BACKGROUND The coronaviruses (CoVs) called the attention of the world for causing outbreaks of severe acute respiratory syndrome (SARS-CoV), in Asia in 2002-03, and respiratory disease in the Middle East (MERS-CoV), in 2012. In December 2019, yet again a new coronavirus (SARS-CoV-2) first identified in Wuhan, China, was associated with a severe respiratory infection, known today as COVID-19. This new virus quickly spread throughout China and 30 additional countries. As result, the World Health Organization (WHO) elevated the status of the COVID-19 outbreak from emergency of international concern to pandemic on March 11, 2020. The impact of COVID-19 on public health and economy fueled a worldwide race to approve therapeutic and prophylactic agents, but so far, there are no specific antiviral drugs or vaccines available. In current scenario, the development of in vitro systems for viral mass production and for testing antiviral and vaccine candidates proves to be an urgent matter. OBJECTIVE The objective of this paper is study the biology of SARS-CoV-2 in Vero-E6 cells at the ultrastructural level. METHODS In this study, we documented, by transmission electron microscopy and real-time reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR), the infection of Vero-E6 cells with SARS-CoV-2 samples isolated from Brazilian patients. FINDINGS The infected cells presented cytopathic effects and SARS-CoV-2 particles were observed attached to the cell surface and inside cytoplasmic vesicles. The entry of the virus into cells occurred through the endocytic pathway or by fusion of the viral envelope with the cell membrane. Assembled nucleocapsids were verified inside rough endoplasmic reticulum cisterns (RER). Viral maturation seemed to occur by budding of viral particles from the RER into smooth membrane vesicles. MAIN CONCLUSIONS Therefore, the susceptibility of Vero-E6 cells to SARS-CoV-2 infection and the viral pathway inside the cells were demonstrated by ultrastructural analysis.

Coronavirus disease 2019 (COVID-19) surveillance, in Brazil, initiated shortly after its description, in China. Our aim was to detect severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) and additional pathogens in samples from the initial phase of the outbreak in Brazil, from late February to late March. From 707 samples analysed, 29 (4.1%) were SARS-CoV-2 positive. Fever and cough were their most prevalent symptoms. Co-detection of rhinovirus was observed in 2 (6.9%) cases. Additional pathogens were identified in 66.1% of the SARS-CoV-2 negative cases, mainly rhinovirus and influenza A(H1N1)pdm09. Thus, we emphasise the importance of differential diagnosis in COVID-19 suspected cases.

Resumo Levantamentos fitossociológicos constituem uma ferramenta de suporte à tomada de decisão em projetos de restauração florestal, contribuindo com a manutenção da biodiversidade vegetal e com o aumento da qualidade dos serviços prestados por esses ecossistemas. O presente estudo teve como objetivo realizar o levantamento fitossociológico das formações florestais presentes no Espaço Ecológico Educativo, Pinheiral-RJ e, com base nos resultados, discutir ações necessárias para restauração dos remanescentes. Foram instaladas parcelas retangulares de 20 x10 m, distribuídas arbitrariamente nas florestas de encosta e aluvial, totalizando 0,3 ha de área amostral e cerca de 5,0 % da área florestal. Todos os indivíduos com Diâmetro a Altura do Peito (DAP) > 5,0 cm foram registrados. A floresta aluvial apresentou 27 espécies e densidade de 1.600 ind./ha, enquanto na de encosta foram 37 espécies e densidade de 1.393 ind./ha. O índice de Shannon foi 2,98 e a equabilidade foi 0,56 para floresta de encosta e, respectivamente 2,59 e 0,48, para floresta aluvial. A composição florística variou significativamente entre as duas formações florestais analisadas, as quais apresentaram baixos valores de riqueza e diversidade de espécies, demonstrando a necessidade de enriquecimento com espécies florestais, na tentativa de restabelecer os valores de biodiversidade encontrados em ecossistemas florestais de referência.

