ABSTRACT Phytophthora infestans is the most important disease in potato crops. Its control is based on the use of chemical products that have developed pathogen resistance and high economic and environmental impacts. To reduce these effects, the use of plant varieties or cultivars resistant to this pathogen has been proposed. The aim of this study was to evaluate the heritability of resistance to this pathogen in a population of elite Solanum phureja genotypes. In this study, 1,355 clones with three replicates from 20 families were included in the evaluation. Heritability was assessed in the broad and narrow senses. Results of the relative area under the disease progress curve varied between 0.08 and 0.64, indicating that the population contains genes that code for resistance. Heritability in both directions (narrow 0.022 and broad 0.255) showed significant differences, indicating an influence of dominance genetic effects and environmental effects. Thus, to use these genotypes in potato breeding programs, hybridization methods should be used instead of selection methods.

ABSTRACT This work was carried out in Antioquia, Colombia, in a collection of the Furcraea and Agave genera, important in the country for manufacturing strings, sacks, geotextiles, and handicrafts Currently, to enhance its use, applications have been developed in textiles, biodegradable materials and thermo-acoustic insulation, among others. The aim of this study was to characterize phenotypically and agronomically 94 accessions. The variables were weighted according to the degree of discrimination; a dissimilarity dendrogram was constructed using UPGMA based on Gower's distance, and the cophenetic correlation coefficient was determined. Six groups were identified; on the one hand, the accessions of the Agave genus formed groups A and B, with and without spines, respectively, showing the highest elongation values. On the other hand, the Furcraea accessions formed groups C to F, with the highest average values of fiber per plant, allowing a first approach to identify promising clones for their use per se or utilized in plant breeding programs. This study represents an approach to knowing the morphological and agronomic variability of the collection and highlights the importance of maintaining the germplasm bank for ex situ conservation.

RESUMEN Este artículo presenta una comparación de los métodos estadísticos habituales que se utilizan para la evaluación de modelos de cultivos. Se realizó un estudio de caso utilizando un conjunto de datos observados del peso seco total en un cultivo de papa diploide y seis conjuntos de datos simulados destinados a predecir las observaciones. Los parámetros estadísticos evaluados fueron el coeficiente de determinación, la raíz cuadrada del cuadrado medio del error, la raíz cuadrada del cuadrado medio del error relativo, el error medio, el índice de concordancia, el índice de concordancia modificado, el índice de concordancia revisado, el índice de eficiencia y el índice de eficiencia revisado. Los resultados mostraron que el coeficiente de determinación no es un índice estadístico útil para la evaluación de modelos de cultivo. La raíz cuadrada del cuadrado medio del error junto a la raíz cuadrada del cuadrado medio del error relativo, ofrecen una excelente idea de cuánto están desviadas las simulaciones en la misma unidad de medida de la variable y en términos porcentuales. La raíz cuadrada del cuadrado medio del error y la raíz cuadrada del cuadrado medio del error relativo no dejan dudas al evaluar la calidad de las simulaciones de un modelo respecto a las observaciones

ABSTRACT This study presents a comparison of the usual statistical methods used for crop model assessment. A case study was conducted using a data set from observations of the total dry weight in diploid potato crop, and six simulated data sets derived from the observations aimed to predict the measured data. Statistical indices such as the coefficient of determination, the root mean squared error, the relative root mean squared error, mean error, index of agreement, modified index of agreement, revised index of agreement, modeling efficiency, and revised modeling efficiency were compared. The results showed that the coefficient of determination is not a useful statistical index for model evaluation. The root mean squared error together with the relative root mean squared error offer an excellent notion of how deviated the simulations are in the same unit of the variable and percentage terms, and they leave no doubt when evaluating the quality of the simulations of a model.

