ABSTRACT Background: Chronic conditions increase the risk of invasive pneumococcal diseases (IPD). Pneumococcal vaccination remarkably reduced IPD morbimortality in vulnerable populations. In Brazil, pneumococcal vaccines are included in the National Immunization Program (PNI): PCV10 for < 2 years-old, and PPV23 for high risk-patients aged ≥ 2 years and institutionalized ≥ 60 years. PCV13 is available in private clinics and recommended in the PNI for individuals with certain underlying conditions. Methods: A retrospective study was performed using clinical data from all inpatients from five hospitals with IPD from 2016 to 2018 and the corresponding data on serotype and antimicrobial-non-susceptibility of pneumococcus. Vaccine-serotype-coverage was estimated. Patients were classified according to presence of comorbidities: healthy, without comorbidities; at-risk, included immunocompetent persons with specific medical conditions; high-risk, with immunocompromising conditions and others Results: 406 IPD cases were evaluated. Among 324 cases with information on medical conditions, children < 5 years were mostly healthy (55.9%), while presence of comorbidity prevailed in adults ≥ 18 years old (> 82.0%). Presence of ≥1 risk condition was reported in ≥ 34.8% of adults. High-risk conditions were more frequent than at-risk in all age groups. Among high-risk comorbidity (n = 211), cancer (28%), HIV/AIDS (25.7%) and hematological diseases (24.5%) were the most frequent. Among at-risk conditions (n = 89), asthma (16.5%) and diabetes (8.1%) were the most frequent. Among 404 isolates, 42.9% belonged to five serotypes: 19A (14.1%), 3 (8.7%), 6C (7.7%), 4 and 8 (6.2% each); 19A and 6C expressed antimicrobial-non-susceptibility. The vaccine-serotype-coverage was: PCV10, 19.1%, PCV13, 43.8%; PCV15, 47.8%; PCV20, 62.9%; PCV21, 65.8%, and PPV23, 67.3%. Information on hospital outcome was available for 283 patients, of which 28.6% died. Mortality was 54.2% for those with meningitis. Conclusion: Vaccine with expanded valence of serotypes is necessary to offer broad prevention to IPD. The present data contribute to pneumococcal vaccination public health policies for vulnerable patients, mainly those with comorbidity and the elderly. Background . (IPD) populations Brazil (PNI) PCV PCV1 yearsold, yearsold old, years-old PPV PPV2 riskpatients patients 6 Methods 201 antimicrobialnonsusceptibility antimicrobial non susceptibility pneumococcus Vaccineserotypecoverage coverage estimated comorbidities atrisk, atrisk at risk, highrisk, highrisk Results 40 evaluated 32 55.9%, 559 55.9% , 55 9 (55.9%) 1 > ( 82.0%. 820 82.0% 82 0 82.0%) 348 34 34.8 Highrisk High groups n 211, 211 211) 28%, 28 28% (28%) HIVAIDS HIV AIDS 25.7% 257 25 7 (25.7% 24.5% 245 24 (24.5% 89, 89 89) 16.5% 165 16 (16.5% 8.1% 81 (8.1% isolates 429 42 42.9 14.1%, 141 14.1% 14 (14.1%) 8.7%, 87 8.7% (8.7%) C 7.7%, 77 7.7% (7.7%) 6.2% 62 (6.2 each each) antimicrobialnonsusceptibility. susceptibility. vaccineserotypecoverage vaccine 191 19 19.1% 43.8% 438 43 PCV15 47.8% 478 47 PCV20 62.9% 629 PCV21 658 65 65.8% 673 67 67.3% 286 28.6 died 542 54 54.2 meningitis Conclusion elderly (IPD (PNI 20 55.9 (55.9% 82.0 34. 21 (28% 25.7 (25.7 24.5 (24.5 16.5 (16.5 8.1 (8.1 42. 14.1 (14.1% 8.7 (8.7% 7.7 (7.7% 6.2 (6. 19.1 43.8 47.8 PCV2 62.9 65.8 67.3 28. 54. 55. (55.9 82. (28 25. (25. 24. (24. 16. (16. 8. (8. 14. (14.1 (8.7 7. (7.7 6. (6 19. 43. 47. 62. 65. 67. (55. (2 (25 (24 (16 (8 (14. (7. (55 (1 (14 (7 (5

