Abstract FioAntar, FIOCRUZ’s research project in Antarctica, is based on the One Health approach. FioAntar aims to generate relevant information that will help reduce the risk of future pandemics and improve the search for chemical compounds and new biological molecules. After four expeditions to Antarctica under the scope of PROANTAR, Fiocruz has identified Influenza H11N2 virus in environmental fecal samples, as well as Histoplasma capsulatum and Bacillus cereus in soil samples. In addition, in a prospective virome analysis from different lakes in the South Shetland Islands, six viral orders were described, supporting future research related to the biodiversity and viral ecology in this extreme ecosystem. Our findings of environmental pathogens of public health importance are a warning about the urgency of establishing a surveillance agenda on zoonoses in Antarctica due to the imminent risks that ongoing environmental and climate changes impose on human health across the planet. FioAntar strives to establish a comprehensive surveillance program across Antarctica, monitoring circulation of pathogens with the potential to transcend continent boundaries, thereby mitigating potential spread. For Fiocruz, Antarctica signifies a new frontier, teeming with opportunities to explore novel techniques, refine established methodologies, and cultivate invaluable knowledge. FIOCRUZs FIOCRUZ s approach molecules PROANTAR HN H N H11N samples addition Islands described ecosystem planet boundaries spread frontier techniques methodologies knowledge

Abstract Numerous Antarctic species are recognized as reservoirs for various pathogens, and their migratory behavior allows them to reach the Brazilian coast, potentially contributing to the emergence and circulation of new infectious diseases. To address the potential zoonotic risks, we conducted surveillance of influenza A virus (IAV) and coronaviruses (CoVs) in the Antarctic Peninsula, specifically focusing on different bird and mammal species in the region. During the summer of 2021/2022, as part of the Brazilian Antarctic Expedition, we collected and examined a total of 315 fecal samples to target these respiratory viruses. Although we did not detect the viruses of interest during this particular expedition, previous research conducted by our team has shown the presence of the H11N2 subtype of influenza A virus in penguin fecal samples from the same region. Given the continuous emergence of new viral strains worldwide, it is crucial to maintain active surveillance in the area, contributing to strengthening integrated One Health surveillance efforts. pathogens coast diseases risks IAV (IAV CoVs (CoVs Peninsula region 20212022 2021 2022 2021/2022 Expedition 31 expedition HN H N H11N worldwide area efforts 2021202 202 2021/202 3 202120 20 2021/20 20212 2 2021/2 2021/

Coronavirus disease 2019 (COVID-19) surveillance, in Brazil, initiated shortly after its description, in China. Our aim was to detect severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) and additional pathogens in samples from the initial phase of the outbreak in Brazil, from late February to late March. From 707 samples analysed, 29 (4.1%) were SARS-CoV-2 positive. Fever and cough were their most prevalent symptoms. Co-detection of rhinovirus was observed in 2 (6.9%) cases. Additional pathogens were identified in 66.1% of the SARS-CoV-2 negative cases, mainly rhinovirus and influenza A(H1N1)pdm09. Thus, we emphasise the importance of differential diagnosis in COVID-19 suspected cases.

Resumen Antecedentes: En América del Sur, las aves actúan como importantes hospedadores dentro del ciclo biológico de garrapatas del género Amblyomma, que por su parte, se encuentran naturalmente infectadas con rickettsias patógenas. Aunque la diversidad de aves en esta región es alta, el conocimiento de la fauna de garrapatas asociadas es aún escaso. Objetivo: Reportar la fauna de garrapatas asociadas a aves presentes en la Amazonía, estado de Acre, Brasil, y evaluar en éstas infección por Rickettsia. Métodos: Las aves fueron capturadas con redes de niebla y examinadas en busca de garrapatas, las que a su vez fueron identificadas por medio de claves taxonómicas y métodos moleculares. Parte de estas garrapatas fueron individualmente sometidas a PCR convencional en busca de fragmentos de tres genes rickettsiales (gltA, ompA, ompB). Resultados: De un total de 1.322 aves capturadas, 79 (6,0%) se encontraron parasitadas con alguna de las siguientes especies de garrapatas: Amblyomma nodosum Neumann, 1899 (72 ninfas), Amblyomma longirostre (Koch, 1844; siete larvas, 13 ninfas), Amblyomma humerale Koch 1844 (cuatro ninfas), Amblyomma geayi Neumann, 1899 (dos larvas, dos ninfas) y 421 larvas de Amblyomma spp Rickettsia sp cepa NOD fue detectada en 3/26 A. nodosum y Rickettsia amblyommatis en 5/8 A. longirostre, así como también en 1/2 A. geayi analizadas. Conclusión: Este es el primer estudio sobre garrapatas parásitas de aves desarrollado en el estado de Acre. Además, se reportan nuevas relaciones parásito-hospedador, nuevos registros para dos especies de garrapatas (A. humerale y A. nodosum) y dos rickettsias (R. amblyommatis y Rickettsia sp cepa NOD) por primera vez en Acre.