RESUMEN El análisis del crecimiento de las plantas se ha utilizado ampliamente para estudiar los factores que influyen en el crecimiento. Este análisis comprende un conjunto de métodos cuantitativos que describen y analizan el crecimiento de plantas enteras y sus órganos. Utiliza datos de medidas directas (peso, área, volumen), lo que permite cuantificar y analizar el crecimiento, utilizando índices basados en modelos definidos por funciones matemáticas. Este estudio tuvo como objetivo realizar un análisis de crecimiento funcional de cultivares de papa diploides en Colombia. Se llevó a cabo un análisis funcional de crecimiento en tres variedades de papa diploides durante tres ciclos consecutivos en Medellín, Colombia. Se utilizó un diseño de bloques al azar, con dos niveles de fertilización y cinco repeticiones. El primer factor correspondió a las tres variedades de papa diploide y el segundo factor a dos niveles de fertilización: 260 y 778 kg de fertilizante por hectárea. Se tomaron muestras semanalmente y cada muestra correspondió a una planta completa por unidad experimental. Se midió el peso seco de cada órgano y área foliar que luego, se usaron para calcular la tasa relativa de crecimiento, la relación del área foliar, la tasa de asimilación neta y el área foliar específica. El tiempo de desarrollo se evaluó en grados día acumulados con temperaturas umbrales de 2 y 29°C. Las tres variedades registraron su mayor tasa de asimilación neta a los 1.252 grados día acumulados (GDA), con valores de 0.0002565, 0.0002021 y 0.0001778 g cm-2 GDA-1 para ‘Latina’, ‘Guaneña’ y ‘Colombia’, respectivamente. La variedad Latina se destacó en varias características fisiológicas, y además fue la variedad de desarrollo más rápido. ‘Latina’ también fue la que tuvo la mayor masa seca total acumulada en el ciclo (271.05 g) y mayor materia seca acumulada en tubérculos (237 g).

ABSTRACT Plant growth analysis has been widely used to study factors that influence plant growth. This analysis uses a set of quantitative methods that describe and analyze the growth of plants and their organs. It uses data from direct measurements (weight, area, volume) and quantifies and analyzes growth using indexes based on models defined by mathematical functions. This study conducted a functional growth analysis of diploid potato cultivars in Colombia. The functional growth analysis of diploid potato cultivars was carried out over three consecutive growing seasons in Medellín, Colombia. A randomized block design was used with two levels of fertilization and five repetitions. The first factor corresponded to the three potato cultivars, and the second factor was two fertilization levels: 260 and 778 kg of fertilizer per hectare. Samples were taken weekly, and each sample was an entire plant per experiment unit. The dry weight of each organ and the leaf area were measured. These measurements were used to calculate the relative growth rate, leaf area ratio, net assimilation rate, and specific leaf area. The development time was evaluated in accumulated degree-days with threshold temperatures of 2 and 29°C. The three cultivars recorded their highest net assimilation rate at 1,252 accumulated degree days (ADD), with values of 0.0002565, 0.0002021, and 0.0001778 g cm-2 ADD-1 in the ‘Latina’, ‘Guaneña’, and ‘Colombia’ cultivars, respectively. The Latina cultivar stood out in several physiological characteristics, including the fastest developing cultivar. ‘Latina’ also had the highest total dry mass accumulated in the cycle (271.05 g) and accumulated dry matter in tubers (237 g).

RESUMEN La papa es uno de los cultivos con mayor influencia a nivel mundial y Colombia se destaca por ser el primer exportador de papa criolla o diploide. Nuevas variedades de papa diploide con propiedades antioxidantes y coloración en su pulpa han sido desarrolladas por la Universidad Nacional de Colombia: Primavera, Paola, Violeta, Milagros y Paysandú. El objetivo del presente estudio fue caracterizar y evaluar la estabilidad de las propiedades fisicoquímicas de la papa variedad Primavera, en estado fresco, durante su almacenamiento a 4 °C. Se utilizó papa variedad Primavera, cultivada en Santa Elena, Antioquia, durante los meses de mayo-agosto de 2016. Las propiedades fueron evaluadas mediante la capacidad antioxidante (DPPH y ABTS), fenoles totales (método de Folin-Ciocalteu), humedad, textura en la papa entera y en rodajas, y el color en la pulpa (CIELab). Las muestras fueron almacenadas en bolsas a una temperatura constante de 4 °C y fueron analizadas en los tiempos de control 0, 7, 14, 21 y 30 d. Se realizó una regresión polinomial para cada variable en función del tiempo. En general, las propiedades evaluadas de la papa variedad Primavera no presentaron una tendencia definida, por el contrario, fueron fluctuantes, lo cual podría estar asociado a diversos factores desde la producción primaria; así como a la interacción de fenómenos químicos y físicos de la materia con su entorno. La papa presentó un contenido importante de compuestos antioxidantes comparada con otras variedades (ABTS: 2,89→2,94 mg Trolox g-1; DPPH: 2,33→1,48 mg Trolox g-1; fenoles totales: 6,09→6,27 mg ácido gálico equivalente g-1). La papa criolla variedad Primavera es un alimento que posee importantes propiedades antioxidantes, lo cual le podría conferir un potencial de agro-industrialización a corto y mediano plazo.

