatial aggregation for the two groups was found only at over 10,000 m² sampling units, particularly for those species found in clayey soils and drier environments, where the sampling units investigated seemed to meet the species requirements. Soil variables, mediated by topographic positions had influenced species spatial aggregation, mainly in an intermediate to large distances varied range (≥ 20 m). Based on our findings, we conclude that environmental heterogeneity and 10,000 m² minimum sample unit sizes should be considered in forest dynamic studies in order to understand the spatial processes structuring the "terra firme" tropical rainforest in Brazilian Amazon.

Mosquitos são vetores de arbovírus que podem causar encefalites e febres hemorrágicas em humanos. Aedes serratus (Theobald), Aedes scapularis (Rondani), e Psorophora ferox (Von Humboldt) são vetores potenciais de arbovírus e são abundantes no Vale do Ribeira, Mata Atlântica, sudeste do Estado de São Paulo, Brasil. O objetivo desse estudo foi inferir a distribuição espacial desses mosquitos e estimar o risco da exposição humana às picadas de mosquitos. Os resultados das análises indicaram que os humanos estão altamente expostos às picadas nos municípios de Cananéia, Iguape e Ilha Comprida. Nessas localidades a incidência de encefalite Rocio foi 2% na década de 1970. Adicionalmente, Ae. serratus, que foi recentemente implicado vetor do vírus da febre amarela no estado do Rio Grande do Sul, deveria ser alvo da vigilância entomológica no sudeste da Mata Atlântica. Considerando a extensão territorial do Brasil e as inerentes dificuldades em amostrar esse vasto território, a modelagem de habitat empregada nesse trabalho poderia ser utilizada para a vigilância de vetores de patógenos.

Mosquitoes are vectors of arboviruses that can cause encephalitis and hemorrhagic fevers in humans. Aedes serratus (Theobald), Aedes scapularis (Rondani) and Psorophora ferox (Von Humboldt) are potential vectors of arboviruses and are abundant in Vale do Ribeira, located in the Atlantic Forest in the southeast of the State of São Paulo, Brazil. The objective of this study was to predict the spatial distribution of these mosquitoes and estimate the risk of human exposure to mosquito bites. Results of the analyses show that humans are highly exposed to bites in the municipalities of Cananéia, Iguape and Ilha Comprida. In these localities the incidence of Rocio encephalitis was 2% in the 1970s. Furthermore, Ae. serratus, a recently implicated vector of yellow fever virus in the State of Rio Grande do Sul, should be a target for the entomological surveillance in the southeastern Atlantic Forest. Considering the continental dimensions of Brazil and the inherent difficulties in sampling its vast area, the habitat suitability method used in the study can be an important tool for predicting the distribution of vectors of pathogens.

Mosquitos são vetores de arbovírus que podem causar encefalites e febres hemorrágicas em humanos. Aedes serratus (Theobald), Aedes scapularis (Rondani), e Psorophora ferox (Von Humboldt) são vetores potenciais de arbovírus e são abundantes no Vale do Ribeira, Mata Atlântica, sudeste do Estado de São Paulo, Brasil. O objetivo desse estudo foi inferir a distribuição espacial desses mosquitos e estimar o risco da exposição humana às picadas de mosquitos. Os resultados das análises indicaram que os humanos estão altamente expostos às picadas nos municípios de Cananéia, Iguape e Ilha Comprida. Nessas localidades a incidência de encefalite Rocio foi 2% na década de 1970. Adicionalmente, Ae. serratus, que foi recentemente implicado vetor do vírus da febre amarela no estado do Rio Grande do Sul, deveria ser alvo da vigilância entomológica no sudeste da Mata Atlântica. Considerando a extensão territorial do Brasil e as inerentes dificuldades em amostrar esse vasto território, a modelagem de habitat empregada nesse trabalho poderia ser utilizada para a vigilância de vetores de patógenos.

Mosquitoes are vectors of arboviruses that can cause encephalitis and hemorrhagic fevers in humans. Aedes serratus (Theobald), Aedes scapularis (Rondani) and Psorophora ferox (Von Humboldt) are potential vectors of arboviruses and are abundant in Vale do Ribeira, located in the Atlantic Forest in the southeast of the State of São Paulo, Brazil. The objective of this study was to predict the spatial distribution of these mosquitoes and estimate the risk of human exposure to mosquito bites. Results of the analyses show that humans are highly exposed to bites in the municipalities of Cananéia, Iguape and Ilha Comprida. In these localities the incidence of Rocio encephalitis was 2% in the 1970s. Furthermore, Ae. serratus, a recently implicated vector of yellow fever virus in the State of Rio Grande do Sul, should be a target for the entomological surveillance in the southeastern Atlantic Forest. Considering the continental dimensions of Brazil and the inherent difficulties in sampling its vast area, the habitat suitability method used in the study can be an important tool for predicting the distribution of vectors of pathogens.

