Objetivou-se obter os índices de diversidade genética para o SNP (single nucleotide polymorphism) do íntron 4 do gene da osteopontina (OPN) para 434 animais (87 touros e 347 vacas) participantes do Teste de Progênie da raça girolando no Brasil. Para a amplificação, foram utilizados primers descritos para a raça holandesa, e a diferenciação dos alelos C/T desse SNP foi obtida por meio da técnica de PCR-RFLP. As frequências genotípicas TT (52,53%), CT (38,71%) e CC (8,76%) e as frequências alélicas de T (71,9%) e C (28,1%) indicam que a população encontra-se em Equilíbrio de Hardy-Weinberg (EHW). Apesar de o loco do gene OPN estar em EHW, a frequência superior do alelo T do SNP nesses animais pode sugerir uma tendência de fixação do alelo T na raça. Não foi observada diferenciação entre o grupo de touros e vacas (F ST = -0,018), corroborando a estimativa de equilíbrio da população. Considerando os valores estimados pelo F IS (0,043), é possível que ocorram altos números de indivíduos homozigotos para o alelo T observados na população, em virtude da provável herança desse alelo vindo da raça zebuína, e não a endogamia. Assim, para melhor caracterização do polimorfismo do gene OPN, devem ser realizadas avaliações em maior número de animais, uma vez que só foram avaliados animais participantes do teste de progênie.

The objective was to obtain the indices of genetic diversity for the SNP (single nucleotide polymorphism) of the 4 intron osteopontin gene (OPN) for 434 animals (87 bulls and 347 cows) participants in the Teste de Progênie da raça girolando (Girolando Progeny Test) in Brazil. For amplification, primers used were described for the Holstein breed, and differentiation of alleles C/T SNP that was obtained by PCR-RFLP. Genotype frequencies of TT (52.53%), CT (38.71%) and CC (8.76%) and allele frequencies of T (71.9%) and C (28.1%) indicate that the population is in Hardy-Weinberg principle (HWP). Although the OPN gene locus is in HWP, the higher frequency of allele T of SNP in these animals may suggest a setting-trend of allele T in the race. No difference was observed between the group of bulls and cows (F ST = -0.018), supporting the estimate of population balance. Considering the values estimated by the F IS (0.043), it is likely that high numbers of individuals homozygous for the T allele observed in the population occur because of possible inheritance of this allele coming from the zebu breed, rather than inbreeding. Thus, to better characterize the OPN gene polymorphism, assessments in a larger number of animals must be performed, since only animals that participated in the Progeny Test were assessed.

O objetivo deste trabalho foi isolar e caracterizar bactérias ruminais tolerantes a taninos obtidas de vacas mestiças Holandês x Zebu alimentadas com dieta composta por capim-elefante (Pennisetum purpureum) picado com ramos novos de angico-vermelho (Parapiptadenia rigida) e folhas de bananeira (Musa sp.). Um total de 117 cepas bacterianas foram isoladas a partir de cultivos de enriquecimento da microbiota ruminal em meio contendo extrato de taninos. Destas, 11 foram capazes de tolerar até 3 g L-1 de taninos. Procedimentos clássicos de caracterização indicaram que diferentes grupos, morfológicos e fisiológicos, estavam representados. Perfis dos fragmentos de restrição com Alu1 e Taq1 dos produtos de PCR de 1.450 bp do gene 16S rRNA agruparam os 11 isolados nos tipos I a VI. O sequenciamento dos produtos PCR 16S rRNA foi utilizado para identificação. Das 11 estirpes estudadas, sete não foram identificáveis pelos métodos utilizados neste trabalho, duas eram estirpes de Butyrivibrio fibrisolvens e duas de Streptococcus bovis.

The objective of this work was to isolate and characterize tannin-tolerant ruminal bacteria from crossbred Holstein x Zebu cows fed a chopped mixture of elephant grass (Pennisetum purpureum), young stems of "angico-vermelho" (Parapiptadenia rigida), and banana tree (Musa sp.) leaves. A total of 117 bacteria strains were isolated from enrichment cultures of rumen microflora in medium containing tannin extracts. Of these, 11 isolates were able to tolerate up to 3 g L-1 of tannins. Classical characterization procedures indicated that different morphological and physiological groups were represented. Restriction fragments profiles using Alu1 and Taq1 of 1,450 bp PCR products from the 16S rRNA gene grouped the 11 isolates into types I to VI. Sequencing of 16S rRNA PCR products was used for identification. From the 11 strains studied, seven were not identifiable by the methods used in this work, two were strains of Butyrivibrio fibrisolvens, and two of Streptococcus bovis.