OBJETIVO: avaliar a frequência das infecções por vírus respiratórios em lactentes hospitalizados com suspeita clínica de coqueluche e analisar suas características admissionais e evolutivas. MÉODOS: foi realizado um estudo de coorte histórica, em um serviço sentinela para coqueluche, no qual a pesquisa de vírus respiratórios também foi rotineira para os lactentes hospitalizados com problemas respiratórios. Foram incluídos todos os lactentes submetidos à notificação compulsória de suspeita de coqueluche. Foram realizadas pesquisas para Bordetela pertussis - BP (PCR/cultura) e vírus respiratórios - VR (imunofluorescência). Foram excluídos os pacientes que haviam recebido macrolídeos previamente à internação. Os dados clínicos foram obtidos dos prontuários. RESULTADOS: dentre os 67 pacientes analisados, a pesquisa para BP foi positiva em 44% e para VR em 26%. Não houve identificação etiológica em 35% e em 5% houve codetecção de VR e BP. Todos os pacientes apresentaram características demográficas semelhantes. A presença de tosse seguida de guincho inspiratório ou cianose foi um forte preditor de coqueluche, assim como, leucocitose e linfocitose evidentes. Coriza e dispneia foram mais frequentes nas infecções virais. Houve suspensão do uso de macrolídeos em 40% dos pacientes com pesquisa positiva para VR e negativa para BP. CONCLUSÃO: os resultados sugerem que lactentes hospitalizados com suspeita de coqueluche podem apresentar infecção viral e a pesquisa etiológica pode possibilitar a redução do uso de macrolídeos em alguns casos. No entanto, salienta-se que o diagnóstico etiológico de infecção por vírus respiratórios, por si só, não exclui a possibilidade de infecção por Bordetella pertussis.

OBJECTIVE: to evaluate the frequency of respiratory viral infections in hospitalized infants with clinical suspicion of pertussis, and to analyze their characteristics at hospital admission and clinical outcomes. METHODS: a historical cohort study was performed in a reference service for pertussis, in which the research of respiratory viruses was also a routine for infants hospitalized with respiratory problems. All infants reported as suspected cases of pertussis were included. Tests for Bordetella pertussis (BP) (polymerase chain reaction/culture) and for respiratory viruses (RVs) (immunofluorescence) were performed. Patients who received macrolides before hospitalization were excluded. Clinical data were obtained from medical records. RESULTS: among the 67 patients studied, BP tests were positive in 44%, and 26% were positive for RV. There was no etiological identification in 35%, and RV combined with BP was identified in 5%. All patients had similar demographic characteristics. Cough followed by inspiratory stridor or cyanosis was a strong predictor of pertussis, as well as prominent leukocytosis and lymphocytosis. Rhinorrhea and dyspnea were more frequent in viral infections. Macrolides were discontinued in 40% of patients who tested positive for RV and negative for BP. CONCLUSION: the results suggest that viral infection can be present in hospitalized infants with clinical suspicion of pertussis, and etiological tests may enable a reduction in the use of macrolides in some cases. However, the etiological diagnosis of respiratory virus infection, by itself, does not exclude the possibility of infection with BP.

