Resumen Cuando las infecciones bacterianas son serias requieren antibióticos como tratamiento de elección. Sin embargo, su uso excesivo ha conducido al desarrollo de bacterias resistentes, haciéndolas más peligrosas. Este es un serio problema de salud en México, donde la publicación de investigación sobre este tópico es aún limitada. Este estudio tuvo como objetivo estimar la prevalencia de resistencia a los antibióticos en infecciones bacterianas en el Hospital General del Estado en Hermosillo (HGE), México, y comparase con información futura, estimar tendencias, y buscar estrategias contra este problema. Se recopiló información de 2,205 registros microbiológicos sobre cultivos bacterianos con antibiogramas de muestras de pacientes en 2016. Estos datos se obtuvieron a través del sistema VITEK®, que proporcionó información sobre las especies bacterianas, y su resistencia contra y tipo de antibióticos. Las bacterias más aisladas fueron Escherichia coli (28.8 %), Staphylococcus aureus (11.5 %) y Pseudomonas aeruginosa (9.8 %). Las prevalencias más altas de resistencia se encontraron contra antibióticos beta-lactámicos. La resistencia a los antibióticos es un problema grave de salud en el HGE. Esto resalta la necesidad de investigar más sobre la resistencia a los antibióticos en México, para que las autoridades consideren tal información en el diseño de estrategias preventivas.

Abstract Bacterial infections can be serious and require antibiotic treatment. However, the overuse of antibiotics has led to the development of antibacterial resistance, which can make infections more dangerous. This is a serious problem in Mexico, where published research on antibiotic resistance is limited. This study aimed to estimate the prevalence of antibiotic resistance in bacterial infections at the Hospital General del Estado in Hermosillo (HGE), Mexico so that it can be compared with future information and look for strategies to mitigate this problem. Information was collected from logs registered at the hospital microbiology area in 2016, on bacterial cultures with antibiograms from 2,205 biological samples. These data were obtained from the VITEK® system, which provided information on the bacteria spp., their antibiotic resistance, and the type of antibiotics to which were resistant. Escherichia coli (28.8 %), Staphylococcus aureus (11.5 %), and Pseudomonas aeruginosa (9.8 %) were the most isolated bacteria. The highest prevalence of resistance was found against beta-lactam antibiotics. This study revealed that antibiotic resistance is a serious problem at the HGE. These findings highlight the need for further research on antibiotic resistance in Mexico to design national prevention strategies.

Resumen El género Enterococcus puede ser encontrado en agua, suelo y en general en todo ambiente, son parte de la microbiota intestinal de animales, incluyendo a humanos. La prevalencia en alimentos se debe principalmente a la resistencia que presentan a las condiciones adversas del ambiente. Setenta y tres aislados de vísceras de pollo fueron confirmados como pertenecientes al género a través de pruebas bioquímicas y fermentación de carbohidratos. La caracterización bioquímica indicó que la especie predominante fue E. casseliflavus. La resistencia de los aislados a antimicrobianos fue notoria para amikacina (42 %), kanamicina (38 %), estreptomicina (55 %), y eritromicina (33 %). El análisis obtenido por ERIC-PCR mostró una alta variabilidad genética entre los aislados. Así también, los aislados mostraron relación entre los perfiles obtenidos con la susceptibilidad a antimicrobianos y por ERIC-PCR. Estos resultados muestran la multiresistencia de Enterococcus en vísceras de pollo expedidos comercialmente, con una alta variabilidad genética. Además, estos Enterococcus pueden ser potencialmente patógenos en individuos como una bacteria nosocomial y además transferir la resistencia en especies que son estrictamente patógenas y causan enfermedades al humano.

Abstract The genus Enterococcus can be found in water, soil, and food, and above all, they are part of the animal (including human) intestinal microbiota. Food prevalence is mainly due to their resistance to adverse environmental conditions. Seventy-three isolates from chicken viscera were confirmed to belong to the Enterococcus genus by biochemical tests and carbohydrate fermentation. Phenotypic characterization of the species indicates that E. casseliflavus was the predominant specie. Antimicrobial resistance to amikacin (42 %), kanamycin (38 %), streptomycin (55 %) and erythromycin (33 %) in the isolates was notorious. The analysis obtained from ERIC-PCR profiles shows a high genetic variability among the isolates. In addition, a relationship between the antimicrobial and ERIC-PCR profiles was observed among isolates. These results indicate the presence of multiresistant Enterococcus in commercial chicken viscera with high genetic variability, which could be a potential nosocomial bacterium or transfer this resistance to another pathogenic species causing human diseases.

