This study aims to explore a possible silent circulation of wild and vaccine-derived polioviruses in departments of Colombia with polio vaccination coverage of below 80%. The study collected 52 samples of wastewater concentrated as a result of precipitation with polyethylene glycol and sodium chloride. The viral detection was carried out through isolation and the identification through neutralization of the cytopathic effect, as well as through a conventional polymerase chain reaction following reverse transcription. The isolated polioviruses were characterized by the VP1 gene sequence. In two of the 52 samples, there was a presence of the Sabin type 2 poliovirus with more than 99% sequence similarity with the Sabin type 2 strain polio. Circulation of the nonpolio enterovirus was detected in 17.3% of the samples. The serotypes identified corresponded to coxsackievirus B1, echovirus 30, and echovirus 11. No evidence of the spread of either vaccine-derived poliovirus or wild poliovirus was detected in the departments of Colombia with polio coverage lower than 80%.

El presente estudio se propuso explorar la posible circulación silente de poliovirus salvajes y derivados de la vacuna (VDPV, por sus siglas en inglés), en departamentos de Colombia con cobertura de vacunación para polio (OPV, por sus siglas en inglés) menor de 80%. Se colectaron 52 muestras de aguas residuales que se concentraron mediante precipitación con polietilenglicol y cloruro de sodio. La detección viral se realizó mediante aislamiento y la identificación por neutralización del efecto citopático, así como mediante reacción en cadena de la polimerasa convencional y en tiempo real, posterior a la transcripción reversa (TR-RCP y rTR-RCP). Los poliovirus aislados se caracterizaron por secuenciación del gen VP1. En dos de las 52 muestras hubo presencia de poliovirus Sabin 2 con más de 99% de similitud de secuencia con la cepa OPV Sabin 2. Se detectó circulación de enterovirus no polio en 17,3% de las muestras. Los serotipos identificados correspondieron a coxsackievirus B1, echovirus 30 y echovirus 11. No se detectaron evidencias de circulación de VDPV ni poliovirus salvaje en los departamentos de Colombia con coberturas de OPV inferiores a 80%.

Objetivos. Identificar las micosis oportunistas que afectan a los pacientes con VIH/sida, y determinar sus características demográficas, socioeconómicas y su relación con el número de células T CD4+. Métodos. Se trata de un estudio descriptivo de serie de casos basado en los participantes de un estudio diseñado para determinar el tipo y la frecuencia de las enfermedades oportunistas en pacientes con VIH/sida. Un caso se definió como un paciente con VIH/sida a quien se le diagnosticó una micosis oportunista, entre octubre de 2007 y mayo de 2010. Los pacientes elegibles estaban siendo tratados en dos instituciones médicas de Bogotá. Se recolectaron muestras respiratorias, de líquido cefalorraquídeo, de sangre y de raspado de lesión orofaríngea, para determinar la presencia de Histoplasma capsulatum, Paracoccidioides brasiliensis, Cryptococcus neoformans o Candida spp. Se utilizaron proporciones para resumir las variables cualitativas y medianas para las cuantitativas. Resultados. En 33 (9,8 %) pacientes con VIH/sida del estudio base (n=336), se diagnosticó una o más de las micosis evaluadas. El 75 % tenía entre 23 y 42 años. La frecuencia de estas infecciones fueron: H. capsulatum (n=1; 3,0 %), P. brasiliensis (n=1; 3,0 %), C. neoformans (n=25; 75,8 %), y Cándida spp. (n=7; 21,2 %). Los valores medianos de células T CD4+ fueron de 176 o menos, independientemente de sus manifestaciones clínicas. Conclusión. Se necesitan estudios adicionales para identificar los factores que podrían estar determinando la presencia de las micosis oportunistas en estos pacientes.

Objectives: To identify the opportunistic fungal infections affecting patients with HIV/AIDS, to determine their demographic and socioeconomic characteristics and the number of CD4+ T cells. Materials and methods: This is a descriptive case series study based on a major study aimed at determining the type and frequency of opportunistic diseases in HIV/AIDS patients. A case was defined as an HIV/AIDS patient who had evidence of fungal infection at baseline. Eligible patients were being treated at two clinical institutions located in Bogotá, Colombia, between October 2007 and May 2010. Respiratory, cerebrospinal fluid and blood samples and scrapping/swabs of oral lesions were collected in order to determine the presence of Histoplasma capsulatum, Paracoccidioides brasiliensis, Cryptococcus neoformans or Candida spp. Proportions were used for qualitative variables and medians for quantitative variables. Results: Overall, 33 (10,2%) patients were diagnosed as having one or more of the evaluated fungal infections , out of 336. Seventy five per cent of them were between the ages of 23 and 42. The frequencies of these fungal infections were: H. capsulatum (n=1; 3.0%), P. brasiliensis (n=1; 3.0%), C. neoformans (n=25; 75.8%), and Candida spp. (n=7; 21.2%). The median values of CD4+ T cells were 176 or less, independently of clinical manifestations. Conclusion: Further studies are required to identify factors contributing to the presence of fungal opportunistic infections in these patients.

Objetivo: Describir las características demográficas, clínicas y epidemiológicas de los pacientes que han fallecido por la nueva gripe pandémica (A H1N1) 2009 en Colombia hasta el 30 de julio de 2009. Materiales y métodos: Éste es un estudio descriptivo. La fuente de información primaria fue el Sistema Nacional de Vigilancia en Salud Pública. Las muestras respiratorias se recolectaron por medio de hisopado faríngeo y se analizaron con pruebas de PCR específicas (rRT-PCR) o secuenciación genética. En algunos casos fatales, se requirieron muestras de tejido pulmonar, traqueal o bronquial para confirmar el diagnóstico. Las variables cualitativas se resumen con proporciones y las cuantitativas, con medias aritméticas. Resultados: Hasta el 30 de julio, se habían presentado 16 muertes confirmadas por laboratorio, en pacientes infectados con el nuevo virus pandémico. De éstas, 9 eran mujeres y 15 estaban hospitalizados. El lugar de residencia más frecuente de los casos fatales era Bogotá y la edad media al fallecimiento era de 28,1 años. La dificultad respiratoria, la fiebre y la tos fueron síntomas presentes en todos los pacientes. Una mujer de 27 años estaba embarazada. Conclusiones: Los hallazgos en los pacientes colombianos fallecidos son similares a lo informado en otros países. Se necesitan nuevos estudios para reconocer los factores que incrementan el riesgo de fallecer por esta enfermedad en nuestro país.

Objective: To describe the demographic, clinical and epidemiologic characteristics of fatal cases in pandemic influenza A(H1N1) patients reported in Colombia by July 30, 2009. Materials and methods: This is a descriptive study. The primary source of information was the National System of Public Health Surveillance(SIVIGILA). Respiratory samples were gathered using throat swabs and analyzed with PCR specific tests (rRT-PCR) or genetic sequencing. In some of the fatal cases, lung, trachea and bronchia tissue samples were required to confirm the diagnosis. Qualitative variables were summarized using ratios and quantitative variables using arithmetic means. Results: By July 30, 16 deaths in patients infected by the new pandemic virus had been confirmed by laboratories. Out of these, nine were women and 15 had been hospitalized. The most frequent domicile among the fatal cases was Bogotá, and the mean age at death was 28.1. Shortness of breath, fever and cough were clinical manifestations present in all of the fatal cases. A 27 years-old woman who died was pregnant. Conclusions: The findings from deceased Colombian patients are similar to those reported in other countries. Further studies are required in order to determine the factors that increase risk of death from this disease in our country.