OBJETIVOS: Identificar os sorotipos de pneumococo mais frequentemente isolados de crianças internadas com pneumonia invasiva, comparar os sorotipos com os incluídos em vacinas conjugadas e analisar sua sensibilidade aos antimicrobianos mais utilizados na faixa etária pediátrica. MÉTODOS: Estudo descritivo, retrospectivo das pneumonias pneumocócicas identificadas em crianças internadas no hospital universitário da Universidade de São Paulo, no período de janeiro de 2003 a outubro de 2008. Os critérios de inclusão foram: faixa etária de 29 dias até 15 anos incompletos com diagnóstico clínico e radiológico de pneumonia e com cultura de sangue e/ou líquido pleural com crescimento de Streptococcus pneumoniae. RESULTADOS: Foram incluídas no estudo 107 crianças. Os sorotipos mais frequentes foram: 14 (36,5%), 1 (16,7%), 5 (14,6%), 6B (6,3%) e 3 (4,2%). A proporção de sorotipos contidos na vacina conjugada heptavalente seria de 53,1%, na vacina 10-valente de 86,5% e na 13-valente seria de 96,9%. De acordo com os padrões do Clinical and Laboratory Standards Institute 2008, 100 cepas (93,5%) de pneumococos foram sensíveis à penicilina (concentração inibitória mínima, CIM < 2 µg/mL), 7 cepas (6,5%) com resistência intermediária (CIM = 4 µg/mL) e nenhuma com resistência (CIM > 8 µg/mL). Verificamos alta taxa de sensibilidade para as cepas testadas para vancomicina, rifampicina, ceftriaxone, clindamicina, cloranfenicol e eritromicina. CONCLUSÕES: Nossos resultados confirmam um expressivo impacto potencial das vacinas conjugadas, principalmente pela 10-valente e 13-valente, sobre os casos de pneumonias invasivas. Os resultados de sensibilidade à penicilina evidenciam que a opção terapêutica de escolha para o tratamento das pneumonias invasivas continua sendo a penicilina.

OBJECTIVES: To identify the most common pneumococcal serotypes in children hospitalized with invasive pneumonia, correlate isolated serotypes with those included in conjugate vaccines, and ascertain the sensitivity of the isolated pneumococcal strains to penicillin and other antibiotics. METHODS: From January 2003 to October 2008, a retrospective study of hospitalized children with a diagnosis of Streptococcus pneumoniae pneumonia was conducted at the university hospital of Universidade de São Paulo. Criteria for inclusion were: age greater than 29 days and less than 15 years, radiological and clinical diagnosis of pneumonia, and isolation of Streptococcus pneumoniae in blood cultures and/or pleural effusion. RESULTS: The study included 107 children. The most common serotypes were 14 (36.5%), 1 (16%), 5 (14.6%), 6B (6.3%) and 3 (4.2%). The proportion of identified serotypes contained in the heptavalent, 10-valent and 13-valent conjugate vaccines was 53.1, 86.5, and 96.9%, respectively. Pneumococcal strains were sensitive to penicillin (minimum inhibitory concentration, MIC < 2 µg/mL) in 100 cases (93.5%) and displayed intermediate resistance (MIC = 4 µg/mL) in 7 cases (6.5%). No strains were penicillin-resistant (MIC > 8 µg/mL) according to the Clinical and Laboratory Standards Institute 2008 standards. Tested isolates were highly sensitive to vancomycin, rifampicin, ceftriaxone, clindamycin, erythromycin, and chloramphenicol. CONCLUSIONS: Our results confirm a significant potential impact of conjugate vaccines, mainly 10-valent and 13-valent, on invasive pneumonia. Furthermore, susceptibility testing results show that penicillin is still the treatment of choice for invasive pneumonia in our setting.