Resumen La determinación de anticuerpos IgM e IgG por inmunofluorescencia indirecta es la prueba estándar para confirmar la fiebre manchada por Rickettsia rickettsii (FMRR), aunque tiene limitado valor clínico pues requiere tres semanas para ser confiable. La Reacción en Cadena de la Polimerasa (PCR) es una opción para el diagnóstico en sangre total, pero hay menos certidumbre respecto a su capacidad al usar muestras de orina y tejido. Nos proponemos estimar la confiabilidad de PCR en muestras de hisopado cutáneo y orina en pacientes sospechosos de FMRR, comparándole con resultados de PCR en muestras de sangre total. Se analizaron muestras de 110 pacientes sospechosos de FMRR atendidos en hospitales de Sonora, entre septiembre de 2018 y octubre de 2019. El cálculo de la confiabilidad se realizó mediante el Coeficiente de Kappa (K). Se detectó R. rickettsii en 21 muestras de orina, encontrando una concordancia sustancial (K = 0.607, IC 95 % (0.385, 0.844)); en tanto, 3 hisopados cutáneos resultaron positivos, pero sin significancia estadística (K = 0.417, IC95 % (- 0.338, 1.172)). Nuestros hallazgos sustentan que la PCR en orina es una técnica confiable para confirmar la sospecha clínica de FMRR en pacientes hospitalizados.

Abstract Rocky Mountain spotted fever (RMSF) is an infectious disease confirmed through IgM and IgG determination obtained by indirect immunofluorescence, although it has limited clinical value since it requires up to three weeks to be reliable. Polymerase Chain Reaction (PCR) is an alternative for RMSF diagnosis in whole blood, but there is less certainty regarding its certainty when urine and tissue samples are used. This study aimed to estimate the reliability of PCR in skin swab and urine samples obtained from patients with suspected RMSF, comparing it with PCR results from whole blood samples. Samples from 110 suspected RMSF hospitalized patients, between September 2018 and October 2019, were analyzed. Reliability was calculated using the Kappa Coefficient (K). R. rickettsii was detected in 21 urine samples, finding substantial agreement (K = 0.607, 95 % CI (0.385, 0.844)); meanwhile, 3 skin swabs were positive, but without statistical significance (K = 0.417, 95 % CI (- 0.338, 1.172)). Our findings support that urine PCR is a reliable technique to confirm clinical suspicion of RMSF in hospitalized patients.

El comportamiento epidemiológico de la fiebre manchada por Rickettsia rickettsii constituye un desafío para los sistemas de salud del continente americano. Es un padecimiento de relevancia médica por la letalidad que provoca si no es diagnosticado ni tratado oportunamente. Aunque cualquier persona es susceptible a la infección, algunos grupos poblacionales son más vulnerables debido a un mayor contacto con la garrapata transmisora, entre ellos los niños, quienes tienen mayor morbilidad por lo que se asocian con resultados fatales. En su origen participa una multitud de factores biológicos, ecológicos y sociales, interrelacionados complejamente, y cuyo abordaje requiere de intervenciones integradas y multidisciplinarias. La incidencia de la enfermedad puede continuar aumentando en la región, de modo que su ocurrencia actual constituye un llamado urgente para la acción regional. Acciones preventivas que disminuyan el contacto con garrapatas e incrementen la sospecha temprana de la enfermedad, son prioritarias en la agenda de salud de varias naciones de las Américas.

Rocky mountain spotted fever is a public health problem in America. The disease remains as a challenge for Health Systems at regional level. It is an illness of medical relevance due to its high case-fatality rate when it is not diagnosed and treated early. Although anyone is susceptible to infection, some groups are more vulnerable due to increased exposure to ticks, including children who have higher morbidity and fatal outcomes. A myriad of biological, ecological and social factors, complexly interrelated, are associated with its epidemiological pattern, which requires integrated and multidisciplinary interventions at different levels. The incidence of the disease may continue to increase in the region and its actual occurrence required an urgent call for regional action. Preventive actions that reduce contact with ticks and increase early disease suspicion should be priorities in the health agenda of various nations in America.