Abstract Phytosociological surveys may consist as decision-making supports for implementation of projects aimed at maintaining the biodiversity or increasing the quality of services provided by the ecosystems. The present study was an immediate making the phytosociological survey of forest formation present at ‘Espaço Ecológico Educativo’, Pinheiral - RJ state, and based on the results, discuss actions needed to restore the remaining. Rectangular plots of 20 x 10 m were installed and distributed randomly in the slopes and alluvial forests, totaling 0.3 ha of the sampling area, about 5.0 % of the forest. All the individuals with Diameter at Breast Height (DBH)> 5.0 cm were recorded. The alluvial forests showed 27 species and density of 1600 ind./ha while in the slope were 37 species and the density of 1393 ind./ha. The Shannon index was 2.98 and the evenness was 0.56 for the forest in the slope and for alluvial forest the diversity was 2.59 and the evenness was 0.48. The floristic composition varied significantly between the forest types. The forest formations present in the area had low richness and diversity of species, demonstrating the need for enrichment in an attempt to restore the biodiversity values found in the reference forest ecosystems.

A Clidemia urceolata DC. é uma espécie pioneira da família Melastomataceae, que coloniza espontaneamente pastagens abandonadas. Ela forma núcleos de tamanhos variados, onde podem ser observadas outras espécies de grupo sucessional mais avançado, podendo constituir uma espécie facilitadora. O presente estudo objetivou quantificar e caracterizar os núcleos na bacia hidrográfica do rio Barra Mansa - RJ (6.839 ha) (22o32'40'' 22º 40'60''S e 44o12' 44º06'20''W), tributário do rio Paraíba do Sul. Eles foram georreferenciados e caracterizados quanto ao porte dos indivíduos de Clidemia urceolata (baixo: H ≤ 0,60 m; médio: 0,60 < H < 1,20 m; e alto: H ≥ 1,20 m), adensamento (esparso, médio e adensado), área do núcleo (pequeno: ≤ 500 m2; médio: 500 a 2000 m2; e grande: ≥ 2000 m2) e estágio de desenvolvimento (inicial, intermediário e avançado). Foram identificados 26 núcleos, totalizando 7,9 ha. Desses, houve predomínio de núcleos com indivíduos de porte médio (76,92%), pouco adensado (42,31%), tamanho grande (42,31%) e estágio intermediário de desenvolvimento (46,16%), evidenciando que se encontram em formação, e que a estratégia de colonização, reprodução e dispersão da Clidemia urceolata pode contribuir para dinamizar a sucessão ecológica, podendo atuar como agente espontâneo de restauração florestal das áreas perturbadas.

Clidemia urceolata DC. is a pioneer species of the family Melastomataceae which colonizes spontaneously abandoned pastures. It forms nuclei of different sizes, where other species of advanced successional groups can be observed, constituting a facilitative species. The present study aimed to quantify and characterize the nuclei in the watershed of Barra Mansa river, Rio de Janeiro state (6.839 ha) (22o 32'40'' 22º 40'60''S e 44o 12' 44º 06'20''W), which is a tributary of Paraíba do Sul river. They were geographically referenced and characterized regarding to the size of Clidemia urceolata individuals (low: H <0,60 m; medium: 0,60 <H <1,20 m; and high: H ≥ 1,20m), densification (scattered, medium and dense), area of the nuclei (small: ≤ 500 m2; medium: 500 to 2000 m2; and large: ≥ 2000 m2) and development stage (initial, intermediate and advanced). 26 nuclei were identified, adding up to 7,9 ha. There was the prevalence of nuclei with medium sized individuals (76,92%), slightly dense (42,31%), big area (42,31%) and intermediate developmental stage (46,16%), evidencing that they are in progress and that colonization strategy, reproduction and dispersion of Clidemia urceolata can contribute to boost the ecological succession, being able to act as a spontaneous agent of forest restoration of the disturbed areas.

