摘要 目的 开发2005年国家级疾病发病率缺失数据透明和可重复的填补方法。 方法 我们比较填补两种食源性疾病的缺失国家级发病率的几种模型：先天性弓形体病和黄曲霉毒素相关的肝细胞癌。假定缺失值是随机缺失。使用最小一乘收缩和选择算子（LASSO）回归来选择预...

Резюме Цель Разработать прозрачные и воспроизводимые методы ввода отсутствующих данных о распространенности заболевания на национальном уровне за 2005 год...

Résumé Objectif Développer des méthodes transparentes et reproductibles pour imputer les données manquantes sur l'incidence d'une maladie au niveau national pour l'année 2005. Méthodes Nous avons comparé plusieurs modèles pour imputer les taux d'incidence manquants au niveau national pour deux maladies d'origine alimentaire: la toxoplasmose congénitale et le carcinome hépatocellulaire lié à l'aflatoxine. Les valeurs manquantes sont supposées être manquantes au hasard. Les variables prédictives ont été sélectionnées en utilisant la régression LASSO ( least absolute shrinkage and selection operator ). Nous avons comparé la performance prédictive des approches d'extrapolation naïves et les modèles de régression à effets aléatoires et mixtes bayé...

Objective To develop transparent and reproducible methods for imputing missing data on disease incidence at national-level for the year 2005. Methods We compared several models for imputing missing country-level incidence rates for two foodborne diseases – congenital toxoplasmosis and aflatoxin-related hepatocellular carcinoma. Missing values were assumed to be missing at random. Predictor variables were selected using least absolute shrinkage and selection operator regression. We compared the predictive performance of naive extrapolation approaches and Bayesian random and mixed-effects regression models. Leave-one-out cross-validation was used to evaluate model accuracy. Findings The predictive accuracy of the Bayesian mixed-effects models was significantly better than that of the naive extrapolation method for one of the two disease models. However, Bayesian mixed-effects models produced wider prediction intervals for both data sets. Conclusion Several approaches are available for imputing missing data at national level. Strengths of a hierarchical regression approach for this type of task are the ability to derive estimates from other similar countries, transparency, computational efficiency and ease of interpretation. The inclusion of informative covariates may improve model performance, but results should be appraised carefully.

ملخص الغرض وضع أساليب تتميز بالشفافية وقابلية التكرار لاحتساب البيانات المفقودة بشأن الإصابة بالمرض على الصعيد الوطني لعام 2005. الطريقة قمنا بمقارنة نماذج...

Resumen Objetivo Desarrollar métodos transparentes y reproducibles de imputación de datos ausentes sobre la incidencia de la morbilidad a nivel nacional para el año 2005. Métodos Se compararon varios modelos de imputación de las tasas ausentes de incidencia a nivel nacional para dos enfermedades transmitidas por los alimentos, la toxoplasmosis congénita y el carcinoma hepatocelular relacionado con la aflatoxina. Se consideró que los valores ausentes faltaban al azar. Las variables de predicción se seleccionaron por medio de la contracción absoluta mínima y la regresión del operador de la selección. Se comparó el rendimiento predictivo de los enfoques de extrapolación ingenua y los modelos bayesianos de regresión al azar y de efectos mixtos, y se empleó una validación cruzada dejando uno fuera para evaluar la exactitud del modelo. Resultados La exactitud predictiva de los modelos bayesianos de efectos mixtos fue significativamente mejor que la del método de extrapolación ingenua para uno de los dos modelos de enfermedad. Sin embargo, los modelos bayesianos de efectos mixtos generaron intervalos de predicción más amplios para ambos conjuntos de datos. Conclusión Son numerosos los enfoques disponibles para la imputación de datos ausentes a nivel nacional. Los puntos fuertes de un enfoque de regresión jerárquica para este tipo de tareas son la capacidad de obtener estimaciones de otros países similares, la transparencia, la eficiencia informática y la facilidad de interpretación. La inclusión de covariables informativas puede mejorar el rendimiento del modelo, aunque se deben evaluar atentamente los resultados.