ABSTRACT: The interferon-gamma release assay (IGRA) is a novel method for the diagnosis of tuberculosis (TB), but its usefulness is uncertain in children. Objective: Examine the diagnostic capacity of QuantiFERON-TB Gold (QFT-G®) one of the IGRA commercial kits, in pediatric population of Sonora, Mexico. Methods: Cross-sectional design with 160 subjects less than 19 years old, in a hospital in Sonora, Mexico. Three groups were compared: one from patients with active TB (TBA), another one with latent TB (TBL) and one of hospital controls. The Stegen-Toledo criteria were the gold standard used. Multivariate logistic regression was performed to test the association between QFT-G® and selected predictors. Results: The sensitivity of QFT-G® in TBA was 76.9% and specificity 90.3%. For TBL, sensitivity was 25.0% and specificity of 98.6%. QFT-G® showed a moderate agreement (K = 0.574) with the standard. QFT-G® was associated with a chest radiograph suggestive of TB, (OR adjusted 4.37, 95% CI: 1.42, 13.42) and being a case of pulmonary TB (OR adjusted 6.15, 95% CI: 1.90, 19.92). Conclusion: The interferon-gamma release assay shows significant capacity to diagnose TBA and can be used to rule out TBL in the pediatric population.

RESUMEN: El ensayo de liberación de interferon gamma es un método novedoso para el diagnóstico de la tuberculosis aunque su utilidad es incierta en población pediátrica. Objetivo: examinar la utilidad diagnóstica del QuantiFERON-TB Gold (QFT-G®), uno de los ensayos de liberación de interferon gamma comerciales, en población pediátrica del Estado de Sonora, México. Materiales y métodos: estudio transversal con 160 menores de 19 años de edad, en un hospital de Sonora, México. Se compararon tres grupos, uno de pacientes con tuberculosis activa, otro con tuberculosis latente y uno más de controles hospitalizados. Los criterios de Stegen-Toledo fueron el estándar empleado. Se usó regresión logística multivariada para evaluar la asociación entre el QFT-G® y los predictores seleccionados. Resultados: la sensibilidad del QFT-G® en la tuberculosis activa fue de 76.9% y la especificidad de 90.3%. Fara la tuberculosis latente la sensibilidad fue 25.0% y la especificidad de 98.6%. El QFT-G® mostró una concordancia moderada (K = 0.574) con el estándar. También mostró asociación con la radiografía de tórax sugestiva de tuberculosis (razón de momios ajustada 4.37, IC 95%: 1.42, 13.42) y con el hecho de ser caso de tuberculosis pulmonar (razón de momios ajustada 6.15, IC 95%: 1.90, 19.92). Conclusión: el ensayo de liberación de interferón gamma es un método útil para diagnosticar tuberculosis activa y puede emplearse para descartar tuberculosis latente en población pediátrica.

Eeach year about 13,000 indigenous laborers migrate to work in the agricultural fields of Sonora, but little is known about their incidence of tuberculosis (TB) or how their perceptions and those of health personnel are related to the disease. Using tools from epidemiology and medical anthropology, we describe the epidemiological profile of TB during 2005-2010 in three agricultural fields in Sonora, and explore how social and cultural factors relate to TB occurrence. The incidence of TB in these communities is four times the national and state average. No ethnic group is documented in medical records, so TB may be underestimated in indigenous people. TB in this population exceeds the national rate, and there are gaps between the biomedical model and the belief systems of patients that reduce the effectiveness of disease control actions.

Cada año unos trece mil jornaleros indígenas laboran en campos agrícolas de Sonora, pero poco se sabe acerca de su incidencia de tuberculosis, y cómo sus percepciones y las del personal de salud se relacionan con la enfermedad. Este es un estudio trasversal, realizado de 2005 a 2010, para describir esa incidencia en dichos trabajadores, que fue superior al promedio nacional y estatal, en dicho periodo; también se exploran los factores socioculturales asociados a la ocurrencia de tuberculosis. En los registros médicos de los pacientes no se documenta el grupo étnico al que pertenecen, lo que puede subestimar la carga de la tuberculosis en estos indígenas, que trabajan en Sonora, y que es elevada. Existen brechas entre el modelo biomédico y el sistema de creencias de los pacientes, que pueden mermar las acciones de control del padecimiento.

OBJECTIVE: To perform the analysis of specific regions of the major genes associated with resistance to isoniazid or rifampin. MATERIALS AND METHODS: Twenty two M. tuberculosis strains, isolated from human samples obtained in Sonora, Mexico. Specific primers for hotspots of the rpoB, katG, inhA genes and the ahpC-oxyR intergenic region were used. The purified PCR products were sequenced. RESULTS: Mutations in the promoter of inhA, the ahpC-oxyR region, and codon 315 of katG and in 451 or 456 codons of rpoB, were identified. CONCLUSIONS: Detection of mutations not previously reported requires further genotypic analysis of Mycobacterium tuberculosis isolates in Sonora.