A serrapilheira, em restauração florestal espontânea, pode influir no balanço hídrico e em seus processos ecológicos. Neste estudo, foi avaliado o estoque de serrapilheira acumulada e sua retenção hídrica ex situ, pelo método de Blow, em locais similares em quatro níveis de restauração florestal espontânea, desenvolvidos a partir da espécie espontânea Clidemia urceolata DC., nos seguintes ambientes: pastagem abandonada (S1); capoeira (S2); capoeirão (S3), e fragmento florestal (S4). O amostrador (0,25 × 0,25 × 0,05 m) foi disposto aleatoriamente em 12 amostras por tratamento, durante o período de estiagem. O maior estoque de serrapilheira acumulada foi observado em S4 (5,15 Mg.ha-1) e a maior retenção hídrica, em S2 (343,87%) e S3 (339,94%), evidenciando que biomassa e diversidade de espécies condicionam a produção, porém não afetam as respostas hídricas da serrapilheira, cujas maiores retenções estão vinculadas à presença de material decíduo da espécie facilitadora nas fases pouco evoluídas e as menores retenções, nas fases mais evoluídas (30 anos de restauração), aumentando a umidade do solo.

Litter on spontaneous forest restoration can influence water balance and its ecological processes. In this study, we evaluated the stock of accumulated litter and its ex situ water retention by the Blow method in similar locations, at 4 levels of forest restoration spontaneously developed from the species Clidemia urceolata DC. in the following environments: abandoned pasture (S1), farmyard (S2), brushwood (S3), and forest fragment (S4). A sampler (0.25 × 0.25 × 0.05 m) was randomly prepared in 12 samples per treatment during the dry period. The largest stock of accumulated litter was observed in S4 (5.15 Mg ha-1) and the greatest water retention levels were found in S2 (343.87%) and S3 (339,94%), demonstrating that biomass and species diversity influence production but do not affect the responses of litter water, whose greater retention levels are related to the presence of deciduous material from facilitative species in the poorly evolved phases and to lower retention levels in the more advanced stages (30 years of restoration), increasing soil moisture contents.

RESUMO Em sementes de espécies florestais, geralmente ocorre grande variação no desempenho germinativo em relação aos substratos em laboratório, sendo necessário determinar o tipo de substrato que proporciona a melhor germinação para cada espécie florestal. Este estudo objetivou avaliar o comportamento de germinação (porcentagem de germinação e índice de velocidade de germinação - IVG) das sementes da leguminosa florestal Anadenanthera peregrina (L.) Speg. (Fabaceae - Mimosoideae), submetidas a diferentes substratos (areia, papel filtro e vermiculita). Os substratos que demonstraram maiores valores de IVG foram vermiculita e papel filtro, sendo que a vermiculita também propiciou maior porcentagem de germinação, indicando que esse substrato é o mais adequado para testes de germinação de sementes de A. peregrina. florestais laboratório L. L (L. Speg Fabaceae Mimosoideae, Mimosoideae , Mimosoideae) areia, areia (areia vermiculita. . vermiculita) A (L

ABSTRACT In seeds of forest species, usually there is a great variation in the seed germination performance in relation to the substrate in laboratory, so it is necessary to determine the type of substrate which allows a better germination for each forest species. This study aimed at evaluating the behavior of seed germination (percentage of germination and index of germination speed - IVG) of the legume forest species Anadenanthera peregrina (L.) Speg. (Fabaceae - Mimosoideae), submitted to different substrates (sand, filter paper and vermiculite). The substrates that demonstrated higher values of IVG were vermiculite and filter paper, and vermiculite also allowed higher percentage of germination, indicating that this substrate is the most adequate for germination tests of seeds of A. peregrina. laboratory L. L (L. Speg Fabaceae Mimosoideae, Mimosoideae , Mimosoideae) sand, sand (sand vermiculite. . vermiculite) A (L