ABSTRACT Potatoes are one of the crops with the greatest influence worldwide, and Colombia is the most important exporter of “Criolla” or diploid potato. Universidad Nacional de Colombia has developed varieties of new diploid potatoes with high antioxidant properties and colored flesh: Primavera, Paola, Violeta, Milagros, and Paysandú. The aim of this research was to characterize and evaluate the stability of physicochemical properties of the raw potato cv Primavera during storage at 4 °C. It was used the potato variety Primavera grown in Santa Elena, Antioquia, during season mayo-august 2016. The evaluated properties were the antioxidant capacity (DPPH and ABTS), phenolic compounds (Folin-Ciocalteu method), moisture, texture in whole tuber and slices, and color in the pulp (CIELab). Samples were stored in bags at a constant temperature of 4 °C and were evaluated for 0, 7, 14, 21, and 30 d. Polynomial regression was performed for each variable vs time. In general, properties for potato variety Primavera did not show a defined trend; otherwise, they were fluctuating; this may be associated with various factors such as primary production and the interaction of physic-chemical phenomena of the matter with its environment. Potato presented an important content of antioxidant compounds compared with other varieties (ABTS: 2.89→2.94 mg Trolox g-1; DPPH: 2.33→1.48 mg Trolox g-1; phenolic compounds: 6.09→6.27 mg gallic acid equivalent g-1). The “criolla” potato cv Primavera has a lot of important antioxidant properties which could confer it an agro-industrial potential in a short and medium term.

Resumen En aras de contribuir al desarrollo tecnológico del sistema productivo de la papa criolla, se desarrolló la presente investigación cuyo objetivo fue adaptar el paradigma fuente-demanda a los procesos de captura y asignación de nutrientes para simular el crecimiento y desarrollo de la planta de papa criolla. Se presenta el proceso de formulación, parametrización y evaluación de un modelo demográfico basado en la fisiología de la papa criolla Solanum phureja cv. Criolla Colombia; Se incluyeron dos variables climáticas, temperatura y radiación solar para simular los procesos de fotosíntesis, respiración, asignación selectiva y acumulación de biomasa. Se compararon los resultados de la simulación con datos de campo independientes a los que fueron empleados para parametrizar el modelo y se encontró un adecuado ajuste en cuanto al crecimiento de raíces, tallos, hojas, estolones y tubérculos.

Abstract In order to contribute to the technological development of the potato crop system, the present study was developed with the aim of adapt the supply - demand paradigm to the resource capture processes and allocation of nutrients to simulate the growth and development of the Criolla Colombia variety potato plant. In this paper the process of formulation, parameterization and evaluation of a physiology based demographic model of potato (Solanum phureja) is presented; Two climatic variables were included, the temperature as a thermal time and solar radiation to simulate the photosynthesis, respiration, selective allocation and biomass distribution. The results of the simulation were compared with the independent field data of those used to parameterize the model and found an adequate adjustment in the growth of roots, stems, leaves, stolons and tubers.

RESUMEN El caucho (Hevea brasiliensis) es una especie de tardío rendimiento. Esto hace que los programas de mejoramiento sean a largo plazo y que los parámetros genéticos de la población base sean importantes para tomar decisiones. El objetivo de esta investigación fue determinar el potencial genético de una población segregante de caucho, mediante la repetibilidad como parámetro para tomar decisiones e iniciar un programa de mejoramiento, que busca el incremento de sólidos totales; además, describir la población de estudio y explorar la relación de la producción de sólidos totales con el clima. Esta investigación fue realizada en una plantación franca de caucho con 3395 árboles en 12.000 m2 y dividida en nueve sublotes, la cual está localizada en el centro de investigación El Nus de Corpoica. Fueron realizadas 10 evaluaciones de sólidos totales en el periodo entre octubre 2014 y septiembre 2016. La repetibilidad de los sólidos totales fue determinada a partir de la estimación de las varianzas de ambiente temporal y permanente usando un enfoque bayesiano. Se usó estadística descriptiva para la media de sólidos totales por sublote y fue explorada su relación con las variables climáticas. La repetibilidad estimada estuvo entre 0,64 y 0,66. Los sublotes presentaron un coeficiente de variación entre 64,76 y 86,51%. Sólidos totales tuvo una correlación con la radiación fotosintéticamente activa de 0,25 para los periodos anteriores a los 15 y 30 días, mientras que tuvo una correlación de - 0,44 y -0,46 para los mismos periodos. Hay una buena probabilidad de que sólidos totales tenga una alta heredabilidad.

