Abstract Escherichia coli causes colibacillosis in farm animals that act as reservoirs for pathogenic strains. Antimicrobial resistance of E. coli producing Extended Spectrum Beta-lactamases [ESBL] is a serious public health problem that can be attributed to factors related to food consumption and contact with domestic animals. This study aimed to determine the presence and patterns of antimicrobial resistance of ESBL E. coli isolated from fecal samples from dairy cattle in the Pichincha province. A total of 182 bovine feces samples were analyzed, 112 samples from cattle slaughtered at the official slaughterhouse in Quito-Pichincha province, and 70 samples from the collection of the Foodborne Diseases and Antimicrobial Resistance Research Unit [UNIETAR]. The isolation of ESBL E. coli, biochemical identification, and resistance tests using the main antibiotics were carried out at UNIETAR. It was possible to identify 93 positive samples for ESBL E. coli (51%), phenotypic analysis revealed that antibiotics such as amoxicillin plus clavulanic acid, cefepime, ceftazidime, ciprofloxacin, amikacin, tetracycline, presented resistance higher than 80%. Furthermore, low resistance to nitrofurantoin, cefoxitin, and ertapenem was observed, while no isolate was resistant to tigecycline. One hundred percent of the isolates presented multi-resistance phenotypes, with the most frequent pattern being composed of 7 families of antibiotics. In conclusion, these results suggest that E. coli from dairy cattle origin could be an important reservoir of ESBL genes.

Resumen La bacteria Escherichia coli causa la colibacilosis en animales de granja que actúan como reservorios de cepas patógenas. La resistencia antimicrobiana de E. coli productor de betalactamasas de espectro extendido [BLEE] es un grave problema de salud pública y se puede atribuir a factores relacionados con el consumo de alimentos y el contacto con animales domésticos. El objetivo de este estudio fue determinar la presencia y patrones de resistencia antimicrobiana de E. coli BLEE aislado en muestras fecales provenientes de bovinos productores de leche de la provincia de Pichincha. Se analizaron un total 182 muestras de heces de bovinos: 112 muestras de bovinos faenados en el Camal Metropolitano de la provincia de Pichincha y 70 muestras de la colección de la Unidad de Investigación de Enfermedades Transmitidas por Alimentos y Resistencias a los Antimicrobianos [UNIETAR], se realizó el aislamiento de E. coli BLEE, la identificación bioquímica y pruebas de resistencia a los principales antibióticos utilizados. Se logró identificar 93 muestras positivas a E. coli BLEE (51 %), el análisis fenotípico reveló que los antibióticos amoxicilina más ácido clavulánico, cefepime, ceftazidima, ciprofloxacina, amikacina y tetraciclina presentaron porcentajes de resistencia mayores al 80 %. Además, se observó una baja resistencia a la nitrofurantoína, cefoxitin y ertapenem, mientras que ningún aislado fue resistente a la tigeciclina. El 100 % de los aislados presentaron fenotipos de multirresistencia y el patrón más frecuente estuvo compuesto por 7 familias de antibióticos. En conclusión, estos resultados sugieren que E. coli originaria de bovinos lecheros podría ser un reservorio de genes BLEE.

RESUMEN La diarrea epidémica porcina (DEP) es una enfermedad contagiosa producida por el virus del mismo nombre que es clasificado dentro del género Alphacoronavirus, familia Coronaviridae. Este virus produce diarrea, vómitos y pérdida de peso en cerdos de todas las edades, pero en los cerditos neonatos alcanza una morbilidad y mortalidad de hasta el 100%. En Ecuador, fue diagnosticada por primera vez en el 2014 mediante PCR convencional o en punto final. Actualmente existe la necesidad de contar con un ensayo ultrasensible, específico, que permita trabajar un gran número de muestras para facilitar la vigilancia epidemiológica de nuevos brotes y detectar animales portadores. Se desarrolló y evaluó un ensayo de PCR en tiempo real con un colorante intercalador de ADN como el SYBR Green para detectar el virus de la DEP (VDEP) en heces de cerdos, con cebadores que tienen como diana el gen N del virus. En la evaluación de la sensibilidad analítica se utilizó un patrón de ARN del VDEP sintetizado en el laboratorio, determinándose que el límite de detección del ensayo desarrollado fue de 4 copias de ARN del VDEP, comparando con la PCR en punto final que fue 100 veces más sensible, la especificidad del ensayo se basó en la posibilidad de detectar falsos positivos mediante la curva de disociación. Los valores de Ct (valor umbral) en el análisis intra e inter-ensayo mostraron coeficientes de variación válidos. En la evaluación del desempeño diagnóstico, el ensayo detectó 18 muestras positivas de un total de 52 para un 100% de concordancia con el PCR en punto final. Se concluye que el ensayo de PCR en tiempo real con SYBR Green desarrollado es altamente sensible, específico, reproducible y rápido para el diagnóstico del VDEP en homogenados de mucosa intestinal de cerdos.