As identificações de hábitats preferenciais de espécies que colonizam espontaneamente ambientes perturbados podem constituir elementos de aperfeiçoamento de técnicas de restauração ecológica. Nesse contexto, a Clidemia urceolata DC destaca-se por colonizar esses ambientes e apresentar ampla distribuição na bacia do rio Paraíba do Sul. Este estudo objetivou avaliar as preferências ecológicas de C. urceolata na bacia hidrográfica do rio Barra Mansa, RJ (22º 32'40" 22º 40'60"S e 44º 12' 44º 06'20"W). Os núcleos da espécie foram demarcados e classificados segundo os seguintes fatores ambientais: feição do terreno, posição relativa na topossequência, face de exposição, declividade e altitude. Foram amostrados 26 núcleos, totalizando 0,005 ha em 6.839 ha da área total. A distribuição da espécie foi mais frequente nos seguintes ambientes: a) terços médio e inferior da topossequência; b) feição côncava do terreno; c) face de exposições sudeste, sul e sudoeste; d) declividade de 8 a 45%; e) altitude entre 432 e 525 m, sendo os últimos quatros fatores mais determinantes. A conjunção de todas essas informações espacializadas na bacia do rio Barra Mansa indica que 30% da área apresenta condições mais favoráveis para o estabelecimento da C. urceolata, o que pode demonstrar um potencial de restauração ambiental.

The identification of preferential habitats of species which spontaneously colonize disturbed areas can constitute elements to improve ecological restoration techniques. Therefore, Clidemia urceolata DC stands out for colonizing those environments and presenting wide distribution in the watershed of Paraíba do Sul River. The objective of this study was to evaluate ecological preferences of C. urceolata in the watershed of Barra Mansa River, RJ (22º 32'40" 22º 40'60"S and 44º 12' 44º 06'20"W). The species nuclei were delimited and classified according to the following environmental factors: terrain feature, relative position on toposequence, exposition face, slope and altitude. It was sampled 26 nuclei, totalizing 0.005 ha from 6.839 ha of total area. Species distribution was more frequent on the following conditions: a) medium and inferior thirds of the toposequence. b) concave face of the terrains. c) southeastern, southern and southwestern exposure faces. d) slope between 8 and 45%. e) altitudes between 432 and 525 m, being the four last factors the most determinant. The conjunction of this information ploted for the watershed of Barra Mansa River indicate that 30% of area present more favorable conditions for the establishment of C. urceolata, what can demonstrate an environmental restoration potential.

A compreensão da dinâmica da matéria orgânica (MO) nos ecossistemas de Mata Atlântica é necessária para o manejo eficiente e conservação de vegetações nativas. A natureza química das substâncias húmicas (SHs) reflete os processos de gênese e uso do solo e pode ser usada como indicador da qualidade da MO. O objetivo deste estudo foi usar a qualidade da MO como sinalizador do ambiente edáfico em áreas de mata nativa, sobre Gleissolo Háplico Tb distrófico, argissólico e Cambissolo Háplico Tb distrófico, e em plantios abandonados de eucalipto de diferentes idades, sobre Argissolo Vermelho-Amarelo distrófico latossólico, localizados na Reserva Biológica União, RJ. Para isso, foram avaliadas as distribuições da MO humificada e os ácidos húmicos do solo por meio de métodos químicos e espectroscópicos, em duas profundidades do solo (0-0,10 e 0,10-0,20 m). Os solos da Reserva Biológica apresentaram fertilidade natural muito baixa, condição esta limitante para o processo de humificação. As SHs representaram, portanto, menos de 50 % do carbono prontamente oxidável, indicando que as substâncias não-húmicas compõem a maior parte da MO; portanto, a serrapilheira tem o papel central na nutrição das plantas e microrganismos. A distribuição relativa das frações que compõem a MO humificada não foi alterada pela cobertura vegetal nem pela classe de solo. Os ácidos húmicos apresentaram natureza química semelhante à normalmente encontrada para os ácidos fúlvicos, e tais características foram expressas no baixo conteúdo de C e nos elevados valores das razões H/C e O/C e da acidez, o que levou à formação de material humificado pouco condensado.A espectroscopia de infravermelho indicou o efeito do tipo de solo e da cobertura vegetal sobre a qualidade química dos ácidos húmicos. O material humificado isolado da Mata Atlântica apresentou maior intensidade de fluorescência, sugerindo maior labilidade e capacidade de ceder elétrons para reações químicas do solo.