ABSTRACT Rubber (Hevea brasiliensis) is a specie of late yield performance. This makes breeding programs long-term and the decisions taken are based in the base population genetic parameters. The aim of this research was to determinate a genetic potential of a rubber segregating population through the use of repeatability as a parameter, in order to make decisions to start a breeding program, with the purpose of increasing the total solids. In addition, to describe the target population and to explore the relation between total solids yield and climate variables. This research was carried out in a segregating population with 3395 trees in 12,000 m2 divided into nine plots located in the research center El Nus of Corpoica. Ten evaluations of total solids were recorded in the period between October 2014 and September 2016. The repeatability of total solids was determined from estimation of individual and temporal environments variance using the Bayesian approach. Descriptive statistics for the total solid mean were used per plot and the correlation between total solids and climate variables were obtained. The repeatability estimate value was among 0.64 and 0.66. The plots had a total solids variation coefficient among 64.76 and 86.51%. Total solids and cumulate photosynthetic active radiation had a direct correlation (0.25) for 15 and 30 days prior period, while mean relative humidity had an inverse correlation of -0.44 and -0.42 with total solid in the same periods. There is a good probability that for this population the total solid can be inherited in a high proportion.

Se hace necesario estudiar el patrón de distribución y asignación de los fotoasimilados en variedades de papa criolla Guaneña y Latina que provienen de la variedad Criolla Colombia y son relativamente nuevas en la agricultura en torno al cultivo de la papa en Colombia. El objetivo de este trabajo fue conocer el comportamiento de la distribución de la materia seca entre los órganos que conforman la planta de papa, con el fin de determinar los momentos claves en el ciclo de cultivo donde se está llevando a cabo el inicio del llenado de tubérculos y establecer el patrón de distribución de biomasa en las variedades mencionadas. Se realizaron tres experimentos consecutivos en la Estación Agraria Paysandú, ubicada en el Corregimiento de Santa Elena (Medellín - Antioquia) a 2.538 msnm. Se utilizó un diseño experimental de bloques completos al azar con dos niveles de fertilización correspondientes a 7 y 21 g de fertilizante por sitio que representan 259,25 y 777,77 kg de fertilizante/ha, y cinco repeticiones. La unidad experimental fue un área de 18,27 m² (7 surcos de 2,7 m de largo), la distancia entre surcos fue de 0,90 m, la distancia entre plantas fue de 0,30 m para una densidad de 37,037 sitios de siembra/ha. Se hicieron muestreos semanales correspondientes a una planta entera por unidad experimental. Las variables evaluadas de medición directa fueron los pesos secos de cada órgano y a partir de estos pesos se determinaron las curvas que determinan el patrón de distribución. El tiempo de desarrollo se evaluó en grados día acumulados y se utilizaron las temperaturas umbrales de 2 y 29°C. En todas las variedades en los dos tratamientos de fertilización la mayor parte de los asimilados en las fases iniciales del ciclo se concentran en las raíces, hojas y tallos y una vez se inicia la formación de tubérculos, las hojas y los tallos vierten la materia seca acumulada hacia el llenado de los órganos de acumulación.

It is necessary to study the photosynthate distribution pattern and allocation in Guaneña and Latina potato varieties, which come from the Colombia variety and are relatively new in agriculture, for potato crops in Colombia. The aim of this study was to determine the distribution behavior of dry matter among the organs that make up the potato plant in order to determine the key moments in the crop cycle, where the filling of the tubers takes place, and to establish the pattern of biomass distribution in these varieties. Three consecutive experiments were performed at the "EstaciónAgraria Paysandú" in Santa Elena (Medellin - Antioquia), at 2,538 m a.s.l. with average temperatures of 13.6, 14.6 and 13.81°C. The field trials were established under a random complete blocks design with a 3x2 factorial layout and five replications. The first factor corresponded to the potato varieties and the second factor corresponded to the two fertilization levels: 7 and 21 g of fertilizer per planting site, representing 259.25 and 777.77 kg of fertilizer per ha. The higher fertilizer dose is the one normally used by farmers. An NPK fertilizer compound (10 - 20 - 20 - 5(S)) was used. There were 30 experiment units with an area of 18.27 m² (seven 2.7 m furrows separated by 0.90 m); the distance between the plants was 0.30 m, for a density of 37,037 planting sites per ha. Weekly samplings were taken, a whole plant per experiment unit. The direct measuring evaluated variables for the dry weights of each organ, which were used to obtain curves and the distribution pattern. The development time was evaluated in accumulated growing degree-days and threshold temperatures of 2 and 29°C were used. In all of the varieties and the two fertilization treatments, most of the assimilates in the early stages of the cycle were concentrated in the roots, leaves and stems; once the tuber formation started, the leaves and stems started to allocate dry matter towards the filling of the accumulation organs.