INTRODUÇÃO: O vírus sincicial respiratório é um dos principais agentes etiológicos das infecções do aparelho respiratório inferior em lactentes. Os genótipos deste vírus e o papel dos anticorpos séricos ainda não estão esclarecidos. Este conhecimento é importante para o desenvolvimento de medidas terapêuticas e profiláticas. OBJETIVOS: Avaliar: os tipos e genótipos do vírus sincicial que causam infecção respiratória em lactentes e a associação dos anticorpos séricos subtipo-específicos com a ocorrência de infecção; a presença de anticorpos subtipo-específicos nas mães e sua associação com o perfil de anticorpos da criança. MÉTODOS: Estudo prospectivo incluindo lactentes hospitalizados com infecção respiratória. Foi coletada secreção de nasofaringe para investigação viral usando imunofluorescência indireta e cultivo viral. Foi coletado sangue para pesquisa de anticorpos usando o sistema Luminex Multiplex. RESULTADOS: Avaliados 192 lactentes: 60,9% com vírus sincicial (73,5% - A e 20,5% - B). Seis genótipos de vírus sincicial respiratório foram identificados: A5,A2,B3,B5,A7 e B4. A soroprevalência dos anticorpos subtipos-específicos foi alta. A presença e o nível de anticorpos subtipos-específicos foram semelhantes, independentemente da presença de infecção, tipo e genótipo do vírus. As mães e as crianças apresentaram perfis semelhantes de anticorpos. CONCLUSÕES: A prevalência dos anticorpos subtipos-específicos foi elevada mas estes anticorpos não conferiram proteção, independentemente do tipo/genótipo do vírus. A semelhança dos perfis de anticorpos das mães e das crianças foi compatível com transmissão transplacentária.

INTRODUCTION: Respiratory syncytial virus (RSV) is a major etiological agent of lower respiratory tract infection in infants. Genotypes of this virus and the role of the infants' serum antibodies have yet to be fully clarified. This knowledge is important for the development of effective therapeutic and prophylactic measures. OBJECTIVES: To evaluate the types and genotypes of RSV causing respiratory tract infection in infants, to analyze the association of subtype-specific serum antibodies with the occurrence of infection and to evaluate the presence of subtype-specific antibodies in the infants' mothers and their association with the profile of the childrens' serum antibodies. METHODS: This was a prospective study on infants hospitalized with respiratory infection. Nasopharyngeal secretions were collected for viral investigation using indirect immunofluorescence and viral culture and blood was collected to test for antibodies using the Luminex Multiplex system. RESULTS: 192 infants were evaluated, with 60.9% having RSV (73.5%- A and 20.5% B). Six genotypes of the virus were identified: A5, A2, B3, B5, A7 and B4. The seroprevalence of the subtype-specific serum antibodies was high. The presence and levels of subtype-specific antibodies were similar, irrespective of the presence of infection or the viral type or genotype. The mothers' antibody profiles were similar to their infants'. CONCLUSIONS: Although the prevalence of subtype-specific antibodies was elevated, these antibodies did not provide protection independently of virus type/genotype. The similarity in the profiles of subtype-specific antibodies presented by the mothers and their children was consistent with transplacental passage.

Objetivo: determinar o perfil etiológico das diarréias agudas de um grupo de crianças de baixo nível socioeconômico atendidas em um serviço regional de pronto-atendimento pediátrico. Método: durante dois anos, as crianças com diarréia aguda atendidas durante um horário pré-estabelecido do dia e da semana foram incluídas no estudo. Os outros critérios seletivos eram: a) idade inferior a 5 anos; b) não utilização de antibiótico no mês precedente; c) ausência de viagem para fora da cidade no mês precedente. Foram pesquisados nas fezes: a) rotavírus (imunofluorescência e contra-imunoeletroforese); b) bactérias - cultura em ágar MacConkey, ágar SS, ágar Columbia, verde brilhante, soroaglutinação, detecção de toxinas - INV, LT,ST,SLT I, SLT II, teste de Séreny, detecção de fatores de virulência -- EAF, eae ,BFP; c) protozoários (Hoffman e Faust). No mesmo período, um grupo controle sem diarréia foi também avaliado para os mesmos patógenos fecais. Resultados: no período de março de 1994 a junho de 1996, foram selecionadas para o estudo 154 crianças com diarréia aguda (GDA) e 42 crianças sem diarréia (GSDA). Foram detectados agentes enteropatogênicos em 112 casos (72,8%) do GDA, e em 9 (21,5%) do GSDA. A associação de dois ou mais enteropatógenos ocorreu em 47 (30,5%) casos do GDA, e em 3 (7,1%) do GSDA. Os patógenos encontrados por caso, do GDA, foram: rotavírus 32 (20,8%), bactérias 53 (34,4%), ambos 25 (16,2%), e 2 (1,4%) com Giardia lamblia (em um caso associada a rotavírus e noutro à bactéria). No GSDA, foram detectadas bactérias em 8 casos (19,1%), e bactéria associada à Giardia lamblia em 1 (2,4%) caso. Das 105 bactérias isoladas no GDA, 90 eram Escherichia coli (EPEC 27, DAEC 24, ETEC 21, EAEC 18), 12 eram Shigella sp, 2 eram Salmonella sp, e uma era Yersinia sp. As crianças com infecção mista - viral e bacteriana - apresentaram maior ocorrência de vômitos repetidos, desidratação e internação.Conclusões: as bactérias foram os enteropatógenos mais detectados nos casos de diarréia aguda, sendo a Escherichia coli a mais freqüente. Na maior parte, as cepas de Escherichia coli eram de biovariedade não-EPEC, habitualmente não investigadas nos laboratórios de patologia clínica. O rotavírus foi encontrado em grande parcela dos casos, muitas vezes em associação com as bactérias. Os protozoários tiveram importância reduzida.