The organic matter dynamics in Atlantic forest ecosystems must be understood to ensure the efficiency of conservation programs. Chemical characteristics of humic substances are important because they reflect the soil genesis processes and soil management, and can be used as indicator of the organic matter quality. The purpose of this study was to test the organic matter quality as a marker of the soil environment in areas of native Atlantic forest developed on a distrophyc Gleysol and a distrophyc Cambisol and in abandoned plantations of eucalyptus of different ages, at the União Biological Reserve, RJ, Brazil. The distribution of the humified fractions of the soil organic matter and humic acids were evaluated by chemical and spectroscopic methods, in two soil layers (0-0.10 and 0.10-0.20 m). Soil fertility of the Biological Reserve was very low, representing a limiting factor for the humification process. Humic substances represented less than 50 % of the oxidized carbon, indicating that most of the organic matter consists of non-humic substances. Consequently, forest litterfall plays a central role in the plant/microorganism nutrition. The relative distribution of the humic fraction was not altered by the plant cover or soil class. The chemical nature of the humic acids was similar to fulvic acids. These characteristics were expressed by a low carbon content, high H/C and O/C ratios and high acidity values which resulted in humified material with low chemical evolution. Infrared spectroscopy indicated the effect of the soil class and plant cover on the chemical quality of the humic acids. The fluorescence intensity of humified material isolated from the Atlantic forest area was high, suggesting higher lability and capacity to release electrons for chemical reactions in the soil.

Resumo Numa área de capoeira em regeneração em Paraty-RJ, foram introduzidas quatro espécies arbóreas fixadoras de N2 (Acacia holosericea, Mimosa caesalpiniifolia, Anadenanthera macrocarpa e Enterolobium contortisiliquum) e duas não fixadoras (Schinus terebinthifolius e Eucalyptus grandis). As espécies fixadoras foram inoculadas com rizóbio e fungos micorrízicos arbusculares (FMAs) enquanto que as não fixadoras apenas com FMAs. Além disso, metade das mudas foi inoculada com bactérias solubilizadoras de fosfato. As bactérias solubilizadoras não beneficiaram o crescimento e nutrição das plantas após o transplante para o campo. M. caesalpiniifolia e E. contortisiliquum apresentaram melhor performance sendo mais recomendadas para enriquecimento de capoeiras em regeneração. ParatyRJ, ParatyRJ Paraty RJ, RJ Paraty-RJ N Acacia holosericea Schinus grandis. grandis . grandis) FMAs (FMAs disso fosfato campo M E

Abstract In a regenerating forest in Paraty-RJ, four N2-fixing tree species (Acacia holosericea, Mimosa caesalpiniifolia, Anadenanthera macrocarpa and Enterolobium contortisiliquum) and two Non-N2- fixing (Schinus terebinthifolius and Eucalyptus grandis) were transplanted. N2-fixing tree species were inoculated with rhizobia and arbuscular mycorrhizal fungi (AMF) while Non-N2-fixing tree species only with AMF. Otherwise, half of the plants were inoculated with P-solubilizing bacteria. P-solubilizing bacteria did not increase the growth and plant nutrition after field transplantation. M. caesalpiniifolia and E. contortisiliquum showed better performance being the most recommended species for enrichment of regenerating forest. ParatyRJ, ParatyRJ Paraty RJ, RJ Paraty-RJ N2fixing Nfixing N2 N Acacia holosericea NonN2 NonN Non Non-N2 Schinus grandis transplanted AMF (AMF NonN2fixing NonNfixing Otherwise Psolubilizing P solubilizing transplantation M E Non-N