Abstract Background: South American birds are known to play a significant role in life cycles of various hard ticks, particularly within Amblyomma genus. However, the tick fauna from the Amazon region has been poorly studied, being limited to very few studies. Objective: To report tick infestations on wild birds captured in a region of the Amazon forest, Acre state, Brazil, and to evaluate rickettsial infection in these ticks. Methods: Wild birds were captured by mist-nets and examined for the presence of ticks, which were all collected and identified to species level by taxonomic keys and/or molecular methods. In addition, part of these ticks was individually tested by PCR targeting portions of three rickettsial genes (gltA, ompA, ompB). Results: Among 1,322 captured birds, 79 individuals (6.0%) were infested by one of the following ticks species: Amblyomma nodosum Neumann, 1899 (72 nymphs), Amblyomma longirostre (Koch, 1844; seven larvae, 13 nymphs), Amblyomma humerale Koch 1844 (four nymphs), Amblyomma geayi Neumann, 1899 (two larvae, two nymphs), and 421 larvae of Amblyomma spp Rickettsia sp strain NOD was detected in 3/26 A. nodosum, and Rickettsia amblyommatis in 5/8 A. longirostre and 1/2 A. geayi ticks tested. Conclusion: This is the first study about ticks parasitizing wild birds in Acre state, adding new host-parasite relationships, new tick species records (A. humerale and A. nodosum) and two rickettsial agents (R amblyommatis and Rickettsia sp strain NOD) for the first time in Acre.

Resumo Antecedentes: Aves sul-americanas são conhecidas por desempenhar um papel significativo no ciclo de vida de várias espécies de ixodídeos, particularmente dentro do gênero Amblyomma. No entanto, a ixodofauna da região amazônica tem sido pouco estudada, sendo limitada apenas a alguns estudos. Objetivo: Relatar as infestações de carrapatos em aves silvestres capturadas na região de floresta amazônica, Acre, Brasil, e avaliar as infecções por riquétsias. Métodos: As aves silvestres foram capturadas por redes de neblina e examinadas para a presença de carrapatos, que foram coletados e identificados até espécies, utilizando chaves taxonômicas e/ou métodos moleculares. Além disso, uma parte desses carrapatos foram testados individualmente pela PCR para a pesquisa de fragmentos de três genes de riquétsias (gltA, ompA, ompB). Resultados: Entre as 1.322 aves capturadas, 79 indivíduos (6,0%) estavam infestados pelas seguintes espécies de carrapatos: Amblyomma nodosum Neumann, 1899 (72 ninfas), Amblyomma longirostre (Koch, 1844; sete larvas, 13 ninfas), Amblyomma humerale Koch 1844 (quatro ninfas), Amblyomma geayi Neumann, 1899 (duas larvas, duas ninfas) e 421 larvas de Amblyomma spp Rickettsia sp cepa NOD foi detectada em 3/26 A. nodosum e Rickettsia amblyommatis em 5/8 A. longirostre e 1/2 A. geayi dos carrapatos testados. Conclusão: Este é o primeiro estudo de carrapatos parasitando aves silvestres no estado do Acre, demostrando novas relações parasita-hospedeiro e registros inéditos de espécies de carrapatos (A. humerale e A. nodosum) e riquétsias (R. amblyommatis e Rickettsia sp strain NOD) para o Acre.

Toxoplasma gondii é um protozoário parasita que infecta animais de sangue quente, incluindo seres humanos. Pequenos roedores e marsupiais têm papel importante na epidemiologia do T. gondii, pois são fontes de infecção para os felídeos domésticos e selvagens. Amostras de soro de 151 roedores e 48 marsupiais, capturados na Mata Atlântica, Estado de São Paulo, Sudeste do Brasil, foram analisadas para a pesquisa de anticorpos anti-T. gondii. Os anticorpos foram detectados pelo Teste de Aglutinação Modificada (MAT ≥ 25), com 8,6% (13/151) dos roedores e 10,4% (5/48) dos marsupiais soropositivos, com títulos variando de 25 a 6.400 e de 25 a 3.200, respectivamente, para os roedores e os marsupiais. Três das oito espécies de roedores (Akodon spp., Oligoryzomys nigripes e Rattus norvegicus) e uma das quatro espécies de marsupiais (Didelphis aurita) apresentaram animais positivos. A presença de anticorpos anti-T. gondii foi descrita pela primeira vez no roedor Oligoryzomys nigripes.