Objective: to evaluate the etiologic profile of acute diarrhea in socioeconomically deprived children assisted at a regional pediatric emergency care service. Methods: during two years all children with acute diarrhea assisted at a previously established day and week time schedule were included in the study. Other selective criteria were: a) age less than 5 years; b) nonuse of antibiotics in the previous month; and c) no travel outside the city in the previous month. Stool examination was used for the detection of the following microorganisms: a) rotavirus (immunofluorescence and counterimmunoelectrophoresis); b) bacteria - culture in MacConkey agar, SS agar, Columbia agar, bright green, serotyping, detection of toxins - INV, LT,ST,SLT I, SLT II, Sereny test, detection of virulence factors - EAF, eae, BFP; and c) protozoa (Hoffman and Faust). In the same period, a control group without diarrhea was also evaluated for the same fecal pathogens. Results: between March 1994 and June 1996, 154 children with acute diarrhea (AD) and 42 control children (WAD), that is, without acute diarrhea, were selected. In the AD group, intestinal pathogens were detected in 112 (72.8%) cases, and in 9 (21.5%) cases in the WAD group. The association of two or more intestinal pathogens occurred in 47 (30.5%) cases in the AD group, and in 3 (7.1%) cases in the WAD group. The pathogens identified in the AD cases were: Rotavirus: 32 (20.8%), bacteria: 53 (34.4%), both: 25 (16.2%), and 2 (1.4%) with Giardia lamblia (in one case associated with Rotavirus and in another one associated with bacteria). In the WAD group, only bacteria were detected in 8 (19.1%) cases, and bacteria associated with Giardia lamblia in 1 (2.4%) case. Altogether, there were 105 bacteria isolated in the AD group: 90 were Escherichia coli (EPEC 27, DAEC 24, ETEC 21, EAEC 18), 12 were Shigella sp, 2 were Salmonella sp, and one was Yersinia sp. Children with mixed infections (viral and bacterial) had increased incidence of severe vomiting, dehydration and hospitalization. Conclusions: bacteria were the most frequent pathogens detected in acute diarrhea cases, among which Escherichia coli was highly predominant. The majority of Escherichia coli strains belong to non-EPEC varieties, strains that are not routinely evaluated in clinical laboratories of pathology. Rotavirus was found in a great number of diarrhea cases, often associated with bacteria. Protozoa showed reduced importance.