This research was carried out to find both, a parsimonious and precise methodology for the selection of variables related to banana production and its spatial characterization. Fifteen chemical variables, eighteen physical variables and two attributes of the plant, quantity of functional root and the weight of the banana bunch were evaluated in 130 sites, corresponding to an equal number of plants, distributed on a 20 x 20 m-cell grid . The experiment was performed on three fields in the farm, each one with 48, 42 and 40 sample sites, respectively. Six regression methods were assessed at the field level and at the level of the entire sample. The related edaphic variables were characterized spatially. Lasso, Lar and Forward Stagewise were the most accurate methods, presenting the lowest values in the root mean square prediction difference (RMSPD) and using the lowest number of variables. The Lasso method produced a model with seven variables. The weighted average diameter of dry aggregates showed a strong negative relationship with the banana production variables (DPMS, ß= -0.96). A similar trend was obtained with aluminum, copper, and iron, but were antagonistic with calcium, indicating unbalance between ions. The ratios Ca/K y (Ca+Mg)/K were imbalanced. The model also rendered the spatial trend component of banana production, and determined the properties with greater potential for site-specific management.

El objetivo del trabajo fue la selección de variables edáficas relacionadas con la producción de banano, así como la caracterización espacial de éstas. Se evaluaron 15 variables químicas, 18 físicas, y dos atributos de la planta que fueron cantidad de raíz funcional y peso del racimo, en 130 sitios, correspondientes a igual número de plantas. Los sitios fueron distribuidos en malla con celdas de 20 x 20 metros de separación. El experimento se realizó en tres lotes de la finca, en los cuales se ubicaron 48, 42 y 40 sitios de muestreo. En la selección de las variables relacionadas con la producción se usaron seis métodos de regresión. Las variables relacionadas se caracterizaron espacialmente. Se encontró que los métodos Lasso, Lar y Forward Stagewise fueron los más precisos, ya que presentaron los menores valores de raíz cuadrada media de los valores de predicción (RMSPD) y los más parsimoniosos al tomar el menor número de variables. Usando el método Lasso se obtuvo un modelo con siete variables. El diámetro ponderado medio en seco de agregados presentó una fuerte relación negativa con la producción (DPMS, ß= -0,96). Similar comportamiento presentaron el aluminio, el cobre y el hierro, pero antagónicos al del calcio, indicando desequilibrios entre iones. Las relaciones Ca/K y (Ca+Mg)/K estuvieron desbalanceadas. El modelo permitió extraer el componente de tendencia espacial de la producción de banano, así como determinar las propiedades con mayor potencial de manejo por sitio específico.

Como una de las posibles medidas de manejo de aplicación práctica para la reducción de inóculo de Spongospora subterranea f. sp. subterranea en suelos infestados con quistosoros del patógeno, se evaluó la incidencia de su infección en diferentes plantas hospederas durante tres siembras consecutivas. Las siembras se realizaron en macetas que contenían 2 kg de suelo previamente inoculados con una concentración de 1x105 quistosoros.g-1 de suelo; las cosechas de las plantas se realizaron cada tres meses, seleccionando dos muestras de raíz por maceta, una para observación de estructuras del patógeno por microscopía de luz, previa tinción con azul de tripano al 0,05% y otra para detección molecular mediante PCR en tiempo real (qPCR). Para el análisis estadístico se evaluaron los modelos Exponencial y Monomolecular, con el objetivo de seleccionar el que mejor se ajustara a los datos obtenidos. Según el valor estimado para la incidencia de estructuras del patógeno en las raíces, en las especies Cyphomandra betacea, Physalis peruvianum, Solanum nigrum, Allium cepa, Solanum quitoense y Rumex crispus, se reduce la presencia de quistosoros y zoosporangios después de tres siembras consecutivas en condiciones de casa de malla, mientras que en las especies Petroselinum crispum, Pennisetum clandestinum, Zea mays y Solanum lycopersicum se aumenta la incidencia de estructuras de S. subterranea f. sp. subterranea en las raíces.