O objetivo neste trabalho foi identificar genes candidatos relacionados à ovulação em suínos. Para tanto, investigou-se a expressão diferencial dos genes STAR (steroidogenic acute regulator), GATA (GATA-binding protein 4), PGF2α (prostaglandin F2α), P4R (progesterone receptor), FSHR (follicle-stimulating hormone receptor) e CYP19 (cytochrome P450 aromatase) em células foliculares ovarianas por meio de reação em cadeia da polimerase em tempo real (qRT-PCR) quantitativo em tempo real. Esses genes codificam para receptores hormonais (FSHR e P4R) hormônio (PGF2α), proteínas esteroidogênicas (STAR e CYP19) e fator de transcrição (GATA). As células foliculares foram coletadas durante a fase folicular do ciclo estral de porcas com alto e baixo número de leitões/leitegada. Houve diferença na abundância de transcritos entre porcas com alta e baixa prolificidade para os genes STAR, GATA, PGF2α, P4R and CYP19. Para o gene do FSHR, a alteração na abundância dos transcritos não foi significativamente diferente. Considerando que foi analisado somente o nível de transcrição desses genes mencionados, não se pode fazer inferências com relação à tradução ou atividade proteica. Portanto, ensaios de sequenciamento gênico e outras análises funcionais serão necessários para complementar esses achados e possibilitar melhor entendimento da complexidade biológica desses genes e seu uso como marcadores para prolificidade em suínos.

The main purpose of the present study was to identify for candidate genes related to ovulation in swines. To do so, it was investigated in ovarian follicular cells through quantitative real-time PCR the differential expression of the following genes: steroidogenic acute regulator (STAR), GATA-binding protein 4 (GATA), prostaglandin F2α (PGF2α), progesterone receptor (P4R), follicle-stimulating hormone receptor (FSHR), and cytochrome P450 aromatase (CYP19). These genes encode hormone receptors (FSHR and P4R), hormone (PGF2α), steroidogenic proteins (STAR and CYP19) and transcription factor (GATA). Folicular cells were collected from sows with high and low number of piglets/litters during the follicular phase of the estrus cycle. There was difference in transcript abundance among low and high prolific sows for the STAR, GATA, PGF2α, P4R and CYP19 genes. For the FSHR gene, the fold change was not considered to be significantly different. Because in the present study only the transcript level of the above mentioned genes was analyzed, no inference can be made regarded to protein translation or activity. Therefore, gene sequence trials and other functional studies will be necessary to complement the present results, allowing a better understanding on biological complexity of these genes and their use as markers for prolificity in swines.

A presença crescente de produtos derivados de plantas geneticamente modificadas (GM) na dieta humana e de animais tem levado ao desenvolvimento de métodos de detecção capazes de distinguir entre alimentos derivados da biotecnologia e alimentos convencionais. As técnicas de PCR convencional e em tempo real têm sido as mais utilizadas para detectar e quantificar resíduos GM em alimentos altamente processados, respectivamente. A extração de DNA é um passo crítico durante o processo de análise. Alguns fatores, tais como, degradação de DNA, efeito de matriz e a presença de inibidores da PCR, implicam que um limite de detecção ou quantificação estabelecido para um determinado método é restrito à matriz usada durante validação e não pode ser estendido a qualquer outra matriz fora do escopo do método. No Brasil, amostras de salsicha constituíram a principal classe de produtos, nas quais resíduos de soja Roundup Ready® (RR) foram detectados. Então a validação de metodologias para detecção e quantificação destes resíduos é urgente. Amostras de salsicha foram submetidas a dois diferentes métodos de extração de DNA: Wizard modificado e CTAB. O rendimento e a qualidade foram comparados em ambos os métodos. As amostras foram analisadas por PCR convencional e em tempo real para detecção e quantificação de resíduos de soja RR. Pelo menos 200 ng de DNA total da amostra de salsicha foram necessários para garantir uma quantificação confiável. Reações contendo concentrações de DNA abaixo deste limite apresentaram grande variação nos valores de porcentagem de GM esperados. Na PCR convencional, o limite de detecção variou de 1,0 a 500 ng, dependendo do conteúdo de soja GM na amostra. A precisão, performance e linearidade foram relativamente altas, indicando que o método de análise foi satisfatório.

The increasing presence of products derived from genetically modified (GM) plants in human and animal diets has led to the development of detection methods to distinguish biotechnology-derived foods from conventional ones. The conventional and real-time PCR have been used, respectively, to detect and quantify GM residues in highly processed foods. DNA extraction is a critical step during the analysis process. Some factors such as DNA degradation, matrix effects, and the presence of PCR inhibitors imply that a detection or quantification limit, established for a given method, is restricted to a matrix used during validation and cannot be projected to any other matrix outside the scope of the method. In Brazil, sausage samples were the main class of processed products in which Roundup Ready® (RR) soybean residues were detected. Thus, the validation of methodologies for the detection and quantification of those residues is absolutely necessary. Sausage samples were submitted to two different methods of DNA extraction: modified Wizard and the CTAB method. The yield and quality were compared for both methods. DNA samples were analyzed by conventional and real-time PCR for the detection and quantification of Roundup Ready® soybean in the samples. At least 200 ng of total sausage DNA was necessary for a reliable quantification. Reactions containing DNA amounts below this value led to large variations on the expected GM percentage value. In conventional PCR, the detection limit varied from 1.0 to 500 ng, depending on the GM soybean content in the sample. The precision, performance, and linearity were relatively high indicating that the method used for analysis was satisfactory.