OBJETIVO: Realizar el análisis de regiones específicas de genes asociados con resistencia a isoniazida o rifampicina. MATERIAL Y MÉTODOS: Se estudiaron 22 cepas de M. tuberculosis, aisladas en Sonora, México. Se utilizaron iniciadores para regiones específicas de los genes rpoB, katG e inhA y la región ahpC-oxyR. Los productos de PCR se secuenciaron y analizaron. RESULTADOS: Se identificaron mutaciones en la región promotora del gen inhA, región ahpC-oxyR, codón 315 del gen katG y codones 451 ó 456 del gen rpoB. CONCLUSIONES: La identificación de mutaciones no descritas previamente obliga a continuar el análisis genotípico de cepas aisladas en Sonora.

OBJECTIVE: To perform the analysis of specific regions of the major genes associated with resistance to isoniazid or rifampin. MATERIALS AND METHODS: Twenty two M. tuberculosis strains, isolated from human samples obtained in Sonora, Mexico. Specific primers for hotspots of the rpoB, katG, inhA genes and the ahpC-oxyR intergenic region were used. The purified PCR products were sequenced. RESULTS: Mutations in the promoter of inhA, the ahpC-oxyR region, and codon 315 of katG and in 451 or 456 codons of rpoB, were identified. CONCLUSIONS: Detection of mutations not previously reported requires further genotypic analysis of Mycobacterium tuberculosis isolates in Sonora.

OBJETIVO: Realizar el análisis de regiones específicas de genes asociados con resistencia a isoniazida o rifampicina. MATERIAL Y MÉTODOS: Se estudiaron 22 cepas de M. tuberculosis, aisladas en Sonora, México. Se utilizaron iniciadores para regiones específicas de los genes rpoB, katG e inhA y la región ahpC-oxyR. Los productos de PCR se secuenciaron y analizaron. RESULTADOS: Se identificaron mutaciones en la región promotora del gen inhA, región ahpC-oxyR, codón 315 del gen katG y codones 451 ó 456 del gen rpoB. CONCLUSIONES: La identificación de mutaciones no descritas previamente obliga a continuar el análisis genotípico de cepas aisladas en Sonora.

Existe un interés creciente en el uso de lactobacilos como probióticos. El uso de microorganismos como probióticos, requiere que éstos cubran ciertos requisitos, dentro de los cuales la resistencia a pH ácido y a sales biliares, se consideran de suma importancia. Actualmente existen distintos procedimientos que permiten evaluar la tolerancia al tránsito gastrointestinal. Debido a que la resistencia a pH ácido y a sales biliares es una condición crítica dentro de la evaluación de cepas probióticas, la finalidad del presente trabajo consistió en comparar la resistencia a sales biliares de 20 cepas de Lactobacillus reuteri aisladas de cerdos sanos, mediante dos procedimientos diferentes basados en la exposición a pH ácido. El análisis estadístico no mostró diferencias en la resistencia de las cepas a sales biliares cuando se realizó una exposición previa a pH ácido. Así, la exposición a pH ácido previo a la incubación con sales biliares, asemeja más a las condiciones fisiológicas que el microorganismo encontrará de manera natural y es una buena alternativa en la evaluación probiótica de lactobacilos de origen porcino. Se requieren estudios que incluyan enzimas digestivas, con el fin de evaluar la resistencia al tránsito gastrointestinal, dado que es uno de los factores más importantes en la evaluación de cepas con potencial actividad probiótica.

A considerable amount of attention has been focused on the use of lactobacilli as probiotics. The use of microorganisms as probiotics must meet certain criteria, among these; the resistance to low pH and bile salts is of great importance. Different procedures have been designed to evaluate tolerance to gastrointestinal transit. Since resistance to low pH and bile salts is critical in the evaluation of probiotic strains, the aim of this study was to compare resistance to bile salts for 20 strains of porcine Lactobacillus reuteri that had been isolated from healthy pigs, using two different procedures based on exposure to low pH. Statistical analysis revealed no difference in resistance of the strains to bile salts whether pH was low or not. The use of low pH prior to exposure to bile salts therefore more closely represents physiological conditions that should be used for the evaluation of potential porcine probiotic lactobacilli. Further studies using digestive enzymes are required to evaluate resistance to gastrointestinal transit, since it is an important factor in the evaluation of strains with potential probiotic activity.