Trap crops have been considered an alternative strategy to reduce the inoculum of soil pathogens such as Spongospora subterranea f.sp. subterranea. In this work, the incidence of this pathogen was evaluated at three consecutive sowings using different alternative hosts. Plants were sown in pots containing 2 kg of soil inoculated with 1x105 cystosori per gram and harvested every three months. Roots were tested for the presence of cystosori and zoosporangia using light microscopy observations with trypan blue (0.05%) and Real-time PCR (qPCR). Data fitting was performed using Exponential and monomolecular models. According to the estimated incidence values of pathogen structures, plant species Cyphomandra betacea, Physalis peruvianum, Solanum nigrum, Allium cepa, Solanum quitoense and Rumex crispus, significantly reduced the amount of cystosori and zoosporangia after the three consecutive sowings. In contrast, Petroselinum crispum, Pennisetum clandestinum, Zea mays and Solanum lycopersicum increased the incidence of S. subterranea f. sp. subterranea.

For a better understanding of the molecular mechanisms involved in the interaction between Solanum phureja Juz. et. Buk. and Spongospora subterranean (Wallr.) Lagerh, the causal agent of powdery scab disease, a 454 transcriptome analysis was carried out using one susceptible (Criolla Colombia) and one tolerant (Criolla Latina) potato cultivars. The results revealed a marked difference in the overexpression pattern for each cultivar. In the susceptible cultivar, the response was based on the activation of genes associated with cell-wall integrity, signal transduction and stress-related genes. The most overexpressed genes were those coding for methalothionein (3297 times), phosphatase 2C (2128 times) and a pectin methylesterase inhibitor (2127 times). Overexpression in the tolerant cultivar was moderate with only two genes (a putative gene and a-Galactosidase) being transcribed more than 1000 times compared with the non-inoculated control suggesting an important constitutive defense response. Overexpression of three genes in the Criolla Latina transcriptome was confirmed by qRT-PCR.

Con el fin de contribuir a un mejor conocimiento de los mecanismos que rigen la interacción entre Solanum phureja Juz. et. Buk. y Spongospora subterranea (Wallr.) Lagerh, agente causal de la sarna polvosa de la papa, se realizó en esta investigación el análisis del transcriptoma de dos cultivares: Criolla Colombia (susceptible) y Criolla Latina (tolerante), mediante pirosecuenciación 454. Los resultados indicaron diferencias entre los genes sobreexpresados en cada cultivar ante la infección con el patógeno. En el cultivar susceptible, la respuesta ocurre a partir de la activación transcripcional de genes asociados a la integridad de la pared celular, transducción de señales y genes involucrados en la respuesta a diferentes tipos de estrés. Los genes que codifican para metalotioneína (3297 veces), fosfatasa 2C (2128 veces) y un inhibidor de pectinmetilesterasa (2127 veces) fueron los más sobreexpresados en este cultivar. Por su parte, en el cultivar tolerante los niveles de sobreexpresión de genes fueron moderados, con sólo dos genes (un gen putativo y a-Galactosidasa) siendo transcritos más de 1000 veces, con respecto a las plantas sin inocular. Estos resultados sugieren que la tolerancia a S. subterranea de este cultivar, incluye también mecanismos de defensa constitutivos. Finalmente, mediante ensayos de qRT-PCR se confirmó la sobreexpresión de tres de los genes identificados en el transcriptoma del cultivar Criolla Latina.

Las enfermedades virales son uno de los problemas más limitantes del cultivo de papa. En los últimos años el amarillamiento de venas (AV) causado por PYVV, se ha presentado como una de las enfermedades más incidentes en Colombia. En este trabajo se evaluaron los síntomas comúnmente asociados a enfermedades virales en cultivos de papa de cuatro departamentos de Colombia, con énfasis en la enfermedad del amarillamiento de venas. Mediante pruebas de ELISA se determinó la posible relación de los síntomas AV, mosaico rugoso (MR), enrollamiento foliar (EF) y enanismo (EN) con la presencia de Potyvirus, PLRV, PVS, PVX; y mediante RT-PCR para PYVV. Los resultados indicaron que MR fue el síntoma más incidente en los cultivos (16%), seguido por EF (10%), AV (7%) y EN (2%). Los cultivos del Oriente Antioqueño e Ipiales (Nariño) fueron las regiones con mayores niveles de AV (>20%). No se encontró una relación significativa para las combinaciones virus/síntomas; por el contrario, se detectaron potyvirus y PVS en 68% y 30% de las muestras, respectivamente. El PYVV se detectó en todas las muestras con AV, aunque más del 15% de dichas muestras también presentaron al menos uno de los otros virus evaluados.