Every year, autochthonous cases of Plasmodium vivax malaria occur in low-endemicity areas of Vale do Ribeira in the south-eastern part of the Atlantic Forest, state of São Paulo, where Anopheles cruzii and Anopheles bellator are considered the primary vectors. However, other species in the subgenus Nyssorhynchus of Anopheles (e.g., Anopheles marajoara) are abundant and may participate in the dynamics of malarial transmission in that region. The objectives of the present study were to assess the spatial distribution of An. cruzii, An. bellator and An. marajoara and to associate the presence of these species with malaria cases in the municipalities of the Vale do Ribeira. Potential habitat suitability modelling was applied to determine both the spatial distribution of An. cruzii, An. bellator and An. marajoara and to establish the density of each species. Poisson regression was utilized to associate malaria cases with estimated vector densities. As a result, An. cruzii was correlated with the forested slopes of the Serra do Mar, An. bellator with the coastal plain and An. marajoara with the deforested areas. Moreover, both An. marajoara and An. cruzii were positively associated with malaria cases. Considering that An. marajoara was demonstrated to be a primary vector of human Plasmodium in the rural areas of the state of Amapá, more attention should be given to the species in the deforested areas of the Atlantic Forest, where it might be a secondary vector.

O cerrado possui seu limite austral de ocorrência nos Campos Gerais do Paraná onde, na forma de pequenos fragmentos disjuntos, tem grande afinidade com as formações savânicas de São Paulo e do Planalto Central do Brasil. Encontra-se, na sua maior parte, em propriedades particulares, sob forte pressão da agropecuária, tendo sido até então pouco estudado. Foram realizadas análises florísticas e fitofisionômicas de 30 remanescentes de cerrado em seis municípios, com determinação de um total de 1.782 táxons. Asteraceae foi a família com maior riqueza de espécies (256), seguida por Fabaceae (207), Poaceae (183), Myrtaceae (72) e Melastomataceae (54). Encontrou-se um gradiente latitudinal e geomorfológico na distribuição das fisionomias: cerrado stricto sensu (50%) e cerradão (13%) distribuem-se nos planaltos areníticos ao norte da região; enquanto cerrado rupestre (17%) e campo sujo com fácies de cerrado (20%) estão mais representados nas porções meridionais, nos relevos escarpados dos vales dos rios. Os remanescentes mostraram similaridade florística com áreas core do Bioma e podem ser consideradas áreas marginais da amplitude geográfica de muitos táxons, compartilhando espécies típicas, características da Província Sulina. Portanto, estas áreas campestres seriam melhor classificadas como savanas do que como estepes. A fitocenose mais austral em Ponta Grossa, com alta riqueza de espécies, encontra-se isolada biogeograficamente dos demais elementos do Bioma, constituindo um possível centro de endemismo.

The cerrado (Brazilian savannah) has its Southern limits of occurrence in the Campos Gerais region in the State of Paraná, through small disjunction patches with great affinities with the Northern savannah formations of São Paulo and the Central Plateau of Brazil. They are mostly on private lands, under strong pressure from agribusiness and have been hitherto little studied. A floristic and phytophysiognomical analysis of 30 remnants in different municipalities was carried out, reaching a total of 1,782 determined taxa, being Asteraceae the richest family (256), followed by Fabaceae (207), Poaceae (183), Myrtaceae (72) and Melastomataceae (54). There is a geomorphological and latitudinal gradient on the distribution of physiognomies: cerrado stricto sensu (50%) and cerradão (13%) are distributed mainly in the sandstone plateaus in the north region, while cerrado rupestre (17%) and grassland with cerrado facies (20%) are most frequent in the river valleys cliffs in the South. These remnants present floristic similarity with the core area of the Biome, and could be considered marginal areas of the geographical range of several taxa, sharing typical species of the Southern Province. Thus the whole area would be more correctly named savannah instead of steppe. The austral phytocoenosis of Ponta Grossa, a possible endemism centre with great richness, is biogeographically isolated from the other cerrado patches.