Toxoplasma gondii is a protozoan parasite that infects a large spectrum of warm-blooded animals, including humans. Small rodents and marsupials play an important role in the epidemiology of T. gondii because they are sources of infection for domestic and feral cats. Serum samples from 151 rodents and 48 marsupials, captured in the Atlantic Forest, São Paulo State, southeastern Brazil, were analyzed for the presence of T. gondii antibodies. Antibodies detected by the modified agglutination test (MAT ≥ 25) were found in 8.6% (13/151) of the rodents and 10.4% (5/48) of the marsupials, with titers ranging from 25 to 6400 and from 25 to 3200, respectively for the rodents and marsupials. Three of the eight species of rodents (Akodon spp., Oligoryzomys nigripesand Rattus norvegicus), and one from the four marsupial species (Didelphis aurita) presented positive animals. T. gondii was described for the first time in the rodent Oligoryzomys nigripes.

Descrevemos aqui carrapatos que parasitam aves em fragmentos florestais ao longo do rio Uberabinha, o principal curso de água que corta manchas de remanescentes de Cerrado em Uberlândia, Minas Gerais, Brasil. Ao todo, foram capturadas, com redes de neblina, 352 aves, de 62 espécies, em sua maioria, Passeriformes. As espécies de aves mais abundantes foram Basileuterus hypoleucus com 36 indivíduos, seguido de Lanio penicillata (n=24) e Thalurania furcata (n=23). Trinta e uma aves, todas Passeriformes, estavam infestadas com 56 carrapatos, sendo 12 larvas e 44 ninfas, todos do gênero Amblyomma. A prevalência de infestação mais elevada foi encontrada em Taraba major (66,6%), Thamnophilus pelzeni (60%) e Saltator maximus (50%). A intensidade média de infestação por carrapatos foi baixa (1,8 carrapato por ave infestada) e a maior parte dos parasitas recolhidos estava localizada no pescoço (60%) das aves, seguido pela cabeça (20%). Todas as larvas estavam fixadas à pele ao redor dos olhos das aves. Amblyomma nodosum foi a espécie de carrapato mais numerosa encontrada nas aves (n=23 ninfas, 52,3% das ninfas), seguido de Amblyomma longirostre (n=5, 11,4% das ninfas). Relações ecológicas são discutidas.

We herein describe ticks parasitizing birds in forest fragments along the Uberabinha River, a major watercourse that cuts through patches of remnants of Brazilian savannah in Uberlândia, Minas Gerais, Brazil. Overall 352 birds from 62 species, overwhelmingly, Passeriformes, were captured with mist-nets. The most abundant bird species was Basileuterus hypoleucus (n=36), followed by Lanio penicillata (n=24) and Thalurania furcata (n=23). Thirty one birds, all Passeriformes, were found infested with 56 ticks from which 12 were larvae and 44 nymphs, all from the Amblyomma genus. Highest infestation prevalence was found on Taraba major (66.6%), Thamnophilus pelzeni (60%) and Saltator maximus (50%). The mean intensity of tick infestation was low (1.8 tick per infested bird) with most of the parasites located on the neck (60%) of birds, followed by the head (20%). All larvae were attached to the skin around the eyes of birds. Amblyomma nodosum was the most numerous tick species found attached to birds (n=23 nymphs, 52.3% of nymphs) followed by Amblyomma longirostre (n=5, 11.4% of nymphs). Ecological relationships are discussed.

Nesse trabalho relatam-se infestações de carrapatos em aves, meio ambiente e em animais domésticos em uma fitofisionomia não florestal, o Cerrado stricto sensu, de uma reserva natural na periferia da área urbana de Uberlândia, Minas Gerais, Brasil. Para tal, 238 aves de 50 espécies foram capturadas, pertencentes a 15 famílias e seis ordens. Passeriforme foi a mais numerosa, com 216 indivíduos (90,75%), dos quais 22 estavam parasitados com 31 carrapatos. Nos Passeriformes a prevalência de infestação de carrapatos foi de 10,2%, a abundância e intensidade média foi de 0,14 e 1,41, respectivamente. Apenas carrapatos imaturos da espécie Amblyomma nodosum foram encontrados em aves. As espécies de carrapatos encontradas tanto em animais (Rhipicephalus sanguineus,Rhipicephalus (Boophilus)microplus, Amblyomma cajennense,Dermacentor nitens) como no ambiente (Amblyomma dubitatum, Rhipicephalus(B.) microplus,Amblyomma cajennense) foram aquelas já esperadas. Esta diferença de espécies de carrapatos entre ambiente e de aves possivelmente ocorreu porque a amostragem do ambiente se restringiu ao solo. Esse estudo também destaca a importância dos diversos microambientes usados por carrapatos e hospedeiros em uma mesma área e a complexa ecologia das relações ave-carrapato. Aspectos ecológicos e epidemiológicos dos achados são discutidos.