Os vírus respiratórios são reconhecidos como os mais frequentes patógenos do trato respiratório inferior para lactentes e crianças de idade reduzida em países desenvolvidos, mas o conhecimento sobre este fato é menor nos países em desenvolvimento.Os autores realizaram um estudo prospectivo para avaliar a ocorrência, os padrões clínicos e a sazonalidade das infecções virais entre as crianças hospitalizadas com doença do trato respiratório inferior (grupo A). A presença de vírus respiratórios na nasofaringe das crianças foi avaliada à admissão em uma enfermaria de pediatria. A cultura celular e a imunofluorescência foram utilizadas para identificação viral. Exames complementares incluiram culturas de sangue e líquido pleural para detecção de bactérias. Dados clínicos e exames radiológicos foram anotados na admissão e durante o período de internação. Para avaliar adequadamente os resultados foi constituído um grupo sem doença respiratória para comparação. Com início em fevereiro de 1995, durante um período de 18 meses, 414 crianças foram incluídas - 239 no grupo A e 175 no grupo B. No grupo A, 111 crianças (46,4%) tinham vírus enquanto somente 5 (2,9%) apresentavam vírus no grupo B. O Vírus Respiratório Sincicial foi detectado em 100 crianças do grupo A (41,8%), o Adenovírus em 11 (4,6%), o vírus Influenza em 2 (0,8%), e o Parainfluenza em uma criança (0,4%). No grupo A as bactérias foram encontradas em 14 casos (5,8%). O Vírus Respiratório Sincicial estava associado a outro vírus ou bactéria em seis casos. Ocorreram dois surtos de Vírus Respiratório Sincicial, com pico em maio e junho. Todas as crianças acometidas por este vírus tinham idade inferior a 3 anos, na sua maior parte menos de um ano de idade. O acometimento bronquial episódico e difuso e/ou a condensação alveolar focal, foram os padrões clínicos mais frequentemente associados aos casos de infecção pelo Vírus Respiratório Sincicial. Todas as crianças do grupo A sobreviveram. Em conclusão, foi observado que o Vírus Respiratório Sincicial foi o patógeno mais frequentemente encontrado em crianças hospitalizadas por doença respiratória grave. As crianças afetadas eram predominantemente lactentes do sexo masculino com bronquiolite e pneumonias focais. De modo similar ao que ocorre em outras regiões subtropicais os surtos do vírus têm pico no outono, extendem-se ao inverno, e se acompanham de um aumento nas internações hospitalares por doença respiratória.

The respiratory viruses are recognized as the most frequent lower respiratory tract pathogens for infants and young children in developed countries but less is known for developing populations. The authors conducted a prospective study to evaluate the occurrence, clinical patterns, and seasonal trends of viral infections among hospitalized children with lower respiratory tract disease (Group A). The presence of respiratory viruses in children's nasopharyngeal was assessed at admission in a pediatric ward. Cell cultures and immunofluorescence assays were used for viral identification. Complementary tests included blood and pleural cultures conducted for bacterial investigation. Clinical data and radiological exams were recorded at admission and throughout the hospitalization period. To better evaluate the results, a non- respiratory group of patients (Group B) was also constituted for comparison. Starting in February 1995, during a period of 18 months, 414 children were included- 239 in Group A and 175 in Group B. In Group A, 111 children (46.4%) had 114 viruses detected while only 5 children (2.9%) presented viruses in Group B. Respiratory Syncytial Virus was detected in 100 children from Group A (41.8%), Adenovirus in 11 (4.6%), Influenza A virus in 2 (0.8%), and Parainfluenza virus in one child (0.4%). In Group A, aerobic bacteria were found in 14 cases (5.8%). Respiratory Syncytial Virus was associated to other viruses and/or bacteria in six cases. There were two seasonal trends for Respiratory Syncytial Virus cases, which peaked in May and June. All children affected by the virus were younger than 3 years of age, mostly less than one year old. Episodic diffuse bronchial commitment and/or focal alveolar condensation were the clinical patterns more often associated to Respiratory Syncytial Virus cases. All children from Group A survived. In conclusion, it was observed that Respiratory Syncytial Virus was the most frequent pathogen found in hospitalized children admitted for severe respiratory diseases. Affected children were predominantly infants and boys presenting bronchiolitis and focal pneumonias. Similarly to what occurs in other subtropical regions, the virus outbreaks peak in the fall and their occurrence extends to the winter, which parallels an increase in hospital admissions due to respiratory diseases.