Viral diseases are one of the most limiting factors in potato production. Recently, vein yellowing (VY) caused by PYVV has become one of the diseases with the highest incidence in potato crops in Colombia. In this work, symptoms commonly associated with viral infection were evaluated in potato crops from four provinces of Colombia, with emphasis in the vein yellowing disease. A correlation between VY, rugose mosaic (RM), leaf roll (LR) and dwarf (D) symptoms and the presence of potyvirus, PLRV, PVS and PVX was determined by ELISA. The presence of PYVV was determined by RT-PCR. Incidence for each symptom was: RM (16%), LR (10%), VY (7%) and D (2%). The highest levels of VY (>20%) were observed in Eastern Antioquia and Ipiales (Nariño). There was not significant correlation between a symptom and a specific virus, since Potyvirus and PVS were found in 68% and 30% of samples, respectively. PYVV was detected in all samples with VY. However, at least another virus was found in 15% of these samples.

As doenças causados por vírus são uns dos problemas de fitosanidade mais importantes da cultura da batata. Nos últimos anos o sintoma de amarelamento das nervaduras (AV) associado ao vírus PYVV, tem-se apresentado como umas das doenças com maior incidência em Colombia. Nesta pesquisa avaliaram-se os sintomas comumente associados a doenças causadas por vírus em cultura da quatro estados da Colômbia. Usando testes de ELISA determinou-se a possível relação entre o sintoma AV, mosaico com rugosidade (MR), deformação foliar (EF) e porte baixo (EN) com a presença de Potyvirus, PLRV, PVS, PVX, e usando RT-PCR para PYVV. Os resultados amostram que MR foi o sintoma com maior incidência (16%), e após deste EF (10%), AV (7%) y EN (2%). Na região do leste do estado de Antioquia e Ipiales no estado de Nariño, apresentaram-se os maiores valores de AV (>20%). Não se encontro uma relação significativa para as combinações vírus/sintomas, mas pelo contrario, detectaram-se potyvirus e PVS no 68% e 30% de todas as amostras, respectivamente. No caso de PYVV encontraram-se que o vírus está presente em todas a amostras com AV, embora mas do 15% das amostras associadas com este sintoma apresentaram pelo menos um dos outros vírus avaliados.

El agente causal de la sarna polvosa de la papa, Spongospora subterranea f. sp. subetrranea es una de las enfermedades más limitantes de la producción del cultivo a nivel mundial. En Colombia, viene incrementando su incidencia al punto de disminuir la producción, sin llegar a encontrar métodos de control efectivos. En este estudio, se buscó establecer un rango de hospederos del patógeno a partir de inoculaciones por bioensayos. Así, plantas de 33 especies se inocularon en solución a una concentración de 1x10(6) quistosoros mL-1 durante 12 días; posteriormente, las plantas fueron sembradas en campo, realizando evaluaciones a los 15, 30, 60, 90 y 120 días después de inoculadas. En cada evaluación se seleccionaron diez plantas de cada especie, con el fin de hacer tinción de raíces e identificar al microscopio estructuras asociadas al patógeno. A partir de la identificación morfológica fue posible clasificar las especies como plantas trampa quienes sólo presentaron zoosporangios, hospedero Tipo I con presencia sólo de quistosoros y hospederos Tipo II quienes presentaron estructuras de zoosporangios y quistosoros. Algunos de éstos hospederos pertenecen a las familias Alliaceae, Apiaceae, Brassicaceae, Poaceae, Polygonaceae, Solanaceae, ampliándose así el rango de especies que pueden ser reportadas como hospederas de Spongospora subterranea f. sp. subterranea en Colombia.

Potato powdery scab, caused by Spongospora subterranea f. sp. subetrranea, is a disease that limits worldwide potato crop production. Incidence of the disease has been increasing in Colombia, thereby affecting tubers production, so far effective control methods have yet to be developed. The aim of this research was to establish the host range plants for Spongospora subterranea f. sp. subterranea by artificial inoculations. Thus, 33 species were inoculated with 1×10(6) sporosori.mL-1 solution for 12 days. The plants were then planted in field, evaluations were performed at 15, 30, 60, 90 and 120 days after inoculation, 10 plants of each species were selected for every evaluation, the roots were stained and the pathogenic structures were identified by microscopy. Morphological examination enabled the identification of trap plants species, which presented zoosporangia only; Type I hosts, which present sporosori only; and Type II hosts, which presented both sporosori and zoosporangia. Some of these hosts belonged to the Alliaceae, Apiaceae, Brassicaceae, Poaceae, Polygonaceae and Solanaceae families, thus extending the species range that can be reported as hosts of Spongospora subterranea f. sp. subterranea in Colombia.