We report tick infestations on birds, in the environment and on domestic animals in a non-forested phytophysiognomy, the savanna-like Cerradosensu stricto, in a natural reserve on the outskirts of the urban area of Uberlândia, Minas Gerais, Brazil. Overall, 238 birds within 50 species, 15 families and six orders were caught. Passeriformes were the most numerous, with 216 birds (90.75%), among which 22 had ticks (n = 31). Within this order, the prevalence of tick infestation was 10.2%, and the abundance and mean intensity were 0.14 and 1.41, respectively. Only immature ticks of the species Amblyomma nodosum were found on the birds. The tick species found both on animals (Rhipicephalus sanguineus,Rhipicephalus (Boophilus)microplus, Amblyomma cajennense andDermacentor nitens) and in the environment (Amblyomma dubitatum, Rhipicephalus(B.) microplus andAmblyomma cajennense) were as expected. This difference in tick species between the environment and birds possibly occurred because the sampling of the environment was limited to the ground. This study also highlights the importance of the diverse microenvironments used by ticks and hosts in the same area and the complex ecology of bird-tick relationships. Ecological and epidemiological aspects of the findings are discussed.

Neste trabalho, são apresentadas as espécies de carrapatos em aves silvestres, sua prevalência e a intensidade de infestação em um fragmento florestal (18º 56' 57" S e 48º 12' 14" W) do Cerrado, no município de Uberlândia, Estado de Minas Gerais. Foram capturadas 162 aves de 26 espécies, mas apenas as aves Passeriformes estavam infestadas. Nestas, foram encontrados um carrapato adulto, 67 ninfas e 296 larvas. Dentre os carrapatos foi possível a identificação de 31 larvas e 27 ninfas de Amblyomma longirostre, 17 ninfas de A. nodosum, uma larva de A. cajennense e um Rhipicephalus sanguineus macho. Todos os outros carrapatos foram classificados como larvas (n = 264) ou ninfas (n = 26) de Amblyomma sp. A intensidade de infestação e a prevalência de carrapatos foram de 4,32 carrapatos/ave infestada e 52%, respectivamente. Na pesquisa de carrapatos em vida livre sobre a vegetação do fragmento florestal, foram capturados apenas cinco ninfas de Amblyomma sp. e um macho adulto de A. nodosum, por um período de dois anos. Carrapatos da espécie Rhipicephalus (Boophilus) microplus foram encontrados parasitando bovinos, cavalos e cães domésticos da região. Mesmo considerando a identificação de apenas 27% dos carrapatos das aves, parece não haver correlação entre infestação ambiental, nos animais domésticos, com a infestação das aves. Pode-se supor que a infestação das aves ocorra acima do solo ou em locais específicos não pesquisados neste trabalho.

This is a report of ticks species, parasite prevalence and infestation intensity of birds in a forest fragment (18º 56' 57" S and 48º 12' 14" W) within the Brazilian cerrado (savanna), in the municipality of Uberlândia, State of Minas Gerais, Brazil. A total of 162 birds from 26 species were captured. One adult tick, 296 larvae and 67 nymphs were found on passerine birds. Of these, it was identified 31 larvae and 27 nymphs of Amblyomma longirostre, 17 nymphs of A. nodosum, one A. cajennense larvae and one male of Rhipicephalus sanguineus. All other ticks were identified as Amblyomma sp. larvae (n = 264) or nymphs (n = 26). Overall tick infestation intensity and prevalence were 4.32 ticks/infested bird and 52%, respectively. Sampling of host-seeking ticks on the ground within the forest during a two-year period showed only five Amblyomma sp. nymphs and one adult male of A. nodosum whereas a search for ticks on domestic animals (cattle, horses and dogs) found Rhipicephalus (Boophilus) microplus ticks. Although identification was possible in only 27% of bird ticks there seemed to be no correlation between environmental and domestic animal and bird infestation. It can be assumed that bird infestation may occur above the ground or at specific sites not sampled.

O presente trabalho confirma, após décadas sem novos relatos, a ocorrência dos carrapatos Amblyomma obolongoguttatum Koch, 1844, A. brasiliense Aragão, 1908, e A. humerale Koch, 1844 no Estado do Espírito Santo, Brasil, além do primeiro relato de A. naponense (Packard,1869) para este estado.

We confirm, after decades without new registers, the occurrence of the ticks Amblyomma obolongoguttatum Koch, 1844, A. brasiliense Aragão, 1908, and A. humerale Koch, 1844 in the State of Espírito Santo, Brazil, besides the first record of A. naponense (Packard, 1869) in this state.