ABSTRACT Porcine epidemic diarrhea (PED) is a contagious disease caused by its virus, classified within the genus Alphacoronavirus, family Coronaviridae. This virus causes diarrhea, vomiting and weight loss in pigs of all ages, especially in neonatal piglets, with morbidity and mortality of up to 100%. In Ecuador, the disease was diagnosed for the first time in 2014 by conventional or endpoint PCR. Currently, there is a need for an ultrasensitive and specific assay, which allows working a large number of samples to facilitate epidemiological surveillance of new outbreaks and detect carrier animals. A real-time PCR assay intercalating DNA dyes such as SYBR Green was developed and assessed to detect PED virus (PEDv) in swine feces with primers targeting the N-gene of the virus. A PEDv RNA standard synthesized in the laboratory was used in the assessment of the analytical sensitivity. The detection limit of the developed assay was determined to be 4 copies of PEDv RNA, compared to endpoint PCR which was 100 times more sensitive. Assay specificity was based on the possibility of detecting false positives using the melting curve. Cycle threshold (Ct) values in intra- and inter-assay analysis showed valid coefficients of variation. When assessing diagnostic performance, the assay detected 18 positive samples out of a total of 52 for 100 % agreement with the endpoint PCR. It is concluded that the developed SYBR Green-based real-time PCR assay is highly sensitive, specific, reproducible and rapid for the detection of PEDv in swine intestinal mucosa homogenates.

Bovine tuberculosis (BTB) is a chronic and contagious disease that affects domestic animals, wildlife, and humans. Caused by Mycobacterium bovis, BTB causes major economic losses and poses a serious constraint to international livestock trade. Moreover, in developing countries where BTB controls are lacking, M. bovis is a public health concern. In most developing countries, the prevalence of BTB in livestock is unknown because the information is either not reported or not available. In Ecuador, there is no national BTB control program. This article reviews the BTB situation in Ecuador by examining exhaustive data from tuberculin testing surveys and slaughterhouse surveillance studies conducted in 1972-2008 in a variety of the country's geographic areas. In Ecuador, several factors, including the dairy industry's expansion (preempted by the high demand for milk and its by-products), intensified efforts to increase the cattle population, the presence of M. bovis, and a lack of BTB controls, have caused a rise in BTB prevalence, and consequently, a growing push for the implementation of a national BTB control program.

La tuberculosis bovina es una enfermedad contagiosa crónica que afecta a los animales domésticos, los animales salvajes y los seres humanos. Es producida por Mycobacterium bovis; causa grandes pérdidas económicas y plantea una grave limitación para el comercio ganadero internacional. Por otro lado, en los países en desarrollo donde no hay controles de la tuberculosis bovina, la infección por M. bovis representa un problema de salud pública. En la mayoría de los países en desarrollo, la prevalencia de tuberculosis en el ganado se desconoce porque la información no se comunica o no se consigue. En el Ecuador no hay un programa nacional de control de la tuberculosis bovina. En este artículo se revisa la situación de la tuberculosis bovina en el Ecuador, sobre la base de un análisis de los datos exhaustivos obtenidos de encuestas sobre pruebas de tuberculina y de los estudios de vigilancia llevados a cabo en mataderos entre 1972 y 2008 en varias zonas geográficas del país. En el Ecuador varios factores, como el crecimiento de la industria láctea (impulsado por la alta demanda de leche y sus derivados), los intensos esfuerzos para aumentar la población bovina, la presencia de M. bovis y la falta de controles de la tuberculosis bovina, han ocasionado un aumento de la prevalencia de esta y, en consecuencia, representan una motivación creciente para llevar a cabo un programa nacional de control de la tuberculosis bovina.