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OBJECTIF: Faire une estimation de la charge mondiale de la toxoplasmose congénitale (TC), qui résulte de l'infection des femmes enceintes par le Toxoplasma gondii. MÉTHODES: Les auteurs ont recherché des sources publiées et non publiées dans neuf bases de données principales et sont entré en contact direct avec les auteurs des documents source. Les recherches ont été spécifiques par pays. Pour être incluses, les études devaient décrire l'incidence de la TC sur les résultats positifs aux IgM spécifiques de la toxoplasmose chez les nourrissons et les femmes enceintes (y compris les résultats de séroconversion) ou les résultats positifs aux IgG spécifiques de la toxoplasmose dans la population en général. Différentes techniques de modélisation ont été employées, selon les données disponibles spécifiques par pays, pour estimer l'incidence et la charge de la TC dans chaque pays. Ces données ont été synthétisées en une estimation de l'incidence globale de la TC et de la charge globale de la TC en années de vie corrigées du facteur invalidité (AVCI). RÉSULTATS: L'incidence annuelle globale de la toxoplasmose congénitale a été estimée à 190 100 cas (intervalle de crédibilité, IC de 95%: 179 300-206 300), ce qui équivaut à une charge de 1,20 millions d'AVCI (IC de 95%: 0,76-1,90). Des taux élevés ont été observés en Amérique du Sud et dans certains pays du Moyen-Orient et à faibles revenus. CONCLUSION: La toxoplasmose congénitale représente une charge de morbidité considérable au niveau mondial; elle devrait donc être incluse dans les futures mises à jour de la charge mondiale de morbidité et les données correspondantes devraient être employées pour soutenir les interventions en santé publique visant à réduire la charge de morbidité.

OBJECTIVE: To estimate the global burden of congenital toxoplasmosis (CT), which results from infection of pregnant women with Toxoplasma gondii. METHODS: The authors systematically searched 9 major databases for published and unpublished sources and established direct contact with the authors of source materials. Searches were country-specific. To be included, studies had to report on the incidence of CT, on positivity to Toxoplasma-specific IgM in infants and pregnant women (including seroconversion results) or on positivity to Toxoplasma-specific IgG in the general population. Various modelling techniques were used, depending on the country-specific data available, to estimate the CT incidence and burden in each country. These data were then synthesized into an estimate of the global incidence of CT and of the global burden of CT in disability-adjusted life years (DALYs). FINDINGS: The global annual incidence of congenital toxoplasmosis was estimated to be 190 100 cases (95% credible interval, CI: 179 300-206 300). This was equivalent to a burden of 1.20 million DALYs (95% CI: 0.76-1.90). High burdens were seen in South America and in some Middle Eastern and low-income countries. CONCLUSION: Congenital toxoplasmosis poses a substantial burden of poor health globally. Toxoplasmosis should be included in future updates of the global burden of disease and the corresponding data should be used to support public health interventions to reduce disease burden.

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OBJETIVO: Calcular la carga mundial de la toxoplasmosis congénita (TC) derivada de la infección de mujeres embarazadas con el parásito Toxoplasma gondii. MÉTODOS: Los autores buscaron sistemáticamente en nueve de las principales bases de datos de fuentes publicadas y no publicadas y establecieron contacto directo con los autores del material original. Se realizaron búsquedas específicas para cada país. Para ser incluidos, los estudios debían informar sobre la incidencia de la TC, la positividad de IgM específicos de Toxoplasma en niños y mujeres embarazadas (incluidos los resultados de la seroconversión) o la positividad de IgG específicos de Toxoplasma en la población general. Se utilizaron diferentes técnicas de modelización, dependiendo de los datos específicos disponibles de cada país, con el objetivo de calcular la incidencia y la carga de TC en cada país. A continuación se sintetizarod esos datos en una estimación de la incidencia mundial de la TC y la carga mundial de la TC en los años de vida con discapacidad. RESULTADOS: Se calculó que la incidencia anual de la toxoplasmosis congénita a nivel mundial es de 190 100 casos (un 95% de intervalo de confianza: 179 300-206 300). Esto equivale a una carga de 1,20 millones de años de vida con discapacidad (un 95% de intervalo de confianza: 0,76 - 1,90). En Sudamérica, algunos países de Oriente Medio y en los países de renta baja se observaron cargas elevadas. CONCLUSIÓN: La toxoplasmosis congénita plantea una carga importante de salud deficiente a nivel mundial. La toxoplasmosis debería incluirse en las actualizaciones futuras de la carga mundial de morbilidad y deberán utilizarse los correspondientes datos para apoyar las intervenciones en materia de salud pública destinadas a reducir la carga de morbilidad.