O objetivo deste trabalho foi avaliar a associação dos polimorfismos dos genes bGH, IGF-1 e PIT-1 com características de peso e ganho de peso numa população F2 de bovinos (Gir x Holandês), pela técnica de PCR-RFLP. As freqüências alélicas A e B, do gene PIT-1, e dos genótipos AA, AB e BB, nas populações parentais foram semelhantes entre si, mas diferentes das freqüências nas populações cruzadas F1 e F2, para esse gene. Quanto ao gene bGH, os animais da raça Holandesa apresentaram freqüência de 100% para o alelo E e os animais da raça Gir, 92% para o alelo F, resultando em alta freqüência de indivíduos heterozigotos nas populações F1 e F2. Quanto ao gene IGF-1, todos os animais da raça Holandesa eram heterozigotos (AB) e, nos animais Gir, a maioria dos indivíduos foi de homozigotos (AA), o que resultou em alta freqüência do alelo A nas populações F1 e F2. Foram encontradas associações significativas do alelo A do gene PIT-1 com as características de peso aos 60, 205, 365 dias e ganho de peso do nascimento aos 60 dias. Em bGH, observou-se efeito significativo do alelo E para peso aos 365 dias e ganho de peso do nascimento aos 60 dias, enquanto o efeito do alelo A do IGF-1 foi significativo somente para peso ao nascimento. Os alelos identificados podem ser usados como marcadores no melhoramento animal.

The objective of this work was to evaluate the association between polymorphisms of bGH, IGF-1 and PIT-1 genes with weight and weight gain traits in a bovine F2 population derived from Holstein x Gyr crosses, using the PCR-RFLP technique. Allelic frequencies A and B of PIT-1 gene and AA, AB, and BB genotypes were similar between parental populations but different from F1 and F2 crossed populations. For the bGH gene, Holstein animals showed allelic frequency of 100% for E allele, while Gyr animals showed allelic frequency of 92% for F allele, resulting in high frequency of heterozygous animals in F1 and F2 populations. For the IGF-1 gene, all Holstein were heterozygous (AB) and most Gyr were homozygous (AA), resulting in a high frequency of A allele in F1 and F2 populations. Significant associations were found between PIT-1 allele A with traits weight at 60, 205 and 365 days and weight gain from birth to 60 days. For IGF-1, significant association was found between A allele and birth weight. For bGH gene, significant associations were found between E allele and 365 days weight and weight gain from birth to 60 days. The selected alleles could be used as markers in animal breeding for these traits.

The effect of the bovine major histocompatibility complex (BoLA) locus on animal health may be due to a direct action of its alleles on immune functions, whereas its indirect effect on production traits might be explained by the better general health conditions of more productive animals. In the present study, the BoLA-DRB3 gene was investigated in 1058 cows belonging to seven Brazilian Gyr Dairy herds (Bos indicus, Zebu cattle). A total of 37 alleles were identified, 15 of them described for the first time in a Zebu breed. A highly significant association (p < 0.02) was observed between allele *54 and a decrease (-26.1 kg) in milk protein yield and there was a significant association (p < 0.05) between this allele and lower (-26.07 kg) milk fat yield. There was also a significant association (p < 0.05) between allele *6 and decreased (-12.47 kg) milk protein and allele *7 and increased (12.72 kg) milk protein. There were also indications of association (p < 0.10) between somatic cell score (SCS) and alleles *3 (SCS increased by 0.54 units) and *31 (SCS increased by 0.46 units). The highly significant association of allele *54 with lower protein yield suggests the possible use of this allele in marker-assisted selection programs.

We studied the phenotypic effects of polymorphisms at the MYF5 gene in a divergent F2 swine population and found that one polymorphism was due to an insertion and another to a deletion. The genotypes of 359 F2 animals were obtained and the Normal/Normal (NN) and Normal/Insertion (NI) genotypes analyzed to determine associations with phenotypic data for performance, carcass and meat quality traits. Significant differences were observed (p < 0.05) between NN and NI animals for drip (NN = 3.14 ± 1.56; NI = 3.69 ± 2.78%), cooking (NN = 32.26 ± 2.41; NI = 33.21 ± 2.31%) and total loss (NN = 34.16 ± 2.63 and NI = 34.97 ± 2.08%). The Deletion marker was not statistically tested. The results indicate that the allelic variant Insertion is associated with a deleterious effect on meat quality traits and should be monitored in marker assisted selection programs.