In order to evaluate the resistance to Spongospora subterranea f. sp. subterranea on 105 genotypes of Solanum phureja (local name in Colombia papa criolla), bioassays were conducted through propagation by lateral stem cuttings. Inoculation was performed with a 1 x 10(6) sporeballs mL-1 solution. The level of resistance or susceptibility of each genotype to the pathogen was determined at three different times: 1) At 15 days after inoculation (DAI), the presence of zoosporangia was evaluated in roots under optical microscopy; 2) At flowering, the presence of galls was observed in roots and 3) At harvest, the tubers were screened for the detection of pustules. Asymptomatic plants, (i.e. plants seemingly without pathogen´s structures or disease symptoms) were evaluated by PCR using specific primers. At 15 DAI it was not possible to determine the degree of resistance in the genotypes and later there were no disease symptoms on tubers. Nevertheless, disease was detectable through gall formation on roots at the flowering stage. The most susceptible genotype was Criolla Colombia. Thirty genotypes, including the commercial variety Criolla Paisa, were highly resistant and presented neither pathogen´s structures nor symptoms.

Se realizaron bioensayos con 105 genotipos de Solanum phureja (papa criolla) para evaluar la resistencia a la sarna polvosa causada por Spongospora subterranea f. sp. subterranea. Estos fueron propagados por esquejes de tallo lateral. La inoculación se realizó con una solución a una concentración de 1x10(6) quistosoros mL-1. Se determinó el grado de resistencia o susceptibilidad de cada genotipo al patógeno en tres momentos diferentes: 1) después de 15 días de la inoculación se evaluó en el microscopio la presencia de zoosporangios en raíces; 2) en estado de floración, se observó la presencia de agallas de raíces; y 3) en la cosecha se evaluaron los tubérculos, observando la presencia de pústulas. Las plantas asintomáticas, aquellas donde no se observaron estructuras del patógeno o síntomas de la enfermedad, fueron evaluadas mediante la técnica de PCR con primers específicos. Los resultados mostraron que a los 15 días no fue posible discriminar el grado de resistencia de los genotipos. Igualmente no hubo presencia de síntomas de la enfermedad en los tubérculos, sin embargo sí se observaron síntomas de agallas en raíces en la evaluación en estado de floración. El genotipo más susceptible fue Criolla Colombia y 30 genotipos presentaron una alta resistencia sin presentar síntomas de la enfermedad o signos del patógeno, dentro de los cuales se incluye la variedad Criolla Paisa.

El cultivo de papa en Colombia es afectado por diversos virus, que incluyen PVY, PLRV, PVX, PMTV y PVS; aunque se han realizado pocos estudios sobre la biología, distribución y patogenicidad de dichos virus en Colombia, siendo especialmente escasa la información referente al PVS. En este trabajo se evaluó mediante pruebas de ELISA, la presencia del PVS en cuatro departamentos de Colombia, así como sus niveles de variación, a partir de la secuenciación de una porción del gen de la cápside viral. Los resultados indicaron una detección promedio del virus en el 40% de las 320 muestras analizadas, con zonas como el Oriente cercano de Antioquia (49%) y Pasto (Nariño) (47%), donde se detectó en mayor proporción el virus. Los análisis de variación molecular indicaron la presencia de las dos razas de PVS (Ordinaria y Andina) en Colombia, siendo los aislamientos de PVS A los más diversos, al pre- sentar un rango de identidad del 88 al 99%. Estos hallazgos indican que es imperativo el fortalecimiento de los programas de certificación de semilla y vigilancia cuarentenaria en el país, especialmente para virus como el PVS, que aunque puede ser asintomático, causa pérdidas hasta del 20% en cultivos de papa.

In Colombia, potato crops are affected by a wide variety of viruses such as PVY, PLRV, PVX, PMTV and PVS. Unfortunately, there are very few studies on the biology, distribution and pathogenicity of these viruses; this situation is even worse for the latent virus PVS. In this work, we evaluated the presence of PVS in four Colombian provinces (Antioquia, Boyacá, Cundinamarca, Nariño) by the use of ELISA. We also studied the degree of molecular variation by sequence comparison of a segment of the gene encoding for the viral coat protein. In average, PVS was detected in 40% of 320 analyzed samples of potato leaves; the highest levels were observed in the East of Antioquia (49%) and Pasto (Nariño) (47%), while in the other regions ranged between 35% and 42%. Analysis of sequence revealed the presence of two PVS strains in Colombia: three isolates were associated to PVS O (Ordinary) and twelve belonged to PVS A (Andean). A high diversity was observed among PVS A strains with percent identities in the range of 88-99%. These findings highlight the importance of strengthening seed certification programs and quarantine measures in Colombia for viruses like PVS, which can cause losses of up to 20% in potato crops and even higher in mixed virus infection.